Scialdone Lab Publications

See all

Filter
2023 Scientific Article in Nucleic Acids Research
Nucleic Acids Res. 51, 12303-12324 (2023)

Chanou, A. ; Weiß, M. ; Holler, K. ; Sajid, A. ; Straub, T. ; Krietsch, J. ; Sanchi, A. ; Ummethum, H. ; Lee, C.S.K. ; Kruse, E. ; Trauner, M. ; Werner, M. ; Lalonde, M. ; Lopes, M. ; Scialdone, A. ; Hamperl, S.

Single molecule MATAC-seq reveals key determinants of DNA replication origin efficiency.
2023 Scientific Article in Nature Methods
Nat. Methods 20, 1037-1047 (2023)

Beagrie, R.A. ; Thieme, C.J. ; Annunziatella, C. ; Baugher, C. ; Zhang, Y. ; Schueler, M. ; Kukalev, A. ; Kempfer, R. ; Chiariello, A.M. ; Bianco, S. ; Li, Y. ; Davis, T. ; Scialdone, A. ; Welch, L.R. ; Nicodemi, M. ; Pombo, A.

Multiplex-GAM: genome-wide identification of chromatin contacts yields insights overlooked by Hi-C.
2023 Scientific Article in Development / Company of Biologists
Development 150:12 (2023)

Lubatti, G. ; Stock, M. ; Iturbide Martinez De Albeniz, A. ; Ruiz Tejada Segura, M.L. ; Riepl, M. ; Tyser, R.C.V. ; Danese, A. ; Colomé-Tatché, M. ; Theis, F.J. ; Srinivas, S. ; Torres-Padilla, M.E. ; Scialdone, A.

CIARA: A cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data.
2023 Scientific Article in Physical Review E
Phys. Rev. E 107:044403 (2023)

Lazzardi, S. ; Valle, F. ; Mazzolini, A. ; Scialdone, A. ; Caselle, M. ; Osella, M.

Emergent statistical laws in single-cell transcriptomic data.
2023 Scientific Article in Cell Reports
Cell Rep. 42:112045 (2023)

Weiß, M. ; Chanou, A. ; Schauer, T. ; Tvardovskiy, A. ; Meiser, S. ; König, A.-C. ; Schmidt, T. ; Kruse, E. ; Ummethum, H. ; Trauner, M. ; Werner, M. ; Lalonde, M. ; Hauck, S.M. ; Scialdone, A. ; Hamperl, S.

Single-copy locus proteomics of early- and late-firing DNA replication origins identifies a role of Ask1/DASH complex in replication timing control.