Hamperl Lab Publications

Nucleic Acids Res. 51, 12303-12324 (2023)

Chanou, A. ; Weiß, M. ; Holler, K. ; Sajid, A. ; Straub, T. ; Krietsch, J. ; Sanchi, A. ; Ummethum, H. ; Lee, C.S.K. ; Kruse, E. ; Trauner, M. ; Werner, M. ; Lalonde, M. ; Lopes, M. ; Scialdone, A. ; Hamperl, S.

Single molecule MATAC-seq reveals key determinants of DNA replication origin efficiency.
In:. 525 B Street, Suite 1900, San Diego, Ca 92101-4495 Usa: Elsevier Academic Press Inc, 2023. 199-219 (Methods Cell Biol. ; 182)

Lalonde, M. ; Ummethum, H. ; Trauner, M. ; Ettinger, A. ; Hamperl, S.

An automated image analysis pipeline to quantify the coordination and overlap of transcription and replication activity in mammalian genomes.
Blood 142, 90-105 (2023)

Bamezai, S. ; Pulikkottil, A.J. ; Yadav, T. ; Vegi, N.M. ; Mueller, J. ; Mark, J. ; Mandal, T. ; Feder, K. ; Ihme, S. ; Song, C. ; Rosler, R. ; Wiese, S. ; Hoell, J.I. ; Kloetgen, A. ; Karsan, A. ; Kumari, A. ; Wojenski, L. ; Sinha, A.U. ; González-Menéndez, I. ; Quintanilla-Martinez, L. ; Donato, E. ; Trumpp, A. ; Kruse, E. ; Hamperl, S. ; Zou, L. ; Rawat, V.P.S. ; Buske, C.

A noncanonical enzymatic function of PIWIL4 maintains genomic integrity and leukemic growth in AML.
Cell Rep. 42:112045 (2023)

Weiß, M. ; Chanou, A. ; Schauer, T. ; Tvardovskiy, A. ; Meiser, S. ; König, A.-C. ; Schmidt, T. ; Kruse, E. ; Ummethum, H. ; Trauner, M. ; Werner, M. ; Lalonde, M. ; Hauck, S.M. ; Scialdone, A. ; Hamperl, S.

Single-copy locus proteomics of early- and late-firing DNA replication origins identifies a role of Ask1/DASH complex in replication timing control.