Rolled up magazines on blue background

CF-MPC Publication

Publications

Brief. Bioinform. 27:bbag378 (2026)

Würf, V. ; Köhler, N. ; Molnar, F. ; Hahnefeld, L. ; Gurke, R. ; Witting, M. ; Pauling, J.K.

LipiDetective:a deep learning model for the identification of molecular lipid species in tandem mass spectra.

Oluwagbemigun, K. ; Ziegler, D. ; Strom, A. ; Heier, M. ; Bonhof, G.J. ; Roden, M. ; Rathmann, W. ; Meisinger, C. ; Peters, A. ; Hauck, S.M. ; Petrera, A. ; Sinner, M.F. ; Kaab, S. ; Thorand, B. ; Herder, C.

Differential associations of resting heart rate and heart rate variability indices with cardiovascular and coronary heart disease mortality risk: The prospective KORA study.
Mol. Metab. 110:102391 (2026)

Fumo, A.R. ; Dreher, S. ; Morigny, P. ; Ji, H. ; Terron Exposito, R. ; Samanci, T.F. ; More, T. ; Ruoff, L. ; Tissink, J.J. ; Yubero, C.P. ; Alfaro, A.J. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Nusser, S.H.A. ; Czigany, Z. ; Dyar, K.A. ; Herzig, S. ; Diaz, M.B. ; Zeigerer, A. ; Hiller, K. ; Wirtz, T.H. ; Weigert, C. ; Rohm, M.

Hepatokines lipocalin 2 and osteopontin drive muscle atrophy in MASH.
Science:eaeh1348 (2026)

Wiesbeck, M. ; Alard, E. ; Merino, F.L. ; Chowdhury, N. ; Egert, L. ; Danese, A. ; Imhof, S. ; Borgia, M.I. ; Rajan, A. ; Marx, N.F. ; Kepesidis, E. ; Köferle, A. ; Cerron-Alvan, L.M. ; Vierl, F. ; Truong, T.-T. ; Thorwirth, M. ; Bilalli, L. ; Ninkovic, J. ; Schieweck, R. ; Diefenbacher, M. ; Hauck, S.M. ; Trainor, P.A. ; Mardakheh, F.K. ; Götz, M. ; Stricker, S.H.

Manipulation of protein translation and stem cell self-renewal by CRISPR activation of rRNA transcription.
Front. Immunol. 17:1728935 (2026)

Flad, L.M. ; Weisser, T. ; Liedl, J. ; Gard, F. ; Petrera, A. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A. ; Kleinwort, K.J.H.

Inhibitory impact of A1 and A2 cow's milk on human peripheral blood mononuclear cells identifies TOM1 as a candidate anti-inflammatory mediator.
Exp. Physiol. 111, 3784-3799 (2026)

Havers, T. ; Eggelbusch, M. ; Meinhold, M. ; Sing, K. ; Okrojek, R. ; Artati, A. ; Witting, M. ; Lutter, D. ; Kieker, C.V. ; Starke, C. ; More, T. ; Hiller, K. ; Dela, F. ; Schönfelder, M. ; Kafka, A. ; Geisler, S. ; Wackerhage, H.

Divergent skeletal muscle metabolite exchange in insulin-like growth factor-1-stimulated myotubes and resistance-exercised human muscle.
Cardiovasc. Res. 122, 1589–1608 (2026)

Zhang, L. ; Omarov, M. ; Xu, L. ; Das, B. ; Luo, H. ; Hauck, S.M. ; Petrera, A. ; Yu, Z. ; Goonewardena, S.N. ; Zeggini, E. ; Peters, A. ; Dichgans, M. ; Murthy, V.L. ; Thorand, B. ; Georgakis, M.K.

Proteomic signatures as biomarkers of atherosclerosis burden.
Sci. Adv. 12:eaea9974 (2026)

Li, Y. ; Krontira, A. ; Vierl, F. ; Richter, M. ; Wang, W. ; Merl-Pham, J. ; Theis, F.J. ; Hauck, S.M. ; Götz, M.

Transcriptional repression by TGIF2 coordinates neurogenic priming and neural stem cell maintenance.
Cell Metab. 38, 1354-1366 (2026)

Grandl, G. ; König, A.-C. ; Metzger, F. ; Liskiewicz, A. ; Hefele, T. ; Nason, S. ; Novikoff, A. ; Al-Refaie, N. ; Rahman, M.A. ; Khalil, A. ; Zhang, Q. ; Collden, G. ; Finan, B. ; Douros, J. ; Habegger, K. ; Cebrian Serrano, A. ; Hauck, S.M. ; Tschöp, M.H. ; Müller, T.D.

FGF21 reduces ER stress by enhancing the unfolded protein and integrated stress responses through increased sulfide signaling.
EMBO Mol. Med., DOI: 10.1038/s44321-026-00468-8 (2026)

Ahadi, S. ; Hornburg, D. ; Babačić, H. ; Müller-Reif, J.B. ; Cantrell, L.S. ; Edfors, F. ; Hauck, S.M. ; Deutsch, E.W. ; Omenn, G.S. ; Geyer, P.E. ; Schwenk, J.M.

Translational bottlenecks in blood-based proteomics.
Glia 74:e70170 (2026)

Schaefer, A. ; Bludau, O. ; Sekulic, A. ; Altunok, S. ; Mergler, S. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Grosche, A. ; Strauß, O. ; Reichhart, N.

Anoctamin-1 is a calcium-dependent chloride channel (CaCC) in Müller cells involved in cell volume regulation.
Cell Death Dis. 17:564 (2026)

Bielmeier, C.B. ; Schmitt, S.I. ; Lehr, V. ; Grundl, A. ; Dillinger, A.E. ; Jägle, H. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Ergün, S. ; Tamm, E.R. ; Schlecht, A. ; Neueder, A. ; Braunger, B.M.

VEGFR2 deletion increases susceptibility to photoreceptor degeneration through glial-neuronal interaction.
Cell 189, 5026-5043 (2026)

Merino, F.L. ; Miranda, L. ; Kumar, A. ; Li, Y. ; Kumar Sundaramoorthy, D. ; Merl-Pham, J. ; Schentarra, E.M. ; Steinek, C. ; Pravata, V. ; Kittock, C. ; Bürkle, M. ; Hersbach, B.A. ; Ferri Beneito, J. ; Giesert, F. ; Jungmann, R. ; Pilaz, L.J. ; Hauck, S.M. ; Cappello, S. ; Götz, M.

Nuclear proteome reveals microtubule-associated protein regulating fate and disease.
Nat. Commun. 17:4778 (2026)

Fedorova, M. ; Bendt, A.K. ; Bertrand-Michel, J. ; Fiehn, O. ; Godzień, J. ; Goracci, L. ; Gruber, F. ; Guan, X.L. ; Han, X. ; Holčapek, M. ; Kuligowski, J. ; Meikle, P.J. ; Nepachalovich, P. ; O’Donnell, V.B. ; Orešič, M. ; Penkov, S. ; Petrović, S. ; Potapov, A. ; Prabutzki, P. ; Righetti, L. ; Ruskovska, T. ; Shevchenko, A. ; Simons, K. ; Spickett, C.M. ; Vvedenskaya, O. ; Watts, J. ; Wenk, M.R. ; Witting, M. ; Xia, Y. ; Yang, B. ; Domingues, M.R.

A lipidomics roadmap: From basic research to societal challenges.

Kolak, A. ; Tschuck, J. ; Weiss, S.A. ; Kaemena, D.F. ; Klimm, K. ; Galhoz, A. ; Ringelstetter, L. ; Fennell, M. ; Merl-Pham, J. ; Artati, A. ; Strasser, S. ; Garippa, R. ; Witting, M. ; Zischka, H. ; Schick, J. ; Hauck, S.M. ; Menden, M.P. ; Vincendeau, M. ; Stockwell, B.R. ; Hadian, K.

miR-940 suppresses ferroptosis by controlling expression of key regulatory genes.

Zöller, M. ; Mastalerz, M. ; Dick, E. ; Merl-Pham, J. ; Hennen, E. ; Chakraborty, A. ; Nakayama, M. ; Klotz, M. ; Marchi, H. ; Le Gleut, R. ; Sadeleer, L.J.D. ; Wuyts, W.A. ; Vanaudenaerde, B. ; Jeridi, A. ; Prasse, A. ; Jäger, B. ; Santofimia‐Castaño, P. ; Stoleriu, M.-G. ; Hilgendorff, A. ; Hauck, S.M. ; Yildirim, A.Ö. ; Schiller, H.B. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Nuclear protein 1 is a cell death regulator in primary human airway epithelial cells and reduced in idiopathic pulmonary fibrosis.

Raja, A. ; Nikopaschou, M. ; de Boer, J.H. ; Ossewaarde-van Norel, J. ; Artati, A. ; Witting, M. ; Stratikos, E. ; Kuiper, J.J.W.

The impact of ERAP1 inhibition on metabolite homeostasis of melanoma cells.

Staab-Weijnitz, C.A. ; Merl-Pham, J. ; Hennen, E. ; Onursal, C. ; Cabeza-Boeddinghaus, N. ; Kandhari, K. ; Stremlau, M. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Bächinger, H.P. ; Hauck, S.M. ; Vanacore, R. ; Hansen, K.C. ; Basak, T.

Prolyl-3-hydroxylase 1 is a central regulator of collagen post-translational modifications and the collagen biosynthetic network.

Walth-Hummel, A.A. ; Jouffe, C. ; Weber, P. ; Motzler, K. ; Geppert, J. ; Sterr, M. ; Gan, W. ; Szczerbinska, I. ; König, A.-C. ; Hauck, S.M. ; Terron Exposito, R. ; Hass, D, ; Wang, C. ; Dyar, K.A. ; Lyon, J.G. ; Lickert, H. ; Ämmälä, C. ; Herzig, S. ; Ashcroft, F.M. ; Bakhti, M. ; MacDonald, P.E. ; Rohm, M.

TBL1X/TBL1XR1 govern β-cell identity through a PAX6-containing gene regulatory network.
Metabolomics 22:59 (2026)

Bossi, E. ; Prehn, C. ; Crotti, L. ; Malfatto, G. ; Paglia, G. ; Witting, M.

Optimization of a targeted metabolomics kit for dried blood spots analysis and longitudinal comparison with serum.
Metabolomics 22:43 (2026)

Theodoridis, G. ; Fiehn, O. ; Holčapek, M. ; Goodacre, R. ; Raftery, D. ; Plumb, R. ; Ebbels, T.M.D. ; Witting, M. ; Gika, H. ; Wilson, I.D.

Correction: What's in a name? Metabolite identification: Challenges and pitfalls in untargeted metabolomics.

Schranner, D. ; Wackerhage, H. ; Weinisch, P. ; Schlegel, J. ; Bremer, S. ; Scherr, J. ; Römisch-Margl, W. ; Riermeier, A. ; Zelger, O. ; Stöcker, F. ; Artati, A. ; Witting, M. ; Krumsiek, J. ; Halle, M. ; Schönfelder, M. ; Kastenmüller, G.

Characterizing human oxidative, anabolic and glycolytic metabolism in athletes with extreme physiologies.
Metabolomics 22:22 (2026)

Theodoridis, G. ; Fiehn, O. ; Holčapek, M. ; Goodacre, R. ; Raftery, D. ; Plumb, R. ; Ebbels, T.M.D. ; Witting, M. ; Gika, H. ; Wilson, I.D.

What's in a name? Metabolite identification: Challenges and pitfalls in untargeted metabolomics.
Nucleic Acids Res. 54:gkag036 (2026)

Gerhalter, M. ; Prattes, M. ; Grundmann, L.E. ; Grishkovskaya, I. ; Semeraro, E.F. ; Zisser, G. ; Kotisch, H. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Haselbach, D. ; Bergler, H.

A comprehensive view on r-protein binding and rRNA domain structuring during early eukaryotic ribosome formation.

Harada, M. ; Adam, J. ; Han, S. ; Shi, M. ; Ge, J. ; Lintelmann, J. ; Cecil, A. ; Zukunft, S. ; Prehn, C. ; Witting, M. ; Scheerer, M.F. ; Neschen, S. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Adamski, J. ; Teupser, D. ; Linkohr, B. ; Gieger, C. ; Hrabě de Angelis, M. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R.

Urea cycle modulation by combined SGLT2 inhibitors and metformin.
J. Proteome Res. 25, 405-417 (2026)

Gronauer, T.F. ; Merl-Pham, J. ; von Toerne, C. ; Habler, K. ; Teupser, D. ; Hauck, S.M.

Blood matrices and sample preparation influence blood marker discovery.
Cell 189, 287-306.e35 (2026)

Lorenz, S. ; Wahida, A. ; Bostock, M.J. ; Seibt, T. ; Santos Dias Mourão, A. ; Levkina, A. ; Trümbach, D. ; Soudy, M. ; Emler, D. ; Rothammer, N. ; Woo, M.S. ; Sonner, J.K. ; Novikova, M. ; Henkelmann, B. ; Aldrovandi, M. ; Kaemena, D.F. ; Mishima, E. ; Vermonden, P. ; Zong, Z. ; Cheng, D. ; Nakamura, T. ; Ito, J. ; Doll, S. ; Proneth, B. ; Bürkle, E. ; Rizzollo, F. ; Escamilla Ayala, A. ; Napolitano, V. ; Kolonko, M. ; Gaussmann, S. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Pertek, A. ; Orschmann, T. ; Van San, E. ; Vanden Berghe, T. ; Hass, D, ; Maida, A. ; Frenz, J.M. ; Pedrera, L. ; Dolga, A.M. ; Kraiger, M. ; Hrabě de Angelis, M. ; Fuchs, H. ; Ebert, G. ; Lenberg, J. ; Friedman, J. ; Scale, C. ; Agostinis, P. ; Zimprich, A. ; Vogt Weisenhorn, D.M. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Wurst, W. ; Glaab, E. ; Lewerenz, J. ; Popper, B. ; Sieben, C. ; Steinacker, P. ; Zischka, H. ; García-Sáez, A.J. ; Tietze, A. ; Ramesh, S.K. ; Ayton, S. ; Vincendeau, M. ; Friese, M.A. ; Wigby, K. ; Sattler, M. ; Mann, M. ; Ingold, I. ; Jayavelu, A.K. ; Popowicz, G.M. ; Conrad, M.

A fin-loop-like structure in GPX4 underlies neuroprotection from ferroptosis.