Publications

2018 in
München, Ludwig-Maximilians-Universität, Medizinische Fakultät, Diss., 2018, 188 S.

Welk, V.

Dissecting the role of proteasome activators in lung biology and disease.

Pepe, M. ; Pelizza, F. ; Lamort, A. ; Kanellakis, N.I. ; Stathopoulos, G.T.

Alteration patterns of tobacco carcinogens in lung adenocarcinoma reveal novel KRAS-addicted candidate oncogenes.

Fernandez, I.E. ; Sun, N. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Verleden, S. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Walch, A.K. ; Eickelberg, O.

Pharmacometabolic effect of pirfenidone treatment in IPF detected by high resolution MALDI-FTICR imaging.

De Santis, M. ; Ota, C. ; Costa, R. ; Doryab, A. ; Alsafadi, H.N. ; Bolukbas, D. ; Königshoff, M. ; Wagner, D.

Development of a hybrid alginate-ECM hydrogel as a potential bioink for 3D bioprinting.

Welk, V. ; Meul, T. ; Lukas, C. ; Bolukbas, D. ; Koch, I. ; Lindner, M. ; Meiners, S.

Analyzing the role of proteasome activator 200 (PA200) in lung cancer.

Knüppel, L. ; Heinzelmann, K. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

FKBP10 regulates fibroblast migration via synthesis of collagen VI.

Lamort, A. ; Weiss, S. ; Lillis, I. ; Armenis, V. ; Arendt, K.A.M. ; Pepe, M. ; Klotz, L.V. ; Marazioti, A. ; Spella, M. ; Giopanou, I. ; Ntaliarda, G. ; Giotopoulou, G.A. ; Lianou, M. ; Oplopoiou, M. ; Kauka, K. ; Jenne, D. ; Stathopoulos, G.T.

Tumor-derived granulocyte chemotactic protein 2 cooperates with neutrophil proteinase 3 to drive lung adenocarcinoma.

Fernandez, I.E. ; Greiffo, F.R. ; Roi, R. ; Behr, J. ; Forrest, A.R. ; Eickelberg, O.

Circulating MDSC modulate IPF progression by orchestrating immunosuppressive and pro-fibrotic networks.

Lambert, K.A. ; Lodge, C. ; Prendergast, L.A. ; Bowatte, G. ; Lowe, A. ; Wjst, M. ; Abramson, M.J. ; Dharmage, S.C. ; Erbas, B.

Associations between early life exposure to pollen and adolescent lung function are modified by residential greenness.

Costa, R. ; Wagner, D.E. ; De Santis, M. ; Bailey, K.E. ; Doryab, A. ; Schorpp, K.K. ; Rothenaigner, I. ; Ota, C. ; Baarsma, H.A. ; Campillos, M.J. ; Hadian, K. ; Königshoff, M.

Novel compounds for WNT/beta-catenin induced lung repair in chronic obstructive pulmonary disease.

Wartenberg, M. ; Andrault, P. ; Schamberger, A.C. ; Chazeirat, T. ; Sizaret, D. ; Renault, J. ; Petit, A. ; Saidi, A. ; Guyetant, S. ; Courty, Y. ; Eickelberg, O. ; Lalmanach, G. ; Lecaille, F.

Cigarette smoke induces overexpression of cathepsin S in active smokers with and without COPD.

Kindt-Dunjko, A. ; Foerster, K. ; Flemmer, A. ; Oak, P. ; Pomschar, A. ; Ertl-Wagner, B. ; Krumsiek, J. ; Hilgendorff, A.

Late Breaking Abstract - Protein signature stratifies severity of chronic lung disease in preterms after birth.

Schmid, O. ; Möller, W. ; Stelzl, A. ; Lund, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Krauss-Etschmann, S. ; Robichaud, A.

Preclinical experiments support recent clinical switch to delivered dose during methacholine bronchoprovocation testing.

Smirnova, N.F. ; Morrone, C. ; Conlon, T.M. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

A quantitative proteomics profiling of murine lung grafts indicates novel pathways associated with chronic lung allograft dysfunction.

Knüppel, L. ; Merl-Pham, J. ; Hennen, E. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

A proteomic analysis of extracellular matrix from idiopathic pulmonary fibrosis patient-derived fibroblasts in response to transforming growth factor beta 1.
Sci. Transl. Med. 10:eaan6735 (2018)

Tsai, J.M. ; Sinha, R. ; Seita, J. ; Fernhoff, N. ; Christ, S. ; Koopmans, T. ; Krampitz, G.W. ; McKenna, K.M. ; Xing, L. ; Sandholzer, M. ; Sales, J.H. ; Shoham, M. ; McCracken, M. ; Joubert, L.M. ; Gordon, S.R. ; Poux, N. ; Wernig, G. ; Norton, J.A. ; Weissman, I.L. ; Rinkevich, Y.

Surgical adhesions in mice are derived from mesothelial cells and can be targeted by antibodies against mesothelial markers.

Morrone, C. ; Smirnova, N.F. ; Kneidinger, N. ; Mann, M. ; Schiller, H.B. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Increased peribronchiolar and perivascular cysteine protease activity is associated with bronchiolitis obliterans syndrome.

Schittny, J.C. ; Möller, W. ; Holzwarth, U. ; Hirn, S. ; Wenk, A. ; Schleh, C. ; Schäffler, M. ; Haberl, N. ; Gibson, N. ; Kreyling, W.G.

Age-dependent deposition patterns and quantitative biokinetics of inhaled 20nm gold nanoparticles in rat lungs.

Conlon, T.M. ; Sarker, R.S. ; Jia, J. ; Heinzelmann, K. ; Tasdemir, D. ; Bayram, H. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Immuno-metabolomic regulation of B cell guided iBALT positioning drives cigarette smoke-induced COPD.

Foerster, K. ; Ertl-Wagner, B. ; Sass, S. ; Stoecklein, S. ; Schoeppe, F. ; Dietrich, O. ; Pomschar, A. ; Schulze, A. ; Huebener, C. ; Theis, F.J. ; Ehrhardt, H. ; Flemmer, A. ; Hilgendorff, A.

Quantitative MRI measurements to detect pulmonary hypertension in bronchopulomnary dysplasia.

Hu, Y. ; Skronska-Wasek, W. ; Ota, C. ; Mutze, K. ; Baarsma, H.A. ; Wagner, D.E. ; Lehmann, M. ; Bracke, K.R. ; Brusselle, G.G. ; Yildirim, A.Ö. ; Koenigshoff, M.

The progenitor cell marker LGR5 is reduced in epithelial cells in emphysema.

Foerster, K. ; Sass, S. ; Pomschar, A. ; Ehrhardt, H. ; Naehrlich, L. ; Schulze, A. ; Flemmer, A. ; Huebener, C. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Dietrich, O. ; Ertl-Wagner, B. ; Hilgendorff, A.

Diagnosis of bronchopulmonary dysplasia using magnetic resonance imaging analysis.

Heinzelmann, K. ; Gerckens, M. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Hilgendorff, A.

DPPIV expression in human lung fibroblasts affects phenotypic changes in fibrosis.

Oak, P. ; Koschlig, M. ; Pritzke, T. ; Foerster, K. ; Ahnert, P. ; Windhorst, A. ; Reicherzer, T. ; Ehrhardt, H. ; Hilgendorff, A.

Gender specific response of the neonatal lung to postnatal injury.

Fernandez, I.E. ; Sun, N. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Verleden, S. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Eickelberg, O. ; Walch, A.K.

Pharmacometabolic response to pirfenidone treatment in pulmonary fibrosis detected by high resolution MALDI FTICR-mass spectrometry imaging.

Preisendörfer, S. ; Knüppel, L. ; Ishikawa, Y. ; Binzenhöfer, L. ; Fernandez, I.E. ; Juan-Guardela, B.M. ; Ruppert, C. ; Guenther, A. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Kaminski, N. ; Schepers, A. ; Bachinger, H. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

FK506 binding protein 11, a plasma cell-specific antibody folding catalyst, is increased in pulmonary fibrosis.

Costa, R. ; Wagner, D.E. ; De Santis, M. ; Bailey, K.E. ; Doryab, A. ; Schorpp, K.K. ; Rothenaigner, I. ; Ota, C. ; Baarsma, H.A. ; Campillos, M. ; Hadian, K. ; Koenigshoff, M.

Drug repurposing for WNT/beta-catenin induced lung repair in chronic obstructive pulmonary disease.
Hum. Genomics 12:50 (2018)

Mahmutovic, L. ; Akcesme, B. ; Durakovic, C. ; Akcesme, F.B. ; Maric, A. ; Adilovic, M. ; Hamad, N. ; Wjst, M. ; Feeney, O. ; Semiz, S.

Perceptions of students in health and molecular life sciences regarding pharmacogenomics and personalized medicine.
Respir. Med. 145, 89-94 (2018)

Matthes, S. ; Stadler, J. ; Barton, J. ; Leuschner, G. ; Munker, D. ; Arnold, P. ; Villena-Hermoza, H. ; Frankenberger, M. ; Probst, P. ; Koch, A. ; Kneidinger, N. ; Milger, K. ; Behr, J. ; Neurohr, C.

Asthma features in severe COPD: Identifying treatable traits.
Arthritis Rheum. 70 (2018)

Thompson, G.A. ; Moura, M.C. ; Nelson, D. ; Hummel, A.M. ; Jenne, D. ; Fervenza, F. ; Hoffman, G.S. ; Kallenberg, C.G.M. ; Langford, C. ; McCune, J.W. ; Merkel, P.A. ; Monach, P.A. ; Seo, P. ; Spiera, R.F. ; St Clair, E.W. ; Ytterberg, S.R. ; Stone, J.H. ; Robinson, W.H. ; Pang, Y. ; Specks, U.

Characterization of preferential recognition of a chimeric recombinant proteinase 3 variant by anti-neutrophil cytoplasmic antibodies.
Front. Immunol. 9:979 (2018)

Ghosh, S. ; Drexler, I. ; Bhatia, S. ; Adler, H. ; Gennery, A.R. ; Borkhardt, A.

Interleukin-2-inducible T-cell kinase deficiency-new patients, new insight?
Front. Immunol. 9, 2197:979 (2018)

Ghosh, S. ; Drexler, I. ; Bhatia, S. ; Adler, H. ; Gennery, A.R. ; Borkhardt, A.

Erratum: Corrigendum: Interleukin-2-inducible T-cell kinase deficiency-new patients, new insight? (Frontiers in immunology (2018) 9 (979)).
Public Health Genomics 21, 19-20 (2018)

Oplopoiou, M. ; Kati, D. ; Ntaliarda, G. ; Giopanou, I. ; Papaleonidopoulos, V. ; Lilis, I. ; Stathopoulos, G.T.

Trp53 signaling in chemically induced lung adenocarcinoma.
EBioMedicine 36, 461-474 (2018)

Ng-Blichfeldt, J.P. ; Schrik, A. ; Kortekaas, R.K. ; Noordhoek, J.A. ; Heijink, I.H. ; Hiemstra, P.S. ; Stolk, J. ; Königshoff, M. ; Gosens, R.

Retinoic acid signaling balances adult distal lung epithelial progenitor cell growth and differentiation.
Cytokine, DOI: 10.1016/j.cyto.2018.08.006 (2018)

Magkouta, S. ; Kollintza, A. ; Moschos, C. ; Spella, M. ; Skianis, I. ; Pappas, A. ; Vazakidou, M.E. ; Stathopoulos, G.T. ; Kalomenidis, I.

Role of angiopoietins in mesothelioma progression.
ACS Nano 12, 7771-7790 (2018)

Kreyling, W.G. ; Möller, W. ; Holzwarth, U. ; Hirn, S. ; Wenk, A. ; Schleh, C. ; Schäffler, M. ; Haberl, N. ; Gibson, N. ; Schittny, J.C.

Age-dependent rat lung deposition patterns of inhaled 20 manometer gold nanoparticles and their quantitative biokinetics in adult rats.
Transboundary Emer. Dis. 65, 1421-1428 (2018)

Chen, Y. ; Ding, Z. ; Liu, X. ; Chen, J. ; Li, J. ; Fei, Y. ; Liu, Z. ; Stöger, T. ; Bi, Y. ; Yin, R.

Biological and phylogenetic characterization of a novel hemagglutination-negative avian avulavirus 6 isolated from wild waterfowl in China.
Aging 10, 2122-2135 (2018)

Prange, R. ; Thiedmann, M. ; Bhandari, A. ; Mishra, N. ; Sinha, A. ; Häsler, R. ; Rosenstiel, P. ; Uliczka, K. ; Wagner, C. ; Yildirim, A.Ö. ; Fink, C. ; Roeder, T.

A Drosophila model of cigarette smoke induced COPD identifies Nrf2 signaling as an expedient target for intervention.
Sci. Rep. 8:13008 (2018)

Roth, C.J. ; Förster, K. ; Hilgendorff, A. ; Ertl-Wagner, B. ; Wall, W.A. ; Flemmer, A.W.

Gas exchange mechanisms in preterm infants on HFOV - a computational approach.
Respir. Res. 19:175 (2018)

Lehmann, M. ; Buhl, L. ; Alsafadi, H.N. ; Klee, S. ; Hermann, S. ; Mutze, K. ; Ota, C. ; Lindner, M. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Wagner, D.E. ; Königshoff, M.

Differential effects of Nintedanib and Pirfenidone on lung alveolar epithelial cell function in ex vivo murine and human lung tissue cultures of pulmonary fibrosis.
Sci. Rep. 8:12983 (2018)

Ota, C. ; Ng-Blichfeldt, J.P. ; Korfei, M. ; Alsafadi, H.N. ; Lehmann, M. ; Skronska-Wasek, W. ; De Santis, M. ; Guenther, A. ; Wagner, D.E. ; Königshoff, M.

Dynamic expression of HOPX in alveolar epithelial cells reflects injury and repair during the progression of pulmonary fibrosis.
Eur. Respir. J. 52:1601355 (2018)

De Santis, M. ; Bolukbas, D.A. ; Lindstedt, S. ; Wagner, D.E.

How to build a lung: Latest advances and emerging themes in lung bioengineering.
Eur. Respir. J. 52:1702314 (2018)

Sun, N. ; Fernandez, I.E. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Feuchtinger, A. ; Burgstaller, G. ; Verleden, S.E. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Eickelberg, O. ; Walch, A.K.

Pharmacometabolic response to pirfenidone in pulmonary fibrosis detected by MALDI-FTICR-MSI.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 198, 1527-1538 (2018)

Martin-Medina, A. ; Lehmann, M. ; Burgy, O. ; Hermann, S. ; Baarsma, H.A. ; Wagner, D.E. ; De Santis, M. ; Ciolek, F. ; Hofer, T.P. ; Frankenberger, M. ; Aichler, M. ; Lindner, M. ; Gesierich, W. ; Guenther, A. ; Walch, A.K. ; Coughlan, C. ; Wolters, P.  ; Lee, J.S. ; Behr, J. ; Königshoff, M.

Increased extracellular vesicles mediate WNT5A signaling in idiopathic pulmonary fibrosis.

Schmitzer, M. ; Winter, H. ; Kneidinger, N. ; Meimarakis, G. ; Dick, A. ; Schramm, R. ; Klotz, L.V. ; Preissler, G. ; Strobl, N. ; von Dossow, V. ; Schneider, C. ; Weig, T. ; Hatz, R. ; Kauke, T.

Persistence of de novo donor-specific HLA-antibodies after lung transplantation: A potential marker of decreased patient survival.
Ann. Neurol. 84, 315-328 (2018)

Spadaro, M. ; Winklmeier, S. ; Beltrán, E. ; Macrini, C. ; Höftberger, R. ; Schuh, E. ; Thaler, F.S. ; Gerdes, L.A. ; Laurent, S.A. ; Gerhards, R. ; Brändle, S. ; Dornmair, K. ; Breithaupt, C. ; Krumbholz, M. ; Moser, M. ; Kirshnamoorthy, G. ; Kamp, F. ; Jenne, D. ; Hohlfeld, R. ; Kümpfel, T. ; Lassmann, H. ; Kawakami, N. ; Meinl, E.

Pathogenicity of human antibodies against myelin oligodendrocyte glycoprotein.
Cancer Res. 78, 3634-3644 (2018)

Magkrioti, C. ; Oikonomou, N. ; Kaffe, E. ; Mouratis, M.A. ; Xylourgidis, N. ; Barbayianni, I. ; Megadoukas, P. ; Harokopos, V. ; Valavanis, C. ; Chun, J. ; Kosma, A. ; Stathopoulos, G.T. ; Bouros, E. ; Bouros, D. ; Syrigos, K. ; Aidinis, V.

The autotaxin - lysophosphatidic acid axis promotes lung carcinogenesis.
In:. 2018.:180040 (Eur. Respir. Rev. ; 27)

Meiners, S. ; Lloyd, C. ; Chambers, R.C.

Cell–matrix interactions in lung disease and regeneration: ERS lung science conference 2018 report.
Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 315, L682-L696 (2018)

Heinzelmann, K. ; Lehmann, M. ; Gerckens, M. ; Noskovicova, N. ; Frankenberger, M. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O.

Cell-surface phenotyping identifies CD36 and CD97 as novel markers of fibroblast quiescence in lung fibrosis.
Lancet Oncol. 19, 930-939 (2018)

Psallidas, I. ; Kanellakis, N.I. ; Gerry, S. ; Thézénas, M.L. ; Charles, P.D. ; Samsonova, A. ; Schiller, H. B. ; Fischer, R. ; Asciak, R. ; Hallifax, R.J. ; Mercer, R. ; Dobson, M. ; Dong, T. ; Pavord, I.D. ; Collins, G.S. ; Kessler, B.M. ; Pass, H.I. ; Maskell, N. ; Stathopoulos, G.T. ; Rahman, N.M.

Development and validation of response markers to predict survival and pleurodesis success in patients with malignant pleural effusion (PROMISE): A multicohort analysis.
J. Biol. Chem. 293, 12415-12428 (2018)

Seren, S. ; Rashed Abouzaid, M. ; Eulenberg-Gustavus, C. ; Hirschfeld, J. ; Soliman, H. ; Jerke, U. ; N'Guessan, K. ; Dallet-Choisy, S. ; Lesner, A. ; Lauritzen, C. ; Schacher, B. ; Eickholz, P. ; Nagy, N. ; Széll, M. ; Croix, C. ; Viaud-Massuard, M.C. ; Al Farraj Aldosari, A. ; Ragunatha, S. ; Ibrahim Mostafa, M. ; Giampieri, F. ; Battino, M. ; Cornillier, H. ; Lorette, G. ; Stephan, J.L. ; Goizet, C. ; Pedersen, J. ; Gauthier, F. ; Jenne, D. ; Marchand-Adam, S. ; Chapple, I.L. ; Kettritz, R. ; Korkmaz, B.

Consequences of cathepsin C inactivation for membrane exposure of proteinase 3, the target antigen in autoimmune vasculitis.
Nanoscale 10, 11564-11577 (2018)

Yang, L. ; Kuang, H. ; Zhang, W. ; Wei, H. ; Xu, H.

Quantum dots cause acute systemic toxicity in lactating rats and growth restriction of offspring.
J. Heart Lung Transpl. 37, 1021-1028 (2018)

Götzfried, J. ; Smirnova, N.F. ; Morrone, C. ; Korkmaz, B. ; Yildirim, A.Ö. ; Eickelberg, O. ; Jenne, D.

Preservation with alpha(1)-antitrypsin improves primary graft function of murine lung transplants.
Pflugers Arch. 47, 1231–1241 (2018)

Kannler, M. ; Lüling, R. ; Yildirim, A.Ö. ; Gudermann, T. ; Steinritz, D. ; Dietrich, A.

TRPA1 channels: Expression in non-neuronal murine lung tissues and dispensability for hyperoxia-induced alveolar epithelial hyperplasia.
Transl. Res., DOI: 10.1016/j.trsl.2018.03.003 (2018)

Meiners, S. ; Evankovich, J. ; Mallampalli, R.K.

The ubiquitin proteasome system as a potential therapeutic target for systemic sclerosis.
Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 315, L87-L101 (2018)

Reicherzer, T. ; Häffner, S. ; Shahzad, T. ; Gronbach, J. ; Mysliwietz, J. ; Huebener, C. ; Hasbargen, U. ; Gertheiss, J. ; Schulze, A. ; Bellusci, S. ; Morty, R.E. ; Hilgendorff, A. ; Ehrhardt, H.

Activation of the NF-kappa B pathway alters the phenotype of MSCs in the tracheal aspirates of preterm infants with severe BPD.
Sci. Rep. 8:6078 (2018)

Saxon, J.A. ; Yu, H. ; Polosukhin, V.V. ; Stathopoulos, G.T. ; Gleaves, L.A. ; McLoed, A.G. ; Massion, P.P. ; Yull, F.E. ; Zhao, Z. ; Blackwell, T.S.

P52 expression enhances lung cancer progression.
Sci. Rep. 8:6788 (2018)

Gradl, R. ; Dierolf, M. ; Guenther, B. ; Hehn, L. ; Möller, W. ; Kutschke, D. ; Yang, L. ; Donnelley, M. ; Murrie, R. ; Erl, A. ; Stöger, T. ; Gleich, B. ; Achterhold, K. ; Schmid, O. ; Pfeiffer, F. ; Morgan, K.S.

In vivo dynamic phase-contrast X-ray Imaging using a compact light source.
Front. Immunol. 9:1216 (2018)

Zhang, W. ; Ohno, S. ; Steer, B. ; Klee, S. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Wagner, D.E. ; Lehmann, M. ; Stöger, T. ; Königshoff, M. ; Adler, H.

S100a4 is secreted by alternatively activated alveolar macrophages and promotes activation of lung fibroblasts in pulmonary fibrosis.
Front. Immunol. 9:366 (2018)

Zhang, P. ; Ding, Z. ; Liu, X. ; Chen, Y. ; Li, J. ; Tao, Z. ; Fei, Y. ; Xue, C. ; Qian, J. ; Wang, X. ; Li, Q. ; Stöger, T. ; Chen, J. ; Bi, Y. ; Yin, R.

Enhanced replication of virulent Newcastle disease virus in chicken macrophages is due to polarized activation of cells by inhibition of TLR7.
Cancer Res. 78, 2939-2951 (2018)

Vreka, M. ; Lilis, I. ; Papageorgopoulou, M. ; Giotopoulou, G.A. ; Lianou, M. ; Giopanou, I. ; Kanellakis, N.I. ; Spella, M. ; Agalioti, T. ; Armenis, V. ; Goldmann, T. ; Marwitz, S. ; Yull, F.E. ; Blackwell, T.S. ; Pasparakis, M. ; Marazioti, A. ; Stathopoulos, G.T.

IkB kinase a Is required for development and progression of KRAS-mutant lung adenocarcinoma.
Respir. Res. 19:67 (2018)

Knüppel, L. ; Heinzelmann, K. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

FK506-binding protein 10 (FKBP10) regulates lung fibroblast migration via collagen VI synthesis.
J. Innate Immun. 10, 487-501 (2018)

Hartl, D. ; Tirouvanziam, R. ; Laval, J. ; Greene, C.M. ; Habiel, D.M. ; Sharma, L. ; Yildirim, A.Ö. ; Dela Cruz, C.S. ; Hogaboam, C.M.

Innate immunity of the lung: From basic mechanisms to translational medicine.
2018 in
In: Abstract submission (American Thoracic Society (ATS) International Conference 2018, 18-23 May 2018, American Thoracic Society (ATS) International Conference 2018). 2018.:13993 - Fractalkine/CX3CR1 Axis ( ; Annual)

Greiffo, F.R. ; Frankenberger, M. ; Dietel, D. ; Ortega-Gomez, A. ; Behr, J. ; Soehnlein, O. ; Fernandez, I.E. ; Eickelberg, O.

Fractalkine/CX3CR1 axis drives kinetic changes of monocytes in fibrotic Interstitial Lung Disease.
Sci. Rep. 8:7547 (2018)

Dehmel, S. ; Nathan, P. ; Bartel, S. ; El-Mehrie, N. ; Scherb, H. ; Milger, K. ; John-Schuster, G. ; Yildirim, A.Ö. ; Hyklema, M. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Schaub, B. ; Eickelberg, O. ; Krauss-Etschmann, S.

Intrauterine smoke exposure deregulates lung function, pulmonary transcriptomes, and in particular insulin-like growth factor (IGF)-1 in a sex-specific manner.
Nat. Cell Biol. 20, 422-431 (2018)

Jiang, D. ; Correa-Gallegos, D. ; Christ, S. ; Stefanska, A. ; Liu, J. ; Ramesh, P. ; Rajendran, V. ; De Santis, M. ; Wagner, D.E. ; Rinkevich, Y.

Two succeeding fibroblastic lineages drive dermal development and the transition from regeneration to scarring.
EMBO Mol. Med. 10:e8349 (2018)

Jia, J. ; Conlon, T.M. ; Sarker, R.S. ; Taşdemir, D. ; Smirnova, N.F. ; Srivastava, B. ; Verleden, S.E. ; Güneş, G. ; Wu, X. ; Prehn, C. ; Gao, J. ; Heinzelmann, K. ; Lintelmann, J. ; Irmler, M. ; Pfeiffer, S. ; Schloter, M. ; Zimmermann, R. ; Hrabě de Angelis, M. ; Beckers, J. ; Adamski, J. ; Bayram, H. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Cholesterol metabolism promotes B-cell positioning during immune pathogenesis of chronic obstructive pulmonary disease.
J. Med. Chem. 61, 1858-1870 (2018)

Guarino, C. ; Gruba, N. ; Grzywa, R. ; Dyguda-Kazimierowicz, E. ; Hamon, Y. ; Łȩgowska, M. ; Skoreński, M. ; Dallet-Choisy, S. ; Marchand-Adam, S. ; Kellenberger, C. ; Jenne, D. ; Sieńczyk, M. ; Lesner, A. ; Gauthier, F. ; Korkmaz, B.

Exploiting the S4-S5 Specificity of Human Neutrophil Proteinase 3 to Improve the Potency of Peptidyl Di(chlorophenyl)-phosphonate Ester Inhibitors: A Kinetic and Molecular Modeling Analysis.
Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 314, L695-L707 (2018)

Noskovicova, N. ; Heinzelmann, K. ; Burgstaller, G. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.

Cub domain-containing protein 1 negatively regulates TGF-β signaling and myofibroblast differentiation.
JCI insight 3:93203 (2018)

Houssaini, A. ; Breau, M. ; Kebe, K. ; Abid, S. ; Marcos, E. ; Lipskaia, L. ; Rideau, D. ; Parpaleix, A. ; Huang, J. ; Amsellem, V. ; Vienney, N. ; Validire, P. ; Maitre, B. ; Attwe, A. ; Lukas, C. ; Vindrieux, D. ; Boczkowski, J. ; Derumeaux, G. ; Pende, M. ; Bernard, D. ; Meiners, S. ; Adnot, S.

mTOR pathway activation drives lung cell senescence and emphysema.

Shandilya, N. ; Ligthart, T. ; van Voorde, I. ; Stahlmecke, B. ; Clavaguera, S. ; Philippot, C. ; Ding, Y. ; Goede, H.

A nanomaterial release model for waste shredding using a Bayesian belief network.
Pediatrics 141:e20170889 (2018)

Lai, T. ; Wu, M. ; Liu, J. ; Luo, M.C. ; He, L. ; Wang, X. ; Wu, B.L. ; Ying, S. ; Chen, Z. ; Li, W. ; Shen, H.

Acid-suppressive drug use during pregnancy and the risk of childhood asthma: A meta-analysis.
Nat. Commun. 9:672 (2018)

Marazioti, A. ; Lilis, I. ; Vreka, M. ; Apostolopoulou, H. ; Kalogeropoulou, A. ; Giopanou, I. ; Giotopoulou, G.A. ; Krontira, A.C. ; Iliopoulou, M. ; Kanellakis, N.I. ; Agalioti, T. ; Giannou, A.D. ; Jones-Paris, C. ; Iwakura, Y. ; Kardamakis, D. ; Blackwell, T.S. ; Taraviras, S. ; Spella, M. ; Stathopoulos, G.T.

Myeloid-derived interleukin-1β drives oncogenic KRAS-NF-κΒ addiction in malignant pleural effusion.
Sci. Rep. 8:2096 (2018)

Hellbach, K. ; Meinel, F.G. ; Conlon, T.M. ; Willer, K. ; Yaroshenko, A. ; Velroyen, A. ; Braunagel, M. ; Auweter, S. ; Reiser, M.F. ; Eickelberg, O. ; Pfeiffer, F. ; Yildirim, A.Ö.

X-ray dark-field imaging to depict acute lung inflammation in mice.
Nat. Commun. 9:288 (2018)

Rozman, J. ; Rathkolb, B. ; Oestereicher, M.A. ; Schütt, C. ; Ravindranath, A.C. ; Leuchtenberger, S. ; Sharma, S. ; Kistler, M. ; Willershäuser, M. ; Brommage, R. ; Meehan, T.F. ; Mason, J. ; Haselimashhadi, H. ; Hough, T. ; Mallon, A.-M. ; Wells, S. ; Santos, L. ; Lelliott, C.J. ; White, J.K. ; Sorg, T. ; Champy, M.-F. ; Bower, L.R. ; Reynolds, C.L. ; Flenniken, A.M. ; Murray, S.A. ; Nutter, L.M.J. ; Svenson, K.L. ; West, D. ; Tocchini-Valentini, G.P. ; Beaudet, A.L. ; Bosch, F. ; Braun, R.B. ; Dobbie, M.S. ; Gao, X. ; Herault, Y. ; Moshiri, A. ; Moore, B.A. ; Kent Lloyd, K.C. ; McKerlie, C. ; Masuya, H. ; Tanaka, N. ; Flicek, P. ; Parkinson, H.E. ; Sedlacek, R. ; Seong, J.K. ; Wang, C.-K.L. ; Moore, M. ; Brown, S.D. ; Tschöp, M.H. ; Wurst, W. ; Klingenspor, M. ; Wolf, E. ; Beckers, J. ; Machicao, F. ; Peter, A. ; Staiger, H. ; Häring, H.-U. ; Grallert, H. ; Campillos, M. ; Maier, H. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Werner, T. ; Hrabě de Angelis, M. ; IMPC Consortium (Eickelberg, O.) ; IMPC Consortium (Yildirim, A.Ö.)

Identification of genetic elements in metabolism by high-throughput mouse phenotyping.  
Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 314, L708-L723 (2018)

Burgstaller, G. ; Sengupta, A. ; Vierkotten, S. ; Preissler, G. ; Lindner, M. ; Behr, J. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O.

Distinct niches within the extracellular matrix dictate fibroblast function in (cell free) 3D lung tissue cultures.

Maldonado, M. ; Salgado-Aguayo, A. ; Herrera, I. ; Cabrera, S. ; Ortíz-Quintero, B. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Eickelberg, O. ; Ramírez, R. ; Manicone, A.M. ; Selman, M. ; Pardo, A.

Upregulation and nuclear location of MMP28 in alveolar epithelium of idiopathic pulmonary fibrosis.
Pharmacol. Ther. 187, 150-166 (2018)

Skronska-Wasek, W. ; Gosens, R. ; Königshoff, M. ; Baarsma, H.A.

WNT receptor signalling in lung physiology and pathology.
Biotechnol. J. 13:1700341 (2018)

Zscheppang, K. ; Berg, J.V. ; Hedtrich, S. ; Verheyen, L. ; Wagner, D.E. ; Suttorp, N. ; Hippenstiel, S. ; Hocke, A.C.

Human pulmonary 3D models for translational research.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 197, 1076-1080 (2018)

Förster, K. ; Sass, S. ; Ehrhardt, H. ; Mous, D.S. ; Rottier, R.J. ; Oak, P. ; Schulze, A. ; Flemmer, A.W. ; Gronbach, J. ; Hübener, C. ; Desai, T. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Hilgendorff, A.

Early identification of bronchopulmonary dysplasia using novel biomarkers by proteomic screening.
J. Community Genet. 9, 103-116 (2018)

Borry, P. ; Bentzen, H.B. ; Budin-Ljøsne, I. ; Cornel, M.C. ; Howard, H.C. ; Feeney, O. ; Jackson, L. ; Mascalzoni, D. ; Mendes, Á. ; Peterlin, B. ; Riso, B. ; Shabani, M. ; Skirton, H. ; Sterckx, S. ; Vears, D. ; Wjst, M. ; Felzmann, H.

The challenges of the expanded availability of genomic information: An agenda-setting paper.
Microb. Ecol. 75, 529-542 (2018)

Kostric, M. ; Milger, K. ; Krauss-Etschmann, S. ; Engel, M. ; Vestergaard, G. ; Schloter, M. ; Schöler, A.

Development of a stable lung microbiome in healthy neonatal mice.
J. Heart Lung Transpl. 37, 268-274 (2018)

Leuschner, G. ; Stocker, F. ; Veit, T. ; Kneidinger, N. ; Winter, H. ; Schramm, R. ; Weig, T. ; Matthes, S. ; Ceelen, F. ; Arnold, P. ; Munker, D. ; Klenner, F. ; Hatz, R. ; Frankenberger, M. ; Behr, J. ; Neurohr, C.

Outcome of lung transplantation in idiopathic pulmonary fibrosis with previous anti-fibrotic therapy.