Publications

BMC Genomics 18:905 (2017)

Trümbach, D. ; Pfeiffer, S. ; Poppe, M. ; Scherb, H. ; Doll, S. ; Wurst, W. ; Schick, J.

ENCoRE: An efficient software for CRISPR screens identifies new players in extrinsic apoptosis.
Bioinformatics 34, 896-898 (2017)

Dirmeier, S. ; Fuchs, C. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.

netReg: Network-regularized linear models for biological association studies.
Radiat. Oncol. 12:77 (2017)

Straube, C. ; Scherb, H. ; Gempt, J. ; Bette, S. ; Zimmer, C. ; Schmidt-Graf, F. ; Schlegel, J. ; Meyer, B. ; Combs, S.E.

Does age really matter? Radiotherapy in elderly patients with glioblastoma, the Munich experience.
JCO Clin. Can. Inform. 1, 1-15 (2017)

Seyednasrollah, F. ; Köstler, D.C. ; Wang, T. ; Piccolo, S.R. ; Vega, R. ; Greiner, R. ; Fuchs, C. ; Gofer, E. ; Kumar, L. ; Wolfinger, R.D. ; Kanigel-Winner, K. ; Bare, C. ; Neto, E.C. ; Yu, T. ; Shen, L. ; Abdallah, K. ; Norman, T. ; Stolovitzky, G. ; Soule, H. ; Sweeney, C.J. ; Ryan, C.J. ; Scher, H.I. ; Sartor, O, ; Elo, L.L. ; Zhou, F.L. ; Guinney, J. ; Costello, J.C. ; Prostate Cancer Challenge DREAM Community (Kondofersky, I. ; Krautenbacher, N. ; Laimighofer, M. ; Scherb, H. ; Söllner, J.F. ; Kurz, C.F.)

A DREAM challenge to build prediction models for short-term discontinuation of docetaxel in metastatic castration-resistant prostate cancer.
Lancet Oncol. 18, 132-142 (2017)

Guinney, J. ; Wang, T. ; Laajala, T.D. ; Kanigel-Winner, K. ; Bare, C. ; Neto, E.C. ; Khan, S. ; Peddinti, K. ; Airola, A. ; Pahikkala, T. ; Mirtti, T. ; Yu, T. ; Bot, B.M. ; Shen, L. ; Abdallah, K. ; Norman, T. ; Friend, S. ; Stolovitzky, G. ; Soule, H. ; Sweeney, C.J. ; Ryan, C.J. ; Scher, H.I. ; Sartor, O, ; Xie, Y. ; Aittokallio, T. ; Zhou, F.L. ; Costello, J.C. ; Prostate Cancer Challenge DREAM Community (Kondofersky, I. ; Krautenbacher, N. ; Laimighofer, M. ; Scherb, H. ; Kurz, C.F. ; Fuchs, C. ; Söllner, J.)

Prediction of overall survival for patients with metastatic castration-resistant prostate cancer: Development of a prognostic model through a crowdsourced challenge with open clinical trial data.
Gastroenterology 152, 571-585.e8 (2017)

Markova, M. ; Pivovarova, O. ; Hornemann, S. ; Sucher, S. ; Frahnow, T. ; Wegner, K. ; Machann, J. ; Petzke, K.J. ; Hierholzer, J. ; Lichtinghagen, R. ; Herder, C. ; Carstensen-Kirberg, M. ; Roden, M. ; Rudovich, N.N. ; Klaus, S. ; Thomann, R. ; Schneeweiss, R. ; Rohn, S. ; Pfeiffer, A.F.

Isocaloric diets high in animal or plant protein reduce liver fat and inflammation in individuals with Type 2 Diabetes.