Rolled up magazines on blue background

Publications

Science:eaeh1348 (2026)

Wiesbeck, M. ; Alard, E. ; Merino, F.L. ; Chowdhury, N. ; Egert, L. ; Danese, A. ; Imhof, S. ; Borgia, M.I. ; Rajan, A. ; Marx, N.F. ; Kepesidis, E. ; Köferle, A. ; Cerron-Alvan, L.M. ; Vierl, F. ; Truong, T.-T. ; Thorwirth, M. ; Bilalli, L. ; Ninkovic, J. ; Schieweck, R. ; Diefenbacher, M. ; Hauck, S.M. ; Trainor, P.A. ; Mardakheh, F.K. ; Götz, M. ; Stricker, S.H.

Manipulation of protein translation and stem cell self-renewal by CRISPR activation of rRNA transcription.
Sci. Rep. 16:20526 (2026)

Kukuljan, I. ; Dasdelen, M.F. ; Schäfer, J. ; Buck, M. ; Götze, K. ; Marr, C.

Illusion of competence: Vision–language models provide confident but inaccurate explanations in cytological diagnostics.
Brief. Bioinform. 27:bbag328 (2026)

Amerifar, S. ; Kopf, A. ; Sass, S. ; Moslehi, Z. ; Hecker, D. ; Enssle, J.C. ; Schulz, M.H. ; Oellerich, T. ; Theis, F.J. ; Buettner, F.

Continuous multi-omics pathway enrichment analysis resolves hidden functional heterogeneity.
Sci. Adv. 12:eaea9974 (2026)

Li, Y. ; Krontira, A. ; Vierl, F. ; Richter, M. ; Wang, W. ; Merl-Pham, J. ; Theis, F.J. ; Hauck, S.M. ; Götz, M.

Transcriptional repression by TGIF2 coordinates neurogenic priming and neural stem cell maintenance.
Curr. Protoc. 6:e70386 (2026)

Selloum, M. ; da Silva Buttkus, P. ; Riet, F. ; Dragano, N.R.V. ; Garrett, L. ; Jacobs, H. ; Hölter, S.M. ; Torquet, N. ; Rathkolb, B. ; Lindner, L. ; Gailus-Durner, V. ; Pavlovic, G. ; Chan, L. ; Beckers, J. ; Demoulière, B.P. ; Fuchs, H. ; Ey, E. ; Sorg, T. ; Hrabě de Angelis, M. ; Herault, Y.

Standardized pipeline for metabolism and cognition in GO-DS21 mouse model: Investigating down syndrome comorbidities.
BioSpektrum 32, 391 (2026)

Theis, F.J. ; Wang, W.

Von Einzelzellatlanten zu Zellsimulationen.
iScience 29:116357 (2026)

Moukham, H. ; Caligaris, M. ; Six, P. ; Padovani, F. ; Schmoller, K.M. ; Virgilio, C.D. ; Nicastro, R. ; Tripodi, F. ; Coccetti, P.

SNF1/AMPK controls its own localization by phosphorylating its activating kinase Sak1.
Plant Physiol., DOI: 10.1093/plphys/kiag405 (2026)

Wunder, T. ; Eulitz, L. ; Kramer, L. ; Ali, Z.M. ; Ostermeier, M. ; Leu, C. ; Szulc, B. ; Holzner, L.J. ; Fechter, J. ; Padovani, F. ; Brandt, B. ; Girr, P. ; Teh, J.T. ; Mühlbauer, S. ; Sotos, C. ; Angstenberger, M. ; Mackinder, L.C.M. ; Schmoller, K.M. ; Rädler, J.O. ; Nickelsen, J. ; de Vries, J. ; Kunz, H.H.

Conserved and lineage-specific roles of KEA-mediated Ion homeostasis in chlamydomonas.
NPJ Digit. Med. 9:480 (2026)

Koch, V. ; Bauer, S. ; Mahajan, S. ; Lupperger, V. ; Joner, M. ; Schunkert, H. ; Schnabel, J.A. ; von Scheidt, M. ; Marr, C.

UNICORN: A deep learning model for integrating multi-stain data in histopathology.
Cell Biomater., DOI: 10.1016/j.celbio.2026.100493 (2026)

Distler, T. ; Daga, K.K. ; Bürkle, M. ; Vásquez-Sepúlveda, S. ; Franze, K. ; Götz, M. ; Masserdotti, G.

Fibrin hydrogels regulate human astrocyte state and neuronal reprogramming.
Cell, DOI: 10.1016/j.cell.2026.05.019 (2026)

Merino, F.L. ; Miranda, L. ; Kumar, A. ; Li, Y. ; Kumar Sundaramoorthy, D. ; Merl-Pham, J. ; Schentarra, E.M. ; Steinek, C. ; Pravata, V. ; Kittock, C. ; Bürkle, M. ; Hersbach, B.A. ; Ferri Beneito, J. ; Giesert, F. ; Jungmann, R. ; Pilaz, L.J. ; Hauck, S.M. ; Cappello, S. ; Götz, M.

Nuclear proteome reveals microtubule-associated protein regulating fate and disease.
Cell 189, 3773-3800.e44 (2026)

Wang, W. ; Hu, Z. ; Weiler, P. ; Mayes, S. ; Lange, M. ; Fountain, D.M. ; Haug, J.O. ; Wang, J. ; Xue, Z. ; Sauka-Spengler, T. ; Theis, F.J.

RegVelo: Gene-regulatory-informed dynamics of single cells.
Nutrients 18:1727 (2026)

Cahill, T. ; Nalesso, V. ; Clarke, P. ; Lagrán, M.M.d. ; Strydom, A. ; Li, C. ; Potier, M. ; Beckers, J. ; Langohr, K. ; Lió, P. ; Torre, R.d.L. ; Forcano, L. ; Hiance-Delahaye, A. ; Hérault, Y. ; Dierssen, M.

Understanding obesity in individuals with down syndrome: Caregiver perceptions, awareness, and motivation.
Environ. Sci. Technol. 60, 16029-16043 (2026)

Offer, S. ; Czech, H. ; Di Bucchianico, S. ; Hartikainen, A. ; Ihalainen, M. ; Hakkarainen, H. ; Happo, M.S. ; Huttunen, K. ; Ihantola, T. ; Suhonen, H. ; Uski, O. ; Martikainen, M. ; Dilger, M. ; Schlager, C. ; Candeias, J. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Jakobi, G. ; Kanashova, T. ; Kortelainen, M. ; Kuuspalo, K. ; Lamberg, H. ; Leskinen, A. ; Michalke, B. ; Oeder, S. ; Orasche, J. ; Passig, J. ; Yli-Pirilä, P. ; Rönkkö, T. ; Schnelle-Kreis, J. ; Sklorz, M. ; Streibel, T. ; Tissari, J. ; Buters, J. ; Mülhopt, S. ; Weiß, C. ; Dittmar, G. ; Jokiniemi, J. ; Hirvonen, M. ; Jalava, P. ; Sippula, O. ; Zimmermann, R.

Atmospheric aging alters the toxicity mechanisms of residential wood combustion aerosol: A parallel In Vivo and In Vitro study.
2026 in
In: (9th International Conference on Medical Imaging with Deep Learning, MIDL 2026, 8-10 July 2026, Chientan). 2026. 2757-2779 ( ; 315)

Ozlugedik, F. ; Dasdelen, M.F. ; Umer, R.M. ; Marr, C.

MoA: Mixture of Aggregators Improves Slide-Level Diagnosis in Computational Pathology.