Publications
Hankofer, V. ; Ghirardo, A. ; Obermaier, L. ; Poschet, G. ; Kumar, J.S. ; Gross, I. ; Durner, J. ; Rychlik, M. ; Wirtz, M. ; Hell, R. ; Schnitzler, J.-P. ; Groth, M.
Photorespiration is linked to DNA methylation by formate as a one-carbon source.Mueller, S. ; de Andrade Krätzig, N. ; Tschurtschenthaler, M. ; Silva, M.G. ; Thordsen, C. ; Trozzo, R. ; Simon, P. ; Saab, F. ; Kaltenbacher, T. ; Zukowska, M. ; Lucarelli, D. ; Öllinger, R. ; Griger, J. ; Groß, N. ; Groll, T. ; Löprich, J. ; Zaurito, A.E. ; Schömig, L.R. ; Bugter, J.M. ; Bärthel, S. ; Falcomatà, C. ; Strong, A. ; Brandt, C. ; Najajreh, M. ; Papargyriou, A. ; Maresch, R. ; Collins, K.A.N. ; Sailer, D. ; Schneeweis, C. ; Burger, S. ; Fröhlich, L.M. ; Klement, C. ; Belka, A. ; Montero, J.J. ; Jungwirth, U. ; Reichert, M. ; Moser, M. ; Neumann, J. ; Vassiliou, G. ; Cadiñanos, J. ; Varela, I. ; Marr, C. ; Alonso, D.F. ; Lollini, P.L. ; Zhao, J. ; Chesler, L. ; Isacke, C.M. ; Riedel, A. ; Braun, C.J. ; Sos, M.L. ; Beleggia, F. ; Reinhardt, H.C. ; Musteanu, M. ; Barbacid, M. ; Quante, M. ; Schmidt-Supprian, M. ; Schneider, G. ; Clare, S. ; Lawley, T.D. ; Dougan, G. ; Steiger, K. ; Conte, N. ; Bradley, A. ; Rad, L. ; Saur, D. ; Rad, R.
A disease model resource reveals core principles of tissue-specific cancer evolution.Schmidt, T. ; Kumar, C.N. ; Stricker, S.H.
Gene anschalten statt umbauen: CRISPR aktiviert Zellprogramme ohne DNA-Eingriff.Bader, J.M. ; Makarov, C. ; Richter, S. ; Strauss, M.T. ; Held, F. ; Wahle, M. ; Lorenz, M.B. ; Pöschl, L. ; Skowronek, P. ; Thielert, M. ; Berthele, A. ; Zeng, W.F. ; Ammar, C. ; Bludau, I. ; Schubert, B. ; Theis, F.J. ; Gasperi, C. ; Hemmer, B. ; Mann, M.
Large-scale proteomics across neurological disorders uncovers biomarker panel and targets in multiple sclerosis.Richter, T. ; Wang, W. ; Palma, A. ; Theis, F.J.
Generative models of cell dynamics: From Neural ODEs to flow matching.Maier, L. ; Sun, Y. ; Kronberg, J. ; Abner, E. ; Coley, K. ; Marenholz, I. ; Weiss, S. ; Foraita, R. ; Karramass, T. ; Mykkänen, J. ; Hernandez-Pacheco, N. ; Wang, C.A. ; Kitaba, N.T. ; Pechlivanis, S. ; Bouzigon, E. ; Tingskov Pedersen, C.E. ; Schoos, A.M. ; Curtin, J. ; Kress, S. ; Hernangomez-Laderas, A. ; Foppiano, F. ; Ashley, S. ; Batini, C. ; Bryant, L. ; Homuth, G. ; Gieger, C. ; Gilles, S. ; Lyytikäinen, L.P. ; Rovio, S. ; Pahkala, K. ; Vernet, R. ; Valenta, R. ; Llop, S. ; Torrent, M. ; Böck, A. ; Tang, M.L.K. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Metspalu, A. ; Esko, T. ; Sprikkelman, A.B. ; John, C. ; Lee, Y.A. ; Beyer, K. ; Völzke, H. ; Pigeot, I. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Duijts, L. ; Lu, H. ; Raitakari, O.T. ; Lehtimäki, T. ; Kähönen, M. ; Tio, C.H.L. ; Melén, E. ; Pennell, C.E. ; Holloway, J.W. ; von Mutius, E. ; Siroux, V. ; Bønnelykke, K. ; Custovic, A. ; Simpson, A. ; Schikowski, T. ; Bilbao, J.R. ; Schaub, B. ; Peters, R. ; Kersten, E.T.G. ; Vonk, J.M. ; Thiering, E. ; Peters, A. ; Koppelman, G.H. ; Standl, M.
Meta-analysis of genome-wide association studies of food allergy and IgE-sensitization.Li, J. ; Wang, J. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Cheng, X. ; Luecken, M. ; Lu, J. ; Monavarfeshani, A. ; Yan, W. ; Zheng, Y. ; Zuo, Z. ; Colborn, S.L.Z. ; Cortez, B.S. ; Owen, L.A. ; Wick, B. ; Bao, X. ; Choi, J. ; Haeussler, M. ; Tran, N.M. ; Shekhar, K. ; Sanes, J.R. ; Stout, J.T. ; Chen, S. ; Li, Y. ; DeAngelis, M.M. ; Theis, F.J. ; Chen, R.
Author Correction: Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina.Bahrami, M. ; Richter, T. ; Schmacke, N.A. ; Egea Lavandera, A. ; Theis, F.J.
From modality-specific to compositional foundation models for cell biology.Langstein-Skora, I. ; Schmid, A. ; Huth, F. ; Shabani, D. ; Spechtenhauser, L. ; Likhodeeva, M. ; Kunert, F. ; Metzner, F.J. ; Emenecker, R.J. ; Richardson, M.O. ; Aftab, W. ; Götz, M.J. ; Payer, S. ; Pietrantoni, N. ; Valka, V. ; Ravichandran, S.K. ; Bartke, T. ; Karl-Peter, H. ; Gerland, U. ; Korber, P. ; Holehouse, A.S.
Sequence and chemical specificity define the functional landscape of intrinsically disordered regions.Stephan, N. ; Halama, A. ; Thareja, G. ; Sarwath, H. ; Grallert, H. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Schmidt, F. ; Graumann, J. ; Suhre, K.
Identification of protein signatures reflecting latent variation in aptamer-based affinity proteomics.Laurent, K. ; Teperino, R. ; Hrabě de Angelis, M. ; Skerrett-Byrne, D.A. ; Beckers, J.
Epigenetic legacy: The role of sperm miRNAs in the paternal inheritance of diabetes and obesity development.Casalone, E. ; Rosselli, M. ; Birolo, G. ; Debernardi, C. ; Catalano, C. ; Aneli, S. ; Allione, A. ; Di Primio, C. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Anton, G. ; Vineis, P. ; Sacerdote, C. ; Matullo, G.
Integration of short non coding RNA and genetic factors for coronary artery disease risk prediction in a prospective study.Tiesmeyer, S. ; Müller-Bötticher, N. ; Malt, A. ; Ma, L. ; Marco-Salas, S. ; Kiessling, P. ; Horn, P. ; Guillot, A. ; Kuemmerle, L. ; Tacke, F. ; Theis, F.J. ; Kuppe, C. ; Nilsson, M. ; Eils, R. ; Long, B. ; Ishaque, N.
Identifying 3D signal overlaps in spatial transcriptomics data with ovrlpy.Marmolejo, C.O. ; Sanchez, C. ; Helms, E. ; McEvoy, M.J. ; Lee, J. ; Werner, M. ; Roberts, P. ; Hamperl, S. ; Saldivar, J.C.
Precise control of transcription condensates across S phase balances linker histone expression with DNA replication, ensuring genome stability.Sinke, L. ; van Dongen, J. ; Delerue, T. ; Wilson, R. ; Xia, Y. ; Beekman, M. ; Willemsen, G. ; Gieger, C. ; Herder, C. ; Koenig, W. ; Peters, A. ; de Geus, E.J.C. ; Ordovas, J.M. ; Bell, J.T. ; Waldenberger, M. ; Boomsma, D.I. ; Slagboom, P.E. ; Heijmans, B.T.
Epigenome-wide association study of circulating interleukin-6 connects DNA methylation to immunometabolic and inflammatory health.