Publications
Uruci, S. ; Lalonde, M. ; Luijsterburg, M.S. ; Hamperl, S.
Polymerase face-off: Emerging concepts in transcription-replication coordination.Dengler, L. ; Padovani, F. ; Lemke, B. ; Brugger, R. ; Benedikt, A. ; Westermann, B. ; Maček, B. ; Schmoller, K.M. ; Ewald, J.C.
In the absence of mitochondrial fusion unequal segregation of mitochondria drives mtDNA loss.NCD Risk Factor Collaboration (Döring, A. ; Gieger, C. ; Heier, M. ; Linkohr, B. ; Peters, A. ; Schneider, A. ; Stieber, J. ; Stöckl, D. ; Thorand, B. ; Wolf, K.)
Obesity rise plateaus in developed nations and accelerates in developing nations.Laurent, K. ; Hoffmann, S. ; Marschall, S. ; Richter, K.B. ; Teperino, R. ; Hrabě de Angelis, M. ; Skerrett-Byrne, D.A. ; Beckers, J.
Embryo transfer following IVF alters susceptibility to metabolic phenotypes in male mouse offspring compared to naturally conceived offspring.Koprulu, M. ; Smith-Byrne, K. ; Ferolito, B.R. ; Macdonald-Dunlop, E. ; Luan, J. ; Hedman, K. ; Ogamba, C.F. ; Kuliesius, J. ; Repetto, L. ; Ramisch, A. ; Abbasi, F. ; Johan Ärnlöv, ; Assimes, T.L. ; Björck, H.M. ; Björkander, S. ; Bøttcher, M. ; Butterworth, A.S. ; Chen, Z.M. ; Cho, K. ; Clarke, R.J. ; Cox, S.R. ; Czene, K. ; Danesh, J. ; Dedoussis, G. ; Elmståhl, S. ; Eriksson, N. ; Eriksson, P. ; Esko, T. ; Ferreiro-Iglesias, A. ; Franks, P.W. ; Fu, J. ; Gaziano, J.M. ; Ghanbari, M. ; Gieger, C. ; Gilly, A. ; Grallert, H. ; Gunter, M.J. ; Gustafsson, S. ; Göteson, A. ; Hall, P. ; Hansson, O. ; Harris, S.E. ; Hayward, C. ; Herder, C. ; Hernandez-Pacheco, N. ; Hijazi, Z. ; Hillary, R.F. ; Hopewell, J.C. ; Hu, S. ; Hwang, S. ; Jern, C. ; Johansson, ?. ; Jonsson, L. ; Kalnapenkis, A. ; Kerrison, N.D. ; Kho, P.F. ; Klarić, L. ; Kohleick, L. ; Kraft, J. ; Landén, M. ; Levy, D. ; Li, L. ; Lind, L. ; Long, J. ; Mattsson, N. ; Melén, E. ; Merid, S.K. ; Mertins, P. ; Michaëlsson, K. ; Möller, P. ; Murgia, F. ; Nyegaard, M. ; Park, Y.-C. ; Pearson, E.R. ; Peters, J. ; Petrie, J. ; Png, G. ; Polašek, O. ; Prins, B.P. ; Ripke, S. ; Roden, M. ; Rohde, P.D. ; Said, S. ; Shen, X. ; Schwenk, J.M. ; Siegbahn, A. ; Smith, J.G. ; Stanne, T.M. ; Suhre, K. ; Sundström, J. ; Thorand, B. ; Valdés‐Márquez, E. ; Vallerga, C.L. ; Meurs, J.B.J.v. ; Viñuela, A. ; Võsa, U. ; Wallentin, L. ; Walters, R.G. ; Wareham, N.J. ; Weber, J.E.
Multi-cohort proteogenomic analyses reveal genetic effects across the proteome and diseasome.Kim, J. ; Xie, S. ; Valenzuela, L.F. ; Xiao, J. ; Lanz, M.C. ; Gao, X. ; Swaffer, M. ; Mitchell, C.E. ; Rubin, S.M. ; Schmoller, K.M. ; Skotheim, J.M.
A Fkh1/2 binding site array in the WHI5 promoter drives sub-scaling transcription.Shapira, Y. ; Noack, F. ; Vangelisti, S. ; Chong, F. ; Lifshitz, A. ; Tanay, A. ; Bonev, B.
Neural stem cell epigenomes and fate bias are temporally coordinated during mouse cortical development.Inecik, K. ; Kara, A. ; Rose, A. ; Haniffa, M. ; Theis, F.J.
TarDis: Achieving robust and structured disentanglement of multiple covariates.Hermant, C. ; Mourra-Díaz, D.M. ; Oomen, M.E. ; Jansz, N. ; Noll, C. ; Canat, A. ; Pal, M. ; Nakatani, T. ; Schauer, T. ; Torres-Padilla, M.E.
TBP regulates transposable element expression in early mouse embryos.Petzold, A. ; Wessely, A. ; Schliep, S. ; Jiang, H. ; Tran, M. ; Koch, E.A. ; Peng, T. ; Starz, H. ; Berking, C. ; Marr, C. ; Heppt, M.V.
Weakly supervised deep learning for cutaneous squamous and basal cell carcinoma in whole-slide histopathology.Malagoli, G. ; Hanel, P. ; Danese, A. ; Wolf, G. ; Colomé-Tatché, M.
Geometry-aware graph attention networks to explain single-cell chromatin states and gene expression with SEAGALL.Balan, T. ; Petitalot, A. ; Albert, J.R. ; Abbou, L. ; Chevreux, G. ; Al-Sady, B. ; Aygenli, B.Ö. ; Bartke, T. ; Margueron, R. ; Duharcourt, S.
A H3K27me3 reader complex couples H3K27me3 accumulation to nascent transcription of transposable elements in Paramecium.Armbrust, N. ; Grosshauser, M. ; Geilenkeuser, J. ; Stroppel, L. ; Jozinovic, M. ; Levermann, H. ; Panne, T. ; Wißmann, J. ; Goelitz, L. ; Schmidt, S. ; Orschmann, T. ; Rusha, E. ; Steinmaßl, E. ; Widenmeyer, F. ; Warsing, N. ; Sabry, M. ; Sultanbai, A. ; Santl, T. ; Geerlof, A. ; Berezin, O. ; Bodea, S.V. ; Moretti, A. ; Schneider, S. ; Theis, F.J. ; Gagneur, J. ; Truong, D.J.J. ; Westmeyer, G.G.
Non-destructive transcriptomics via vesicular export.Ghirotto, B. ; Gonçalves, L.E. ; Ruder, V. ; James, C. ; Gerasimova, E. ; Rizo, T. ; Wend, H. ; Farrell, M. ; Gerez, J.A. ; Prymaczok, N.C. ; Kuijs, M. ; Shulman, M. ; Hartebrodt, A. ; Prots, I. ; Gessner, A. ; Vieth, M. ; Zunke, F. ; Winkler, J. ; Blumenthal, D.B. ; Theis, F.J. ; Riek, R. ; Günther, C. ; Neurath, M. ; Gupta, P. ; Winner, B.
TNF alpha unmasks enteric malate aspartate shuttle dysfunction bridging Parkinson disease and intestinal inflammation.Dasdelen, M.F. ; Kukuljan; I. ; Lienemann, P. ; Ozlugedik, F. ; Sadafi, A. ; Hehr, M. ; Spiekermann, K. ; Pohlkamp, C. ; Marr, C.
AI-based hematological malignancy prediction from peripheral blood smears in a large diagnostic laboratory cohort.