All Publications
Linguraru, M.G. ; Dou, Q. ; Feragen, A. ; Giannarou, S. ; Glocker, B. ; Lekadir, K. ; Schnabel, J.A.
Preface.Arruda, A.L.
Understanding multimorbidity with big data in genomics.Klein, D. ; Uscidda, T. ; Theis, F.J. ; Cuturi, M.C.
GENOT: Entropic (Gromov) Wasserstein flow matching with applications to single-cell genomics.Szałata, A. ; Benz, A. ; Cannoodt, R. ; Cortes, M. ; Fong, J. ; Kuppasani, S. ; Lieberman, R. ; Liu, T. ; Mas-Rosario, J.A. ; Meinl, R. ; Nourisa, J. ; Tumiel, R. ; Tunjic, T.M. ; Wang, M. ; Weber, N. ; Zhao, H. ; Anchang, B. ; Theis, F.J. ; Luecken, M. ; Burkhardt, D.B.
A benchmark for prediction of transcriptomic responses to chemical perturbations across cell types.Klein, D. ; Uscidda, T. ; Theis, F.J. ; Cuturi, M.C.
Generative Entropic Neural Optimal Transport To Map Within and Across Space.von Rohrscheidt, J.C. ; Rieck, B. ; Schmon, S.M.
Bayesian computation meets topology.Ayadi, S. ; Hetzel, L. ; Sommer, J. ; Theis, F.J. ; Günnemann, S.
Unified guidance for geometry-conditioned molecular generation.Nasirigerdeh, R. ; Torkzadehmahani, R. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Kernel normalized convolutional networks.Mueller, T.T. ; Starck, S. ; Bintsi, K.M. ; Ziller, A. ; Braren, R. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
Are Population Graphs Really as Powerful as Believed?Eyring, L. ; Klein, D. ; Uscidda, T. ; Palla, G. ; Kilbertus, N. ; Akata, Z. ; Theis, F.J.
Unbalancedness in Neural Monge Maps Improves Unpaired Domain Translation.Fleischmann, S. ; Dietz, S. ; Shanbhag, J. ; Wuensch, A. ; Nitschké, M.J.E. ; Miehling, J. ; Wartzack, S. ; Leyendecker, S. ; Eskofier, B.M. ; Koelewijn, A.D.
Exploring dataset bias and scaling techniques in multi-source gait biomechanics: An explainable machine learning approach.Föllmer, B. ; Williams, M.C. ; Dey, D. ; Arbab-Zadeh, A. ; Maurovich-Horvat, P. ; Volleberg, R.H.J.A. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A. ; Newby, D.E. ; Dweck, M.R. ; Guagliumi, G. ; Falk, V. ; Mézquita, A.J.V. ; Biavati, F. ; Isgum, I. ; Dewey, M.
Roadmap on the use of artificial intelligence for imaging of vulnerable atherosclerotic plaque in coronary arteries.Arnold, M.
Integrating multi-omics data for target and biomarker discovery.Schweickart, A. ; Huynh, K. ; Batra, R. ; Neth, B.J. ; Martino, C. ; Dilmore, A.H. ; Giles, C. ; Wang, T. ; Mellett, N.A. ; Duong, T. ; Shenhav, L. ; Zhang, A. ; Shi, P. ; Karu, N. ; West, K. ; Zemlin, J. ; Rahman, G. ; Panitchpakdi, M. ; Meehan, M. ; Weldon, K.C. ; Register, T.C. ; Arnold, M. ; Meikle, P.J. ; Schimmel, L. ; Blennow, K. ; Zetterberg, H. ; Blach, C. ; Dorrestein, P. ; Knight, R. ; Krumsiek, J. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Craft, S.
A Modified Mediterranean Ketogenic Diet reverses signaturesand mitigates modifiable risk factors of Alzheimer’s disease.Batra, R. ; Arnold, M. ; Wang, X. ; Allen, M. ; Wörheide, M. ; Blach, C. ; Levey, A.I. ; Seyfried, N.T. ; Bennett, D.A. ; Kastenmüller, G. ; Ertekin-Taner, N. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Krumsiek, J.
Central and Peripheral Biochemical Changes in Alzheimer’sDisease: Insights from the Alzheimer Disease MetabolomicsConsortium.MahmoudianDehkordi, S. ; Voigt-Zuwala, R.M. ; Dhana, K. ; Labus, J.S. ; Mohanty, I. ; Agarwal, P. ; Morris, M.C. ; Barnes, L.L. ; Sacks, F. ; Batra, R. ; Kastenmüller, G. ; Keshavarzian, A. ; Kaddurah-Daouk, R.
Metabolomics Analysis of the MIND Study Informs about Metabolic Benefit and Heterogeneity among Individuals‐ A Precision Medicine Approach for Diet Interventions.Fish, L.A. ; Telpoukhovskaia, M.A. ; Algoo, J. ; Hadad, N. ; Gurdon, B. ; Dai, M. ; Ouellette, A.R. ; Neuner, S.M. ; Dunn, A.R. ; Willcox, J.A.L. ; Wu, Y. ; Dumitrescu, L.C. ; Bellur, O. ; Zhang, J. ; O'Connell, K.M.S. ; Dammer, E.B. ; Seyfried, N.T. ; Muzumdar, S. ; Gillis, J. ; Robson, P.J. ; Arnold, M. ; Hohman, T.J. ; Philip, V.M. ; Menon, V. ; Kaczorowski, C.C.
A cognitive resilience gene expression signature in excitatory intratelencephalic cortical neurons.Samakovlis, C. ; Firsova, A.B. ; Salas, S.M. ; Kuemmerle, L. ; Abalo, X.M. ; Larsson, L. ; Mahbubani, K.T. ; Sountoulidis, A. ; Theelke, J. ; Andrusivova, Z. ; Galicia, L.A. ; Liontos, A. ; Balassa, T. ; Kovács, F. ; Horvath, P. ; Chen, Y. ; Schniering, J. ; Stoleriu, M.-G. ; Behr, J. ; Meyer, K. ; Timens, W. ; Schiller, H. B. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Lundeberg, J. ; Nilsson, M. ; Nawijn, M.C.
Topographic atlas of cell states identifies regional gene expression in the adult human lung.Virshup, I. ; Rybakov, S. ; Theis, F.J. ; Angerer, P. ; Wolf, A.
anndata: Access and store annotated data matrices.Puskaric, M. ; Attieh, H.A. ; Prasser, F. ; Gusinow, R. ; Dellacasa, C. ; Rossi, E. ; Naranjo, J.M. ; Canziani, L.M. ; Gorska, A. ; Hasenauer, J.
Data infrastructure for integrating clinical data in the large-scale international ORCHESTRA cohort: From data import to federated analysis.Hajiramezanali, E. ; Bunne, C. ; Hasanzadeh, A. ; Biancalani, T. ; Nguyen, E. ; Jin, Y. ; Brbic, M. ; Regev, A. ; Theis, F.J.
Machine learning for genomics explorations.Schmidt, S. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Weisenhorn, D.M. ; Wurst, W.
Molecular mechanisms underlying the onset of metabolic deficits in sporadic Parkinson’s disease.Haskuee, M.B. ; Efendiyev, M.A. ; Murty, K.K.
Containment policies, behaviour and dynamics of the pandemic.Akagi, G. ; Efendiyev, M.A.
Lyapunov stability of non-isolated equilibria for strongly irreversible Allen-Cahn equations.Schmidt, A. ; Casadei, N. ; Brand, F. ; Demidov, G. ; Vojgani, E. ; Abolhassani, A. ; Aldisi, R. ; Butler-Laporte, G. ; Alawathurage, T.M. ; Augustin, M. ; Bals, R. ; Bellinghausen, C. ; Berger, M.M. ; Bitzer, M. ; Bode, C. ; Boos, J. ; Brenner, T. ; Cornely, O.A. ; Eggermann, T. ; Erber, J. ; Feldt, T. ; Fuchsberger, C. ; Gagneur, J. ; Göpel, S. ; Haack, T. ; Häberle, H. ; Hanses, F. ; Heggemann, J. ; Hehr, U. ; Hellmuth, J.C. ; Herr, C. ; Hinney, A. ; Hoffmann, P. ; Illig, T. ; Jensen, B.O. ; Keitel, V. ; Kim-Hellmuth, S. ; Koehler, P. ; Kurth, I. ; Lanz, A.L. ; Latz, E. ; Lehmann, C. ; Luedde, T. ; Maj, C. ; Mian, M. ; Miller, A. ; Muenchhoff, M. ; Pink, I. ; Protzer, U. ; Rohn, H. ; Rybniker, J. ; Scaggiante, F. ; Schaffeldt, A. ; Scherer, C. ; Schieck, M. ; Schmidt, S.V. ; Schommers, P. ; Spinner, C.D. ; Vehreschild, M.J.G.T. ; Velavan, T.P. ; Volland, S. ; Wilfling, S. ; Winter, C. ; Richards, J.B. ; Heimbach, A. ; Becker, K. ; Ossowski, S. ; Schultze, J.L. ; Nürnberg, P. ; Nöthen, M.M. ; Motameny, S. ; Nothnagel, M. ; Riess, O. ; Schulte, E.C. ; Ludwig, K.U.
Systematic assessment of COVID-19 host genetics using whole genome sequencing data.Linguraru, M.G. ; Dou, Q. ; Feragen, A. ; Giannarou, S. ; Glocker, B. ; Lekadir, K. ; Schnabel, J.A.
Preface.Spieker, V. ; Eichhorn, H. ; Stelter, J.K. ; Huang, W. ; Braren, R.F. ; Rueckert, D. ; Sahli Costabal, F. ; Hammernik, K. ; Prieto, C. ; Karampinos, D.C. ; Schnabel, J.A.
Self-supervised k-space regularization for motion-resolved abdominal MRI using neural implicit k-space representations.Chen, Y. ; Hofmann, V. ; Riess, A. ; Singh, T. ; Majumder, S. ; John, S.
Computational and analytical approaches for DNA methylation pattern modeling.Sadeghi, M. ; Richer, R. ; Egger, B. ; Schindler-Gmelch, L. ; Rupp, L.H. ; Rahimi, F. ; Berking, M. ; Eskofier, B.M.
Harnessing multimodal approaches for depression detection using large language models and facial expressions.IGVF Affiliate Member Projects (Heinig, M.)
Deciphering the impact of genomic variation on function.Kurzen, N. ; Mubarak, M. ; Eigemann, J. ; Seiringer, P. ; Wasserer, S. ; Hillig, C. ; Menden, M.P. ; Biedermann, T. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Jargosch, M. ; Eyerich, S. ; Lauffer, F.
Death associated protein kinase 1 dampens keratinocyte necroptosis and expression of inflammatory genes in lichen planus.Napoli, M. ; Immler, R. ; Rohwedder, I. ; Lupperger, V. ; Pfabe, J. ; Gonzalez Pisfil, M. ; Yevtushenko, A. ; Vogl, T. ; Roth, J. ; Salvermoser, M. ; Dietzel, S. ; Slak Rupnik, M. ; Marr, C. ; Walzog, B. ; Sperandio, M. ; Pruenster, M.
Cytosolic S100A8/A9 promotes Ca2+ supply at LFA-1 adhesion clusters during neutrophil recruitment.Heylen, D. ; Pusparum, M. ; Kuliesius, J. ; Wilson, J. ; Park, Y.-C. ; Jamiołkowski, J. ; D'Onofrio, V. ; Valkenborg, D. ; Aerts, J. ; Ertaylan, G. ; Hooyberghs, J.
Synthetic plasma pool cohort correction for affinity-based proteomics datasets allows multiple study comparison.Muñoz-Martín, N. ; Simon-Chica, A. ; Díaz-Díaz, C. ; Cadenas, V. ; Temiño, S. ; Esteban, I. ; Ludwig, A. ; Schormair, B. ; Winkelmann, J. ; Olejnickova, V. ; Sedmera, D. ; Filgueiras-Rama, D. ; Torres, M.
Meis transcription factors regulate cardiac conduction system development and adult function.Bonev, B. ; Castelo-Branco, G. ; Chen, F. ; Codeluppi, S. ; Corces, M.R. ; Fan, J. ; Heiman, M. ; Harris, K. ; Inoue, F. ; Kellis, M. ; Levine, A.P. ; Lotfollahi, M. ; Luo, C. ; Maynard, K.R. ; Nitzan, M. ; Ramani, V. ; Satijia, R. ; Schirmer, L. ; Shen, Y. ; Sun, N. ; Green, G.S. ; Theis, F. ; Wang, X. ; Welch, J.D. ; Gokce, O. ; Konopka, G. ; Liddelow, S.A. ; Macosko, E. ; Ali Bayraktar, O. ; Habib, N. ; Nowakowski, T.J.
Author Correction: Opportunities and challenges of single-cell and spatially resolved genomics methods for neuroscience discovery.Nguyen, B.H.P. ; Garger, D. ; Lu, D. ; Maalmi, H. ; Prokisch, H. ; Thorand, B. ; Adamski, J. ; Kastenmüller, G. ; Waldenberger, M. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Suhre, K. ; Bönhof, G.J. ; Rathmann, W. ; Roden, M. ; Grallert, H. ; Ziegler, D. ; Herder, C. ; Menden, M.P.
Interpretable multimodal machine learning (IMML) framework reveals pathological signatures of distal sensorimotor polyneuropathy.Keinert, M. ; Schindler-Gmelch, L. ; Rupp, L.H. ; Sadeghi, M. ; Capito, K. ; Hager, M. ; Rahimi, F. ; Richer, R. ; Egger, B. ; Eskofier, B.M. ; Berking, M.
Facing depression: Evaluating the efficacy of the EmpkinS-EKSpression reappraisal training augmented with facial expressions - protocol of a randomized controlled trial.Bunne, C. ; Roohani, Y. ; Rosen, Y. ; Gupta, A. ; Zhang, X. ; Roed, M. ; Alexandrov, T. ; AlQuraishi, M. ; Brennan, P. ; Burkhardt, D.B. ; Califano, A. ; Cool, J. ; Dernburg, A.F. ; Ewing, K. ; Fox, E.B. ; Haury, M. ; Herr, A.E. ; Horvitz, E. ; Hsu, P.D. ; Jain, V. ; Johnson, G.R. ; Kalil, T. ; Kelley, D.R. ; Kelley, S.O. ; Kreshuk, A. ; Mitchison, T. ; Otte, S. ; Shendure, J. ; Sofroniew, N.J. ; Theis, F.J. ; Theodoris, C.V. ; Upadhyayula, S. ; Valer, M. ; Wang, B. ; Xing, E. ; Yeung-Levy, S. ; Zitnik, M. ; Karaletsos, T. ; Regev, A. ; Lundberg, E. ; Leskovec, J. ; Quake, S.R.
How to build the virtual cell with artificial intelligence: Priorities and opportunities.Hrovatin, K. ; Sikkema, L. ; Shitov, V.A. ; Heimberg, G. ; Shulman, M. ; Oliver, A.J. ; Müller, M. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Wang, H. ; Ramirez Suastegui, C. ; He, P. ; Schaar, A. ; Teichmann, S.A. ; Theis, F.J. ; Luecken, M.
Considerations for building and using integrated single-cell atlases.He, Z. ; Dony, L. ; Fleck, J.S. ; Szałata, A. ; Li, K. ; Slišković, I. ; Lin, H.C. ; Santel, M. ; Atamian, A. ; Quadrato, G. ; Sun, J. ; Pașca, S.P. ; Camp, J.G. ; Theis, F.J. ; Treutlein, B.
Publisher Correction: An integrated transcriptomic cell atlas of human neural organoids.Estévez-Arias, B. ; Matalonga, L. ; Yubero, D. ; Polavarapu, K. ; Codina, A.E. ; Ortez, C. ; Carrera-García, L. ; Expósito-Escudero, J. ; Jou, C. ; Meyer, S. ; Kilicarslan, O.A. ; Aleman, A. ; Thompson, R. ; Luknárová, R. ; Esteve-Codina, A. ; Gut, M. ; Laurie, S. ; Demidov, G. ; Yépez, V.A. ; Beltran, S. ; Gagneur, J. ; Töpf, A. ; Lochmüller, H. ; Nascimento, A. ; Hoenicka, J. ; Palau, F. ; Natera-de Benito, D.
Correction: Phenotype-driven genomics enhance diagnosis in children with unresolved neuromuscular diseases.McClean, M. ; Panciu, T.C. ; Lange, C. ; Duarte, R.G. ; Theis, F.J.
Artificial intelligence in tuberculosis: A new ally in disease control.Papargyriou, A. ; Najajreh, M. ; Cook, D.P. ; Maurer, C.H. ; Bärthel, S. ; Messal, H.A. ; Ravichandran, S.K. ; Richter, T. ; Knolle, M. ; Metzler, T. ; Shastri, A.R. ; Öllinger, R. ; Jasper, J. ; Schmidleitner, L. ; Wang, S. ; Schneeweis, C. ; Ishikawa-Ankerhold, H. ; Engleitner, T. ; Mataite, L. ; Semina, M. ; Trabulssi, H. ; Lange, S. ; Ravichandra, A. ; Schuster, M. ; Mueller, S. ; Peschke, K. ; Schäfer, A. ; Dobiasch, S. ; Combs, S.E. ; Schmid, R.M. ; Bausch, A.R. ; Braren, R. ; Heid, I. ; Scheel, C. ; Schneider, G. ; Zeigerer, A. ; Luecken, M. ; Steiger, K. ; Kaissis, G. ; van Rheenen, J. ; Theis, F.J. ; Saur, D. ; Rad, R. ; Reichert, M.
Heterogeneity-driven phenotypic plasticity and treatment response in branched-organoid models of pancreatic ductal adenocarcinoma.Oexle, K.
Are there two disjunct episignatures for KMT2B-related disease?Caporale, N. ; Castaldi, D. ; Rigoli, M.T. ; Cheroni, C. ; Valenti, A. ; Stucchi, S. ; Lessi, M. ; Bulgheresi, D. ; Trattaro, S. ; Pezzali, M. ; Vitriolo, A. ; Lopez-Tobon, A. ; Bonfanti, M. ; Ricca, D. ; Schmid, K. ; Heinig, M. ; Theis, F.J. ; Villa, C.E. ; Testa, G.
Multiplexing cortical brain organoids for the longitudinal dissection of developmental traits at single-cell resolution.Voudouris, K. ; Roe, N.
Metatheoretical linguistics: A philosopher's guide.Ursch, L.T. ; Müschen, J.S. ; Ritter, J. ; Klermund, J. ; Bernard, B.E. ; Kolb, S. ; Warmuth, L. ; Andrieux, G. ; Miller, G. ; Jiménez-Muñoz, M. ; Theis, F.J. ; Boerries, M. ; Busch, D.H. ; Cathomen, T. ; Schumann, K.
Modulation of TCR stimulation and pifithrin-α improves the genomic safety profile of CRISPR-engineered human T cells.Turnham, R.E. ; Pitea, A. ; Jang, G.M. ; Xu, Z. ; Lim, H.C. ; Choi, A.L. ; Von Dollen, J. ; Levin, R.S. ; Webber, J.T. ; McCarthy, E. ; Hu, J. ; Li, X. ; Che, L. ; Singh, A. ; Yoon, A.J. ; Chan, G. ; Kelley, R.K. ; Swaney, D.L. ; Zhang, W. ; Bandyopadhyay, S. ; Theis, F.J. ; Eckhardt, M. ; Chen, X. ; Shokat, K.M. ; Ideker, T. ; Krogan, N.J. ; Gordan, J.D.
HBV remodels PP2A complexes to rewire kinase signaling in hepatocellular carcinoma.Bohnacker, S. ; Henkel, F. ; Hartung, F. ; Geerlof, A. ; Riemer, S. ; Prodjinotho, U.F. ; Salah, E.B. ; Mourao, A. ; Bohn, S. ; Teder, T. ; Thomas, D. ; Gurke, R. ; Böckel, C. ; Ud-Dean, M. ; König, A.-C. ; Quaranta, A. ; Alessandrini, F. ; Lechner, A. ; Spitzlberger, B. ; Kabat, A.M. ; Pearce, E.J. ; Haeggström, J.Z. ; Hauck, S.M. ; Wheelock, C.E. ; Jakobsson, P.J. ; Sattler, M. ; Voehringer, D. ; Feige, M.J. ; da Costa, C.P. ; Esser-von Bieren, J.
A helminth enzyme subverts macrophage-mediated immunity by epigenetic targeting of prostaglandin synthesis.Allara, E. ; Bell, S. ; Smith, R. ; Keene, S.J. ; Gill, D. ; Gaziano, L. ; Morselli Gysi, D. ; Wang, F. ; Tragante, V. ; Mason, A. ; Karthikeyan, S. ; Lumbers, R.T. ; Bonglack, E. ; Ouwehand, W. ; Roberts, D.J. ; Dowsett, J. ; Ostrowski, S.R. ; Larsen, M.H. ; Ullum, H. ; Pedersen, O.B. ; Brunak, S. ; Banasik, K. ; Erikstrup, C. ; Mitchell, J. ; Fuchsberger, C. ; Pattaro, C. ; Pramstaller, P.P. ; Girelli, D. ; Arvas, M. ; Toivonen, J. ; Molnos, S. ; Peters, A. ; Polasek, O. ; Rudan, I. ; Hayward, C. ; McDonnell, C. ; Pirastu, N. ; Wilson, J.F. ; van den Hurk, K. ; Quee, F. ; Ferrucci, L. ; Bandinelli, S. ; Tanaka, T. ; Girotto, G. ; Concas, M.P. ; Pecori, A. ; Verweij, N. ; van der Harst, P. ; van de Vegte, Y.J. ; Kiemeney, L.A. ; Sweep, F.C. ; Galesloot, T.E. ; Sulem, P. ; Gudbjartsson, D. ; Ferkingstad, E. ; Djousse, L. ; Cho, K. ; Inouye, M. ; Burgess, S. ; Benyamin, B. ; Oexle, K. ; Swinkels, D.W. ; Stefansson, K. ; Magnusson, M. ; Ganna, A. ; Gaziano, M. ; Ivey, K. ; Danesh, J. ; Pereira, A. ; Wood, A.M. ; Butterworth, A.S. ; di Angelantonio, E.
Novel loci and biomedical consequences of iron homoeostasis variation.Deutges, M. ; Sadafi, A. ; Navab, N. ; Marr, C.
Neural cellular automata for lightweight, robust and explainable classification of white blood cell images.Klede, K. ; Altstidl, T. ; Zanca, D. ; Eskofier, B.M.
The impact of random models on standardized clustering similarity.Bercea, C.-I. ; Wiestler, B. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A.
Diffusion models with implicit guidance for medical anomaly detection.di Folco, M. ; Bercea, C.-I. ; Chan, E. ; Schnabel, J.A.
Interpretable representation learning of cardiac MRI via attribute regularization.Eichhorn, H. ; Spieker, V. ; Hammernik, K. ; Saks, E. ; Weiss, K. ; Preibisch, C. ; Schnabel, J.A.
Physics-informed deep learning for motion-corrected reconstruction of quantitative brain MRI.Bonev, B. ; Gonçalo, C.B. ; Chen, F. ; Codeluppi, S. ; Corces, M.R. ; Fan, J. ; Heiman, M. ; Harris, K. ; Inoue, F. ; Kellis, M. ; Levine, A.P. ; Lotfollahi, M. ; Luo, C. ; Maynard, K.R. ; Nitzan, M. ; Ramani, V. ; Satijia, R. ; Schirmer, L. ; Shen, Y. ; Sun, N. ; Green, G.S. ; Theis, F. ; Wang, X. ; Welch, J.D. ; Gokce, O. ; Konopka, G. ; Liddelow, S.A. ; Macosko, E. ; Bayraktar, O. ; Habib, N. ; Nowakowski, T.J.
Opportunities and challenges of single-cell and spatially resolved genomics methods for neuroscience discovery.Lewis, S.A. ; Chopra, M. ; Cohen, J.S. ; Bain, J.M. ; Aravamuthan, B. ; Carmel, J.B. ; Fahey, M.C. ; Segel, R. ; Wintle, R.F. ; Zech, M. ; May, H.T. ; Haque, N. ; Fehlings, D. ; Srivastava, S. ; Kruer, M.C.
Clinical actionability of genetic findings in cerebral palsy: A systematic review and meta-analysis.Schlieben, L.D. ; Achleitner, M.T. ; Bourke, B. ; Diesner, M. ; Feichtinger, R.G. ; Fichtner, A. ; Flechtenmacher, C. ; Hadzic, N. ; Hegarty, R. ; Heilos, A. ; Janecke, A. ; Konstantopoulou, V. ; Lenz, D. ; Mayr, J.A. ; Müller, T. ; Prokisch, H. ; Vogel, G.F.
Missense variants in the TRPMr7 α-kinase domain are associated with recurrent pediatric acute liver failure.Bocher, O. ; Singh, A. ; Huang, Y. ; Võsa, U. ; Reimann, E. ; Arruda, A.L. ; Barysenska, A. ; Kolde, A. ; Rayner, N.W. ; Esko, T. ; Mägi, R. ; Zeggini, E.
Disentangling the consequences of type 2 diabetes on targeted metabolite profiles using causal inference and interaction QTL analyses.Kuemmerle, L. ; Luecken, M. ; Firsova, A.B. ; Barros De Andrade E Sousa, L. ; Straßer, L. ; Mekki, I.I ; Campi, F. ; Heumos, L. ; Shulman, M. ; Beliaeva, V. ; Hediyeh-Zadeh, S. ; Schaar, A. ; Mahbubani, K.T. ; Sountoulidis, A. ; Balassa, T. ; Kovács, F. ; Horvath, P. ; Piraud, M. ; Ertürk, A. ; Samakovlis, C. ; Theis, F.J.
Probe set selection for targeted spatial transcriptomics.Fischer, S.M. ; Felsner, L. ; Osuala, R. ; Kiechle, J. ; Lang, D. ; Peeken, J.C. ; Schnabel, J.A.
Progressive growing of patch size: Resource-efficient curriculum learning for dense prediction tasks.Kittke, V. ; Zhao, C. ; Lam, D.D. ; Harrer, P. ; Krezel, W. ; Schormair, B. ; Oexle, K. ; Winkelmann, J.
RLS-associated MEIS transcription factors control distinct processes in human neural stem cells.Hedrich, N.L. ; Schulz, E. ; Hall-McMaster, S. ; Schuck, N.W.
An inductive bias for slowly changing features in human reinforcement learning.Maalmi, H. ; Nguyen, B.H.P. ; Strom, A. ; Bönhof, G.J. ; Rathmann, W. ; Ziegler, D. ; Menden, M.P. ; Roden, M. ; Herder, C.
Prediction model for polyneuropathy in recent-onset diabetes based on serum neurofilament light chain, fibroblast growth factor-19 and standard anthropometric and clinical variables.Martinelli, S. ; Hafner, K. ; Koedel, M. ; Knauer-Arloth, J. ; Gassen, N.C. ; Binder, E.B.
Differential dynamics and roles of FKBP51 isoforms and their implications for targeted therapies.Svec, M. ; Mantel, T. ; Zech, M. ; Haslinger, B.
Reply to: "Clinical and molecular profiling in GNAO1 permits phenotype-genotype correlation".Ferrera, G. ; Derderian, K. ; Izzo, R. ; Gnutti, B. ; Legati, A. ; Zorzi, G. ; Lamantea, E. ; Iuso, A. ; Ardissone, A.
WDR45-related encephalopathy mimicking Leigh syndrome associated with complex I deficiency: A case report.Rayner, N.W. ; Park, Y.-C. ; Fuchsberger, C. ; Barysenska, A. ; Zeggini, E.
Toward GDPR compliance with the Helmholtz Munich genotype imputation server.Katsoula, G. ; Lawrence, J.E.G. ; Arruda, A.L. ; Tutino, M. ; Balogh, P. ; Southam, L. ; Swift, D. ; Behjati, S. ; Teichmann, S.A. ; Wilkinson, J.M. ; Zeggini, E.
Primary cartilage transcriptional signatures reflect cell-type-specific molecular pathways underpinning osteoarthritis.Suzuki, K. ; Hatzikotoulas, K. ; Southam, L. ; Taylor, H.J. ; Yin, X. ; Lorenz, K.M. ; Mandla, R. ; Huerta-Chagoya, A. ; Melloni, G.E.M. ; Kanoni, S. ; Rayner, N.W. ; Bocher, O. ; Arruda, A.L. ; Sonehara, K. ; Namba, S. ; Lee, S.S.K. ; Preuss, M.H. ; Petty, L.E. ; Schroeder, P. ; Vanderwerff, B.R. ; Kals, M. ; Bragg, F. ; Lin, K. ; Guo, X. ; Zhang, W. ; Yao, J. ; Kim, Y.J. ; Graff, M. ; Takeuchi, F. ; Nano, J. ; Lamri, A. ; Nakatochi, M. ; Moon, S. ; Scott, R.A. ; Cook, J.P. ; Lee, J.J. ; Pan, I. ; Taliun, D. ; Parra, E.J. ; Chai, J.F. ; Bielak, L.F. ; Tabara, Y. ; Hai, Y. ; Thorleifsson, G. ; Grarup, N. ; Sofer, T. ; Wuttke, M. ; Sarnowski, C. ; Gieger, C. ; Nousome, D. ; Trompet, S. ; Kwak, S.H. ; Long, J. ; Sun, M. ; Tong, L. ; Chen, W.M. ; Nongmaithem, S.S. ; Noordam, R. ; Lim, V.J.Y. ; Tam, C.H.T. ; Joo, Y.Y. ; Chen, C.H. ; Raffield, L.M. ; Prins, B.P. ; Nicolas, A. ; Yanek, L.R. ; Chen, G. ; Brody, J.A. ; Kabagambe, E.K. ; An, P. ; Xiang, A.H. ; Choi, H.S. ; Cade, B.E. ; Tan, J. ; Broadaway, K.A. ; Williamson, A. ; Kamali, Z. ; Cui, J. ; Thangam, M. ; Adair, L.S. ; Adeyemo, A. ; Aguilar-Salinas, C.A. ; Ahluwalia, T.S. ; Anand, S.S. ; Bertoni, A.G. ; Bork-Jensen, J. ; Brandslund, I. ; Buchanan, T.A. ; Burant, C.F. ; Butterworth, A.S. ; Canouil, M. ; Chan, J.C.N. ; Chang, L.C. ; Chee, M.L. ; Chen, J. ; Chen, S.H. ; Chen, Y.T. ; Chen, Z. ; Chuang, L.M. ; Cushman, M. ; Danesh, J. ; Das, S.K. ; de Silva, H.J. ; Dedoussis, G. ; Dimitrov, L. ; Doumatey, A.P. ; Du, S. ; Duan, Q. ; Eckardt, K.U. ; Emery, L.S. ; Evans, D.S. ; Evans, M.K. ; Fischer, K. ; Floyd, J.S. ; Ford, I. ; Franco, O.H. ; Frayling, T.M. ; Freedman, B.I. ; Genter, P. ; Gerstein, H.C. ; Giedraitis, V. ; González-Villalpando, C. ; Gonzalez-Villalpando, M.E. ; Gordon-Larsen, P. ; Gross, M. ; Guare, L.A. ; Hackinger, S. ; Hakaste, L. ; Han, S. ; Hattersley, A.T. ; Herder, C. ; Horikoshi, M. ; Howard, A.G. ; Hsueh, W.A. ; Huang, M. ; Huang, W. ; Hung, Y.J. ; Hwang, M.Y. ; Hwu, C.M. ; Ichihara, S. ; Ikram, M.A. ; Ingelsson, M. ; Islam, M.T. ; Isono, M. ; Jang, H.M. ; Jasmine, F. ; Jiang, G. ; Jonas, J.B. ; Jørgensen, T. ; Kamanu, F.K. ; Kandeel, F.R. ; Kasturiratne, A. ; Katsuya, T. ; Kaur, V. ; Kawaguchi, T. ; Keaton, J.M. ; Kho, A.N. ; Khor, C.C. ; Kibriya, M.G. ; Kim, D.H. ; Kronenberg, F. ; Kuusisto, J. ; Läll, K. ; Lange, L.A. ; Lee, K.M. ; Lee, M.S. ; Lee, N.R. ; Leong, A. ; Li, L. ; Li, Y. ; Li-Gao, R. ; Ligthart, S. ; Lindgren, C.M. ; Linneberg, A. ; Liu, C.T. ; Liu, J. ; Locke, A.E. ; Louie, T. ; Luan, J. ; Luk, A.O.Y. ; Luo, X. ; Lv, J. ; Lynch, J.A. ; Lyssenko, V. ; Maeda, S. ; Mamakou, V. ; Mansuri, S.R. ; Matsuda, K. ; Meitinger, T. ; Melander, O. ; Metspalu, A. ; Mo, H. ; Morris, A.D. ; Moura, F.A. ; Nadler, J.L. ; Nalls, M.A. ; Nayak, U. ; Ntalla, I. ; Okada, Y. ; Orozco, L. ; Patel, S.R. ; Patil, S. ; Pei, P. ; Pereira, M.A. ; Peters, A. ; Pirie, F.J. ; Polikowsky, H.G. ; Porneala, B.C. ; Prasad, G. ; Rasmussen-Torvik, L.J. ; Reiner, A.P. ; Roden, M. ; Rohde, R. ; Roll, K. ; Sabanayagam, C. ; Sandow, K. ; Sankareswaran, A. ; Sattar, N. ; Schönherr, S. ; Shahriar, M. ; Shen, B. ; Shi, J. ; Shin, D.M. ; Shojima, N. ; Smith, J.A. ; So, W.Y. ; Stancáková, A. ; Steinthorsdottir, V. ; Stilp, A.M. ; Strauch, K. ; Taylor, K.D. ; Thorand, B. ; Thorsteinsdottir, U. ; Tomlinson, B. ; Tran, T.C. ; Tsai, F.J. ; Tuomilehto, J. ; Tusié-Luna, T. ; Udler, M.S. ; Valladares-Salgado, A. ; van Dam, R.M. ; van Klinken, J.B. ; Varma, R. ; Wacher-Rodarte, N. ; Wheeler, E. ; Wickremasinghe, A.R. ; van Dijk, K.W. ; Witte, D.R. ; Yajnik, C.S. ; Yamamoto, K. ; Yoon, K. ; Yu, C. ; Yuan, J.M. ; Yusuf, S. ; Zawistowski, M. ; Zhang, L. ; Zheng, W. ; Raffel, L.J. ; Igase, M. ; Ipp, E. ; Redline, S. ; Cho, Y.S. ; Lind, L. ; Province, M.A. ; Fornage, M. ; Hanis, C.L. ; Ingelsson, E. ; Zonderman, A.B. ; Psaty, B.M. ; Wang, Y.X. ; Rotimi, C.N. ; Becker, D.M. ; Matsuda, F. ; Liu, Y. ; Yokota, M. ; Kardia, S.L.R. ; Peyser, P.A. ; Pankow, J.S. ; Engert, J.C. ; Bonnefond, A. ; Froguel, P. ; Wilson, J.G. ; Sheu, W.H.H. ; Wu, J.Y. ; Hayes, M.G. ; Ma, R.C.W. ; Wong, T.Y. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Tuomi, T. ; Chandak, G.R. ; Collins, F.S. ; Bharadwaj, D. ; Paré, G. ; Sale, M.M. ; Ahsan, H. ; Motala, A.A. ; Shu, X.O. ; Park, K.S. ; Jukema, J.W. ; Cruz, M. ; Chen, Y.I. ; Rich, S.S. ; McKean-Cowdin, R. ; Grallert, H. ; Cheng, C.Y. ; Ghanbari, M. ; Tai, E.S. ; Dupuis, J. ; Kato, N. ; Laakso, M. ; Köttgen, A. ; Koh, W.P. ; Bowden, D.W. ; Palmer, C.N.A. ; Kooner, J.S. ; Kooperberg, C. ; Liu, S. ; North, K.E. ; Saleheen, D. ; Hansen, T. ; Pedersen, O. ; Wareham, N.J. ; Lee, J. ; Kim, B.J. ; Millwood, I.Y. ; Walters, R.G. ; Stefansson, K. ; Ahlqvist, E. ; Goodarzi, M.O. ; Mohlke, K.L. ; Langenberg, C. ; Haiman, C.A. ; Loos, R.J.F. ; Florez, J.C. ; Rader, D.J. ; Ritchie, M.D. ; Zöllner, S. ; Mägi, R. ; Marston, N.A. ; Ruff, C.T. ; van Heel, D.A. ; Finer, S. ; Denny, J.C. ; Yamauchi, T. ; Kadowaki, T. ; Chambers, J.C. ; Ng, M.C.Y. ; Sim, X. ; Below, J.E. ; Tsao, P.S. ; Chang, K.M. ; McCarthy, M.I. ; Meigs, J.B. ; Mahajan, A. ; Spracklen, C.N. ; Mercader, J.M. ; Boehnke, M. ; Rotter, J.I. ; Vujkovic, M.R. ; Voight, B.F. ; Morris, A.P. ; Zeggini, E.
Genetic drivers of heterogeneity in type 2 diabetes pathophysiology.Porse, B.T. ; Furtwangler, B. ; Uresin, N. ; Richter, S. ; Schuster, M.B. ; Theis, F.J. ; Schoof, E.M.
A single-cell proteomics by mass spectrometry based map of the human CD34+hematopoie tic stem and progenitor cell compartment.Heckmann, K. ; Iuso, A. ; Reunert, J. ; Grüneberg, M. ; Seelhöfer, A. ; Rust, S. ; Fiermonte, G. ; Paradies, E. ; Piazzolla, C. ; Mannil, M. ; Marquardt, T.
Expanding the genetic and clinical spectrum of SLC25A42-associated disorders and testing of pantothenic acid to improve CoA level in vitro.He, Z. ; Dony, L. ; Fleck, J.S. ; Szałata, A. ; Li, K. ; Slišković, I. ; Lin, H.C. ; Santel, M. ; Atamian, A. ; Quadrato, G. ; Sun, J. ; Pașca, S.P. ; Camp, J.G. ; Theis, F.J. ; Treutlein, B.
An integrated transcriptomic cell atlas of human neural organoids.Indelicato, E. ; Eberl, A. ; Boesch, S. ; Lange, L.M. ; Klein, C. ; Lohmann, K. ; Zech, M.
Genome aggregation database version 4-allele frequency changes and impact on variant interpretation in dystonia.Ringgold, V. ; Shields, G.S. ; Hauck, F. ; Kurz, M. ; Schindler-Gmelch, L. ; Abel, L. ; Richer, R. ; Eskofier, B.M. ; Rohleder, N.
The Short Stress State Questionnaire in German (SSSQ-G).Schärli, S. ; Luther, F. ; Di Domizio, J. ; Hillig, C. ; Radonjic-Hoesli, S. ; Thormann, K. ; Simon, D. ; Møller Rønnstad, A.T. ; Ruge, I.F. ; Fritz, B.G. ; Bjarnsholt, T. ; Vallone, A. ; Kezic, S. ; Menden, M.P. ; Roesner, L.M. ; Werfel, T. ; Thyssen, J.P. ; Eyerich, S. ; Gilliet, M. ; Bertschi, N.L. ; Schlapbach, C.
IL-9 sensitizes human Th2 cells to pro-inflammatory IL-18 signals in atopic dermatitis.Ghasempour, S. ; Warner, N. ; Guan, R. ; Rodari, M.M. ; Ivanochko, D. ; Whittaker Hawkins, R. ; Marwaha, A. ; Nowak, J.K. ; Liang, Y. ; Mulder, D.J. ; Stallard, L. ; Li, M. ; Yu, D.D. ; Pluthero, F.G. ; Batura, V. ; Zhao, M. ; Siddiqui, I. ; Upton, J.E.M. ; Hulst, J.M. ; Kahr, W.H.A. ; Mendoza-Londono, R. ; Charbit-Henrion, F. ; Hoefsloot, L.H. ; Khiat, A. ; Moreira, D. ; Trindade, E. ; Espinheira, M.D.C. ; Pinto Pais, I. ; Weerts, M.J.A. ; Douben, H. ; Kotlarz, D.M. ; Snapper, S.B. ; Klein, C. ; Dowling, J.J. ; Julien, J.P. ; Joosten, M. ; Cerf-Bensussan, N. ; Freeman, S.A. ; Parlato, M. ; van Ham, T.J. ; Muise, A.M.
Human ITGAV variants are associated with immune dysregulation, brain abnormalities, and colitis.Jaeger, K.M. ; Nissen, M. ; Flaucher, M. ; Gräf, L. ; Joanidopoulos, J. ; Anneken, L. ; Huebner, H. ; Goossens, C. ; Titzmann, A. ; Pontones, C. ; Fasching, P.A. ; Beckmann, M.W. ; Eskofier, B.M. ; Leutheuser, H.
Systematic comparison of ECG delineation algorithm performance on smartwatch data.Philipps, M. ; Körner, A. ; Vanhoefer, J. ; Pathirana, D. ; Hasenauer, J.
Non-negative universal differential equations with applications in systems biology.Schulz, M. ; Bleser, S. ; Groels, M. ; Bošnački, D. ; Burger, J.A. ; Chiorazzi, N. ; Marr, C.
Mathematical multi-compartment modeling of chronic lymphocytic leukemia cell kinetics under ibrutinib.Soremekun, S. ; Jjingo, D. ; Kateete, D. ; Nash, O. ; Grallert, H. ; Peters, A. ; Chikowore, T. ; Batini, C. ; Soremekun, O. ; Fatumo, S.
Structural insights into conformational stability of both wild-type and mutant Insulin Receptor Gene.Martinelli, F. ; Heinken, A. ; Henning, A.K. ; Ulmer, M.A. ; Hensen, T. ; González, A. ; Arnold, M. ; Asthana, S. ; Budde, K. ; Engelman, C.D. ; Estaki, M. ; Grabe, H.J. ; Heston, M.B. ; Johnson, S. ; Kastenmüller, G. ; Martino, C. ; McDonald, D. ; Rey, F.E. ; Kilimann, I. ; Peters, O. ; Wang, X. ; Spruth, E.J. ; Schneider, A. ; Fliessbach, K. ; Wiltfang, J. ; Hansen, N. ; WenzelGlanz ; Buerger, K. ; Janowitz, D. ; Laske, C. ; Munk, M.H. ; Spottke, A. ; Roy, N. ; Nauck, M. ; Teipel, S. ; Knight, R. ; Kaddurah-Daouk, R.F. ; Bendlin, B.B. ; Hertel, J. ; Thiele, I.
Author Correction: Whole-body metabolic modelling reveals microbiome and genomic interactions on reduced urine formate levels in Alzheimer's disease.Koch, V. ; Wagner, S. ; Kazeminia, S. ; Sancar, E. ; Hehr, M. ; Schnabel, J.A. ; Peng, T. ; Marr, C.
DinoBloom: A foundation model for generalizable cell embeddings in hematology.Lennartz, R. ; Khassetarash, A. ; Nigg, S.R. ; Eskofier, B.M. ; Nigg, B.M.
Neural network and layer-wise relevance propagation reveal how ice hockey protective equipment restricts players' motion.Linguraru, M.G. ; Dou, Q. ; Feragen, A. ; Giannarou, S. ; Glocker, B. ; Lekadir, K. ; Schnabel, J.A.
Preface.Heumos, S. ; Heuer, M.L. ; Hanssen, F. ; Heumos, L. ; Guarracino, A. ; Heringer, P. ; Ehmele, P. ; Prins, P. ; Garrison, E. ; Nahnsen, S.
Cluster-efficient pangenome graph construction with nf-core/pangenome.Losert, C. ; Pekayvaz, K. ; Knottenberg, V. ; Nicolai, L. ; Stark, K. ; Heinig, M.
Application of unsupervised multi-omic factor analysis to uncover patterns of variation and molecular processes linked to cardiovascular disease.Knauer-Arloth, J. ; Hryhorzhevska, A. ; Binder, E.B.
Multi-omics analysis of the molecular response to glucocorticoids - insights into shared genetic risk from psychiatric to medical disorders.Stehr, A.M. ; Lenberg, J. ; Friedman, J. ; Dobbelaere, D. ; Imbard, A. ; Lévy, J. ; Donoghue, S. ; Derive, N. ; Stoeva, R. ; Gueguen, P. ; Zech, M.
Consolidating the role of mutated ATP2B2 in neurodevelopmental and cerebellar pathologies.Oksza-Orzechowski, K. ; Quinten, E. ; Shafighi, S. ; Kiełbasa, S.M. ; van Kessel, H.W. ; de Groen, R.A.L. ; Vermaat, J.S.P. ; Sepúlveda Yáñez, J.H. ; Navarrete, M.A. ; Veelken, H. ; van Bergen, C.A.M. ; Szczurek, E.
CaClust: Linking genotype to transcriptional heterogeneity of follicular lymphoma using BCR and exomic variants.Träuble, K. ; Heinig, M.
A cross-species foundation model for single cells.Demidov, G. ; Yaldiz, B. ; Garcia-Pelaez, J. ; de Boer, E. ; Schuermans, N. ; Van de Vondel, L. ; Paramonov, I. ; Johansson, L.F. ; Musacchia, F. ; Benetti, E. ; Bullich, G. ; Sablauskas, K. ; Beltran, S. ; Gilissen, C. ; Hoischen, A. ; Ossowski, S. ; de Voer, R. ; Lohmann, K. ; Oliveira, C. ; Töpf, A. ; Vissers, L.E.L.M. ; Zguro, K. ; Zara, F. ; Zaganas, I. ; Yépez, V.A. ; Wirth, B. ; Webb, D. ; Verdin, H. ; Van Nieuwenhove, E. ; van Montfrans, J. ; van Heurck, R. ; van der Veken, L. ; Valle, L. ; Uva, P. ; Udd, B. ; Trimouille, A. ; Thompson, R. ; Tartaglia, M. ; Sznajer, Y. ; Striano, P. ; Steinke-Lange, V. ; Spilioti, M. ; Scudieri, P. ; Schrock, E. ; Schon, K. ; Scala, M. ; Savarese, M. ; Santen, G.W.E. ; Rump, A. ; Ruivenkamp, C.A.L. ; Roos, A. ; Rooryck, C. ; Riva, A. ; Renieri, A. ; Ratnaike, T. ; Radio, F.C. ; Privitera, F. ; De la Paz, M.P. ; Poppe, B. ; Polavarapu, K. ; Platzer, K. ; Peterlin, B. ; Pérez-Dueñas, B. ; Pauly, M. ; Parrini, E. ; Olimpio, C. ; Reghan, M.O. ; de Benito, D.N. ; Osorio, A.N. ; Munell, F. ; Munchau, A. ; Moortgat, S. ; Monestier, O. ; Molnar, M.J. ; Meunier, C. ; Mertes, C. ; Mei, D. ; Maystadt, I. ; May, P. ; Maver, A. ; Mathioudakis, L. ; Masclaux, F. ; Mary, S. ; Delgado, B.M. ; Marcé-Grau, A. ; Malaichamy, S. ; Macaya, A. ; Luknárová, R. ; Martín, E.L. ; Lochmüller, H. ; Leitão, E. ; Lederer, D. ; Leavis, H. ; Laner, A. ; Lacombe, D. ; Solve-RD Consortium (Krass, L.) ; Korff, C.M. ; Kokosali, E. ; Karakaya, M. ; Karadurmus, D.
Comprehensive reanalysis for CNVs in ES data from unsolved rare disease cases results in new diagnoses.Linguraru, M.G. ; Dou, Q. ; Feragen, A. ; Giannarou, S. ; Glocker, B. ; Lekadir, K. ; Schnabel, J.A.
Preface.Wang, W. ; Wang, Y. ; Lyu, R. ; Grün, D.
Scalable identification of lineage-specific gene regulatory networks from metacells with NetID.Huth, M. ; Garavito, C.A. ; Seep, L. ; Cirera, L. ; Saúte, F. ; Sicuri, E. ; Hasenauer, J.
Federated difference-in-differences with multiple time periods in DataSHIELD.Stephenson, N. ; Rosenthal, E. ; Jones, M. ; Deng, S. ; Wheeler, G. ; Pushparajah, K. ; Schnabel, J.A. ; Simpson, J.M.
Virtual reality for preprocedure planning of covered stent correction of superior sinus venosus atrial septal defects.Necpál, J. ; Schneider, S.A. ; Zech, M. ; Jech, R.
Paradoxical caffeine-responsive paroxysmal nonkinesigenic dyskinesias.Lange, M. ; Piran, Z. ; Klein, M. ; Spanjaard, B. ; Klein, D. ; Junker, J.P. ; Theis, F.J. ; Nitzan, M.
Mapping lineage-traced cells across time points with moslin.Lakrisenko, P. ; Pathirana, D. ; Weindl, D. ; Hasenauer, J.
Benchmarking methods for computing local sensitivities in ordinary differential equation models at dynamic and steady states.Batra, R. ; Krumsiek, J. ; Wang, X. ; Allen, M. ; Blach, C. ; Kastenmüller, G. ; Arnold, M. ; Ertekin-Taner, N. ; Kaddurah-Daouk, R.
Comparative brain metabolomics reveals shared and distinct metabolic alterations in Alzheimer's disease and progressive supranuclear palsy.Shafighi, S. ; Geras, A. ; Jurzysta, B. ; Sahaf Naeini, A. ; Filipiuk, I. ; Ra Czkowska, A. ; Toosi, H. ; Koperski, L. ; Thrane, K. ; Engblom, C. ; Mold, J.E. ; Chen, X. ; Hartman, J. ; Nowis, D. ; Carbone, A. ; Lagergren, J. ; Szczurek, E.
Integrative spatial and genomic analysis of tumor heterogeneity with Tumoroscope.Janke, C. ; Rubio-Acero, R. ; Weigert, M. ; Reinkemeyer, C. ; Khazaei, Y. ; Kleinlein, L. ; Le Gleut, R. ; Radon, K. ; Hannes, M. ; Picasso, F. ; Lucke, A.E. ; Plank, M. ; Kotta, I.C. ; Paunovic, I. ; Zhelyazkova, A. ; Noreña, I. ; Winter, S. ; Hoelscher, M. ; Wieser, A. ; Küchenhoff, H. ; Castelletti, N.
Understanding the omicron variant impact in healthcare workers: Insights from the prospective COVID-19 post-immunization serological cohort in Munich (KoCo-Impf) on risk factors for breakthrough and reinfections.Sens, D. ; Shilova, L. ; Gräf, L. ; Grebenshchikova, M. ; Eskofier, B.M. ; Casale, F.P.
Genetics-driven risk predictions leveraging the Mendelian randomization framework.Estévez-Arias, B. ; Matalonga, L. ; Yubero, D. ; Polavarapu, K. ; Codina, A.E. ; Ortez, C. ; Carrera-García, L. ; Expósito-Escudero, J. ; Jou, C. ; Meyer, S. ; Kilicarslan, O.A. ; Aleman, A. ; Thompson, R. ; Luknárová, R. ; Esteve-Codina, A. ; Gut, M. ; Laurie, S. ; Demidov, G. ; Yépez, V.A. ; Beltran, S. ; Gagneur, J. ; Töpf, A. ; Lochmüller, H. ; Nascimento, A. ; Hoenicka, J. ; Palau, F. ; Natera-de Benito, D.
Phenotype-driven genomics enhance diagnosis in children with unresolved neuromuscular diseases.Perez, G. ; Barber, G.P. ; Benet-Pages, A. ; Casper, J. ; Clawson, H. ; Diekhans, M. ; Fischer, C. ; Gonzalez, J.N. ; Hinrichs, A.S. ; Lee, C.M. ; Nassar, L.R. ; Raney, B.J. ; Speir, M.L. ; van Baren, M.J. ; Vaske, C.J. ; Haussler, D. ; Kent, W.J. ; Haeussler, M.
The UCSC Genome Browser database: 2025 update.García-Marín, L.M. ; Campos, A.I. ; Diaz-Torres, S. ; Rabinowitz, J.A. ; Ceja, Z. ; Mitchell, B.L. ; Grasby, K.L. ; Thorp, J.G. ; Agartz, I. ; Alhusaini, S. ; Ames, D. ; Amouyel, P. ; Andreassen, O.A. ; Arfanakis, K. ; Vasquez, A.A. ; Armstrong, N.J. ; Athanasiu, L. ; Bastin, M.E. ; Beiser, A.S. ; Bennett, D.A. ; Bis, J.C. ; Boks, M.P. ; Boomsma, D.I. ; Brodaty, H. ; Brouwer, R.M. ; Buitelaar, J.K. ; Burkhardt, R. ; Cahn, W. ; Calhoun, V.D. ; Carmichael, O.T. ; Chakravarty, M.M. ; Chen, Q. ; Ching, C.R.K. ; Cichon, S. ; Crespo-Facorro, B. ; Crivello, F. ; Dale, A.M. ; Smith, G.D. ; de Geus, E.J. ; de Jager, P.L. ; de Zubicaray, G.I. ; Debette, S. ; Decarli, C. ; Depondt, C. ; Desrivières, S. ; Djurovic, S. ; Ehrlich, S. ; Erk, S. ; Espeseth, T. ; Fernández, G. ; Filippi, I. ; Fisher, S.E. ; Fleischman, D.A. ; Fletcher, E. ; Fornage, M. ; Forstner, A.J. ; Francks, C. ; Franke, B. ; Ge, T. ; Goldman, A.L. ; Grabe, H.J. ; Green, R.C. ; Grimm, O. ; Groenewold, N.A. ; Gruber, O. ; Gudnason, V. ; Håberg, A.K. ; Haukvik, U.K. ; Heinz, A. ; Hibar, D.P. ; Hilal, S. ; Himali, J.J. ; Ho, B.C. ; Hoehn, D.F. ; Hoekstra, P.J. ; Hofer, E. ; Hoffmann, W. ; Holmes, A.J. ; Homuth, G. ; Hosten, N. ; Ikram, M.K. ; Ipser, J.C. ; Jack, C.R. ; Jahanshad, N. ; Jönsson, E.G. ; Kahn, R.S. ; Kanai, R. ; Klein, M. ; Knol, M.J. ; Launer, L.J. ; Lawrie, S.M. ; Hellard, S.L. ; Lee, P.H. ; Lemaître, H. ; Li, S. ; Liewald, D.C. ; Lin, H. ; Longstreth, W.T. Jr. ; Lopez, O.L. ; Luciano, M. ; Maillard, P. ; Marquand, A.F. ; Martin, N.G. ; Martinot, J.L. ; Mather, K.A. ; Mattay, V.S. ; McMahon, K.L. ; Mecocci, P. ; Melle, I. ; Meyer-Lindenberg, A. ; Mirza-Schreiber, N. ; Milaneschi, Y. ; Mosley, T.H. ; Mühleisen, T.W. ; Müller-Myhsok, B. ; Muñoz Maniega, S. ; Nauck, M. ; Nho, K. ; Niessen, W.J. ; Nöthen, M.M. ; Nyquist, P.A. ; Oosterlaan, J. ; Pandolfo, M. ; Paus, T. ; Pausova, Z. ; Penninx, B.W. ; Pike, G.B. ; Psaty, B.M. ; Pütz, B. ; Reppermund, S. ; Rietschel, M.D. ; Risacher, S.L. ; Romanczuk-Seiferth, N. ; Romero-Garcia, R. ; Roshchupkin, G.V. ; Rotter, J.I. ; Sachdev, P.S. ; Sämann, P.G. ; Saremi, A. ; Sargurupremraj, M. ; Saykin, A.J. ; Schmaal, L. ; Schmidt, H. ; Schmidt, R. ; Schofield, P.R. ; Scholz, M. ; Schumann, G. ; Schwarz, E. ; Shen, L. ; Shin, J. ; Sisodiya, S.M. ; Smith, A.V. ; Smoller, J.W. ; Soininen, H.S. ; Steen, V.M. ; Stein, D.J. ; Stein, J.L. ; Thomopoulos, S.I. ; Toga, A.W. ; Tordesillas-Gutierrez, D. ; Trollor, J.N. ; Valdes-Hernandez, M.C. ; van 't Ent, D. ; van Bokhoven, H. ; van der Meer, D. ; van der Wee, N.J.A. ; Vázquez-Bourgon, J. ; Veltman, D.J. ; Vernooij, M.W. ; Villringer, A. ; Vinke, L.N. ; Völzke, H. ; Walter, H. ; Wardlaw, J.M. ; Weinberger, D.R. ; Weiner, M.W. ; Wen, W. ; Westlye, L.T. ; Westman, E. ; White, T. ; Witte, A.V. ; Wolf, C. ; Yang, J. ; Zwiers, M.P. ; Ikram, M.A. ; Seshadri, S. ; Thompson, P.M. ; Satizabal, C.L. ; Medland, S.E. ; Rentería, M.E.
Genomic analysis of intracranial and subcortical brain volumes yields polygenic scores accounting for variation across ancestries.Ogloblinsky, M.C. ; Bocher, O. ; Aloui, C. ; Leutenegger, A.L. ; Ozisik, O. ; Baudot, A. ; Tournier-Lasserve, E. ; Castillo-Madeen, H. ; Lewinsohn, D. ; Conrad, D.F. ; Genin, E. ; Marenne, G.
PSAP-Genomic-Regions: A method leveraging population data to prioritize coding and non-coding variants in whole genome sequencing for rare Disease diagnosis.Åkerlund, M. ; Baskozos, G. ; Li, W. ; Themistocleous, A.C. ; Pascal, M.M.V. ; Rayner, N.W. ; Attal, N. ; Baron, R. ; Baudic, S. ; Bennedsgaard, K. ; Bouhassira, D. ; Comini, M. ; Crombez, G. ; Faber, C.G. ; Finnerup, N.B. ; Gierthmühlen, J. ; Granovsky, Y. ; Gylfadottir, S.S. ; Hébert, H.L. ; Jensen, T.S. ; John, J. ; Kemp, H.I. ; Lauria, G. ; Laycock, H. ; Meng, W. ; Nilsen, K.B. ; Palmer, C. ; Rice, A.S.C. ; Serra, J. ; Smith, B.H. ; Tesfaye, S. ; Topaz, L.S. ; Veluchamy, A. ; Vollert, J. ; Yarnitsky, D. ; van Zuydam, N. ; Zwart, J.A. ; McCarthy, M.I. ; Lyssenko, V. ; Bennett, D.L.
Genetic associations of neuropathic pain and sensory profile in a deeply phenotyped neuropathy cohort.Grube, L. ; Petit, P. ; Vuillerme, N. ; Nitschké, M.J.E. ; Nwosu, O.B. ; Knitza, J. ; Krusche, M. ; Seifer, A.K. ; Eskofier, B.M. ; Schett, G. ; Morf, H.
Complementary app-based yoga home exercise therapy for patients with axial spondyloarthritis: Usability study.Clarke, B. ; Holtkamp, E. ; Öztürk, H. ; Mück, M. ; Wahlberg, M. ; Meyer, K. ; Munzlinger, F. ; Brechtmann, F. ; Hölzlwimmer, F.R. ; Lindner, J. ; Chen, Z. ; Gagneur, J. ; Stegle, O.
Integration of variant annotations using deep set networks boosts rare variant association testing.Ham, H. ; Jing, H. ; Lamborn, I.T. ; Kober, M.M. ; Koval, A. ; Berchiche, Y.A. ; Anderson, D.E. ; Druey, K.M. ; Mandl, J.N. ; Isidor, B. ; Ferreira, C.R. ; Freeman, A.F. ; Ganesan, S. ; Karsak, M. ; Mustillo, P.J. ; Teo, J. ; Zolkipli-Cunningham, Z. ; Chatron, N. ; Lecoquierre, F. ; Oler, A.J. ; Schmid, J.P. ; Kuhns, D.B. ; Xu, X. ; Hauck, F. ; Al-Herz, W. ; Wagner, M. ; Terhal, P.A. ; Muurinen, M. ; Barlogis, V. ; Cruz, P. ; Danielson, J. ; Stewart, H. ; Loid, P. ; Rading, S. ; Keren, B. ; Pfundt, R. ; Zarember, K.A. ; Vill, K. ; Potocki, L. ; Olivier, K.N. ; Lesca, G. ; Faivre, L. ; Wong, M. ; Puel, A. ; Chou, J. ; Tusseau, M. ; Moutsopoulos, N.M. ; Matthews, H.F. ; Simons, C. ; Taft, R.J. ; Soldatos, A. ; Masle-Farquhar, E. ; Pittaluga, S. ; Brink, R. ; Fink, D.L. ; Kong, H.H. ; Kabat, J. ; Kim, W.S. ; Bierhals, T. ; Meguro, K. ; Hsu, A.P. ; Gu, J. ; Stoddard, J. ; Banos-Pinero, B. ; Slack, M. ; Trivellin, G. ; Mazel, B. ; Soomann, M. ; Li, S. ; Watts, V.J. ; Stratakis, C.A. ; Rodriguez-Quevedo, M.F. ; Bruel, A.L. ; Lipsanen-Nyman, M. ; Saultier, P. ; Jain, R. ; Lehalle, D. ; Torres, D. ; Sullivan, K.E. ; Barbarot, S. ; Neu, A. ; Duffourd, Y. ; Similuk, M. ; McWalter, K. ; Blanc, P.D. ; Bézieau, S. ; Jin, T. ; Geha, R.S. ; Casanova, J.L. ; Mäkitie, O.M. ; Kubisch, C. ; Edery, P. ; Christodoulou, J. ; Germain, R.N. ; Goodnow, C.C. ; Sakmar, T.P. ; Billadeau, D.D. ; Küry, S. ; Katanaev, V.L. ; Zhang, Y. ; Lenardo, M.J. ; Su, H.C.
Germline mutations in a G protein identify signaling cross-talk in T cells.Calakos, N. ; Zech, M.
Emerging molecular-genetic families in dystonia: Endosome-autophagosome-lysosome and integrated stress response pathways.Capitanchik, C. ; Wilkins, O.G. ; Wagner, N. ; Gagneur, J. ; Ule, J.
From computational models of the splicing code to regulatory mechanisms and therapeutic implications.Kogl, F. ; Reithmeir, A. ; Sideri-Lampretsa, V. ; Machado, I. ; Braren, R. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A. ; Zimmer, V.A.
General vision encoder features as guidance in medical image registration.Machado, I.P. ; Reithmeir, A. ; Kogl, F. ; Rundo, L. ; Funingana, G. ; Reinius, M. ; Mungmeeprued, G. ; Gao, Z. ; McCague, C. ; Kerfoot, E. ; Woitek, R. ; Sala, E. ; Ou, Y. ; Brenton, J.D. ; Schnabel, J.A. ; Crispin, M.
A self-supervised image registration approach for measuring local response patterns in metastatic ovarian cancer.Laabs, B.H. ; Lohmann, K. ; Vollstedt, E.J. ; Reinberger, T. ; Nuxoll, L.M. ; Kilic-Berkmen, G. ; Perlmutter, J.S. ; Loens, S. ; Cruchaga, C. ; Franke, A. ; Dobricic, V. ; Hinrichs, F. ; Grözinger, A. ; Altenmüller, E. ; Bellows, S. ; Boesch, S. ; Bressman, S.B. ; Duque, K.R. ; Espay, A.J. ; Ferbert, A. ; Feuerstein, J.S. ; Frank, S. ; Gasser, T. ; Haslinger, B. ; Jech, R. ; Kaiser, F. ; Kamm, C. ; Kollewe, K. ; Kühn, A.A. ; LeDoux, M.S. ; Lohmann, E. ; Mahajan, A. ; Munchau, A. ; Multhaupt-Buell, T. ; Pantelyat, A. ; Pirio Richardson, S.E. ; Raymond, D. ; Reich, S.G. ; Saunders Pullman, R. ; Schormair, B. ; Sharma, N. ; Sichani, A.H. ; Simonyan, K. ; Volkmann, J. ; Wagle Shukla, A. ; Winkelmann, J. ; Wright, L.J. ; Zech, M. ; Zeuner, K.E. ; Zittel, S. ; Kasten, M. ; Sun, Y.V. ; Bäumer, T. ; Brüggemann, N. ; Ozelius, L.J. ; Jinnah, H.A. ; Klein, C. ; König, I.R.
Genetic risk factors in isolated dystonia escape genome-wide association studies.Binks, S.N.M. ; Elliott, K.S. ; Muñiz-Castrillo, S. ; Gilbert, E. ; Kawasaki de Araujo, T. ; Harper, A.R. ; Brown, A.C. ; Chong, A.Y. ; Band, G. ; Peris Sempere, V. ; Pinto, A.L. ; Costantino, F. ; Rayner, N.W. ; Mentzer, A.J. ; Delanty, N. ; Rogemond, V. ; Picard, G. ; Handel, A.E. ; Melzer, N. ; Titulaer, M.J. ; Lee, S.T. ; Leypoldt, F. ; Kuhlenbaeumer, G. ; Honnorat, J. ; Mignot, E. ; Cavelleri, G.L. ; Knight, J.C. ; Irani, S.R.
Novel risk loci in LGI1-antibody encephalitis: Genome-wide association study discovery and validation cohorts.Flaucher, M. ; Pruemer, F. ; Jaeger, K.M. ; Rolny, J. ; Trissler, P. ; Eckl, S. ; Eskofier, B.M. ; Leutheuser, H.
Motivational factors for experienced users of mobile health applications in heart failure management.Osuala, R. ; Lang, D. ; Verma, P. ; Joshi, S. ; Tsirikoglou, A. ; Skorupko, G. ; Kushibar, K. ; Garrucho, L. ; Pinaya, W.H.L. ; Diaz, O. ; Schnabel, J.A. ; Lekadir, K.
Towards learning contrast kinetics with multi-condition latent diffusion models.Heumos, L. ; Ehmele, P. ; Treis, T. ; Upmeier Zu Belzen, J. ; Roellin, E. ; May, L. ; Namsaraeva, A. ; Horlava, N. ; Shitov, V.A. ; Zhang, X. ; Zappia, L. ; Knöll, R. ; Lang, N.J. ; Hetzel, L. ; Virshup, I. ; Sikkema, L. ; Curion, F. ; Eils, R. ; Schiller, H. B. ; Hilgendorff, A. ; Theis, F.J.
An open-source framework for end-to-end analysis of electronic health record data.Willim, J. ; Woike, D. ; Greene, D. ; Das, S. ; Pfeifer, K. ; Yuan, W. ; Lindsey, A. ; Itani, O. ; Böhme, A.L. ; Tibbe, D. ; Hönck, H.H. ; Hassani Nia, F. ; Zech, M. ; Brunet, T. ; Faivre, L. ; Sorlin, A. ; Vitobello, A. ; Smol, T. ; Colson, C. ; Baranano, K. ; Schatz, K. ; Bayat, A. ; Schoch, K. ; Spillmann, R.C. ; Davis, E.E. ; Conboy, E. ; Vetrini, F. ; Platzer, K. ; Neuser, S. ; Gburek-Augustat, J. ; Grace, A.N. ; Mitchell, B.D. ; Stegmann, A.P. ; Sinnema, M. ; Meeks, N. ; Saunders, C. ; Cadieux-Dion, M. ; Hoyer, J. ; Van-Gils, J. ; de Sainte-Agathe, J.M. ; Thompson, M.L. ; Bebin, E.M. ; Weisz-Hubshman, M. ; Tabet, A.C. ; Verloes, A. ; Lévy, J. ; Latypova, X. ; Harder, S. ; Silverman, G.A. ; Pak, S.C. ; Schedl, T. ; Freson, K. ; Mumford, A. ; Turro, E. ; Schlein, C. ; Shashi, V. ; Kreienkamp, H.J.
Variants in LRRC7 lead to intellectual disability, autism, aggression and abnormal eating behaviors.Reithmeir, A. ; Felsner, L. ; Braren, R. ; Schnabel, J.A. ; Zimmer, V.A.
Data-driven tissue- and subject-specific elastic regularization for medical image registration.Linguraru, M.G. ; Dou, Q. ; Feragen, A. ; Giannarou, S. ; Glocker, B. ; Lekadir, K. ; Schnabel, J.A.
Preface.d'Ascoli, S. ; Becker, S. ; Mathis, A. ; Schwaller, P. ; Kilbertus, N.
ODEFormer: Symbolic regression of dynamical systems with transformers.Kotlarz, D.M.
Unveiling a critical role of IL-7 in Celiac Disease - Insights from a novel human autoimmune organoid model.Edenhofer, G. ; Frank, P. ; Roth, J. ; Leike, R.H. ; Guerdi, M. ; Platz, L.I. ; Guardiani, M. ; Eberle, V. ; Westerkamp, M. ; Enßlin, T.A.
Re-envisioning numerical information field theory (NIFTy.re): A library for gaussian processes and variational inference.Nussbaum, C. ; Kim-Hellmuth, S.
Unlocking the genetic influence on milk variation and its potential implication for infant health.Castellotti, B. ; Gellera, C. ; Caputo, D. ; Danti, F.R. ; Messina, G. ; Corbetta, M. ; Magri, S. ; Taroni, F. ; Prokisch, H. ; Zech, M. ; Zorzi, G.
Paroxysmal non-kinesigenic dyskinesias associated with biallelic POLG variants: A case report.Nagarajan, D. ; Parracho, R.T. ; Corujo, D. ; Xie, M. ; Kutkaite, G. ; Olsen, T.K. ; Rúbies Bedós, M. ; Salehi, M. ; Baryawno, N. ; Menden, M.P. ; Chen, X. ; Buschbeck, M. ; Mao, Y.
Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma.Stehr, A.M. ; Koeglsperger, T. ; Jacob, M. ; Rhodio, V. ; Winkelmann, J. ; Hopfner, F. ; Zech, M.
Tremor-dominant movement disorder in ANKRD11- associated KBG syndrome.Fröhlich, A.S. ; Gerstner, N. ; Gagliardi, M. ; Ködel, M. ; Yusupov, N. ; Matosin, N. ; Czamara, D. ; Sauer, S. ; Roeh, S. ; Murek, V. ; Chatzinakos, C. ; Daskalakis, N.P. ; Knauer-Arloth, J. ; Ziller, M.J. ; Binder, E.B.
Single-nucleus transcriptomic profiling of human orbitofrontal cortex reveals convergent effects of aging and psychiatric disease.Oertel, W.H. ; Janzen, A. ; Henrich, M.T. ; Geibl, F.F. ; Sittig, E. ; Meles, S.K. ; Carli, G. ; Leenders, K.L. ; Booij, J. ; Surmeier, D.J. ; Timmermann, L. ; Strupp, M.
Acetyl-DL-leucine in two individuals with REM sleep behavior disorder improves symptoms, reverses loss of striatal dopamine-transporter binding and stabilizes pathological metabolic brain pattern-case reports.Carper, D. ; Lac, M. ; Coue, M. ; Labour, A. ; Märtens, A. ; Banda, J.A.A. ; Mazeyrie, L. ; Mechta, M. ; Ingerslev, L.R. ; Elhadad, M.A. ; Petit, J.V. ; Maslo, C. ; Monbrun, L. ; Del Carmine, P. ; Sainte-Marie, Y. ; Bourlier, V. ; Laurens, C. ; Mithieux, G. ; Joanisse, D.R. ; Coudray, C. ; Feillet-Coudray, C. ; Montastier, E. ; Viguerie, N. ; Tavernier, G. ; Waldenberger, M. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R. ; Adamski, J. ; Suhre, K. ; Gieger, C. ; Kastenmüller, G. ; Illig, T. ; Lichtinghagen, R. ; Seissler, J. ; Mounier, R. ; Hiller, K. ; Jordan, J. ; Barrès, R. ; Kuhn, M. ; Pesta, D. ; Moro, C.
Loss of atrial natriuretic peptide signaling causes insulin resistance, mitochondrial dysfunction, and low endurance capacity.Blackburn, P.R. ; Ebstein, F. ; Hsieh, T.C. ; Motta, M. ; Radio, F.C. ; Herkert, J.C. ; Rinne, T. ; Thiffault, I. ; Rapp, M. ; Alders, M. ; Maas, S. ; Gérard, B. ; Smol, T. ; Vincent-Delorme, C. ; Cogné, B. ; Isidor, B. ; Vincent, M. ; Bachmann-Gagescu, R. ; Rauch, A. ; Joset, P. ; Ferrero, G.B. ; Ciolfi, A. ; Husson, T. ; Guerrot, A.M. ; Bacino, C.A. ; Macmurdo, C. ; Thompson, S.S. ; Rosenfeld, J.A. ; Faivre, L. ; Mau-them, F.T. ; Deb, W. ; Vignard, V. ; Agrawal, P.B. ; Madden, J.A. ; Goldenberg, A. ; Lecoquierre, F. ; Zech, M. ; Prokisch, H. ; Necpál, J. ; Jech, R. ; Winkelmann, J. ; Koprusakova, M.T. ; Konstantopoulou, V. ; Younce, J.R. ; Shinawi, M. ; Mighton, C. ; Fung, C. ; Morel, C.F. ; Lerner-Ellis, J. ; DiTroia, S. ; Barth, M. ; Bonneau, D. ; Krapels, I.P. ; Stegmann, A.P.A. ; van der Schoot, V. ; Brunet, T. ; Bußmann, C. ; Mignot, C. ; Zampino, G. ; Wortmann, S.B. ; Mayr, J.A. ; Feichtinger, R.G. ; Courtin, T. ; Ravelli, C. ; Keren, B. ; Ziegler, A. ; Hasadsri, L. ; Pichurin, P.N. ; Klee, E.W. ; Grand, K. ; Sanchez-Lara, P.A. ; Krüger, E. ; Bézieau, S. ; Klinkhammer, H. ; Krawitz, P.M. ; Eichler, E.E. ; Tartaglia, M. ; Küry, S. ; Wang, T.
Loss-of-function variants in CUL3 cause a syndromic neurodevelopmental disorder.Kuck, L. ; McNamee, A.P. ; Bordukova, M. ; Sadafi, A. ; Marr, C. ; Peart, J.N. ; Simmonds, M.J.
Lysis of human erythrocytes due to Piezo1-dependent cytosolic calcium overload as a mechanism of circulatory removal.Li, Y. ; Wang, Y. ; Tan, Y.Q. ; Yue, Q. ; Guo, Y. ; Yan, R. ; Meng, L. ; Zhai, H. ; Tong, L. ; Yuan, Z. ; Li, W. ; Wang, C. ; Han, S. ; Ren, S. ; Yan, Y. ; Wang, W. ; Gao, L. ; Tan, C. ; Hu, T. ; Zhang, H. ; Liu, L. ; Yang, P. ; Jiang, W. ; Ye, Y. ; Tan, H. ; Wang, Y. ; Lu, C. ; Li, X. ; Xie, J. ; Yuan, G. ; Cui, Y. ; Shen, B. ; Guan, Y. ; Shi, Q. ; Lin, G. ; Ni, T. ; Sun, Z. ; Ye, L. ; Vourekas, A. ; Guo, X. ; Lin, M. ; Zheng, K.
The landscape of RNA-binding proteins in mammalian spermatogenesis.Zorzi, G. ; Zibordi, F. ; Sorrentino, U. ; Prokisch, H. ; Garavaglia, B. ; Zech, M.
Potassium channel subunit Kir4.1 mutated in paroxysmal kinesigenic dyskinesia: Screening of an Italian cohort.Repetto, L. ; Chen, J. ; Yang, Z. ; Zhai, R. ; Timmers, P.R.H.J. ; Feng, X. ; Li, T. ; Yao, Y. ; Maslov, D. ; Timoshchuk, A. ; Tu, F. ; Twait, E.L. ; May-Wilson, S. ; Muckian, M.D. ; Prins, B.P. ; Png, G. ; Kooperberg, C. ; Johansson, Å ; Hillary, R.F. ; Wheeler, E. ; Pan, L. ; He, Y. ; Klasson, S. ; Ahmad, S. ; Peters, J.E. ; Gilly, A. ; Karaleftheri, M. ; Tsafantakis, E. ; Haessler, J. ; Gyllensten, U. ; Harris, S.E. ; Wareham, N.J. ; Göteson, A. ; Lagging, C. ; Ikram, M.A. ; van Duijn, C.M. ; Jern, C. ; Landén, M. ; Langenberg, C. ; Deary, I.J. ; Marioni, R.E. ; Enroth, S. ; Reiner, A.P. ; Dedoussis, G. ; Zeggini, E. ; Sharapov, S. ; Aulchenko, Y.S. ; Butterworth, A.S. ; Mälarstig, A. ; Wilson, J.F. ; Navarro, P. ; Shen, X.
The genetic landscape of neuro-related proteins in human plasma.Ringgold, V. ; Abel, L. ; Eskofier, B.M. ; Rohleder, N.
Validation of the Virtual Reality Stroop Room: Effects of inhibiting interfering information under time-pressure and task-switching demands.Krauss, D. ; Engel, L. ; Ott, T. ; Braunig, J. ; Richer, R. ; Gambietz, M. ; Albrecht, N.C. ; Hille, E.M. ; Ullmann, I. ; Braun, M. ; Dabrock, P. ; Kolpin, A. ; Koelewijn, A.D. ; Eskofier, B.M. ; Vossiek, M.
A review and tutorial on machine learning-enabled radar-based biomedical monitoring.Arruda, A.L. ; Katsoula, G. ; Chen, S. ; Reimann, E. ; Kreitmaier, P. ; Zeggini, E.
The genetics and functional genomics of osteoarthritis.Schlieper, P. ; Dombrowski, M. ; Nguyen, A. ; Zanca, D. ; Eskofier, B.M.
Data-centric benchmarking of neural network architectures for the univariate time series forecasting task.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
On the well-posedness of some model arising in the mathematical biology.Sharma, S. ; Dong, Q. ; Haid, M. ; Adam, J. ; Bizzotto, R. ; Fernandez-Tajes, J.J. ; Jones, A.G. ; Tura, A. ; Artati, A. ; Prehn, C. ; Kastenmüller, G. ; Koivula, R.W. ; Franks, P.W. ; Walker, M. ; Forgie, I.M. ; Giordano, G.N. ; Pavo, I. ; Ruetten, H. ; Dermitzakis, M. ; McCarthy, M.I. ; Pedersen, O. ; Schwenk, J.M. ; Tsirigos, K.D. ; De Masi, F. ; Brunak, S. ; Viñuela, A. ; Mari, A. ; McDonald, T.J. ; Kokkola, T. ; Adamski, J. ; Pearson, E.R. ; Grallert, H.
Role of human plasma metabolites in prediabetes and type 2 diabetes from the IMI-DIRECT study.Albrecht, N.C. ; Langer, D. ; Krauss, D. ; Richer, R. ; Abel, L. ; Eskofier, B.M. ; Rohleder, N. ; Koelpin, A.
EmRad: Ubiquitous vital sign sensing using compact continuous-wave radars.Johnston, K.G. ; Grieco, S.F. ; Nie, Q. ; Theis, F.J. ; Xu, X.
Small data methods in omics: The power of one.Hussain, Z. ; Binz, M. ; Mata, R. ; Wulff, D.U.
A tutorial on open-source large language models for behavioral science.Fischer, F. ; Fischer, D.S. ; Mukhin, R. ; Isaev, A. ; Biederstedt, E. ; Villani, A.C. ; Theis, F.J.
scTab: Scaling cross-tissue single-cell annotation models.Drost, F. ; Dorigatti, E. ; Straub, A. ; Hilgendorf, P. ; Wagner, K.I. ; Heyer, K. ; López Montes, M. ; Bischl, B. ; Busch, D.H. ; Schober, K. ; Schubert, B.
Predicting T cell receptor functionality against mutant epitopes.Böckel, C. ; Pastor, X. ; Heinig, M. ; Walzthoeni, T.
Differential analysis of protein-DNA binding using ChIP-seq data.Bernhardt, A.M. ; Oeller, M. ; Friedrich, I. ; Kocakavuk, E. ; Nachman, E. ; Peikert, K. ; Roderigo, M. ; Rossmann, A. ; Schröter, T. ; Wilhelm, L.O. ; Prell, T. ; van Riesen, C. ; Nieweler, J. ; Katzdobler, S. ; Weiler, M. ; Jacobi, H. ; Warnecke, T. ; Claus, I. ; Palleis, C. ; Breimann, S. ; Falkenburger, B.H. ; Brandt, M. ; Hermann, A. ; Rumpf, J.J. ; Clasen, J. ; Höglinger, G. ; Gandor, F. ; Levin, J. ; Giese, A. ; Janzen, A. ; Oertel, W.H.
Risk willingness in multiple system atrophy and Parkinson's disease understanding patient preferences.Binz, M. ; Dasgupta, I. ; Jagadish, A.K. ; Botvinick, M. ; Wang, J.X. ; Schulz, E.
Meta-learning: Data, architecture, and both.Szałata, A. ; Hrovatin, K. ; Becker, S. ; Tejada Lapuerta, A. ; Cui, H. ; Wang, B. ; Theis, F.J.
Transformers in single-cell omics: A review and new perspectives.Tschuck, J. ; Padmanabhan Nair, V. ; Galhoz, A. ; Zaratiegui, C. ; Tai, H.-M. ; Ciceri, G. ; Rothenaigner, I. ; Tchieu, J. ; Stockwell, B.R. ; Studer, L. ; Cabianca, D.S. ; Menden, M.P. ; Vincendeau, M. ; Hadian, K.
Suppression of ferroptosis by vitamin A or radical-trapping antioxidants is essential for neuronal development.Prokisch, H. ; Zech, M.
Proteomic profiling in dystonia: The next frontier for pathophysiology research and biomarker exploration.Roider, J. ; Nguyen, A. ; Zanca, D. ; Eskofier, B.M.
Assessing the performance of remaining time prediction methods for business processes.Kousa, A.I. ; Jahn, L. ; Zhao, K. ; Flores, A.E. ; Acenas, D. ; Lederer, E. ; Argyropoulos, K.V. ; Lemarquis, A.L. ; Granadier, D. ; Cooper, K. ; D'Andrea, M. ; Sheridan, J.M. ; Tsai, J. ; Sikkema, L. ; Lazrak, A. ; Nichols, K. ; Lee, N. ; Ghale, R. ; Malard, F. ; Andrlova, H. ; Velardi, E. ; Youssef, S.A. ; Burgos da Silva, M. ; Docampo, M. ; Sharma, R. ; Mazutis, L. ; Wimmer, V.C. ; Rogers, K.L. ; DeWolf, S. ; Gipson, B. ; Gomes, A.L.C. ; Setty, M. ; Pe'er, D. ; Hale, L. ; Manley, N.R. ; Gray, D.H.D. ; van den Brink, M.R.M. ; Dudakov, J.A.
Age-related epithelial defects limit thymic function and regeneration.Stelter, J. ; Weiss, K. ; Steinhelfer, L. ; Spieker, V. ; Huaroc Moquillaza, E. ; Zhang, W. ; Makowski, M.R. ; Schnabel, J.A. ; Kainz, B. ; Braren, R.F. ; Karampinos, D.C.
Simultaneous whole-liver water T1 and T2 mapping withisotropic resolution during free-breathing.Roos, A. ; Häusler, M. ; Kollipara, L. ; Töpf, A. ; Preusse, C. ; Stucka, R. ; Nolte, K.W. ; Strom, T. ; Berutti, R. ; Jiang, X. ; Koll, R. ; Lochmüller, H. ; Schacht, S.M. ; Zahedi, R.P. ; Weis, J. ; Senderek, J.
HNRNPA1 de novo variant associated with early childhood onset, rapidly progressive generalized myopathy.Ponce-de-Leon, M. ; Wang-Sattler, R. ; Peters, A. ; Rathmann, W. ; Grallert, H. ; Artati, A. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Meisinger, C. ; Linseisen, J.
Stool and blood metabolomics in the metabolic syndrome: A cross-sectional study.Roider, J. ; Zanca, D. ; Eskofier, B.M.
Efficient training of recurrent neural networks for remaining time prediction in predictive process monitoring.Papamarkou, T. ; Birdal, T. ; Bronstein, M.D. ; Carlsson, G. ; Curry, J. ; Gao, Y. ; Hajij, M. ; Kwitt, R. ; Liò, P. ; Di Lorenzo, P. ; Maroulas, V. ; Miolane, N. ; Nasrin, F. ; Ramamurthy, K.N. ; Rieck, B. ; Scardapane, S. ; Schaub, M.T. ; Veličković, P. ; Wang, B. ; Wang, Y. ; Wei, G.W. ; Zamzmi, G.
Position: Topological deep learning is the new frontier for relational learning.Coda-Forno, J. ; Binz, M. ; Wang, J.X. ; Schulz, E.
CogBench: A large language model walks into a psychology lab.Jagadish, A.K. ; Coda-Forno, J. ; Thalmann, M. ; Schulz, E. ; Binz, M.
Human-like category learning by injecting ecological priors from large language models into neural networks.Schubert, J.A. ; Jagadish, A.K. ; Binz, M. ; Schulz, E.
In-context learning agents are asymmetric belief updaters.Wollschläger, T. ; Kemper, N. ; Hetzel, L. ; Sommer, J. ; Günnemann, S.
Expressivity and generalization: Fragment-biases for molecular GNNs.Arruda, J. ; Schälte, Y. ; Peiter, C. ; Teplytska, O. ; Jaehde, U. ; Hasenauer, J.
An amortized approach to non-linear mixed-effects modeling based on neural posterior estimation.Verdun, C.M. ; Melnyk, O. ; Krahmer, F. ; Jung, P.
Fast, blind, and accurate: Tuning-free sparse regression with global linear convergence.Kazeminia, S. ; Brezik, M. ; Shetab Boushehri, S. ; Marr, C.
A data-driven solution for the cold start problem in biomedical image classification.Mueller, T.T. ; Chevli, M. ; Daigavane, A. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Differentially private graph neural networks for medical population graphs and the impact of the graph structure.Erdur, A.C. ; Rusche, D. ; Scholz, D. ; Kiechle, J. ; Fischer, S. ; Llorián-Salvador, O. ; Buchner, J.A. ; Nguyen, M.Q. ; Etzel, L. ; Weidner, J. ; Metz, M.C. ; Wiestler, B. ; Schnabel, J.A. ; Rueckert, D. ; Combs, S.E. ; Peeken, J.C.
Deep learning for autosegmentation for radiotherapy treatment planning: State-of-the-art and novel perspectives.Roth, B. ; Koch, V. ; Wagner, S. ; Schnabel, J.A. ; Marr, C. ; Peng, T.
Low-resource finetuning of foundation models beats state-of-the-art in histopathology.Stein, J. ; di Folco, M. ; Schnabel, J.A.
Influence of prompting strategies on segment anything model (SAM) for short-axis cardiac MRI segmentation.Kiechle, J. ; Fischer, S.M. ; Lang, D. ; di Folco, M. ; Foreman, S.C. ; Rösner, V.K.N. ; Lohse, A.K. ; Mogler, C. ; Knebel, C. ; Makowski, M.R. ; Woertler, K. ; Combs, S.E. ; Gersing, A.S. ; Peeken, J.C. ; Schnabel, J.A.
Unifying local and global shape descriptors to grade soft-tissue sarcomas using graph convolutional networks.Kotlarz, D.M.
Defining the role of immune microniches in intestinal effector regulatory T-cell functionality.Kunc, L. ; Havránková, P. ; Škorvánek, M. ; Příhodová, I. ; Poláková, K. ; Nosková, L. ; Tesarova, M. ; Honzík, T. ; Zech, M. ; Jech, R.
Dystonia: A novel sign of the Smith-Magenis syndrome – A three-case report.Sarfraz, I. ; Wang, Y. ; Shastry, A. ; Teh, W.K. ; Sokolov, A. ; Herb, B.R. ; Creasy, H.H. ; Virshup, I. ; Dries, R. ; Degatano, K. ; Mahurkar, A. ; Schnell, D.J. ; Madrigal, P. ; Hilton, J. ; Gehlenborg, N. ; Tickle, T. ; Campbell, J.D.
MAMS: Matrix and analysis metadata standards to facilitate harmonization and reproducibility of single-cell data.Marin, F.I. ; Teufel, F. ; Horlacher, M. ; Madsen, D.H. ; Pultz, D. ; Winther, O. ; Boomsma, W.
BEND: Benchmarking DNA language models on biologically meaningful tasks.Müller, P. ; Meissen, F. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
Weakly supervised object detection in chest X-rays with differentiable ROI proposal networks and soft ROI pooling.Galter, I. ; Schneltzer, E. ; Marr, C. ; Spielmann, N. ; Hrabě de Angelis, M.
EchoVisuAL: Efficient Segmentation of Echocardiograms Using Deep Active Learning.Gräf, L. ; Sens, D. ; Shilova, L. ; Casale, F.P.
Disease risk predictions with differentiable mendelian randomization.Segarra-Casas, A. ; Yépez, V.A. ; Demidov, G. ; Laurie, S. ; Esteve-Codina, A. ; Gagneur, J. ; Parkhurst, Y. ; Muni-Lofra, R. ; Harris, E. ; Marini-Bettolo, C. ; Straub, V. ; Töpf, A.
An integrated transcriptomics and genomics approach detects an X/Autosome translocation in a female with duchenne muscular dystrophy.Liang, N. ; Nho, K. ; Newman, J.W. ; Arnold, M. ; Huynh, K. ; Meikle, P.J. ; Borkowski, K. ; Kaddurah-Daouk, R.
Peripheral inflammation is associated with brain atrophy and cognitive decline linked to mild cognitive impairment and Alzheimer's disease.Gudina, E.K. ; Elsbernd, K. ; Yilma, D. ; Kisch, R. ; Wallrafen-Sam, K. ; Abebe, G. ; Mekonnen, Z. ; Berhane, M. ; Gerbaba, M. ; Suleman, S. ; Mamo, Y. ; Rubio-Acero, R. ; Ali, S. ; Zeynudin, A. ; Merkt, S. ; Hasenauer, J. ; Chala, T.K. ; Wieser, A. ; Kroidl, A.
Tailoring COVID-19 vaccination strategies in high-seroprevalence settings: Insights from Ethiopia.Saßmannshausen, M. ; Sautbaeva, L. ; von der Emde, L.A. ; Vaisband, M. ; Sloan, K.R. ; Hasenauer, J. ; Holz, F.G. ; Ach, T.
Retro mode imaging for detection and quantification of Sub-RPE drusen and subretinal drusenoid deposits in age-related macular degeneration.Salehi, F. ; Lopera Gonzalez, L.I. ; Bayat, S. ; Kleyer, A. ; Zanca, D. ; Brost, A. ; Schett, G. ; Eskofier, B.M.
Machine learning prediction of treatment response to biological disease-modifying antirheumatic drugs in rheumatoid arthritis.Grexa, I. ; Iván, Z.Z. ; Migh, E. ; Kovács, F. ; Bolck, H.A. ; Zheng, X. ; Mund, A. ; Moshkov, N. ; Miczán, V. ; Koos, K. ; Horvath, P.
SuperCUT, an unsupervised multimodal image registration with deep learning for biomedical microscopy.Asani, B. ; Holmberg, O. ; Schiefelbein, J.B. ; Hafner, M. ; Herold, T. ; Spitzer, H. ; Siedlecki, J. ; Kern, C. ; Kortuem, K.U. ; Frishberg, A. ; Theis, F.J. ; Priglinger, S.G.
Evaluation of OCT biomarker changes in treatment-naive neovascular AMD using a deep semantic segmentation algorithm.Kreitmaier, P. ; Swift, D. ; Wilkinson, J.M. ; Zeggini, E.
Epigenomic differences between osteoarthritis grades in primary cartilage.Siebenmorgen, T. ; Cardoso Micu Menezes, F.M. ; Benassou, S. ; Merdivan, E. ; Didi, K. ; Mourao, A. ; Kitel, R. ; Liò, P. ; Kesselheim, S. ; Piraud, M. ; Theis, F.J. ; Sattler, M. ; Popowicz, G.M.
MISATO: Machine learning dataset of protein-ligand complexes for structure-based drug discovery.Sheng, X. ; Nenseth, H.Z. ; Qu, S. ; Kuzu, O.F. ; Frahnow, T. ; Simon, L. ; Greene, S. ; Zeng, Q. ; Fazli, L. ; Rennie, P.S. ; Mills, I.G. ; Danielsen, H. ; Theis, F.J. ; Patterson, J.B. ; Jin, Y. ; Saatcioglu, F.
Author Correction: IRE1α-XBP1s pathway promotes prostate cancer by activating c-MYC signaling.Ghaffar, A. ; Akhter, T. ; Strømme, P. ; Misceo, D. ; Khan, A. ; Frengen, E. ; Umair, M. ; Isidor, B. ; Cogné, B. ; Khan, A.A. ; Bruel, A.L. ; Sorlin, A. ; Kuentz, P. ; Chiaverini, C. ; Innes, A.M. ; Zech, M. ; Baláž, M. ; Havránková, P. ; Jech, R. ; Ahmed, Z.M. ; Riazuddin, S.
Variants of NAV3, a neuronal morphogenesis protein, cause intellectual disability, developmental delay, and microcephaly.Kobayashi, E.S. ; Lotan, N.S. ; Schejter, Y.D. ; Makowski, C. ; Kraus, V. ; Ramchandar, N. ; Meiner, V. ; Thiffault, I. ; Farrow, E. ; Cakici, J. ; Kingsmore, S. ; Wagner, M. ; Rieber, N. ; Bainbridge, M.
Biallelic loss of function variants in SENP7 cause immunodeficiency with neurologic and muscular phenotypes.Schmidt, A. ; Danyel, M. ; Grundmann, K. ; Brunet, T. ; Klinkhammer, H. ; Hsieh, T.C. ; Engels, H. ; Peters, S. ; Knaus, A. ; Moosa, S. ; Averdunk, L. ; Boschann, F. ; Sczakiel, H.L. ; Schwartzmann, S. ; Mensah, M.A. ; Pantel, J.T. ; Holtgrewe, M. ; Bösch, A. ; Weis, C. ; Weinhold, N. ; Suter, A.A. ; Stoltenburg, C. ; Neugebauer, J. ; Kallinich, T. ; Kaindl, A.M. ; Holzhauer, S. ; Bührer, C. ; Bufler, P. ; Kornak, U. ; Ott, C.E. ; Schülke, M. ; Nguyen, H.H.P. ; Hoffjan, S. ; Grasemann, C. ; Rothoeft, T. ; Brinkmann, F. ; Matar, N. ; Sivalingam, S. ; Perne, C. ; Mangold, E. ; Kreiss, M. ; Cremer, K. ; Betz, R.C. ; Mücke, M.B. ; Grigull, L. ; Klockgether, T. ; Spier, I. ; Heimbach, A. ; Bender, T. ; Brand, F. ; Stieber, C. ; Morawiec, A.M. ; Karakostas, P. ; Schäfer, V.S. ; Bernsen, S. ; Weydt, P. ; Castro-Gomez, S. ; Aziz, A. ; Grobe-Einsler, M. ; Kimmich, O. ; Kobeleva, X. ; Önder, D. ; Lesmann, H. ; Kumar, S. ; Tacik, P. ; Basin, M.A. ; Incardona, P. ; Lee-Kirsch, M.A. ; Berner, R. ; Schuetz, C. ; Körholz, J. ; Kretschmer, T. ; di Donato, N. ; Schröck, H. ; Heinen, A. ; Reuner, U. ; Hanßke, A.M. ; Kaiser, F.J. ; Manka, E. ; Munteanu, M. ; Kuechler, A. ; Cordula, K. ; Hirtz, R. ; Schlapakow, E. ; Schlein, C. ; Lisfeld, J. ; Kubisch, C. ; Herget, T. ; Hempel, M. ; Weiler-Normann, C. ; Ullrich, K. ; Schramm, C. ; Rudolph, C. ; Rillig, F. ; Groffmann, M. ; Muntau, A.C. ; Tibelius, A. ; Schwaibold, E.M.C. ; Schaaf, C.P. ; Zawada, M. ; Kaufmann, L. ; Hinderhofer, K. ; Okun, P.M. ; Kotzaeridou, U. ; Hoffmann, G.F. ; Choukair, D. ; Bettendorf, M. ; Spielmann, M. ; Ripke, A. ; Pauly, M. ; Munchau, A. ; Lohmann, K. ; Hüning, I. ; Hanker, B. ; Bäumer, T. ; Herzog, R. ; Hellenbroich, Y. ; Westphal, D.S. ; Strom, T. ; Kovacs, R. ; Riedhammer, K.M. ; Mayerhanser, K. ; Graf, E. ; Brugger, M. ; Hoefele, J. ; Oexle, K. ; Mirza-Schreiber, N. ; Berutti, R. ; Schatz, U. ; Krenn, M. ; Makowski, C. ; Weigand, H. ; Schröder, S. ; Rohlfs, M. ; Vill, K. ; Hauck, F. ; Borggraefe, I. ; Müller-Felber, W. ; Kurth, I. ; Elbracht, M. ; Knopp, C. ; Begemann, M. ; Kraft, F. ; Lemke, J.R. ; Hentschel, J. ; Platzer, K. ; Strehlow, V. ; Abou Jamra, R. ; Kehrer, M. ; Demidov, G. ; Beck-Wödl, S. ; Graessner, H. ; Sturm, M. ; Zeltner, L. ; Schöls, L.J. ; Magg, J. ; Bevot, A. ; Kehrer, C. ; Kaiser, N. ; Turro, E. ; Horn, D. ; Grüters-Kieslich, A. ; Klein, C. ; Mundlos, S. ; Nöthen, M. ; Riess, O. ; Meitinger, T. ; Krude, H. ; Krawitz, P.M. ; Haack, T. ; Ehmke, N. ; Wagner, M.
Next-generation phenotyping integrated in a national framework for patients with ultrarare disorders improves genetic diagnostics and yields new molecular findings.Dorešić, D. ; Grein, S. ; Hasenauer, J.
Efficient parameter estimation for ODE models of cellular processes using semi-quantitative data.Ali, M. ; Kuijs, M. ; Hediyeh-Zadeh, S. ; Treis, T. ; Hrovatin, K. ; Palla, G. ; Schaar, A. ; Theis, F.J.
GraphCompass: Spatial metrics for differential analyses of cell organization across conditions.Palit, S. ; Shrestha, A.K. ; Thapa, S. ; L Grimm, S. ; Coarfa, C. ; Theis, F.J. ; Simon, L.M. ; Shivanna, B.
Leveraging integrated RNA sequencing to decipher adrenomedullin's protective mechanisms in experimental bronchopulmonary dysplasia.Osuala, R. ; Joshi, S. ; Tsirikoglou, A. ; Garrucho, L. ; Pinaya, W.H.L. ; Diaz, O. ; Lekadir, K.
Pre- to post-contrast breast MRI synthesis for enhanced tumour segmentation.Weinisch, P. ; Raffler, J. ; Römisch-Margl, W. ; Arnold, M. ; Mohney, R.P. ; Rist, M.J. ; Prehn, C. ; Skurk, T. ; Hauner, H. ; Daniel, H. ; Suhre, K. ; Kastenmüller, G.
The HuMet Repository: Watching human metabolism at work.Tóth, A.D. ; Szalai, B. ; Kovács, O.T. ; Garger, D. ; Prokop, S. ; Soltész-Katona, E. ; Balla, A. ; Inoue, A. ; Várnai, P. ; Turu, G. ; Hunyady, L.
G protein-coupled receptor endocytosis generates spatiotemporal bias in β-arrestin signaling.Garcia, E.B.G. ; Lladó, X. ; Mann, R.M. ; Osuala, R. ; Martí, R.
Breast composition measurements from Full-Field Digital Mammograms using generative adversarial networks.Wagner, M. ; Wortmann, S.B.
Mitochondrial DNA-encoded defects.Elfert, E. ; Kaminski, W.E. ; Matek, C. ; Hoermann, G. ; Axelsen, E.W. ; Marr, C. ; Piehler, A.P.
Expert-level detection of M-proteins in serum protein electrophoresis using machine learning.Çelik, M.H. ; Gagneur, J. ; Lim, R.G. ; Wu, J. ; Thompson, L.M. ; Xie, X.
Identifying dysregulated regions in amyotrophic lateral sclerosis through chromatin accessibility outliers.Pietzner, M. ; Denaxas, S. ; Yasmeen, S. ; Ulmer, M.A. ; Nakanishi, T. ; Arnold, M. ; Kastenmüller, G. ; Hemingway, H. ; Langenberg, C.
Complex patterns of multimorbidity associated with severe COVID-19 and long COVID.Morales-Romero, B. ; Muñoz-Pujol, G. ; Artuch, R. ; García-Cazorla, A. ; O'Callaghan, M. ; Sykut-Cegielska, J. ; Campistol, J.M. ; Moreno-Lozano, P.J. ; Oud, M.M. ; Wevers, R.A. ; Lefeber, D.J. ; Esteve-Codina, A. ; Yépez, V.A. ; Gagneur, J. ; Wortmann, S.B. ; Prokisch, H. ; Ribes, A. ; García-Villoria, J. ; Tort, F.
Genome and RNA sequencing were essential to reveal cryptic intronic variants associated to defective ATP6AP1 mRNA processing.Adamer, M.F. ; de Brouwer, E. ; O’Bray, L. ; Rieck, B.
The magnitude vector of images.Gaertner, F. ; Ishikawa-Ankerhold, H. ; Stutte, S. ; Fu, W. ; Weitz, J. ; Dueck, A. ; Nelakuditi, B. ; Fumagalli, V. ; van den Heuvel, D. ; Belz, L. ; Sobirova, G. ; Zhang, Z. ; Titova, A. ; Navarro, A.M. ; Pekayvaz, K. ; Lorenz, M. ; von Baumgarten, L. ; Kranich, J. ; Straub, T. ; Popper, B. ; Zheden, V. ; Kaufmann, W.A. ; Guo, C. ; Piontek, G. ; von Stillfried, S. ; Boor, P. ; Colonna, M. ; Clauß, S. ; Schulz, C. ; Brocker, T. ; Walzog, B. ; Scheiermann, C. ; Aird, W.C. ; Nerlov, C. ; Stark, K. ; Petzold, T. ; Engelhardt, S. ; Sixt, M. ; Hauschild, R. ; Rudelius, M. ; Oostendorp, R.A.J. ; Iannacone, M. ; Heinig, M. ; Massberg, S.
Plasmacytoid dendritic cells control homeostasis of megakaryopoiesis.Curion, F. ; Rich-Griffin, C. ; Agarwal, D. ; Ouologuem, S. ; Rue-Albrecht, K. ; May, L. ; Garcia, G.E.L. ; Heumos, L. ; Thomas, T. ; Lason, W. ; Sims, D. ; Theis, F.J. ; Dendrou, C.A.
Panpipes: A pipeline for multiomic single-cell and spatial transcriptomic data analysis.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
On the solvability of some systems of integro-differential equations with and without a drift.Pereira, A. ; Diwakar, S.J. ; Masserdotti, G. ; Beşkardeş, S. ; Simon, T. ; So, Y. ; Martín-Loarte, L. ; Bergemann, F. ; Vasan, L. ; Schauer, T. ; Danese, A. ; Bocchi, R. ; Colomé-Tatché, M. ; Schuurmans, C. ; Philpott, A. ; Straub, T. ; Bonev, B. ; Götz, M.
Direct neuronal reprogramming of mouse astrocytes is associated with multiscale epigenome remodeling and requires Yy1.Bosch, M. ; Kallin, N. ; Donakonda, S. ; Zhang, J.D. ; Wintersteller, H. ; Hegenbarth, S. ; Heim, K. ; Ramirez, C. ; Fürst, A. ; Lattouf, E.I. ; Feuerherd, M. ; Chattopadhyay, S. ; Kumpesa, N. ; Griesser, V. ; Hoflack, J.C. ; Siebourg-Polster, J. ; Mogler, C. ; Swadling, L. ; Pallett, L.J. ; Meiser, P. ; Manske, K. ; de Almeida, G.P. ; Kosinska, A. ; Sandu, I. ; Schneider, A. ; Steinbacher, V. ; Teng, Y. ; Schnabel, J.A. ; Theis, F. ; Gehring, A.J. ; Boonstra, A. ; Janssen, H.L.A. ; Vandenbosch, M. ; Cuypers, E. ; Öllinger, R. ; Engleitner, T. ; Rad, R. ; Steiger, K. ; Oxenius, A. ; Lo, W.L. ; Klepsch, V. ; Baier, G. ; Holzmann, B. ; Maini, M.K. ; Heeren, R. ; Murray, P.J. ; Thimme, R. ; Herrmann, C. ; Protzer, U. ; Böttcher, J.P. ; Zehn, D. ; Wohlleber, D. ; Lauer, G.M. ; Hofmann, M. ; Luangsay, S. ; Knolle, P.A.
A liver immune rheostat regulates CD8 T cell immunity in chronic HBV infection.Rhein, S. ; Costalunga, R. ; Inderhees, J. ; Gürtzgen, T. ; Faupel, T.C. ; Shaheryar, Z. ; Arrulo Pereira, A. ; Othman, A. ; Begemann, K. ; Binder, S. ; Stölting, I. ; Dorta, V. ; Nawroth, P.P. ; Fleming, T. ; Oexle, K. ; Prévot, V. ; Nogueiras, R. ; Meyhöfer, S. ; Meyhöfer, S.M. ; Schwaninger, M.
The reactive pyruvate metabolite dimethylglyoxal mediates neurological consequences of diabetes.Zamanian, A. ; von Kleist, H. ; Ciora, O.A. ; Piperno, M. ; Lancho, G. ; Ahmidi, N.
Analysis of missingness scenarios for observational health data.Hager, P. ; Jungmann, F. ; Holland, R. ; Bhagat, K. ; Hubrecht, I. ; Knauer, M. ; Vielhauer, J. ; Makowski, M. ; Braren, R. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
Evaluation and mitigation of the limitations of large language models in clinical decision-making.Arcas, M.B. ; Osuala, R. ; Lekadir, K. ; Diaz, O.
Mitigating annotation shift in cancer classification using single-image generative models.Badmann, S. ; Castrop, F. ; Brugger, M. ; Winkelmann, J. ; Zech, M.
Adult-onset parkinsonism as late manifestation of HIVEP2-associated developmental disorder.Trastulla, L. ; Dolgalev, G. ; Moser, S. ; Jiménez-Barrón, L.T. ; Andlauer, T.F.M. ; von Scheidt, M. ; Budde, M. ; Heilbronner, U. ; Papiol, S. ; Teumer, A. ; Homuth, G. ; Völzke, H. ; Dörr, M. ; Falkai, P. ; Schulze, T.G. ; Gagneur, J. ; Iorio, F. ; Müller-Myhsok, B. ; Schunkert, H. ; Ziller, M.J.
Distinct genetic liability profiles define clinically relevant patient strata across common diseases.Drost, F. ; An, Y. ; Bonafonte Pardás, I. ; Dratva, L.M. ; Lindeboom, R.G.H. ; Haniffa, M. ; Teichmann, S.A. ; Theis, F.J. ; Lotfollahi, M. ; Schubert, B.
Multi-modal generative modeling for joint analysis of single-cell T cell receptor and gene expression data.Curion, F. ; Wu, X. ; Heumos, L. ; Gonzales André, M.M. ; Halle, L. ; Ozols, M. ; Grant-Peters, M. ; Rich-Griffin, C. ; Yeung, H.Y. ; Dendrou, C.A. ; Schiller, H. B. ; Theis, F.J.
hadge: A comprehensive pipeline for donor deconvolution in single-cell studies.Jaeger, K.M. ; Nissen, M. ; Rahm, S. ; Titzmann, A. ; Fasching, P.A. ; Beilner, J. ; Eskofier, B.M. ; Leutheuser, H.
Power-MF: Robust fetal QRS detection from non-invasive fetal electrocardiogram recordings.Ahmad Madni, H. ; Umer, R.M. ; Luca Foresti, G.
Exploiting data diversity in multi-domain federated learning.Reithmeir, A. ; Schnabel, J.A. ; Zimmer, V.A.
Learning physics-inspired regularization for medical image registration with hypernetworks.Engelmann, J.P. ; Palma, A. ; Tomczak, J.M. ; Theis, F.J. ; Casale, F.P.
Mixed models with multiple instance learning.Schlieper, P. ; Luft, H. ; Klede, K. ; Strohmeyer, C. ; Eskofier, B.M. ; Zanca, D.
Enhancing unsupervised outlier model selection: A study on ireos algorithms.Caulier, B. ; Joaquina, S. ; Gelebart, P. ; Dowling, T.H. ; Kaveh, F. ; Thomas, M. ; Tandaric, L. ; Wernhoff, P. ; Katyayini, N.U. ; Wogsland, C. ; Gjerstad, M.E. ; Fløisand, Y. ; Kvalheim, G. ; Marr, C. ; Kobold, S. ; Enserink, J.M. ; Gjertsen, B.T. ; McCormack, E. ; Inderberg, E.M.S. ; Wälchli, S.
CD37 is a safe chimeric antigen receptor target to treat acute myeloid leukemia.Yu, S. ; Han, S. ; Shi, M. ; Harada, M. ; Ge, J. ; Li, X. ; Cai, X. ; Heier, M. ; Kastenmüller, G. ; Suhre, K. ; Gieger, C. ; Koenig, W. ; Rathmann, W. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R.
Prediction of myocardial infarction using a combined generative adversarial network model and feature-enhanced loss function.Wang, Z. ; Hasenauer, J. ; Schälte, Y.
Missing data in amortized simulation-based neural posterior estimation.Ziller, A. ; Mueller, T.T. ; Stieger, S. ; Feiner, L.F. ; Brandt, J. ; Braren, R. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Reconciling privacy and accuracy in AI for medical imaging.Rahman-Soad, A. ; Bittner, N. ; Hilker, M.
Pine response to sawfly pheromones: Effects on sawfly's oviposition and larval growth.Iyer, D.P. ; Moyon, L. ; Wittler, L. ; Cheng, C.Y. ; Ringeling, F.R. ; Canzar, S. ; Marsico, A. ; Bulut-Karslioğlu, A.
Combinatorial microRNA activity is essential for the transition of pluripotent cells from proliferation into dormancy.van Blokland, I.V. ; Oelen, R. ; Groot, H.E. ; Benjamins, J.W. ; Pekayvaz, K. ; Losert, C. ; Knottenberg, V. ; Heinig, M. ; Nicolai, L. ; Stark, K. ; van der Harst, P. ; Franke, L. ; van der Wijst, M.G.P.
Single-cell dissection of the immune response after acute myocardial infarction.Pascual-Alonso, A. ; Xiol, C. ; Smirnov, D. ; Kopajtich, R. ; Prokisch, H. ; Armstrong, J.
Multi-omics in MECP2 duplication syndrome patients and carriers.Cavestro, C. ; Morra, F. ; Legati, A. ; D'Amato, M. ; Nasca, A. ; Iuso, A. ; Lubarr, N. ; Morrison, J.L. ; Wheeler, P.G. ; Serra-Juhé, C. ; Rodríguez-Santiago, B. ; Turón-Viñas, E. ; Prouteau, C. ; Barth, M. ; Hayflick, S.J. ; Ghezzi, D. ; Tiranti, V. ; Di Meo, I.
Emerging variants, unique phenotypes, and transcriptomic signatures: An integrated study of COASY-associated diseases.Manzoni, E. ; Carli, S. ; Gaignard, P. ; Schlieben, L.D. ; Hirano, M. ; Ronchi, D. ; Gonzales, E. ; Shimura, M. ; Murayama, K. ; Okazaki, Y. ; Barić, I. ; Petkovic Ramadža, D. ; Karall, D. ; Mayr, J. ; Martinelli, D. ; La Morgia, C. ; Primiano, G. ; Santer, R. ; Servidei, S. ; Bris, C. ; Cano, A. ; Furlan, F. ; Gasperini, S. ; Laborde, N. ; Lamperti, C. ; Lenz, D. ; Mancuso, M. ; Montano, V. ; Menni, F. ; Musumeci, O. ; Nesbitt, V. ; Procopio, E. ; Rouzier, C. ; Staufner, C. ; Taanman, J.W. ; Tal, G. ; Ticci, C. ; Cordelli, D.M. ; Carelli, V. ; Procaccio, V. ; Prokisch, H. ; Garone, C.
Deoxyguanosine kinase deficiency: Natural history and liver transplant outcome.Burek, K. ; Rabstein, S. ; Kantermann, T. ; Vetter, C. ; Wang-Sattler, R. ; Lehnert, M. ; Pallapies, D. ; Jöckel, K.H. ; Brüning, T. ; Behrens, T.
Altered coordination between sleep timing and cortisol profiles in night working female hospital employees.Usynin, D. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Incentivising the federation: Gradient-based metrics for data selection and valuation in private decentralised training.Neuhofer, C. ; Prokisch, H.
Digenic inheritance in rare disorders and mitochondrial disease-crossing the frontier to a more comprehensive understanding of etiology.Parvizi, T. ; Klotz, S. ; Keritam, O. ; Caliskan, H. ; Imhof, S. ; König, T. ; Haider, L. ; Traub-Weidinger, T. ; Wagner, M. ; Brunet, T. ; Brugger, M. ; Zimprich, A. ; Rath, J. ; Stogmann, E. ; Gelpi, E. ; Cetin, H.
Clinical heterogeneity within the ALS-FTD spectrum in a family with a homozygous optineurin mutation.Bock, C. ; Walter, J.E. ; Rieck, B. ; Strebel, I. ; Rumora, K. ; Schaefer, I.K. ; Zellweger, M.J. ; Borgwardt, K. ; Müller, C.
Enhancing the diagnosis of functionally relevant coronary artery disease with machine learning.Jansen, R. ; Milaneschi, Y. ; Schranner, D. ; Kastenmüller, G. ; Arnold, M. ; Han, X. ; Dunlop, B.W. ; Rush, A.J. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Penninx, B.W.J.H.
The metabolome-wide signature of major depressive disorder.Curion, F. ; Theis, F.J.
Machine learning integrative approaches to advance computational immunology.Weiler, P. ; Lange, M. ; Klein, M. ; Pe'er, D. ; Theis, F.J.
CellRank 2: Unified fate mapping in multiview single-cell data.Thowfeequ, S. ; Fiorentino, J. ; Hu, D. ; Solovey, M. ; Ruane, S. ; Whitehead, M. ; Zhou, F. ; Godwin, J. ; Mateo-Otero, Y. ; Vanhaesebroeck, B. ; Scialdone, A. ; Srinivas, S.
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration.Harada, M. ; Adam, J. ; Covic, M. ; Ge, J. ; Brandmaier, S. ; Muschet, C. ; Huang, J. ; Han, S. ; Rommel, M. ; Rotter, M. ; Heier, M. ; Mohney, R.P. ; Krumsiek, J. ; Kastenmüller, G. ; Rathmann, W. ; Zou, Z. ; Zukunft, S. ; Scheerer, M.F. ; Neschen, S. ; Adamski, J. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Ankerst, D.P. ; Meitinger, T. ; Alderete, T.L. ; Hrabě de Angelis, M. ; Suhre, K. ; Wang-Sattler, R.
Bidirectional modulation of TCA cycle metabolites and anaplerosis by metformin and its combination with SGLT2i.Schormair, B. ; Zhao, C. ; Bell, S. ; Didriksen, M. ; Nawaz, M.S. ; Schandra, N. ; Stefani, A. ; Högl, B. ; Dauvilliers, Y. ; Bachmann, C.G. ; Kemlink, D. ; Sonka, K. ; Paulus, W. ; Trenkwalder, C. ; Oertel, W.H. ; Hornyak, M. ; Teder-Laving, M. ; Metspalu, A. ; Hadjigeorgiou, G.M. ; Polo, O. ; Fietze, I. ; Ross, O.A. ; Wszolek, Z.K. ; Ibrahim, A. ; Bergmann, M. ; Kittke, V. ; Harrer, P. ; Dowsett, J. ; Chenini, S. ; Ostrowski, S.R. ; Sørensen, E. ; Erikstrup, C. ; Pedersen, O.B. ; Topholm Bruun, M. ; Nielsen, K.R. ; Butterworth, A.S. ; Soranzo, N. ; Ouwehand, W.H. ; Roberts, D.J. ; Danesh, J. ; Burchell, B. ; Furlotte, N.A. ; Nandakumar, P. ; Earley, C.J. ; Ondo, W.G. ; Xiong, L. ; Desautels, A. ; Perola, M. ; Vodicka, P. ; Dina, C. ; Stoll, M. ; Franke, A. ; Lieb, W. ; Stewart, A.F.R. ; Shah, S.H. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Rye, D.B. ; Rouleau, G.A. ; Berger, K. ; Stefansson, H. ; Ullum, H. ; Stefansson, K. ; Hinds, D.A. ; di Angelantonio, E. ; Oexle, K. ; Winkelmann, J.
Genome-wide meta-analyses of restless legs syndrome yield insights into genetic architecture, disease biology and risk prediction.Hüper, L. ; Steinacker, P. ; Polyakova, M. ; Mueller, K. ; Godulla, J. ; Herzig, S. ; Danek, A. ; Engel, A. ; Diehl-Schmid, J. ; Classen, J. ; Fassbender, K. ; Fliessbach, K. ; Jahn, H. ; Kassubek, J. ; Kornhuber, J. ; Landwehrmeyer, B. ; Lauer, M. ; Obrig, H. ; Oeckl, P. ; Prudlo, J. ; Saur, D. ; Anderl-Straub, S. ; Synofzik, M. ; Wagner, M. ; Wiltfang, J. ; Winkelmann, J. ; Volk, A.E. ; Huppertz, H.J. ; Otto, M. ; Schroeter, M.L.
Neurofilaments and progranulin are related to atrophy in frontotemporal lobar degeneration - A transdiagnostic study cross-validating atrophy and fluid biomarkers.Ahmed, M.I.M. ; Einhauser, S. ; Peiter, C. ; Senninger, A. ; Baranov, O. ; Eser, T.M. ; Huth, M. ; Olbrich, L. ; Castelletti, N. ; Rubio-Acero, R. ; Carnell, G. ; Heeney, J. ; Kroidl, I. ; Held, K. ; Wieser, A. ; Janke, C. ; Hoelscher, M. ; Hasenauer, J. ; Wagner, R. ; Geldmacher, C.
Evolution of protective SARS-CoV-2-specific B and T cell responses upon vaccination and Omicron breakthrough infection.Cao, X. ; Huber, S. ; Ahari, A.J. ; Traube, F.R. ; Seifert, M. ; Oakes, C.C. ; Secheyko, P. ; Vilov, S. ; Scheller, I.F. ; Wagner, N. ; Yépez, V.A. ; Blombery, P. ; Haferlach, T. ; Heinig, M. ; Wachutka, L. ; Hutter, S. ; Gagneur, J.
Analysis of 3760 hematologic malignancies reveals rare transcriptomic aberrations of driver genes.Pekayvaz, K. ; Losert, C. ; Knottenberg, V. ; Gold, C. ; van Blokland, I.V. ; Oelen, R. ; Groot, H.E. ; Benjamins, J.W. ; Brambs, S. ; Kaiser, R. ; Gottschlich, A. ; Hoffmann, G.V. ; Eivers, L. ; Martinez-Navarro, A. ; Bruns, N. ; Stiller, S. ; Akgöl, S. ; Yue, K. ; Polewka, V. ; Escaig, R. ; Joppich, M. ; Janjic, A. ; Popp, O. ; Kobold, S. ; Petzold, T. ; Zimmer, R. ; Enard, W. ; Saar, K. ; Mertins, P. ; Huebner, N. ; van der Harst, P. ; Franke, L.H. ; van der Wijst, M.G.P. ; Massberg, S. ; Heinig, M. ; Nicolai, L. ; Stark, K.
Multiomic analyses uncover immunological signatures in acute and chronic coronary syndromes.Seep, L. ; Grein, S. ; Splichalova, I. ; Ran, D. ; Mikhael, M. ; Hildebrand, S. ; Lauterbach, M. ; Hiller, K. ; Ribeiro, D.J.S. ; Sieckmann, K. ; Kardinal, R. ; Huang, H. ; Yu, J. ; Kallabis, S. ; Behrens, J. ; Till, A. ; Peeva, V. ; Strohmeyer, A. ; Bruder, J. ; Blum, T. ; Soriano-Arroquia, A. ; Tischer, D. ; Kuellmer, K. ; Li, Y. ; Beyer, M. ; Gellner, A.K. ; Fromme, T. ; Wackerhage, H. ; Klingenspor, M. ; Fenske, W.K. ; Scheja, L. ; Meissner, F. ; Schlitzer, A. ; Mass, E. ; Wachten, D. ; Latz, E. ; Pfeifer, A. ; Hasenauer, J.
From planning stage towards FAIR data: A practical metadatasheet for biomedical scientists.Stadler, M. ; Lukauskas, S. ; Bartke, T. ; Müller, C.L.
asteRIa enables robust interaction modeling between chromatin modifications and epigenetic readers.Zhao, C.
GWAS Gateway - Transitioning Variants from Association to Causality in Complex Diseases [Commentary on Perturbation of the insomnia WDR90 GWAS locus pinpoints rs3752495 as a causal variant influencing distal expression of neighboring gene, PIG-Q].Merkt, S. ; Ali, S. ; Gudina, E.K. ; Adissu, W. ; Gize, A. ; Muenchhoff, M. ; Graf, A. ; Krebs, S. ; Elsbernd, K. ; Kisch, R. ; Betizazu, S.S. ; Fantahun, B. ; Bekele, D. ; Rubio-Acero, R. ; Gashaw, M. ; Girma, E. ; Yilma, D. ; Zeynudin, A. ; Paunovic, I. ; Hoelscher, M. ; Blum, H. ; Hasenauer, J. ; Kroidl, A. ; Wieser, A.
Long-term monitoring of SARS-CoV-2 seroprevalence and variants in Ethiopia provides prediction for immunity and cross-immunity.Lotfollahi, M. ; Hao, Y. ; Theis, F.J. ; Satija, R.
The future of rapid and automated single-cell data analysis using reference mapping.Sung, A.Y. ; Guerra, R.M. ; Steenberge, L.H. ; Alston, C.L. ; Murayama, K. ; Okazaki, Y. ; Shimura, M. ; Prokisch, H. ; Ghezzi, D. ; Torraco, A. ; Carrozzo, R. ; Rötig, A. ; Taylor, R.W. ; Keck, J.L. ; Pagliarini, D.J.
Systematic analysis of NDUFAF6 in complex I assembly and mitochondrial disease.Keaton, J.M. ; Kamali, Z. ; Xie, T. ; Vaez, A. ; Williams, A. ; Goleva, S.B. ; Ani, A. ; Evangelou, E. ; Hellwege, J.N. ; Yengo, L. ; Young, W.J. ; Traylor, M. ; Giri, A. ; Zheng, Z. ; Zeng, J. ; Chasman, D.I. ; Morris, A.P. ; Caulfield, M.J. ; Hwang, S.J. ; Kooner, J.S. ; Conen, D. ; Attia, J.R. ; Morrison, A.C. ; Loos, R.J.F. ; Kristiansson, K. ; Schmidt, R. ; Hicks, A.A. ; Pramstaller, P.P. ; Nelson, C.P. ; Samani, N.J. ; Risch, L. ; Gyllensten, U. ; Melander, O. ; Riese, H. ; Wilson, J.F. ; Campbell, H. ; Rich, S.S. ; Psaty, B.M. ; Lu, Y. ; Rotter, J.I. ; Guo, X. ; Rice, K.M. ; Vollenweider, P. ; Sundström, J. ; Langenberg, C. ; Tobin, M.D. ; Giedraitis, V. ; Luan, J. ; Tuomilehto, J. ; Kutalik, Z. ; Ripatti, S. ; Salomaa, V. ; Girotto, G. ; Trompet, S. ; Jukema, J.W. ; van der Harst, P. ; Ridker, P.M. ; Giulianini, F. ; Vitart, V. ; Goel, A. ; Watkins, H. ; Harris, S.E. ; Deary, I.J. ; van der Most, P.J. ; Oldehinkel, A.J. ; Keavney, B.D. ; Hayward, C. ; Campbell, A. ; Boehnke, M. ; Scott, L.J. ; Boutin, T. ; Mamasoula, C. ; Järvelin, M.R. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Lakatta, E.G. ; Cucca, F. ; Hui, J. ; Knekt, P. ; Enroth, S. ; de Borst, M.H. ; Polašek, O. ; Concas, M.P. ; Catamo, E. ; Cocca, M. ; Li-Gao, R. ; Hofer, E. ; Schmidt, H. ; Spedicati, B. ; Waldenberger, M. ; Strachan, D.P. ; Laan, M. ; Teumer, A. ; Dörr, M. ; Gudnason, V. ; Cook, J.P. ; Ruggiero, D. ; Kolcic, I. ; Boerwinkle, E. ; Traglia, M. ; Lehtimäki, T. ; Raitakari, O.T. ; Johnson, A.D. ; Newton-Cheh, C. ; Brown, M.J. ; Dominiczak, A.F. ; Sever, P.J. ; Poulter, N. ; Chambers, J.C. ; Elosua, R. ; Siscovick, D. ; Esko, T. ; Metspalu, A. ; Strawbridge, R.J. ; Laakso, M. ; Hamsten, A. ; Hottenga, J.J. ; de Geus, E. ; Morris, A.D. ; Palmer, C.N.A. ; Nolte, I.M. ; Milaneschi, Y. ; Marten, J. ; Wright, A. ; Zeggini, E. ; Howson, J.M.M. ; O'Donnell, C.J. ; Spector, T. ; Nalls, M.A. ; Simonsick, E.M. ; Liu, Y. ; van Duijn, C.M. ; Butterworth, A.S. ; Danesh, J.N. ; Menni, C. ; Wareham, N.J. ; Khaw, K.T. ; Sun, Y.V. ; Wilson, P.W.F. ; Cho, K. ; Visscher, P.M. ; Denny, J.C. ; Levy, D. ; Edwards, T.L. ; Munroe, P.B. ; Snieder, H. ; Warren, H.R.
Genome-wide analysis in over 1 million individuals of European ancestry yields improved polygenic risk scores for blood pressure traits.Koch, V.
Can artificial intelligence help Heart Teams make decisions?Levenson, R.M. ; Singh, Y. ; Rieck, B. ; Hathaway, Q.A. ; Farrelly, C. ; Rozenblit, J. ; Prasanna, P. ; Erickson, B. ; Choudhary, A. ; Carlsson, G. ; Deepa, D.
Advancing precision medicine: Algebraic topology and differential geometry in radiology and computational pathology.Stock, M. ; Popp, N. ; Fiorentino, J. ; Scialdone, A.
Topological benchmarking of algorithms to infer Gene Regulatory Networks from Single-Cell RNA-seq Data.Papakyriacou, I. ; Kutkaite, G. ; Rúbies Bedós, M. ; Nagarajan, D. ; Alford, L.P. ; Menden, M.P. ; Mao, Y.
Loss of NEDD8 in cancer cells causes vulnerability to immune checkpoint blockade in triple-negative breast cancer.Lorenzo, J.P. ; Molla, L. ; Amro, E.M. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Ruf, S. ; Neber, C. ; Gkougkousis, C. ; Ridani, J. ; Subramani, P.G. ; Boulais, J. ; Harjanto, D. ; Vonica, A. ; di Noia, J.M. ; Dieterich, C. ; Zaugg, J.B. ; Papavasiliou, F.N.
APOBEC2 safeguards skeletal muscle cell fate through binding chromatin and regulating transcription of non-muscle genes during myoblast differentiation.Indelicato, E. ; Schlieben, L.D. ; Stenton, S.L. ; Boesch, S. ; Škorvánek, M. ; Necpál, J. ; Jech, R. ; Winkelmann, J. ; Prokisch, H. ; Zech, M.
Dystonia and mitochondrial disease: The movement disorder connection revisited in 900 genetically diagnosed patients.Shrine, N. ; Guyatt, A.L. ; Erzurumluoglu, A.M. ; Jackson, V.E. ; Hobbs, B.D. ; Melbourne, C.A. ; Batini, C. ; Fawcett, K.A. ; Song, K. ; Sakornsakolpat, P. ; Li, X. ; Boxall, R. ; Reeve, N.F. ; Obeidat, M. ; Zhao, J.H. ; Wielscher, M. ; Weiss, S. ; Kentistou, K.A. ; Cook, J.P. ; Sun, B.B. ; Zhou, J. ; Hui, J. ; Karrasch, S. ; Imboden, M. ; Harris, S.E. ; Marten, J. ; Enroth, S. ; Kerr, S.M. ; Surakka, I. ; Vitart, V. ; Lehtimäki, T. ; Allen, R.J. ; Bakke, P.S. ; Beaty, T.H. ; Bleecker, E.R. ; Bossé, Y. ; Brandsma, C.A. ; Chen, Z. ; Crapo, J.D. ; Danesh, J. ; DeMeo, D.L. ; Dudbridge, F. ; Ewert, R. ; Gieger, C. ; Gulsvik, A. ; Hansell, A.L. ; Hao, K. ; Hoffman, J.D. ; Hokanson, J.E. ; Homuth, G. ; Joshi, P.K. ; Joubert, P. ; Langenberg, C. ; Li, L. ; Lin, K. ; Lind, L. ; Locantore, N. ; Luan, J. ; Mahajan, A. ; Maranville, J.C. ; Murray, A. ; Nickle, D.C. ; Packer, R. ; Parker, M.M. ; Paynton, M.L. ; Porteous, D.J. ; Prokopenko, D. ; Qiao, D. ; Rawal, R. ; Runz, H. ; Sayers, I. ; Sin, D.D. ; Smith, B.H. ; Artigas, M.S. ; Sparrow, D. ; Tal-Singer, R. ; Timmers, P.R.H.J. ; van den Berge, M. ; Whittaker, J.C. ; Woodruff, P.G. ; Yerges-Armstrong, L.M. ; Troyanskaya, O.G. ; Raitakari, O.T. ; Kähönen, M. ; Polašek, O. ; Gyllensten, U. ; Rudan, I. ; Deary, I.J. ; Probst-Hensch, N.M. ; Schulz, H. ; James, A.L. ; Wilson, J.F. ; Stubbe, B. ; Zeggini, E. ; Jarvelin, M.R. ; Wareham, N. ; Silverman, E.K. ; Hayward, C. ; Morris, A.P. ; Butterworth, A.S. ; Scott, R.A. ; Walters, R.G. ; Meyers, D.A. ; Cho, M.H. ; Strachan, D.P. ; Hall, I.P. ; Tobin, M.D. ; Wain, L.V.
Author Correction: New genetic signals for lung function highlight pathways and chronic obstructive pulmonary disease associations across multiple ancestries.Lukauskas, S. ; Tvardovskiy, A. ; Nguyen, N.V. ; Stadler, M. ; Faull, P. ; Ravnsborg, T. ; Özdemir Aygenli, B. ; Dornauer, S. ; Flynn, H. ; Lindeboom, R.G.H. ; Barth, T.K. ; Brockers, K. ; Hauck, S.M. ; Vermeulen, M. ; Snijders, A.P. ; Müller, C.L. ; DiMaggio, P.A. ; Jensen, O.N. ; Schneider, R. ; Bartke, T.
Publisher Correction: Decoding chromatin states by proteomic profiling of nucleosome readers.Asif, M. ; Khayyat, A.I.A. ; Alawbathani, S. ; Abdullah, U. ; Sanner, A. ; Georgomanolis, T. ; Haasters, J. ; Becker, K. ; Budde, B. ; Becker, C. ; Thiele, H. ; Baig, S.M. ; Isidoro-García, M. ; Winter, D. ; Pogoda, H.M. ; Muhammad, S. ; Hammerschmidt, M. ; Kraft, F. ; Kurth, I. ; Martin, H.G. ; Wagner, M. ; Nürnberg, P. ; Hussain, M.S.
Biallelic loss-of-function variants of ZFTRAF1 cause neurodevelopmental disorder with microcephaly and hypotonia.Westerkamp, M. ; Eberle, V. ; Guardiani, M. ; Frank, P. ; Platz, L.I. ; Arras, P. ; Knollmüller, J. ; Stadler, J. ; Enblin, T.
The first spatio-spectral Bayesian imaging of SN1006 in X-rays.Sorrentino, U. ; Romito, L.M. ; Garavaglia, B. ; Fichera, M. ; Colangelo, I. ; Prokisch, H. ; Winkelmann, J. ; Necpál, J. ; Jech, R. ; Zech, M.
Myoclonus and dystonia as recurrent presenting features in patients with the SCA21-associated TMEM240 p.Pro170Leu variant.Richer, R. ; Koch, V. ; Abel, L. ; Hauck, F. ; Kurz, M. ; Ringgold, V. ; Müller, V. ; Küderle, A. ; Schindler-Gmelch, L. ; Eskofier, B.M. ; Rohleder, N.
Machine learning-based detection of acute psychosocial stress from body posture and movements.Gindra, R. ; Zheng, Y. ; Green, E.J. ; Reid, M.E. ; Mazzilli, S.A. ; Merrick, D.T. ; Burks, E.J. ; Kolachalama, V.B. ; Beane, J.E.
Graph perceiver network for lung tumor and bronchial premalignant lesion stratification from histopathology.Yin, K. ; Büttner, M. ; Deligiannis, I.K. ; Strzelecki, M. ; Zhang, L. ; Talavera Lopez, C.N. ; Theis, F.J. ; Odom, D.T. ; Martinez Jimenez, C.P.
Polyploidisation pleiotropically buffers ageing in hepatocytes.Wedman, J.J. ; Sibon, O.C.M. ; Mastantuono, E. ; Iuso, A.
Impaired coenzyme A homeostasis in cardiac dysfunction and benefits of boosting coenzyme A production with vitamin B5 and its derivatives in the management of heart failure.Gramer, G. ; Wortmann, S.B. ; Fang-Hoffmann, J. ; Kohlmüller, D. ; Okun, J.G. ; Prokisch, H. ; Meitinger, T. ; Hoffmann, G.F.
New cases of maleylacetoacetate isomerase deficiency with detection by newborn screening and natural history over 32 years: Experience from a German newborn screening center.Liang, R. ; Zhu, W. ; Gao, Y. ; Zhao, C. ; Zhang, C. ; Xu, L. ; Zuo, Y. ; Lv, Y. ; Zhao, M. ; Li, C. ; Gao, J. ; Mei, J. ; Gong, X. ; Zhang, L. ; Shen, S. ; Yang, C. ; Ren, J. ; Liu, Y. ; Wang, Z. ; Wang, P. ; Zhou, J. ; Wang, F. ; Wu, J. ; Chen, J. ; Zhu, Y. ; Dong, X. ; Han, F.
Clinical features, polysomnography, and genetics association study of restless legs syndrome in clinic based Chinese patients: A multicenter observational study.Dvoretskova, E. ; Ho, M.C. ; Kittke, V. ; Neuhaus, F. ; Vitali, I. ; Lam, D.D. ; Delgado, I. ; Feng, C. ; Torres, M. ; Winkelmann, J. ; Mayer, C.
Spatial enhancer activation influences inhibitory neuron identity during mouse embryonic development.Indelicato, E. ; Boesch, S. ; Zech, M.
Heterogeneous phenotypic evolution in ANO3-related dystonia due to the recurrent p.Glu510Lys variant.Nitschké, M.J.E. ; Dorschky, E. ; Leyendecker, S. ; Eskofier, B.M. ; Koelewijn, A.D.
Estimating 3D kinematics and kinetics from virtual inertial sensor data through musculoskeletal movement simulations.Albert, T. ; Eskofier, B.M. ; Zanca, D.
From patches to objects: Exploiting spatial reasoning for better visual representations.Saßmannshausen, M. ; Döngelci, S. ; Vaisband, M. ; von der Emde, L. ; Sloan, K.R. ; Hasenauer, J. ; Holz, F.G. ; Schmitz-Valckenberg, S. ; Ach, T.
Spatially resolved association of structural biomarkers on retinal function in non-exudative age-related macular degeneration over 4 years.von der Emde, L. ; Rennen, G.C. ; Vaisband, M. ; Hasenauer, J. ; Liegl, R. ; Fleckenstein, M. ; Pfau, M. ; Holz, F.G. ; Ach, T.
Impact of lens autofluorescence and opacification on retinal imaging.Koletzko, B. ; Demmelmair, H. ; Grote, V. ; Horak, J. ; Kastenmüller, G. ; Newton-Tanzer, E. ; Luque, V. ; Totzauer, M.
Infant Feeding and Later Health: Exploring Mechanisms to Improve Preventive Approaches.Highton, J. ; Chong, Q.Z. ; Crawley, R. ; Schnabel, J.A. ; Bhatia, K.K.
Evaluation of randomized input sampling for explanation (RISE) for 3D XAI - proof of concept for black-box brain-hemorrhage classification.Mueller, T.T. ; Starck, S. ; Feiner, L.F. ; Bintsi, K.M. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Extended graph assessment metrics for regression and weighted graphs.Gsänger, M. ; Hösel, V. ; Mohamad-Klotzbach, C. ; Müller, J.
Opinion models, election data, and political theory.Uluc, N. ; Glasl, S. ; Gasparin, F. ; Yuan, T. ; He, H. ; Jüstel, D. ; Pleitez, M.A. ; Ntziachristos, V.
Non-invasive measurements of blood glucose levels by time-gating mid-infrared optoacoustic signals.Jacob, M. ; Brugger, M. ; Andres, S. ; Wagner, M. ; Graf, E. ; Berutti, R. ; Tilch, E. ; Pavlov, M. ; Mayerhanser, K. ; Hoefele, J. ; Meitinger, T. ; Winkelmann, J. ; Brunet, T.
Genome sequencing for cases unsolved by exome sequencing: Identifying a single-exon deletion in TBCK in a case from 30 years ago.Koupourtidou, C. ; Schwarz, V. ; Aliee, H. ; Frerich, S. ; Fischer-Sternjak, J. ; Bocchi, R. ; Simon-Ebert, T. ; Bai, X. ; Sirko, S. ; Kirchhoff, F. ; Dichgans, M. ; Götz, M. ; Theis, F.J. ; Ninkovic, J.
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex.Critical Assessment of Genome Interpretation Consortium (Müller, N.S.) ; Critical Assessment of Genome Interpretation Consortium (Eraslan, G.)
CAGI, the Critical Assessment of Genome Interpretation, establishes progress and prospects for computational genetic variant interpretation methods.Karollus, A. ; Hingerl, J. ; Gankin, D. ; Grosshauser, M. ; Klemon, K. ; Gagneur, J.
Species-aware DNA language models capture regulatory elements and their evolution.Pandey, R.S. ; Arnold, M. ; Batra, R. ; Krumsiek, J. ; Kotredes, K.P. ; Garceau, D. ; Williams, H. ; Sasner, M. ; Howell, G.R. ; Kaddurah-Daouk, R. ; Carter, G.W.
Metabolomics profiling reveals distinct, sex-specific signatures in serum and brain metabolomes in mouse models of Alzheimer's disease.Zimmer, V.A. ; Hammernik, K. ; Sideri-Lampretsa, V. ; Huang, W. ; Reithmeir, A. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A.
Towards generalised neural implicit representations for image registration.Machado, I. ; Puyol-Antón, E. ; Hammernik, K. ; Cruz, G. ; Ugurlu, D. ; Olakorede, I. ; Öksüz, I. ; Ruijsink, B. ; Castelo-Branco, M. ; Young, A. ; Prieto, C. ; Schnabel, J.A. ; King, A.
A deep learning-based integrated framework for quality-aware undersampled cine cardiac MRI reconstruction and analysis.Bak, M. ; Madai, V.I. ; Celi, L.A. ; Kaissis, G. ; Cornet, R. ; Maris, M. ; Rueckert, D. ; Buyx, A. ; McLennan, S.
Federated learning is not a cure-all for data ethics.Klingelhuber, F. ; Frendo-Cumbo, S. ; Omar-Hmeadi, M. ; Massier, L. ; Kakimoto, P. ; Taylor, A.J. ; Couchet, M. ; Ribicic, S. ; Wabitsch, M. ; Messias, A.C. ; Iuso, A. ; Müller, T.D. ; Rydén, M. ; Mejhert, N. ; Krahmer, N.
A spatiotemporal proteomic map of human adipogenesis.Zeggini, E. ; Morris, A.P.
Genetic risk variants lead to type 2 diabetes development through different pathways.Souza Oliveira, D. ; Ponfick, M. ; Braun, D.I. ; Osswald, M. ; Sierotowicz, M. ; Chatterjee, S. ; Weber, D. ; Eskofier, B.M. ; Castellini, C. ; Farina, D. ; Kinfe, T.M. ; Del Vecchio, A.
A direct spinal cord-computer interface enables the control of the paralysed hand in spinal cord injury.Marconato, L. ; Palla, G. ; Yamauchi, K.A. ; Virshup, I. ; Heidari, E. ; Treis, T. ; Vierdag, W.M. ; Toth, M. ; Stockhaus, S. ; Shrestha, R.B. ; Rombaut, B. ; Pollaris, L. ; Lehner, L. ; Vöhringer, H. ; Kats, I. ; Saeys, Y. ; Saka, S.K. ; Huber, W. ; Gerstung, M. ; Moore, J. ; Theis, F.J. ; Stegle, O.
SpatialData: An open and universal data framework for spatial omics.Indelicato, E. ; Romito, L.M. ; Harrer, P. ; Golfrè Andreasi, N. ; Colangelo, I. ; Kopajtich, R. ; Winkelmann, J. ; Prokisch, H. ; Garavaglia, B. ; Zech, M.
Genome aggregation database version 4-new challenges of variant analysis in movement disorders.Telpoukhovskaia, M.A. ; Murdy, T.J. ; Marola, O.J. ; Charland, K. ; MacLean, M. ; Luquez, T. ; Lish, A.M. ; Neuner, S. ; Dunn, A. ; Onos, K.D. ; Wiley, J. ; Archer, D. ; Huentelman, M.J. ; Arnold, M. ; Menon, V. ; Goate, A. ; Van Eldik, L.J. ; Territo, P.R. ; Howell, G.R. ; Carter, G.W. ; O'Connell, K.M.S. ; Kaczorowski, C.C.
New directions for Alzheimer's disease research from the Jackson Laboratory Center for Alzheimer's and Dementia Research 2022 workshop.von der Emde, L. ; Rennen, G.C. ; Vaisband, M. ; Hasenauer, J. ; Liegl, R. ; Fleckenstein, M. ; Pfau, M. ; Holz, F.G. ; Ach, T.
Personalized lens correction improves quantitative fundus autofluorescence analysis.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
On solvability of some systems of Fredholm integro-differential equations with mixed diffusion in a square.Stein, J. ; di Folco, M. ; Schnabel, J.A.
Sparse annotation strategies for segmentation of short axis cardiac MRI.Ebstein, F. ; Latypova, X. ; Hung, K.Y.S. ; Prado, M.A. ; Lee, B.H. ; Möller, S. ; Wendlandt, M. ; Zieba, B.A. ; Florenceau, L. ; Vignard, V. ; Poirier, L. ; Toutain, B. ; Moroni, I. ; Dubucs, C. ; Chassaing, N. ; Horvath, J. ; Prokisch, H. ; Küry, S. ; Bézieau, S. ; Paulo, J.A. ; Finley, D. ; Krüger, E. ; Ghezzi, D. ; Isidor, B.
Biallelic USP14 variants cause a syndromic neurodevelopmental disorder.Tomaz da Silva, P. ; Zhang, Y. ; Theodorakis, E. ; Martens, L.D. ; Yépez, V.A. ; Pelechano, V. ; Gagneur, J.
Cellular energy regulates mRNA degradation in a codon-specific manner.Hagenberg, J. ; Budde, M. ; Pandeva, T. ; Kondofersky, I. ; Schaupp, S.K. ; Theis, F.J. ; Schulze, T.G. ; Müller, N.S. ; Heilbronner, U. ; Batra, R. ; Knauer-Arloth, J.
longmixr: A tool for robust clustering of high-dimensional cross-sectional and longitudinal variables of mixed data types.Zahedi, R.P. ; Ghamsari, R. ; Argha, A. ; Macphillamy, C. ; Beheshti, A. ; Alizadehsani, R. ; Lovell, N.H. ; Lotfollahi, M. ; Alinejad-Rokny, H.
Deep learning in spatially resolved transcriptfomics: A comprehensive technical view.Martinelli, F. ; Heinken, A. ; Henning, A.K. ; Ulmer, M.A. ; Hensen, T. ; González, A. ; Arnold, M. ; Asthana, S. ; Budde, K. ; Engelman, C.D. ; Estaki, M. ; Grabe, H.J. ; Heston, M.B. ; Johnson, S. ; Kastenmüller, G. ; Martino, C. ; McDonald, D. ; Rey, F.E. ; Kilimann, I. ; Peters, O. ; Wang, X. ; Spruth, E.J. ; Schneider, A. ; Fliessbach, K. ; Wiltfang, J. ; Hansen, N. ; Glanz, W. ; Buerger, K. ; Janowitz, D. ; Laske, C. ; Munk, M.H. ; Spottke, A. ; Roy, N. ; Nauck, M. ; Teipel, S. ; Knight, R. ; Kaddurah-Daouk, R.F. ; Bendlin, B.B. ; Hertel, J. ; Thiele, I.
Whole-body metabolic modelling reveals microbiome and genomic interactions on reduced urine formate levels in Alzheimer's disease.Tayebi Arasteh, S. ; Ziller, A. ; Kühl, C. ; Makowski, M. ; Nebelung, S. ; Braren, R. ; Rueckert, D. ; Truhn, D. ; Kaissis, G.
Preserving fairness and diagnostic accuracy in private large-scale AI models for medical imaging.Blickhaeuser, B. ; Stenton, S.L. ; Neuhofer, C. ; Floride, E. ; Nesbitt, V. ; Fratter, C. ; Koch, J. ; Kauffmann, B. ; Catarino, C. ; Schlieben, L.D. ; Kopajtich, R. ; Carelli, V. ; Sadun, A.A. ; McFarland, R. ; Fang, F. ; La Morgia, C. ; Paquay, S. ; Nassogne, M.C. ; Ghezzi, D. ; Lamperti, C. ; Wortmann, S. ; Poulton, J. ; Klopstock, T. ; Prokisch, H.
Digenic Leigh syndrome on the background of the m.11778G>A Leber hereditary optic neuropathy variant.Bittner, N. ; Shi, C. ; Zhao, D. ; Ding, J. ; Southam, L. ; Swift, D. ; Kreitmaier, P. ; Tutino, M. ; Stergiou, O. ; Cheung, J.T.S. ; Katsoula, G. ; Hankinson, J. ; Wilkinson, J.M. ; Orozco, G. ; Zeggini, E.
Primary osteoarthritis chondrocyte map of chromatin conformation reveals novel candidate effector genes.Krontira, A.C. ; Cruceanu, C. ; Dony, L. ; Kyrousi, C. ; Link, M.H. ; Rek, N. ; Pöhlchen, D. ; Raimundo, C. ; Penner-Goeke, S. ; Schowe, A. ; Czamara, D. ; Lahti-Pulkkinen, M. ; Sammallahti, S. ; Wolford, E. ; Heinonen, K. ; Roeh, S. ; Sportelli, V. ; Wölfel, B. ; Ködel, M. ; Sauer, S. ; Rex-Haffner, M. ; Räikkönen, K. ; Labeur, M. ; Cappello, S. ; Binder, E.B.
Human cortical neurogenesis is altered via glucocorticoid-mediated regulation of ZBTB16 expression.Lukauskas, S. ; Tvardovskiy, A. ; Nguyen, N.V. ; Stadler, M. ; Faull, P. ; Ravnsborg, T. ; Özdemir Aygenli, B. ; Dornauer, S. ; Flynn, H. ; Lindeboom, R.G.H. ; Barth, T.K. ; Brockers, K. ; Hauck, S.M. ; Vermeulen, M. ; Snijders, A.P. ; Müller, C.L. ; DiMaggio, P.A. ; Jensen, O.N. ; Schneider, R. ; Bartke, T.
Decoding chromatin states by proteomic profiling of nucleosome readers.Kirchberg, I. ; Lainka, E. ; Gangfuß, A. ; Kuechler, A. ; Baertling, F. ; Schlieben, L.D. ; Lenz, D. ; Tschiedel, E.
Distinct neonatal hyperammonemia and liver synthesis dysfunction: Case report of a severe MEGDHEL syndrome.Sorrentino, U. ; Boesch, S. ; Doummar, D. ; Ravelli, C. ; Serranová, T. ; Indelicato, E. ; Winkelmann, J. ; Burglen, L. ; Jech, R. ; Zech, M.
CHD8-related disorders redefined: An expanding spectrum of dystonic phenotypes.Shetab Boushehri, S. ; Kornivetc, A. ; Winter, D. ; Kazeminia, S. ; Essig, K. ; Schmich, F. ; Marr, C.
PXPermute reveals staining importance in multichannel imaging flow cytometry.Kocher, K. ; Moosmann, C. ; Drost, F. ; Schülein, C. ; Irrgang, P. ; Steininger, P. ; Zhong, J. ; Träger, J. ; Spriewald, B. ; Bock, C. ; Busch, D.H. ; Bogdan, C. ; Schubert, B. ; Winkler, T.H. ; Tenbusch, M. ; Schuster, E.M. ; Schober, K.
Adaptive immune responses are larger and functionally preserved in a hypervaccinated individual.Esser, E. ; Schulte, E.C. ; Graf, A. ; Karollus, A. ; Smith, N.H. ; Michler, T. ; Dvoretskii, S. ; Angelov, A. ; Sonnabend, M. ; Peter, S.A. ; Engesser, C. ; Radonić, A. ; Thürmer, A. ; von Kleist, M. ; Gebhardt, F. ; da Costa, C.P. ; Busch, D.H. ; Muenchhoff, M. ; Blum, H. ; Keppler, O.T. ; Gagneur, J. ; Protzer, U.
Viral genome sequencing to decipher in-hospital SARS-CoV-2 transmission events.Chang, Y. ; Bach, L. ; Hasiuk, M. ; Wen, L. ; Elmzzahi, T. ; Tsui, C. ; Gutiérrez-Melo, N. ; Steffen, T. ; Utzschneider, D.T. ; Raj, T. ; Jost, P.J. ; Heink, S. ; Cheng, J. ; Burton, O.T. ; Zeiträg, J. ; Alterauge, D. ; Dahlström, F. ; Becker, J.C. ; Kastl, M. ; Symeonidis, K. ; van Uelft, M. ; Becker, M. ; Reschke, S. ; Krebs, S. ; Blum, H. ; Abdullah, Z. ; Paeschke, K. ; Ohnmacht, C. ; Neumann, C. ; Liston, A. ; Meissner, F. ; Korn, T. ; Hasenauer, J. ; Heissmeyer, V. ; Beyer, M. ; Kallies, A. ; Jeker, L.T. ; Baumjohann, D.
TGF-β specifies TFH versus TH17 cell fates in murine CD4+ T cells through c-Maf.Brugger, M. ; Lauri, A. ; Zhen, Y. ; Gramegna, L.L. ; Zott, B. ; Sekulić, N. ; Fasano, G. ; Kopajtich, R. ; Cordeddu, V. ; Radio, F.C. ; Mancini, C. ; Pizzi, S. ; Paradisi, G. ; Zanni, G. ; Vasco, G. ; Carrozzo, R. ; Palombo, F. ; Tonon, C. ; Lodi, R. ; La Morgia, C. ; Arelin, M. ; Blechschmidt, C. ; Finck, T. ; Sørensen, V. ; Kreiser, K. ; Strobl-Wildemann, G. ; Daum, H. ; Michaelson-Cohen, R. ; Ziccardi, L. ; Zampino, G. ; Prokisch, H. ; Abou Jamra, R. ; Fiorini, C. ; Arzberger, T. ; Winkelmann, J. ; Caporali, L. ; Carelli, V. ; Stenmark, H. ; Tartaglia, M. ; Wagner, M.
Bi-allelic variants in SNF8 cause a disease spectrum ranging from severe developmental and epileptic encephalopathy to syndromic optic atrophy.Kuhn, C.K. ; Stenzel, U. ; Berndt, S.I ; Liebscher, I. ; Schöneberg, T. ; Horn, S.
The repertoire and structure of adhesion GPCR transcript variants assembled from publicly available deep-sequenced human samples.Seiringer, P. ; Hillig, C. ; Schäbitz, A. ; Jargosch, M. ; Pilz, A.C. ; Eyerich, S. ; Szegedi, A. ; Sochorová, M. ; Gruber, F. ; Zouboulis, C.C. ; Biedermann, T. ; Menden, M.P. ; Eyerich, K. ; Törőcsik, D.
Spatial transcriptomics reveals altered lipid metabolism and inflammation-related gene expression of sebaceous glands in psoriasis and atopic dermatitis.Lin, J. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Müller, C.L. ; Peters, A. ; Thorand, B.
Associations of proteomics with hypertension and systolic blood pressure: KORA S4/F4/FF4 and KORA-Age1/Age2 Cohort Studies.Mueller, T.T. ; Usynin, D. ; Paetzold, J.C. ; Braren, R. ; Rueckert, D. ; Kaissis, G.
Differential privacy guarantees for analytics and machine learning on graphs: A survey of results.Frenz-Wiessner, S. ; Fairley, S.D. ; Buser, M. ; Goek, I. ; Salewskij, K. ; Jonsson, G. ; Illig, D. ; Zu Putlitz, B. ; Petersheim, D. ; Li, Y. ; Chen, P.H. ; Kalauz, M. ; Conca, R. ; Sterr, M. ; Geuder, J. ; Mizoguchi, Y. ; Megens, R.T.A. ; Linder, M.I. ; Kotlarz, D. ; Rudelius, M. ; Penninger, J.M. ; Marr, C. ; Klein, C.
Generation of complex bone marrow organoids from human induced pluripotent stem cells.Unterauer, E.M. ; Shetab Boushehri, S. ; Jevdokimenko, K. ; Masullo, L.A. ; Ganji, M. ; Sograte-Idrissi, S. ; Kowalewski, R. ; Strauss, S. ; Reinhardt, S.C.M. ; Perovic, A. ; Marr, C. ; Opazo, F. ; Fornasiero, E.F. ; Jungmann, R.
Spatial proteomics in neurons at single-protein resolution.Coupette, C. ; Vreeken, J. ; Rieck, B.
All the world's a (hyper)graph: A data drama.Alamoudi, E. ; Reck, F. ; Bundgaard, N. ; Graw, F. ; Brusch, L. ; Hasenauer, J. ; Schälte, Y.
A wall-time minimizing parallelization strategy for approximate Bayesian computation.Afzali, A.M. ; Nirschl, L. ; Sie, C. ; Pfaller, M. ; Ulianov, O. ; Hassler, T. ; Federle, C. ; Petrozziello, E. ; Kalluri, S.R. ; Chen, H.H. ; Tyystjärvi, S. ; Muschaweckh, A. ; Lammens, K. ; Delbridge, C. ; Büttner, A. ; Steiger, K. ; Seyhan, G. ; Ottersen, O.P. ; Öllinger, R. ; Rad, R. ; Jarosch, S. ; Straub, A. ; Mühlbauer, A. ; Grassmann, S. ; Hemmer, B. ; Böttcher, J.P. ; Wagner, I. ; Kreutzfeldt, M. ; Merkler, D. ; Bonafonte Pardás, I. ; Schmidt Supprian, M. ; Buchholz, V.R. ; Heink, S. ; Busch, D.H. ; Klein, L. ; Korn, T.
B cells orchestrate tolerance to the neuromyelitis optica autoantigen AQP4.Spieker, V. ; Huang, W. ; Eichhorn, H. ; Stelter, J. ; Weiss, K. ; Zimmer, V.A. ; Braren, R.F. ; Karampinos, D.C. ; Hammernik, K. ; Schnabel, J.A.
ICoNIK: Generating Respiratory-Resolved Abdominal MR Reconstructions Using Neural Implicit Representations in k-Space.Raveendran, V. ; Spieker, V. ; Braren, R.F. ; Karampinos, D.C. ; Zimmer, V.A. ; Schnabel, J.A.
Segmentation-guided Medical Image Registration: Quality Awareness using Label Noise Correctionn.Lagogiannis, I. ; Meissen, F. ; Kaissis, G. ; Rueckert, D.
Unsupervised pathology detection: A deep dive Into the state of the art.De Santana Villasboas Arruda, A.L. ; Khandaker, G.M. ; Morris, A.P. ; Smith, G.D. ; Huckins, L.M. ; Zeggini, E.
Genomic insights into the comorbidity between type 2 diabetes and schizophrenia.Kraus, K.M. ; Oreshko, M. ; Schnabel, J.A. ; Bernhardt, D. ; Combs, S.E. ; Peeken, J.C.
Dosiomics and radiomics-based prediction of pneumonitis after radiotherapy and immune checkpoint inhibition: The relevance of fractionation.Mellor, S. ; Timms, R.C. ; O’Neill, G.C. ; Tierney, T.M. ; Spedden, M.E. ; Brookes, M.J. ; Wagstyl, K. ; Barnes, G.R. ; MELD Project Consortium (Spitzer, H.)
Combining OPM and lesion mapping data for epilepsy surgery planning: A simulation study.Kiss, A.E. ; Venkatasubramani, A.V. ; Pathirana, D. ; Krause, S. ; Sparr, A.C. ; Hasenauer, J. ; Imhof, A. ; Müller, M. ; Becker, P.B.
Processivity and specificity of histone acetylation by the male-specific lethal complex.Efendiyev, M.A. ; Vougalter, V.
Solvability in the sense of sequences for some linear and nonlinear Fredholm operators with the logarithmic Laplacian.Pfeuffer, J. ; Bielow, C. ; Wein, S. ; Jeong, K. ; Netz, E. ; Walter, A. ; Alka, O. ; Nilse, L. ; Colaianni, P.D. ; McCloskey, D. ; Kim, J. ; Rosenberger, G. ; Bichmann, L. ; Walzer, M. ; Veit, J. ; Boudaud, B. ; Bernt, M. ; Patikas, N. ; Pilz, M. ; Startek, M.P. ; Kutuzova, S. ; Heumos, L. ; Charkow, J. ; Sing, J.C. ; Feroz, A. ; Siraj, A. ; Weisser, H. ; Dijkstra, T.M.H. ; Perez-Riverol, Y. ; Röst, H.L. ; Kohlbacher, O. ; Sachsenberg, T.
OpenMS 3 enables reproducible analysis of large-scale mass spectrometry data.Meissen, F. ; Breuer, S. ; Knolle, M. ; Buyx, A. ; Müller, R. ; Kaissis, G. ; Wiestler, B. ; Rückert, D.
(Predictable) performance bias in unsupervised anomaly detection.Gebert, J. ; Brunet, T. ; Wagner, M. ; Rath, J. ; Aull-Watschinger, S. ; Pataraia, E. ; Krenn, M.
A Homozygous PTRHD1 missense variant (p.Arg122Gln) in an individual with intellectual disability, generalized epilepsy, and juvenile parkinsonism.Peters, B. ; Dattner, T. ; Schlieben, L.D. ; Sun, T. ; Staufner, C. ; Lenz, D.
Disorders of vesicular trafficking presenting with recurrent acute liver failure: NBAS, RINT1, and SCYL1 deficiency.Leu, C.-L. ; Lam, D.D. ; Salminen, A.V. ; Wefers, B. ; Becker, L. ; Garrett, L. ; Rozman, J. ; Wurst, W. ; Hrabě de Angelis, M. ; Hölter, S.M. ; Winkelmann, J. ; Williams, R.H.
A patient-enriched MEIS1 coding variant causes a restless legs syndrome-like phenotype in mice.Sonsalla, G. ; Malpartida, A.B. ; Riedemann, T. ; Gusic, M. ; Rusha, E. ; Bulli, G. ; Najas, S. ; Janjic, A. ; Hersbach, B.A. ; Smialowski, P. ; Drukker, M. ; Enard, W. ; Prehn, J.H.M. ; Prokisch, H. ; Götz, M. ; Masserdotti, G.
Direct neuronal reprogramming of NDUFS4 patient cells identifies the unfolded protein response as a novel general reprogramming hurdle.Harrer, P. ; Inderhees, J. ; Zhao, C. ; Schormair, B. ; Tilch, E. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Jöhren, O. ; Fleming, T. ; Nawroth, P.P. ; Berger, K. ; Hermesdorf, M. ; Winkelmann, J. ; Schwaninger, M. ; Oexle, K.
Phenotypic and genome-wide studies on dicarbonyls: Major associations to glomerular filtration rate and gamma-glutamyltransferase activity.Harada, M. ; Han, S. ; Shi, M. ; Ge, J. ; Yu, S. ; Adam, J. ; Adamski, J. ; Scheerer, M.F. ; Neschen, S. ; Hrabě de Angelis, M. ; Wang-Sattler, R.
Metabolic effects of SGLT2i and metformin on 3-hydroxybutyric acid and lactate in db/db mice.Lange de Luna, J. ; Nounu, A. ; Neumeyer; S. ; Sinke, L. ; Wilson, R. ; Hellbach, F. ; Matias-Garcia, P.R. ; Delerue, T. ; Winkelmann, J. ; Peters, A. ; Thorand, B. ; Beekman, M. ; Heijmans, B.T. ; Slagboom, E. ; Gieger, C. ; Linseisen, J. ; Waldenberger, M.
Epigenome-wide association study of dietary fatty acid intake.Ratter-Rieck, J.M. ; Shi, M. ; Suhre, K. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Rathmann, W. ; Thorand, B. ; Roden, M. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R. ; Herder, C.
Omentin associates with serum metabolite profiles indicating lower diabetes risk: KORA F4 Study.Maushagen, J. ; Addin, N.S. ; Schuppert, C. ; Ward-Caviness, C.K. ; Nattenmüller, J. ; Adamski, J. ; Peters, A. ; Bamberg, F. ; Schlett, C.L. ; Wang-Sattler, R. ; Rospleszcz, S.
Serum metabolite signatures of cardiac function and morphology in individuals from a population-based cohort.Paul, M.S. ; Michener, S.L. ; Pan, H. ; Chan, H. ; Pfliger, J.M. ; Rosenfeld, J.A. ; Lerma, V.C. ; Tran, A. ; Longley, M.A. ; Lewis, R.A. ; Weisz-Hubshman, M. ; Bekheirnia, M.R. ; Bekheirnia, N. ; Massingham, L. ; Zech, M. ; Wagner, M. ; Engels, H. ; Cremer, K. ; Mangold, E. ; Peters, S. ; Trautmann, J. ; Mester, J.L. ; Guillen Sacoto, M.J. ; Person, R. ; McDonnell, P.P. ; Cohen, S.R. ; Lusk, L. ; Cohen, A.S.A. ; Le Pichon, J.B. ; Pastinen, T. ; Zhou, D. ; Engleman, K. ; Racine, C. ; Faivre, L. ; Moutton, S. ; Denommé-Pichon, A.S. ; Koh, H.Y. ; Poduri, A. ; Bolton, J.L. ; Knopp, C. ; Julia Suh, D.S. ; Maier, A. ; Toosi, M.B. ; Karimiani, E.G. ; Maroofian, R. ; Schaefer, G.B. ; Ramakumaran, V.S. ; Vasudevan, P. ; Prasad, C. ; Osmond, M. ; Schuhmann, S. ; Vasileiou, G. ; Russ-Hall, S. ; Scheffer, I.E. ; Carvill, G.L. ; Mefford, H.C. ; Bacino, C.A. ; Lee, B.H. ; Chao, H.T.
A syndromic neurodevelopmental disorder caused by rare variants in PPFIA3.Madni, H.A. ; Umer, R.M. ; Foresti, G.L.
Robust federated learning for heterogeneous model and data.Madni, H.A. ; Umer, R.M. ; Foresti, G.L.
Federated learning for data and model heterogeneity in medical imaging.Tayebi Arasteh, S. ; Lotfinia, M. ; Nolte, T. ; Sähn, M.J. ; Isfort, P. ; Kühl, C. ; Nebelung, S. ; Kaissis, G. ; Truhn, D.
Securing collaborative medical aI by using differential privacy: Domain transfer for classification of chest radiographs.Wang, J. ; Horlacher, M. ; Cheng, L. ; Winther, O.
DeepLocRNA: An interpretable deep learning model for predicting RNA subcellular localisation with domain-specific transfer-learning.Ding, J. ; Hillig, C. ; White, C.W. ; Fernandopulle, N.A. ; Anderton, H. ; Kern, J.S. ; Menden, M.P. ; Mackay, G.A.
CXCL17 induces activation of human mast cells via MRGPRX2.Gannon, H. ; Larsson, L. ; Chimhuya, S. ; Mangiza, M. ; Wilson, E. ; Kesler, E. ; Chimhini, G. ; Fitzgerald, F. ; Zailani, G. ; Crehan, C. ; Khan, N. ; Hull-Bailey, T. ; Sassoon, Y. ; Baradza, M. ; Heys, M. ; Chiume, M.
Development and implementation of digital diagnostic algorithms for neonatal units in Zimbabwe and Malawi: Development and usability study.Fearns, N. ; Wagner, M. ; Borggräfe, I. ; Kunz, M. ; Rémi, J. ; Vollmar, C.
Good outcome of resective epilepsy surgery in a one-year-old child with drug-resistant focal epilepsy with a novel pathogenic COL4A1 mutation.Aleo, S.J. ; Del Dotto, V. ; Romagnoli, M. ; Fiorini, C. ; Capirossi, G. ; Peron, C. ; Maresca, A. ; Caporali, L. ; Capristo, M. ; Tropeano, C.V. ; Zanna, C. ; Ross-Cisneros, F.N. ; Sadun, A.A. ; Pignataro, M.G. ; Giordano, C. ; Fasano, C. ; Cavaliere, A. ; Porcelli, A.M. ; Tioli, G. ; Musiani, F. ; Catania, A. ; Lamperti, C. ; Marzoli, S.B. ; De Negri, A. ; Cascavilla, M.L. ; Battista, M. ; Barboni, P. ; Carbonelli, M. ; Amore, G. ; La Morgia, C. ; Smirnov, D. ; Vasilescu, C. ; Farzeen, A. ; Blickhaeuser, B. ; Prokisch, H. ; Priglinger, C. ; Livonius, B. ; Catarino, C.B. ; Klopstock, T. ; Tiranti, V. ; Carelli, V. ; Ghelli, A.M.
Genetic variants affecting NQO1 protein levels impact the efficacy of idebenone treatment in Leber hereditary optic neuropathy.Hellbach, F. ; Freuer, D. ; Meisinger, C. ; Peters, A. ; Winkelmann, J. ; Costeira, R. ; Hauner, H. ; Baumeister, S.E. ; Bell, J.T. ; Waldenberger, M. ; Linseisen, J.
Usual dietary intake and change in DNA methylation over years: EWAS in KORA FF4 and KORA fit.De Santana Villasboas Arruda, A.L. ; Morris, A.P. ; Zeggini, E.
Advancing equity in human genomics through tissue-specific multi-ancestry molecular data.Hammann, N. ; Lenz, D. ; Baric, I. ; Crushell, E. ; Vici, C.D. ; Distelmaier, F. ; Feillet, F. ; Freisinger, P. ; Hempel, M. ; Khoreva, A.L. ; Laass, M.W. ; Lacassie, Y. ; Lainka, E. ; Larson-Nath, C. ; Li, Z. ; Lipiński, P. ; Lurz, E. ; Megarbane, A. ; Nobre, S. ; Olivieri, G. ; Peters, B. ; Prontera, P. ; Schlieben, L.D. ; Seroogy, C.M. ; Sobacchi, C. ; Suzuki, S.C. ; Tran, C.L. ; Vockley, J. ; Wang, J.S. ; Wagner, M. ; Prokisch, H. ; Garbade, S.F. ; Kolker, S. ; Hoffmann, G.F. ; Staufner, C.
Impact of genetic and non-genetic factors on phenotypic diversity in NBAS-associated disease.Lang, P.F. ; Penas, D.R. ; Banga, J.R. ; Weindl, D. ; Novak, B.
Reusable rule-based cell cycle model explains compartment-resolved dynamics of 16 observables in RPE-1 cells.Mayr, C. ; Sengupta, A. ; Asgharpour, S. ; Ansari, M. ; Pestoni, J. ; Ogar, P. ; Angelidis, I. ; Liontos, A. ; Rodriguez-Castillo, J.A. ; Lang, N.J. ; Strunz, M. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Gerckens, M. ; De Sadeleer, L.J. ; Oehrle, B. ; Viteri-Alvarez, S.V. ; Fernandez, I.E. ; Tallquist, M. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Stoleriu, M.G. ; Behr, J. ; Kneidinger, N. ; Wuyts, W.A. ; Wasnick, R. ; Yildirim, A.Ö. ; Ahlbrecht, K. ; Morty, R.E. ; Samakovlis, C. ; Theis, F.J. ; Burgstaller, G. ; Schiller, H. B.
Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury induced myofibroblasts.Raney, B.J. ; Barber, G.P. ; Benet-Pages, A. ; Casper, J. ; Clawson, H. ; Cline, M.S. ; Diekhans, M. ; Fischer, C. ; Navarro Gonzalez, J. ; Hickey, G. ; Hinrichs, A.S. ; Kuhn, R.M. ; Lee, B.T. ; Lee, C.M. ; Le Mercier, P. ; Miga, K.H. ; Nassar, L.R. ; Nejad, P. ; Paten, B. ; Perez, G. ; Schmelter, D. ; Speir, M.L. ; Wick, B.D. ; Zweig, A.S. ; Haussler, D. ; Kent, W.J. ; Haeussler, M.
The UCSC Genome Browser database: 2024 update.Kirschenbaum, D. ; Xie, K. ; Ingelfinger, F. ; Katzenelenbogen, Y. ; Abadie, K. ; Look, T. ; Sheban, F. ; Phan, T.S. ; Li, B. ; Zwicky, P. ; Yofe, I. ; David, E. ; Mazuz, K. ; Hou, J. ; Chen, Y. ; Shaim, H. ; Shanley, M. ; Becker, S. ; Qian, J. ; Colonna, M. ; Ginhoux, F. ; Rezvani, K. ; Theis, F.J. ; Yosef, N. ; Weiss, T. ; Weiner, A. ; Amit, I.
Time-resolved single-cell transcriptomics defines immune trajectories in glioblastoma.Klaproth-Andrade, D. ; Hingerl, J. ; Bruns, Y. ; Smith, N.H. ; Träuble, J. ; Wilhelm, M. ; Gagneur, J.
Deep learning-driven fragment ion series classification enables highly precise and sensitive de novo peptide sequencing.Zech, M. ; Winkelmann, J.
Next-generation sequencing and bioinformatics in rare movement disorders.Kasela, S. ; Aguet, F. ; Kim-Hellmuth, S. ; Brown, B.C. ; Nachun, D.C. ; Tracy, R.P. ; Durda, P. ; Liu, Y. ; Taylor, K.D. ; Johnson, W.C. ; van Den Berg, D. ; Gabriel, S. ; Gupta, N. ; Smith, J.D. ; Blackwell, T.W. ; Rotter, J.I. ; Ardlie, K.G. ; Manichaikul, A. ; Rich, S.S. ; Barr, R.G. ; Lappalainen, T.
Interaction molecular QTL mapping discovers cellular and environmental modifiers of genetic regulatory effects.Martens, L.D. ; Fischer, D.S. ; Yépez, V.A. ; Theis, F.J. ; Gagneur, J.
Modeling fragment counts improves single-cell ATAC-seq analysis.Efendiyev, M.A. ; Hu, Q.
Global Hopf bifurcation for differential equations with multiple threshold-type state-dependent delays.Hornung, R. ; Ludwigs, F. ; Hagenberg, J. ; Boulesteix, A.L.
Prediction approaches for partly missing multi-omics covariate data: A literature review and an empirical comparison study.Kotlarz, D.M.
Unveiling the protective role of BTNL-selected γδ T cells in inflammatory bowel disease.Marchi, H. ; Fuchs, C.
Hurdle-QAP models overcome dependency and sparsity in scientific collaboration count networks.Sadafi, A. ; Salehi, R. ; Gruber, A. ; Shetab Boushehri, S. ; Giehr, P. ; Navab, N. ; Marr, C.
A continual learning approach for cross-domain white blood cell classification.Wagner, S. ; Matek, C. ; Shetab Boushehri, S. ; Boxberg, M. ; Lamm, L. ; Sadafi, A. ; Winter, D. ; Marr, C. ; Peng, T.
Built to last? Reproducibility and reusability of deep learning algorithms in computational pathology.Bordukova, M. ; Makarov, N. ; Rodriguez-Esteban, R. ; Schmich, F. ; Menden, M.P.
Generative artificial intelligence empowers digital twins in drug discovery and clinical trials.Claussen, E.R. ; Renfrew, P.D. ; Müller, C.L. ; Drew, K.
Scaffold Matcher: A CMA-ES based algorithm for identifying hotspot aligned peptidomimetic scaffolds.Senftleber, N.K. ; Andersen, M.K. ; Jørsboe, E. ; Stæger, F.F. ; Nøhr, A.K. ; Garcia-Erill, G. ; Meisner, J. ; Santander, C.G. ; Balboa, R.F. ; Gilly, A. ; Bjerregaard, P. ; Larsen, C.V.L. ; Grarup, N. ; Jørgensen, M.E. ; Zeggini, E. ; Moltke, I. ; Hansen, T. ; Albrechtsen, A.
GWAS of lipids in Greenlanders finds association signals shared with Europeans and reveals an independent PCSK9 association signal.Gayoso, A. ; Weiler, P. ; Lotfollahi, M. ; Klein, D. ; Hong, J. ; Streets, A. ; Theis, F.J. ; Yosef, N.
Deep generative modeling of transcriptional dynamics for RNA velocity analysis in single cells.Föllmer, B. ; Williams, M.C. ; Dey, D. ; Arbab-Zadeh, A. ; Maurovich-Horvat, P. ; Volleberg, R.H.J.A. ; Rueckert, D. ; Schnabel, J.A. ; Newby, D.E. ; Dweck, M.R. ; Guagliumi, G. ; Falk, V. ; Vázquez Mézquita, A.J. ; Biavati, F. ; Isgum, I. ; Dewey, M.
Roadmap on the use of artificial intelligence for imaging of vulnerable atherosclerotic plaque in coronary arteries.