Rolled up magazines on blue background

Publications

2019 in
In: Translational Research Methods in Diabetes, Obesity, and Nonalcoholic Fatty Liver Disease. 2019. 309-347

Grallert, H. ; Marzi, C. ; Hauck, S.M. ; Gieger, C.

Omics: Potential role in early phase drug development.
2019 in
Poster: Intestinal organoids - from stem cells to metabolism and microbiome interactions, 29 September 2019, Kopenhagen. (2019)

Sterr, M. ; Aliluev, A. ; Tritschler, S. ; Cernilogar, F.M. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Schotta, G. ; Böttcher, A. ; Lickert, H.

Gradual pioneer factor expression resolves enteroendocrine lineage recruitment from intestinal stem cells.
Eur. Neuropsychopharmacol. 29, S7-S8 (2019)

Cruceanu, C. ; Dony, L. ; Kontira, A.C. ; Fischer, D.S. ; Roeh, S. ; DiGiaimo, R. ; Cappello, S. ; Theis, F.J. ; Binder, E.B.

Brain organoids as models of the developing human brain: deciphering the molecular signature of prenatal stress.
GigaScience 8:giz162 (2019)

Tsepilov, Y.A. ; Sharapov, S.Z. ; Zaytseva, O.O. ; Krumsiek, J. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Kastenmüller, G. ; Wang-Sattler, R. ; Strauch, K. ; Gieger, C. ; Aulchenko, Y.S.

A network-based conditional genetic association analysis of the human metabolome (vol 7, gij137, 2018).
Glia 67, E689-E690 (2019)

Koupourtidou, C. ; Schwarz, V. ; Sanchez-Gonzalez, R. ; Breunig, C. ; Fischer, J. ; Sirko, S. ; Götz, M. ; Hauck, S.M. ; Stricker, S.H. ; Ninkovic, J.

Tlr2 and Cxcr3 pathways modulate scar formation after traumatic brain injury.
Glia 67, E693-E693 (2019)

Sirko, S. ; Schichor, C. ; Tonn, J.-. ; Götz, M.

Injury-induced plasticity of parenchymal astrocytes in the human cerebral cortex.
Glia 67, E758-E758 (2019)

Bres, E.E. ; Safina, D. ; Mueller, J. ; Esser, A. ; Yang, H. ; Bedner, P. ; Helluy, X. ; Jansen, S. ; Manahan-Vaughan, D. ; Steinhaeuser, C. ; Pietrzik, C.U. ; Götz, M. ; Faissner, A.

Lrp1 loss in radial glia and their progeny - astrocytic dysfunctions contribute to spontaneous epileptogenesis.
J. Eur. Acad. Dermatol. Venereol. 33, 2380-2380 (2019)

Thomas, J. ; Küpper, M. ; Batra, R. ; Jargosch, M. ; Atenhan, A. ; Baghin, V. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Eyerich, K. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Garzorz-Stark, N.

Is the humoral immunity dispensable for the pathogenesis of psoriasis? (vol 33, pg 115, 2019).
Nat. Plants 5, 1237-1249 (2019)

Ricci, W.A. ; Lu, Z. ; Ji, L. ; Marand, A.P. ; Ethridge, C.L. ; Murphy, N.G. ; Noshay, J.M. ; Galli, M. ; Mejía-Guerra, M.K. ; Colomé-Tatché, M. ; Johannes, F. ; Rowley, M.J. ; Corces, V.G. ; Zhai, J. ; Scanlon, M.J. ; Buckler, E.S. ; Gallavotti, A. ; Springer, N.M. ; Schmitz, R.J. ; Zhang, X.

Widespread long-range cis-regulatory elements in the maize genome.

Noordam, R. ; Bos, M.M. ; Wang, H. ; Winkler, T.W. ; Bentley, A.R. ; Kilpeläinen, T.O. ; de Vries, P.S. ; Sung, Y.J. ; Schwander, K. ; Cade, B.E. ; Manning, A. ; Aschard, H. ; Brown, M.R. ; Chen, H. ; Franceschini, N. ; Musani, S.K. ; Richard, M. ; Vojinovic, D. ; Aslibekyan, S. ; Bartz, T.M. ; de Las Fuentes, L. ; Feitosa, M. ; Horimoto, A.R. ; Ilkov, M. ; Kho, M. ; Kraja, A. ; Li, C. ; Lim, E. ; Liu, Y. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Rankinen, T. ; Tajuddin, S.M. ; van der Spek, A. ; Wang, Z. ; Marten, J. ; Laville, V. ; Alver, M. ; Evangelou, E. ; Graff, M.E. ; He, M. ; Kühnel, B. ; Lyytikäinen, L.P. ; Marques-Vidal, P. ; Nolte, I.M. ; Palmer, N.D. ; Rauramaa, R. ; Shu, X.O. ; Snieder, H. ; Weiss, S. ; Wen, W. ; Yanek, L.R. ; Adolfo, C. ; Ballantyne, C. ; Bielak, L. ; Biermasz, N.R. ; Boerwinkle, E. ; Dimou, N. ; Eiriksdottir, G. ; Gao, C. ; Gharib, S.A. ; Gottlieb, D.J. ; Haba-Rubio, J. ; Harris, T.B. ; Heikkinen, S. ; Heinzer, R. ; Hixson, J.E. ; Homuth, G. ; Ikram, M.A. ; Komulainen, P. ; Krieger, J.E. ; Lee, J. ; Liu, J. ; Lohman, K.K. ; Luik, A.I. ; Mägi, R. ; Martin, L.W. ; Meitinger, T. ; Metspalu, A. ; Milaneschi, Y. ; Nalls, M.A. ; O'Connell, J. ; Peters, A. ; Peyser, P. ; Raitakari, O.T. ; Reiner, A.P. ; Rensen, P.C.N. ; Rice, T.K. ; Rich, S.S. ; Roenneberg, T. ; Rotter, J.I. ; Schreiner, P.J. ; Shikany, J. ; Sidney, S.S. ; Sims, M. ; Sitlani, C.M. ; Sofer, T. ; Strauch, K. ; Swertz, M.A. ; Taylor, K.D. ; Uitterlinden, A.G. ; van Duijn, C.M. ; Völzke, H. ; Waldenberger, M. ; Wallance, R.B. ; van Dijk, K.W. ; Yu, C. ; Zonderman, A.B. ; Becker, D.M. ; Elliott, P. ; Esko, T. ; Gieger, C. ; Grabe, H.J. ; Lakka, T.A. ; Lehtimäki, T. ; North, K.E. ; Penninx, B.W.J.H. ; Vollenweider, P. ; Wagenknecht, L.E. ; Wu, T. ; Xiang, Y.B. ; Zheng, W. ; Arnett, D.K. ; Bouchard, C. ; Evans, M.K. ; Gudnason, V. ; Kardia, S. ; Kelly, T.N. ; Kritchevsky, S.B. ; Loos, R.J.F. ; Pereira, A.C. ; Province, M. ; Psaty, B.M. ; Rotimi, C. ; Zhu, X. ; Amin, N. ; Cupples, L.A. ; Fornage, M. ; Fox, E.F. ; Guo, X. ; Gauderman, W.J. ; Rice, K. ; Kooperberg, C. ; Munroe, P.B. ; Liu, C.T. ; Morrison, A.C. ; Rao, D.C. ; van Heemst, D. ; Redline, S.

Multi-ancestry sleep-by-SNP interaction analysis in 126,926 individuals reveals lipid loci stratified by sleep duration.
Lect. Notes Comput. Sc. 11764 LNCS, 676-684 (2019)

Peng, T. ; Boxberg, M. ; Weichert, W. ; Navab, N. ; Marr, C.

Multi-task learning of a deep K-nearest neighbour network for histopathological image classification and retrieval.
Lect. Notes Comput. Sc. 11764 LNCS, 685-693 (2019)

Sadafi, A. ; Köhler, N. ; Makhro, A. ; Bogdanova, A. ; Navab, N. ; Marr, C. ; Peng, T.

Multiclass deep active learning for detecting red blood cell subtypes in brightfield microscopy.
Nat. Struct. Mol. Biol., DOI: 10.1038/s41594-019-0341-8 (2019)

Beltran, M. ; Tavares, M. ; Justin, N. ; Khandelwal, G. ; Ambrose, J. ; Foster, B. ; Worlock, K.B. ; Tvardovskiy, A. ; Kunzelmann, S. ; Herrero, J. ; Bartke, T. ; Gamblin, S.J. ; Wilson, J.R. ; Jenner, R.G.

Author Correction: G-tract RNA removes Polycomb repressive complex 2 from genes (Nature Structural & Molecular Biology, (2019), 26, 10, (899-909), 10.1038/s41594-019-0293-z).
2019 in
In: (Conference on Lasers and Electro-Optics Europe and European Quantum Electronics Conference, CLEO/Europe-EQEC 2019, 23-27 June 2019, Munich, Germany). 2019.:8871546

Leonardo, C. ; Kepesidis, K.V. ; Linkohr, B. ; Voronina, L. ; Huber, M. ; Trubetskov, M. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Krausz, F. ; Zigman, M.

Broadband IR-fingerprinting of human blood as a universal tool for diseases diagnostics.

Clark, D.W. ; Okada, Y. ; Moore, K.H.S. ; Mason, D. ; Pirastu, N. ; Gandin, I. ; Mattsson, H. ; Barnes, C.L.K. ; Lin, K. ; Zhao, J.H. ; Deelen, P. ; Rohde, R. ; Schurmann, C. ; Guo, X. ; Giulianini, F. ; Zhang, W. ; Medina-Gomez, C. ; Karlsson, R. ; Bao, Y. ; Bartz, T.M. ; Baumbach, C. ; Biino, G. ; Bixley, M.J. ; Brumat, M. ; Chai, J.F. ; Corre, T. ; Cousminer, D.L. ; Dekker, A.M. ; Eccles, D.A. ; van Eijk, K.R. ; Fuchsberger, C. ; Gao, H. ; Germain, M. ; Gordon, S.D. ; de Haan, H.G. ; Harris, S.E. ; Hofer, E. ; Huerta-Chagoya, A. ; Igartua, C. ; Jansen, I.E. ; Jia, Y. ; Kacprowski, T. ; Karlsson, T. ; Kleber, M.E. ; Li, S.A. ; Li-Gao, R. ; Mahajan, A. ; Matsuda, K. ; Meidtner, K. ; Meng, W. ; Montasser, M.E. ; van der Most, P.J. ; Munz, M. ; Nutile, T. ; Palviainen, T. ; Prasad, G. ; Prasad, R.B. ; Priyanka, T.D.S. ; Rizzi, F. ; Salvi, E. ; Sapkota, B.R. ; Shriner, D. ; Skotte, L. ; Smart, M.C. ; Smith, A.V. ; van der Spek, A. ; Spracklen, C.N. ; Strawbridge, R.J. ; Tajuddin, S.M. ; Trompet, S. ; Turman, C. ; Verweij, N. ; Viberti, C. ; Wang, L. ; Warren, H.R. ; Wootton, R.E. ; Yanek, L.R. ; Yao, J. ; Yousri, N.A. ; Zhao, W. ; Adeyemo, A.A. ; Afaq, S. ; Aguilar-Salinas, C.A. ; Akiyama, M. ; Albert, M.L. ; Allison, M.A. ; Alver, M. ; Aung, T. ; Azizi, F. ; Bentley, A.R. ; Boeing, H. ; Boerwinkle, E. ; Borja, J.B. ; de Borst, G.J. ; Bottinger, E.P. ; Broer, L. ; Campbell, H. ; Chanock, S. ; Chee, M.L. ; Chen, G. ; Chen, Y.I. ; Chen, Z. ; Chiu, Y.F. ; Cocca, M. ; Collins, F.S. ; Concas, M.P. ; Corley, J. ; Cugliari, G. ; van Dam, R.M. ; Damulina, A. ; Daneshpour, M.S. ; Day, F.R. ; Delgado, G.E. ; Dhana, K. ; Doney, A.S.F. ; Dörr, M. ; Doumatey, A.P. ; Dzimiri, N. ; Ebenesersdóttir, S.S. ; Elliott, J. ; Ewert, R. ; Felix, J.F. ; Fischer, K. ; Freedman, B.I. ; Girotto, G. ; Goel, A. ; Gögele, M. ; Goodarzi, M.O. ; Graff, M. ; Granot-Hershkovitz, E. ; Grodstein, F. ; Guarrera, S. ; Gudbjartsson, D.F. ; Guity, K. ; Gunnarsson, B. ; Guo, Y. ; Hagenaars, S.P. ; Haiman, C.A. ; Halevy, A. ; Harris, T.B. ; Hedayati, M. ; van Heel, D.A. ; Hirata, M. ; Höfer, I. ; Hsiung, C.A. ; Huang, J. ; Hung, Y.J. ; Ikram, M.A. ; Jagadeesan, A. ; Jousilahti, P. ; Kamatani, Y. ; Kanai, M. ; Kerrison, N.D. ; Kessler, T. ; Khaw, K.T. ; Khor, C.C. ; de Kleijn, D.P.V. ; Koh, W.P. ; Kolcic, I. ; Kraft, P. ; Krämer, B.K. ; Kutalik, Z. ; Kuusisto, J. ; Langenberg, C. ; Launer, L.J. ; Lawlor, D.A. ; Lee, I.T. ; Lee, W.J. ; Lerch, M.M. ; Li, L. ; Liu, J. ; Loh, M. ; London, S.J. ; Loomis, S.J. ; Lu, Y. ; Luan, J. ; Mägi, R. ; Manichaikul, A.W. ; Manunta, P. ; Másson, G. ; Matoba, N. ; Mei, X.W. ; Meisinger, C. ; Meitinger, T. ; Mezzavilla, M. ; Milani, L. ; Millwood, I.Y. ; Momozawa, Y. ; Moore, A. ; Morange, P.E. ; Moreno-Macías, H. ; Mori, T.A. ; Morrison, A.C. ; Muka, T. ; Murakami, Y. ; Murray, A.D. ; de Mutsert, R. ; Mychaleckyj, J.C. ; Nalls, M.A. ; Nauck, M. ; Neville, M.J. ; Nolte, I.M. ; Ong, K.K. ; Orozco, L. ; Padmanabhan, S. ; Pálsson, G. ; Pankow, J.S. ; Pattaro, C. ; Pattie, A. ; Polasek, O. ; Poulter, N. ; Pramstaller, P.P. ; Quintana-Murci, L. ; Räikkönen, K. ; Ralhan, S. ; Rao, D.C. ; van Rheenen, W. ; Rich, S.S. ; Ridker, P.M. ; Rietveld, C.A. ; Robino, A. ; van Rooij, F.J.A. ; Ruggiero, D. ; Saba, Y. ; Sabanayagam, C. ; Sabater-Lleal, M. ; Sala, C.F. ; Salomaa, V. ; Sandow, K. ; Schmidt, H. ; Scott, L.J. ; Scott, W.R. ; Sedaghati-Khayat, B. ; Sennblad, B. ; van Setten, J. ; Sever, P.J. ; Sheu, W.H. ; Shi, Y. ; Shrestha, S. ; Shukla, S.R. ; Sigurdsson, J.K. ; Sikka, T.T. ; Singh, J.R. ; Smith, B.H. ; Stancáková, A. ; Stanton, A. ; Starr, J.M. ; Stefansdottir, L. ; Straker, L. ; Sulem, P. ; Sveinbjornsson, G. ; Swertz, M.A. ; Taylor, A.M. ; Taylor, K.D. ; Terzikhan, N. ; Tham, Y.C. ; Thorleifsson, G. ; Thorsteinsdottir, U. ; Tillander, A. ; Tracy, R.P. ; Tusié-Luna, T. ; Tzoulaki, I. ; Vaccargiu, S. ; Vangipurapu, J. ; Veldink, J.H. ; Vitart, V. ; Völker, U. ; Vuoksimaa, E. ; Wakil, S.M. ; Waldenberger, M. ; Wander, G.S. ; Wang, Y.X. ; Wareham, N.J. ; Wild, S. ; Yajnik, C.S. ; Yuan, J.M. ; Zeng, L. ; Zhang, L. ; Zhou, J. ; Amin, N. ; Asselbergs, F.W. ; Bakker, S.J.L. ; Becker, D.M. ; Lehne, B. ; Bennett, D.A. ; van den Berg, L.H. ; Berndt, S.I. ; Bharadwaj, D. ; Bielak, L.F. ; Bochud, M. ; Boehnke, M. ; Bouchard, C. ; Bradfield, J.P. ; Brody, J.A. ; Campbell, A. ; Carmi, S. ; Caulfield, M.J. ; Cesarini, D. ; Chandak, G.R. ; Cheng, C.Y. ; Ciullo, M. ; Cornelis, M. ; Cusi, D. ; Smith, G.D. ; Deary, I.J. ; Dorajoo, R. ; van Duijn, C.M. ; Ellinghaus, D. ; Erdmann, J. ; Evangelou, E. ; Evans, M.K. ; Faul, J.D. ; Feenstra, B. ; Feitosa, M. ; Foisy, S. ; Franke, A. ; Friedlander, Y. ; Gasparini, P. ; Gieger, C. ; Gonzalez, C. ; Goyette, P. ; Grant, S.F.A. ; Griffiths, L.R. ; Groop, L. ; Gudnason, V. ; Gyllensten, U. ; Hakonarson, H. ; Hamsten, A. ; van der Harst, P. ; Heng, C.K. ; Hicks, A.A. ; Hochner, H. ; Huikuri, H. ; Hunt, S.C. ; Jaddoe, V.W.V. ; de Jager, P.L. ; Johannesson, M. ; Johansson, Å ; Jonas, J.B. ; Jukema, J.W. ; Junttila, J. ; Kaprio, J. ; Kardia, S.L.R. ; Karpe, F. ; Kumari, M. ; Laakso, M. ; van der Laan, S.W. ; Lahti, J. ; Laudes, M. ; Lea, R.A. ; Lieb, W. ; Lumley, T. ; Martin, N.G. ; März, W. ; Matullo, G. ; McCarthy, M.I. ; Medland, S.E. ; Merriman, T.R. ; Metspalu, A. ; Meyer, B.F. ; Mohlke, K.L. ; Montgomery, G.W. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Munroe, P.B. ; North, K.E. ; Nyholt, D.R. ; O'Connell, J.R. ; Ober, C. ; Oldehinkel, A.J. ; Palmas, W. ; Palmer, C. ; Pasterkamp, G.G. ; Patin, E. ; Pennell, C.E. ; Perusse, L. ; Peyser, P.A. ; Pirastu, M. ; Polderman, T.J.C. ; Porteous, D.J. ; Posthuma, D. ; Psaty, B.M. ; Rioux, J.D. ; Rivadeneira, F. ; Rotimi, C. ; Rotter, J.I. ; Rudan, I. ; den Ruijter, H.M. ; Sanghera, D.K. ; Sattar, N. ; Schmidt, R. ; Schulze, M.B. ; Schunkert, H. ; Scott, R.A. ; Shuldiner, A.R. ; Sim, X. ; Small, N. ; Smith, J.A. ; Sotoodehnia, N. ; Tai, E.S. ; Teumer, A. ; Timpson, N.J. ; Toniolo, D. ; Tregouet, D.A. ; Tuomi, T. ; Vollenweider, P. ; Wang, C.A. ; Weir, D.R. ; Whitfield, J.B. ; Wijmenga, C. ; Wong, T.Y. ; Wright, J. ; Yang, J. ; Yu, L. ; Zemel, B.S. ; Zonderman, A.B. ; Perola, M. ; Magnusson, P.K.E. ; Uitterlinden, A.G. ; Kooner, J.S. ; Chasman, D.I. ; Loos, R.J.F. ; Franceschini, N. ; Franke, L. ; Haley, C.S. ; Hayward, C. ; Walters, R.G. ; Perry, J.R.B. ; Esko, T. ; Helgason, A. ; Stefansson, K. ; Joshi, P.K. ; Kubo, M. ; Wilson, J.F.

Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes.
Mol. Cell 76, 531-545.e5 (2019)

Quagliarini, F. ; Mir, A.A. ; Balazs, K. ; Wierer, M. ; Dyar, K.A. ; Jouffe, C. ; Makris, K. ; Hawe, J. ; Heinig, M. ; Filipp, F.V. ; Barish, G.D. ; Uhlenhaut, N.H.

Cistromic reprogramming of the diurnal glucocorticoid hormone response by high-fat diet.

Holmberg, O. ; Kortuem, K.U. ; Köhler, N. ; Theis, F.J.

Predicting retinal thickness from fundus images across modalities using deep learning.
Genome Biol. 20:225 (2019)

Hanna, C.W. ; Pérez-Palacios, R. ; Gahurova, L. ; Schubert, M. ; Krueger, F. ; Biggins, L. ; Andrews, S. ; Colomé-Tatché, M. ; Bourc'his, D. ; Dean, W. ; Kelsey, G.

Endogenous retroviral insertions drive non-canonical imprinting in extra-embryonic tissues.
Mult. Scler. J. 25, 906-907 (2019)

Knauer-Arloth, J. ; Eraslan, G. ; Andlauer, T. ; Gieger, C. ; Gold, R. ; Heilmann-Heimbach, S. ; Kacprowski, T. ; Meitinger, T. ; Laudes, M. ; Luessi, F. ; Müller-Myhsok, B. ; Nischwitz, S. ; Peters, A. ; Paul, F. ; Rawal, R. ; Strauch, K. ; Wiendl, H. ; Hemmer, B. ; Theis, F.J. ; Binder, E. ; Müller, N.S.

Identification of functionally relevant genetic variants associated with multiple sclerosis using deep learning.
Xenotransplantation 26 (2019)

Böttcher, A. ; Tritschler, S. ; Yang, K. ; Theis, F.J. ; Lickert, H. ; Wolf, E. ; Kemter, E.

Studying in vivo beta cell maturation in pigs by scRNAseq.
Development 146:dev185025 (2019)

Bruneau, B.G. ; Koseki, H. ; Strome, S. ; Torres-Padilla, M.E.

Chromatin and epigenetics in development: A Special Issue.
Nat. Struct. Mol. Biol. 26, 899-909 (2019)

Beltran, M. ; Tavares, M. ; Justin, N. ; Khandelwal, G. ; Ambrose, J. ; Foster, B. ; Worlock, K.B. ; Kunzelmann, S. ; Herrero, J. ; Bartke, T. ; Gamblin, S.J. ; Wilson, J.R. ; Jenner, R.G.

G-tract RNA removes Polycomb repressive complex 2 from genes.
In:. 2019. 184-186 (Lect. Notes Comput. Sc. ; 11729 LNCS)

Waibel, D.J.E. ; Tiemann, U. ; Lupperger, V. ; Semb, H. ; Marr, C.

In-silico staining from bright-field and fluorescent images using deep learning.
Lect. Notes Comput. Sc. 11731 LNCS, 289-298 (2019)

Mishra, M. ; Schmitt, S. ; Zischka, H. ; Strasser, M. ; Navab, N. ; Marr, C. ; Peng, T.

Quantifying structural heterogeneity of healthy and cancerous mitochondria using a combined segmentation and classification USK-net.
Lect. Notes Comput. Sc. 11731 LNCS, v-vii (2019)

Tetko, I.V. ; Theis, F.J. ; Karpov, P. ; Kůrková, V.

Preface.
Eur. J. Immunol. 49, 48-48 (2019)

Musumeci, A. ; Lutz, K. ; Dursun, E. ; Sie, C. ; Ziegenhain, C. ; Bagnoli, J. ; Luecken, M. ; Korn, T. ; Enard, W. ; Theis, F.J. ; Krug, A.

Identification of a DC precursor population with pDC and cDC potential responding to endosomal TLR stimulation with increased pDC output.
Eur. J. Immunol. 49, 88-88 (2019)

Rausch, L. ; Kranich, J. ; Chlis, N.-K. ; Schifferer, M. ; Simons, M. ; Theis, F.J. ; Brocker, T.

Analysis of EV-decorated CD8+T cells during viral infection.

Bakhti, M. ; Scheibner, K. ; Tritschler, S. ; Bastidas-Ponce, A. ; Tarquis-Medina, M. ; Theis, F.J. ; Lickert, H.

Establishment of a high-resolution 3D modeling system for studying pancreatic epithelial cell biology in vitro.
Lect. Notes Comput. Sc. 11729 LNCS, v-vii (2019)

Tetko, I.V. ; Theis, F.J. ; Karpov, P. ; Kůrková, V.

Preface.
Lect. Notes Comput. Sc. 11728 LNCS, v-vii (2019)

Tetko, I.V. ; Theis, F.J. ; Karpov, P. ; Kůrková, V.

Preface.
Lect. Notes Comput. Sc. 11727 LNCS, v-vii (2019)

Tetko, I.V. ; Theis, F.J. ; Karpov, P. ; Kůrková, V.

Preface.
Neuron 103, 1086-1095.e5 (2019)

Mattugini, N. ; Bocchi, R. ; Scheuss, V. ; Russo, G.L. ; Torper, O. ; Lao, C.L. ; Götz, M.

Inducing different neuronal subtypes from astrocytes in the injured mouse cerebral cortex.
Nitric oxide 93, 53-70 (2019)

Kolbert, Z. ; Barroso, J.B. ; Brouquisse, R. ; Corpas, F.J. ; Gupta, K.J. ; Lindermayr, C. ; Loake, G.J. ; Palma, J.M. ; Petřivalský, M. ; Wendehenne, D. ; Hancock, J.T.

A forty year journey: The generation and roles of NO in plants.
mBio 10:e01723-19 (2019)

Pich, D. ; Mrozek-Gorska, P. ; Bouvet, M. ; Sugimoto, A. ; Akidil, E. ; Grundhoff, A. ; Hamperl, S. ; Ling, P.D. ; Hammerschmidt, W.

First days in the life of naïve human B-lymphocytes infected with Epstein-Barr Virus.
Nat. Genet. 51, 1459-1474 (2019)

Tin, A. ; Marten, J. ; Halperin Kuhns, V.L. ; Li, Y. ; Wuttke, M. ; Kirsten, H. ; Sieber, K.B. ; Qiu, C. ; Gorski, M. ; Yu, Z. ; Giri, A. ; Sveinbjornsson, G. ; Li, M. ; Chu, A.Y. ; Hoppmann, A. ; O'Connor, L.J. ; Prins, B. ; Nutile, T. ; Noce, D. ; Akiyama, M. ; Cocca, M. ; Ghasemi, S. ; van der Most, P.J. ; Horn, K. ; Xu, Y. ; Fuchsberger, C. ; Sedaghat, S. ; Afaq, S. ; Amin, N. ; Ärnlöv, J. ; Bakker, S.J.L. ; Bansal, N. ; Baptista, D. ; Bergmann, S. ; Biggs, M.L. ; Biino, G. ; Boerwinkle, E. ; Bottinger, E.P. ; Boutin, T.S. ; Brumat, M. ; Burkhardt, R. ; Campana, E. ; Campbell, A. ; Campbell, H. ; Carroll, R.J. ; Catamo, E. ; Ciullo, M. ; Concas, M.P. ; Coresh, J. ; Corre, T. ; Cusi, D. ; Felicita, S.C. ; de Borst, M.H. ; de Grandi, A. ; de Mutsert, R. ; de Vries, A.P.J. ; Delgado, G. ; Demirkan, A. ; Devuyst, O. ; Dittrich, K. ; Eckardt, K.U. ; Ehret, G. ; Endlich, K. ; Evans, M.K. ; Gansevoort, R.T. ; Gasparini, P. ; Giedraitis, V. ; Gieger, C. ; Girotto, G. ; Gögele, M. ; Gordon, S.D. ; Gudbjartsson, D.F. ; Gudnason, V. ; Haller, T. ; Hamet, P. ; Harris, T.B. ; Hayward, C. ; Hicks, A.A. ; Hofer, E. ; Holm, H. ; Huang, W. ; Hutri-Kähönen, N. ; Hwang, S.J. ; Ikram, M.A. ; Lewis, R.M. ; Ingelsson, E. ; Jakobsdottir, J. ; Jonsdottir, I. ; Jonsson, H. ; Joshi, P.K. ; Josyula, N.S. ; Jung, B. ; Kähönen, M. ; Kamatani, Y. ; Kanai, M. ; Kerr, S.M. ; Kiess, W. ; Kleber, M.E. ; Koenig, W. ; Kooner, J.S. ; Körner, A. ; Kovacs, P. ; Krämer, B.K. ; Kronenberg, F. ; Kubo, M. ; Kühnel, B. ; La Bianca, M. ; Lange, L.A. ; Lehne, B. ; Lehtimäki, T. ; Liu, J. ; Loeffler, M. ; Loos, R.J.F. ; Lyytikäinen, L.P. ; Mägi, R. ; Mahajan, A. ; Martin, N.G. ; März, W. ; Mascalzoni, D. ; Matsuda, K. ; Meisinger, C. ; Meitinger, T. ; Metspalu, A. ; Milaneschi, Y. ; O'Donnell, C.J. ; Wilson, O.D. ; Gaziano, J.M. ; Mishra, P.P. ; Mohlke, K.L. ; Mononen, N. ; Montgomery, G.W. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Müller-Nurasyid, M. ; Nadkarni, G.N. ; Nalls, M.A. ; Nauck, M. ; Nikus, K. ; Ning, B. ; Nolte, I.M. ; Noordam, R. ; O'Connell, J.R. ; Olafsson, I. ; Padmanabhan, S. ; Penninx, B.W.J.H. ; Perls, T. ; Peters, A. ; Pirastu, M. ; Pirastu, N. ; Pistis, G. ; Polasek, O. ; Ponte, B. ; Porteous, D.J. ; Poulain, T. ; Preuss, M.H. ; Rabelink, T.J. ; Raffield, L.M. ; Raitakari, O.T. ; Rettig, R. ; Rheinberger, M. ; Rice, K.M. ; Rizzi, F. ; Robino, A. ; Rudan, I. ; Krajcoviechova, A. ; Cifkova, R. ; Rueedi, R. ; Ruggiero, D. ; Ryan, K.A. ; Saba, Y. ; Salvi, E. ; Schmidt, H. ; Schmidt, R. ; Shaffer, C.M. ; Smith, A.V. ; Smith, B.H. ; Spracklen, C.N. ; Strauch, K. ; Stumvoll, M. ; Sulem, P. ; Tajuddin, S.M. ; Teren, A. ; Thiery, J. ; Thio, C.H.L. ; Thorsteinsdottir, U. ; Toniolo, D. ; Tönjes, A. ; Tremblay, J. ; Uitterlinden, A.G. ; Vaccargiu, S. ; van der Harst, P. ; van Duijn, C.M. ; Verweij, N. ; Völker, U. ; Vollenweider, P. ; Waeber, G. ; Waldenberger, M. ; Whitfield, J.B. ; Wild, S.H. ; Wilson, J.F. ; Yang, Q. ; Zhang, W. ; Zonderman, A.B. ; Bochud, M. ; Wilson, J.G. ; Pendergrass, S.A. ; Ho, K. ; Parsa, A. ; Pramstaller, P.P. ; Psaty, B.M. ; Böger, C.A. ; Snieder, H. ; Butterworth, A.S. ; Okada, Y. ; Edwards, T.L. ; Stefansson, K. ; Susztak, K. ; Scholz, M. ; Heid, I.M. ; Hung, A.M. ; Teumer, A. ; Pattaro, C. ; Woodward, O.M. ; Vitart, V. ; Köttgen, A.

Target genes, variants, tissues and transcriptional pathways influencing human serum urate levels.

Sluka, S.H.M. ; Stämpfli, S.F. ; Akhmedov, A. ; Klein-Rodewald, T. ; Sanz-Moreno, A. ; Horsch, M. ; Grest, P. ; Rothmeier, A.S. ; Rathkolb, B. ; Schrewe, A. ; Beckers, J. ; Neff, F. ; Wolf, E. ; Camici, G.G. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Hrabě de Angelis, M. ; Lüscher, T.F. ; Ruf, W. ; Tanner, F.C.

Murine tissue actor disulfide mutation causes a bleeding phenotype with sex specific organ pathology and lethality.
EMBO Rep. 20:e48552 (2019)

Glantschnig, C. ; Mattijssen, F. ; Vogl, E.S. ; Ali Khan, A. ; Rios Garcia, M. ; Fischer, K. ; Müller, T.D. ; Uhlenhaut, N.H. ; Nawroth, P.P. ; Scheideler, M. ; Rose, A.J. ; Pellegata, N.S. ; Herzig, S.

The glucocorticoid receptor in brown adipocytes is dispensable for control of energy homeostasis.

Mameishvili, E. ; Serafimidis, I. ; Iwaszkiewicz, S. ; Lesche, M. ; Reinhardt, S. ; Bölicke, N. ; Büttner, M. ; Stellas, D. ; Papadimitropoulou, A. ; Szabolcs, M. ; Anastassiadis, K. ; Dahl, A. ; Theis, F.J. ; Efstratiadis, A. ; Gavalas, A.

Aldh1b1 expression defines progenitor cells in the adult pancreas and is required for Kras-induced pancreatic cancer.
Circulation 140, 645-657 (2019)

Agha, G. ; Mendelson, M.M. ; Ward-Caviness, C.K. ; Joehanes, R. ; Huan, T. ; Gondalia, R. ; Salfati, E.L. ; Brody, J.A. ; Fiorito, G. ; Bressler, J. ; Chen, B.H. ; Ligthart, S. ; Guarrera, S. ; Colicino, E. ; Just, A.C. ; Wahl, S. ; Gieger, C. ; Vandiver, A.R. ; Tanaka, T. ; Hernandez, D.G. ; Pilling, L.C. ; Singleton, A.B. ; Sacerdote, C. ; Krogh, V. ; Panico, S. ; Tumino, R. ; Li, Y. ; Zhang, G. ; Stewart, J.D. ; Floyd, J.S. ; Wiggins, K.L. ; Rotter, J.I. ; Multhaup, M. ; Bakulski, K. ; Horvath, S. ; Tsao, P.S. ; Absher, D.M. ; Vokonas, P. ; Hirschhorn, J. ; Fallin, M.D. ; Liu, C. ; Bandinelli, S. ; Boerwinkle, E. ; Dehghan, A. ; Schwartz, J.D. ; Psaty, B.M. ; Feinberg, A.P. ; Hou, L. ; Ferrucci, L. ; Sotoodehnia, N. ; Matullo, G. ; Peters, A. ; Fornage, M. ; Assimes, T.L. ; Whitsel, E.A. ; Levy, D. ; Baccarelli, A.A.

Blood leukocyte DNA methylation predicts risk of future myocardial infarction and coronary heart disease: A longitudinal study of 11,461 participants from population-based cohorts.
Genome Biol. 20:183 (2019)

Ashuach, T. ; Fischer, D.S. ; Kreimer, A. ; Ahituv, N. ; Theis, F.J. ; Yosef, N.

MPRAnalyze: Statistical framework for massively parallel reporter assays.

Castro Dias, M. ; Coisne, C. ; Baden, P. ; Enzmann, G. ; Garrett, L. ; Becker, L. ; Hölter, S.M. ; Hrabě de Angelis, M. ; Deutsch, U. ; Engelhardt, B. ; German Mouse Clinic Consortium (Aguilar-Pimentel, J.A. ; Adler, T. ; Spielmann, N. ; Moreth, K. ; Hans, W. ; Amarie, O.V. ; Graw, J. ; Rozman, J. ; Neff, F. ; Calzada-Wack, J. ; Rathkolb, B. ; Wurst, W. ; Beckers, J. ; Östereicher, M.A. ; Miller, G. ; Maier, H. ; Stoeger, C. ; Leuchtenberger, S. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H.)

Claudin-12 is not required for blood-brain barrier tight junction function.

Ragazzini, R. ; Pérez-Palacios, R. ; Baymaz, I.H. ; Diop, S. ; Ancelin, K. ; Zielinski, D. ; Michaud, A. ; Givelet, M. ; Borsos, M. ; Aflaki, S. ; Legoix, P. ; Jansen, P.W.T.C. ; Servant, N. ; Torres-Padilla, M.E. ; Bourc'his, D. ; Fouchet, P. ; Vermeulen, M. ; Margueron, R.

EZHIP constrains Polycomb Repressive Complex 2 activity in germ cells.
Eur. Neuropsychopharmacol. 29, 1037-1037 (2019)

Czamara, D. ; Eraslan, G. ; Lahti, J. ; Figueiredo, A.S. ; Girchenko, P. ; Lahti-Pulkkinen, M. ; Hämäläinen, E. ; Kajantie, E. ; Laivuori, H. ; Villa, P. ; Reynolds, R. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Räikkönen, K. ; Binder, E.

Genotype, prenatal environment or both-what shapes the newborn´s epigenome?
Eur. Neuropsychopharmacol. 29, 1161-1161 (2019)

Schaupp, S. ; Budde, M. ; Kondofersky, I. ; Papiol, S. ; Heilbronner, U. ; Gade, K. ; Anderson-Schmidt, H. ; Kalman, J. ; Senner, F. ; Andlauer, T.F.M. ; Rietschel, M. ; Degenhardt, F. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Schulze, T.

Polygenic risk score analysis of trajectories of cognitive performance in psychiatric patients.
Eur. Neuropsychopharmacol. 29, 1257-1258 (2019)

Schulte, E. ; Kondofersky, I. ; Budde, M. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.

Polygenic burden analysis of longitudinal clusters of psychopathological features in a cross-diagnostic group of individuals with severe mental illness.
Pharmacoepidemiol. Drug Saf. 28, 585-586 (2019)

Weberpals, J. ; Becker, T. ; Schmich, F. ; Ruettinger, D. ; Theis, F.J. ; Bauer-Mehren, A.

Deep learning-based propensity score computation: Cohort study in second line treated advanced non-small cell lung cancer (aNSCLC) patients.
Front. Immunol. 10:1859 (2019)

Escoter Torres, L. ; Caratti, G. ; Mechtidou, A. ; Tuckermann, J. ; Uhlenhaut, N.H. ; Vettorazzi, S.

Fighting the fire: Mechanisms of inflammatory gene regulation by the glucocorticoid receptor.

van der Spek, A. ; Broer, L. ; Draisma, H.H.M. ; Pool, R. ; Albrecht, E. ; Beekman, M. ; Mangino, M. ; Raag, M. ; Nyholt, D.R. ; Dharuri, H.K. ; Codd, V. ; Amin, N. ; de Geus, E.J.C. ; Deelen, J. ; Demirkan, A. ; Yet, I. ; Fischer, K. ; Haller, T. ; Henders, A.K. ; Isaacs, A. ; Medland, S.E. ; Montgomery, G.W. ; Mooijaart, S.P. ; Strauch, K. ; Suchiman, H.E.D. ; Vaarhorst, A.A.M. ; van Heemst, D. ; Wang-Sattler, R. ; Whitfield, J.B. ; Willemsen, G. ; Wright, M.J. ; Martin, N.G. ; Samani, N.J. ; Metspalu, A. ; Spector, T.D. ; Boomsma, D.I. ; van Duijn, C.M. ; Gieger, C.

Metabolomics reveals a link between homocysteine and lipid metabolism and leukocyte telomere length: The ENGAGE consortium.

Tirier, S.M. ; Park, J. ; Preußer, F. ; Amrhein, L. ; Gu, Z. ; Steiger, S. ; Mallm, J.P. ; Krieger, T. ; Waschow, M. ; Eismann, B. ; Gut, M. ; Gut, I.G. ; Rippe, K. ; Schlesner, M. ; Theis, F.J. ; Fuchs, C. ; Ball, C.R. ; Glimm, H. ; Conrad, C.

Pheno-seq - linking visual features and gene expression in 3D cell culture systems.
Nat. Methods 16, 715-721 (2019)

Lotfollahi, M. ; Wolf, F.A. ; Theis, F.J.

scGen predicts single-cell perturbation responses.
Genome Biol. 20:155 (2019)

Uzbas, F. ; Opperer, F. ; Sönmezer, C. ; Shaposhnikov, D. ; Sass, S. ; Krendl, C. ; Angerer, P. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Drukker, M.

BART-Seq: cost-effective massively parallelized targeted sequencing for genomics, transcriptomics, and single-cell analysis.

Mrozek-Gorska, P. ; Buschle, A. ; Pich, D. ; Schwarzmayr, T. ; Fechtner, R. ; Scialdone, A. ; Hammerschmidt, W.

Epstein-Barr virus reprograms human B lymphocytes immediately in the prelatent phase of infection.
Plant Cell Physiol. 60, 2449-2463 (2019)

Kolbert, Z. ; Molnar, A. ; Oláh, D. ; Feigl, G. ; Horváth, E. ; Erdei, L. ; Ördög, A. ; Rudolf, E.E. ; Barth, T.K. ; Lindermayr, C.

S-nitrosothiol signaling is involved in regulating hydrogen peroxide metabolism of zinc-stressed Arabidopsis.
Cytometry A 95, 952-965 (2019)

Caicedo, J.C. ; Roth, J. ; Goodman, A. ; Becker, T. ; Karhohs, K.W. ; Broisin, M. ; Molnar, C. ; McQuin, C. ; Singh, S. ; Theis, F.J. ; Carpenter, A.E.

Evaluation of deep learning strategies for nucleus segmentation in fluorescence images.
Stem Cell Res. Ther. 10:218 (2019)

Hladik, D. ; Höfig, I. ; Oestreicher, U. ; Beckers, J. ; Matjanovski, M. ; Bao, X. ; Scherthan, H. ; Atkinson, M.J. ; Rosemann, M.

Long-term culture of mesenchymal stem cells impairs ATM-dependent recognition of DNA breaks and increases genetic instability.
Front. Immunol. 10:1515 (2019)

Patil, S. ; Heuser, C. ; de Almeida, G.P. ; Theis, F.J. ; Zielinski, C.E.

Meeting the challenges of high-dimensional single-cell data analysis in immunology.

Lepko, T. ; Pusch, M. ; Müller, T. ; Schulte, D. ; Ehses, J. ; Kiebler, M. ; Hasler, J. ; Huttner, H.B. ; Vandenbroucke, R.E. ; Vandendriessche, C. ; Modic, M. ; Martin-Villalba, A. ; Zhao, S. ; LLorens-Bobadilla, E. ; Schneider, A. ; Fischer, A. ; Breunig, C. ; Stricker, S.H. ; Götz, M. ; Ninkovic, J.

Choroid plexus-derived miR-204 regulates the number of quiescent neural stem cells in the adult brain.
Nature 571, 419-423 (2019)

Erhard, F. ; Baptista, M.A.P. ; Krammer, T. ; Hennig, T. ; Lange, M. ; Arampatzi, P. ; Jürges, C.S. ; Theis, F.J. ; Saliba, A.-E. ; Dölken, L.

scSLAM-seq reveals core features of transcription dynamics in single cells.
JAMA Cardiol. 4, 575-579 (2019)

Lamina, C. ; Kronenberg, F. ; Mack, S. ; Coassin, S. ; Rueedi, R. ; Yousri, N.A. ; Seppälä, I. ; Lp(a)-GWAS-Consortium (Gieger, C.) ; Schönherr, S. ; Forer, L. ; Erhart, G. ; Marques-Vidal, P. ; Lp(a)-GWAS-Consortium (Ried, J.S.) ; Waeber, G. ; Bergmann, S. ; Daehnhardt, D. ; Stoeckl, A. ; Raitakari, O.T. ; Kähönen, M. ; Lp(a)-GWAS-Consortium (Peters, A.) ; Lp(a)-GWAS-Consortium (Meitinger, T.) ; Lp(a)-GWAS-Consortium (Strauch, K.) ; Kedenko, L. ; Paulweber, B. ; Lehtimäki, T. ; Hunt, S.C. ; Vollenweider, P.

Estimation of the required lipoprotein(a)-lowering therapeutic effect size for reduction in coronary heart disease outcomes a mendelian randomization analysis.
Front. Genet. 10:535 (2019)

Hawe, J. ; Theis, F.J. ; Heinig, M.

Inferring interaction networks from multi-omics data.

Zhang, J. ; Buegger, F. ; Albert, A. ; Ghirardo, A. ; Winkler, J.B. ; Schnitzler, J.-P. ; Hebelstrup, K.H. ; Durner, J. ; Lindermayr, C.

Phytoglobin overexpression promotes barley growth in the presence of enhanced level of atmospheric nitric oxide.
Development 146:dev170506 (2019)

Tritschler, S. ; Büttner, M. ; Fischer, D.S. ; Lange, M. ; Bergen, V. ; Lickert, H. ; Theis, F.J.

Concepts and limitations for learning developmental trajectories from single cell genomics.

Zwarts, I. ; van Zutphen, T. ; Kruit, J.K. ; Liu, W. ; Oosterveer, M.H. ; Verkade, H.J. ; Uhlenhaut, N.H. ; Jonker, J.W.

Identification of the fructose transporter GLUT5 (SLC2A5) as a novel target of nuclear receptor LXR.
Nat. Med. 25, 1153-1163 (2019)

Vieira Braga, F.A. ; Kar, G. ; Berg, M. ; Carpaij, O.A. ; Polanski, K. ; Simon, L. ; Brouwer, S. ; Gomes, T. ; Hesse, L. ; Jiang, J. ; Fasouli, E.S. ; Efremova, M. ; Vento-Tormo, R. ; Talavera-López, C. ; Jonker, M.R. ; Affleck, K. ; Palit, S. ; Strzelecka, P.M. ; Firth, H.V. ; Mahbubani, K.T. ; Cvejic, A. ; Meyer, K.B. ; Saeb-Parsy, K. ; Luinge, M. ; Brandsma, C.A. ; Timens, W. ; Angelidis, I. ; Strunz, M. ; Koppelman, G.H. ; van Oosterhout, A.J. ; Schiller, H. B. ; Theis, F.J. ; van den Berge, M. ; Nawijn, M.C. ; Teichmann, S.A.

A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma.
Bioinformatics 35, 4834-4836 (2019)

Jeske, T. ; Huypens, P. ; Stirm, L. ; Höckele, S. ; Wurmser, C.M. ; Böhm, A. ; Weigert, C. ; Staiger, H. ; Klein, C. ; Beckers, J. ; Hastreiter, M.

DEUS: An R package for accurate small RNA profiling based on differential expression of unique sequences.

Czamara, D. ; Eraslan, G. ; Page, C.M. ; Lahti, J. ; Lahti-Pulkkinen, M. ; Hämäläinen, E. ; Kajantie, E. ; Laivuori, H. ; Villa, P.M. ; Reynolds, R.M. ; Nystad, W. ; Håberg, S.E. ; London, S.J. ; O'Donnell, K.J. ; Garg, E. ; Meaney, M.J. ; Entringer, S. ; Wadhwa, P.D. ; Buss, C. ; Jones, M.J. ; Lin, D.T.S. ; MacIsaac, J.L. ; Kobor, M.S. ; Koen, N. ; Zar, H.J. ; Koenen, K.C. ; Dalvie, S. ; Stein, D.J. ; Kondofersky, I. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Räikkönen, K. ; Binder, E.B.

Integrated analysis of environmental and genetic influences on cord blood DNA methylation in new-borns.
Hum. Mol. Genet. 28, 2062-2077 (2019)

Sharapov, S.Z. ; Tsepilov, Y.A. ; Klaric, L. ; Mangino, M. ; Thareja, G. ; Shadrina, A.S. ; Simurina, M. ; Dagostino, C. ; Dmitrieva, J. ; Vilaj, M. ; Vučković, F. ; Pavić, T. ; Stambuk, J. ; Trbojević-Akmačić, I. ; Krištić, J. ; Simunovic, J. ; Momcilovic, A. ; Campbell, H. ; Doherty, M. ; Dunlop, M.G. ; Farrington, S.M. ; Pučić-Baković, M. ; Gieger, C. ; Allegri, M. ; Louis, E. ; Georges, M. ; Suhre, K. ; Spector, T. ; Williams, F.M.K. ; Lauc, G. ; Aulchenko, Y.S.

Defining the genetic control of human blood plasma N-glycome using genome-wide association study.
Nat. Genet. 51, 957-972 (2019)

Wuttke, M. ; Li, Y. ; Li, M. ; Sieber, K.B. ; Feitosa, M.F. ; Gorski, M. ; Tin, A. ; Wang, L. ; Chu, A.Y. ; Hoppmann, A. ; Kirsten, H. ; Giri, A. ; Chai, J.F. ; Sveinbjornsson, G. ; Tayo, B.O. ; Nutile, T. ; Fuchsberger, C. ; Marten, J. ; Cocca, M. ; Ghasemi, S. ; Xu, Y. ; Horn, K. ; Noce, D. ; van der Most, P.J. ; Sedaghat, S. ; Yu, Z. ; Akiyama, M. ; Afaq, S. ; Ahluwalia, T.S. ; Almgren, P. ; Amin, N. ; Ärnlöv, J. ; Bakker, S.J.L. ; Bansal, N. ; Baptista, D. ; Bergmann, S. ; Biggs, M.L. ; Biino, G. ; Boehnke, M. ; Boerwinkle, E. ; Boissel, M. ; Bottinger, E.P. ; Boutin, T.S. ; Brenner, H. ; Brumat, M. ; Burkhardt, R. ; Butterworth, A.S. ; Campana, E. ; Campbell, A. ; Campbell, H. ; Canouil, M. ; Carroll, R.J. ; Catamo, E. ; Chambers, J.C. ; Chee, M.L. ; Chen, X. ; Cheng, C.Y. ; Cheng, Y. ; Christensen, K. ; Cifkova, R. ; Ciullo, M. ; Concas, M.P. ; Cook, J.P. ; Coresh, J. ; Corre, T. ; Sala, C.F. ; Cusi, D. ; Danesh, J. ; Daw, E.W. ; de Borst, M.H. ; de Grandi, A. ; de Mutsert, R. ; de Vries, A.P.J. ; Degenhardt, F. ; Delgado, G. ; Demirkan, A. ; di Angelantonio, E. ; Dittrich, K. ; Divers, J. ; Dorajoo, R. ; Eckardt, K.U. ; Ehret, G. ; Elliott, P. ; Endlich, K. ; Evans, M.K. ; Felix, J.F. ; Foo, V.H.X. ; Franco, O.H. ; Franke, A. ; Freedman, B.I. ; Freitag-Wolf, S. ; Friedlander, Y. ; Froguel, P. ; Gansevoort, R.T. ; Gao, H. ; Gasparini, P. ; Gaziano, J.M. ; Giedraitis, V. ; Gieger, C. ; Girotto, G. ; Giulianini, F. ; Gögele, M. ; Gordon, S.D. ; Gudbjartsson, D.F. ; Gudnason, V. ; Haller, T. ; Hamet, P. ; Harris, T.B. ; Hartman, C.A. ; Hayward, C. ; Hellwege, J.N. ; Heng, C.K. ; Hicks, A.A. ; Hofer, E. ; Huang, W. ; Hutri-Kähönen, N. ; Hwang, S.J. ; Ikram, M.A. ; Indridason, O.S. ; Ingelsson, E. ; Ising, M. ; Jaddoe, V.W.V. ; Jakobsdottir, J. ; Jonas, J.B. ; Joshi, P.K. ; Josyula, N.S. ; Jung, B. ; Kähönen, M. ; Kamatani, Y. ; Kammerer, C.M. ; Kanai, M. ; Kastarinen, M. ; Kerr, S.M. ; Khor, C.C. ; Kiess, W. ; Kleber, M.E. ; Koenig, W. ; Kooner, J.S. ; Körner, A. ; Kovacs, P. ; Kraja, A.T. ; Krajcoviechova, A. ; Kramer, H. ; Krämer, B.K. ; Kronenberg, F. ; Kubo, M. ; Kühnel, B. ; Kuokkanen, M. ; Kuusisto, J. ; La Bianca, M. ; Laakso, M. ; Lange, L.A. ; Langefeld, C.D. ; Lee, J.J. ; Lehne, B. ; Lehtimäki, T. ; Lieb, W. ; Lim, S.C. ; Lind, L. ; Lindgren, C.M. ; Liu, J. ; Loeffler, M. ; Loos, R.J.F. ; Lucae, S. ; Lukas, M.A. ; Lyytikäinen, L.P. ; Mägi, R. ; Magnusson, P.K.E. ; Mahajan, A. ; Martin, N.G. ; Martins, J. ; März, W. ; Mascalzoni, D. ; Matsuda, K. ; Meisinger, C. ; Meitinger, T. ; Melander, O. ; Metspalu, A. ; Mikaelsdottir, E.K. ; Milaneschi, Y. ; Miliku, K. ; Mishra, P.P. ; Mohlke, K.L. ; Mononen, N. ; Montgomery, G.W. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Mychaleckyj, J.C. ; Nadkarni, G.N. ; Nalls, M.A. ; Nauck, M. ; Nikus, K. ; Ning, B. ; Nolte, I.M. ; Noordam, R. ; O'Connell, J. ; O'Donoghue, M.L. ; Olafsson, I. ; Oldehinkel, A.J. ; Orho-Melander, M. ; Ouwehand, W.H. ; Padmanabhan, S. ; Palmer, N.D. ; Palsson, R. ; Penninx, B.W.J.H. ; Perls, T. ; Perola, M. ; Pirastu, M. ; Pirastu, N. ; Pistis, G. ; Podgornaia, A.I. ; Polasek, O. ; Ponte, B. ; Porteous, D.J. ; Poulain, T. ; Pramstaller, P.P. ; Preuss, M.H. ; Prins, B.P. ; Province, M.A. ; Rabelink, T.J. ; Raffield, L.M. ; Raitakari, O.T. ; Reilly, D.F. ; Rettig, R. ; Rheinberger, M. ; Rice, K.M. ; Ridker, P.M. ; Rivadeneira, F. ; Rizzi, F. ; Roberts, D.J. ; Robino, A. ; Rossing, P. ; Rudan, I. ; Rueedi, R. ; Ruggiero, D. ; Ryan, K.A. ; Saba, Y. ; Sabanayagam, C. ; Salomaa, V. ; Salvi, E. ; Saum, K.U. ; Schmidt, H. ; Schmidt, R. ; Schöttker, B. ; Schulz, C.A. ; Schupf, N. ; Shaffer, C.M. ; Shi, Y. ; Smith, A.V. ; Smith, B.H. ; Soranzo, N. ; Spracklen, C.N. ; Strauch, K. ; Stringham, H.M. ; Stumvoll, M. ; Svensson, P.O. ; Szymczak, S. ; Tai, E.S. ; Tajuddin, S.M. ; Tan, N.Y.Q. ; Taylor, K.D. ; Teren, A. ; Tham, Y.C. ; Thiery, J. ; Thio, C.H.L. ; Thomsen, H. ; Thorleifsson, G. ; Toniolo, D. ; Tönjes, A. ; Tremblay, J. ; Tzoulaki, I. ; Uitterlinden, A.G. ; Vaccargiu, S. ; van Dam, R.M. ; van der Harst, P. ; van Duijn, C.M. ; Velez Edward, D.R. ; Verweij, N. ; Vogelezang, S. ; Völker, U. ; Vollenweider, P. ; Waeber, G. ; Waldenberger, M. ; Wallentin, L. ; Wang, Y.X. ; Wang, C. ; Waterworth, D.M. ; Bin Wei, W. ; White, H. ; Whitfield, J.B. ; Wild, S.H. ; Wilson, J.F. ; Wojczynski, M.K. ; Wong, C. ; Wong, T.Y. ; Xu, L. ; Yang, Q. ; Yasuda, M. ; Yerges-Armstrong, L.M. ; Zhang, W. ; Zonderman, A.B. ; Rotter, J.I. ; Bochud, M. ; Psaty, B.M. ; Vitart, V. ; Wilson, J.G. ; Dehghan, A. ; Parsa, A. ; Chasman, D.I. ; Ho, K. ; Morris, A.P. ; Devuyst, O. ; Akilesh, S. ; Pendergrass, S.A. ; Sim, X. ; Böger, C.A. ; Okada, Y. ; Edwards, T.L. ; Snieder, H. ; Stefansson, K. ; Hung, A.M. ; Heid, I.M. ; Scholz, M. ; Teumer, A. ; Köttgen, A. ; Pattaro, C.

A catalog of genetic loci associated with kidney function from analyses of a million individuals.
Am. J. Epidemiol. 188, 991-1012 (2019)

Yu, B. ; Zanetti, K.A. ; Temprosa, M. ; Albanes, D. ; Appel, N. ; Barrera, C.B. ; Ben-Shlomo, Y. ; Boerwinkle, E. ; Casas, J.P. ; Clish, C. ; Dale, C.E. ; Dehghan, A. ; Derkach, A. ; Eliassen, A.H. ; Elliott, P. ; Fahy, E. ; Gieger, C. ; Gunter, M.J. ; Harada, S. ; Harris, T. ; Herr, D.R. ; Herrington, D. ; Hirschhorn, J.N. ; Hoover, E. ; Hsing, A.W. ; Johansson, M. ; Kelly, R.S. ; Khoo, C.M. ; Kivimäki, M. ; Kristal, B.S. ; Langenberg, C. ; Lasky-Su, J. ; Lawlor, D.A. ; Lotta, L.A. ; Mangino, M. ; Le Marchand, L. ; Mathé, E. ; Matthews, C.E. ; Menni, C. ; Mucci, L.A. ; Murphy, R. ; Oresič, M. ; Orwoll, E.S. ; Ose, J. ; Pereira, A.C. ; Playdon, M.C. ; Poston, L. ; Price, J. ; Qi, Q. ; Rexrode, K. ; Risch, A. ; Sampson, J. ; Seow, W.J. ; Sesso, H.D. ; Shah, S.H. ; Shu, X.O. ; Smith, G.C.S. ; Sovio, U. ; Stevens, V.L. ; Stolzenberg-Solomon, R.S. ; Takebayashi, T. ; Tillin, T. ; Travis, R. ; Tzoulaki, I. ; Ulrich, C.M. ; Vasan, R.S. ; Verma, M. ; Wang, Y. ; Wareham, N.J. ; Wong, A. ; Younes, N. ; Zhao, H. ; Zheng, W. ; Moore, S.C.

The consortium of metabolomics studies (COMETS): Metabolomics in 47 prospective cohort studies.

Bastidas-Ponce, A. ; Tritschler, S. ; Dony, L. ; Scheibner, K. ; Tarquis-Medina, M. ; Salinno, C. ; Schirge, S. ; Burtscher, I. ; Böttcher, A. ; Theis, F.J. ; Lickert, H. ; Bakhti, M.

Comprehensive single cell mRNA profiling reveals a detailed roadmap for pancreatic endocrinogenesis.
Nature 569, 342-343 (2019)

Theis, F.J. ; Lickert, H.

A map of beta-cell differentiation.
Curr. Opin. Genet. Dev. 55, 52-58 (2019)

Jansz, N. ; Torres-Padilla, M.E.

Genome activation and architecture in the early mammalian embryo.
Hum. Mol. Genet. 28, 2615-2633 (2019)

Sung, Y.J. ; de Las Fuentes, L. ; Winkler, T.W. ; Chasman, D.I. ; Bentley, A.R. ; Kraja, A.T. ; Ntalla, I. ; Warren, H.R. ; Guo, X. ; Schwander, K. ; Manning, A.K. ; Brown, M.R. ; Aschard, H. ; Feitosa, M.F. ; Franceschini, N. ; Lu, Y. ; Cheng, C.Y. ; Sim, X. ; Vojinovic, D. ; Marten, J. ; Musani, S.K. ; Kilpeläinen, T.O. ; Richard, M.A. ; Aslibekyan, S. ; Bartz, T.M. ; Dorajoo, R. ; Li, C. ; Liu, Y. ; Rankinen, T. ; Smith, A.V. ; Tajuddin, S.M. ; Tayo, B.O. ; Zhao, W. ; Zhou, Y. ; Matoba, N. ; Sofer, T. ; Alver, M. ; Amini, M. ; Boissel, M. ; Chai, J.F. ; Chen, X. ; Divers, J. ; Gandin, I. ; Gao, C. ; Giulianini, F. ; Goel, A. ; Harris, S.E. ; Hartwig, F.P. ; He, M. ; Horimoto, A.R.V.R. ; Hsu, F.C. ; Jackson, A.U. ; Kammerer, C.M. ; Kasturiratne, A. ; Komulainen, P. ; Kühnel, B. ; Leander, K. ; Lee, W.J. ; Lin, K.H. ; Luan, J. ; Lyytikäinen, L.P. ; McKenzie, C.A. ; Nelson, C.P. ; Noordam, R. ; Scott, R.A. ; Sheu, W.H.H. ; Stancáková, A. ; Takeuchi, F. ; van der Most, P.J. ; Varga, T.V. ; Waken, R.J. ; Wang, H. ; Wang, Y. ; Ware, E.B. ; Weiss, S. ; Wen, W. ; Yanek, L.R. ; Zhang, W. ; Zhao, J.H. ; Afaq, S. ; Alfred, T. ; Amin, N. ; Arking, D.E. ; Aung, T. ; Barr, R.G. ; Bielak, L.F. ; Boerwinkle, E. ; Bottinger, E.P. ; Braund, P.S. ; Brody, J.A. ; Broeckel, U. ; Cade, B. ; Campbell, A. ; Canouil, M. ; Chakravarti, A. ; Cocca, M. ; Collins, F.S. ; Connell, J.M. ; de Mutsert, R. ; de Silva, H.J. ; Dörr, M. ; Duan, Q. ; Eaton, C.B. ; Ehret, G. ; Evangelou, E. ; Faul, J.D. ; Forouhi, N.G. ; Franco, O.H. ; Friedlander, Y. ; Gao, H. ; Gigante, B. ; Gu, C.C. ; Gupta, P. ; Hagenaars, S.P. ; Harris, T.B. ; He, J. ; Heikkinen, S. ; Heng, C.K. ; Hofman, A. ; Howard, B.V. ; Hunt, S.C. ; Irvin, M.R. ; Jia, Y. ; Katsuya, T. ; Kaufman, J. ; Kerrison, N.D. ; Khor, C.C. ; Koh, W.P. ; Koistinen, H.A. ; Kooperberg, C.B. ; Krieger, J.E. ; Kubo, M. ; Kutalik, Z. ; Kuusisto, J. ; Lakka, T.A. ; Langefeld, C.D. ; Langenberg, C. ; Launer, L.J. ; Lee, J.H. ; Lehne, B. ; Levy, D. ; Lewis, C.E. ; Li, Y. ; Lim, S.H. ; Liu, C.T. ; Liu, J. ; Loh, M. ; Lohman, K.K. ; Louie, T. ; Mägi, R. ; Matsuda, K. ; Meitinger, T. ; Metspalu, A. ; Milani, L. ; Momozawa, Y. ; Mosley, T.H. ; Nalls, M.A. ; Nasri, U. ; O'Connell, J.R. ; Ogunniyi, A. ; Palmas, W.R. ; Palmer, N.D. ; Pankow, J.S. ; Pedersen, N.L. ; Peters, A. ; Peyser, P.A. ; Polasek, O. ; Porteous, D. ; Raitakari, O.T. ; Renström, F. ; Rice, T.K. ; Ridker, P.M. ; Robino, A. ; Robinson, J.G. ; Rose, L.M. ; Rudan, I. ; Sabanayagam, C. ; Salako, B.L. ; Sandow, K. ; Schmidt, C.O. ; Schreiner, P.J. ; Scott, W.R. ; Sever, P. ; Sims, M. ; Sitlani, C.M. ; Smith, B.H. ; Smith, J.A. ; Snieder, H. ; Starr, J.M. ; Strauch, K. ; Tang, H. ; Taylor, K.D. ; Teo, Y.Y. ; Tham, Y.C. ; Uitterlinden, A.G. ; Waldenberger, M. ; Wang, L. ; Wang, Y.X. ; Wei, W.B. ; Wilson, G. ; Wojczynski, M.K. ; Xiang, Y.B. ; Yao, J. ; Yuan, J.M. ; Zonderman, A.B. ; Becker, D.M. ; Boehnke, M. ; Bowden, D.W. ; Chambers, J.C. ; Chen, Y.I. ; Weir, D.R. ; de Faire, U. ; Deary, I.J. ; Esko, T. ; Farrall, M. ; Forrester, T. ; Freedman, B.I. ; Froguel, P. ; Gasparini, P. ; Gieger, C. ; Horta, B.L. ; Hung, Y.J. ; Jonas, J.B. ; Kato, N. ; Kooner, J.S. ; Laakso, M. ; Lehtimäki, T. ; Liang, K.W. ; Magnusson, P.K.E. ; Oldehinkel, A.J. ; Pereira, A.C. ; Perls, T. ; Rauramaa, R. ; Redline, S. ; Rettig, R. ; Samani, N.J. ; Scott, J. ; Shu, X.O. ; van der Harst, P. ; Wagenknecht, L.E. ; Wareham, N.J. ; Watkins, H. ; Wickremasinghe, A.R. ; Wu, T. ; Kamatani, Y. ; Laurie, C.C. ; Bouchard, C. ; Cooper, R.S. ; Evans, M.K. ; Gudnason, V. ; Hixson, J. ; Kardia, S.L.R. ; Kritchevsky, S.B. ; Psaty, B.M. ; van Dam, R.M. ; Arnett, D.K. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Fornage, M. ; Fox, E.R. ; Hayward, C. ; van Duijn, C.M. ; Tai, E.S. ; Wong, T.Y. ; Loos, R.J.F. ; Reiner, A.P. ; Rotimi, C.N. ; Bierut, L.J. ; Zhu, X. ; Cupples, L.A. ; Province, M.A. ; Rotter, J.I. ; Franks, P.W. ; Rice, K. ; Elliott, P. ; Caulfield, M.J. ; Gauderman, W.J. ; Munroe, P.B. ; Rao, D.C. ; Morrison, A.C.

A multi-ancestry genome-wide study incorporating gene-smoking interactions identifies multiple new loci for pulse pressure and mean arterial pressure.
Nature 569, 729-733 (2019)

Borsos, M. ; Perricone, S.M. ; Schauer, T. ; Pontabry, J. ; de Luca, K.L. ; de Vries, S.S. ; Ruiz-Morales, E.R. ; Torres-Padilla, M.E. ; Kind, J.

Genome-lamina interactions are established de novo in the early mouse embryo.
Nature 570, 71-76 (2019)

Flannick, J. ; Mercader, J.M. ; Fuchsberger, C. ; Udler, M.S. ; Mahajan, A. ; Wessel, J. ; Teslovich, T.M. ; Caulkins, L. ; Koesterer, R. ; Barajas-Olmos, F. ; Blackwell, T.W. ; Boerwinkle, E. ; Brody, J.A. ; Centeno-Cruz, F. ; Chen, L. ; Chen, S. ; Contreras-Cubas, C. ; Córdova, E. ; Correa, A. ; Cortes, M. ; DeFronzo, R.A. ; Dolan, L. ; Drews, K.L. ; Elliott, A. ; Floyd, J.S. ; Gabriel, S. ; Garay-Sevilla, M.E. ; García-Ortiz, H. ; Gross, M. ; Han, S. ; Heard-Costa, N.L. ; Jackson, A.U. ; Jørgensen, M.E. ; Kang, H.M. ; Kelsey, M. ; Kim, B.J. ; Koistinen, H.A. ; Kuusisto, J. ; Leader, J.B. ; Linneberg, A. ; Liu, C.T. ; Liu, J. ; Lyssenko, V. ; Manning, A.K. ; Marcketta, A. ; Malacara-Hernandez, J.M. ; Martínez-Hernández, A. ; Matsuo, K. ; Mayer-Davis, E. ; Mendoza-Caamal, E. ; Mohlke, K.L. ; Morrison, A.C. ; Ndungu, A. ; Ng, M.C.Y. ; O'Dushlaine, C. ; Payne, A.J. ; Pihoker, C. ; Post, W.S. ; Preuss, M. ; Psaty, B.M. ; Vasan, R.S. ; Rayner, N.W. ; Reiner, A.P. ; Revilla-Monsalve, C. ; Robertson, N.R. ; Santoro, N. ; Schurmann, C. ; So, W.Y. ; Soberón, X. ; Stringham, H.M. ; Strom, T.M. ; Tam, C.H.T. ; Thameem, F. ; Tomlinson, B. ; Torres, J.M. ; Tracy, R.P. ; van Dam, R.M. ; Vujkovic, M.R. ; Wang, S. ; Welch, R.P. ; Witte, D.R. ; Wong, T.Y. ; Atzmon, G. ; Barzilai, N. ; Blangero, J. ; Bonnycastle, L.L. ; Bowden, D.W. ; Chambers, J.C. ; Chan, E. ; Cheng, C.Y. ; Cho, Y.S. ; Collins, F.S. ; de Vries, P.S. ; Duggirala, R. ; Glaser, B. ; Gonzalez, C. ; Gonzalez, M.E. ; Groop, L. ; Kooner, J.S. ; Kwak, S.H. ; Laakso, M. ; Lehman, D.M. ; Nilsson, P. ; Spector, T.D. ; Tai, E.S. ; Tuomi, T. ; Tuomilehto, J. ; Wilson, J.G. ; Aguilar-Salinas, C.A. ; Bottinger, E.B. ; Burke, B. ; Carey, D.J. ; Chan, J.C.N. ; Dupuis, J. ; Frossard, P. ; Heckbert, S.R. ; Hwang, M.Y. ; Kim, Y.J. ; Kirchner, H.L. ; Lee, J.Y. ; Lee, J. ; Loos, R.J.F. ; Ma, R.C.W. ; Morris, A.D. ; O'Donnell, C.J. ; Palmer, C.N.A. ; Pankow, J. ; Park, K.S. ; Rasheed, A. ; Saleheen, D. ; Sim, X. ; Small, K.S. ; Teo, Y.Y. ; Haiman, C. ; Hanis, C.L. ; Henderson, B.E. ; Orozco, L. ; Tusié-Luna, T. ; Dewey, F.E. ; Baras, A. ; Gieger, C. ; Meitinger, T. ; Strauch, K. ; Lange, L.A. ; Grarup, N. ; Hansen, T. ; Pedersen, O. ; Zeitler, P. ; Dabelea, D. ; Abecasis, G. ; Bell, G.I. ; Cox, N.J. ; Seielstad, M. ; Sladek, R. ; Meigs, J.B. ; Rich, S.S. ; Rotter, J.I. ; Altshuler, D. ; Burtt, N.P. ; Scott, L.J. ; Morris, A.P. ; Florez, J.C. ; McCarthy, M.I. ; Boehnke, M.

Exome sequencing of 20,791 cases of type 2 diabetes and 24,440 controls.
PLoS ONE 14:e0216110 (2019)

Matejka, K. ; Stückler, F. ; Salomon, M. ; Ensenauer, R. ; Reischl, E. ; Hoerburger, L. ; Grallert, H. ; Kastenmüller, G. ; Peters, A. ; Daniel, H. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Hauner, H. ; Laumen, H.

Dynamic modelling of an ACADS genotype in fatty acid oxidation - Application of cellular models for the analysis of common genetic variants.

Zannas, A.S. ; Jia, M. ; Hafner, K. ; Baumert, J.J. ; Wiechmann, T. ; Pape, J.C. ; Knauer-Arloth, J. ; Ködel, M. ; Martinelli, S. ; Roitman, M. ; Röh, S. ; Haehle, A. ; Emeny, R.T. ; Iurato, S. ; Carrillo-Roa, T. ; Lahti, J. ; Räikkönen, K. ; Eriksson, J.G. ; Drake, A.J. ; Waldenberger, M. ; Wahl, S. ; Kunze, S. ; Lucae, S. ; Bradley, B. ; Gieger, C. ; Hausch, F. ; Smith, A.K. ; Ressler, K.J. ; Müller-Myhsok, B. ; Ladwig, K.-H. ; Rein, T. ; Gassen, N.C. ; Binder, E.B.

Epigenetic upregulation of FKBP5 by aging and stress contributes to NF-kappa B-driven inflammation and cardiovascular risk.
Eur. Heart J. 40, 2883-2896 (2019)

Tzoulaki, I. ; Castagné, R. ; Boulangé, C.L. ; Karaman, I. ; Chekmeneva, E. ; Evangelou, E. ; Ebbels, T.M.D. ; Kaluarachchi, M.R. ; Chadeau-Hyam, M. ; Mosen, D. ; Dehghan, A. ; Moayyeri, A. ; Ferreira, D.L.S. ; Guo, X. ; Rotter, J.I. ; Taylor, K.D. ; Kavousi, M. ; de Vries, P.S. ; Lehne, B. ; Loh, M. ; Hofman, A. ; Nicholson, J.K. ; Chambers, J. ; Gieger, C. ; Holmes, E. ; Tracy, R. ; Kooner, J. ; Greenland, P. ; Franco, O.H. ; Herrington, D. ; Lindon, J.C. ; Elliott, P.

Serum metabolic signatures of coronary and carotid atherosclerosis and subsequent cardiovascular disease.

Baumann, V. ; Wiesbeck, M. ; Breunig, C.T. ; Braun, J.M. ; Köferle, A. ; Ninkovic, J. ; Götz, M. ; Stricker, S.H.

Targeted removal of epigenetic barriers during transcriptional reprogramming.
2019 in
Poster: CSH meeting: mechanisms of metabolic signaling, 14 May 2019, Cold Spring Harbour, NY, USA. (2019)

Pellegrino, J. ; Shahjahanpour, A. ; Lukauskas, S. ; Olayo Alarcon, R. ; Ramakrishnan, A. ; Colomé-Tatché, M. ; Schneider, R.

Glucose starvation in Huh7 cells triggers a transcriptional memory.
2019 in
Poster: RECOMB 2019, 4-8 May 2019, Washington D.C.. (2019)

Hawe, J. ; Lehne, B. ; Waldenberger, M. ; Gieger, C. ; Chambers, J. ; Heinig, M.

Reconstructing regulatory networks from multi-omics data using prior information.
Am. J. Epidemiol. 188, 1033-1054 (2019)

de Vries, P.S. ; Brown, M.R. ; Bentley, A.R. ; Sung, Y.J. ; Winkler, T.W. ; Ntalla, I. ; Schwander, K. ; Kraja, A.T. ; Guo, X. ; Franceschini, N. ; Cheng, C.Y. ; Sim, X. ; Vojinovic, D. ; Huffman, J.E. ; Musani, S.K. ; Li, C. ; Feitosa, M.F. ; Richard, M.A. ; Noordam, R. ; Aschard, H. ; Bartz, T.M. ; Bielak, L.F. ; Deng, X. ; Dorajoo, R. ; Lohman, K.K. ; Manning, A.K. ; Rankinen, T. ; Smith, A.V. ; Tajuddin, S.M. ; Evangelou, E. ; Graff, M. ; Alver, M. ; Boissel, M. ; Chai, J.F. ; Chen, X. ; Divers, J. ; Gandin, I. ; Gao, C. ; Goel, A. ; Hagemeijer, Y. ; Harris, S.E. ; Hartwig, F.P. ; He, M. ; Horimoto, A.R.V.R. ; Hsu, F.C. ; Jackson, A.U. ; Kasturiratne, A. ; Komulainen, P. ; Kühnel, B. ; Laguzzi, F. ; Lee, J.H. ; Luan, J. ; Lyytikäinen, L.P. ; Matoba, N. ; Nolte, I.M. ; Pietzner, M. ; Riaz, M. ; Said, M.A. ; Scott, R.A. ; Sofer, T. ; Stancáková, A. ; Takeuchi, F. ; Tayo, B.O. ; van der Most, P.J. ; Varga, T.V. ; Wang, Y. ; Ware, E.B. ; Wen, W. ; Yanek, L.R. ; Zhang, W. ; Zhao, J.H. ; Afaq, S. ; Amin, N. ; Amini, M. ; Arking, D.E. ; Aung, T. ; Ballantyne, C. ; Boerwinkle, E. ; Broeckel, U. ; Campbell, A. ; Canouil, M. ; Charumathi, S. ; Chen, Y.I. ; Connell, J.M. ; de Faire, U. ; de Las Fuentes, L. ; de Mutsert, R. ; de Silva, H.J. ; Ding, J. ; Dominiczak, A.F. ; Duan, Q. ; Eaton, C.B. ; Eppinga, R.N. ; Faul, J.D. ; Fisher, V. ; Forrester, T. ; Franco, O.H. ; Friedlander, Y. ; Ghanbari, M. ; Giulianini, F. ; Grabe, H.J. ; Grove, M.L. ; Gu, C.C. ; Harris, T.B. ; Heikkinen, S. ; Heng, C.K. ; Hirata, M. ; Hixson, J.E. ; Howard, B.V. ; Ikram, M.A. ; Jacobs, D.R. ; Johnson, C. ; Jonas, J.B. ; Kammerer, C.M. ; Katsuya, T. ; Khor, C.C. ; Kilpeläinen, T.O. ; Koh, W.P. ; Koistinen, H.A. ; Kolcic, I. ; Kooperberg, C. ; Krieger, J.E. ; Kritchevsky, S.B. ; Kubo, M. ; Kuusisto, J. ; Lakka, T.A. ; Langefeld, C.D. ; Langenberg, C. ; Launer, L.J. ; Lehne, B. ; Lemaitre, R.N. ; Li, Y. ; Liang, J. ; Liu, J. ; Liu, K. ; Loh, M. ; Louie, T. ; Mägi, R. ; Manichaikul, A.W. ; McKenzie, C.A. ; Meitinger, T. ; Metspalu, A. ; Milaneschi, Y. ; Milani, L. ; Mohlke, K.L. ; Mosley, T.H. ; Mukamal, K.J. ; Nalls, M.A. ; Nauck, M. ; Nelson, C.P. ; Sotoodehnia, N. ; O'Connell, J.R. ; Palmer, N.D. ; Pazoki, R. ; Pedersen, N.L. ; Peters, A. ; Peyser, P.A. ; Polasek, O. ; Poulter, N. ; Raffel, L.J. ; Raitakari, O.T. ; Reiner, A.P. ; Rice, T.K. ; Rich, S.S. ; Robino, A. ; Robinson, J.G. ; Rose, L.M. ; Rudan, I. ; Schmidt, C.O. ; Schreiner, P.J. ; Scott, W.R. ; Sever, P. ; Shi, Y. ; Sidney, S. ; Sims, M. ; Smith, B.H. ; Smith, J.A. ; Snieder, H. ; Starr, J.M. ; Strauch, K. ; Tan, N. ; Taylor, K.D. ; Teo, Y.Y. ; Tham, Y.C. ; Uitterlinden, A.G. ; van Heemst, D. ; Vuckovic, D. ; Waldenberger, M. ; Wang, L. ; Wang, Z. ; Wei, W.B. ; Williams, C. ; Wilson, G. ; Wojczynski, M.K. ; Yao, J. ; Yu, B. ; Yu, C. ; Yuan, J.M. ; Zhao, W. ; Zonderman, A.B. ; Becker, D.M. ; Boehnke, M. ; Bowden, D.W. ; Chambers, J.C. ; Deary, I.J. ; Esko, T. ; Farrall, M. ; Franks, P.W. ; Freedman, B.I. ; Froguel, P. ; Gasparini, P. ; Gieger, C. ; Horta, B.L. ; Kamatani, Y. ; Kato, N. ; Kooner, J.S. ; Laakso, M. ; Leander, K. ; Lehtimäki, T. ; Magnusson, P.K.E. ; Penninx, B. ; Pereira, A.C. ; Rauramaa, R. ; Samani, N.J. ; Scott, J. ; Shu, X.O. ; van der Harst, P. ; Wagenknecht, L.E. ; Wang, Y.X. ; Wareham, N.J. ; Watkins, H. ; Weir, D.R. ; Wickremasinghe, A.R. ; Zheng, W. ; Elliott, P. ; North, K.E. ; Bouchard, C. ; Evans, M.K. ; Gudnason, V. ; Liu, C.T. ; Liu, Y. ; Psaty, B.M. ; Ridker, P.M. ; van Dam, R.M. ; Kardia, S.L.R. ; Zhu, X. ; Rotimi, C.N. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Fornage, M. ; Kelly, T.N. ; Fox, E.R. ; Hayward, C. ; van Duijn, C.M. ; Tai, E.S. ; Wong, T.Y. ; Rotter, J.I. ; Gauderman, W.J. ; Province, M.A. ; Munroe, P.B. ; Rice, K. ; Chasman, D.I. ; Cupples, L.A. ; Rao, D.C. ; Morrison, A.C.

Multiancestry genome-wide association study of lipid levels incorporating gene-alcohol interactions.

Ignatova, V.V. ; Jansen, P.W.T.C. ; Baltissen, M.P. ; Vermeulen, M. ; Schneider, R.

The interactome of a family of potential methyltransferases in HeLa cells.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 61, 31-41 (2019)

Schiller, H. B. ; Montoro, D.T. ; Simon, L. ; Rawlins, E.L. ; Meyer, K.B. ; Strunz, M. ; Vieira Braga, F. ; Timens, W. ; Koppelman, G.H. ; Budinger, G.R.S. ; Burgess, J.K. ; van den Berge, M. ; Theis, F.J. ; Regev, A. ; Kaminski, N. ; Rajagopal, J. ; Teichmann, S.A. ; Misharin, A.V. ; Nawijn, M.C.

The Human Lung Cell Atlas: A high-resolution reference map of the human lung in health and disease.
EBioMedicine 43, 562-575 (2019)

Ballester-Lopez, C. ; Conlon, T.M. ; Ertüz, Z. ; Greiffo, F.R. ; Irmler, M. ; Verleden, S.E. ; Beckers, J. ; Fernandez, I.E. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

The Notch ligand DNER regulates macrophage IFN gamma release in chronic obstructive pulmonary disease.

Laimighofer, M. ; Lickert, R. ; Fuerst, R. ; Theis, F.J. ; Winkler, C. ; Bonifacio, E. ; Ziegler, A.-G. ; Krumsiek, J.

Common patterns of gene regulation associated with Cesarean section and the development of islet autoimmunity - indications of immune cell activation.
Nat. Rev. Genet. 20, 389-403 (2019)

Eraslan, G. ; Avsec, Ž. ; Gagneur, J. ; Theis, F.J.

Deep learning: New computational modelling techniques for genomics.

Vetrivel, S. ; Tiso, N. ; Kügler, A. ; Irmler, M. ; Horsch, M. ; Beckers, J. ; Hladik, D. ; Giesert, F. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Sabrautzki, S. ; Adler, T. ; Treise, I. ; Busch, D.H. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Ollert, M. ; Götz, A. ; Amarie, O.V. ; Stöger, T. ; Schulz, H. ; Becker, L. ; Klopstock, T. ; Schrewe, A. ; Spielmann, N. ; Bekeredjian, R. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Zimprich, A. ; Wurst, W. ; Mayer-Kuckuk, P. ; Hans, W. ; Rozman, J. ; Klingenspor, M. ; Neff, F. ; da Silva Buttkus, P. ; Calzada-Wack, J. ; Rácz, I. ; Zimmer, A. ; Rathkolb, B. ; Wolf, E. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Östereicher, M.A. ; Miller, G. ; Steinkamp, R. ; Lengger, C. ; Maier, H. ; Stoeger, C. ; Leuchtenberger, S. ; Hrabě de Angelis, M. ; Graw, J.

Mutation in the mouse histone gene Hist2h3c1 leads to degeneration of the lens vesicle and severe microphthalmia.
Nat. Genet. 51, 636-648 (2019)

Bentley, A.R. ; Sung, Y.J. ; Brown, M.R. ; Winkler, T.W. ; Kraja, A.T. ; Ntalla, I. ; Schwander, K. ; Chasman, D. ; Lim, E. ; Deng, X. ; Guo, X. ; Liu, J. ; Lu, Y. ; Cheng, C. ; Sim, X. ; Vojinovic, D. ; Huffman, J.E. ; Musani, S.K. ; Li, C. ; Feitosa, M.F. ; Richard, M.A. ; Noordam, R. ; Baker, J. ; Chen, G. ; Aschard, H. ; Bartz, T.M. ; Ding, J. ; Dorajoo, R. ; Manning, A.K. ; Rankinen, T. ; Smith, A. ; Tajuddin, S.M. ; Zhao, W. ; Graff, M. ; Alver, M. ; Boissel, M. ; Chai, J.F. ; Chen, X. ; Divers, J. ; Evangelou, E. ; Gao, C. ; Goel, A. ; Hagemeijer, Y. ; Harris, S.E. ; Hartwig, F.P. ; He, M. ; Horimoto, A.R.V.R. ; Hsu, F.-C. ; Hung, Y. ; Jackson, A.U. ; Kasturiratne, A. ; Komulainen, P. ; Kühnel, B. ; Leander, K. ; Lin, K. ; Luan, J. ; Lyytikainen, L. ; Matoba, N. ; Nolte, I.M. ; Pietzner, M. ; Prins, B. ; Riaz, M. ; Robino, A. ; Said, M.A. ; Schupf, N. ; Scott, R.A. ; Sofer, T. ; Stancáková, A. ; Takeuchi, F. ; Tayo, B.O. ; van der Most, P.J. ; Varga, T.V. ; Wang, T. ; Wang, Y. ; Ware, E.B. ; Wen, W. ; Xiang, Y. ; Yanek, L.R. ; Zhang, W. ; Zhao, J.H. ; Adeyemo, A. ; Afaq, S. ; Amin, N. ; Amini, M. ; Arking, D.E. ; Arzumanyan, Z. ; Aung, T. ; Ballantyne, C. ; Barr, R.G. ; Bielak, L.F. ; Boerwinkle, E. ; Bottinger, E.P. ; Broeckel, U. ; Brown, M. ; Cade, B.E. ; Campbell, A. ; Canouil, M. ; Charumathi, S. ; Chen, Y.I. ; Christensen, K. ; Concas, M.P. ; Connell, J.M. ; de Las Fuentes, L. ; de Silva, H.J. ; de Vries, P.S. ; Doumatey, A. ; Duan, Q. ; Eaton, C.B. ; Eppinga, R.N. ; Faul, J.D. ; Floyd, J.S. ; Forouhi, N.G. ; Forrester, T. ; Friedlander, Y. ; Gandin, I. ; Gao, H. ; Ghanbari, M. ; Gharib, S.A. ; Gigante, B. ; Giulianini, F. ; Grabe, H.J. ; Gu, C.C. ; Harris, T.B. ; Heikkinen, S. ; Heng, C. ; Hirata, M. ; Hixson, J.E. ; Ikram, M.A. ; Jia, Y. ; Joehanes, R. ; Johnson, C. ; Jonas, J.B. ; Justice, A.E. ; Katsuya, T. ; Khor, C.C. ; Kilpeläinen, T.O. ; Koh, W. ; Kolcic, I. ; Kooperberg, C. ; Krieger, J.E. ; Kritchevsky, S.B. ; Kubo, M. ; Kuusisto, J. ; Lakka, T.A. ; Langefeld, C.D. ; Langenberg, C. ; Launer, L.J. ; Lehne, B. ; Lewis, C.E. ; Li, Y. ; Liang, J. ; Lin, S. ; Liu, C. ; Liu, K. ; Loh, M. ; Lohman, K.K. ; Louie, T. ; Luzzi, A. ; Mägi, R. ; Mahajan, A. ; Manichaikul, A.W. ; McKenzie, C.A. ; Meitinger, T. ; Metspalu, A. ; Milaneschi, Y. ; Milani, L. ; Mohlke, K.L. ; Momozawa, Y. ; Morris, A.P. ; Murray, A.D. ; Nalls, M.A. ; Nauck, M. ; Nelson, C.P. ; North, K.E. ; O'Connell, J.R. ; Palmer, N.D. ; Papanicolau, G.J. ; Pedersen, N.L. ; Peters, A. ; Peyser, P.A. ; Polasek, O. ; Poulter, N. ; Raitakari, O.T. ; Reiner, A.P. ; Renström, F. ; Rice, T.K. ; Rich, S.S. ; Robinson, J.G. ; Rose, L.M. ; Rosendaal, F.R. ; Rudan, I. ; Schmidt, C.O. ; Schreiner, P.J. ; Scott, W.R. ; Sever, P. ; Shi, Y. ; Sidney, S. ; Sims, M. ; Smith, J.A. ; Snieder, H. ; Starr, J.M. ; Strauch, K. ; Stringham, H.M. ; Tan, N.Y.Q. ; Tang, H. ; Taylor, K.D. ; Teo, Y.Y. ; Tham, Y.C. ; Tiemeier, H. ; Turner, S.T. ; Uitterlinden, A.G. ; van Heemst, D. ; Waldenberger, M. ; Wang, H. ; Wang, L. ; Wei, W.B. ; Williams, C.A. ; Wilson, G. ; Wojczynski, M.K. ; Yao, J. ; Young, K. ; Yu, C. ; Yuan, J. ; Zhou, J. ; Zonderman, A.B. ; Becker, D.M. ; Boehnke, M. ; Bowden, D.W. ; Chambers, J.C. ; Cooper, R.S. ; de Faire, U. ; Deary, I.J. ; Elliott, P. ; Esko, T. ; Farrall, M. ; Franks, P.W. ; Freedman, B. ; Froguel, P. ; Gasparini, P. ; Gieger, C. ; Horta, B.L. ; Juang, J.J. ; Kamatani, Y. ; Kammerer, C.M. ; Kato, N. ; Kooner, J.S. ; Laakso, M. ; Laurie, C.C. ; Lee, I. ; Lehtimäki, T. ; Magnusson, P.K.E. ; Oldehinkel, A.J. ; Penninx, B.W.J.H. ; Pereira, A.C. ; Rauramaa, R. ; Redline, S. ; Samani, N.J. ; Scott, J. ; Shu, X. ; van der Harst, P. ; Wagenknecht, L.E. ; Wang, J. ; Wang, Y.X. ; Wareham, N.J. ; Watkins, H. ; Weir, D.R. ; Wickremasinghe, A.R. ; Wu, T. ; Zeggini, E. ; Zheng, W. ; Bouchard, C. ; Evans, M.K. ; Gudnason, V. ; Kardia, S.L.R. ; Liu, Y. ; Psaty, B.M. ; Ridker, P.M. ; van Dam, R.M. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Fornage, M. ; Province, M.A. ; Kelly, T.N. ; Fox, E.R. ; Hayward, C. ; van Duijn, C.M. ; Tai, E.S. ; Wong, T.Y. ; Loos, R.J.F. ; Franceschini, N. ; Rotter, J.I. ; Zhu, X. ; Bierut, L.J. ; Gauderman, W.J. ; Rice, K. ; Munroe, P.B. ; Morrison, A.C. ; Rao, D.C. ; Rotimi, C.N. ; Cupples, L.A.

Multi-ancestry genome-wide gene–smoking interaction study of 387,272 individuals identifies new loci associated with serum lipids.
Nat. Biotechnol. 37, 461-468 (2019)

Fischer, D.S. ; Fiedler, A. ; Kernfeld, E.M. ; Genga, R.M.J. ; Bastidas-Ponce, A. ; Bakhti, M. ; Lickert, H. ; Hasenauer, J. ; Maehr, R. ; Theis, F.J.

Inferring population dynamics from single-cell RNA-sequencing time series data.
Metabolites 9:61 (2019)

Yu, B. ; Flexeder, C. ; McGarrah, R.W. ; Wyss, A. ; Morrison, A.C. ; North, K.E. ; Boerwinkle, E. ; Kastenmüller, G. ; Gieger, C. ; Suhre, K. ; Karrasch, S. ; Peters, A. ; Wagner, G.R. ; Michelotti, G.A. ; Mohney, R.P. ; Schulz, H. ; London, S.J.

Metabolomics identifies novel blood biomarkers of pulmonary function and COPD in the general population.

Adlam, D. ; Olson, T.M. ; Combaret, N. ; Kovacic, J.C. ; Iismaa, S.E. ; Al-Hussani, A. ; O'Byrne, M.M. ; Bouajila, S. ; Georges, A. ; Mishra, K. ; Braund, P.S. ; d’Escamard, V. ; Huang, S. ; Margaritis, M. ; Nelson, C.P. ; de Andrade, M. ; Kadian-Dodov, D. ; Welch, C.A. ; Bouatia-Naji, N. ; CARDIoGRAMplusC4D Consortium (Gieger, C. ; Meitinger, T. ; Peters, A.)

Association of the PHACTR1/EDN1 genetic locus with spontaneous coronary artery dissection.
Allergy 74, 1364-1373 (2019)

Krautenbacher, N. ; Flach, N. ; Böck, A. ; Laubhahn, K. ; Laimighofer, M. ; Theis, F.J. ; Ankerst, D.P. ; Fuchs, C. ; Schaub, B.

A strategy for high-dimensional multivariable analysis classifies childhood asthma phenotypes from genetic, immunological, and environmental factors.
Exp. Dermatol. 28, E13-E13 (2019)

Jiang, D. ; Christ, S. ; Gallegos, D.C. ; Ramesh, P. ; Gopal, S.K. ; Yu, Q. ; Mayr, C. ; Lupperger, V. ; Liu, J. ; Marr, C. ; Schiller, H. B. ; Rinkevich, Y.

Visualizing scar development in living tissues reveals the collective migration of fibroblasts mediated by N-cadherin.
Exp. Dermatol. 28, E29-E30 (2019)

Wang, R. ; Thomas, J. ; Batra, R. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.

CD23 is a biomarker of clinical response to IgE-specific immunoadsorption in patients with severe atopic eczema.
Hum. Genet. 138, 375–388 (2019)

Schlicht, K. ; Nyczka, P. ; Caliebe, A. ; Freitag-Wolf, S. ; Claringbould, A. ; Franke, L. ; Võsa, U. ; Kardia, S.L.R. ; Smith, J.A. ; Zhao, W. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Prokisch, H. ; Strauch, K. ; Baurecht, H. ; Weidinger, S. ; Rosenstiel, P. ; Hütt, M.T. ; Knecht, C. ; Szymczak, S. ; Krawczak, M.

The metabolic network coherence of human transcriptomes is associated with genetic variation at the cadherin 18 locus.
Nitric oxide 88, 10-26 (2019)

Keisham, M. ; Jain, P. ; Singh, N. ; von Toerne, C. ; Bhatla, S.C. ; Lindermayr, C.

Deciphering the nitric oxide, cyanide and iron-mediated actions of sodium nitroprusside in cotyledons of salt stressed sunflower seedlings.
Metabolites 9:44 (2019)

Chak, C.M. ; Lacruz, M.E. ; Adam, J. ; Brandmaier, S. ; Covic, M. ; Huang, J. ; Meisinger, C. ; Tiller, D. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Berger, U. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Kluttig, A. ; Wang-Sattler, R.

Ageing investigation using two-time-point metabolomics data from KORA and CARLA studies.
Genome Biol. 20:59 (2019)

Wolf, F.A. ; Hamey, F.K. ; Plass, M. ; Solana, J. ; Dahlin, J.S. ; Göttgens, B. ; Rajewsky, N. ; Simon, L. ; Theis, F.J.

PAGA: Graph abstraction reconciles clustering with trajectory inference through a topology preserving map of single cells.

Wang, X. ; Sterr, M. ; Ansarullah ; Burtscher, I. ; Böttcher, A. ; Beckenbauer, J. ; Siehler, J. ; Meitinger, T. ; Häring, H.-U. ; Staiger, H. ; Cernilogar, F.M. ; Schotta, G. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Wright, C.V.E. ; Bakhti, M. ; Lickert, H.

Point mutations in the PDX1 transactivation domain impair human beta-cell development and function.
Nat. Med. 25, 561–568 (2019)

Klaus, J. ; Kanton, S. ; Kyrousi, C. ; Ayo-Martin, A.C. ; Di Giaimo, R. ; Riesenberg, S. ; O'Neill, A.C. ; Camp, J.G. ; Tocco, C. ; Santel, M. ; Rusha, E. ; Drukker, M. ; Schroeder, M. ; Götz, M. ; Robertson, S.P. ; Treutlein, B. ; Cappello, S.

Altered neuronal migratory trajectories in human cerebral organoids derived from individuals with neuronal heterotopia.
NPJ Syst. Biol. Appl. 5:11 (2019)

Fröhlich, F. ; Reiser, A. ; Fink, L. ; Woschée, D. ; Ligon, T. ; Theis, F.J. ; Rädler, J.O. ; Hasenauer, J.

Publisher Correction: Multi-experiment nonlinear mixed effectmodeling of single-cell translation kinetics after transfection.
Nat. Genet. 51, 481-493 (2019)

Shrine, N. ; Guyatt, A.L. ; Erzurumluoglu, A.M. ; Jackson, V.E. ; Hobbs, B.D. ; Melbourne, C.A. ; Batini, C. ; Fawcett, K.A. ; Song, K. ; Sakornsakolpat, P. ; Li, X. ; Boxall, R. ; Reeve, N.F. ; Obeidat, M. ; Zhao, J.H. ; Wielscher, M. ; Weiss, S. ; Kentistou, K.A. ; Cook, J.P. ; Sun, B.B. ; Zhou, J. ; Hui, J. ; Karrasch, S. ; Imboden, M. ; Harris, S.E. ; Marten, J. ; Enroth, S. ; Kerr, S.M. ; Surakka, I. ; Vitart, V. ; Lehtimäki, T. ; Allen, R.J. ; Bakke, P.S. ; Beaty, T.H. ; Bleecker, E.R. ; Bossé, Y. ; Brandsma, C.A. ; Chen, Z. ; Crapo, J.D. ; Danesh, J. ; DeMeo, D.L. ; Dudbridge, F. ; Ewert, R. ; Gieger, C. ; Gulsvik, A. ; Hansell, A.L. ; Hao, K. ; Hoffman, J.D. ; Hokanson, J.E. ; Homuth, G. ; Joshi, P.K. ; Joubert, P. ; Langenberg, C. ; Li, L. ; Lin, K. ; Lind, L. ; Locantore, N. ; Luan, J. ; Mahajan, A. ; Maranville, J.C. ; Murray, A. ; Nickle, D.C. ; Packer, R. ; Parker, M.M. ; Paynton, M.L. ; Porteous, D.J. ; Prokopenko, D. ; Qiao, D. ; Rawal, R. ; Runz, H. ; Sayers, I. ; Sin, D.D. ; Smith, B.H. ; Soler Artigas, M. ; Sparrow, D. ; Tal-Singer, R. ; Timmers, P.R.H.J. ; van den Berge, M. ; Whittaker, J.C. ; Woodruff, P.G. ; Yerges-Armstrong, L.M. ; Troyanskaya, O.G. ; Raitakari, O.T. ; Kähönen, M. ; Polašek, O. ; Gyllensten, U. ; Rudan, I. ; Deary, I.J. ; Probst-Hensch, N.M. ; Schulz, H. ; James, A.L. ; Wilson, J.F. ; Stubbe, B. ; Zeggini, E. ; Jarvelin, M.R. ; Wareham, N.J. ; Silverman, E.K. ; Hayward, C. ; Morris, A.P. ; Butterworth, A.S. ; Scott, R.A. ; Walters, R.G. ; Meyers, D.A. ; Cho, M.H. ; Strachan, D.P. ; Hall, I.P. ; Tobin, M.D. ; Wain, L.V.

New genetic signals for lung function highlight pathways and chronic obstructive pulmonary disease associations across multiple ancestries.
Nat. Genet. 51, 494-505 (2019)

Sakornsakolpat, P. ; Prokopenko, D. ; Lamontagne, M. ; Reeve, N.F. ; Guyatt, A.L. ; Jackson, V.E. ; Shrine, N. ; Qiao, D. ; Bartz, T.M. ; Kim, D.K. ; Lee, M.K. ; Latourelle, J.C. ; Li, X. ; Morrow, J.D. ; Obeidat, M. ; Wyss, A.B. ; Bakke, P. ; Barr, R.G. ; Beaty, T.H. ; Belinsky, S.A. ; Brusselle, G.G. ; Crapo, J.D. ; de Jong, K. ; DeMeo, D.L. ; Fingerlin, T.E. ; Gharib, S.A. ; Gulsvik, A. ; Hall, I.P. ; Hokanson, J.E. ; Kim, W.J. ; Lomas, D.A. ; London, S.J. ; Meyers, D.A. ; O’Connor, G.T. ; Rennard, S.I. ; Schwartz, D.A. ; Sliwinski, P. ; Sparrow, D.B. ; Strachan, D.P. ; Tal-Singer, R. ; Tesfaigzi, Y. ; Vestbo, J. ; Vonk, J.M. ; Yim, J.-J. ; Zhou, X. ; Bossé, Y. ; Manichaikul, A. ; Lahousse, L. ; Silverman, E.K. ; Boezen, H.M. ; Wain, L.V. ; Tobin, M.D. ; Hobbs, B.D. ; Cho, M.H. ; SpiroMeta Consortium (Karrasch, S. ; Gieger, C. ; Rawal, R. ; Schulz, H. ; Zeggini, E.)

Genetic landscape of chronic obstructive pulmonary disease identifies heterogeneous cell-type and phenotype associations.
Nat. Cell Biol. 21, 311-318 (2019)

Nakamura, K. ; Saredi, G. ; Becker, J.R. ; Foster, B. ; Nguyen, N.V. ; Beyer, T.E. ; Cesa, L.C. ; Faull, P.A. ; Lukauskas, S. ; Frimurer, T. ; Chapman, J.R. ; Bartke, T. ; Groth, A.

H4K20meO recognition by BRCA1-BARD1 directs homologous recombination to sister chromatids.
Nature 567, 113-117 (2019)

Camargo Ortega, G. ; Falk, S. ; Johansson, P.A. ; Peyre, E. ; Broix, L. ; Sahu, S.K. ; Hirst, W. ; Schlichthaerle, T. ; de Juan Romero, C. ; Draganova, K. ; Vinopal, S. ; Chinnappa, K. ; Gavranovic, A. ; Karakaya, T. ; Steininger, T. ; Merl-Pham, J. ; Feederle, R. ; Shao, W. ; Shi, S.H. ; Hauck, S.M. ; Jungmann, R. ; Bradke, F. ; Borrell, V. ; Geerlof, A. ; Reber, S. ; Tiwari, V.K. ; Huttner, W.B. ; Wilsch-Bräuninger, M. ; Nguyen, L.A. ; Götz, M.

The centrosome protein AKNA regulates neurogenesis via microtubule organization.

Angelidis, I. ; Simon, L. ; Fernandez, I.E. ; Strunz, M. ; Mayr, C. ; Greiffo, F.R. ; Tsitsiridis, G. ; Ansari, M. ; Graf, E. ; Strom, T.M. ; Nagendran, M. ; Desai, T. ; Eickelberg, O. ; Mann, M. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.

An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics.

Kilpeläinen, T.O. ; Bentley, A.R. ; Noordam, R. ; Sung, Y.J. ; Schwander, K. ; Winkler, T.W. ; Jakupović, H. ; Chasman, D.I. ; Manning, A. ; Ntalla, I. ; Aschard, H. ; Brown, M.R. ; de Las Fuentes, L. ; Franceschini, N. ; Guo, X. ; Vojinovic, D. ; Aslibekyan, S. ; Feitosa, M.F. ; Kho, M. ; Musani, S.K. ; Richard, M. ; Wang, H. ; Wang, Z. ; Bartz, T.M. ; Bielak, L.F. ; Campbell, A. ; Dorajoo, R. ; Fisher, V. ; Hartwig, F.P. ; Horimoto, A.R.V.R. ; Li, C. ; Lohman, K.K. ; Marten, J. ; Sim, X. ; Smith, A.V. ; Tajuddin, S.M. ; Alver, M. ; Amini, M. ; Boissel, M. ; Chai, J.F. ; Chen, X. ; Divers, J. ; Evangelou, E. ; Gao, C. ; Graff, M. ; Harris, S.E. ; He, M. ; Hsu, F.C. ; Jackson, A.U. ; Zhao, J.H. ; Kraja, A.T. ; Kühnel, B. ; Laguzzi, F. ; Lyytikäinen, L.P. ; Nolte, I.M. ; Rauramaa, R. ; Riaz, M. ; Robino, A. ; Rueedi, R. ; Stringham, H.M. ; Takeuchi, F. ; van der Most, P.J. ; Varga, T.V. ; Verweij, N. ; Ware, E.B. ; Wen, W. ; Li, X. ; Yanek, L.R. ; Amin, N. ; Arnett, D.K. ; Boerwinkle, E. ; Brumat, M. ; Cade, B. ; Canouil, M. ; Chen, Y.D.I. ; Concas, M.P. ; Connell, J. ; de Mutsert, R. ; de Silva, H.J. ; de Vries, P.S. ; Demirkan, A. ; Ding, J. ; Eaton, C.B. ; Faul, J.D. ; Friedlander, Y. ; Gabriel, K.P. ; Ghanbari, M. ; Giulianini, F. ; Gu, C.C. ; Gu, D. ; Harris, T.B. ; He, J. ; Heikkinen, S. ; Heng, C.-K. ; Hunt, S.C. ; Ikram, M.A. ; Jonas, J.B. ; Koh, W.-P. ; Komulainen, P. ; Krieger, J.E. ; Kritchevsky, S.B. ; Kutalik, Z. ; Kuusisto, J. ; Langefeld, C.D. ; Langenberg, C. ; Launer, L.J. ; Leander, K. ; Lemaitre, R.N. ; Lewis, C.E. ; Liang, J. ; Lifelines Cohort Study ; Liu, J. ; Mägi, R. ; Manichaikul, A. ; Meitinger, T. ; Metspalu, A. ; Milaneschi, Y. ; Mohlke, K.L. ; Mosley, T.H Jr. ; Murray, A.D. ; Nalls, M.A. ; Nang, E.-E. K. ; Nelson, C.P. ; Nona, S. ; Norris, J.M. ; Nwuba, C.V. ; O’Connell, J. ; Palmer, N.D. ; Papanicolau, G.J. ; Pazoki, R. ; Pedersen, N.L. ; Peters, A. ; Peyser, P.A. ; Polasek, O. ; Porteous, D.J. ; Poveda, A. ; Raitakari, O.T. ; Rich, S.S. ; Risch, N. ; Robinson, J.G. ; Rose, L.M. ; Rudan, I. ; Schreiner, P.J. ; Scott, R.A. ; Sidney, S.S. ; Sims, M. ; Smith, J.A. ; Snieder, H. ; Sofer, T. ; Starr, J.M. ; Sternfeld, B. ; Strauch, K. ; Tang, H. ; Taylor, K.D. ; Tsai, M.Y. ; Tuomilehto, J. ; Uitterlinden, A.G. ; van der Ende, M.Y. ; van Heemst, D. ; Voortman, T. ; Waldenberger, M. ; Wennberg, P. ; Wilson, G. ; Xiang, Y.-B. ; Yao, J. ; Yu, C. ; Yuan, J.-M. ; Zhao, W. ; Zonderman, A.B. ; Becker, D.M. ; Boehnke, M. ; Bowden, D.W ; de Faire, U. ; Deary, I.J. ; Elliott, P. ; Esko, T. ; Freedman, B.I. ; Froguel, P. ; Gasparini, P. ; Gieger, C. ; Kato, N. ; Laakso, M. ; Lakka, T.A. ; Lehtimäki, T. ; Magnusson, P.K.E. ; Oldehinkel, A.J. ; Penninx, B.W.J.H. ; Samani, N.J. ; Shu, X.-O. ; van der Harst, P. ; van Vliet-Ostaptchouk, J.V. ; Vollenweider, P. ; Wagenknecht, L.E. ; Wang, Y.X. ; Wareham, N.J. ; Weir, D.R. ; Wu, T. ; Zheng, W. ; Zhu, X. ; Evans, M.K. ; Franks, P.W. ; Gudnason, V. ; Hayward, C. ; Horta, B.L. ; Kelly, T.N. ; Liu, Y. ; North, K.E. ; Pereira, A.C. ; Ridker, P.M. ; Tai, E.S. ; van Dam, R.M. ; Fox, E.R. ; Kardia, S.L.R. ; Liu, C.-T. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Province, M.A. ; Redline, S. ; van Duijn, C.M. ; Rotter, J.I. ; Kooperberg, C. ; Gauderman, W.J. ; Psaty, B.M. ; Rice, K. ; Munroe, P.B. ; Fornage, M. ; Cupples, L.A. ; Rotimi, C.N. ; Morrison, A.C. ; Rao, D.C. ; Loos, R.J.F.

Multi-ancestry study of blood lipid levels identifies four loci interacting with physical activity.

Karasik, D. ; Zillikens, M.C. ; Hsu, Y.H. ; Aghdassi, A. ; Åkesson, K. ; Amin, N. ; Barroso, I. ; Bennett, D.A. ; Bertram, L. ; Bochud, M. ; Borecki, I.B. ; Broer, L. ; Buchman, A.S. ; Byberg, L. ; Campbell, H. ; Campos-Obando, N. ; Cauley, J.A. ; Cawthon, P.M. ; Chambers, J.C. ; Chen, Z. ; Cho, N.H. ; Choi, H.J. ; Chou, W.C. ; Cummings, S.R. ; de Groot, L.C.P.G.M. ; de Jager, P.L. ; Demuth, I. ; Diatchenko, L. ; Econs, M.J. ; Eiriksdottir, G. ; Enneman, A.W. ; Eriksson, J. ; Eriksson, J.G. ; Estrada, K. ; Evans, D.S. ; Feitosa, M.F. ; Fu, M. ; Gieger, C. ; Grallert, H. ; Gudnason, V. ; Lenore, L.J. ; Hayward, C. ; Hofman, A. ; Homuth, G. ; Huffman, K.M. ; Husted, L.B. ; Illig, T. ; Ingelsson, E. ; Ittermann, T. ; Jansson, J.O. ; Johnson, T. ; Biffar, R. ; Jordan, J.M. ; Jula, A. ; Karlsson, M. ; Khaw, K.T. ; Kilpeläinen, T.O. ; Klopp, N. ; Kloth, J.S.L. ; Koller, D.L. ; Kooner, J.S. ; Kraus, W.E. ; Kritchevsky, S.B. ; Kutalik, Z. ; Kuulasmaa, T. ; Kuusisto, J. ; Laasko, M. ; Lahti, J. ; Lang, T. ; Langdahl, B.L. ; Lerch, M.M. ; Lewis, J.R. ; Lill, C. ; Lind, L. ; Lindgren, C. ; Liu, Y. ; Livshits, G. ; Ljunggren, O. ; Loos, R.J.F. ; Lorentzon, M. ; Luan, J. ; Luben, R.N. ; Malkin, I. ; McGuigan, F.E. ; Medina-Gomez, C. ; Meitinger, T. ; Melhus, H. ; Mellström, D. ; Michaëlsson, K. ; Mitchell, B.D. ; Morris, A.P. ; Mosekilde, L. ; Nethander, M. ; Newman, A.B. ; O'Connell, J.R. ; Oostra, B.A. ; Orwoll, E.S. ; Palotie, A. ; Peacock, M. ; Perola, M. ; Peters, A. ; Prince, R.L. ; Psaty, B.M. ; Räikkönen, K. ; Ralston, S.H. ; Ripatti, S ; Rivadeneira, F. ; Robbins, J.A. ; Rotter, J.I. ; Rudan, I. ; Salomaa, V. ; Satterfield, S. ; Schipf, S. ; Shin, C.S. ; Smith, A.V. ; Smith, S.B. ; Soranzo, N. ; Spector, T.D. ; Stancáková, A. ; Stefansson, K. ; Steinhagen-Thiessen, E. ; Stolk, L. ; Streeten, E.A. ; Styrkarsdottir, U. ; Swart, K.M.A. ; Thompson, P. ; Thomson, C.A. ; Thorleifsson, G. ; Thorsteinsdottir, U. ; Tikkanen, E. ; Tranah, G.J. ; Uitterlinden, A.G. ; van Duijn, C.M. ; van Schoor, N.M. ; Vandenput, L. ; Vollenweider, P. ; Völzke, H. ; Wactawski-Wende, J. ; Walker, M. ; Wareham, N.J. ; Waterworth, D. ; Weedon, M.N ; Wichmann, H.-E. ; Widen, E. ; Williams, F.M.K. ; Wilson, J.F. ; Wright, N.C. ; Yerges-Armstrong, L.M. ; Yu, L. ; Zhang, W. ; Zhao, J.H. ; Zhou, Y. ; Nielson, C.M. ; Harris, T.B. ; Demissie, S. ; Kiel, D.P. ; Ohlsson, C.

Disentangling the genetics of lean mass.
Nat. Genet. 51, 245-257 (2019)

Karlsson Linnér, R. ; Biroli, P. ; Kong, E. ; Meddens, S.F.W. ; Wedow, R. ; Fontana, M.A. ; Lebreton, M. ; Tino, S.P. ; Abdellaoui, A. ; Hammerschlag, A.R. ; Nivard, M.G. ; Okbay, A. ; Rietveld, C.A. ; Timshel, P.N. ; Trzaskowski, M. ; Vlaming, R.d. ; Zünd, C.L. ; Bao, Y. ; Buzdugan, L. ; Caplin, A.H. ; Chen, C.Y. ; Eibich, P. ; Fontanillas, P. ; Gonzalez, J.R. ; Joshi, P.K. ; Karhunen, V. ; Kleinman, A. ; Levin, R.Z. ; Lill, C.M. ; Meddens, G.A. ; Muntané, G. ; Sanchez-Roige, S. ; Rooij, F.J.v. ; Taskesen, E. ; Wu, Y. ; Zhang, F. ; 23and Me Research Team ; eQTLGen Consortium (Prokisch, H. ; Schramm, K.) ; International Cannabis Consortium ; Social Science Genetic Association Consortium (Baumbach, C. ; Meisinger, C. ; Meitinger, T. ; Strauch, K. ; Gieger, C.) ; Auton, A. ; Boardman, J.D. ; Clark, D.W. ; Conlin, A. ; Dolan, C.C. ; Fischbacher, U. ; Groenen, P.J.F. ; Mullan Harris, K. ; Hasler, G. ; Hofman, A. ; Ikram, M.A. ; Jain, S. ; Karlsson, R. ; Kessler, R.C. ; Kooyman, M. ; MacKillop, J. ; Männikkö, M. ; Morcillo-Suarez, C. ; McQueen, M.B. ; Schmidt, K.M. ; Smart, M.C. ; Sutter, M. ; Thurik, A.R. ; Uitterlinden, A.G. ; White, J. ; de Wit, H. ; Yang, J. ; Bertram, L. ; Boomsma, D.I. ; Esko, T. ; Fehr, E. ; Hinds, D.A. ; Johannesson, M. ; Kumari, M. ; Laibson, D. ; Magnusson, P.K.E. ; Meyer, M.N. ; Navarro, A. ; Palmer, A.A. ; Pers, T.H. ; Posthuma, D. ; Schunk, D. ; Stein, M.B, ; Svento, R. ; Tiemeier, H. ; Timmers, P.R.H.J. ; Turley, P. ; Ursano, R.J. ; Wagner, G.G. ; Wilson, J.F. ; Gratten, J. ; Lee, J.J. ; Cesarini, D. ; Benjamin, D.J. ; Koellinger, P.D. ; Beauchamp, J.P.

Genome-wide association analyses of risk tolerance and risky behaviors in over 1 million individuals identify hundreds of loci and shared genetic influences.

Sheng, X. ; Nenseth, H.Z. ; Qu, S. ; Kuzu, O.F. ; Frahnow, T. ; Simon, L. ; Greene, S. ; Zeng, Q. ; Fazli, L. ; Rennie, P.S. ; Mills, I.G. ; Danielsen, H. ; Theis, F.J. ; Patterson, J.B. ; Jin, Y. ; Saatcioglu, F.

IRE1α-XBP1s pathway promotes prostate cancer by activating c-MYC signaling.
FASEB J. 33, 5924-5941 (2019)

Glantschnig, C. ; Koenen, M. ; Gil Lozano, M. ; Karbiener, M. ; Pickrahn, I. ; Williams-Dautovich, J. ; Patel, R. ; Cummins, C.L. ; Giroud, M. ; Hartleben, G. ; Vogl, E.S. ; Blüher, M. ; Tuckermann, J. ; Uhlenhaut, N.H. ; Herzig, S. ; Scheideler, M.

A miR-29a-driven negative feedback loop regulates peripheral glucocorticoid receptor signaling.
Epigenomics 11, 363-366 (2019)

Brockers, K. ; Schneider, R.

Histone H1, the forgotten histone.

Eraslan, G. ; Simon, L. ; Mircea, M. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.

Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder.

Hemmer, M.C. ; Wierer, M. ; Schachtrup, K. ; Downes, M. ; Hübner, N. ; Evans, R.M. ; Uhlenhaut, N.H.

E47 modulates hepatic glucocorticoid action.
Front. Microbiol. 9:3338 (2019)

Kaderali, L. ; Theis, F.J. ; Ganusov, V.V. ; Ciupe, S.M. ; Mehr, R. ; Ribeiro, R.M. ; Hernandez-Vargas, E.A.

Editorial: Integrative computational systems biology approaches in immunology and medicine.
Trends Cancer 5, 5-7 (2019)

Singh, H.R. ; Stricker, S.H.

Glucose-regulated TET2 activity links cancer to diabetes.
Nat. Methods 16, 43-49 (2019)

Büttner, M. ; Miao, Z. ; Wolf, F.A. ; Teichmann, S.A. ; Theis, F.J.

A test metric for assessing single-cell RNA-seq batch correction.
Methods Mol. Biol. 1896, 159-190 (2019)

van den Bos, H. ; Bakker, B. ; Taudt, A. ; Guryev, V. ; Colomé-Tatché, M. ; Lansdorp, P.M. ; Foijer, F. ; Spierings, D.C.J.

Quantification of aneuploidy in mammalian systems.

Tischler, J. ; Gruhn, W.H. ; Reid, J. ; Allgeyer, E. ; Buettner, F. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Simons, B.D. ; Wernisch, L. ; Surani, M.A.

Metabolic regulation of pluripotency and germ cell fate through alpha-ketoglutarate.

Thomas, J. ; Küpper, M. ; Batra, R. ; Jargosch, M. ; Atenhan, A. ; Baghin, V. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S. ; Garzorz-Stark, N.

Is the humoral immunity dispensable for the pathogenesis of psoriasis?