Rolled up magazines on blue background

All Publications

Oncology 101, 126-133 (2022)

Erlmeier, F. ; Sun, N. ; Shen, J. ; Feuchtinger, A. ; Buck, A. ; Prade, V.M. ; Kunzke, T. ; Schraml, P. ; Moch, H. ; Autenrieth, M. ; Weichert, W. ; Hartmann, A. ; Walch, A.K.

MALDI mass spectrometry imaging-Diagnostic pathways and metabolites for renal tumor entities.
Cancers 14:5485 (2022)

Xue, B. ; von Heyking, K. ; Gassmann, H. ; Poorebrahim, M. ; Thiede, M. ; Schober, K. ; Mautner, J. ; Hauer, J. ; Ruland, J. ; Busch, D.H. ; Thiel, U. ; Burdach, S.E.G.

T cells directed against the metastatic driver chondromodulin-1 in ewing sarcoma: Comparative engineering with CRISPR/Cas9 vs. retroviral gene transfer for adoptive transfer.
JCI insight 7:e162138 (2022)

Buck, A. ; Prade, V.M. ; Kunzke, T. ; Erben, R.G. ; Walch, A.K.

Spatial metabolomics reveals upregulation of several pyrophosphate-producing pathways in cortical bone of Hyp mice.
Front. Immunol. 13:889836 (2022)

Nückel, J. ; Planatscher, E. ; Mohr, A.W. ; Deichl, K. ; Mijočević, H. ; Feuerherd, M. ; Wolff, L.S. ; Erber, J. ; Schneider, J. ; Quante, M. ; Winter, C. ; Ruland, J. ; Hapfelmeier, A. ; Hammerschmidt, W. ; Moosmann, A. ; Protzer, U. ; Behrends, U. ; Mautner, J.

Association between IgG responses against the nucleocapsid proteins of alphacoronaviruses and COVID-19 severity.
Oncol. Res. Treat. 45, 2, 162-162 (2022)

Zeller, T. ; Lutz, S. ; Munnich, I.A. ; Windisch, R. ; Hilger, P. ; Herold, T. ; Tahiri, N. ; Banck, J.C. ; Weigert, O. ; Moosmann, A. ; von Bergwelt-Baildon, M. ; Bruns, H. ; Wichmann, C. ; Valerius, T. ; Schewe, D.M. ; Peipp, M. ; Roesner, T. ; Humpe, A. ; Kellner, C.

Dual checkpoint blockade of CD47 and LILRB1 enhances CD20 antibody-dependent phagocytosis of lymphoma cells by macrophages.
PNAS Nexus 1:pgac045 (2022)

Rössler, J. ; Pich, D. ; Albanese, M. ; Wratil, P.R. ; Krähling, V. ; Hellmuth, J.C. ; Scherer, C. ; von Bergwelt-Baildon, M. ; Becker, S. ; Keppler, O.T. ; Brisson, A. ; Zeidler, R. ; Hammerschmidt, W.

Quantitation of SARS-CoV-2 neutralizing antibodies with a virus-free, authentic test.
Nat. Commun. 13:4689 (2022)

Koch, J. ; Schober, S.J. ; Hindupur, S.V. ; Klein, F.G. ; Mantwill, K. ; Ehrenfeld, M. ; Schillinger, U. ; Hohnecker, T. ; Qi, P. ; Steiger, K. ; Aichler, M. ; Gschwend, J.E. ; Nawroth, R. ; Holm, P.S.

Targeting the Retinoblastoma/E2F repressive complex by CDK4/6 inhibitors amplifies oncolytic potency of an oncolytic adenovirus.
Front. Immunol. 13:913275 (2022)

Kuhn, L. ; Valentin, S. ; Stojanovic, K. ; Strobl, D.C. ; Babushku, T. ; Wang, Y. ; Rambold, U. ; Scheffler, L. ; Grath, S. ; John-Robbert, D. ; Blum, H. ; Feuchtinger, A. ; Blutke, A. ; Weih, F. ; Kitamura, D. ; Rad, R. ; Strobl, L.J. ; Zimber-Strobl, U.

RelB contributes to the survival, migration and lymphomagenesis of B cells with constitutively active CD40 signaling.
Front. Microbiol. 13:955603 (2022)

Albanese, M. ; Tagawa, T. ; Hammerschmidt, W.

Strategies of Epstein-Barr virus to evade innate antiviral immunity of its human host.
PLoS ONE 17:e0271630 (2022)

Hiepp, L. ; Mayr, D. ; Gärtner, K. ; Schmoeckel, E. ; Klauschen, F. ; Burges, A. ; Mahner, S. ; Zeidler, R. ; Czogalla, B.

Carbonic anhydrase XII as biomarker and therapeutic target in ovarian carcinomas.

Beer, S. ; Wange, L.E. ; Zhang, X. ; Kuklik-Roos, C. ; Enard, W. ; Hammerschmidt, W. ; Scialdone, A. ; Kempkes, B.

EBNA2-EBF1 complexes promote MYC expression and metabolic processes driving S-phase progression of Epstein-Barr virus-infected B cells.
Mol. Metab. 66:101616 (2022)

Maity-Kumar, G. ; Ständer, L. ; de Angelis, M. ; Lee, S. ; Molenaar, A. ; Becker, L. ; Garrett, L. ; Amarie, O.V. ; Hölter, S.M. ; Wurst, W. ; Fuchs, H. ; Feuchtinger, A. ; Gailus-Durner, V. ; García-Cáceres, C. ; Othman, A.E. ; Brockmann, C. ; Schöffling, V.I. ; Beiser, K. ; Krude, H. ; Mroz, P.A. ; Hofmann, S.M. ; Tuckermann, J. ; DiMarchi, R.D. ; Hrabě de Angelis, M. ; Tschöp, M.H. ; Pfluger, P.T. ; Müller, T.D.

Validation of Mct8/Oatp1c1 dKO mice as a model organism for the Allan-Herndon-Dudley Syndrome.
Nat. Commun. 13:5104 (2022)

Kedor, C. ; Freitag, H. ; Meyer-Arndt, L. ; Wittke, K. ; Hanitsch, L.G. ; Zöller, T. ; Steinbeis, F. ; Haffke, M. ; Rudolf, G. ; Heidecker, B. ; Bobbert, T. ; Spranger, J. ; Volk, H.D. ; Skurk, C. ; Konietschke, F. ; Paul, F. ; Behrends, U. ; Bellmann-Strobl, J. ; Scheibenbogen, C.

A prospective observational study of post-COVID-19 chronic fatigue syndrome following the first pandemic wave in Germany and biomarkers associated with symptom severity.
Nat. Commun. 13:6009 (2022)

Kedor, C. ; Freitag, H. ; Meyer-Arndt, L. ; Wittke, K. ; Hanitsch, L.G. ; Zöller, T. ; Steinbeis, F. ; Haffke, M. ; Rudolf, G. ; Heidecker, B. ; Bobbert, T. ; Spranger, J. ; Volk, H.D. ; Skurk, C. ; Konietschke, F. ; Paul, F. ; Behrends, U. ; Bellmann-Strobl, J. ; Scheibenbogen, C.

Author Correction: A prospective observational study of post-COVID-19 chronic fatigue syndrome following the first pandemic wave in Germany and biomarkers associated with symptom severity (Nature Communications, (2022), 13, 1, (5104), 10.1038/s41467-022-32507-6).
EBioMedicine 85:104296 (2022)

Ackermann, M. ; Kamp, J.C. ; Werlein, C. ; Walsh, C.L. ; Stark, H. ; Prade, V.M. ; Surabattula, R. ; Wagner, W.L. ; Disney, C. ; Bodey, A.J. ; Illig, T. ; Leeming, D.J. ; Karsdal, M.A. ; Tzankov, A. ; Boor, P. ; Kühnel, M.P. ; Länger, F.P. ; Verleden, S.E. ; Kvasnicka, H.M. ; Kreipe, H.H. ; Haverich, A. ; Black, S.M. ; Walch, A. ; Tafforeau, P. ; Lee, P.D. ; Hoeper, M.M. ; Welte, T. ; Seeliger, B. ; David, S.P. ; Schuppan, D. ; Mentzer, S.J. ; Jonigk, D.D.

The fatal trajectory of pulmonary COVID-19 is driven by lobular ischemia and fibrotic remodelling.
Eur. J. Cancer 176, 41-49 (2022)

Lombardo, E. ; Hess J. ; Kurz, C. ; Riboldi, M. ; Marschner, S. ; Baumeister, P. ; Lauber, K. ; Pflugradt, U. ; Walch, A.K. ; Canis, M. ; Klauschen, F. ; Zitzelsberger, H. ; Belka, C. ; Landry, G. ; Unger, K.

DeepClassPathway: Molecular pathway aware classification using explainable deep learning.
Cancers 14:3745 (2022)

Hess J. ; Unger, K. ; Maihoefer, C. ; Schuettrumpf, L. ; Weber, P. ; Marschner, S. ; Wintergerst, L. ; Pflugradt, U. ; Baumeister, P. ; Walch, A.K. ; Woischke, C. ; Kirchner, T. ; Werner, M. ; Soerensen, K. ; Baumann, M. ; Tinhofer, I. ; Combs, S.E. ; Debus, J. ; Schaefer, H. ; Krause, M. ; Linge, A. ; von der Gruen, J. ; Stuschke, M. ; Zips, D. ; Canis, M. ; Lauber, K. ; Ganswindt, U. ; Henke, M. ; Zitzelsberger, H. ; Belka, C.

Integration of p16/HPV DNA status with a 24-miRNA-defined molecular phenotype improves clinically relevant stratification of head and neck cancer patients.
Lab. Invest. 102, 1400-1405 (2022)

Kreutzer, L. ; Weber, P. ; Heider, T. ; Heikenwaelder, M. ; Riedl, T. ; Baumeister, P. ; Klauschen, F. ; Belka, C. ; Walch, A.K. ; Zitzelsberger, H. ; Hess J. ; Unger, K.

Simultaneous metabolite MALDI-MSI, whole exome and transcriptome analysis from formalin-fixed paraffin-embedded tissue sections.

Hui, B. ; Lu, C. ; Li, H. ; Hao, X. ; Liu, H. ; Zhuo, D. ; Wang, Q. ; Li, Z. ; Liu, L. ; Wang, X. ; Gu, Y. ; Tang, W.

Inhibition of APOE potentiates immune checkpoint therapy for cancer.
Biomedicines 10:825 (2022)

Kellner, M. ; von Neubeck, B. ; Czogalla, B. ; Feederle, R. ; Vick, B. ; Jeremias, I. ; Zeidler, R.

A novel anti-CD73 antibody that selectively inhibits membrane 2 CD73 shows antitumor activity and induces tumor immune escape.
Leukemia 36, 2281–2292 (2022)

Mentz, M. ; Keay, W. ; Strobl, C.D. ; Antoniolli, M. ; Adolph, L. ; Heide, M. ; Lechner, A. ; Haebe, S. ; Osterode, E. ; Kridel, R. ; Ziegenhain, C. ; Wange, L.E. ; Hildebrand, J.A. ; Shree, T. ; Silkenstedt, E. ; Staiger, A.M. ; Ott, G. ; Horn, H. ; Szczepanowski, M. ; Richter, J. ; Levy, R. ; Rosenwald, A. ; Enard, W. ; Zimber-Strobl, U. ; von Bergwelt-Baildon, M. ; Hiddemann, W. ; Klapper, W. ; Schmidt-Supprian, M. ; Rudelius, M. ; Bararia, D. ; Passerini, V. ; Weigert, O.

PARP14 is a novel target in STAT6 mutant follicular lymphoma.
Cancers 14:1763 (2022)

Erlmeier, F. ; Sun, N. ; Shen, J. ; Feuchtinger, A. ; Buck, A. ; Prade, V.M. ; Kunzke, T. ; Schraml, P. ; Moch, H. ; Autenrieth, M. ; Weichert, W. ; Hartmann, A. ; Walch, A.K.

MALDI mass spectrometry imaging—prognostic pathways and metabolites for renal cell carcinomas.
Histochem. Cell Biol. 157, 595–605 (2022)

Wang, Q. ; Sun, N. ; Kunzke, T. ; Buck, A. ; Shen, J. ; Prade, V.M. ; Stöckl, B. ; Wang, J. ; Feuchtinger, A. ; Walch, A.K.

A simple preparation step to remove excess liquid lipids in white adipose tissue enabling improved detection of metabolites via MALDI-FTICR imaging MS.
BMC Cancer 22:254 (2022)

Ebert, K. ; Haffner, I. ; Zwingenberger, G. ; Keller, S. ; Raimúndez, E. ; Geffers, R. ; Wirtz, R. ; Barbaria, E. ; Hollerieth, V. ; Arnold, R. ; Walch, A.K. ; Hasenauer, J. ; Maier, D. ; Lordick, F. ; Luber, B.

Combining gene expression analysis of gastric cancer cell lines and tumor specimens to identify biomarkers for anti-HER therapies-the role of HAS2, SHB and HBEGF.
Cancer Cell 40, 639-655.e13 (2022)

Ravi, V.M. ; Will, P. ; Kueckelhaus, J. ; Sun, N. ; Joseph, K. ; Salié, H. ; Vollmer, L. ; Kuliesiute, U. ; von Ehr, J. ; Benotmane, J.K. ; Neidert, N. ; Follo, M. ; Scherer, F. ; Goeldner, J.M. ; Behringer, S.P. ; Franco, P. ; Khiat, M. ; Zhang, J. ; Hofmann, U.G. ; Fung, C. ; Ricklefs, F.L. ; Lamszus, K. ; Boerries, M. ; Ku, M.C. ; Beck, J. ; Sankowski, R. ; Schwabenland, M. ; Prinz, M. ; Schüller, U. ; Killmer, S. ; Bengsch, B. ; Walch, A.K. ; Delev, D. ; Schnell, O. ; Heiland, D.H.

Spatially resolved multi-omics deciphers bidirectional tumor-host interdependence in glioblastoma.

Tang, W. ; Zhou, Y. ; Zhao, H. ; Sun, G. ; Rong, D. ; Li, Z. ; Hu, M. ; Han, L.F. ; He, X. ; Zhao, S. ; Chen, X. ; Yuan, H. ; Chen, S. ; Wang, Q. ; Gu, J. ; Wang, X. ; Song, J.

A 3D multi-modal intelligent intervention system using electromagnetic navigation for real-time positioning and ultrasound images: A prospective randomized controlled trial.
Cancer Comm. 42, 517-535 (2022)

Shen, J. ; Sun, N. ; Zens, P. ; Kunzke, T. ; Buck, A. ; Prade, V.M. ; Wang, J. ; Wang, Q. ; Hu, R. ; Feuchtinger, A. ; Berezowska, S. ; Walch, A.K.

Spatial metabolomics for evaluating response to neoadjuvant therapy in non-small cell lung cancer patients.
J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 37, 592-596 (2022)

Testa, C. ; Papini, A.M. ; Zeidler, R. ; Vullo, D. ; Carta, F. ; Supuran, C.T. ; Rovero, P.

First studies on tumor associated carbonic anhydrases IX and XII monoclonal antibodies conjugated to small molecule inhibitors.

Prade, V.M. ; Sun, N. ; Shen, J. ; Feuchtinger, A. ; Kunzke, T. ; Buck, A. ; Schraml, P. ; Moch, H. ; Schwamborn, K. ; Autenrieth, M. ; Gschwend, J.E. ; Erlmeier, F. ; Hartmann, A. ; Walch, A.K.

The synergism of spatial metabolomics and morphometry improves machine learning-based renal tumour subtype classification.
Nat. Commun. 13:1589 (2022)

Paul, T. ; Ledderose, S. ; Bartsch, H. ; Sun, N. ; Soliman, S. ; Märkl, B. ; Ruf, V. ; Herms, J. ; Stern, M. ; Keppler, O.T. ; Delbridge, C. ; Müller, S. ; Piontek, G. ; Kimoto, Y.S. ; Schreiber, F. ; Williams, T.A. ; Neumann, J. ; Knösel, T. ; Schulz, H. ; Spallek, R. ; Graw, M. ; Kirchner, T. ; Walch, A.K. ; Rudelius, M.

Adrenal tropism of SARS-CoV-2 and adrenal findings in a post-mortem case series of patients with severe fatal COVID-19.
Basic Res. Cardiol. 117:11 (2022)

Kogan, P.S. ; Wirth, F. ; Tomar, A. ; Darr, J. ; Teperino, R. ; Lahm, H. ; Dreßen, M. ; Puluca, N. ; Zhang, Z. ; Neb, I. ; Beck, N. ; Luzius, T. ; de la Osa de la Rosa, L. ; Gärtner, K. ; Hüls, C. ; Zeidler, R. ; Ramanujam, D. ; Engelhardt, S. ; Wenk, C. ; Holdt, L.M. ; Mononen, M. ; Sahara, M. ; Cleuziou, J. ; Hörer, J. ; Lange, R. ; Krane, M. ; Doppler, S.A.

Uncovering the molecular identity of cardiosphere-derived cells (CDCs) by single-cell RNA sequencing.
Cell Metab. 34, 473-486.e9 (2022)

Loft, A. ; Schmidt, S.F. ; Caratti, G. ; Stifel, U. ; Havelund, J.F. ; Sekar, R. ; Kwon, Y. ; Sulaj, A. ; Chow, K.K. ; Alfaro, A.J. ; Schwarzmayr, T. ; Rittig, N. ; Svart, M. ; Tsokanos, F.-F. ; Maida, A. ; Blutke, A. ; Feuchtinger, A. ; Møller, N. ; Blüher, M. ; Nawroth, P. ; Szendrödi, J. ; Færgeman, N.J. ; Zeigerer, A. ; Tuckermann, J. ; Herzig, S.

A macrophage-hepatocyte glucocorticoid receptor axis coordinates fasting ketogenesis.
Clin. Cancer Res. 28, 2865-2877 (2022)

Wang, J. ; Kunzke, T. ; Prade, V.M. ; Shen, J. ; Buck, A. ; Feuchtinger, A. ; Haffner, I. ; Luber, B. ; Liu, D.H.W. ; Langer, R. ; Lordick, F. ; Sun, N. ; Walch, A.K.

Spatial metabolomics identifies distinct tumor-specific subtypes in gastric cancer patients.
Cell Metab. 34, 329-345.e8 (2022)

Sato, S. ; Dyar, K.A. ; Treebak, J.T. ; Jepsen, S.L. ; Ehrlich, A.M. ; Ashcroft, S.P. ; Trost, K. ; Kunzke, T. ; Prade, V.M. ; Small, L. ; Basse, A.L. ; Schönke, M. ; Chen, S. ; Samad, M. ; Baldi, P. ; Barrès, R. ; Walch, A.K. ; Moritz, T. ; Holst, J.J. ; Lutter, D. ; Zierath, J.R. ; Sassone-Corsi, P.

Atlas of exercise metabolism reveals time-dependent signatures of metabolic homeostasis.
Clin. Cancer Res. 28, 1038-1052 (2022)

Weber, P. ; Künstner, A. ; Hess J. ; Unger, K. ; Marschner, S. ; Idel, C. ; Ribbat-Idel, J. ; Walz, C. ; Rietzler, S. ; Valeanu, L. ; Herkommer, T. ; Kreutzer, L. ; Klymenko, O. ; Kirchner, T. ; Ganswindt, U. ; Walch, A.K. ; Sterr, M. ; Lickert, H. ; Canis, M. ; Rades, D. ; Perner, S. ; Berriel Diaz, M. ; Herzig, S. ; Wollenberg, B. ; Busch, H. ; Zitzelsberger, H.

Therapy-related transcriptional subtypes in matched primary and recurrent head and neck cancer.
Nucleic Acids Res. 50, 490-511 (2022)

Bernaudat, F. ; Gustems, M. ; Günther, J. ; Oliva, M.F. ; Buschle, A. ; Göbel,C. ; Pagniez, P. ; Lupo, J. ; Signor, L. ; Müller, C.W. ; Morand, P. ; Sattler, M. ; Hammerschmidt, W. ; Petosa, C.

Structural basis of DNA methylation-dependent site selectivity of the Epstein-Barr virus lytic switch protein ZEBRA/Zta/BZLF1.
J. Pathol. 256, 202-213 (2022)

Buck, A. ; Prade, V.M. ; Kunzke, T. ; Feuchtinger, A. ; Kröll, D. ; Feith, M. ; Dislich, B. ; Balluff, B. ; Langer, R. ; Walch, A.K.

Metabolic tumor constitution is superior to tumor regression grading for evaluating response to neoadjuvant therapy of esophageal adenocarcinoma patients.