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Hehr, M. ; Sadafi, A. ; Matek, C. ; Lienemann, P. ; Pohlkamp, C. ; Haferlach, T. ; Spiekermann, K. ; Marr, C.
A morphological dataset of white blood cells from patients with four different genetic AML entities and non-malignant controls.Sommer, J. ; Hetzel, L. ; Lüdke, D. ; Theis, F.J. ; Günnemann, S.
The power of motifs as inductive bias for learning molecular distributions.Tran, M. ; Cid, Y.D. ; Lahiani, A. ; Theis, F.J. ; Peng, T. ; Klaiman, E.
Training transitive and commutative multimodal transformers with LoReTTa.Akcan, T.S.
Deciphering Trans-acting Regulatory Molecular Mechanisms with Machine Learning.Dorigatti, E. ; Schubert, B. ; Bischl, B. ; Ruegamer, D.
Frequentist uncertainty quantification in semi-structured neural networks.Willems, S.M. ; Ng, N.H.J. ; Fernández, J. ; Fine, R.S. ; Wheeler, E. ; Wessel, J. ; Kitajima, H. ; Marenne, G. ; Sim, X. ; Yaghootkar, H. ; Wang, S. ; Chen, S. ; Chen, Y. ; Chen, Y.I. ; Grarup, N. ; Li-Gao, R. ; Varga, T.V. ; Asimit, J.L. ; Feng, S. ; Strawbridge, R.J. ; Kleinbrink, E.L. ; Ahluwalia, T.S. ; An, P. ; Appel, E.V. ; Arking, D.E. ; Auvinen, J. ; Bielak, L.F. ; Bihlmeyer, N.A. ; Bork-Jensen, J. ; Brody, J.A. ; Campbell, A. ; Chu, A.Y. ; Davies, G. ; Demirkan, A. ; Floyd, J.S. ; Giulianini, F. ; Guo, X. ; Gustafsson, S. ; Jackson, A.U. ; Jakobsdottir, J. ; Järvelin, M.R. ; Jensen, R.A. ; Kanoni, S. ; Keinanen-Kiukaanniemi, S. ; Li, M. ; Lu, Y. ; Luan, J. ; Manning, A.K. ; Marten, J. ; Meidtner, K. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Muka, T. ; Pistis, G. ; Prins, B. ; Rice, K.M. ; Sanna, S. ; Smith, A.V. ; Smith, J.A. ; Southam, L. ; Stringham, H.M. ; Tragante, V. ; van der Laan, S.W. ; Warren, H.R. ; Yao, J. ; Yiorkas, A.M. ; Zhang, W. ; Zhao, W. ; Graff, M. ; Highland, H.M. ; Justice, A.E. ; Marouli, E. ; Medina-Gomez, C. ; Afaq, S. ; Alhejily, W.A. ; Amin, N. ; Asselbergs, F.W. ; Bonnycastle, L.L. ; Bots, M.L. ; Brandslund, I. ; Chen, J. ; Danesh, J. ; de Mutsert, R. ; Dehghan, A. ; Ebeling, T. ; Elliott, P. ; Farmaki, A.E. ; Faul, J.D. ; Franks, P.W. ; Franks, S. ; Fritsche, A. ; Gjesing, A.P. ; Goodarzi, M.O. ; Gudnason, V. ; Hallmans, G. ; Harris, T.B. ; Herzig, K.H. ; Hivert, M.F. ; Jørgensen, T. ; Jørgensen, M.E. ; Jousilahti, P. ; Kajantie, E. ; Karaleftheri, M. ; Kardia, S.L.R. ; Kinnunen, L. ; Koistinen, H.A. ; Komulainen, P. ; Kovacs, P. ; Kuusisto, J. ; Laakso, M. ; Lange, L.A. ; Launer, L.J. ; Leong, A. ; Lindström, J. ; Manning Fox, J.E. ; Männistö, S. ; Maruthur, N.M. ; Moilanen, L. ; Mulas, A. ; Nalls, M.A. ; Neville, M. ; Pankow, J.S. ; Pattie, A. ; Petersen, E.R.B. ; Puolijoki, H. ; Rasheed, A. ; Redmond, P. ; Renström, F. ; Roden, M. ; Saleheen, D. ; Saltevo, J. ; Savonen, K. ; Sebert, S. ; Skaaby, T. ; Small, K.S. ; Stancáková, A. ; Stokholm, J. ; Strauch, K. ; Tai, E.S. ; Taylor, K.D. ; Thuesen, B.H. ; Tönjes, A. ; Tsafantakis, E. ; Tuomi, T. ; Tuomilehto, J. ; Uusitupa, M. ; Vääräsmäki, M. ; Vaartjes, I. ; Zoledziewska, M. ; Abecasis, G. ; Balkau, B. ; Bisgaard, H. ; Blakemore, A.I. ; Blüher, M. ; Boeing, H. ; Boerwinkle, E. ; Bønnelykke, K. ; Bottinger, E.P. ; Caulfield, M.J. ; Chambers, J.C. ; Chasman, D.I. ; Cheng, C.Y. ; Collins, F.S. ; Coresh, J. ; Cucca, F. ; de Borst, G.J. ; Deary, I.J. ; Dedoussis, G. ; Deloukas, P. ; den Ruijter, H.M. ; Dupuis, J. ; Evans, M.K. ; Ferrannini, E. ; Franco, O.H. ; Grallert, H. ; Hansen, T. ; Hattersley, A.T. ; Hayward, C. ; Hirschhorn, J.N. ; Ikram, A. ; Ingelsson, E. ; Karpe, F. ; Kaw, K.T. ; Kiess, W. ; Kooner, J.S. ; Körner, A. ; Lakka, T. ; Langenberg, C. ; Lind, L. ; Lindgren, C.M. ; Linneberg, A. ; Lipovich, L. ; Liu, C.T. ; Liu, J. ; Liu, Y. ; Loos, R.J.F. ; MacDonald, P.E. ; Mohlke, K.L. ; Morris, A.D. ; Munroe, P.B. ; Murray, A. ; Padmanabhan, S. ; Palmer, C.N.A. ; Pasterkamp, G. ; Pedersen, O. ; Peyser, P.A. ; Polasek, O. ; Porteous, D. ; Province, M.A. ; Psaty, B.M. ; Rauramaa, R. ; Ridker, P.M. ; Rolandsson, O. ; Rorsman, P. ; Rosendaal, F.R. ; Rudan, I. ; Salomaa, V. ; Schulze, M.B. ; Sladek, R. ; Smith, B.H. ; Spector, T.D. ; Starr, J.M. ; Stumvoll, M. ; van Duijn, C.M. ; Walker, M. ; Wareham, N.J. ; Weir, D.R. ; Wilson, J.G. ; Wong, T.Y. ; Zeggini, E. ; Zonderman, A.B. ; Rotter, J.I. ; Morris, A.P. ; Boehnke, M. ; Florez, J.C. ; McCarthy, M.I. ; Meigs, J.B. ; Mahajan, A. ; Scott, R.A. ; Gloyn, A.L. ; Barroso, I.
Large-scale exome array summary statistics resources for glycemic traits to aid effector gene prioritization.Coupette, C. ; Dalleiger, S. ; Rieck, B.
Ollivier-Ricci cvurvature for hypergraphs: A unified framework.Becker, S. ; Klein, M. ; Neitz, A. ; Parascandolo, G. ; Kilbertus, N.
Predicting ordinary differential equations with transformers.Maalmi, H. ; Nguyen, B.H.P. ; Strom, A. ; Zaharia, O.P. ; Straßburger, K. ; Bönhof, G.J. ; Rathmann, W. ; Trenkamp, S. ; Burkart, V. ; Szendrödi, J. ; Menden, M.P. ; Ziegler, D. ; Roden, M. ; Herder, C.
Prediction of polyneuropathy in recent-onset diabetes: A machine learning algorithm using blood-based protein biomarkers and standard demographic and clinical features.Arnold, M. ; Buyukozkan, M. ; Doraiswamy, P.M. ; Nho, K. ; Wu, T. ; Gudnason, V. ; Launer, L.J. ; Wang-Sattler, R. ; Adamski, J. ; de Jager, P.L. ; Ertekin-Taner, N. ; Bennett, D.A. ; Saykin, A.J. ; Peters, A. ; Suhre, K. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Kastenmüller, G. ; Krumsiek, J.
Individual bioenergetic capacity as a potential source of resilience to Alzheimer's disease.Eichhorn, H. ; Hammernik, K. ; Epp, S.M. ; Karampinos, D.C. ; Schnabel, J.A. ; Preibisch, C.
Investigating the impact of motion and associated B0 changes on oxygenation sensitive MRI through realistic simulations.Bercea, C.-I. ; Wiestler, B. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A.
Generalizing Unsupervised Anomaly Detection: Towards Unbiased Pathology Screening.Klede, K. ; Altstidl, T. ; Zanca, D. ; Eskofier, B.M.
p-value Adjustment for Monotonous, Unbiased, and Fast Clustering Comparison.Scetbon, M. ; Klein, M. ; Palla, G. ; Cuturi, M.C.
Unbalanced Low-rank Optimal Transport Solvers.Kaissis, G. ; Ziller, A. ; Kolek, S. ; Riess, A. ; Rueckert, D.
Optimal privacy guarantees for a relaxed threat model: Addressing sub-optimal adversaries in differentially private machine learning.Southern, J. ; Wayland, J.D. ; Bronstein, M.D. ; Rieck, B.
Curvature Filtrations for Graph Generative Model Evaluation.Oexle, K. ; Reuster, T.
Anxiety.Klede, K. ; Altstidl, T. ; Zanca, D. ; Eskofier, B.M.
p-value adjustment for monotonous, unbiased, and fast clustering comparison.Meissen, F. ; Müller, P. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
Robust Detection Outcome: A Metric for Pathology Detection in Medical Images.Tan, H. ; Wang, W. ; Zhou, C. ; Wang, Y. ; Zhang, S. ; Yang, P. ; Guo, R. ; Chen, W. ; Zhang, J. ; Ye, L. ; Cui, Y. ; Ni, T. ; Zheng, K.
Single-cell RNA-seq uncovers dynamic processes orchestrated by RNA-binding protein DDX43 in chromatin remodeling during spermiogenesis.Theis, F.J. ; Dar, D. ; Vento-Tormo, R. ; Vicković, S. ; Wang, L. ; Kagohara, L.T. ; Rendeiro, A.F. ; Joyce, J.A.
What do you most hope spatial molecular profiling will help us understand? Part 1.Rathnayake, S.N.H. ; Ditz, B. ; Willemse, B.W.M. ; Timens, W. ; Kooistra, W. ; Heijink, I.H. ; Oliver, B.G.G. ; van den Berge, M. ; Faiz, A. ; National Heart, Lung, and Blood Institute LungMAP Consortium (Aliee, H.) ; National Heart, Lung, and Blood Institute LungMAP Consortium (Theis, F.J.)
Longitudinal effects of 1-year smoking cessation on human bronchial epithelial transcriptome.Richter, T. ; Schaar, A. ; Drummer, F. ; Liao, C.-W. ; Endres, L. ; Theis, F.J.
SpatialSSL: Whole-Brain Spatial Transcriptomics in the Mouse Brain with Self-Supervised Learning.Kaspar, L. ; Dony, L. ; Cruceanu, C. ; Binder, E.B. ; Theis, F.J.
Effects of glucocorticoid exposure on gene expression and cell fate specification in cerebral organoids.Vollstedt, E.J. ; Schaake, S. ; Lohmann, K. ; Padmanabhan, S. ; Brice, A. ; Lesage, S. ; Tesson, C. ; Vidailhet, M. ; Wurster, I. ; Hentati, F. ; Mirelman, A. ; Giladi, N. ; Marder, K. ; Waters, C. ; Fahn, S. ; Kasten, M. ; Brüggemann, N. ; Borsche, M. ; Foroud, T. ; Tolosa, E. ; Garrido, A. ; Annesi, G. ; Correia Guedes, L. ; Avenali, M. ; Petrucci, S. ; Clark, L. ; Fedotova, E.Y. ; Alvarez, V. ; Menéndez-González, M. ; Jesús Maestre, S. ; Gómez-Garre, P. ; Mir, P. ; Belin, A.C. ; Jankovic, J. ; Nishioka, K. ; Funayama, M. ; Clarimõn, J. ; Williams-Gray, C.H. ; Camacho, M. ; Cornejo-Olivas, M. ; Torres-Ramirez, L. ; Wu, Y.R. ; Lee-Chen, G.J. ; Morgadinho, A. ; Pulkes, T. ; Puschmann, A. ; Mellick, G.D. ; Dorszewska, J. ; Carr, J. ; Ferese, R. ; Gambardella, S. ; Chase, B. ; Markopoulou, K. ; Satake, W. ; Toda, T. ; Rossi, M. ; Merello, M. ; Lynch, T. ; Olszewska, D.A. ; Lim, S.Y. ; Ahmad-Annuar, A. ; Ertan, S. ; Genç, G. ; de Carvalho Aguiar, P. ; Barkhuizen, M. ; Pimentel, M.M.G. ; Saunders-Pullman, R. ; van de Warrenburg, B. ; Bressman, S. ; Toft, M. ; Appel-Cresswell, S. ; Lang, A.E. ; Škorvánek, M. ; Boon, A.J.W. ; Krüger, R. ; Sammler, E.M. ; Tumas, V. ; Winkelmann, J. ; Damásio, J. ; Klivényi, P. ; Hattori, N. ; Illarioshkin, S.N. ; Klein, C.
Embracing monogenic Parkinson's disease: The MJFF global genetic PD cohort.Frenz-Wiessner, S. ; Fairley, S. ; Buser, M. ; Goek, I. ; Salewskij, K. ; Jonsson, G. ; zu Putlitz, B. ; Petersheim, D. ; Illig, D. ; Li, Y. ; Chen, P. ; Kalauz, M. ; Conca, R. ; Sterr, M. ; Geuder, J. ; Mizoguchi, Y. ; Kotlarz, D. ; Rudelius, M. ; Penninger, J.M. ; Marr, C. ; Klein, C.
Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Bone Marrow Organoids to Model Hematopoietic Development.Castelblanco, A. ; Matzeu, G. ; Ruggeri, E. ; Omenetto, F.G. ; Hilgendorff, A. ; Schnabel, J.A. ; Schubert, B.
Colorimetric Sensor Reading and Illumination Correction via Multi-Task Deep-Learning.Sideri-Lampretsa, V. ; Zimmer, V.A. ; Qiu, H. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
MAD: Modality Agnostic Distance Measure for Image Registration.Li, J.H. ; Brenner, L.N. ; Kaur, V. ; Figueroa, K. ; Schroeder, P. ; Huerta-Chagoya, A. ; Udler, M.S. ; Leong, A. ; MAGIC Investigators (Grallert, H. ; Zeggini, E. ; Peters, A. ; Schwarz, P.E.)
Genome-wide association analysis identifies ancestry-specific genetic variation associated with acute response to metformin and glipizide in SUGAR-MGH.Oertel, W.H. ; Müller, H.H. ; Unger, M.M. ; Schade-Brittinger, C. ; Balthasar, K. ; Articus, K. ; Brinkman, M. ; Venuto, C.S. ; Tracik, F. ; Eberling, J. ; Eggert, K.M. ; Kamp, C. ; Kieburtz, K. ; Boyd, J.T.
Transdermal nicotine treatment and progression of early Parkinson's disease.Bani-Harouni, D. ; Mueller, T.T. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Gradient Self-alignment in Private Deep Learning.Hölzl, F.A. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Equivariant Differentially Private Deep Learning: Why DP-SGD Needs Sparser Models.Nasirigerdeh, R. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Utility-preserving federated learning.Chobola, T. ; Usynin, D. ; Kaissis, G.
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An integrated single-cell islet atlas in health and disease.Sikkema, L. ; Luecken, M.
A cellular reference atlas of the human lung.Feiner, L.F. ; Menten, M.J. ; Hammernik, K. ; Hager, P. ; Huang, W. ; Rueckert, D. ; Braren, R.F. ; Kaissis, G.
Propagation and attribution of uncertainty in medical imaging pipelines.Indelicato, E. ; Boesch, S. ; Havránková, P. ; Příhodová, I. ; Winkelmann, J. ; Jech, R. ; Zech, M.
SOXopathies and dystonia: Consolidation of a recurrent association.Morris, C. ; Lipman, Y. ; Maron, H. ; Rieck, B. ; Kriege, N.M. ; Grohe, M. ; Fey, M. ; Borgwardt, K.
Weisfeiler and Leman go Machine Learning: The Story so far.Zugarini, A. ; Rothenbacher, T. ; Klede, K. ; Ernandes, M. ; Eskofier, B.M. ; Zanca, D.
Die Rätselrevolution: Automated German Crossword Solving.Gote-Schniering, J. ; Lehmann, M. ; Ansari, M. ; Wiedemann, K. ; Melo-Narváez, M.C ; Steinchen, C. ; Jentzsch, R.C. ; Mayr, C. ; Chen, Y. ; Lang, N. ; Agami, A. ; Angelidis, I. ; Zhou, S. ; Koenigshoff, M. ; Theis, F.J. ; Schiller, H.B.
Spatiotemporal analysis of inflammaging and senescence programs in lung fibrosis using time-resolved single-cell transcriptomics and multiplexed immunofluorescence.De Sadeleer, L.J. ; Chen, Y. ; Jentzsch, R.C. ; Wang, Z. ; Qazi, N. ; Lang, N.J. ; Albanese, P. ; Jankevics, A. ; Theis, F.J. ; Scheltema, R.A. ; Wuyts, W.A. ; Gote-Schniering, J. ; Schiller, H. B.
Evolution of epithelial-mesenchymal cell circuits in the progression of pulmonary fibrosis.Chen, Y. ; Schniering, J. ; Müller, M. ; Albanese, P. ; Jankevics, A. ; Jentzsch, R.C. ; Tata, A. ; Ansari, M. ; De Sadeleer, L.J. ; Yang, L. ; Heumos, L. ; Agami, A. ; Zhou, S. ; Mayr, C. ; Hatz, R. ; Schneider, C.P. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Stoleriu, M.G. ; Dorfmueller, P. ; Theis, F.J. ; Tata, P.R. ; Luecken, M. ; Scheltema, R.A. ; Schiller, H. B.
A spatially resolved extracellular matrix proteome atlas of the distal human lung.Eichhorn, H. ; Hammernik, K. ; Spieker, V. ; Epp, S.M. ; Rueckert, D. ; Preibisch, C. ; Schnabel, J.A.
Physics-Aware Motion Simulation For T2*-Weighted Brain MRI.Huguet, G. ; Tong, A.Z. ; Rieck, B. ; Huang, J. ; Kuchroo, M. ; Hirn, M. ; Wolf, G. ; Krishnaswamy, S.
Time-inhomogeneous diffusion geometry and topology.Jonsson, B.F. ; Follett, C.L. ; Bien, J. ; Dutkiewicz, S. ; Hyun, S. ; Kulk, G. ; Forget, G.L. ; Müller, C.L. ; Racault, M.F. ; Hill, C.N. ; Jackson, T. ; Sathyendranath, S.
Using Probability Density Functions to Evaluate Models (PDFEM, v1.0) to compare a biogeochemical model with satellite-derived chlorophyll.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
Solvability of some Fredholm integro-differential equations with mixed diffusion in a square.Mueller, T.T. ; Paetzold, J.C. ; Prabhakar, C. ; Usynin, D. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Differentially private graph neural networks for whole-graph classification.Adebanji, A.O. ; Aschl, F. ; Chumo, E.C. ; Owiredu, E.O. ; Müller, J. ; Mbegalo, T.
Social response and measles dynamics.Platz, L.I. ; Knollmüller, J. ; Arras, P. ; Frank, P. ; Reinecke, M. ; Jüstel, D. ; Enßlin, T.A.
Multicomponent imaging of the Fermi gamma-ray sky in the spatio-spectral domain.Efendiyev, M.A. ; Sengul, T. ; Tiryakioglu, B.
Two approaches to instability analysis of the viscous Burgers' equation.Krenn, M. ; Wagner, M. ; Zulehner, G. ; Weng, R. ; Jäger, F. ; Keritam, O. ; Sener, M. ; Brücke, C. ; Milenkovic, I. ; Langer, A. ; Buchinger, D. ; Habersam, R. ; Mayerhanser, K. ; Brugger, M. ; Brunet, T. ; Jacob, M. ; Graf, E. ; Berutti, R. ; Cetin, H. ; Hoefele, J. ; Winkelmann, J. ; Zimprich, F. ; Rath, J.
Next-generation sequencing and comprehensive data reassessment in 263 adult patients with neuromuscular disorders: Insights into the gray zone of molecular diagnoses.Asani, B. ; Horlava, N. ; Spitzer, H. ; Theis, F.J. ; Priglinger, S. ; Schiefelbein, J.
Predicting OCT-morphological anti-VEGF treatment response in patients with neovascular age-related degeneration using artificial intelligence.Schiefelbein, J. ; Horlava, N. ; Spitzer, H. ; Theis, F.J. ; Priglinger, S. ; Asani, B.
New OCT based definition of treatment response to anti-VEGF in treatment naive neovascular AMD patients using an Deep Learning Algorithm.Li, J. ; Wang, J. ; Cheng, X. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Luecken, M. ; Liang, Q. ; Theis, F.J. ; Deangelis, M.M. ; Li, Y. ; Chen, R.
Single cell atlas of the human retina.van der Garde, M. ; Thomas, M. ; Riviere, J. ; Figueredo, A.N. ; Hecker, J. ; Metzeler, K. ; Marr, C. ; Goetze, K.
Multiomic analysis of chip bone marrow hematopoietic stem/progenitor cells reveals potential early stage of malignancy.Pukaj, A. ; Bader, J. ; Makarov, C. ; Richter, S. ; Friederike, H. ; Theis, F.J. ; Mann, M. ; Hemmer, B. ; Gasperi, C.
A genetic association study identifying cis protein quantitative trait loci in patients with MS.Tanida, T. ; Müller, P. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
Interactive and xxplainable region-guided radiology report generation.Jing, H. ; Ge, H. ; Tang, H. ; Farnoud, A. ; Saidul Islam, M. ; Wang, L. ; Wang, C. ; Cui, X.
Assessing airflow unsteadiness in the human respiratory tract under different expiration conditions.Sobczyk, M.K. ; Faber, B.G. ; Southam, L. ; Frysz, M. ; Hartley, A. ; Zeggini, E. ; Tang, H. ; Gaunt, T.R.
Causal relationships between anthropometric traits, bone mineral density, osteoarthritis and spinal stenosis: A Mendelian randomisation investigation.Mairhörmann, B. ; Castelblanco, A. ; Häfner, F. ; Koliogiannis, V. ; Haist, L. ; Winter, D. ; Flemmer, A.W. ; Ehrhardt, H. ; Stöcklein, S. ; Dietrich, O. ; Förster, K. ; Hilgendorff, A. ; Schubert, B.
Automated MRI lung segmentation and 3D morphologic features for quantification of neonatal lung disease.Müller, P. ; de la Cuesta-Zuluaga, J. ; Kuhn, M. ; Baghai Arassi, M. ; Treis, T. ; Blasche, S. ; Zimmermann, M. ; Bork, P. ; Patil, K.R. ; Typas, A. ; Garcia-Santamarina, S. ; Maier, L.A.
High-throughput anaerobic screening for identifying compounds acting against gut bacteria in monocultures or communities.Eckardt, F. ; Mittas, R. ; Horlava, N. ; Schiefelbein, J. ; Asani, B. ; Michalakis, S. ; Gerhardt, M. ; Priglinger, C. ; Keeser, D. ; Koutsouleris, N. ; Priglinger, S. ; Theis, F.J. ; Peng, T. ; Schworm, B.
Deep Learning based retinal layer segmentation in optical coherence tomography scans of patients with inherited retinal diseases.Lang, N.J. ; Schniering, J. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Yang, L. ; De Sadeleer, L.J. ; Jentzsch, R.C. ; Shitov, V.A. ; Zhou, S. ; Ansari, M. ; Agami, A. ; Mayr, C. ; Hooshiar Kashani, B. ; Chen, Y. ; Heumos, L. ; Pestoni, J. ; Molnar, E.S. ; Geeraerts, E. ; Anquetil, V. ; Saniere, L. ; Wögrath, M. ; Gerckens, M. ; Lehmann, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Hatz, R.A. ; Kneidinger, N. ; Behr, J. ; Wuyts, W.A. ; Stoleriu, M.-G. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Burgstaller, G. ; Schiller, H. B.
Ex vivo tissue perturbations coupled to single-cell RNA-seq reveal multilineage cell circuit dynamics in human lung fibrogenesis.Chen, T. ; Wang, L. ; Xie, G. ; Kristal, B.S. ; Zheng, X. ; Sun, T. ; Arnold, M. ; Louie, G. ; Li, M. ; Wu, L. ; MahmoudianDehkordi, S. ; Sniatynski, M.J. ; Borkowski, K. ; Guo, Q. ; Kuang, J. ; Wang, J. ; Nho, K. ; Ren, Z. ; Kueider-Paisley, A. ; Blach, C. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Jia, W.
Serum bile acids improve prediction of Alzheimer's progression in a sex-dependent manner.Maroofian, R. ; Zamani, M. ; Kaiyrzhanov, R. ; Liebmann, L. ; Ghayoor Karimiani, E. ; Vona, B. ; Huebner, A.K. ; Calame, D.G. ; Misra, V.K. ; Sadeghian, S. ; Azizimalamiri, R. ; Mohammadi, M.H. ; Zeighami, J. ; Heydaran, S. ; Beiraghi Toosi, M. ; Akhondian, J. ; Babaei, M. ; Hashemi, N. ; Schnur, R.E. ; Suri, M. ; Setzke, J. ; Wagner, M. ; Brunet, T. ; Grochowski, C.M. ; Emrick, L. ; Chung, W.K. ; Hellmich, U.A. ; Schmidts, M. ; Lupski, J.R. ; Galehdari, H. ; Severino, M. ; Houlden, H. ; Hübner, C.A.
Biallelic variants in SLC4A10 encoding the sodium-dependent chloride-bicarbonate exchanger NCBE lead to a neurodevelopmental disorder.Scheller, I.F. ; Lutz, K. ; Mertes, C. ; Yépez, V.A. ; Gagneur, J.
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pyPESTO: A modular and scalable tool for parameter estimation for dynamic models.Okolie, A. ; Müller, J. ; Kretzschmar, M.
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Explainable machine learning for profiling the immunological synapse and functional characterization of therapeutic antibodies.Doster, T. ; Emerson, T. ; Kvinge, H. ; Miolane, N. ; Papillon, M. ; Rieck, B. ; Sanborn, S.
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Refinement and usability analysis of an eHealth app for ankylosing spondylitis as a complementary treatment to physical therapy: Development and Usability study.Kos, A. ; Lopez, J.P. ; Bordes, J. ; De Donno, C. ; Dine, J. ; Brivio, E. ; Karamihalev, S. ; Luecken, M. ; Almeida-Correa, S. ; Gasperoni, S. ; Dick, A. ; Miranda, L. ; Büttner, M. ; Stoffel, R. ; Flachskamm, C. ; Theis, F.J. ; Schmidt, M.V. ; Chen, A.
Early life adversity shapes social subordination and cell type-specific transcriptomic patterning in the ventral hippocampus.COVID-19 Host Genetics Initiative (Schulte, E.C. ; Protzer, U. ; Müller, N.S.)
A second update on mapping the human genetic architecture of COVID-19.Monfrini, E. ; Avanzino, L. ; Palermo, G. ; Bonato, G. ; Brescia, G. ; Ceravolo, R. ; Cantarella, G. ; Mandich, P. ; Prokisch, H. ; Storm van's Gravesande, K. ; Straccia, G. ; Elia, A.E. ; Reale, C. ; Panteghini, C. ; Zorzi, G. ; Eleopra, R. ; Erro, R. ; Carecchio, M. ; Garavaglia, B. ; Zech, M. ; Romito, L. ; Di Fonzo, A.
Dominant VPS16 pathogenic variants: Not only isolated dystonia.Giunti, B. ; Rieck, B.
DONUT: Creation, development, and opportunities of a database.Debus, C. ; Piraud, M. ; Streit, A. ; Theis, F.J. ; Götz, M.
Reporting electricity consumption is essential for sustainable AI.Karlas, A. ; Katsouli, N. ; Fasoula, N.-A. ; Bariotakis, M. ; Chlis, N.-K. ; Omar, M. ; He, H. ; Iakovakis, D. ; Schäffer, C. ; Kallmayer, M. ; Füchtenbusch, M. ; Ziegler, A.-G. ; Eckstein, H.H. ; Hadjileontiadis, L.J. ; Ntziachristos, V.
Dermal features derived from optoacoustic tomograms via machine learning correlate microangiopathy phenotypes with diabetes stage.Gippert, S. ; Wagner, M. ; Brunet, T. ; Berruti, R. ; Brugger, M. ; Schwaibold, E.M.C. ; Haack, T.B. ; Hoffmann, G.F. ; Bettendorf, M. ; Choukair, D.
Exome sequencing (ES) of a pediatric cohort with chronic endocrine diseases: A single-center study (within the framework of the TRANSLATE-NAMSE project).Jing, H. ; Ge, H. ; Wang, L. ; Choi, S. ; Farnoud, A. ; An, Z. ; Lai, W. ; Cui, X.
Investigating unsteady airflow characteristics in the human upper airway based on the clinical inspiration data.Spieker, V. ; Eichhorn, H. ; Hammernik, K. ; Rueckert, D. ; Preibisch, C. ; Karampinos, D.C. ; Schnabel, J.A.
Deep Learning for Retrospective Motion Correction in MRI: A Comprehensive Review.Schmidt, S. ; Stautner, C. ; Vu, D.T. ; Heinz, A. ; Regensburger, M. ; Karayel, O. ; Trümbach, D. ; Artati, A. ; Kaltenhäuser, S. ; Nassef, M.Z. ; Hembach, S. ; Steinert, L. ; Winner, B. ; Jürgen, W. ; Jastroch, M. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Westmeyer, G.G. ; Adamski, J. ; Mann, M. ; Hiller, K. ; Giesert, F. ; Vogt Weisenhorn, D.M. ; Wurst, W.
A reversible state of hypometabolism in a human cellular model of sporadic Parkinson's disease.Taheri, M.H. ; Askari, N. ; Feng, Y. ; Nabaei, M. ; Islam, M.S. ; Farnoud, A. ; Cui, X.
Swirling flow and capillary diameter effect on the performance of an active dry powder inhalers.Corda-D'Incan, G. ; Schnabel, J.A. ; Hammers, A. ; Reader, A.J.
Single-modality supervised joint PET-MR image reconstruction.Florian, K. ; Benet-Pages, A. ; Berner, D. ; Teubert, A. ; Eck, S. ; Arnold, N. ; Bauer, P. ; Begemann, M. ; Sturm, M. ; Kleinle, S. ; Haack, T.B. ; Eggermann, T.
Quality assurance within the context of genome diagnostics (a german perspective).Efendiyev, M.A.
Linear and nonlinear non-Fredholm operators: Theory and applications.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
On the solvability of some systems of integro-differential equations with transport and concentrated sources.Dehner, C. ; Zahnd, G. ; Ntziachristos, V. ; Jüstel, D.
A deep neural network for real-time optoacoustic image reconstruction with adjustable speed of sound.Enz, B.M. ; Engelmann, J.P. ; Lohmann, U.
Use of threshold parameter variation for tropical cyclone tracking.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
Solvability in the sense of sequences for some non-Fredholm operators with the logarithmic Laplacian.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
Solvability in the sense of sequences for some logarithmic Schrödinger operators in higher dimensions.Madni, H.A. ; Umer, R.M. ; Foresti, G.L.
Blockchain-based swarm learning for the mitigation of gradient leakage in federated learning.Wang, D. ; Rausch, C. ; Buerger, S.A. ; Tschuri, S. ; Rothenberg-Thurley, M. ; Schulz, M. ; Hasenauer, J. ; Ziemann, F. ; Metzeler, K.H. ; Marr, C.
Modeling early treatment response in AML from cell-free tumor DNA.Sadafi, A. ; Hehr, M. ; Navab, N. ; Marr, C.
A Study of Age and Sex Bias in Multiple Instance Learning Based Classification of Acute Myeloid Leukemia Subtypes.Liu, Y. ; Müller, G. ; Navab, N. ; Marr, C. ; Huisken, J. ; Peng, T.
BigFUSE: Global Context-Aware Image Fusion in Dual-View Light-Sheet Fluorescence Microscopy with Image Formation Prior.von Rohrscheidt, J.C. ; Rieck, B.
Topological Singularity Detection at Multiple Scales.Nissen, M. ; Barrios Campo, N. ; Flaucher, M. ; Jaeger, K.M. ; Titzmann, A. ; Blunck, D. ; Fasching, P.A. ; Engelhardt, V. ; Eskofier, B.M. ; Leutheuser, H.
Prevalence and course of pregnancy symptoms using self-reported pregnancy app symptom tracker data.Tran, M. ; Lahiani, A. ; Dicente Cid, Y. ; Boxberg, M. ; Lienemann, P. ; Matek, C. ; Wagner, S. ; Theis, F.J. ; Klaiman, E. ; Peng, T.
B-Cos Aligned Transformers Learn Human-Interpretable Features.Alhoori, H. ; Fox, E.A. ; Frommholz, I. ; Liu, H. ; Coupette, C. ; Rieck, B. ; Ghosal, T. ; Wu, J.
Who can Submit an Excellent Review for this Manuscript in the Next 30 Days? - Peer Reviewing in the Age of Overload.Sidulova, M. ; Sun, X. ; Gossmann, A.
Deep Unsupervised Clustering for Conditional Identification of Subgroups Within a Digital Pathology Image Set.Khalili Param, H. ; Tofighian, H. ; Mokhlesabadi, M. ; Nabaei, M. ; Farnoud, A.
Targeted drug delivery during radioembolization in a comprehensive hepatic artery system: A computational study.Huth, M. ; Arruda, J. ; Gusinow, R. ; Contento, L. ; Tacconelli, E. ; Hasenauer, J.
Accessibility of covariance information creates vulnerability in Federated Learning frameworks.Schmidt, N. ; Ganskih, S. ; Wei, Y. ; Gabel, A. ; Zielinski, S. ; Keshishian, H. ; Lareau, C.A. ; Zimmermann, L. ; Makroczyova, J. ; Pearce, C. ; Krey, K. ; Hennig, T. ; Stegmaier, S. ; Moyon, L. ; Horlacher, M. ; Werner, S. ; Aydin, J. ; Olguin-Nava, M. ; Potabattula, R. ; Kibe, A. ; Dölken, L. ; Smyth, R.P. ; Caliskan, N. ; Marsico, A. ; Krempl, C. ; Bodem, J. ; Pichlmair, A. ; Carr, S.A. ; Chlanda, P. ; Erhard, F. ; Munschauer, M.
SND1 binds SARS-CoV-2 negative-sense RNA and promotes viral RNA synthesis through NSP9.Swoboda, A.S. ; Arfelli, V.C. ; Danese, A. ; Windisch, R. ; Kerbs, P. ; Redondo Monte, E. ; Bagnoli, J.W. ; Chen-Wichmann, L. ; Caroleo, A. ; Cusan, M. ; Krebs, S. ; Blum, H. ; Sterr, M. ; Enard, W. ; Herold, T. ; Colomé-Tatché, M. ; Wichmann, C. ; Greif, P.A.
CSF3R T618I collaborates With RUNX1-RUNX1T1 to expand hematopoietic progenitors and sensitizes to GLI inhibition.von der Emde, L. ; Mallwitz, M. ; Vaisband, M. ; Hasenauer, J. ; Saßmannshausen, M. ; Terheyden, J.H. ; Sloan, K.R. ; Schmitz-Valckenberg, S. ; Finger, R.P. ; Holz, F.G. ; Ach, T.
Retest variability and patient reliability indices of quantitative fundus autofluorescence in age-related macular degeneration: Aa MACUSTAR study report.Kühnel, A. ; Hagenberg, J. ; Knauer-Arloth, J. ; Ködel, M. ; Czisch, M. ; Sämann, P.G. ; Binder, E.B. ; Kroemer, N.B.
Stress-induced brain responses are associated with BMI in women.De Donno, C. ; Hediyeh-Zadeh, S. ; Moinfar, A.A. ; Wagenstetter, M. ; Zappia, L. ; Lotfollahi, M. ; Theis, F.J.
Population-level integration of single-cell datasets enables multi-scale analysis across samples.Frishberg, A. ; Milman, N. ; Alpert, A. ; Spitzer, H. ; Asani, B. ; Schiefelbein, J.B. ; Bakin, E. ; Regev-Berman, K. ; Priglinger, S.G. ; Schultze, J.L. ; Theis, F.J. ; Shen-Orr, S.S.
Reconstructing disease dynamics for mechanistic insights and clinical benefit.Kotsis, F. ; Bächle, H. ; Altenbuchinger, M. ; Dönitz, J. ; Njipouombe Nsangou, Y.A. ; Meiselbach, H. ; Kosch, R. ; Salloch, S. ; Bratan, T. ; Zacharias, H.U. ; Schultheiss, U.T.
Expectation of clinical decision support systems: A survey study among nephrologist end-users.Raimundez, E. ; Fedders, M. ; Hasenauer, J.
Posterior marginalization accelerates Bayesian inference for dynamical models of biological processes.Ntini, E. ; Budach, S. ; Vang Ørom, U.A. ; Marsico, A.
Genome-wide measurement of RNA dissociation from chromatin classifies transcripts by their dynamics and reveals rapid dissociation of enhancer lncRNAs.Loureiro, H. ; Kolben, T.M. ; Kiermaier, A. ; Rüttinger, D. ; Ahmidi, N. ; Becker, T. ; Bauer-Mehren, A.
Correlation between early trends of a prognostic biomarker and overall survival in non-small-cell lung cancer clinical trials.Chanou, A. ; Weiß, M. ; Holler, K. ; Sajid, A. ; Straub, T. ; Krietsch, J. ; Sanchi, A. ; Ummethum, H. ; Lee, C.S.K. ; Kruse, E. ; Trauner, M. ; Werner, M. ; Lalonde, M. ; Lopes, M. ; Scialdone, A. ; Hamperl, S.
Single molecule MATAC-seq reveals key determinants of DNA replication origin efficiency.Brechtmann, F. ; Bechtler, T. ; Londhe, S. ; Mertes, C. ; Gagneur, J.
Evaluation of input data modality choices on functional gene embeddings.Alamoudi, E. ; Schälte, Y. ; Müller, R. ; Starruß, J. ; Bundgaard, N. ; Graw, F. ; Brusch, L. ; Hasenauer, J.
FitMultiCell: simulating and parameterizing computational models of multi-scale and multi-cellular processes.Loureiro, H. ; Roller, A. ; Schneider, M. ; Talavera Lopez, C.N. ; Becker, T. ; Bauer-Mehren, A.
Matching by OS prognostic score to construct external controls in lung cancer clinical trials.Spitzer, H. ; Ripart, M. ; Fawaz, A. ; Williams, L.Z.J. ; Robinson, E.C. ; Iglesias, J.E. ; Adler, S. ; Wagstyl, K.
Robust and Generalisable Segmentation of Subtle Epilepsy-Causing Lesions: A Graph Convolutional Approach.Ratajczak, F. ; Joblin, M. ; Hildebrandt, M. ; Ringsquandl, M. ; Falter-Braun, P. ; Heinig, M.
Speos: An ensemble graph representation learning framework to predict core gene candidates for complex diseases.Costeira, R. ; Evangelista, L. ; Wilson, R. ; Yan, X. ; Hellbach, F. ; Sinke, L. ; Christiansen, C. ; Villicaña, S. ; Masachs, O.M. ; Tsai, P.C. ; Mangino, M. ; Menni, C. ; Berry, S.E. ; Beekman, M. ; van Heemst, D. ; Slagboom, P.E. ; Heijmans, B.T. ; Suhre, K. ; Kastenmüller, G. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Small, K.S. ; Linseisen, J. ; Waldenberger, M. ; Bell, J.T.
Metabolomic biomarkers of habitual B vitamin intakes unveil novel differentially methylated positions in the human epigenome.Sánchez Quant, E.S. ; Richter, M. ; Colomé-Tatché, M. ; Martinez Jimenez, C.P.
Single-cell metabolic profiling reveals subgroups of primary human hepatocytes with heterogeneous responses to drug challenge.Häfner, F. ; Kindt, A.S.D. ; Strobl, K. ; Forster, K. ; Heydarian, M. ; Gonzalez-Rodriguez, E. ; Schubert, B. ; Kraus, Y. ; Robert, D.P. ; Flemmer, A.W. ; Ertl-Wagner, B. ; Dietrich, O. ; Stoecklein, S. ; Tello, K. ; Hilgendorff, A.
MRI pulmonary artery flow detects lung vascular pathology in preterms with lung disease.Ori, C. ; Ansari, M. ; Angelidis, I. ; Olmer, R. ; Martin, U. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B. ; Drukker, M.
Human pluripotent stem cell fate trajectories toward lung and hepatocyte progenitors.Chan, E. ; O’Hanlon, C. ; Marquez, C.A. ; Petalcorin, M. ; Mariscal-Harana, J. ; Gu, H. ; Kim, R.J. ; Judd, R.M. ; Chowienczyk, P.J. ; Schnabel, J.A. ; Razavi, R. ; King, A.P. ; Ruijsink, B. ; Puyol-Antón, E.
Automated quality controlled analysis of 2D phase contrast cardiovascular magnetic resonance imaging.Bercea, C.-I. ; Wiestler, B. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A.
Reversing the Abnormal: Pseudo-Healthy Generative Networks for Anomaly Detection.Bercea, C.-I. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A.
What Do AEs Learn? Challenging Common Assumptions in Unsupervised Anomaly Detection.Bercea, C.-I. ; Puyol-Antón, E. ; Wiestler, B. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A. ; King, A.P.
Bias in Unsupervised Anomaly Detection in Brain MRI.Lang, D. ; Schwartz, E. ; Bercea, C.-I. ; Giryes, R. ; Schnabel, J.A.
Multispectral 3D Masked Autoencoders for Anomaly Detection in Non-Contrast Enhanced Breast MRI.Mueller, T.T. ; Zhou, S. ; Starck, S. ; Jungmann, F. ; Ziller, A. ; Aksoy, O. ; Movchan, D. ; Braren, R. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
Body Fat Estimation from Surface Meshes Using Graph Neural Networks.Silvaieh, S. ; König, T. ; Wurm, R. ; Parvizi, T. ; Berger-Sieczkowski, E. ; Goeschl, S. ; Hotzy, C. ; Wagner, M. ; Berutti, R. ; Sammler, E. ; Stogmann, E. ; Zimprich, A.
Comprehensive genetic screening of early-onset dementia patients in an Austrian cohort-suggesting new disease-contributing genes.Thomsen, M. ; Lange, L.M. ; Zech, M. ; Lohmann, K.
Genetics and pathogenesis of dystonia.Thiels, C. ; Lücke, T. ; Rothoeft, T. ; Lukas, C. ; Nguyen, H.P. ; von Kleist-Retzow, J.C. ; Prokisch, H. ; Grimmel, M. ; Haack, T. ; Hoffjan, S.
ACOX1 gain-of-function variant in two German pediatric patients, in one case mimicking autoimmune inflammatory disease.Brunet, T. ; Zott, B. ; Lieftüchter, V. ; Lenz, D. ; Schmidt, A. ; Peters, P. ; Kopajtich, R. ; Zaddach, M. ; Zimmermann, H. ; Hüning, I. ; Ballhausen, D. ; Staufner, C. ; Bianzano, A. ; Hughes, J. ; Taylor, R.W. ; McFarland, R. ; Devlin, A. ; Mihaljevic, M. ; Barišić, N. ; Rohlfs, M. ; Wilfling, S. ; Sondheimer, N. ; Hewson, S. ; Marinakis, N.M. ; Kosma, K. ; Traeger-Synodinos, J. ; Elbracht, M. ; Begemann, M. ; Trepels-Kottek, S. ; Hasan, D. ; Scala, M. ; Capra, V. ; Zara, F. ; van der Ven, A.T. ; Driemeyer, J. ; Apitz, C. ; Kramer, J. ; Strong, A. ; Hakonarson, H. ; Watson, D. ; Mayr, J.A. ; Prokisch, H. ; Meitinger, T. ; Borggraefe, I. ; Spiegler, J. ; Baric, I. ; Paolini, M. ; Gerstl, L. ; Wagner, M.
De novo variants in RNF213 are associated with a clinical spectrum ranging from Leigh syndrome to early-onset stroke.Lenz, D. ; Schlieben, L.D. ; Shimura, M. ; Bianzano, A. ; Smirnov, D. ; Kopajtich, R. ; Berutti, R. ; Adam, R. ; Aldrian, D. ; Baric, I. ; Baumann, U. ; Bozbulut, N.E. ; Brugger, M. ; Brunet, T. ; Bufler, P. ; Burnyte, B. ; Calvo, P.L. ; Crushell, E. ; Dalgıç, B. ; Das, A.M. ; Dezsőfi, A. ; Distelmaier, F. ; Fichtner, A. ; Freisinger, P. ; Garbade, S.F. ; Gaspar, H. ; Goujon, L. ; Hadzic, N. ; Hartleif, S. ; Hegen, B. ; Hempel, M. ; Henning, S. ; Hoerning, A. ; Houwen, R. ; Hughes, J. ; Iorio, R. ; Iwanicka-Pronicka, K. ; Jankofsky, M. ; Junge, N. ; Kanavaki, I. ; Kansu, A. ; Kaspar, S. ; Kathemann, S. ; Kelly, D. ; Kırsaçlıoğlu, C.T. ; Knoppke, B. ; Kohl, M. ; Kölbel, H. ; Kolker, S. ; Konstantopoulou, V. ; Krylova, T. ; Kuloglu, Z. ; Kuster, A. ; Laass, M.W. ; Lainka, E. ; Lurz, E. ; Mandel, H. ; Mayerhanser, K. ; Mayr, J.A. ; McKiernan, P. ; McLean, P. ; McLin, V. ; Mention, K. ; Müller, H. ; Pasquier, L. ; Pavlov, M. ; Pechatnikova, N. ; Peters, B. ; Petkovic Ramadža, D. ; Piekutowska-Abramczuk, D. ; Pilic, D. ; Rajwal, S. ; Rock, N. ; Roetig, A. ; Santer, R. ; Schenk, W. ; Semenova, N. ; Sokollik, C. ; Sturm, E. ; Taylor, R.W. ; Tschiedel, E. ; Urbonas, V. ; Urreizti, R. ; Vermehren, J. ; Vockley, J. ; Vogel, G.F. ; Wagner, M. ; van der Woerd, W. ; Wortmann, S. ; Zakharova, E. ; Hoffmann, G.F. ; Meitinger, T. ; Murayama, K. ; Staufner, C. ; Prokisch, H.
Genetic landscape of pediatric acute liver failure of indeterminate origin.Indelicato, E. ; Boesch, S. ; Mencacci, N.E. ; Ghezzi, D. ; Prokisch, H. ; Winkelmann, J. ; Zech, M.
Dystonia in ATP synthase defects: Reconnecting mitochondria and dopamine.Gruber, T. ; Contreras, R. ; Sánchez Quant, E.S. ; Miok, V. ; Makris, K. ; Le Thuc, O. ; Gonzales García, I. ; Garcia-Clavé, E. ; Althammer, F. ; Krabichler, Q. ; DeCamp, L.M. ; Jones, R.G. ; Lutter, D. ; Williams, R.H. ; Pfluger, P.T. ; Müller, T.D. ; Woods, S.C. ; Pospisilik, J.A. ; Martinez-Jimenez, C.P. ; Tschöp, M.H. ; Grinevich, V. ; García-Cáceres, C.
High-calorie diets uncouple hypothalamic oxytocin neurons from a gut-to-brain satiation pathway via κ-opioid signaling.Li, Y. ; Sun, H. ; Fang, W. ; Ma, Q. ; Han, S. ; Wang-Sattler, R. ; Du, W. ; Yu, Q.
SURE: Screening unlabeled samples for reliable negative samples based on reinforcement learning.Gilly, A. ; Park, Y.-C. ; Tsafantakis, E. ; Karaleftheri, M. ; Dedoussis, G. ; Zeggini, E.
Genome-wide meta-analysis of 92 cardiometabolic protein serum levels.Kreitmaier, P. ; Park, Y.-C. ; Swift, D. ; Gilly, A. ; Wilkinson, J.M. ; Zeggini, E.
Epigenomic profiling of the infrapatellar fat pad in osteoarthritis.Sens, D. ; Sadafi, A. ; Casale, F.P. ; Navab, N. ; Marr, C.
BEL: A Bag Embedding Loss for Transformer Enhances Multiple Instance Whole Slide Image Classification.Waibel, D.J.E. ; Röell, E. ; Rieck, B. ; Giryes, R. ; Marr, C.
A Diffusion Model Predicts 3D Shapes from 2D Microscopy Images.Sadafi, A. ; Navab, N. ; Marr, C.
Active Learning Enhances Classification of Histopathology Whole Slide Images with Attention-Based Multiple Instance Learning.Nadimpalli, K.V. ; Chattopadhyay, A. ; Rieck, B.
Euler Characteristic Transform Based Topological Loss for Reconstructing 3D Images from Single 2D Slices.Sadafi, A. ; Adonkina, O. ; Khakzar, A. ; Lienemann, P. ; Hehr, M. ; Rueckert, D. ; Navab, N. ; Marr, C.
Pixel-Level Explanation of Multiple Instance Learning Models in Biomedical Single Cell Images.Wagner, S. ; Reisenbüchler, D. ; West, N.P. ; Niehues, J.M. ; Zhu, J. ; Foersch, S. ; Veldhuizen, G.P. ; Quirke, P. ; Grabsch, H.I. ; van den Brandt, P.A. ; Hutchins, G.G.A. ; Richman, S.D. ; Yuan, T. ; Langer, R. ; Jenniskens, J.C.A. ; Offermans, K. ; Mueller, W. ; Gray, R. ; Gruber, S.B. ; Greenson, J.K. ; Rennert, G. ; Bonner, J.D. ; Schmolze, D. ; Jonnagaddala, J. ; Hawkins, N.J. ; Ward, R.L. ; Morton, D. ; Seymour, M. ; Magill, L. ; Nowak, M. ; Hay, J. ; Koelzer, V.H. ; Church, D.N. ; Church, D. ; Domingo, E. ; Edwards, J. ; Glimelius, B. ; Gogenur, I. ; Harkin, A. ; Iveson, T. ; Jaeger, E. ; Kelly, C. ; Kerr, R. ; Maka, N. ; Morgan, H. ; Oien, K. ; Orange, C. ; Palles, C. ; Roxburgh, C. ; Sansom, O. ; Saunders, M. ; Tomlinson, I. ; Matek, C. ; Geppert, C. ; Peng, C. ; Zhi, C. ; Ouyang, X. ; James, J.A. ; Loughrey, M.B. ; Salto-Tellez, M. ; Brenner, H. ; Hoffmeister, M. ; Truhn, D. ; Schnabel, J.A. ; Boxberg, M. ; Peng, T. ; Kather, J.N.
Transformer-based biomarker prediction from colorectal cancer histology: A large-scale multicentric study.Khan, A.H. ; Umer, R.M. ; Dunnhofer, M. ; Micheloni, C. ; Martinel, N.
LBKENet: Lightweight Blur Kernel Estimation Network for Blind Image Super-Resolution.Sun, B.B. ; Chiou, J. ; Traylor, M. ; Benner, C. ; Hsu, Y.H. ; Richardson, T.G. ; Surendran, P. ; Mahajan, A. ; Robins, C. ; Vasquez-Grinnell, S.G. ; Hou, L. ; Kvikstad, E.M. ; Burren, O.S. ; Davitte, J. ; Ferber, K.L. ; Gillies, C.E. ; Hedman, A.K. ; Hu, S. ; Lin, T. ; Mikkilineni, R. ; Pendergrass, R.K. ; Pickering, C. ; Prins, B. ; Baird, D. ; Chen, C.Y. ; Ward, L.D. ; Deaton, A.M. ; Welsh, S. ; Willis, C.M. ; Lehner, N. ; Arnold, M. ; Wörheide, M. ; Suhre, K. ; Kastenmüller, G. ; Sethi, A. ; Cule, M. ; Raj, A. ; Kang, H.M. ; Burkitt-Gray, L. ; Melamud, E. ; Black, M.H. ; Fauman, E.B. ; Howson, J.M.M. ; McCarthy, M.I. ; Nioi, P. ; Petrovski, S. ; Scott, R.A. ; Smith, E.N. ; Szalma, S. ; Waterworth, D.M. ; Mitnaul, L.J. ; Szustakowski, J.D. ; Gibson, B.W. ; Miller, M.R. ; Whelan, C.D.
Plasma proteomic associations with genetics and health in the UK Biobank.Zamanian, A. ; Ahmidi, N. ; Drton, M.
Assessable and interpretable sensitivity analysis in the pattern graph framework for nonignorable missingness mechanisms.Henao, J. ; Lauber, M. ; Azevedo, M. ; Grekova, A. ; Theis, F.J. ; List, M. ; Ogris, C. ; Schubert, B.
Multi-omics regulatory network inference in the presence of missing data.Contento, L. ; Stapor, P. ; Weindl, D. ; Hasenauer, J.
A More Expressive Spline Representation for SBML Models Improves Code Generation Performance in AMICI.Ramakrishnan, A. ; Symeonidi, A. ; Hanel, P. ; Schmid, K.T. ; Richter, M.L. ; Schubert, M. ; Colomé-Tatché, M.
epiAneufinder identifies copy number alterations from single-cell ATAC-seq data.John, S. ; Müller, J.
Age structure, replicator equation, and the prisoner's dilemma.Hrovatin, K. ; Bastidas-Ponce, A. ; Bakhti, M. ; Zappia, L. ; Büttner, M. ; Salinno, C. ; Sterr, M. ; Böttcher, A. ; Migliorini, A. ; Lickert, H. ; Theis, F.J.
Delineating mouse β-cell identity during lifetime and in diabetes with a single cell atlas.Arcego, D.M. ; Buschdorf, J.P. ; O'Toole, N. ; Wang, Z. ; Barth, B. ; Pokhvisneva, I. ; Rayan, N.A. ; Patel, S. ; de Mendonça Filho, E.J. ; Lee, P. ; Tan, J. ; Koh, M.X. ; Sim, C.M. ; Parent, C. ; de Lima, R.M.S. ; Clappison, A. ; O'Donnell, K.J. ; Dalmaz, C. ; Arloth, J. ; Provençal, N. ; Binder, E.B. ; Diorio, J. ; Silveira, P.P. ; Meaney, M.J.
A glucocorticoid-sensitive hippocampal gene network moderates the impact of early life adversity on mental health outcomes.Rodemann, J. ; Goschenhofer, J. ; Dorigatti, E. ; Nagler, T. ; Augustin, T.
Approximately Bayes-Optimal Pseudo-Label Selection.Ohnmacht, A. ; Stahler, A. ; Stintzing, S. ; Modest, D.P. ; Holch, J.W. ; Westphalen, C.B. ; Hölzel, L. ; Schübel, M.K. ; Galhoz, A. ; Farnoud, A. ; Ud-Dean, M. ; Vehling-Kaiser, U. ; Decker, T. ; Moehler, M. ; Heinig, M. ; Heinemann, V. ; Menden, M.P.
The Oncology Biomarker Discovery framework reveals cetuximab and bevacizumab response patterns in metastatic colorectal cancer.Gentilotti, E. ; Gorska, A. ; Tami, A. ; Gusinow, R. ; Mirandola, M. ; Rodríguez Baño, J. ; Palacios Baena, Z.R. ; Rossi, E. ; Hasenauer, J. ; Lopes-Rafegas, I. ; Righi, E. ; Caroccia, N. ; Cataudella, S. ; Pasquini, Z. ; Osmo, T. ; Del Piccolo, L. ; Savoldi, A. ; Kumar-Singh, S. ; Mazzaferri, F. ; Caponcello, M.G. ; de Boer, G. ; Hara, G.L. ; Pinho Guedes, M.N. ; Maccarrone, G. ; Pezzani, M.D. ; Sibani, M. ; Davies, R.J. ; Vitali, S. ; Franchina, G. ; Tomassini, G. ; Sciammarella, C. ; Cecchetto, R. ; Gibellini, D. ; De Toffoli, C.K. ; Rosini, G. ; Perlini, C. ; Meroi, M. ; Puviani, F.C. ; Fasan, D. ; Micheletto, C. ; Montemezzi, S. ; Cardobi, N. ; Vantini, G. ; Mazzali, G. ; Stabile, G. ; Marcanti, M. ; Zonta, M.P. ; Calì, D. ; Mason, A. ; Gisondi, P. ; Mongardi, M. ; Sorbello, S. ; Wold, K.I. ; Vincenti-González, M.F. ; Veloo, A.C.M. ; Harmsma, V.P.R. ; Pantano, D. ; van der Meer, M. ; Gard, L. ; Lizarazo, E.F. ; Knoester, M. ; Friedrich, A.W. ; Niesters, H.G.M. ; Viale, P. ; Marzolla, D. ; Cosentino, F. ; Di Chiara, M. ; Fornaro, G. ; Bonazzetti, C. ; Tazza, B. ; Toschi, A. ; Vetamanu, O. ; Giacomini, M.E. ; Trapani, F. ; Marconi, L. ; Attard, L. ; Tedeschi, S. ; Gabrielli, L. ; Lazzarotto, T. ; Olivares, P. ; Castilla, J. ; Vélez, J. ; Almadana, V. ; Martín-Barrera, L. ; Martín-Gutiérrez, A.B. ; Gutiérrez-Campos, D. ; Fernández-Regaña, M. ; Silva-Campos, A. ; Fernández-Riejos, P. ; García-Sánchez, M.I. ; Giuliano, C.V. ; López, C. ; Neumann, G. ; Camporro, J. ; de Vedia, L. ; Agugliaro, H. ; Scipione, G. ; Dellacasa, C. ; Chandramouli, B.
Clinical phenotypes and quality of life to define post-COVID-19 syndrome: A cluster analysis of the multinational, prospective ORCHESTRA cohort.Polychronidou, M. ; Hou, J. ; Babu, M.M. ; Liberali, P. ; Amit, I. ; Deplancke, B. ; Lahav, G. ; Itzkovitz, S. ; Mann, M. ; Saez-Rodriguez, J. ; Theis, F.J. ; Eils, R.
Single-cell biology: What does the future hold?Rosowski, S. ; Remmert, C. ; Marder, M. ; Akishiba, M. ; Bushe, J. ; Feuchtinger, A. ; Platen, A. ; Ussar, S. ; Theis, F.J. ; Wiedenmann, S. ; Meier, M.
Single-cell characterization of neovascularization using hiPSC-derived endothelial cells in a 3D microenvironment.Jo, T. ; Kim, J. ; Bice, P. ; Huynh, K. ; Wang, T. ; Arnold, M. ; Meikle, P.J. ; Giles, C. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Saykin, A.J. ; Nho, K. ; Kueider-Paisley, A. ; Doraiswamy, P.M. ; Blach, C. ; Moseley, A. ; Thompson, W. ; St John-Williams, L. ; Mahmoudiandehkhordi, S. ; Tenenbaum, J. ; Welsh-Balmer, K. ; Plassman, B. ; Risacher, S.L. ; Alzheimer's Disease Metabolomics Consortium (ADMC) (Kastenmüller, G.) ; Han, X. ; Baillie, R. ; Knight, R. ; Dorrestein, P. ; Brewer, J. ; Mayer, E. ; Labus, J. ; Baldi, P. ; Gupta, A. ; Fiehn, O. ; Barupal, D. ; Meikle, P. ; Mazmanian, S. ; Rader, D. ; Kling, M. ; Shaw, L. ; Trojanowski, J. ; van Duijin, C. ; Nevado-Holgado, A. ; Bennett, D. ; Krishnan, R. ; Keshavarzian, A. ; Vogt, R. ; Ikram, A. ; Hankemeier, T. ; Price, N. ; Funk, C. ; Baloni, P. ; Jia, W. ; Wishart, D. ; Brinton, R. ; Chang, R. ; Farrer, L. ; Au, R. ; Qiu, W. ; Würtz, P. ; Koal, T. ; Mangravite, L. ; Suhre, K. ; Newman, J. ; Moreno, H. ; Foroud, T. ; Sacks, F. ; Jansson, J. ; Weiner, M.W. ; Aisen, P. ; Petersen, R. ; Jack, C.R. ; Jagust, W. ; Trojanowki, J.Q. ; Toga, A.W. ; Beckett, L. ; Green, R.C. ; Morris, J.C. ; Perrin, R.J. ; Shaw, L.M. ; Khachaturian, Z. ; Carrillo, M. ; Potter, W. ; Barnes, L. ; Bernard, M. ; Gonzalez, H. ; Ho, C. ; Hsiao, J.K. ; Jackson, J. ; Masliah, E. ; Masterman, D. ; Okonkwo, O. ; Perrin, R. ; Ryan, L. ; Silverberg, N. ; Fleisher, A. ; Sacrey, D.T. ; Fockler, J. ; Conti, C.
Circular-SWAT for deep learning based diagnostic classification of Alzheimer's disease: Application to metabolome data.Beagrie, R.A. ; Thieme, C.J. ; Annunziatella, C. ; Baugher, C. ; Zhang, Y. ; Schueler, M. ; Kukalev, A. ; Kempfer, R. ; Chiariello, A.M. ; Bianco, S. ; Li, Y. ; Davis, T. ; Scialdone, A. ; Welch, L.R. ; Nicodemi, M. ; Pombo, A.
Multiplex-GAM: genome-wide identification of chromatin contacts yields insights overlooked by Hi-C.Lin, J. ; Nano, J. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Zeller, T. ; Koenig, W. ; Müller, C.L. ; Peters, A. ; Thorand, B.
Proteomic profiling of longitudinal changes in kidney function among middle-aged and older men and women: The KORA S4/F4/FF4 study.Simon, L.M. ; Flocco, C. ; Burkart, F. ; Methner, A. ; Henke, D. ; Rauer, L. ; Müller, C.L. ; Vogel, J. ; Quaisser, C. ; Overmann, J. ; Simon, S.
Microbial fingerprints reveal interaction between museum objects, curators, and visitors.Amar, Y. ; Rogner, D. ; Silva, R. ; Fösel, B. ; Ud-Dean, M. ; Lagkouvardos, I. ; Steimle‑Grauer, S.A. ; Niedermeier, S. ; Kublik, S. ; Jargosch, M. ; Heinig, M. ; Thomas, J. ; Eyerich, S. ; Wikström, J.D. ; Schloter, M. ; Eyerich, K. ; Biedermann, T. ; Köberle, M.
Correction: Darier’s disease exhibits a unique cutaneous microbial dysbiosis associated with inflammation and body malodour (Microbiome, (2023), 11, 1, (162), 10.1186/s40168-023-01587-x).Rügamer, D. ; Bender, A. ; Wiegrebe, S. ; Racek, D. ; Bischl, B. ; Müller, C.L. ; Stachl, C.
Factorized Structured Regression for Large-Scale Varying Coefficient Models.Raab, R. ; Küderle, A. ; Zakreuskaya, A. ; Stern, A.D. ; Klucken, J. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D. ; Boll, S. ; Eils, R. ; Wagener, H. ; Eskofier, B.M.
Federated electronic health records for the European Health Data Space.Carvajal Maldonado, J. ; Lamm, L. ; Liu, Y. ; Righetto, R. ; Schnabel, J.A. ; Peng, T.
F2FD: Fourier Perturbations for Denoising Cryo-Electron Tomograms and Comparison to Established Approaches.Nasirigerdeh, R. ; Torkzadehmahani, J. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Kernel Normalized Convolutional Networks for Privacy-Preserving Machine Learning.Ziller, A. ; Erdur, A.C. ; Jungmann, F. ; Rueckert, D. ; Braren, R. ; Kaissis, G.
Exploiting Segmentation Labels and Representation Learning to Forecast Therapy Response of PDAC Patients.Poggio, E. ; Barazzuol, L. ; Salmaso, A. ; Milani, C. ; Deligiannopoulou, A. ; Cazorla, Á.G. ; Jang, S.S. ; Juliá-Palacios, N. ; Keren, B. ; Kopajtich, R. ; Lynch, S.A. ; Mignot, C. ; Moorwood, C. ; Neuhofer, C. ; Nigro, V. ; Oostra, A. ; Prokisch, H. ; Saillour, V. ; Schuermans, N. ; Torella, A. ; Verloo, P. ; Yazbeck, E. ; Zollino, M. ; Jech, R. ; Winkelmann, J. ; Necpál, J. ; Calì, T. ; Brini, M. ; Zech, M.
ATP2B2 de novo variants as a cause of variable neurodevelopmental disorders that feature dystonia, ataxia, intellectual disability, behavioral symptoms, and seizures.Borggraefe, I. ; Wagner, M.
Precision therapy in KCNQ2-related epilepsy.Zanuttigh, E. ; Rusha, E. ; Peron, C. ; Brunetti, D. ; Zorzi, G. ; Pertek, A. ; Nteli, P. ; Winkelmann, J. ; Tiranti, V. ; Iuso, A.
Generation of two human iPSC lines, HMGUi004-A and FINCBi004-A, from fibroblasts of MPAN patients carrying pathogenic recessive mutations in the gene C19orf12.Pascual-Alonso, A. ; Xiol, C. ; Smirnov, D. ; Kopajtich, R. ; Prokisch, H. ; Armstrong, J.
Identification of molecular signatures and pathways involved in Rett syndrome using a multi-omics approach.O'Neill, A.G. ; Burrell, A.L. ; Zech, M. ; Elpeleg, O. ; Harel, T. ; Edvardson, S. ; Mor-Shaked, H. ; Rippert, A.L. ; Nomakuchi, T. ; Izumi, K. ; Kollman, J.M.
Neurodevelopmental disorder mutations in the purine biosynthetic enzyme IMPDH2 disrupt its allosteric regulation.Trieschmann, G. ; Wilhelm, C. ; Berweck, S. ; Zech, M.
De novo retinoic acid receptor beta (RARB) variant associated with microphthalmia and dystonia.Carli, G. ; Meles, S.K. ; Janzen, A. ; Sittig, E. ; Kogan, R.V. ; Perani, D. ; Oertel, W.H. ; Leenders, K.L.
Occipital hypometabolism is a risk factor for conversion to Parkinson’s disease in isolated REM sleep behaviour disorder.Engel, C. ; Valence, S. ; Delplancq, G. ; Maroofian, R. ; Accogli, A. ; Agolini, E. ; Alkuraya, F.S. ; Baglioni, V. ; Bagnasco, I. ; Becmeur-Lefebvre, M. ; Bertini, E. ; Borggraefe, I. ; Brischoux-Boucher, E. ; Bruel, A.L. ; Brusco, A. ; Bubshait, D.K. ; Cabrol, C. ; Cilio, M.R. ; Cornet, M.C. ; Coubes, C. ; Danhaive, O. ; Delague, V. ; Denommé-Pichon, A.S. ; Di Giacomo, M.C. ; Doco-Fenzy, M. ; Engels, H. ; Cremer, K. ; Gerard, M. ; Gleeson, J.G. ; Heron, D. ; Goffeney, J. ; Guimier, A. ; Harms, F.L. ; Houlden, H. ; Iacomino, M. ; Kaiyrzhanov, R. ; Kamien, B. ; Karimiani, E.G. ; Kraus, D. ; Kuentz, P. ; Kutsche, K. ; Lederer, D. ; Massingham, L. ; Mignot, C. ; Morris-Rosendahl, D. ; Nagarajan, L. ; Odent, S. ; Ormieres, C. ; Partlow, J.N. ; Pasquier, L. ; Penney, L. ; Philippe, C. ; Piccolo, G. ; Poulton, C. ; Putoux, A. ; Rio, M. ; Rougeot, C. ; Salpietro, V. ; Scheffer, I. ; Schneider, A. ; Srivastava, S. ; Straussberg, R. ; Striano, P. ; Valente, E.M. ; Venot, P. ; Villard, L. ; Vitobello, A. ; Wagner, J. ; Wagner, M. ; Zaki, M.S. ; Zara, F. ; Lesca, G. ; Yassaee, V.R. ; Miryounesi, M. ; Hashemi-Gorji, F. ; Beiraghi, M. ; Ashrafzadeh, F. ; Galehdari, H. ; Walsh, C. ; Novelli, A. ; Tacke, M. ; Sadykova, D. ; Maidyrov, Y. ; Koneev, K. ; Shashkin, C. ; Capra, V. ; Zamani, M. ; van Maldergem, L. ; Burglen, L. ; Piard, J.
BRAT1–related disorders: phenotypic spectrum and phenotype-genotype correlations from 97 patients.Oexle, K. ; Zech, M. ; Stühn, L.G. ; Siegert, S. ; Brunet, T. ; Schmidt, W.M. ; Wagner, M. ; Schmidt, A. ; Engels, H. ; Tilch, E. ; Monestier, O. ; Destrée, A. ; Hanker, B. ; Boesch, S. ; Jech, R. ; Berutti, R. ; Kaiser, F. ; Haslinger, B. ; Haack, T.B. ; Garavaglia, B. ; Krawitz, P. ; Winkelmann, J. ; Mirza-Schreiber, N.
Episignature analysis of moderate effects and mosaics.Winkelmann, J. ; Schormair, B.
The genetics of restless legs syndrome.Uhlig, H.H. ; Booth, C. ; Cho, J. ; Dubinsky, M. ; Griffiths, A.M. ; Grimbacher, B. ; Hambleton, S. ; Huang, Y. ; Jones, K. ; Kammermeier, J. ; Kanegane, H. ; Koletzko, S. ; Kotlarz, D.M. ; Klein, C. ; Lenardo, M.J. ; Lo, B. ; McGovern, D.P.B. ; Ozen, A. ; de Ridder, L. ; Ruemmele, F. ; Shouval, D.S. ; Snapper, S.B. ; Travis, S.P. ; Turner, D. ; Wilson, D.C. ; Muise, A.M.
Precision medicine in monogenic inflammatory bowel disease: Proposed mIBD REPORT standards.Kamiza, A.B. ; Touré, S.M. ; Zhou, F. ; Soremekun, O. ; Cissé, C. ; Wélé, M. ; Touré, A.M. ; Nashiru, O. ; Corpas, M. ; Nyirenda, M. ; Crampin, A. ; Shaffer, J. ; Doumbia, S. ; Zeggini, E. ; Morris, A.P. ; Asimit, J.L. ; Chikowore, T. ; Fatumo, S.
Multi-trait discovery and fine-mapping of lipid loci in 125,000 individuals of African ancestry.Bocher, O. ; Willer, C.J. ; Zeggini, E.
Unravelling the genetic architecture of human complex traits through whole genome sequencing.Shi, M. ; Han, S. ; Klier, K. ; Fobo, G. ; Montrone, C. ; Yu, S. ; Harada, M. ; Henning, A.K. ; Friedrich, N. ; Bahls, M. ; Dörr, M. ; Nauck, M. ; Völzke, H. ; Homuth, G. ; Grabe, H.J. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Suhre, K. ; Rathmann, W. ; Ruepp, A. ; Hertel, J. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R.
Identification of candidate metabolite biomarkers for metabolic syndrome and its five components in population-based human cohorts.Kerimov, N. ; Tambets, R. ; Hayhurst, J.D. ; Rahu, I. ; Kolberg, P. ; Raudvere, U. ; Kuzmin, I. ; Chowdhary A. ; Vija, A. ; Teras, H.J. ; Kanai, M. ; Ulirsch, J. ; Ryten, M. ; Hardy, J. ; Guelfi, S. ; Trabzuni, D. ; Kim-Hellmuth, S. ; Rayner, N.W. ; Finucane, H. ; Peterson, H. ; Mosaku, A. ; Parkinson, H. ; Alasoo, K.
eQTL Catalogue 2023: New datasets, X chromosome QTLs, and improved detection and visualisation of transcript-level QTLs.Shrine, N. ; Izquierdo, A.G. ; Chen, J. ; Packer, R. ; Hall, R.J. ; Guyatt, A.L. ; Batini, C. ; Thompson, R.J. ; Pavuluri, C. ; Malik, V. ; Hobbs, B.D. ; Moll, M. ; Kim, W. ; Tal-Singer, R. ; Bakke, P. ; Fawcett, K.A. ; John, C. ; Coley, K. ; Piga, N.N. ; Pozarickij, A. ; Lin, K. ; Millwood, I.Y. ; Chen, Z. ; Li, L. ; Wijnant, S.R.A. ; Lahousse, L. ; Brusselle, G. ; Uitterlinden, A.G. ; Manichaikul, A. ; Oelsner, E.C. ; Rich, S.S. ; Barr, R.G. ; Kerr, S.M. ; Vitart, V. ; Brown, M.R. ; Wielscher, M. ; Imboden, M. ; Jeong, A. ; Bartz, T.M. ; Gharib, S.A. ; Flexeder, C. ; Karrasch, S. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Stubbe, B. ; Hu, X. ; Ortega, V.E. ; Meyers, D.A. ; Bleecker, E.R. ; Gabriel, S.B. ; Gupta, N. ; Smith, A.V. ; Luan, J. ; Zhao, J.H. ; Hansen, A.F. ; Langhammer, A. ; Willer, C. ; Bhatta, L. ; Porteous, D. ; Smith, B.H. ; Campbell, A. ; Sofer, T. ; Lee, J. ; Daviglus, M.L. ; Yu, B. ; Lim, E. ; Xu, H. ; O’Connor, G.T. ; Thareja, G. ; Albagha, O.M.E. ; Ismail, S.I. ; Al-Muftah, W. ; Badji, R. ; Mbarek, H. ; Darwish, D. ; Fadl, T. ; Yasin, H. ; Ennaifar, M. ; Abdellatif, R. ; Alkuwari, F. ; Alvi, M. ; Al-Sarraj, Y. ; Saad, C. ; Althani, A. ; Fethnou, E. ; Qafoud, F. ; Alkhayat, E. ; Afifi, N. ; Tomei, S. ; Liu, W. ; Lorenz, S. ; Syed, N. ; Almabrazi, H. ; Vempalli, F.R. ; Temanni, R. ; Saqri, T.A. ; Khatib, M. ; Hamza, M. ; Zaid, T.A. ; El Khouly, A. ; Zeggini, E. ; Tobin, M.D.
Author Correction: Multi-ancestry genome-wide association analyses improve resolution of genes and pathways influencing lung function and chronic obstructive pulmonary disease risk (Nature Genetics, (2023), 55, 3, (410-422), 10.1038/s41588-023-01314-0).Hehr, M. ; Sadafi, A. ; Matek, C. ; Lienemann, P. ; Pohlkamp, C. ; Haferlach, T. ; Spiekermann, K. ; Marr, C.
Explainable AI identifies diagnostic cells of genetic AML subtypes.Sadafi, A. ; Bordukova, M. ; Makhro, A. ; Navab, N. ; Bogdanova, A. ; Marr, C.
RedTell: An AI tool for interpretable analysis of red blood cell morphology.Madni, H.A. ; Umer, R.M. ; Foresti, G.L.
Swarm-fhe: Fully homomorphic encryption based swarm learning for malicious clients.Märkl, F. ; Benmebarek, M.R. ; Keyl, J. ; Cadilha, B.L. ; Geiger, M. ; Karches, C. ; Obeck, H. ; Schwerdtfeger, M. ; Michaelides, S. ; Briukhovetska, D. ; Stock, S. ; Jobst, J. ; Müller, P.J. ; Majed, L. ; Seifert, M. ; Klüver, A.K. ; Lorenzini, T. ; Grünmeier, R. ; Thomas, M. ; Gottschlich, A. ; Klaus, R. ; Marr, C. ; von Bergwelt-Baildon, M. ; Rothenfusser, S. ; Levesque, M.P. ; Heppt, M.V. ; Endres, S. ; Klein, C. ; Kobold, S.
Bispecific antibodies redirect synthetic agonistic receptor modified T cells against melanoma.Matek, C. ; Marr, C. ; von Bergwelt-Baildon, M. ; Spiekermann, K.
Künstliche Intelligenz für die computerunterstützte Leukämiediagnostik.Buck, M.C. ; Bast, L. ; Hecker, J.S. ; Riviere, J. ; Rothenberg-Thurley, M. ; Vogel, L. ; Wang, D. ; Andrä, I. ; Theis, F.J. ; Bassermann, F. ; Metzeler, K.H. ; Oostendorp, R.A.J. ; Marr, C. ; Götze, K.S.
Progressive disruption of hematopoietic architecture from clonal hematopoiesis to MDS.McCaw, Z.R. ; O'Dushlaine, C. ; Somineni, H. ; Bereket, M. ; Klein, C. ; Karaletsos, T. ; Casale, F.P. ; Koller, D. ; Soare, T.W.
An allelic-series rare-variant association test for candidate-gene discovery.Gottschlich, A. ; Thomas, M. ; Grünmeier, R. ; Lesch, S. ; Rohrbacher, L. ; Igl, V. ; Briukhovetska, D. ; Benmebarek, M.R. ; Vick, B. ; Dede, S. ; Müller, K. ; Xu, T. ; Dhoqina, D. ; Märkl, F. ; Robinson, S. ; Sendelhofert, A. ; Schulz, H. ; Umut, ; Kavaka, V. ; Tsiverioti, C.A. ; Carlini, E. ; Nandi, S. ; Strzalkowski, T. ; Lorenzini, T. ; Stock, S. ; Müller, P.J. ; Dörr, J. ; Seifert, M. ; Cadilha, B.L. ; Brabenec, R. ; Röder, N. ; Rataj, F. ; Nüesch, M. ; Modemann, F. ; Wellbrock, J. ; Fiedler, W. ; Kellner, C. ; Beltran, E. ; Herold, T. ; Paquet, D. ; Jeremias, I. ; von Baumgarten, L. ; Endres, S. ; Subklewe, M. ; Marr, C. ; Kobold, S.
Single-cell transcriptomic atlas-guided development of CAR-T cells for the treatment of acute myeloid leukemia.Kalgudde Gopal, S. ; Dai, R. ; Stefanska, A.M. ; Ansari, M. ; Zhao, J. ; Ramesh, P. ; Bagnoli, J.W. ; Correa-Gallegos, D. ; Lin, Y. ; Christ, S. ; Angelidis, I. ; Lupperger, V. ; Marr, C. ; Davies, L.C. ; Enard, W. ; Machens, H.G. ; Schiller, H. B. ; Jiang, D. ; Rinkevich, Y.
Wound infiltrating adipocytes are not myofibroblasts.Atwell, S. ; Waibel, D.J.E. ; Shetab Boushehri, S. ; Wiedenmann, S. ; Marr, C. ; Meier, M.
Label-free imaging of 3D pluripotent stem cell differentiation dynamics on chip.Sikkema, L. ; Ramirez Suastegui, C. ; Strobl, D.C. ; Gillett, T.E. ; Zappia, L. ; Madissoon, E. ; Markov, N.S. ; Zaragosi, L.E. ; Ji, Y. ; Ansari, M. ; Arguel, M.J. ; Apperloo, L. ; Banchero, M. ; Bécavin, C. ; Berg, M. ; Chichelnitskiy, E. ; Chung, M.I. ; Collin, A. ; Gay, A.C.A. ; Schniering, J. ; Hooshiar Kashani, B. ; Inecik, K. ; Jain, M. ; Kapellos, T. ; Kole, T.M. ; Leroy, S. ; Mayr, C. ; Oliver, A.J. ; von Papen, M. ; Peter, L. ; Taylor, C.J. ; Walzthoeni, T. ; Xu, C. ; Bui, L.T. ; De Donno, C. ; Dony, L. ; Faiz, A. ; Guo, M. ; Gutierrez, A.J. ; Heumos, L. ; Huang, N. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Jackson, N.D. ; Kadur Lakshminarasimha Murthy, P. ; Lotfollahi, M. ; Tabib, T. ; Talavera Lopez, C.N. ; Travaglini, K.J. ; Wilbrey-Clark, A. ; Worlock, K.B. ; Yoshida, M. ; van den Berge, M. ; Bossé, Y. ; Desai, T.J. ; Eickelberg, O. ; Kaminski, N. ; Krasnow, M.A. ; Lafyatis, R. ; Nikolić, M.Z. ; Powell, J.E. ; Rajagopal, J. ; Rojas, M. ; Rozenblatt-Rosen, O. ; Seibold, M.A. ; Sheppard, D. ; Shepherd, D.P. ; Sin, D.D. ; Timens, W. ; Tsankov, A.M. ; Whitsett, J. ; Xu, Y. ; Banovich, N.E. ; Barbry, P. ; Duong, T.E. ; Falk, C.S. ; Meyer, K.B. ; Kropski, J.A. ; Pe'er, D. ; Schiller, H. B. ; Tata, P.R. ; Schultze, J.L. ; Teichmann, S.A. ; Misharin, A.V. ; Nawijn, M.C. ; Luecken, M. ; Theis, F.J.
An integrated cell atlas of the lung in health and disease.Meier, A.B. ; Zawada, D. ; De Angelis, M.T. ; Martens, L.D. ; Santamaria, G. ; Zengerle, S. ; Nowak-Imialek, M. ; Kornherr, J. ; Zhang, F. ; Tian, Q. ; Wolf, C.M. ; Kupatt, C. ; Sahara, M. ; Lipp, P. ; Theis, F.J. ; Gagneur, J. ; Goedel, A. ; Laugwitz, K.L. ; Dorn, T. ; Moretti, A.
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease.Salvatore, M. ; Horlacher, M. ; Marsico, A. ; Winther, O. ; Andersson, R.
Transfer learning identifies sequence determinants of cell-type specific regulatory element accessibility.Heumos, L. ; Ehmele, P. ; Kuhn Cuellar, L. ; Menden, K. ; Miller, E. ; Lemke, S. ; Gabernet, G. ; Nahnsen, S.
mlf-core: A framework for deterministic machine learning.Micolucci, L. ; Matacchione, G. ; Albertini, M.C. ; Marra, M. ; Ramini, D. ; Giuliani, A. ; Sabbatinelli, J. ; Procopio, A.D. ; Olivieri, F. ; Marsico, A. ; Monsurrò, V.
A data-mining approach to identify NF-kB-responsive microRNAs in tissues involved in inflammatory processes: Potential relevance in age-related diseases.Karollus, A. ; Mauermeier, T. ; Gagneur, J.
Current sequence-based models capture gene expression determinants in promoters but mostly ignore distal enhancers.Amin, N. ; Liu, J. ; Bonnechere, B. ; MahmoudianDehkordi, S. ; Arnold, M. ; Batra, R. ; Chiou, Y.J. ; Fernandes, M. ; Ikram, M.A. ; Kraaij, R. ; Krumsiek, J. ; Newby, D. ; Nho, K. ; Radjabzadeh, D. ; Saykin, A.J. ; Shi, L. ; Sproviero, W. ; Winchester, L. ; Yang, Y. ; Nevado-Holgado, A.J. ; Kastenmüller, G. ; Kaddurah-Daouk, R. ; van Duijn, C.M.
Interplay of metabolome and gut microbiome in individuals with major depressive disorder vs control individuals.Li, S. ; Schmid, K. ; de Vries, D.H. ; Korshevniuk, M. ; Losert, C. ; Oelen, R. ; van Blokland, I.V. ; Groot, H.E. ; Swertz, M.A. ; van der Harst, P. ; Westra, H.J. ; van der Wijst, M.G.P. ; Heinig, M. ; Franke, L.
Identification of genetic variants that impact gene co-expression relationships using large-scale single-cell data.Bärthel, S. ; Falcomatà, C. ; Rad, R. ; Theis, F.J. ; Saur, D.
Single-cell profiling to explore pancreatic cancer heterogeneity, plasticity and response to therapy.Yuzeir, A. ; Bejarano, D.A. ; Grein, S. ; Hasenauer, J. ; Schlitzer, A. ; Yu, J.
IntestLine: A shiny-based application to map the rolled intestinal tissue onto a line.Garí, M. ; Moos, R. ; Bury, D. ; Kasper-Sonnenberg, M. ; Jankowska, A. ; Andysz, A. ; Hanke, W. ; Nowak, D. ; Bose-O'Reilly, S. ; Koch, H.M. ; Polanska, K.
Correction: Human-Biomonitoring derived exposure and Daily Intakes of Bisphenol A and their associations with neurodevelopmental outcomes among children of the Polish Mother and Child Cohort Study.Fischer, F. ; Doll, A. ; Uereyener, D. ; Roenneberg, S. ; Hillig, C. ; Weber, L. ; Hackert, V. ; Meinel, M. ; Farnoud, A. ; Seiringer, P. ; Thomas, J. ; Anand, P. ; Graner, L. ; Schlenker, F. ; Zengerle, R. ; Jonsson, P. ; Jargosch, M. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Biedermann, T. ; Howell, M. ; Reich, K. ; Eyerich, K. ; Menden, M.P. ; Garzorz-Stark, N. ; Lauffer, F. ; Eyerich, S.
Gene expression-based molecular test as diagnostic aid for the differential diagnosis of psoriasis and eczema in formalin-fixed and paraffin-embedded tissue, microbiopsies, and tape strips.Lotfollahi, M. ; Klimovskaia Susmelj, A. ; De Donno, C. ; Hetzel, L. ; Ji, Y. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Srivatsan, S.R. ; Naghipourfar, M. ; Daza, R.M. ; Martin, B. ; Shendure, J. ; McFaline-Figueroa, J.L. ; Boyeau, P. ; Wolf, F.A. ; Yakubova, N. ; Günnemann, S. ; Trapnell, C. ; Lopez-Paz, D. ; Theis, F.J.
Predicting cellular responses to complex perturbations in high-throughput screens.Giannella, M. ; Huth, M. ; Righi, E. ; Hasenauer, J. ; Marconi, L. ; Konnova, A. ; Gupta, A. ; Hotterbeekx, A. ; Berkell, M. ; Palacios-Baena, Z.R. ; Morelli, M.C. ; Tamè, M. ; Busutti, M. ; Potena, L. ; Salvaterra, E. ; Feltrin, G. ; Gerosa, G. ; Furian, L. ; Burra, P. ; Piano, S. ; Cillo, U. ; Cananzi, M. ; Loy, M. ; Zaza, G. ; Onorati, F. ; Carraro, A. ; Gastaldon, F. ; Nordio, M. ; Kumar-Singh, S. ; Baño, J.R. ; Lazzarotto, T. ; Viale, P. ; Tacconelli, E.
Using machine learning to predict antibody response to SARS-CoV-2 vaccination in solid organ transplant recipients: The multicentre ORCHESTRA cohort.Feriz, A.M. ; Khosrojerdi, A. ; Lotfollahi, M. ; Shamsaki, N. ; GhasemiGol, M. ; HosseiniGol, E. ; Fereidouni, M. ; Rohban, M.H. ; Sebzari, A.R. ; Saghafi, S. ; Leone, P. ; Silvestris, N. ; Safarpour, H. ; Racanelli, V.
Single-cell RNA sequencing uncovers heterogeneous transcriptional signatures in tumor-infiltrated dendritic cells in prostate cancer.Wagner, N. ; Çelik, M.H. ; Hölzlwimmer, F.R. ; Mertes, C. ; Prokisch, H. ; Yépez, V.A. ; Gagneur, J.
Aberrant splicing prediction across human tissues.Sperling, K. ; Scherb, H. ; Neitzel, H.
Population monitoring of trisomy 21: Problems and approaches.Pouwels, S.D. ; van den Berge, M. ; Vasse, G.F. ; Timens, W. ; Brandsma, C.A. ; Aliee, H. ; Hiemstra, P.S. ; Guryev, V. ; Faiz, A.
Smoking increases expression of the SARS-CoV-2 spike protein-binding long ACE2 isoform in bronchial epithelium.Suppinger, S. ; Zinner, M. ; Aizarani, N. ; Lukonin, I. ; Ortiz, R. ; Azzi, C. ; Stadler, M.B. ; Vianello, S. ; Palla, G. ; Kohler, H. ; Mayran, A. ; Lutolf, M.P. ; Liberali, P.
Multimodal characterization of murine gastruloid development.Singh, P. ; Gollapalli, K. ; Mangiola, S. ; Schranner, D. ; Yusuf, M.A. ; Chamoli, M. ; Shi, S.L. ; Lopes Bastos, B. ; Nair, T. ; Riermeier, A. ; Vayndorf, E.M. ; Wu, J.Z. ; Nilakhe, A. ; Nguyen, C.Q. ; Muir, M. ; Kiflezghi, M.G. ; Foulger, A. ; Junker, A. ; Devine, J. ; Sharan, K. ; Chinta, S.J. ; Rajput, S. ; Rane, A. ; Baumert, P. ; Schönfelder, M. ; Iavarone, F. ; di Lorenzo, G. ; Kumari, S. ; Gupta, A. ; Sakar, R. ; Khyriem, C. ; Chawla, A.S. ; Sharma, A. ; Sarper, N. ; Chattopadhyay, N. ; Biswal, B.K. ; Settembre, C. ; Nagarajan, P. ; Targoff, K.L. ; Picard, M. ; Gupta, S. ; Velagapudi, V. ; Papenfuss, A.T. ; Kaya, A. ; Ferreira, M.G. ; Kennedy, B.K. ; Andersen, J.K. ; Lithgow, G.J. ; Ali, A.M. ; Mukhopadhyay, A. ; Palotie, A. ; Kastenmüller, G. ; Kaeberlein, M. ; Wackerhage, H. ; Pal, B. ; Yadav, V.K.
Taurine deficiency as a driver of aging.Spitzer, H. ; Berry, S. ; Donoghoe, M. ; Pelkmans, L. ; Theis, F.J.
Learning consistent subcellular landmarks to quantify changes in multiplexed protein maps.Eser, T.M. ; Baranov, O. ; Huth, M. ; Ahmed, M.I.M. ; Deák, F. ; Held, K. ; Lin, L. ; Pekayvaz, K. ; Leunig, A. ; Nicolai, L. ; Pollakis, G. ; Buggert, M. ; Price, D.A. ; Rubio-Acero, R. ; Reich, J. ; Falk, P. ; Markgraf, A. ; Puchinger, K. ; Castelletti, N. ; Olbrich, L. ; Vanshylla, K. ; Klein, F. ; Wieser, A. ; Hasenauer, J. ; Kroidl, I. ; Hoelscher, M. ; Geldmacher, C.
Nucleocapsid-specific T cell responses associate with control of SARS-CoV-2 in the upper airways before seroconversion.Schälte, Y. ; Hasenauer, J.
Informative and adaptive distances and summary statistics in sequential approximate Bayesian computation.Lazzardi, S. ; Valle, F. ; Mazzolini, A. ; Scialdone, A. ; Caselle, M. ; Osella, M.
Emergent statistical laws in single-cell transcriptomic data.Okolie, A. ; Müller, J.
Corrigendum to "Exact and approximate formulas for contact tracing on random trees" [Mathematical Biosciences 321 (2020) 108320].Horlacher, M. ; Cantini, G. ; Hesse, J. ; Schinke, P. ; Goedert, N. ; Londhe, S. ; Moyon, L. ; Marsico, A.
A systematic benchmark of machine learning methods for protein-RNA interaction prediction.Azzini, A.M. ; Canziani, L.M. ; Davis, R.J. ; Mirandola, M. ; Hoelscher, M. ; Meyer, L. ; Laouénan, C. ; Giannella, M. ; Rodríguez-Baño, J. ; Boffetta, P. ; Mates, D. ; Malhotra-Kumar, S. ; Scipione, G. ; Stellmach, C. ; Rinaldi, E. ; Hasenauer, J. ; Tacconelli, E.
How european research projects can support vaccination strategies: The case of the ORCHESTRA project for SARS-CoV-2.Krause, J. ; Nickel, A. ; Madsen, A. ; Aitken-Buck, H.M. ; Stoter, A.M.S. ; Schrapers, J. ; Ojeda, F. ; Geiger, K. ; Kern, M. ; Kohlhaas, M. ; Bertero, E. ; Hofmockel, P. ; Hübner, F. ; Assum, I. ; Heinig, M. ; Müller, C. ; Hansen, A. ; Krause, T. ; Park, D.D. ; Just, S. ; Aïssi, D. ; Börnigen, D. ; Lindner, D. ; Friedrich, N. ; Alhussini, K. ; Bening, C. ; Schnabel, R.B. ; Karakas, M. ; Iacoviello, L. ; Salomaa, V. ; Linneberg, A. ; Tunstall-Pedoe, H. ; Kuulasmaa, K. ; Kirchhof, P. ; Blankenberg, S. ; Christ, T. ; Eschenhagen, T. ; Lamberts, R.R. ; Maack, C. ; Stenzig, J. ; Zeller, T.
An arrhythmogenic metabolite in atrial fibrillation.Borkowski, K. ; Seyfried, N.T. ; Arnold, M. ; Lah, J.J. ; Levey, A.I. ; Hales, C.M. ; Dammer, E.B. ; Blach, C. ; Louie, G. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Newman, J.W.
Integration of plasma and CSF metabolomics with CSF proteomic reveals novel associations between lipid mediators and central nervous system vascular and energy metabolism.Almet, A.A. ; Yuan, H. ; Annusver, K. ; Ramos, R. ; Liu, Y. ; Wiedemann, J. ; Sorkin, D.H. ; Landén, N.X. ; Sonkoly, E. ; Haniffa, M. ; Nie, Q. ; Lichtenberger, B.M. ; Luecken, M. ; Andersen, B. ; Tsoi, L.C. ; Watt, F.M. ; Gudjonsson, J.E. ; Plikus, M.V. ; Kasper, M.
A Roadmap for a consensus human skin cell atlas and single-cell data standardization.Lee, H. ; Aylward, A.J. ; Pearse, R.V. ; Lish, A.M. ; Hsieh, Y.C. ; Augur, Z.M. ; Benoit, C.R. ; Chou, V. ; Knupp, A. ; Pan, C. ; Goberdhan, S. ; Duong, D.M. ; Seyfried, N.T. ; Bennett, D.A. ; Taga, M.F. ; Huynh, K. ; Arnold, M. ; Meikle, P.J. ; de Jager, P.L. ; Menon, V. ; Young, J.E. ; Young-Pearse, T.L.
Cell-type-specific regulation of APOE and CLU levels in human neurons by the Alzheimer's disease risk gene SORL1.Garger, D. ; Meinel, M. ; Dietl, T. ; Hillig, C. ; Garzorz-Stark, N. ; Eyerich, K. ; Hrabě de Angelis, M. ; Eyerich, S. ; Menden, M.P.
The impact of the cardiovascular component and somatic mutations on ageing.Thielert, M. ; Itang, E.C. ; Ammar, C. ; Rosenberger, F.A. ; Bludau, I. ; Schweizer, L. ; Nordmann, T.M. ; Skowronek, P. ; Wahle, M. ; Zeng, W.F. ; Zhou, X.X. ; Brunner, A.D. ; Richter, S. ; Levesque, M.P. ; Theis, F.J. ; Steger, M. ; Mann, M.
Robust dimethyl-based multiplex-DIA doubles single-cell proteome depth via a reference channel.Maddu, S. ; Sturm, D. ; Cheeseman, B.L. ; Müller, C.L. ; Sbalzarini, I.F.
STENCIL-NET for equation-free forecasting from data.Horlacher, M. ; Wagner, N. ; Moyon, L. ; Kuret, K. ; Goedert, N. ; Salvatore, M. ; Ule, J. ; Gagneur, J. ; Winther, O. ; Marsico, A.
Towards in silico CLIP-seq: predicting protein-RNA interaction via sequence-to-signal learning.Braun, F.K. ; Rothhammer-Hampl, T. ; Lorenz, J. ; Pohl, S. ; Menevse, A.N. ; Vollmann-Zwerenz, A. ; Bumes, E. ; Büttner, M. ; Zoubaa, S. ; Proescholdt, M. ; Schmidt, N.O. ; Hau, P. ; Beckhove, P. ; Winner, B. ; Riemenschneider, M.J.
Scaffold-based (Matrigel™) 3D culture technique of glioblastoma recovers a patient-like immunosuppressive phenotype.Michielsen, L. ; Lotfollahi, M. ; Strobl, D.C. ; Sikkema, L. ; Reinders, M.J.T. ; Theis, F.J. ; Mahfouz, A.
Single-cell reference mapping to construct and extend cell-type hierarchies.Wang, J. ; Horlacher, M. ; Cheng, L. ; Winther, O.
RNA trafficking and subcellular localization-a review of mechanisms, experimental and predictive methodologies.Filipp, F.V.
Spatial cancer systems biology resolves heterotypic interactions and identifies disruption of spatial hierarchy as a pathological driver event.Hammad, S. ; Ogris, C. ; Othman, A. ; Erdoesi, P. ; Schmidt-Heck, W. ; Biermayer, I. ; Helm, B. ; Gao, Y. ; Piorońska, W. ; Holland, C.H. ; D'Alessandro, L.A. ; De La Torre, C. ; Sticht, C. ; Al Aoua, S. ; Theis, F.J. ; Bantel, H. ; Ebert, M.P. ; Klingmüller, U. ; Hengstler, J.G. ; Dooley, S. ; Müller, N.S.
Tolerance of repeated toxic injuries of murine livers is associated with steatosis and inflammation.Moore, J. ; Basurto-Lozada, D. ; Besson, S. ; Bogovic, J. ; Bragantini, J. ; Brown, E.M. ; Burel, J.M. ; Casas Moreno, X. ; de Medeiros, G. ; Diel, E.E. ; Gault, D. ; Ghosh, S.S. ; Gold, I. ; Halchenko, Y.O. ; Hartley, M. ; Horsfall, D. ; Keller, M.S. ; Kittisopikul, M. ; Kovács, G. ; Küpcü Yoldaş, A. ; Kyoda, K. ; le Tournoulx de la Villegeorges, A. ; Li, T. ; Liberali, P. ; Lindner, D. ; Linkert, M. ; Lüthi, J. ; Maitin-Shepard, J. ; Manz, T. ; Marconato, L. ; McCormick, M. ; Lange, M. ; Mohamed, K. ; Moore, W. ; Norlin, N. ; Ouyang, W. ; Özdemir, B. ; Palla, G. ; Pape, C. ; Pelkmans, L. ; Pietzsch, T. ; Preibisch, S. ; Prete, M. ; Rzepka, N. ; Samee, S. ; Schaub, N. ; Sidky, H. ; Solak, A.C. ; Stirling, D.R. ; Striebel, J. ; Tischer, C. ; Toloudis, D. ; Virshup, I. ; Walczysko, P. ; Watson, A.M. ; Weisbart, E. ; Wong, F. ; Yamauchi, K.A. ; Bayraktar, O. ; Cimini, B.A. ; Gehlenborg, N. ; Haniffa, M. ; Hotaling, N. ; Onami, S. ; Royer, L.A. ; Saalfeld, S. ; Stegle, O. ; Theis, F.J. ; Swedlow, J.R.
OME-Zarr: A cloud-optimized bioimaging file format with international community support.Bahrami, E. ; Schmid, J.P. ; Jurinovic, V. ; Becker, M. ; Wirth, A.-K. ; Ludwig, R. ; Kreissig, S. ; Duque Angel, T.V. ; Amend, D. ; Hunt, K. ; Öllinger, R. ; Rad, R. ; Frenz, J.M. ; Solovey, M. ; Ziemann, F. ; Mann, M. ; Vick, B. ; Wichmann, C. ; Herold, T. ; Jayavelu, A.K. ; Jeremias, I.
Combined proteomics and CRISPR‒Cas9 screens in PDX identify ADAM10 as essential for leukemia in vivo.Marlais, T. ; Bickford-Smith, J. ; Talavera Lopez, C.N. ; Le, H. ; Chowdhury, F. ; Miles, M.A.
A comparative 'omics' approach for prediction of candidate Strongyloides stercoralis diagnostic coproantigens.Noltes, M.E. ; Bader, M. ; Metman, M.J.H. ; Vonk, J. ; Steinkamp, P.J. ; Kukacka, J. ; Westerlaan, H.E. ; Dierckx, R.A.J.O. ; van Hemel, B.M. ; Brouwers, A.H. ; van Dam, G.M. ; Jüstel, D. ; Ntziachristos, V. ; Kruijff, S.
Towards in vivo characterization of thyroid nodules suspicious for malignancy using multispectral optoacoustic tomography.Virshup, I. ; Bredikhin, D. ; Heumos, L. ; Palla, G. ; Sturm, G. ; Gayoso, A. ; Kats, I. ; Koutrouli, M. ; Berger, B. ; Pe'er, D. ; Regev, A. ; Teichmann, S.A. ; Finotello, F. ; Wolf, F.A. ; Yosef, N. ; Stegle, O. ; Theis, F.J.
The scverse project provides a computational ecosystem for single-cell omics data analysis.Heumos, L. ; Schaar, A. ; Lance, C. ; Litinetskaya, A. ; Drost, F. ; Zappia, L. ; Luecken, M. ; Strobl, D.C. ; Henao, J. ; Curion, F. ; Schiller, H. B. ; Theis, F.J.
Best practices for single-cell analysis across modalities.Momeni Larimi, M. ; Babamiri, A. ; Biglarian, M. ; Ramiar, A. ; Tabe, R. ; Inthavong, K. ; Farnoud, A.
Numerical and experimental analysis of drug inhalation in realistic human upper airway model.Kolabas, Z.I. ; Kuemmerle, L. ; Perneczky, R. ; Förstera, B. ; Ulukaya, S. ; Ali, M. ; Kapoor, S. ; Bartos, L.M. ; Büttner, M. ; Caliskan, Ö.S. ; Rong, Z. ; Mai, H. ; Höher, L. ; Jeridi, D. ; Molbay, M. ; Khalin, I. ; Deligiannis, I.K. ; Negwer, M. ; Roberts, K. ; Simats, A. ; Carofiglio, O. ; Todorov, M.I. ; Horvath, I. ; Öztürk, F. ; Hummel, S. ; Biechele, G. ; Zatcepin, A. ; Unterrainer, M. ; Gnörich, J. ; Roodselaar, J. ; Shrouder, J. ; Khosravani, P. ; Tast, B. ; Richter, L. ; Díaz-Marugán, L. ; Kaltenecker, D. ; Lux, L. ; Chen, Y. ; Zhao, S. ; Rauchmann, B.S. ; Sterr, M. ; Kunze, I. ; Stanic Aguilera, K.N. ; Kan, V.W.Y. ; Besson-Girard, S. ; Katzdobler, S. ; Palleis, C. ; Schädler, J. ; Paetzold, J.C. ; Liebscher, S. ; Hauser, A.E. ; Gokce, O. ; Lickert, H. ; Steinke, H. ; Benakis, C. ; Braun, C. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Buerger, K. ; Albert, N.L. ; Höglinger, G. ; Levin, J. ; Haass, C. ; Kopczak, A. ; Dichgans, M. ; Havla, J. ; Kümpfel, T. ; Kerschensteiner, M. ; Schifferer, M. ; Simons, M. ; Liesz, A. ; Krahmer, N. ; Bayraktar, O.A. ; Franzmeier, N. ; Plesnila, N. ; Erener, S. ; Puelles, V.G. ; Delbridge, C. ; Bhatia, H.S. ; Hellal, F. ; Elsner, M. ; Bechmann, I. ; Ondruschka, B. ; Brendel, M. ; Theis, F.J. ; Ertürk, A.
Distinct molecular profiles of skull bone marrow in health and neurological disorders.Jüstel, D. ; Irl, H. ; Hinterwimmer, F. ; Dehner, C. ; Simson, W. ; Navab, N. ; Schneider, G. ; Ntziachristos, V.
Spotlight on nerves: Portable multispectral optoacoustic imaging of peripheral nerve vascularization and morphology.Contento, L. ; Castelletti, N. ; Raimundez, E. ; Le Gleut, R. ; Schälte, Y. ; Stapor, P. ; Hinske, L.C. ; Hoelscher, M. ; Wieser, A. ; Radon, K. ; Fuchs, C. ; Hasenauer, J.
Integrative modelling of reported case numbers and seroprevalence reveals time-dependent test efficiency and infectious contacts.Vornholz, L. ; Isay, S.E. ; Kurgyis, Z. ; Strobl, D.C. ; Loll, P. ; Mosa, M.H. ; Luecken, M. ; Sterr, M. ; Lickert, H. ; Winter, C. ; Greten, F.R. ; Farin, H.F. ; Theis, F.J. ; Ruland, J.
Synthetic enforcement of STING signaling in cancer cells appropriates the immune microenvironment for checkpoint inhibitor therapy.Böhner, A. ; Jargosch, M. ; Müller, N.S. ; Garzorz-Stark, N. ; Pilz, A.C. ; Lauffer, F. ; Wang, R. ; Roenneberg, S. ; Zink, A. ; Thomas, J. ; Theis, F.J. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
The neglected twin: Nummular eczema is a variant of atopic dermatitis with codominant TH2/TH17 immune response.Lubatti, G. ; Stock, M. ; Iturbide Martinez De Albeniz, A. ; Ruiz Tejada Segura, M.L. ; Riepl, M. ; Tyser, R.C.V. ; Danese, A. ; Colomé-Tatché, M. ; Theis, F.J. ; Srinivas, S. ; Torres-Padilla, M.E. ; Scialdone, A.
CIARA: A cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data.Kapellos, T. ; Baßler, K. ; Fujii, W. ; Nalkurthi, C. ; Schaar, A. ; Bonaguro, L. ; Pecht, T. ; Galvao, I. ; Agrawal, S. ; Saglam, A. ; Dudkin, E. ; Frishberg, A. ; De Domenico, E. ; Horne, A. ; Donovan, C. ; Kim, R.Y. ; Gallego-Ortega, D. ; Gillett, T.E. ; Ansari, M. ; Schulte-Schrepping, J. ; Offermann, N. ; Antignano, I. ; Sivri, B. ; Lu, W. ; Eapen, M.S. ; van Uelft, M. ; Osei-Sarpong, C. ; van den Berge, M. ; Donker, H.C. ; Groen, H.J.M. ; Sohal, S.S. ; Klein, J. ; Schreiber, T. ; Feißt, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Schiller, H. B. ; Nawijn, M.C. ; Becker, M. ; Händler, K. ; Beyer, M. ; Capasso, M. ; Ulas, T. ; Hasenauer, J. ; Pizarro, C. ; Theis, F.J. ; Hansbro, P.M. ; Skowasch, D. ; Schultze, J.
Systemic alterations in neutrophils and their precursors in early-stage chronic obstructive pulmonary disease.Bukas, C. ; Galter, I. ; da Silva Buttkus, P. ; Fuchs, H. ; Maier, H. ; Gailus-Durner, V. ; Müller, C.L. ; Hrabě de Angelis, M. ; Piraud, M. ; Spielmann, N.
Echo2Pheno: A deep-learning application to uncover echocardiographic phenotypes in conscious mice.Meijs, C. ; Brugts, J.J. ; Lund, L.H. ; Linssen, G.C.M. ; Rocca, H.B. ; Dahlström, U. ; Vaartjes, I. ; Koudstaal, S. ; Asselbergs, F.W. ; Savarese, G. ; Uijl, A.
Identifying distinct clinical clusters in heart failure with mildly reduced ejection fraction.Wimberger, N. ; Ober, F. ; Avar, G. ; Grau, M. ; Xu, W. ; Lenz, G. ; Menden, M.P. ; Krappmann, D.
Oncogene-induced MALT1 protease activity drives post-transcriptional gene expression in malignant lymphomas.Ohnmacht, A. ; Rajamani, A. ; Avar, G. ; Kutkaite, G. ; Gonçalves, E. ; Saur, D. ; Menden, M.P.
The pharmacoepigenomic landscape of cancer cell lines reveals the epigenetic component of drug sensitivity.Amar, Y. ; Rogner, D. ; Silva, R. ; Fösel, B. ; Ud-Dean, M. ; Lagkouvardos, I. ; Steimle-Grauer, S.A. ; Niedermeier, S. ; Kublik, S. ; Jargosch, M. ; Heinig, M. ; Thomas, J. ; Eyerich, S. ; Wikström, J.D. ; Schloter, M. ; Eyerich, K. ; Biedermann, T. ; Köberle, M.
Darier's disease exhibits a unique cutaneous microbial dysbiosis associated with inflammation and body malodour.van der Spek, A. ; Stewart, I.D. ; Kühnel, B. ; Pietzner, M. ; Alshehri, T. ; Gauß, F. ; Hysi, P.G. ; MahmoudianDehkordi, S. ; Heinken, A. ; Luik, A.I. ; Ladwig, K.-H. ; Kastenmüller, G. ; Menni, C. ; Hertel, J. ; Ikram, M.A. ; de Mutsert, R. ; Suhre, K. ; Gieger, C. ; Strauch, K. ; Völzke, H. ; Meitinger, T. ; Mangino, M. ; Flaquer, A. ; Waldenberger, M. ; Peters, A. ; Thiele, I. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Dunlop, B.W. ; Rosendaal, F.R. ; Wareham, N.J. ; Spector, T.D. ; Kunze, S. ; Grabe, H.J. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Langenberg, C. ; van Duijn, C.M. ; Amin, N.
Circulating metabolites modulated by diet are associated with depression.Meijs, C. ; Handoko, M.L. ; Savarese, G. ; Vernooij, R.W.M. ; Vaartjes, I. ; Banerjee, A. ; Koudstaal, S. ; Brugts, J.J. ; Asselbergs, F.W. ; Uijl, A.
Discovering distinct phenotypical clusters in heart failure across the ejection fraction spectrum: A systematic review.Reinkemeyer, C. ; Khazaei, H. ; Weigert, M. ; Hannes, M. ; Le Gleut, R. ; Plank, M. ; Winter, S. ; Noreña, I. ; Meier, T. ; Xu, L. ; Rubio-Acero, R. ; Wiegrebe, S. ; Le Thi, T.G. ; Fuchs, C. ; Radon, K. ; Paunovic, I. ; Janke, C. ; Wieser, A. ; Küchenhoff, H. ; Hoelscher, M. ; Castelletti, N.
The prospective COVID-19 post-immunization serological cohort in Munich (KoCo-Impf): Risk factors and determinants of immune response in healthcare workers.Le Gleut, R. ; Plank, M. ; Pütz, M. ; Radon, K. ; Bakuli, A. ; Rubio-Acero, R. ; Paunovic, I. ; Rieß, F. ; Winter, S. ; Reinkemeyer, C. ; Schälte, Y. ; Olbrich, L. ; Hannes, M. ; Kroidl, I. ; Noreña, I. ; Janke, C. ; Wieser, A. ; Hoelscher, M. ; Fuchs, C. ; Castelletti, N.
The representative COVID-19 cohort Munich (KoCo19): From the beginning of the pandemic to the Delta virus variant.Weigel, B. ; Tegethoff, J.F. ; Grieder, S.D. ; Lim, B. ; Nagarajan, B. ; Liu, Y.C. ; Truberg, J. ; Papageorgiou, D. ; Adrian-Segarra, J.M. ; Schmidt, L.K. ; Kaspar, J. ; Poisel, E. ; Heinzelmann, E. ; Saraswat, M. ; Christ, M. ; Arnold, C. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Campos, J. ; Krijgsveld, J. ; Monyer, H. ; Zaugg, J.B. ; Acuna, C. ; Mall, M.
MYT1L haploinsufficiency in human neurons and mice causes autism-associated phenotypes that can be reversed by genetic and pharmacologic intervention.Stephenson, N. ; Pushparajah, K. ; Wheeler, G. ; Deng, S. ; Schnabel, J.A. ; Simpson, J.M.
Extended reality for procedural planning and guidance in structural heart disease - a review of the state-of-the-art.Wright, R. ; Gomez, A. ; Zimmer, V.A. ; Toussaint, N. ; Khanal, B. ; Matthew, J. ; Skelton, E. ; Kainz, B. ; Rueckert, D. ; Hajnal, J.V. ; Schnabel, J.A.
Fast fetal head compounding from multi-view 3D ultrasound.Reid, K.M. ; Steel, D. ; Nair, S. ; Bhate, S. ; Biassoni, L. ; Sudhakar, S. ; Heys, M. ; Burke, E. ; Kamsteeg, E.J. ; Hameed, B. ; Zech, M. ; Mencacci, N.E. ; Barwick, K. ; Topf, M. ; Kurian, M.A.
Loss-of-function variants in DRD1 in infantile parkinsonism-dystonia.Slosarek, T. ; Ibing, S. ; Schormair, B. ; Heyne, H.O. ; Bottinger, E.P. ; Andlauer, T.F.M. ; Schurmann, C.
Implementation and evaluation of personal genetic testing as part of genomics analysis courses in German universities.Averdunk, L. ; Huetzen, M.A. ; Moreno-Andrés, D. ; Kalb, R. ; McKee, S. ; Hsieh, T.C. ; Seibt, A. ; Schouwink, M. ; Lalani, S. ; Faqeih, E.A. ; Brunet, T. ; Boor, P. ; Neveling, K. ; Hoischen, A. ; Hildebrandt, B. ; Graf, E. ; Lu, L. ; Jin, W. ; Schaper, J. ; Omer, J.A. ; Demaret, T. ; Fleischer, N. ; Schindler, D. ; Krawitz, P. ; Mayatepek, E. ; Wieczorek, D. ; Wang, L.L. ; Antonin, W. ; Jachimowicz, R.D. ; von Felbert, V. ; Distelmaier, F.
Biallelic variants in CRIPT cause a Rothmund-Thomson-like syndrome with increased cellular senescence.Kratz, C.P. ; Smirnov, D. ; Autry, R. ; Jäger, N. ; Waszak, S.M. ; Großhennig, A. ; Berutti, R. ; Wendorff, M. ; Hainaut, P. ; Pfister, S.M. ; Prokisch, H. ; Ripperger, T. ; Malkin, D.
Reply to Li and colleagues.Pavelekova, P. ; Necpál, J. ; Jech, R. ; Havránková, P. ; Švantnerová, J. ; Jurkova, V. ; Gdovinova, Z. ; Lackova, A. ; Han, V. ; Winkelmann, J. ; Zech, M. ; Škorvánek, M.
Predictors of whole exome sequencing in dystonic cerebral palsy and cerebral palsy-like disorders.Seyedtaghia, M.R. ; Soudyab, M. ; Shariati, M. ; Esfehani, R.J. ; Vafadar, S. ; Shalaei, N. ; Nouri, V. ; Zech, M. ; Winkelmann, J. ; Shoeibi, A. ; Sadr-Nabavi, A.
Copy number analysis from whole-exome sequencing data revealed a novel homozygous deletion in PARK7 leads to severe early-onset Parkinson's disease.Indelicato, E. ; Pfeilstetter, J. ; Zech, M. ; Unterberger, I. ; Wanschitz, J. ; Berweck, S. ; Boesch, S.
New-onset refractory status epilepticus due to a novel MT-TF variant: Time for acute genetic testing before treatment?Smallwood, K. ; Watt, K.E.N. ; Ide, S. ; Baltrunaite, K. ; Brunswick, C. ; Inskeep, K. ; Capannari, C. ; Adam, M.P. ; Begtrup, A. ; Bertola, D.R. ; Demmer, L. ; Demo, E. ; Devinsky, O. ; Gallagher, E.R. ; Guillen Sacoto, M.J. ; Jech, R. ; Keren, B. ; Kussmann, J. ; Ladda, R. ; Lansdon, L.A. ; Lunke, S. ; Mardy, A. ; McWalters, K. ; Person, R. ; Raiti, L. ; Saitoh, N. ; Saunders, C.J. ; Schnur, R. ; Škorvánek, M. ; Sell, S.L. ; Slavotinek, A. ; Sullivan, B.R. ; Stark, Z. ; Symonds, J.D. ; Wenger, T. ; Weber, S. ; Whalen, S. ; White, S.M. ; Winkelmann, J. ; Zech, M. ; Zeidler, S. ; Maeshima, K. ; Stottmann, R.W. ; Trainor, P.A. ; Weaver, K.N.
POLR1A variants underlie phenotypic heterogeneity in craniofacial, neural, and cardiac anomalies.Patterson, V. ; Ullah, F. ; Bryant, L. ; Griffin, J.N. ; Sidhu, A. ; Saliganan, S. ; Blaile, M. ; Saenz, M.S. ; Smith, R. ; Ellingwood, S. ; Grange, D.K. ; Hu, X. ; Mireguli, M. ; Luo, Y. ; Shen, Y. ; Mulhern, M. ; Zackai, E. ; Ritter, A. ; Izumi, K. ; Hoefele, J. ; Wagner, M. ; Riedhammer, K.M. ; Seitz, B. ; Robin, N.H. ; Goodloe, D. ; Mignot, C. ; Keren, B. ; Cox, H. ; Jarvis, J. ; Hempel, M. ; Gibson, C.F. ; Tran Mau-Them, F. ; Vitobello, A. ; Bruel, A.L. ; Sorlin, A. ; Mehta, S. ; Raymond, F.L. ; Gilmore, K. ; Powell, B.C. ; Weck, K. ; Li, C. ; Vulto-van Silfhout, A.T. ; Giacomini, T. ; Mancardi, M.M. ; Accogli, A. ; Salpietro, V. ; Zara, F. ; Vora, N.L. ; Davis, E.E. ; Burdine, R. ; Bhoj, E.
Abrogation of MAP4K4 protein function causes congenital anomalies in humans and zebrafish.Ollila, H.M. ; Sharon, E. ; Lin, L. ; Sinnott-Armstrong, N. ; Ambati, A. ; Yogeshwar, S.M. ; Hillary, R.P. ; Jolanki, O. ; Faraco, J. ; Einen, M. ; Luo, G. ; Zhang, J. ; Han, F. ; Yan, H. ; Dong, X.S. ; Li, J. ; Hong, S.C. ; Kim, T.W. ; Dauvilliers, Y. ; Barateau, L. ; Lammers, G.J. ; Fronczek, R. ; Mayer, G. ; Santamaría, J. ; Arnulf, I. ; Knudsen-Heier, S. ; Bredahl, M.K.L. ; Thorsby, P.M. ; Plazzi, G. ; Pizza, F. ; Moresco, M. ; Crowe, C. ; Van den Eeden, S.K. ; Lecendreux, M. ; Bourgin, P. ; Kanbayashi, T. ; Martínez-Orozco, F.J. ; Peraita-Adrados, R. ; Benetó, A. ; Montplaisir, J. ; Desautels, A. ; Huang, Y.S. ; Jennum, P. ; Nevsimalova, S. ; Kemlink, D. ; Iranzo, A. ; Overeem, S. ; Wierzbicka, A. ; Geisler, P. ; Sonka, K. ; Honda, M. ; Högl, B. ; Stefani, A. ; Coelho, F.M. ; Mantovani, V. ; Feketeova, E. ; Wadelius, M. ; Eriksson, N. ; Smedje, H. ; Hallberg, P. ; Hesla, P.E. ; Rye, D. ; Pelin, Z. ; Ferini-Strambi, L. ; Bassetti, C.L. ; Mathis, J. ; Khatami, R. ; Aran, A. ; Nampoothiri, S. ; Olsson, T. ; Kockum, I. ; Partinen, M. ; Perola, M. ; Kornum, B.R. ; Rüeger, S. ; Winkelmann, J. ; Miyagawa, T. ; Toyoda, H. ; Khor, S.S. ; Shimada, M. ; Tokunaga, K. ; Rivas, M. ; Pritchard, J.K. ; Risch, N. ; Kutalik, Z. ; O'Hara, R. ; Hallmayer, J. ; Ye, C.J. ; Mignot, E.J.
Narcolepsy risk loci outline role of T cell autoimmunity and infectious triggers in narcolepsy.de Sainte Agathe, J.M. ; Pode-Shakked, B. ; Naudion, S. ; Michaud, V. ; Arveiler, B. ; Fergelot, P. ; Delmas, J. ; Keren, B. ; Poirsier, C. ; Alkuraya, F.S. ; Tabarki, B. ; Bend, E. ; Davis, K. ; Bebin, M. ; Thompson, M.L. ; Bryant, E.M. ; Wagner, M. ; Hannibal, I. ; Lenberg, J. ; Krenn, M. ; Wigby, K.M. ; Friedman, J.R. ; Iascone, M. ; Cereda, A. ; Miao, T. ; Leguern, E. ; Argilli, E. ; Sherr, E. ; Caluseriu, O. ; Tidwell, T. ; Bayrak-Toydemir, P. ; Hagedorn, C. ; Brugger, M. ; Vill, K. ; Morneau-Jacob, F.D. ; Chung, W. ; Weaver, K.N. ; Owens, J.W. ; Husami, A. ; Chaudhari, B.P. ; Stone, B.S. ; Burns, K. ; Li, R. ; de Lange, I.M. ; Biehler, M. ; Ginglinger, E. ; Gérard, B. ; Stottmann, R.W. ; Trimouille, A.
ARF1-related disorder: Phenotypic and molecular spectrum.Necpál, J. ; Winkelmann, J. ; Zech, M. ; Jech, R.
A de novo GRIA3 variant with complex hyperkinetic movement disorder in a girl with developmental delay and self-limited epilepsy.Ebstein, F. ; Küry, S. ; Most, V. ; Rosenfelt, C. ; Scott-Boyer, M.P. ; van Woerden, G.M. ; Besnard, T. ; Papendorf, J.J. ; Studencka-Turski, M. ; Wang, T. ; Hsieh, T.C. ; Golnik, R. ; Baldridge, D. ; Forster, C. ; de Konink, C. ; Teurlings, S.M.W. ; Vignard, V. ; van Jaarsveld, R.H. ; Ades, L. ; Cogné, B. ; Mignot, C. ; Deb, W. ; Jongmans, M.C.J. ; Cole, F.S. ; van den Boogaard, M.H. ; Wambach, J.A. ; Wegner, D.J. ; Yang, S. ; Hannig, V. ; Brault, J.A. ; Zadeh, N. ; Bennetts, B. ; Keren, B. ; Gélineau, A.C. ; Powis, Z. ; Towne, M. ; Bachman, K. ; Seeley, A. ; Beck, A.E. ; Morrison, J. ; Westman, R. ; Averill, K. ; Brunet, T. ; Haasters, J. ; Carter, M.T. ; Osmond, M. ; Wheeler, P.G. ; Forzano, F. ; Mohammed, S. ; Trakadis, Y. ; Accogli, A. ; Harrison, R. ; Guo, Y. ; Hakonarson, H. ; Rondeau, S. ; Baujat, G. ; Barcia, G. ; Feichtinger, R.G. ; Mayr, J.A. ; Preisel, M. ; Laumonnier, F. ; Kallinich, T. ; Knaus, A. ; Isidor, B. ; Krawitz, P. ; Völker, U. ; Hammer, E. ; Droit, A. ; Eichler, E.E. ; Elgersma, Y. ; Hildebrand, P.W. ; Bolduc, F. ; Kruger, E. ; Bézieau, S.
PSMC3 proteasome subunit variants are associated with neurodevelopmental delay and type I interferon production.Harrer, P. ; Mirza-Schreiber, N. ; Mandel, V. ; Roeber, S. ; Stefani, A. ; Naher, S. ; Wagner, M. ; Gieger, C. ; Waldenberger, M. ; Peters, A. ; Högl, B. ; Herms, J. ; Schormair, B. ; Zhao, C. ; Winkelmann, J. ; Oexle, K.
Epigenetic association analyses and risk prediction of RLS.Rots, D. ; Jakub, T.E. ; Keung, C. ; Jackson, A. ; Banka, S. ; Pfundt, R. ; de Vries, B.B.A. ; van Jaarsveld, R.H. ; Hopman, S.M.J. ; van Binsbergen, E. ; Valenzuela, I. ; Hempel, M. ; Bierhals, T. ; Kortüm, F. ; Lecoquierre, F. ; Goldenberg, A. ; Hertz, J.M. ; Andersen, C.B. ; Kibæk, M. ; Prijoles, E.J. ; Stevenson, R.E. ; Everman, D.B. ; Patterson, W.G. ; Meng, L. ; Gijavanekar, C. ; De Dios, K. ; Lakhani, S. ; Levy, T. ; Wagner, M. ; Wieczorek, D. ; Benke, P.J. ; Lopez Garcia, M.S. ; Perrier, R. ; Sousa, S.B. ; Almeida, P.M. ; Simões, M.J. ; Isidor, B. ; Deb, W. ; Schmanski, A.A. ; Abdul-Rahman, O. ; Philippe, C. ; Bruel, A.L. ; Faivre, L. ; Vitobello, A. ; Thauvin, C. ; Smits, J.J. ; Garavelli, L. ; Caraffi, S.G. ; Peluso, F. ; Davis-Keppen, L. ; Platt, D. ; Royer, E. ; Leeuwen, L. ; Sinnema, M. ; Stegmann, A.P.A. ; Stumpel, C.T.R.M. ; Tiller, G.E. ; Bosch, D.G.M. ; Potgieter, S.T. ; Joss, S. ; Splitt, M. ; Holden, S. ; Prapa, M. ; Foulds, N. ; Douzgou, S. ; Puura, K. ; Waltes, R. ; Chiocchetti, A.G. ; Freitag, C.M. ; Satterstrom, F.K. ; De Rubeis, S. ; Buxbaum, J. ; Gelb, B.D. ; Branko, A. ; Kushima, I. ; Howe, J. ; Scherer, S.W. ; Arado, A. ; Baldo, C. ; Patat, O. ; Bénédicte, D. ; Lopergolo, D. ; Santorelli, F.M. ; Haack, T. ; Dufke, A. ; Bertrand, M. ; Falb, R.J. ; Rieß, A. ; Krieg, P. ; Spranger, S. ; Bedeschi, M.F. ; Iascone, M. ; Josephi-Taylor, S. ; Roscioli, T. ; Buckley, M.F. ; Liebelt, J. ; Dagli, A.I. ; Aten, E. ; Hurst, A.C.E. ; Hicks, A. ; Suri, M. ; Aliu, E. ; Naik, S. ; Sidlow, R. ; Coursimault, J. ; Nicolas, G. ; Küpper, H. ; Petit, F. ; Ibrahim, V. ; Top, D. ; Di Cara, F. ; Louie, R.J. ; Stolerman, E. ; Brunner, H.G. ; Vissers, L.E.L.M. ; Kramer, J.M. ; Kleefstra, T.
The clinical and molecular spectrum of the KDM6B-related neurodevelopmental disorder.Silvaieh, S. ; König, T. ; Wurm, R. ; Parvizi, T. ; Berger-Sieczkowski, E. ; Goeschl, S. ; Hotzy, C. ; Wagner, M. ; Berutti, R. ; Sammler, E. ; Stogmann, E. ; Zimprich, A.
Correction: Comprehensive genetic screening of early-onset dementia patients in an Austrian cohort-suggesting new disease-contributing genes.Baglivo, M. ; Nasca, A. ; Lamantea, E. ; Vinci, S. ; Spagnolo, M. ; Marchet, S. ; Prokisch, H. ; Catania, A. ; Lamperti, C. ; Ghezzi, D.
Evaluation of mitochondrial dysfunction and idebenone responsiveness in fibroblasts from Leber's hereditary optic neuropathy (LHON) subjects.van der Ven, A.T. ; Cabrera-Orefice, A. ; Wente, I. ; Feichtinger, R.G. ; Tsiakas, K. ; Weiss, D. ; Bierhals, T. ; Scholle, L. ; Prokisch, H. ; Kopajtich, R. ; Santer, R. ; Mayr, J.A. ; Hempel, M. ; Wittig, I.
Expanding the phenotypic and biochemical spectrum of NDUFAF3-related mitochondrial disease.Mollereau, B. ; Hayflick, S.J. ; Escalante, R. ; Mauthe, M. ; Papandreou, A. ; Iuso, A. ; Celle, M. ; Aniorte, S. ; Issa, A.R. ; Lasserre, J.P. ; Lesca, G. ; Thobois, S. ; Burger, P. ; Walter, L.
A burning question from the first international BPAN symposium: Is restoration of autophagy a promising therapeutic strategy for BPAN?Smirnov, D. ; Konstantinovskiy, N. ; Prokisch, H.
Integrative omics approaches to advance rare disease diagnostics.Harrer, P. ; Škorvánek, M. ; Kittke, V. ; Dzinovic, I. ; Borngräber, F. ; Thomsen, M. ; Mandel, V. ; Svorenova, T. ; Ostrozovičová, M. ; Kulcsarová, K. ; Berutti, R. ; Busch, H. ; Ott, F. ; Kopajtich, R. ; Prokisch, H. ; Kumar, K.R. ; Mencacci, N.E. ; Kurian, M.A. ; Di Fonzo, A. ; Boesch, S. ; Kühn, A.A. ; Blümlein, U. ; Lohmann, K. ; Haslinger, B. ; Weise, D. ; Jech, R. ; Winkelmann, J. ; Zech, M.
Dystonia linked to EIF4A2 haploinsufficiency: A disorder of protein translation dysfunction.Di Fonzo, A. ; Jinnah, H.A. ; Zech, M.
Dystonia genes and their biological pathways.Dzinovic, I. ; Graf, E. ; Brugger, M. ; Berutti, R. ; Příhodová, I. ; Blaschek, A. ; Winkelmann, J. ; Jech, R. ; Vill, K. ; Zech, M.
Challenges in establishing the diagnosis of PRRT2-related dystonia: Recurrent pathogenic variants in a homopolymeric stretch.Indelicato, E. ; Boesch, S. ; Zech, M.
Reply to: "Early onset nonprogressive generalized dystonia is caused by biallelic SHQ1 variants".Voraberger, B. ; Mayr, J.A. ; Fratzl-Zelman, N. ; Blouin, S. ; Uday, S. ; Kopajtich, R. ; Koedam, M. ; Hödlmayr, H. ; Wortmann, S.B. ; Csillag, B. ; Prokisch, H. ; van der Eerden, B.C.J. ; El-Gazzar, A. ; Högler, W.
Investigating the role of ASCC1 in the causation of bone fragility.Kleinle, S. ; Scholz, V. ; Benet-Pages, A. ; Wohlfrom, T. ; Gehling, S. ; Scharf, F. ; Rost, S. ; Prott, E.C. ; Grinzinger, S. ; Hotter, A. ; Haug, V. ; Niemeier, S. ; Wiethoff-Ubrig, L. ; Hagenacker, T. ; Goldhahn, K. ; von Moers, A. ; Walter, M. ; Reilich, P. ; Eggermann, K. ; Kraft, F. ; Kurth, I. ; Erdmann, H. ; Holinski-Feder, E. ; Neuhann, T. ; Abicht, A.
Closing the Gap - Detection of 5q-spinal muscular atrophy by short-read Next-generation sequencing and unexpected results in a diagnostic patient cohort.Keshawarz, A. ; Joehanes, R. ; Ma, J. ; Lee, G.Y. ; Costeira, R. ; Tsai, P.C. ; Masachs, O.M. ; Bell, J.T. ; Wilson, R. ; Thorand, B. ; Winkelmann, J. ; Peters, A. ; Linseisen, J. ; Waldenberger, M. ; Lehtimäki, T. ; Mishra, P.P. ; Kähönen, M. ; Raitakari, O. ; Helminen, M. ; Wang, C.A. ; Melton, P.E. ; Huang, R.C. ; Pennell, C.E. ; O'Sullivan, T.A. ; Ochoa-Rosales, C. ; Voortman, T. ; van Meurs, J.B.J. ; Young, K.L. ; Graff, M. ; Wang, Y. ; Kiel, D.P. ; Smith, C.E. ; Jacques, P.F. ; Levy, D.
Dietary and supplemental intake of vitamins C and E is associated with altered DNA methylation in an epigenome-wide association study meta-analysis.Zheng, J. ; Wheeler, E. ; Pietzner, M. ; Andlauer, T.F.M. ; Yau, M.S. ; Hartley, A.E. ; Brumpton, B.M. ; Rasheed, H. ; Kemp, J.P. ; Frysz, M. ; Robinson, J. ; Reppe, S. ; Prijatelj, V. ; Gautvik, K.M. ; Falk, L. ; Maerz, W. ; Gergei, I. ; Peyser, P.A. ; Kavousi, M. ; de Vries, P.S. ; Miller, C.L. ; Bos, M. ; van der Laan, S.W. ; Malhotra, R. ; Herrmann, M. ; Scharnagl, H. ; Kleber, M. ; Dedoussis, G. ; Zeggini, E. ; Nethander, M. ; Ohlsson, C. ; Lorentzon, M. ; Wareham, N. ; Langenberg, C. ; Holmes, M.V. ; Davey Smith, G. ; Tobias, J.H.
Lowering of circulating sclerostin may increase risk of atherosclerosis and its risk factors: Evidence from a genome-wide association meta-analysis followed by Mendelian randomization.Rahmioglu, N. ; Mortlock, S. ; Ghiasi, M. ; Møller, P.L. ; Stefansdottir, L. ; Galarneau, G. ; Turman, C. ; Danning, R. ; Law, M.H. ; Sapkota, Y. ; Christofidou, P. ; Skarp, S. ; Giri, A. ; Banasik, K. ; Krassowski, M. ; Lepamets, M. ; Marciniak, B. ; Nõukas, M. ; Perro, D. ; Sliz, E. ; Sobalska-Kwapis, M. ; Thorleifsson, G. ; Topbas-Selcuki, N.F. ; Vitonis, A. ; Westergaard, D. ; Arnadottir, R. ; Burgdorf, K.S. ; Campbell, A. ; Cheuk, C.S.K. ; Clementi, C. ; Cook, J. ; de Vivo, I. ; DiVasta, A. ; Dorien, O. ; Donoghue, J.F. ; Edwards, T. ; Fontanillas, P. ; Fung, J.N. ; Geirsson, R.T. ; Girling, J.E. ; Harkki, P. ; Harris, H.R. ; Healey, M. ; Heikinheimo, O. ; Holdsworth-Carson, S. ; Hostettler, I.C. ; Houlden, H. ; Houshdaran, S. ; Irwin, J.C. ; Jarvelin, M.R. ; Kamatani, Y. ; Kennedy, S.H. ; Kepka, E. ; Kettunen, J. ; Kubo, M. ; Kulig, B. ; Kurra, V. ; Laivuori, H. ; Laufer, M.R. ; Lindgren, C.M. ; MacGregor, S. ; Mangino, M. ; Martin, N.G. ; Matalliotaki, C. ; Matalliotakis, M. ; Murray, A.D. ; Ndungu, A. ; Nezhat, C. ; Olsen, C.M. ; Opoku-Anane, J. ; Padmanabhan, S. ; Paranjpe, M. ; Peters, M. ; Polak, G. ; Porteous, D.J. ; Rabban, J. ; Rexrode, K.M. ; Romanowicz, H. ; Saare, M. ; Saavalainen, L. ; Schork, A.J. ; Sen, S. ; Shafrir, A.L. ; Siewierska-Górska, A. ; Słomka, M. ; Smith, B.H. ; Smolarz, B. ; Szaflik, T. ; Szyłło, K. ; Takahashi, A. ; Terry, K.L. ; Tomassetti, C. ; Treloar, S.A. ; Vanhie, A. ; Vincent, K. ; Vo, K.C. ; Werring, D.J. ; Zeggini, E. ; Zervou, M.I. ; Adachi, S. ; Buring, J.E. ; Ridker, P.M. ; D'Hooghe, T. ; Goulielmos, G.N. ; Hapangama, D.K. ; Hayward, C. ; Horne, A.W. ; Low, S.K. ; Martikainen, H. ; Chasman, D.I. ; Rogers, P.A.W. ; Saunders, P.T. ; Sirota, M. ; Spector, T. ; Strapagiel, D. ; Tung, J.Y. ; Whiteman, D.C. ; Giudice, L.C. ; Velez-Edwards, D.R. ; Uimari, O. ; Kraft, P. ; Salumets, A. ; Nyholt, D.R. ; Mägi, R. ; Stefansson, K. ; Becker, C.M. ; Yurttas-Beim, P. ; Steinthorsdottir, V. ; Nyegaard, M. ; Missmer, S.A. ; Montgomery, G.W. ; Morris, A.P. ; Zondervan, K.T.
The genetic basis of endometriosis and comorbidity with other pain and inflammatory conditions.Shrine, N. ; Izquierdo, A.G. ; Chen, J. ; Packer, R. ; Hall, R.J. ; Guyatt, A.L. ; Batini, C. ; Thompson, R.J. ; Pavuluri, C. ; Malik, V. ; Hobbs, B.D. ; Moll, M. ; Kim, W. ; Tal-Singer, R. ; Bakke, P. ; Fawcett, K.A. ; John, C. ; Coley, K. ; Piga, N.N. ; Pozarickij, A. ; Lin, K. ; Millwood, I.Y. ; Chen, Z. ; Li, L. ; Wijnant, S.R.A. ; Lahousse, L. ; Brusselle, G. ; Uitterlinden, A.G. ; Manichaikul, A. ; Oelsner, E.C. ; Rich, S.S. ; Barr, R.G. ; Kerr, S.M. ; Vitart, V. ; Brown, M.R. ; Wielscher, M. ; Imboden, M. ; Jeong, A. ; Bartz, T.M. ; Gharib, S.A. ; Flexeder, C. ; Karrasch, S. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Stubbe, B. ; Hu, X. ; Ortega, V.E. ; Meyers, D.A. ; Bleecker, E.R. ; Gabriel, S.B. ; Gupta, N. ; Smith, A.V. ; Luan, J. ; Zhao, J.H. ; Hansen, A.F. ; Langhammer, A. ; Willer, C. ; Bhatta, L. ; Porteous, D. ; Smith, B.H. ; Campbell, A. ; Sofer, T. ; Lee, J. ; Daviglus, M.L. ; Yu, B. ; Lim, E. ; Xu, H. ; O'Connor, G.T. ; Thareja, G. ; Albagha, O.M.E. ; Suhre, K. ; Granell, R. ; Faquih, T.O. ; Hiemstra, P.S. ; Slats, A.M. ; Mullin, B.H. ; Hui, J. ; James, A. ; Beilby, J. ; Patasova, K. ; Hysi, P. ; Koskela, J.T. ; Wyss, A.B. ; Jin, J. ; Sikdar, S. ; Lee, M. ; May-Wilson, S. ; Pirastu, N. ; Kentistou, K.A. ; Joshi, P.K. ; Timmers, P.R.H.J. ; Williams, A.T. ; Free, R.C. ; Wang, X. ; Morrison, J.L. ; Gilliland, F.D. ; Wang, C.A. ; Foong, R.E. ; Harris, S.E. ; Taylor, A. ; Redmond, P. ; Cook, J.P. ; Mahajan, A. ; Lind, L. ; Palviainen, T. ; Lehtimäki, T. ; Raitakari, O.T. ; Kaprio, J. ; Rantanen, T. ; Pietiläinen, K.H. ; Cox, S.R. ; Pennell, C.E. ; Hall, G.L. ; Gauderman, W.J. ; Brightling, C. ; Wilson, J.F. ; Vasankari, T. ; Laitinen, T. ; Salomaa, V. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Timpson, N.J. ; Zeggini, E. ; Dupuis, J. ; Hayward, C. ; Brumpton, B. ; Langenberg, C. ; Weiss, S. ; Homuth, G. ; Schmidt, C.O. ; Probst-Hensch, N. ; Jarvelin, M.R. ; Morrison, A.C. ; Polasek, O. ; Rudan, I. ; Lee, J.H. ; Sayers, I. ; Rawlins, E.L. ; Dudbridge, F. ; Silverman, E.K. ; Strachan, D.P. ; Walters, R.G. ; Morris, A.P. ; London, S.J. ; Cho, M.H. ; Wain, L.V. ; Hall, I.P. ; Tobin, M.D.
Multi-ancestry genome-wide association analyses improve resolution of genes and pathways influencing lung function and chronic obstructive pulmonary disease risk.Bridges, E.C. ; Rayner, N.W. ; Mountford, H.S. ; Bates, T.C. ; Luciano, M.
Longitudinal reading measures and genome imputation in the National Child Development Study: Prospects for future reading research.Bocher, O. ; Marenne, G. ; Genin, E. ; Perdry, H.
Ravages: An R package for the simulation and analysis of rare variants in multicategory phenotypes.Hollis, B. ; Chatzigeorgiou, C. ; Southam, L. ; Hatzikotoulas, K. ; Kluzek, S. ; Williams, A. ; Zeggini, E. ; Jostins-Dean, L. ; Watt, F.E.
Lifetime risk and genetic predisposition to post-traumatic OA of the knee in the UK Biobank.Mayanja, R. ; Machipisa, T. ; Soremekun, O. ; Kamiza, A.B. ; Kintu, C. ; Kalungi, A. ; Kalyesubula, R. ; Sande, O.J. ; Jjingo, D. ; Fabian, J. ; Robinson-Cohen, C. ; Franceschini, N. ; Nitsch, D. ; Nyirenda, M. ; Zeggini, E. ; Morris, A.P. ; Chikowore, T. ; Fatumo, S.
Genome-wide association analysis of cystatin-C kidney function in continental Africa.Faber, B.G. ; Frysz, M. ; Boer, C.G. ; Evans, D.S. ; Ebsim, R. ; Flynn, K.A. ; Lundberg, M. ; Southam, L. ; Hartley, A. ; Saunders, F.R. ; Lindner, C. ; Gregory, J.S. ; Aspden, R.M. ; Lane, N.E. ; Harvey, N.C. ; Evans, D.M ; Zeggini, E. ; Davey Smith, G. ; Cootes, T. ; van Meurs, J. ; Kemp, J.P. ; Tobias, J.H.
The identification of distinct protective and susceptibility mechanisms for hip osteoarthritis: Findings from a genome-wide association study meta-analysis of minimum joint space width and Mendelian randomisation cluster analyses.Mullin, B.H. ; Zhu, K. ; Brown, S.J. ; Mullin, S. ; Dudbridge, F. ; Pavlos, N.J. ; Richards, J.B. ; Grundberg, E. ; Bell, J.T. ; Zeggini, E. ; Walsh, J.P. ; Xu, J. ; Wilson, S.G.
Leveraging osteoclast genetic regulatory data to identify genes with a role in osteoarthritis.Carland, C. ; Png, G. ; Mälarstig, A. ; Kho, P.F. ; Gustafsson, S. ; Michaelsson, K. ; Lind, L. ; Tsafantakis, E. ; Karaleftheri, M. ; Dedoussis, G. ; Ramisch, A. ; Macdonald-Dunlop, E. ; Klaric, L. ; Joshi, P.K. ; Chen, Y. ; Björck, H.M. ; Eriksson, P. ; Carrasco-Zanini, J. ; Wheeler, E. ; Suhre, K. ; Gilly, A. ; Zeggini, E. ; Viñuela, A. ; Dermitzakis, E.T. ; Wilson, J.F. ; Langenberg, C. ; Thareja, G. ; Halama, A. ; Schmidt, F. ; Zanetti, D. ; Assimes, T.
Proteomic analysis of 92 circulating proteins and their effects in cardiometabolic diseases.Bocher, O. ; Gilly, A. ; Park, Y.-C. ; Zeggini, E. ; Morris, A.P.
Bridging the diversity gap: Analytical and study design considerations for improving the accuracy of trans-ancestry genetic prediction.De Santana Villasboas Arruda, A.L. ; Hartley, A. ; Katsoula, G. ; Smith, G.D. ; Morris, A.P. ; Zeggini, E.
Genetic underpinning of the comorbidity between type 2 diabetes and osteoarthritis.Shen, P. ; Serve, S. ; Wu, P. ; Liu, X. ; Dai, Y. ; Durán-Hernández, N. ; Nguyen, D.T.M. ; Fuchs, M. ; Maleitzke, T. ; Reisener, M.J. ; Dzamukova, M. ; Nussbaumer, K. ; Brunner, T.M. ; Li, Y. ; Holecska, V. ; Heinz, G. ; Heinrich, F. ; Durek, P. ; Katsoula, G. ; Gwinner, C. ; Jung, T. ; Zeggini, E. ; Winkler, T. ; Mashreghi, M.F. ; Pumberger, M. ; Perka, C. ; Löhning, M.
NOS inhibition reverses TLR2-induced chondrocyte dysfunction and attenuates age-related osteoarthritis.Colombo, S.A.P. ; Brown, S.L. ; Hepworth, M.R. ; Hankinson, J. ; Granato, F. ; Kitchen, S.J. ; Hussell, T. ; Simpson, A. ; Cook, P.C. ; MacDonald, A.S.
Comparative phenotype of circulating versus tissue immune cells in human lung and blood compartments during health and disease.Müller, J. ; Hösel, V.
Contact tracing & super-spreaders in the branching-process model.Lakrisenko, P. ; Stapor, P. ; Grein, S. ; Paszkowski, L. ; Pathirana, D. ; Fröhlich, F. ; Lines, G.T. ; Weindl, D. ; Hasenauer, J.
Efficient computation of adjoint sensitivities at steady-state in ODE models of biochemical reaction networks.Joza, S. ; Hu, M.T. ; Jung, K.Y. ; Kunz, D. ; Stefani, A. ; Dušek, P. ; Terzaghi, M. ; Arnaldi, D. ; Videnovic, A. ; Schiess, M.C. ; Hermann, W. ; Lee, J.Y. ; Ferini-Strambi, L. ; Lewis, S.J.G. ; Leclair-Visonneau, L. ; Oertel, W.H. ; Antelmi, E. ; Sixel-Döring, F. ; Cochen De Cock, V. ; Liguori, C. ; Liu, J. ; Provini, F. ; Puligheddu, M. ; Nicoletti, A. ; Bassetti, C.L.A. ; Bušková, J. ; Dauvilliers, Y. ; Ferri, R. ; Montplaisir, J.Y. ; Lawton, M. ; Kim, H.J. ; Bes, F. ; Högl, B. ; Sonka, K. ; Fiamingo, G. ; Pietro, M. ; Lavadia, M.L. ; Suescun, J. ; Woo, K.A. ; Marelli, S. ; Ehgoetz Martens, K. ; Janzen, A. ; Plazzi, G. ; Mollenhauer, B. ; Fernandes, M. ; Li, Y. ; Cortelli, P. ; Figorilli, M. ; Cicero, C.E. ; Schaefer, C. ; Guiraud, L. ; Lanza, G. ; Gagnon, J.F. ; Sunwoo, J.S. ; Ibrahim, A. ; Girtler, N. ; Trenkwalder, C. ; Baldelli, L. ; Pelletier, A. ; Postuma, R.B.
Progression of clinical markers in prodromal Parkinson's disease and dementia with Lewy bodies: a multicentre study.Nasca, A. ; Mencacci, N.E. ; Invernizzi, F. ; Zech, M. ; Sarmiento, I.J.K. ; Legati, A. ; Frascarelli, C. ; Bustos, B.I. ; Romito, L.M. ; Krainc, D. ; Winkelmann, J. ; Carecchio, M. ; Nardocci, N. ; Zorzi, G. ; Prokisch, H. ; Lubbe, S.J. ; Garavaglia, B. ; Ghezzi, D.
Variants in ATP5F1B are associated with dominantly inherited dystonia.Anantua, R. ; Duran, J. ; Ngata, N. ; Oramas, L. ; Röder, J. ; Emami, R. ; Ricarte, A. ; Curd, B. ; Broderick, A.E. ; Wayland, J.D. ; Wong, G.N. ; Ressler, S. ; Nigam, N. ; Durodola, E.
Emission modeling in the EHT–ngEHT age.Horlacher, M. ; Oleshko, S. ; Hu, Y. ; Ghanbari, M. ; Cantini, G. ; Schinke, P. ; Vergara, E.E. ; Bittner, F. ; Mueller, N.S. ; Ohler, U. ; Moyon, L. ; Marsico, A.
A computational map of the human-SARS-CoV-2 protein-RNA interactome predicted at single-nucleotide resolution.Blaschek, A. ; Sitzberger, A. ; Brugger, M. ; Graf, E. ; Berutti, R. ; Zech, M. ; Vill, K.
TAOK1-related neurodevelopmental disorder: A new differential diagnosis for childhood-onset tremor?Weiss, K.J. ; Berger, U. ; Haider, M. ; Wagner, M. ; Märtner, E.M.C. ; Regenauer-Vandewiele, S. ; Lotz-Havla, A. ; Schuhmann, E. ; Röschinger, W. ; Maier, E.M.
Free carnitine concentrations and biochemical parameters in medium-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency: Genotype-phenotype correlation.Dong, Q. ; Sidra, S. ; Gieger, C. ; Wang-Sattler, R. ; Rathmann, W. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Koenig, W. ; Peters, A. ; Grallert, H. ; Sharma, S.
Metabolic signatures elucidate the effect of body mass index on type 2 diabetes.Höllbacher, B. ; Strickland, B. ; Greulich, F. ; Uhlenhaut, N.H. ; Heinig, M.
Machine learning reveals STAT motifs as predictors for GR-mediated gene repression.Akcan, T.S. ; Vilov, S. ; Heinig, M.
Predictive model of transcriptional elongation control identifies trans regulatory factors from chromatin signatures.Schlieben, L.D. ; Prokisch, H.
Genetics of mitochondrial diseases: Current approaches for the molecular diagnosis.Kuzkina, A. ; Panzer, C. ; Seger, A. ; Schmitt, D. ; Rößle, J. ; Schreglmann, S.R. ; Knacke, H. ; Salabasidou, E. ; Kohl, A. ; Sittig, E. ; Barbe, M. ; Berg, D. ; Volkmann, J. ; Sommer, C. ; Oertel, W.H. ; Schaeffer, E. ; Sommerauer, M. ; Janzen, A. ; Doppler, K.
Dermal real-time quaking-induced conversion is a sensitive marker to confirm isolated rapid eye movement sleep behavior disorder as an early α-synucleinopathy.Lotfollahi, M. ; Rybakov, S. ; Hrovatin, K. ; Hediyeh-Zadeh, S. ; Talavera Lopez, C.N. ; Misharin, A.V. ; Theis, F.J.
Biologically informed deep learning to query gene programs in single-cell atlases.Matosin, N. ; Arloth, J. ; Czamara, D. ; Edmond, K.Z. ; Maitra, M. ; Fröhlich, A.S. ; Martinelli, S. ; Kaul, D. ; Bartlett, R. ; Curry, A.R. ; Gassen, N.C. ; Hafner, K. ; Müller, N.S. ; Worf, K. ; Rehawi, G. ; Nagy, C. ; Halldorsdottir, T. ; Cruceanu, C. ; Gagliardi, M. ; Gerstner, N. ; Ködel, M. ; Murek, V. ; Ziller, M.J. ; Scarr, E. ; Tao, R. ; Jaffe, A.E. ; Arzberger, T. ; Falkai, P. ; Kleinmann, J.E. ; Weinberger, D.R. ; Mechawar, N. ; Schmitt, A. ; Dean, B. ; Turecki, G. ; Hyde, T.M. ; Binder, E.B.
Associations of psychiatric disease and ageing with FKBP5 expression converge on superficial layer neurons of the neocortex.Rügamer, D. ; Kolb, C. ; Fritz, C. ; Pfisterer, F. ; Kopper, P. ; Bischl, B. ; Shen, R. ; Bukas, C. ; Barros De Andrade E Sousa, L. ; Thalmeier, D. ; Baumann, P.F.M. ; Kook, L. ; Klein, N. ; Müller, C.L.
deepregression: A flexible neural network framework for semi-structured deep distributional regression.Hecker, D. ; Behjati Ardakani, F. ; Karollus, A. ; Gagneur, J. ; Schulz, M.H.
The adapted activity-by-contact model for enhancer-gene assignment and its application to single-cell data.Saßmannshausen, M. ; Vaisband, M. ; von der Emde, L. ; Sloan, K.R. ; Hasenauer, J. ; Holz, F.G. ; Ach, T.
Hyperreflective foci in intermediate age-related macular degeneration: Spatial abundance and impact on retinal morphologyWeiß, M. ; Chanou, A. ; Schauer, T. ; Tvardovskiy, A. ; Meiser, S. ; König, A.-C. ; Schmidt, T. ; Kruse, E. ; Ummethum, H. ; Trauner, M. ; Werner, M. ; Lalonde, M. ; Hauck, S.M. ; Scialdone, A. ; Hamperl, S.
Single-copy locus proteomics of early- and late-firing DNA replication origins identifies a role of Ask1/DASH complex in replication timing control.Weihs, A. ; Chaker, L. ; Martin, T.C. ; Braun, K.V.E. ; Campbell, P.J. ; Cox, S.R. ; Fornage, M. ; Gieger, C. ; Grabe, H.J. ; Grallert, H. ; Harris, S.E. ; Kühnel, B. ; Marioni, R.E. ; Martin, N.G. ; McCartney, D.L. ; McRae, A.F. ; Meisinger, C. ; Meurs, J.V. ; Nano, J. ; Nauck, M. ; Peters, A. ; Prokisch, H. ; Roden, M. ; Selvin, E. ; Beekman, M. ; van Heemst, D. ; Slagboom, E.P. ; Swenson, B.R. ; Tin, A. ; Tsai, P.C. ; Uitterlinden, A.G. ; Visser, W.E. ; Völzke, H. ; Waldenberger, M. ; Walsh, J.P. ; Köttgen, A. ; Wilson, S.G. ; Peeters, R.P. ; Bell, J.T. ; Medici, M. ; Teumer, A.
Epigenome-wide association study reveals CpG sites associated with thyroid function and regulatory effects on KLF9.Farnoud, A. ; Tofighian, H. ; Baumann, I. ; Ahookhosh, K. ; Pourmehran, O. ; Cui, X. ; Heuveline, V. ; Song, C. ; Vreugde, S. ; Wormald, P.J. ; Menden, M.P. ; Schmid, O.
Numerical and machine Learning analysis of the parameters affecting the regionally delivered nasal dose of nano- and micro-sized aerosolized drugs.Zanuttigh, E. ; Derderian, K. ; Güra, M. ; Geerlof, A. ; Di Meo, I. ; Cavestro, C. ; Hempfling, S. ; Ortiz Collazos, S. ; Mauthe, M. ; Kmiec, T. ; Cammarota, E. ; Panzeri, M.C. ; Klopstock, T. ; Sattler, M. ; Winkelmann, J. ; Messias, A.C. ; Iuso, A.
Identification of autophagy as a functional target suitable for the pharmacological treatment of mitochondrial membrane protein-associated neurodegeneration (MPAN) in vitro.Kotlarz, D.M.
Identification of the γδ IEL-secreted Paneth cell protective factor API5 as a promising therapeutic target for ATG16L1-associated Crohn's disease.Faber, B.G. ; Frysz, M. ; Hartley, A.E. ; Ebsim, R. ; Boer, C.G. ; Saunders, F.R. ; Gregory, J.S. ; Aspden, R.M. ; Harvey, N.C. ; Southam, L. ; Giles, W. ; Le Maitre, C.L. ; Wilkinson, J.M. ; van Meurs, J.B.J. ; Zeggini, E. ; Cootes, T. ; Lindner, C. ; Kemp, J.P. ; Davey Smith, G. ; Tobias, J.H.
A GWAS meta-analysis of alpha angle suggests cam-type morphology may be a specific feature of hip osteoarthritis in older adults.Vilov, S. ; Heinig, M.
DeepSom: A CNN-based approach to somatic variant calling in WGS samples without a matched normal.Rohwedder, I. ; Wackerbarth, L.M. ; Heinig, K. ; Ballweg, A. ; Altstätter, J. ; Ripphahn, M. ; Nussbaum, C. ; Salvermoser, M. ; Bierschenk, S. ; Straub, T. ; Gunzer, M. ; Schmidt-Supprian, M. ; Kolben, T. ; Schulz, C. ; Ma, A. ; Walzog, B. ; Heinig, M. ; Sperandio, M.
A20 and the non-canonical NF-κB pathway are key regulators of neutrophil recruitment during fetal ontogeny.Thuesen, A.C.B. ; Stæger, F.F. ; Kaci, A. ; Solheim, M.H. ; Aukrust, I. ; Jørsboe, E. ; Santander, C.G. ; Andersen, M.K. ; Li, Z. ; Gilly, A. ; Stinson, S.E. ; Gjesing, A.P. ; Bjerregaard, P. ; Pedersen, M.L. ; Larsen, C.V.L. ; Grarup, N. ; Jørgensen, M.E. ; Zeggini, E. ; Bjørkhaug, L. ; Njølstad, P.R. ; Albrechtsen, A. ; Moltke, I. ; Hansen, T.
A novel splice-affecting HNF1A variant with large population impact on diabetes in Greenland.Bredthauer, C. ; Fischer, A. ; Ahari, A.J. ; Cao, X. ; Weber, J. ; Rad, L. ; Rad, R. ; Wachutka, L. ; Gagneur, J.
Transmicron: Accurate prediction of insertion probabilities improves detection of cancer driver genes from transposon mutagenesis screens.Ullmann, T. ; Peschel, S. ; Finger, P. ; Müller, C.L. ; Boulesteix, A.L.
Over-optimism in unsupervised microbiome analysis: Insights from network learning and clustering.Weiler, P. ; Van den Berge, K. ; Street, K. ; Tiberi, S.
A guide to trajectory inference and RNA velocity.Nassar, L.R. ; Barber, G.P. ; Benet-Pages, A. ; Casper, J. ; Clawson, H. ; Diekhans, M. ; Fischer, C. ; Gonzalez, J.N. ; Hinrichs, A.S. ; Lee, B.T. ; Lee, C.M. ; Muthuraman, P. ; Nguy, B. ; Pereira, T. ; Nejad, P. ; Perez, G. ; Raney, B.J. ; Schmelter, D. ; Speir, M.L. ; Wick, B.D. ; Zweig, A.S. ; Haussler, D. ; Kuhn, R.M. ; Haeussler, M. ; Kent, W.J.
The UCSC genome browser database: 2023 update.Li, Y. ; Yu, Z. ; Schenk, M. ; Lagovsky, I. ; Illig, D. ; Walz, C. ; Rohlfs, M. ; Conca, R. ; Muise, A.M. ; Snapper, S.B. ; Uhlig, H.H. ; Garty, B.Z. ; Klein, C. ; Kotlarz, D.M.
Human MD2 deficiency-an inborn error of immunity with pleiotropic features.Capitani, M. ; Al-Shaibi, A.A. ; Pandey, S. ; Gartner, L. ; Taylor, H.A. ; Hubrack, S.Z. ; Agrebi, N. ; Al-Mohannadi, M.J. ; Al Kaabi, S. ; Vogl, T. ; Roth, J. ; Kotlarz, D.M. ; Klein, C. ; Charles, A.K. ; Vijayakumar, V. ; Karim, M.Y. ; George, B. ; Travis, S.P. ; Elawad, M. ; Lo, B. ; Uhlig, H.H.
Biallelic TLR4 deficiency in humans.Harrer, P. ; Schalk, A. ; Shimura, M. ; Baer, S. ; Calmels, N. ; Spitz, M.A. ; Abi Warde, M.T. ; Schaefer, E. ; Kittke, V. ; Dincer, Y. ; Wagner, M. ; Dzinovic, I. ; Berutti, R. ; Sato, T. ; Shirakawa, T. ; Okazaki, Y. ; Murayama, K. ; Oexle, K. ; Prokisch, H. ; Mall, V. ; Melčák, I. ; Winkelmann, J. ; Zech, M.
Recessive NUP54 variants underlie early-onset dystonia with striatal lesions.Krenn, M. ; Sener, M. ; Rath, J. ; Zulehner, G. ; Keritam, O. ; Wagner, M. ; Laccone, F. ; Iglseder, S. ; Marte, S. ; Baumgartner, M. ; Eisenkölbl, A. ; Liechtenstein, C. ; Rudnik, S. ; Quasthoff, S. ; Grinzinger, S. ; Spenger, J. ; Wortmann, S.B. ; Löscher, W.N. ; Zimprich, F. ; Kellersmann, A. ; Rappold, M. ; Bernert, G. ; Freilinger, M. ; Cetin, H.
The clinical and molecular landscape of congenital myasthenic syndromes in Austria: A nationwide study.Hernandez, E.D. ; Fernándes, D. ; Efendiyev, M.A. ; Wu, J.
Finite fractal dimensional global attractor for abstract differential equations with state-dependent delay.Basuroy, T. ; Dreier, M. ; Baum, C. ; Blomquist, T. ; Trumbly, R. ; Filipp, F.V. ; de la Serna, I.L.
Epigenetic and pharmacological control of pigmentation via Bromodomain Protein 9 (BRD9).Thareja, G. ; Belkadi, A. ; Arnold, M. ; Albagha, O.M.E. ; Graumann, J. ; Schmidt, F. ; Grallert, H. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Suhre, K.
Differences and commonalities in the genetic architecture of protein quantitative trait loci in European and Arab populations.Popp, B. ; Brugger, M. ; Poschmann, S. ; Bartolomaeus, T. ; Radtke, M. ; Hentschel, J. ; di Donato, N. ; Rump, A. ; Gburek-Augustat, J. ; Graf, E. ; Wagner, M. ; Sorge, I. ; Lemke, J.R. ; Meitinger, T. ; Abou Jamra, R. ; Strehlow, V. ; Brunet, T.
The constitutional gain-of-function variant p.Glu1099Lys in NSD2 is associated with a novel syndrome.Ghalandary ; Gao, Y. ; Amend, D. ; Kutkaite, G. ; Vick, B. ; Spiekermann, K. ; Rothenberg-Thurley, M. ; Metzeler, K.H. ; Marcinek, A. ; Subklewe, M. ; Menden, M.P. ; Jurinovic, V. ; Bahrami, E. ; Jeremias, I.
WT1 and DNMT3A play essential roles in the growth of certain patient AML cells in mice.Kim, D.-K. ; Weller, B. ; Lin, C.-W. ; Sheykhkarimli, D. ; Knapp, J.J. ; Dugied, G. ; Zanzoni, A. ; Pons, C. ; Tofaute, M.J. ; Maseko, S.B. ; Spirohn, K. ; Laval, F. ; Lambourne, L. ; Kishore, N. ; Rayhan, A. ; Sauer, M. ; Young, V. ; Halder, H. ; Marin De La Rosa, N.A. ; Pogoutse, O. ; Strobel, A. ; Schwehn, P. ; Li, R. ; Rothballer, S.T. ; Altmann, M. ; Cassonnet, P. ; Coté, A.G. ; Elorduy Vergara, L. ; Hazelwood, I. ; Liu, B.B. ; Nguyen, M. ; Pandiarajan, R. ; Dohai, B.S.M. ; Rodriguez, P.A. ; Poirson, J. ; Giuliana, P. ; Willems, L. ; Taipale, M. ; Jacob, Y. ; Hao, T. ; Hill, D.E. ; Brun, C. ; Twizere, J.C. ; Krappmann, D. ; Heinig, M. ; Falter, C. ; Aloy, P. ; Demeret, C. ; Vidal, M. ; Calderwood, M.A. ; Roth, F.B. ; Falter-Braun, P.
A proteome-scale map of the SARS-CoV-2-human contactome.Kreitmaier, P. ; Katsoula, G. ; Zeggini, E.
Insights from multi-omics integration in complex disease primary tissues.Kindt, A. ; Förster, K. ; Cochius-den Otter, S.C.M. ; Flemmer, A.W. ; Hauck, S.M. ; Flatley, A. ; Kamphuis, J. ; Karrasch, S. ; Behr, J. ; Franz, A. ; Härtel, C. ; Krumsiek, J. ; Tibboel, D. ; Hilgendorff, A.
Validation of disease-specific biomarkers for the early detection of bronchopulmonary dysplasia.