Publications

Plant Sci. 362:112830 (2026)

Széles, E. ; Kondak, D. ; Da Silva, R.C. ; Szabados, L. ; Lindermayr, C. ; Kolbert, Z.

Genetic and bIOCHEMICAL approaches used FOR identification and MECHANISTIC characterization of NitriC oxide-RESPONSIVE plant genes.
J. Virol., DOI: 10.1128/jvi.01646-25:e0164625 (2025)

Yan, W. ; Liu, X. ; Jiang, S. ; Li, H. ; Chi, W. ; Luo, R. ; Peng, J. ; Jiang, F. ; Stöger, T. ; Wajid, A. ; Dodovski, A. ; Gao, C. ; Mingala, C.N. ; Andreychuk, D.B. ; Yin, R.

Emergence and characterization of historically extinct virulent genotype IV Newcastle disease virus in wild and domestic birds: genetic insights, pathogenicity, and vaccine efficacy.
Sci. Adv. 11:eadx8586 (2025)

Liu, Q. ; Yang, L. ; Li, C. ; Han, L. ; Wilmot, J. ; Yang, G. ; Leinardi, R. ; Zhou, Q. ; Schröppel, A. ; Kutschke, D. ; Secklehner, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Huaux, F. ; Zeuschner, D. ; Carlin, L.M. ; Sperandio, M. ; Schmid, O. ; Stöger, T. ; Rehberg, M.

Alveolar macrophages initiate the spatially targeted recruitment of neutrophils after nanoparticle inhalation.

Firsova, A.B. ; Marco Salas, S. ; Kuemmerle, L. ; Abalo, X.M. ; Sountoulidis, A. ; Larsson, L. ; Mahbubani, K.T. ; Theelke, J. ; Andrusivova, Z. ; Alonso Galicia, L. ; Liontos, A. ; Balassa, T. ; Kovács, F. ; Horvath, P. ; Chen, Y. ; Gote-Schniering, J. ; Stoleriu, M.-G. ; Behr, J. ; Meyer, K.B. ; Timens, W. ; Schiller, H.B. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Lundeberg, J. ; Nilsson, M. ; Nawijn, M.C. ; Samakovlis, C.

Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung.

Mümmler, C. ; Lenoir, A. ; Götschke, J. ; Gerckens, M. ; Kaiser, M. ; Kayser, M. ; Drick, N. ; Suhling, H. ; Biener, L. ; Pizarro, C. ; Skowasch, D. ; Kneidinger, N. ; Behr, J. ; Milger, K.

Long-term outcomes of dupilumab therapy in severe asthma: A retrospective, multicenter, real-world study.
J. Clin. Invest., DOI: 10.1172/JCI180927:e180927 (2025)

Kumari, N. ; Wright, S.C. ; Witham, C.M. ; Monserrat, L. ; Palafox, M. ; Charles Richard, J.L. ; Costa, C. ; Elkabets, M. ; Agostino, M. ; Klemm, T. ; Eccles, M.K. ; Garnham, A. ; Wu, T. ; Nilsson, J.A. ; Walz, N. ; Venugopal, V. ; Cerra, A. ; Vasilevski, N. ; Bridgeman, S.C. ; Bassi, S. ; Saei, A. ; Helal, M. ; Neundorf, P. ; Riedel, A. ; Rosenfeldt, M. ; Gill, J. ; Pahor, N. ; Hartmann, O. ; Chung, J. ; Sidhu, S.S. ; Moderau, N. ; Jha, S. ; Rodon, J. ; Diefenbacher, M. ; Komander, D. ; Serra, V. ; Eichhorn, P.

USP10/GSK3B-mediated inhibition of PTEN drives resistance to PI3K inhibitors in breast cancer.
ACS Nano, DOI: 10.1021/acsnano.5c12054 (2025)

Voss, C. ; Han, L. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Haefner, V. ; Angelidis, I. ; Mayr, C.H. ; Berthing, T. ; Zhou, Q. ; Günther, E. ; Huzain, O. ; Schmid, O. ; Vogel, U. ; Schniering, J. ; Gaedcke, S. ; Theis, F.J. ; Schiller, H.B. ; Stöger, T.

Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: Single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation.
In: RNA Therapeutics. 2025. 417-437 (Methods Mol. Biol. ; 2965)

Rademacker, S. ; Müller, J.T. ; Kromer, A.P.E. ; Carneiro, S.P. ; Merkel, O.M.

Nanoparticle-mediated siRNA delivery in human epithelial lung cells cultured at the air-liquid interface.
ERJ Open Res. 11:01183-2024 (2025)

Förster, K. ; Strobl, K. ; Kindt, A. ; Häfner, F. ; Schubert, B. ; Heinen, F. ; Flemmer, A.W. ; Steffinger, D. ; Dietrich, O. ; Stoecklein, S. ; Brinkmann, F. ; Hilgendorff, A.

Lung MRI scoring reveals persistence of emphysema-like changes in lungs of infants born preterm at (pre)school age.
Allergy, DOI: 10.1111/all.70121 (2025)

Korkmaz, R.Ü. ; Omony, J. ; Tan, X. ; Klotz, M. ; Dragunas, G. ; Chen, S. ; Shankhwar, S. ; Ertüz, Z. ; Müller, C. ; Ragab, M. ; Jeridi, A. ; Augustin, R. ; Nawroth, J. ; Kapellos, T. ; Rankl, B. ; Yildirim, A.Ö. ; von Mutius, E.

The therapeutic potential of farm dust extracts in a mouse model of eosinophilic inflammation.
Coronaviruses 6:e250624231114 (2025)

Sahu, T. ; Pande, B. ; Kumar, P. ; Khelkar, T. ; Bhaskar, L.V.K.S. ; Verma, H.K.

A perspective on gastrointestinal complications in COVID-19: Clinical features, diagnosis, research, mechanisms, and multidisciplinary management.
JACC: Case Reports 30:105295 (2025)

Biechele, G. ; Fink, N.R. ; Dinkel, J. ; Mehnert, R. ; Starrach, T. ; Schelling, M. ; Hübener, C. ; Mahner, S. ; Wintersperger, B. ; Ricke, J. ; Stöcklein, S.

Fetal cardiac magnetic resonance imaging in left-sided diaphragmatic hernia.
Mater. Today, DOI: 10.1016/j.mattod.2025.08.024 (2025)

Stone, V. ; Moschini, E. ; Murphy, F. ; Hunt, N. ; Blosi, M. ; Hristozov, D. ; Johnston, H. ; Stenton, F. ; Mikolajczyk, A. ; Oomen, A.G. ; Schmid, O. ; Tsiliki, G. ; Brunelli, A. ; Badetti, E. ; Vogel, U. ; Gajewicz-Skretna, A. ; Wohlleben, W.

Minimising data needs to support the safer design of multicomponent nanomaterials – Application of grouping.
Adv. Sustain. Syst., DOI: 10.1002/adsu.202500208 (2025)

Dekkers, S. ; Adam, V. ; Battista, V.D. ; Haase, A. ; Prinz, J. ; Nagel, G. ; Fransman, W. ; Persson, M. ; Suarez-Merino, B. ; Wohlleben, W. ; Schmid, O. ; Someren, E.v.

Safe‐and‐sustainable‐by‐design approach and decision support system for advanced materials.
Int. J. Chron. Obstruct. Pulmon. Dis. 20, 3073 - 3091 (2025)

Zimmermann, J. ; Schön, J. ; Pfeiffer, V. ; Beutel, T. ; Felker, A. ; Stacher‐Priehse, E. ; Damirov, F. ; Reinmuth, N. ; Hatz, R. ; Schneider, C.P. ; Stoleriu, M.-G.

COPD severity as an independent predictor of long-term survival in operable lung cancer: A retrospective analysis from a high-volume thoracic surgery center.
Adv. Sustain. Syst., DOI: 10.1002/adsu.202500213 (2025)

Adam, V. ; Di Battista, V. ; Testard, F. ; Persson, M. ; Persson, D. ; Gargouri, D. ; Filoramo, A. ; Grafström, R.C. ; Kohonen, P. ; Hongisto, V. ; Conolly, M. ; Navas, J.M. ; Skjolding, L.M. ; Gajewicz-Skretna, A. ; Danielsen, P.H. ; Vogel, U. ; Jensen, K.A. ; van Someren, E. ; Dekkers, S. ; Schmid, O. ; Wohlleben, W. ; Suarez Merino, B.

Decision support system for safe-and-sustainable-by-design advanced materials: Case study demonstration.
Allergy, DOI: 10.1111/all.70070 (2025)

Lunding, L.P. ; Weckmann, M. ; Zissler, U.M. ; Jakwerth, C.A. ; Bodenstein-Sgró, R. ; Webering, S. ; Vock, C. ; Ehlers, J.C. ; Fernandez Ceballos, R.A.M. ; Nemani, S.S.P. ; Reddy, K.D. ; Oliver, B.G.G. ; Vermeulen, C.J. ; van de Berge, M. ; Ober, C. ; Künstner, A. ; Busch, H. ; König, I. ; Garbers, C. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Nold, M.F. ; Yildirim, A.Ö. ; Nold-Petry, C.A. ; Orinska, Z. ; Bahmer, T. ; Heyckendorf, J. ; Hansen, G. ; von Mutius, E. ; Rabe, K.F. ; Dittrich, A.M. ; Schaub, B. ; Brinkmann, F. ; Kopp, M.V. ; Wegmann, M.

Immune training of the interleukin 6 gene in airway epithelial cells is central to asthma exacerbations.

Kecorius, S. ; Madueno, L. ; Birmili, W. ; Löndahl, J. ; Plauškaite, K. ; Byčenkiene, S. ; Lovrić, M. ; Petric, V. ; Carranza-García, M. ; Jiménez-Navarro, M.J. ; Martínez-Ballesteros, M. ; Weiss, M. ; Schmid, O. ; Cyrys, J. ; Peters, A. ; Kecorius, G.

Urban pollution impact assessment in six lithuanian cities with a focus on road traffic emissions - integrated framework for environmental health studies.

Chakraborty, A. ; Giraldo-Arias, J. ; Merl-Pham, J. ; Dick, E. ; Mastalerz, M. ; Zöller, M. ; Marchi, H. ; Le Gleut, R. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Hauck, S.M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Cholesterol regulates airway epithelial cell differentiation by inhibiting p53 nuclear translocation.
RSC Sustain., DOI: 10.1039/d5su00392j (2025)

Wohlleben, W. ; Adam, V. ; Lledo, P.C. ; Dekkers, S. ; Durand, C. ; Haase, A. ; Soeteman-Hernandez, L.G. ; Livieri, A. ; Martel-Martin, S. ; Pizzol, L. ; Rollon, B.P. ; Prenner, S. ; Rein, C. ; Van Someren, E.J.W. ; Fransman, W. ; Zabeo, A. ; Rumbo, C. ; Schmid, O. ; Hristozov, D.

A suite of tools for safe-and-sustainable-by-design advanced materials from the EU projects DIAGONAL, HARMLESS and SUNSHINE.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, 1889-1892 (2025)

Merl-Pham, J. ; Knüppel, L. ; Binzenhöfer, L. ; Hennen, E. ; Kaminski, N. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Hauck, S.M. ; Hilgendorff, A. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Collagen post-translational modifications are altered in IPF including within ECM receptor binding motifs.
Cell Death Differ., DOI: 10.1038/s41418-025-01565-w (2025)

Suanes-Cobos, L. ; Aguilera-Ventura, I. ; Torres-Ramos, M. ; Serrano-Yubero, A. ; Moreno Fernández-Aliseda, C. ; Fernández, S. ; Garrido-Rodríguez, M. ; de la Luna, S. ; Prieto-Garcia, C. ; Diefenbacher, M. ; Mejias-Perez, E. ; Calzado, M.A.

A novel feedback loop between DYRK2 and USP28 regulates cancer homeostasis and DNA damage signaling.
Nat. Rev. Bioeng. 3, 810–812 (2025)

Yang, L. ; Han, L. ; Schmid, O. ; Chen, C.

Precision dosimetry in pulmonary drug delivery.
Nat. Methods 22, 1887–1899 (2025)

Vonficht, D. ; Jopp-Saile, L. ; Yousefian, S. ; Flore, V. ; Simó Vesperinas, I. ; Teuber, R. ; Avanesyan, B. ; Luo, Y. ; Röthemeier, C. ; Grünschläger, F. ; Fernández-Vaquero, M. ; Fregona, V. ; Ordoñez-Rueda, D. ; Schmalbrock, L.K. ; Deininger, L. ; Yamachui Sitcheu, A.J. ; Gu, Z. ; Funk, M.C. ; Mikut, R. ; Heikenwälder, M. ; Eggert, A. ; von Stackelberg, A. ; Kobold, S. ; Krönke, J. ; Keller, U. ; Trumpp, A. ; Hegazy, A.N. ; Eckert, C. ; Hübschmann, D. ; Haas, S.

Ultra-high-scale cytometry-based cellular interaction mapping.

Wagner, D.E. ; Alsafadi, H.N. ; Mitash, N. ; Justet, A. ; Hu, Q. ; Pineda, R. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Korfei, M. ; Gvazava, N. ; Wannemo, K. ; Onwuka, U. ; Mozurak, M. ; Estrada-Bernal, A. ; Cala-Garcia, J. ; Mutze, K. ; Costa, R. ; Bölükbas, D.A. ; Stegmayr, J. ; Skronska-Wasek, W. ; Klee, S. ; Ota, C. ; Baarsma, H.A. ; Wang, J. ; Sembrat, J. ; Hilgendorff, A. ; Ding, J. ; Günther, A. ; Chambers, R. ; Rosas, I. ; de Langhe, S. ; Kaminski, N. ; Lehmann, M. ; Eickelberg, O. ; Königshoff, M.

Inhibition of epithelial cell YAP-TEAD/LOX signaling attenuates pulmonary fibrosis in preclinical models.

Hagl, B. ; Spielberger, B.D. ; Neumann, B. ; Pelham, S.J. ; Pandey, D. ; Schlundt, A. ; Barro, C. ; Lechner, A. ; Wolf, C. ; Deenick, E.K. ; Sattler, M. ; Tangye, S.G. ; Rothenfusser, S. ; Renner, E.D.

Signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) variant p.K709N causes hyper-IgE syndrome likely by impaired STAT3-dimer formation.
Nat. Biotechnol. 43, 1035-1040 (2025)

Luecken, M. ; Gigante, S. ; Burkhardt, D.B. ; Cannoodt, R. ; Strobl, D.C. ; Markov, N.S. ; Zappia, L. ; Palla, G. ; Lewis, W. ; Dimitrov, D. ; Vinyard, M.E. ; Magruder, D.S. ; Müller, M. ; Andersson, A. ; Dann, E. ; Qin, Q. ; Otto, D.J. ; Klein, M. ; Botvinnik, O.B. ; Deconinck, L. ; Waldrant, K. ; Yasa, S.N. ; Szałata, A. ; Benz, A. ; Li, Z. ; Bloom, J.M. ; Pisco, A.O. ; Saez-Rodriguez, J. ; Wulsin, D. ; Pinello, L. ; Saeys, Y. ; Theis, F.J. ; Krishnaswamy, S.

Defining and benchmarking open problems in single-cell analysis.
Curr. Pharm. Des., DOI: 10.2174/0113816128368759250527073556 (2025)

Naik, T. ; Verma, H.K. ; Mulkalwar, M. ; Mishra, D. ; Bhaskar, L.

Comprehensive meta-analysis on the impact of the MDM2 SNP 309 T>G gene variant in leukemia susceptibility.
Eur. Respir. Rev. 34:240233 (2025)

Miller, Z. ; Twardowski, L.M. ; Reader, B.F. ; Rojas, M. ; Lehmann, M. ; Mora, A.L.

Mechanisms and markers of lung ageing in health and disease.
ERJ Open Res. 11:01141-2024 (2025)

Barnikel, M. ; Milger, K. ; Mertsch, P. ; Arnold, P. ; Leuschner, G. ; Veit, T. ; Gerckens, M. ; Mümmler, C. ; Barton, J. ; Ghiani, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Dinkel, J. ; Neurohr, C. ; Behr, J. ; Kneidinger, N.

Classification and course of pulmonary hypertension associated with end-stage COPD.
Environ. Sci. Technol. 59, 14969-14980 (2025)

Saarimäki, L.A. ; Fratello, M. ; Del Giudice, G. ; Di Lieto, E. ; Afantitis, A. ; Alenius, H. ; Chiavazzo, E. ; Gulumian, M. ; Karisola, P. ; Lynch, I. ; Mancardi, G.L. ; Melagraki, G. ; Netti, P. ; Papadiamantis, A.G. ; Peijnenburg, W. ; A Santos, H. ; Serchi, T. ; Shahbazi, M.A. ; Stöger, T. ; Valsami-Jones, E. ; Vivo, P. ; Vinković Vrček, I. ; Vogel, U. ; Wick, P. ; Winkler, D.A. ; Serra, A. ; Greco, D.

Wisdom of crowds for supporting the safety evaluation of nanomaterials.
World J. Virol. 14:101693 (2025)

Sahu, T. ; Jagzape, A.T. ; Sinha, M. ; Sinha, R. ; Verma, H.K.

New frontiers in sickle cell disease: The role of antiviral therapies and emerging drugs in managing viral infections.
BioSpektrum 31, 370-373 (2025)

Rusznyak, L. ; Wasnick, R. ; Funk, M.C.

Lungen-Organoide bringen neuen Schwung in die COPD-Forschung.
Plant Physiol. Biochem. 227:110184 (2025)

Kondak, D. ; Deák, A. ; Rónavári, A. ; Bodor, T. ; Kondak, S. ; Adedokun, O.P. ; Benkő, P. ; Szőllősi, R. ; Szalai, G. ; Janda, T. ; Ayaydin, F. ; Lindermayr, C. ; Kónya, Z. ; Kolbert, Z.

Chitosan encapsulated S-nitrosoglutathione is an efficient nanodonor in Brassica napus seedlings.
Adv. Func. Mat., DOI: 10.1002/adfm.202502805 (2025)

Sieber-Schaefer, F. ; Jiang, M. ; Kromer, A.P.E. ; Nguyen, A. ; Molbay, M. ; Pinto Carneiro, S. ; Juergens, D. ; Burgstaller, G. ; Popper, B. ; Winkeljann, B. ; Merkel, O.M.

Machine learning-enabled polymer discovery for enhanced pulmonary siRNA delivery.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A3105 - A3105 (2025)

Deng, B. ; Trassl, L. ; Jia, J. ; Skiadas, G. ; Ntaliarda, G. ; Behrend, S.J. ; Schamberger, A.C. ; Yildirim, A.Ö. ; Stathopoulos, G.T. ; Asarian, L. ; Chateau, M.d. ; Fernandez, I.E.

Targeting KRAS-mutant Lung Adenocarcinoma Tumors Through IL-1ß Inhibition.
Pneumologie 79, S92 - S93 (2025)

Weckler, B. ; Martin, R.J. ; Kutzinski, M. ; Bertrams, W. ; Jung, A.L. ; Pott, H. ; Laakmann, K. ; Schulte, L.N. ; Ahnert, P. ; Heider, D. ; Ringshandl, S. ; Seidemann, C. ; Suttorp, N. ; Witzenrath, M. ; Wildberg, J. ; Lehmann, M. ; Rohde, G. ; Greulich, T. ; Vogelmeier, C. ; Schmeck, B.

Eosinophil count as biomarker for risk stratification of community-acquired pneumonia: a prospective cohort study.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol., DOI: 10.1165/rcmb.2024-0469OC (2025)

Sui, J. ; Johnson, A.R. ; Kapellos, T. ; Shiva, S. ; Kliment, C.R.

ANT1 deficiency impairs macrophage metabolism and migration, protecting against emphysema in COPD.
Clin. Transl. Med. 15:e70341 (2025)

Prüfer, F. ; Steer, B. ; Kaufmann, E. ; Wolf, P. ; Adler, B. ; Korfei, M. ; Günther, A. ; Königshoff, M. ; Adler, H.

Macrophage C1q contributes to pulmonary fibrosis by disturbing the metabolism of alveolar epithelial cells.
Adv. Sustain. Syst., DOI: 10.1002/adsu.202500217 (2025)

Prinz, J. ; Nagel, G. ; Dekkers, S. ; van Someren, E.P. ; Adam, V. ; Battista, V.D. ; Suarez-Merino, B. ; Wohlleben, W. ; Persson, M. ; Baun, A. ; Schmid, O. ; Haase, A.

HARMLESS early warning system for advanced materials.
In: Respiratory Physiology: New Knowledge, Better Diagnosis. 2025. 259-276 (ERS Monog. ; 2025-April)

Staab-Weijnitz, C. ; Lehmann, M.

Environmental exposure and the ageing lung.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A7646 - A7646 (2025)

Narvaez, M.M. ; Gölitz, F. ; Jain, E. ; Gote-Schniering, J. ; Stoleriu, M.G. ; Bertrams, W. ; Schmeck, B. ; Yildirim, A.Ö. ; Rauen, U. ; Wille, T. ; Lehmann, M.

Cold Storage of Human Precision-cut Lung Slices Preserves Cellular and Transcriptional Identity Enabling Optimized On-demand Translational Lung Research.
JOSS 10, 7698 - 7698 (2025)

Cannoodt, R. ; Deconinck, L. ; Couckuyt, A. ; Markov, N.S. ; Zappia, L. ; Luecken, M. ; Interlandi, M. ; Saeys, Y. ; Saelens, W.

funkyheatmap: Visualising data frames with mixed data types.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A5246 - A5246 (2025)

Zhao, A. ; Rojas, J.J. ; Cao, C. ; Zhang, Y. ; Semenova, A. ; Schiller, H. ; Estépar, R.S.J. ; Bhattacharya, D. ; Sauler, M. ; Polverino, F.

Lung Marginal Zone-like B Cells: A Novel Pathogenic Immune Cell Population in Chronic Obstructive Pulmonary Disease.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A6856 - A6856 (2025)

Zöller, M. ; Mayr, C.H. ; Mastalerz, M. ; Dick, E. ; Chakraborty, A. ; Nakayma, M. ; Simon, L. ; Merl-Pham, J. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Schmid, O. ; Hauck, S.M. ; Schiller, H. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Transient and Persistent Airway Proteome Changes Induced by Cigarette Smoke.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A6855 - A6855 (2025)

Zöller, M. ; Mastalerz, M. ; Dick, E. ; Hennen, E. ; Chakraborty, A. ; Merl-Pham, J. ; Marchi, H. ; Le Gleut, R. ; Jeridi, A. ; Prasse, A. ; Jäger, B. ; Santofimia‐Castaño, P. ; Stoleriu, M.-G. ; Hilgendorff, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Hauck, S.M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Quantitative Proteomics Identifies Nuclear Protein 1 as a Regulator of Cell Death in Differentiated Primary Human Bronchial Epithelial Cells.
Pneumologie 79, S24 - S25 (2025)

Stoleriu, M.-G. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Schamberger, A.C. ; Heydarian, M. ; Gabriel, C. ; Najak, A. ; Disovic, A. ; Schneider, J. ; Gerckens, M. ; Burgstaller, G. ; Ding, Y. ; Doryab, A. ; Voss, C. ; Ketscher, C. ; Sienel, W. ; Kauke, T. ; Fertmann, J. ; Schneider, C. ; Behr, J. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Schubert, B. ; Hauck, S.M. ; Hatz, R. ; Schmid, O. ; Stöger, T. ; Schiller, H. ; Hilgendorff, A.

Development of advanced in-vitro human bronchial epithelial models and lung cell atlas in COPD enabled by thoracic surgery translational research.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A7319 - A7319 (2025)

Hilgendorff, A. ; Kindt-Dunjko, A. ; Häfner, F. ; Förster, K. ; Heydarian, M. ; Hauck, S.M. ; Flemmer, A.W. ; von Toerne, C. ; Sophia, S. ; Toshner, M. ; Sucre, J.M.S.

Interleukin 7 Signaling as an Indicator of Pulmonary Vascular Disease in Preterm Infants Identified by Proteomic Screening and MRI Analysis.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A5276 - A5276 (2025)

Faiz, A. ; Idrees, S. ; Johansen, M. ; Kovács, K.J. ; Boedijono, F. ; Chen, H. ; Galvao, I. ; Donovan, C. ; Kim, R. ; Sikkema, L. ; Strobl, D.C. ; Belz, G.T. ; Segal, L.N. ; Chotirmall, S.H. ; Nawijn, M.C. ; Lehmann, M. ; Kapellos, T. ; Gallego‐Ortega, D. ; Hansbro, P.M.

The Mouse Single Cell Lung Disease Atlas.
J. Oral Biol. Craniofacial Res. 15, 691-695 (2025)

Kurmi, P. ; Nalabothu, P. ; Sahoo, S. ; Verma, H.K. ; Reddy, S.G. ; Bhaskar, L.V.K.S.

Evaluating the impact of Matrilin-1 gene polymorphisms on mandibular prognathism: A meta-analysis.
Br. J. Cancer, DOI: 10.1038/s41416-025-02970-1 (2025)

Nitschkowski, D. ; Vierbuchen, T. ; Heine, H. ; Behrends, J. ; Reiling, N. ; Reck, M. ; Rabe, K.F. ; Kugler, C. ; Ammerpohl, O. ; Drömann, D. ; Muley, T. ; Kriegsmann, M. ; Stathopoulos, G.T. ; Arendt, K.A.M. ; Goldmann, T. ; Marwitz, S.

SMAD2 linker phosphorylation impacts overall survival, proliferation, TGFβ1-dependent gene expression and pluripotency-related proteins in NSCLC.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol., DOI: 10.1165/rcmb.2024-0117OC (2025)

Chakraborty, A. ; Zöller, M. ; Sardogan, A. ; Klotz, M. ; Mastalerz, M. ; Marchi, H. ; Meixner, R. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Nakayama, M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Development of a polidocanol-based human in vitro model to explore airway epithelial repair.
Clin. Transplant. 39:e70157 (2025)

Gade, N. ; Seifert, P. ; Gerckens, M. ; Mümmler, C. ; Kauke, T. ; Dick, A. ; Veit, T. ; Roden, D. ; Hoffmann, S. ; Scherzer, M. ; Höpler, J. ; Binzenhöfer, L. ; Lanz, H. ; Michel, S. ; Schneider, C. ; Irlbeck, M. ; Tomasi, R. ; Hatz, R. ; Hagl, C. ; Massberg, S. ; Milger, K. ; Behr, J. ; Lüsebrink, E. ; Kneidinger, N.

Association of HLA mismatch with adverse cardiovascular events following lung transplantation: A single-center study.
Environ. Int. 198:109391 (2025)

Russo, R.C. ; Togbe, D. ; Couillin, I. ; Segueni, N. ; Han, L. ; Quesniaux, V.F.J. ; Stöger, T. ; Ryffel, B.

Ozone-induced lung injury and inflammation: Pathways and therapeutic targets for pulmonary diseases caused by air pollutants.

van der Koog, L. ; Woest, M.E. ; Gorter, I.C. ; Verschut, V. ; Elferink, R.A.B. ; Zuidhof, A.B. ; Nugraha, D.F. ; Koloko Ngassie, M.L. ; Bos, S.I.T. ; Dhakad, D. ; Wolters, J.C. ; Horvatovich, P.L. ; Prakash, Y.S. ; Timens, W. ; Yildirim, A.Ö. ; Brandsma, C.A. ; Frijlink, H.W. ; Nagelkerke, A. ; Gosens, R.

Fibroblast-derived osteoglycin promotes epithelial cell repair.
Nat. Methods 22, 834-844 (2025)

Zappia, L. ; Richter, S. ; Ramirez Suastegui, C. ; Kfuri-Rubens, R. ; Vornholz, L. ; Wang, W. ; Dietrich, O. ; Frishberg, A. ; Luecken, M. ; Theis, F.J.

Feature selection methods affect the performance of scRNA-seq data integration and querying.
Nat. Methods 22, 813-823 (2025)

Salas, S.M. ; Kuemmerle, L. ; Mattsson-Langseth, C. ; Tismeyer, S. ; Avenel, C. ; Hu, T. ; Rehmann, H. ; Grillo, M. ; Czarnewski, P. ; Helgadottir, S. ; Tiklova, K. ; Andersson, A. ; Rafati, N. ; Chatzinikolaou, M. ; Theis, F.J. ; Luecken, M. ; Wählby, C. ; Ishaque, N. ; Nilsson, M.

Optimizing Xenium In Situ data utility by quality assessment and best-practice analysis workflows.
Cancer Drug Resist. 8:27 (2025)

Suri, C. ; Pande, B. ; Sahithi, L.S. ; Swarnkar, S. ; Khelkar, T. ; Verma, H.K.

Metabolic crossroads: Unravelling immune cell dynamics in gastrointestinal cancer drug resistance.

Barnikel, M. ; Kneidinger, N. ; Gerckens, M. ; Mümmler, C. ; Lenoir, A. ; Mertsch, P. ; Veit, T. ; Leuschner, G. ; Waelde, A. ; Neurohr, C. ; Behr, J. ; Milger, K.

Current blood eosinophilia does not predict the presence of pulmonary hypertension in patients with end-stage lung disease.
Nat. Commun. 16:1911 (2025)

Fischer, A. ; Han, W. ; Hu, S. ; Mück-Häusl, M. ; Wannemacher, J. ; Kadri, S. ; Lin, Y. ; Dai, R. ; Christ, S. ; Su, Y. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Deisenhofer, C. ; Dutta, S. ; Kadri, A. ; Güney, T.G. ; Correa-Gallegos, D. ; Mayr, C.H. ; Hatz, R. ; Stoleriu, M.G. ; Lindner, M. ; Hilgendorff, A. ; Adler, H. ; Machens, H.G. ; Schiller, H.B. ; Hauck, S.M. ; Rinkevich, Y.

Author Correction: Targeting pleuro-alveolar junctions reverses lung fibrosis in mice.
Nat. Cell Biol. 27, 384–392 (2025)

Willem, T. ; Shitov, V.A. ; Luecken, M. ; Kilbertus, N. ; Bauer, S. ; Piraud, M. ; Buyx, A. ; Theis, F.J.

Biases in machine-learning models of human single-cell data.

Melo-Narváez, C. ; Gölitz, F. ; Jain, E. ; Gote-Schniering, J. ; Stoleriu, M.-G. ; Bertrams, W. ; Schmeck, B. ; Yildirim, A.Ö. ; Rauen, U. ; Wille, T. ; Lehmann, M.

Cold storage of human precision-cut lung slices in TiProtec preserves cellular composition and transcriptional responses and enables on-demand mechanistic studies.

Fischer, A. ; Han, W. ; Hu, S. ; Mück-Häusl, M. ; Wannemacher, J. ; Kadri, S. ; Lin, Y. ; Dai, R. ; Christ, S. ; Su, Y. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Deisenhofer, C. ; Dutta, S. ; Kadri, A. ; Güney, T.G. ; Correa-Gallegos, D. ; Mayr, C.H. ; Hatz, R. ; Stoleriu, M.G. ; Lindner, M. ; Hilgendorff, A. ; Adler, H. ; Machens, H.G. ; Schiller, H.B. ; Hauck, S.M. ; Rinkevich, Y.

Targeting pleuro-alveolar junctions reverses lung fibrosis in mice.
ACS Appl. Mater. Interfaces 17, 11861-11872 (2025)

Müller, J.T. ; Kromer, A.P.E. ; Ezaddoustdar, A. ; Alexopoulos, I. ; Steinegger, K.M. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Berninghausen, O. ; Beckmann, R. ; Braubach, P. ; Burgstaller, G. ; Wygrecka, M. ; Merkel, O.M.

Nebulization of RNA-loaded micelle-embedded polyplexes as a potential treatment of idiopathic pulmonary fibrosis.
Oncogene 44:336 (2025)

Reissland, M. ; Hartmann, O. ; Tauch, S. ; Bugter, J.M. ; Prieto-Garcia, C. ; Schulte, C. ; Loebbert, S. ; Solvie, D. ; Bitman-Lotan, E. ; Narain, A. ; Jacomin, A.C. ; Schuelein-Voelk, C. ; Fuss, C.T. ; Pahor, N. ; Ade, C. ; Buck, V. ; Potente, M. ; Li, V. ; Beliu, G. ; Wiegering, A. ; Grossmann, T. ; Eilers, M. ; Wolf, E. ; Maric, H. ; Rosenfeldt, M. ; Maurice, M.M. ; Dikic, I. ; Gallant, P. ; Orian, A. ; Diefenbacher, M.

Correction: USP10 drives cancer stemness and enables super-competitor signalling in colorectal cancer.
Redox Biol. 80:103503 (2025)

Li, H. ; Furusawa, T. ; Cavero, R. ; Xiao, Y. ; Chari, R. ; Wu, X. ; Sun, D. ; Hartmann, O. ; Dhall, A. ; Holewinski, R. ; Andresson, T. ; Karim, B. ; Villamor-Payà, M. ; Gallardo, D. ; Day, C.P. ; Pal, L.R. ; Nair, N.U. ; Ruppin, E. ; Aladjem, M.I. ; Pommier, Y. ; Diefenbacher, M. ; Lim, J.M. ; Levine, R.L. ; Stracker, T.H. ; Weyemi, U.

Metabolic dependency mapping identifies Peroxiredoxin 1 as a driver of resistance to ATM inhibition.
FEBS J., DOI: 10.1111/febs.17411 (2025)

Korkmaz-Icöz, S. ; Szabo, G. ; Gieldon, A. ; McDonald, P.P. ; Dashkevich, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Korkmaz, B.

Protective effects of neutrophil serine protease inhibition against ischemia-reperfusion injury in lung or heart transplantation.
Appetite 207:107840 (2025)

Geary, N. ; Asarian, L. ; Leeners, B.

Best practices for including sex as a variable in appetite research.
J. Allergy Clin. Immunol. Pract. 13, 1110-1122.e1 (2025)

Götschke, J. ; Walter, J. ; Leuschner, G. ; Gerckens, M. ; Götschke, M. ; Mertsch, P. ; Mümmler, C. ; Lenoir, A. ; Barnikel, M. ; Dinkel, J. ; Behr, J. ; Kneidinger, N. ; Spiro, J. ; Milger, K.

Mucus plug score predicts clinical and pulmonary function response to biologic therapy in patients with severe asthma.
Aerosol Sci. Technol. 59, 1198-1209 (2025)

Nannu Shankar, S. ; O’Connor, A. ; Mital, K. ; Zhang, Y. ; Theodore, A. ; Shirkhani, A. ; Amanatidis, S. ; Lewis, G.S. ; Eiguren Fernandez, A. ; Tilly, T.B. ; Schmid, O. ; Sabo-Attwood, T. ; Wu, C.Y.

Cellular responses of lung cells cultured at an air-liquid interface are influenced by spatial nanoparticle deposition patterns in an in vitro aerosol exposure system.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 72, 16-31 (2025)

Lehmann, M. ; Krishnan, R. ; Sucre, J. ; Kulkarni, H.S. ; Pineda, R.H. ; Anderson, C. ; Banovich, N.E. ; Behrsing, H.P. ; Dean, C.H. ; Haak, A. ; Gosens, R. ; Kaminski, N. ; Zagorska, A. ; Koziol-White, C. ; Metcalf, J.P. ; Kim, Y.H. ; Loebel, C. ; Neptune, E.R. ; Noël, A. ; Raghu, G. ; Sewald, K. ; Sharma, A. ; Suki, B. ; Sperling, A. ; Tatler, A. ; Turner, S. ; Rosas, I.O. ; Pam Van, R.Y. ; Wille, T. ; Randell, S.H. ; Pryhuber, G. ; Rojas, M. ; Bourke, J. ; Königshoff, M.

Precision-cut lung slices: Emerging tools for preclinical and translational lung research an official american thoracic society workshop report.
In: (Computer Vision – ECCV 2024). Gewerbestrasse 11, Cham, Ch-6330, Switzerland: Springer International Publishing Ag, 2025. 413-430 (Lect. Notes Comput. Sc. ; 15144)

Chobola, T. ; Liu, Y. ; Zhang, H. ; Schnabel, J.A. ; Peng, T.

Fast context-based low-light image enhancement via neural implicit representations.
Hum. Gene 43:201361 (2025)

Kampalli, P.K. ; Ghanta, M.K. ; Verma, H.K. ; Alam, A. ; Peela, S. ; Bhaskar, L.V.K.S.

Exploring the relationship between ERCC1 polymorphisms and colorectal cancer risk: Insights from an in-depth meta-analysis.
Avian Pathol. 54, 40-49 (2025)

Sha, Y. ; Yan, W. ; Liu, X. ; Chai, H. ; Chen, J. ; Li, H. ; Wang, M. ; Jiang, S. ; Wang, S. ; Ren, Y. ; Liu, Y. ; Stöger, T. ; Wajid, A. ; Dodovski, A. ; Gao, C. ; Mingala, C.N. ; Andreychuk, D.B. ; Yin, R.

The first report and biological characterization of Avian Orthoavulavirus 16 in wild migratory waterfowl and domestic poultry in China reveal a potential threat to birds.
2024 in
In: (38th Conference on Neural Information Processing Systems, NeurIPS 2024, 9-15 December 2024, Vancouver). 2024. accepted ( ; 37)

Bukas, C. ; Subramanian, H. ; See, F. ; Steinchen, C. ; Ezhov, I. ; Boosarpu, G. ; Asgharpour, S. ; Burgstaller, G. ; Lehmann, M. ; Kofler, F. ; Piraud, M.

MultiOrg: A Multi-rater organoid-detection dataset.
Research Square, DOI: 10.21203/rs.3.rs-5046381/v1 (2024)

Samakovlis, C. ; Firsova, A.B. ; Salas, S.M. ; Kuemmerle, L. ; Abalo, X.M. ; Larsson, L. ; Mahbubani, K.T. ; Sountoulidis, A. ; Theelke, J. ; Andrusivova, Z. ; Galicia, L.A. ; Liontos, A. ; Balassa, T. ; Kovács, F. ; Horvath, P. ; Chen, Y. ; Schniering, J. ; Stoleriu, M.-G. ; Behr, J. ; Meyer, K. ; Timens, W. ; Schiller, H. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Lundeberg, J. ; Nilsson, M. ; Nawijn, M.C.

Topographic atlas of cell states identifies regional gene expression in the adult human lung.
2024 in
In: Bio-Nano Interfaces: Perspectives, Properties, and Applications. 2024. 795-818

Johnston, B.D. ; Kreyling, W.G. ; Pfeiffer, C. ; Schäffler, M. ; Sarioglu, H. ; Ristig, S. ; Hirn, S. ; Haberl, N. ; Thalhammer, S. ; Hauck, S.M. ; Semmler-Behnke, M. ; Epple, M. ; Hühn, J. ; Pino, P.D. ; Parak, W.J.

Colloidal stability and surface chemistry are key factors for the composition of the protein corona of inorganic gold nanoparticles.
2024 in
In: Bio-Nano Interfaces: Perspectives, Properties, and Applications. 2024. 1019-1032

Kreyling, W.G. ; Abdelmonem, A.M. ; Ali, Z. ; Alves, F. ; Geiser, M. ; Haberl, N. ; Hartmann, R. ; Hirn, S. ; de Aberasturi, D.J. ; Kantner, K. ; Khadem-Saba, G. ; Montenegro, J.M. ; Rejman, J. ; Rojo, T. ; Ufartes, R. ; Wenk, A. ; Parak, W.J.

In vivo integrity of polymer-coated gold nanoparticles.
2024 in
In: Bio-Nano Interfaces: Perspectives, Properties, and Applications. 2024. 381-396

Ali, Z. ; Abbasi, A.Z. ; Zhang, F. ; Arosio, P. ; Lascialfari, A. ; Casula, M.F. ; Wenk, A. ; Kreyling, W.G. ; Plapper, R. ; Seidel, M. ; Niessner, R. ; Knöll, J. ; Seubert, A. ; Parak, W.J.

Multifunctional nanoparticles for dual imaging.
J. Aerosol Sci. 181:106425 (2024)

Estaji, M. ; Nabaei, M. ; Yang, L. ; Schmid, O. ; Farnoud, A.

Aerosol dosimetry in the whole conducting zone of a murine left-lung using CF-PD and LSFM images.
Nat. Methods, DOI: 10.1038/s41592-024-02532-y (2024)

Hrovatin, K. ; Sikkema, L. ; Shitov, V.A. ; Heimberg, G. ; Shulman, M. ; Oliver, A.J. ; Müller, M. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Wang, H. ; Ramirez Suastegui, C. ; He, P. ; Schaar, A. ; Teichmann, S.A. ; Theis, F.J. ; Luecken, M.

Considerations for building and using integrated single-cell atlases.
Nano Lett. 24, 15683-15692 (2024)

Steinegger, K.M. ; Allmendinger, L. ; Sturm, S. ; Sieber-Schäfer, F. ; Kromer, A.P.E. ; Muller-Caspary, K. ; Winkeljann, B. ; Merkel, O.M.

Molecular dynamics simulations elucidate the molecular organization of poly(beta-amino ester) based polyplexes for siRNA delivery.
Breathe 20:240175 (2024)

Rathnayake, S.N.H. ; Cruz, J. ; Cuevas Ocaña, S. ; Lehmann, M. ; Demeyer, H.

The more stars, the brighter! Interview with the ECM award winner 2023.
Nat. Bio. Eng., DOI: 10.1038/s41551-024-01273-9 (2024)

Papargyriou, A. ; Najajreh, M. ; Cook, D.P. ; Maurer, C.H. ; Bärthel, S. ; Messal, H.A. ; Ravichandran, S.K. ; Richter, T. ; Knolle, M. ; Metzler, T. ; Shastri, A.R. ; Öllinger, R. ; Jasper, J. ; Schmidleitner, L. ; Wang, S. ; Schneeweis, C. ; Ishikawa-Ankerhold, H. ; Engleitner, T. ; Mataite, L. ; Semina, M. ; Trabulssi, H. ; Lange, S. ; Ravichandra, A. ; Schuster, M. ; Mueller, S. ; Peschke, K. ; Schäfer, A. ; Dobiasch, S. ; Combs, S.E. ; Schmid, R.M. ; Bausch, A.R. ; Braren, R. ; Heid, I. ; Scheel, C. ; Schneider, G. ; Zeigerer, A. ; Luecken, M. ; Steiger, K. ; Kaissis, G. ; van Rheenen, J. ; Theis, F.J. ; Saur, D. ; Rad, R. ; Reichert, M.

Heterogeneity-driven phenotypic plasticity and treatment response in branched-organoid models of pancreatic ductal adenocarcinoma.
Eur. Respir. J. 64:2401531 (2024)

Funk, M.C. ; Nawroth, J. ; Lehmann, M.

A breath of the future: A novel human model for COPD and beyond.
Cell Host Microbe 32, 2112-2130.e10 (2024)

Rong, Z. ; Mai, H. ; Ebert, G. ; Kapoor, S. ; Puelles, V.G. ; Czogalla, J. ; Hu, S. ; Su, J. ; Prtvar, D. ; Singh, I. ; Schädler, J. ; Delbridge, C. ; Steinke, H. ; Frenzel, H. ; Schmidt, K. ; Braun, C. ; Bruch, G. ; Ruf, V. ; Ali, M. ; Sühs, K.W. ; Nemati, M. ; Hopfner, F. ; Ulukaya, S. ; Jeridi, D. ; Mistretta, D. ; Caliskan, Ö.S. ; Wettengel, J.M. ; Cherif, F. ; Kolabas, Z.I. ; Molbay, M. ; Horvath, I. ; Zhao, S. ; Krahmer, N. ; Yildirim, A.Ö. ; Ussar, S. ; Herms, J. ; Huber, T.B. ; Tahirovic, S. ; Schwarzmaier, S.M. ; Plesnila, N. ; Höglinger, G. ; Ondruschka, B. ; Bechmann, I. ; Protzer, U. ; Elsner, M. ; Bhatia, H.S. ; Hellal, F. ; Ertürk, A.

Persistence of spike protein at the skull-meninges-brain axis may contribute to the neurological sequelae of COVID-19.

Yang, L. ; Liu, Q. ; Kumar, P. ; Sengupta, A. ; Farnoud, A. ; Shen, R. ; Trofimova, D. ; Ziegler, S. ; Davoudi, N. ; Doryab, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Diefenbacher, M. ; Schiller, H. ; Razansky, D. ; Piraud, M. ; Burgstaller, G. ; Kreyling, W.G. ; Isensee, F. ; Rehberg, M. ; Stöger, T. ; Schmid, O.

LungVis 1.0: An automatic AI-powered 3D imaging ecosystem unveils spatial profiling of nanoparticle delivery and acinar migration of lung macrophages.
ACS Nano 18, 33168−33180 (2024)

Wang, Y. ; Chen, P. ; Wen, H. ; Gui, X. ; Yan, D. ; Huang, D. ; Wang, D.

Advanced nanoplatform mediated by CRISPR-Cas9 and aggregation-induced emission photosensitizers to boost cancer theranostics.
Nat. Methods 21, 2260–2270 (2024)

Kuemmerle, L. ; Luecken, M. ; Firsova, A.B. ; Barros De Andrade E Sousa, L. ; Straßer, L. ; Mekki, I.I ; Campi, F. ; Heumos, L. ; Shulman, M. ; Beliaeva, V. ; Hediyeh-Zadeh, S. ; Schaar, A. ; Mahbubani, K.T. ; Sountoulidis, A. ; Balassa, T. ; Kovács, F. ; Horvath, P. ; Piraud, M. ; Ertürk, A. ; Samakovlis, C. ; Theis, F.J.

Probe set selection for targeted spatial transcriptomics.
Bioinformatics 40:btae609 (2024)

Heumos, S. ; Heuer, M.L. ; Hanssen, F. ; Heumos, L. ; Guarracino, A. ; Heringer, P. ; Ehmele, P. ; Prins, P. ; Garrison, E. ; Nahnsen, S.

Cluster-efficient pangenome graph construction with nf-core/pangenome.
Cell. Mol. Immunol., DOI: 10.1038/s41423-024-01219-w (2024)

Wang, Y. ; Rambold, U. ; Fiedler, P. ; Babushku, T. ; Tapken, C.L. ; Hoefig, K.P. ; Hofer, T.P. ; Adler, H. ; Yildirim, A.Ö. ; Strobl, L.J. ; Zimber-Strobl, U.

CD30 influences germinal center B-cell dynamics and the expansion of IgG1-switched B cells.
Oncogene, DOI: 10.1038/s41388-024-03141-x (2024)

Reissland, M. ; Hartmann, O. ; Tauch, S. ; Bugter, J.M. ; Prieto-Garcia, C. ; Schulte, C. ; Loebbert, S. ; Solvie, D. ; Bitman-Lotan, E. ; Narain, A. ; Jacomin, A.C. ; Schuelein-Voelk, C. ; Fuss, C.T. ; Pahor, N. ; Ade, C. ; Buck, V. ; Potente, M. ; Li, V. ; Beliu, G. ; Wiegering, A. ; Grossmann, T. ; Eilers, M. ; Wolf, E. ; Maric, H. ; Rosenfeldt, M. ; Maurice, M.M. ; Dikic, I. ; Gallant, P. ; Orian, A. ; Diefenbacher, M.

USP10 drives cancer stemness and enables super-competitor signalling in colorectal cancer.
JCI insight 9:e180239 (2024)

Sui, J. ; Xiao, H. ; Mbaekwe, U. ; Ting, N.C. ; Murday, K. ; Hu, Q. ; Gregory, A.D. ; Kapellos, T. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M. ; Zhang, Y. ; Sciurba, F.C. ; Das, J. ; Kliment, C.R.

Interpretable machine learning uncovers epithelial transcriptional rewiring and a role for Gelsolin in COPD.
Microbiol. Immunol. 68, 399-405 (2024)

Wang, S. ; Liu, X. ; Chen, J. ; Yan, W. ; Li, H. ; Chi, W. ; Luo, R. ; Lin, X. ; Yin, Y. ; Dong, C. ; Wang, H. ; Zheng, B. ; Liu, Y. ; Stöger, T. ; Wajid, A. ; Dodovski, A. ; Gao, C. ; Mingala, C.N. ; Andreychuk, D.B. ; Yin, R.

First detection and biological characterization of an avian metaavulavirus 8 isolated from a migratory swan goose in Qinghai Lake, Northwest China.
JCI insight 9:e168889 (2024)

Burgy, O. ; Mayr, C.H. ; Schenesse, D. ; Fousekis Papakonstantinou, E. ; Ballester, B. ; Sengupta, A. ; She, Y. ; Hu, Q. ; Melo-Narváez, M.C ; Jain, E. ; Pestoni, J. ; Mozurak, M. ; Estrada-Bernal, A. ; Onwuka, U. ; Coughlan, C. ; Parimon, T. ; Chen, P. ; Heimerl, T. ; Bange, G. ; Schmeck, B.T. ; Lindner, M. ; Hilgendorff, A. ; Ruppert, C. ; Guenther, A. ; Mann, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Eickelberg, O. ; Jung, A.L. ; Schiller, H. ; Lehmann, M. ; Burgstaller, G. ; Königshoff, M.

Fibroblast-derived extracellular vesicles contain SFRP1 and mediate pulmonary fibrosis.
Non-coding RNA 10:50 (2024)

Suri, C. ; Swarnkar, S. ; Bhaskar, L. ; Verma, H.K.

Non-coding RNA as a biomarker in lung cancer.
Microorganisms 12:2030 (2024)

Suri, C. ; Pande, B. ; Sahithi, L.S. ; Sahu, T. ; Verma, H.K.

Interplay between lung diseases and viral infections: A comprehensive review.
Nat. Rev. Endocrinol. 20, 629–630 (2024)

Kumar, V. ; Yildirim, A.Ö. ; Nawroth, P.

The role of DNA damage in diabetic complications.
Nat. Med., DOI: 10.1038/s41591-024-03214-0 (2024)

Heumos, L. ; Ehmele, P. ; Treis, T. ; Upmeier Zu Belzen, J. ; Roellin, E. ; May, L. ; Namsaraeva, A. ; Horlava, N. ; Shitov, V.A. ; Zhang, X. ; Zappia, L. ; Knöll, R. ; Lang, N.J. ; Hetzel, L. ; Virshup, I. ; Sikkema, L. ; Curion, F. ; Eils, R. ; Schiller, H. ; Hilgendorff, A. ; Theis, F.J.

An open-source framework for end-to-end analysis of electronic health record data.
Transplantation, DOI: 10.1097/TP.0000000000005189 (2024)

Gerckens, M. ; Mümmler, C. ; Richard, A. ; Strodel, J. ; Mertsch, P. ; Milger, K. ; Veit, T. ; Gade, N. ; Yildirim, A.Ö. ; Schneider, C. ; Kauke, T. ; Michel, S. ; Irlbeck, M. ; Behr, J. ; Kneidinger, N.

Characterization of baseline lung allograft dysfunction in single lung transplant recipients.
Eur. Respir. J. 64:2400921 (2024)

Yildirim, A.Ö. ; Conlon, T.M. ; Adcock, I.M. ; Gosens, R. ; Lehmann, M. ; Kapellos, T. ; Tesfaigzi, Y. ; Polverino, F. ; Sauler, M. ; Wasnick, R. ; Neptune, E.R.

COPD-iNET: A call to the lung community for action to combat the global epidemic of COPD.
New Phytol. 244, 786-797 (2024)

Kolbert, Z. ; Barroso, J.B. ; Boscari, A. ; Corpas, F.J. ; Gupta, K.J. ; Hancock, J.T. ; Lindermayr, C. ; Palma, J.M. ; Petřivalský, M. ; Wendehenne, D. ; Loake, G.J.

Interorgan, intraorgan and interplant communication mediated by nitric oxide and related species.
Cancers 16:2885 (2024)

Damirov, F. ; Stoleriu, M.-G. ; Manapov, F. ; Boedeker, E. ; Dreher, S. ; Gerz, S. ; Hehr, T. ; Sandner, E. ; Ott, G. ; Hatz, R. ; Preissler, G.

Perioperative predictive factors for tumor regression and survival in non-Small cell lung cancer patients undergoing neoadjuvant treatment and lung resection.

Li, C. ; Liu, Q. ; Han, L. ; Zhang, H. ; Immler, R. ; Rathkolb, B. ; Secklehner, J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Zeuschner, D. ; Nicke, A. ; Carlin, L.M. ; Sperandio, M. ; Stöger, T. ; Rehberg, M.

The eATP/P2×7R axis drives quantum dot-nanoparticle induced neutrophil recruitment in the pulmonary microcirculation.

Schneider, C. [extern] ; Michel, S. ; Kneidinger, N. ; Fertmann, J. [extern] ; Kleid, L. [extern] ; Walter, J. [extern] ; Moehnle, P. [extern] ; Wichmann, C. [extern] ; Kovác, J. [extern] ; Humpe, A. [extern] ; Schneider, C. [extern] ; Irlbeck, M. [extern] ; Dick, A. [extern] ; Kauke, T. [extern]

High-risk HLA-DQ mismatches are associated with adverse outcomes after lung transplantation.
Eur. Radiol., DOI: 10.1007/s00330-024-11031-9 (2024)

Biechele, G. ; Koliogiannis, V. ; Rennollet, P. ; Prester, T. ; Schulz, E. ; Kolben, T. ; Jegen, M. ; Hübener, C. ; Hasbargen, U. ; Flemmer, A. ; Dietrich, O. ; Burkard, T. ; Schinner, R. ; Dinkel, J. ; Muenchhoff, M. ; Hintz, S. ; Delius, M. ; Mahner, S. ; Ricke, J. ; Hilgendorff, A. ; Stöcklein, S.

Preserved prenatal lung growth assessed by fetal MRI in the omicron-dominated phase of the SARS-CoV-2 pandemic.
Transl. Oncol. 49:102070 (2024)

Jia, J. ; Trassl, L. ; Kong, F. ; Deng, B. ; Liu, R. ; Sun, Z. ; Lan, X. ; Yildirim, A.Ö. ; Stathopoulos, G.T. ; Fernandez, I.E. ; Schamberger, A.C.

Improved survival of patients with stage III small-cell lung cancer with primary resection: A SEER-based analysis.

Hu, Y. ; Hu, Q. ; Ansari, M. ; Riemondy, K. ; Pineda, R.H. ; Sembrat, J. ; Leme, A.S. ; Ngo, K. ; Morgenthaler, O. ; Ha, K. ; Gao, B. ; Janssen, W.J. ; Basil, M.C. ; Kliment, C.R. ; Morrisey, E. ; Lehmann, M. ; Evans, C.M. ; Schiller, H. ; Königshoff, M.

Airway derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD.
Front. Cell. Infect. Microbiol. 14:1383917 (2024)

Ma-Lauer, Y. ; Li, P. ; Niemeyer, D. ; Richter, A. ; Pusl, K. ; von Brunn, B. ; Ru, Y. ; Xiang, C. ; Schwinghammer, S. ; Liu, J. ; Baral, P. ; Berthold, E. ; Qiu, H. ; Roy, A. ; Kremmer, E. ; Flaswinkel, H. ; Drosten, C. ; Jin, Z. ; von Brunn, A.

Oxysterole-binding protein targeted by SARS-CoV-2 viral proteins regulates coronavirus replication.
Am. J. Transplant., DOI: 10.1016/j.ajt.2024.07.033 (2024)

Coppens, A. ; Verleden, S.E. ; Claes, E. ; Voet, H. ; Verleden, G.M. ; Lapperre, T.S. ; Yildirim, A.Ö. ; Jungraithmayr, W. ; Yamada, Y. ; Peeters, D.J. ; Hendriks, J.M.H.

Murine orthotopic lung transplant models: A comprehensive overview of genetic mismatch degrees and histopathological insights into chronic lung allograft dysfunction.
Nano Today 58:19 (2024)

Jiang, M. ; Zhang, Y. ; Zheng, T. ; Chang, Y. ; Qiao, N. ; Qin, M. ; He, P. ; He, C. ; Du, G. ; Merkel, O.M. ; Sun, X.

Transdermal microneedles integrating biomimetic self-adjuvant particles for enhanced immunity.
NanoImpact 35:100523 (2024)

Hristozov, D. ; Badetti, E. ; Bigini, P. ; Brunelli, A. ; Dekkers, S. ; Diomede, L. ; Doak, S.H. ; Fransman, W. ; Gajewicz-Skretna, A. ; Giubilato, E. ; Gómez-Cuadrado, L. ; Grafström, R.C. ; Gutleb, A.C. ; Halappanavar, S. ; Hischier, R. ; Hunt, N. ; Katsumiti, A. ; Kermanizadeh, A. ; Marcomini, A. ; Moschini, E. ; Oomen, A.G. ; Pizzol, L. ; Rumbo, C. ; Schmid, O. ; Shandilya, N. ; Stone, V. ; Stoycheva, S. ; Stöger, T. ; Merino, B.S. ; Tran, L. ; Tsiliki, G. ; Vogel, U.B. ; Wohlleben, W. ; Zabeo, A.

Next generation risk assessment approaches for advanced nanomaterials: current status and future perspectives.
Cells 13:1129 (2024)

Melo-Narváez, M.C ; Bramey, N. ; See, F. ; Heinzelmann, K. ; Ballester, B. ; Steinchen, C. ; Jain, E. ; Federl, K. ; Hu, Q. ; Dhakad, D. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M. ; Lehmann, M.

Stimuli-specific senescence of primary human lung fibroblasts modulates alveolar stem cell function.
2024 in
In: Progress and Prospect of Nanocarriers: Design, Concept, and Recent Advances. 2024. 289-326

Raina, N. ; Singh, M. ; Rani, R. ; Garg, A.D. ; Sharma, A. ; Kumar, P. ; Gupta, M.

Polymeric micelles for drug delivery: Properties, designs and applications.
Mol. Carcinog. 63, 1024-1037 (2024)

Furusawa, T. ; Cavero, R. ; Liu, Y. ; Li, H. ; Xu, X. ; Andresson, T. ; Reinhold, W.C. ; White, O. ; Boufraqech, M. ; Meyer, T.J. ; Hartmann, O. ; Diefenbacher, M. ; Pommier, Y. ; Weyemi, U.

Metabolism-focused CRISPR screen unveils mitochondrial pyruvate carrier 1 as a critical driver for PARP inhibitor resistance in lung cancer.
Gut, DOI: 10.1136/gutjnl-2023-331519 (2024)

Vogt, M.A. ; Dudvarski Stankovic, N. ; Cruz Garcia, Y. ; Hofstetter, J. ; Schneider, K. ; Kuybu, F. ; Hauck, T.E. ; Adhikari, B. ; Hamann, A. ; Rocca, Y. ; Grysczyk, L. ; Martin, B. ; Gebhardt-Wolf, A. ; Wiegering, A. ; Diefenbacher, M. ; Gasteiger, G. ; Knapp, S. ; Saur, D. ; Eilers, M. ; Rosenfeldt, M. ; Erhard, F. ; Vos, S.M. ; Wolf, E.

Targeting MYC effector functions in pancreatic cancer by inhibiting the ATPase RUVBL1/2.
Apoptosis 29, 1145-1160 (2024)

Abbas, R. ; Hartmann, O. ; Asiss, D.T. ; Abbas, R. ; Kagan, J. ; Kim, H.T. ; Oren, M. ; Diefenbacher, M. ; Orian, A. ; Larisch, S.

ARTS and small-molecule ARTS mimetics upregulate p53 levels by promoting the degradation of XIAP.
Front. Immunol. 15:1425938 (2024)

Sierra-Marquez, J. ; Schaller, L. ; Sassenbach, L. ; Ramírez-Fernández, A. ; Alt, P. ; Rissiek, B. ; Zimmer, B. ; Schredelseker, J. ; Hector, J. ; Stähler, T. ; Koch-Nolte, F. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Dietrich, A. ; Kopp, R. ; Nicke, A.

Different localization of P2X4 and P2X7 receptors in native mouse lung - lack of evidence for a direct P2X4-P2X7 receptor interaction.
Cell Death Discov. 10:311 (2024)

Shahzad, T. ; Dong, Y. ; Behnke, N.K. ; Brandner, J. ; Hilgendorff, A. ; Chao, C.M. ; Behnke, J. ; Bellusci, S. ; Ehrhardt, H.

Anti-CCL2 therapy reduces oxygen toxicity to the immature lung.
Int. J. Chron. Obstruct. Pulmon. Dis. 19, 1515-1529 (2024)

Stoleriu, M.-G. ; Pienn, M. ; Joerres, R.A. ; Alter, P. ; Fero, T. ; Urschler, M. ; Kovács, G. ; Olschewski, H. ; Kauczor, H.U. ; Wielpütz, M.O. ; Jobst, B. ; Welte, T. ; Behr, J. ; Trudzinski, F.C. ; Bals, R. ; Watz, H. ; Vogelmeier, C.F. ; Biederer, J. ; Kahnert, K.

Expiratory venous volume and arterial tortuosity are associated with disease severity and mortality risk in patients with COPD: Results from COSYCONET.
J. Clin. Med. 13:3977 (2024)

Suri, C. ; Pande, B. ; Sahu, T. ; Sahithi, L.S. ; Verma, H.K.

Revolutionizing gastrointestinal disorder management: Cutting-edge advances and future prospects.
In: RNA Amplification and Analysis. 2024. 187-203 (Methods Mol. Biol. ; 2822)

Carneiro, S.P. ; Müller, J.T. ; Merkel, O.M.

Fluorescent Techniques for RNA Detection in Nanoparticles.
Genome Biol. 25:181 (2024)

Curion, F. ; Rich-Griffin, C. ; Agarwal, D. ; Ouologuem, S. ; Rue-Albrecht, K. ; May, L. ; Garcia, G.E.L. ; Heumos, L. ; Thomas, T. ; Lason, W. ; Sims, D. ; Theis, F.J. ; Dendrou, C.A.

Panpipes: A pipeline for multiomic single-cell and spatial transcriptomic data analysis.
BIOMED. PHARMACOTHER. 177:117001 (2024)

Gupta, V.K. ; Sahu, L. ; Sonwal, S. ; Suneetha, A. ; Kim, D.H. ; Kim, J. ; Verma, H.K. ; Pavitra, E. ; Raju, G.S.R. ; Bhaskar, L. ; Lee, H.U. ; Huh, Y.S.

Advances in biomedical applications of vitamin D for VDR targeted management of obesity and cancer.
Genome Biol. 25:109 (2024)

Curion, F. ; Wu, X. ; Heumos, L. ; Gonzales André, M.M. ; Halle, L. ; Ozols, M. ; Grant-Peters, M. ; Rich-Griffin, C. ; Yeung, H.Y. ; Dendrou, C.A. ; Schiller, H. ; Theis, F.J.

hadge: A comprehensive pipeline for donor deconvolution in single-cell studies.
Redox Biol. 75:103211 (2024)

Berndt, C. ; Alborzinia, H. ; Amen, V.S. ; Ayton, S. ; Barayeu, U. ; Bartelt, A. ; Bayir, H. ; Bebber, C.M. ; Birsoy, K. ; Böttcher, J.P. ; Brabletz, S. ; Brabletz, T. ; Brown, A.R. ; Brüne, B. ; Bulli, G. ; Bruneau, A. ; Chen, Q. ; DeNicola, G.M. ; Dick, T.P. ; Distéfano, A. ; Dixon, S.J. ; Engler, J.B. ; Esser-von Bieren, J. ; Fedorova, M. ; Friedmann Angeli, J.P. ; Friese, M.A. ; Fuhrmann, D.C. ; García-Sáez, A.J. ; Garbowicz, K. ; Götz, M. ; Gu, W. ; Hammerich, L. ; Hassannia, B. ; Jiang, X. ; Jeridi, A. ; Kang, Y.P. ; Kagan, V.E. ; Konrad, D.B. ; Kotschi, S. ; Lei, P. ; Le Tertre, M. ; Lev, S. ; Liang, D. ; Linkermann, A. ; Lohr, C. ; Lorenz, S. ; Luedde, T. ; Methner, A. ; Michalke, B. ; Milton, A.V. ; Min, J. ; Mishima, E. ; Müller, S. ; Motohashi, H. ; Muckenthaler, M.U. ; Murakami, S. ; Olzmann, J.A. ; Pagnussat, G.C. ; Pan, Z. ; Papagiannakopoulos, T. ; Pedrera Puentes, L. ; Pratt, D.A. ; Proneth, B. ; Ramsauer, L. ; Rodriguez, R. ; Saito, Y. ; Schmidt, F. ; Schmitt, C. ; Schulze, A. ; Schwab, A. ; Schwantes, A. ; Soula, M. ; Spitzlberger, B. ; Stockwell, B.R. ; Thewes, L. ; Thorn-Seshold, O. ; Toyokuni, S. ; Tonnus, W. ; Trumpp, A. ; Vandenabeele, P. ; Vanden Berghe, T. ; Venkataramani, V. ; Vogel, F.C.E. ; von Karstedt, S. ; Wang, F. ; Westermann, F. ; Wientjens, C. ; Wilhelm, C. ; Wölk, M. ; Wu, K. ; Yang, X. ; Yu, F. ; Zou, Y. ; Conrad, M.

Ferroptosis in health and disease.
BIOMED. PHARMACOTHER. 176:116849 (2024)

Pavitra, E. ; Acharya, R.K. ; Gupta, V.K. ; Verma, H.K. ; Kang, H. ; Lee, J.H. ; Sahu, T. ; Bhaskar, L. ; Raju, G.S.R. ; Huh, Y.S.

Impacts of oxidative stress and anti-oxidants on the development, pathogenesis, and therapy of sickle cell disease: A comprehensive review.
Environ. Sci.-Nano, DOI: 10.1039/d3en00831b (2024)

Wohlleben, W. ; Persson, M. ; Suarez-Merino, B. ; Baun, A. ; Di Battista, V. ; Dekkers, S. ; van Someren, E.P. ; Broßell, D. ; Stahlmecke, B. ; Wiemann, M. ; Schmid, O. ; Haase, A.

Advanced materials earliest assessment (AMEA).

Burt, M. ; Angelidou, G. ; Mais, C.N. ; Preußer, C. ; Glatter, T. ; Heimerl, T. ; Groß, R. ; Serrania, J. ; Boosarpu, G. ; Pogge von Strandmann, E. ; Müller, J.A. ; Bange, G. ; Becker, A. ; Lehmann, M. ; Jonigk, D. ; Neubert, L. ; Freitag, H. ; Paczia, N. ; Schmeck, B. ; Jung, A.L.

Lipid A in outer membrane vesicles shields bacteria from polymyxins.
Diseases 12:93 (2024)

Mohanty, P. ; Pande, B. ; Acharya, R. ; Bhaskar, L.V.K.S. ; Verma, H.K.

Unravelling the triad of lung cancer, drug resistance, and metabolic pathways.
Cytometry A, DOI: 10.1002/cyto.a.24843 (2024)

Palumbo, F. ; Gunjak, M. ; Lee, P.J. ; Gunther, S. ; Hilgendorff, A. ; Vadász, I. ; Herold, S. ; Seeger, W. ; Mühlfeld, C. ; Morty, R.E.

Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs.
BMC Pediatr. 24:249 (2024)

Ciora, O.A. ; Seegmüller, T. ; Fischer, J.S. ; Wirth, T. ; Häfner, F. ; Stöcklein, S. ; Flemmer, A.W. ; Förster, K. ; Kindt, A. ; Bassler, D. ; Poets, C.F. ; Ahmidi, N. ; Hilgendorff, A.

Delineating morbidity patterns in preterm infants at near-term age using a data-driven approach.

Babushku, T. ; Lechner, M. ; Ehrenberg, S. ; Rambold, U. ; Schmidt-Supprian, M. ; Yates, A.J. ; Rane, S. ; Zimber-Strobl, U. ; Strobl, L.J.

Notch2 controls developmental fate choices between germinal center and marginal zone B cells upon immunization.
EBioMedicine 101:105030 (2024)

Kerckhof, P. ; Ambrocio, G.P.L. ; Beeckmans, H. ; Kaes, J. ; Geudens, V. ; Bos, S. ; Willems, L. ; Vermaut, A. ; Vermant, M. ; Goos, T. ; De Fays, C. ; Aversa, L. ; Mohamady, Y. ; Vanstapel, A. ; Orlitová, M. ; Van Slambrouck, J. ; Jin, X. ; Varghese, V. ; Josipovic, I. ; Boone, M.N. ; Dupont, L.J. ; Weynand, B. ; Dubbeldam, A. ; Van Raemdonck, D.E. ; Ceulemans, L.J. ; Gayan-Ramirez, G. ; De Sadeleer, L.J. ; McDonough, J.E. ; Vanaudenaerde, B.M. ; Vos, R.

Ventilatory capacity in CLAD is driven by dysfunctional airway structure.
Curr. Treat. Options Oncol. 25, 465-495 (2024)

Costanzo, V. ; Ratre, Y.K. ; Andretta, E. ; Acharya, R. ; Bhaskar, L.V.K.S. ; Verma, H.K.

A comprehensive review of cancer drug-induced cardiotoxicity in blood cancer patients: Current perspectives and therapeutic strategies.
Nat. Methods 21, 365-367 (2024)

Pfeuffer, J. ; Bielow, C. ; Wein, S. ; Jeong, K. ; Netz, E. ; Walter, A. ; Alka, O. ; Nilse, L. ; Colaianni, P.D. ; McCloskey, D. ; Kim, J. ; Rosenberger, G. ; Bichmann, L. ; Walzer, M. ; Veit, J. ; Boudaud, B. ; Bernt, M. ; Patikas, N. ; Pilz, M. ; Startek, M.P. ; Kutuzova, S. ; Heumos, L. ; Charkow, J. ; Sing, J.C. ; Feroz, A. ; Siraj, A. ; Weisser, H. ; Dijkstra, T.M.H. ; Perez-Riverol, Y. ; Röst, H.L. ; Kohlbacher, O. ; Sachsenberg, T.

OpenMS 3 enables reproducible analysis of large-scale mass spectrometry data.
Cells 13:241 (2024)

Kaes, J. ; Pollenus, E. ; Hooft, C. ; Liu, H. ; Aelbrecht, C. ; Cambier, S. ; Jin, X. ; Van Slambrouck, J. ; Beeckmans, H. ; Kerckhof, P. ; Velde, G.V. ; Van Raemdonck, D. ; Yildirim, A.Ö. ; Van den Steen, P.E. ; Vos, R. ; Ceulemans, L.J. ; Vanaudenaerde, B.M.

The immunopathology of pulmonary rejection after murine lung transplantation.
Thorax 79, 524-537 (2024)

Stoleriu, M.-G. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Schamberger, A.C. ; Heydarian, M. ; Ding, Y. ; Voss, C. ; Schneider, J.J. ; Gerckens, M. ; Burgstaller, G. ; Castelblanco, A. ; Kauke, T. ; Fertmann, J. ; Schneider, C. ; Behr, J. ; Lindner, M. ; Stacher-Priehse, E. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Schubert, B. ; Hauck, S.M. ; Schmid, O. ; Hatz, R.A. ; Stöger, T. ; Schiller, H. ; Hilgendorff, A.

COPD basal cells are primed towards secretory to multiciliated cell imbalance driving increased resilience to environmental stressors.
Environ. Sci.-Nano 11, 924-941 (2024)

Di Battista, V. ; Sanchez-Lievanos, K.R. ; Jeliazkova, N. ; Murphy, F. ; Tsiliki, G. ; Zabeo, A. ; Gajewicz-Skretna, A. ; Mikołajczyk, A. ; Hristozov, D. ; Stone, V. ; Schmid, O. ; Hunt, N. ; Oomen, A.G. ; Wohlleben, W.

Similarity of multicomponent nanomaterials in a safer-by-design context: The case of core-shell quantum dots.
Adv. Sci. 11:e2308659 (2024)

Zhou, Q. ; Liu, Q. ; Wang, Y. ; Chen, J. ; Schmid, O. ; Rehberg, M. ; Yang, L.

Bridging smart nanosystems with clinically relevant models and advanced imaging for precision drug delivery.
Nature 625:E4 (2024)

Correa-Gallegos, D. ; Ye, H. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Kadri, S. ; Kandi, R. ; Dai, R. ; Lin, Y. ; Kopplin, R. ; Shantaram Shenai, D. ; Wannemacher, J. ; Ichijo, R. ; Jiang, D. ; Strunz, M. ; Ansari, M. ; Angelidis, I. ; Schiller, H. B. ; Volz, T. ; Machens, H.G. ; Rinkevich, Y.

Author Correction: CD201+ fascia progenitors choreograph injury repair.

Mayr, C. ; Sengupta, A. ; Asgharpour, S. ; Ansari, M. ; Pestoni, J. ; Ogar, P. ; Angelidis, I. ; Liontos, A. ; Rodriguez-Castillo, J.A. ; Lang, N.J. ; Strunz, M. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Gerckens, M. ; De Sadeleer, L.J. ; Oehrle, B. ; Viteri-Alvarez, V. ; Fernandez, I.E. ; Tallquist, M. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Stoleriu, M.G. ; Behr, J. ; Kneidinger, N. ; Wuyts, W.A. ; Wasnick, R. ; Yildirim, A.Ö. ; Ahlbrecht, K. ; Morty, R.E. ; Samakovlis, C. ; Theis, F.J. ; Burgstaller, G. ; Schiller, H.

Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury induced myofibroblasts.
In:. Gewerbestrasse 11, Cham, Ch-6330, Switzerland: Springer International Publishing Ag, 2024. 313-328 (Handb. Exp. Pharmacol. ; 284)

Carneiro, S. ; Müller, J.T. ; Merkel, O.M.

Targeted molecular therapeutics for pulmonary diseases: Addressing the need for precise drug delivery.

Song, S. ; van Dijk, F. ; Vasse, G.F. ; Liu, Q. ; Gosselink, I.F. ; Weltjens, E. ; Remels, A.H. ; de Jager, M.H. ; Bos, S. ; Li, C. ; Stöger, T. ; Rehberg, M. ; Kutschke, D. ; van Eck, G. ; Wu, X. ; Willems, S.H. ; Boom, D. ; Kooter, I.M. ; Spierings, D. ; Wardenaar, R. ; Cole, M. ; Nawijn, M.C. ; Salvati, A. ; Gosens, R. ; Melgert, B.N.

Inhalable textile microplastic fibers impair airway epithelial differentiation.
2023 in
In: Multifunctional And Targeted Theranostic Nanomedicines: Formulation, Design And Applications. 2023. 187-213

Shilpi, S. ; Gulbake, A.S. ; Chouhan, S. ; Kumar, P.

Functionalized carbon nanotubes, graphene oxide, fullerenes, and nanodiamonds: Emerging theranostic nanomedicines.

Rosenkranz, S. ; Pausch, C. ; Coghlan, J.G. ; Huscher, D. ; Pittrow, D. ; Grünig, E. ; Staehler, G. ; Vizza, C.D. ; Gall, H. ; Distler, O. ; Delcroix, M. ; Ghofrani, H.A. ; Ewert, R. ; Kabitz, H.J. ; Skowasch, D. ; Behr, J. ; Milger, K. ; Halank, M. ; Wilkens, H. ; Seyfarth, H.J. ; Held, M. ; Scelsi, L. ; Neurohr, C. ; Vonk-Noordegraaf, A. ; Ulrich, S. ; Klose, H. ; Claussen, M. ; Eisenmann, S. ; Schmidt, K.H. ; Remppis, B.A. ; Skride, A. ; Jureviciene, E. ; Gumbiene, L. ; Miliauskas, S. ; Löffler-Ragg, J. ; Lange, T.J. ; Olsson, K.M. ; Hoeper, M.M. ; Opitz, C.

Risk stratification and response to therapy in patients with pulmonary arterial hypertension and comorbidities: A COMPERA analysis.
2023 in
In: (Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference). 2023. 1-5 ( ; 2023)

Castelblanco, A. ; Matzeu, G. ; Ruggeri, E. ; Omenetto, F.G. ; Hilgendorff, A. ; Schnabel, J.A. ; Schubert, B.

Colorimetric Sensor Reading and Illumination Correction via Multi-Task Deep-Learning.

Wasnick, R. ; Korfei, M. ; Piskulak, K. ; Henneke, I. ; Wilhelm, J. ; Mahavadi, P. ; Dartsch, R.C. ; von der Beck, D. ; Koch, M. ; Shalashova, I. ; Weiss, A.R. ; Klymenko, O. ; Askevold, I. ; Fink, L. ; Witt, H. ; Hackstein, H. ; El Agha, E. ; Bellusci, S. ; Klepetko, W. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O. ; Schermuly, R.T. ; Braun, T. ; Seeger, W. ; Ruppert, C. ; Guenther, A.

Notch1 induces defective epithelial surfactant processing and pulmonary fibrosis.
World J. Virol. 12, 242-255 (2023)

Mohanty, P. ; Panda, P. ; Acharya, R.K. ; Pande, B. ; Bhaskar, L. ; Verma, H.K.

Emerging perspectives on RNA virus-mediated infections: From pathogenesis to therapeutic interventions.

De Sadeleer, L.J. ; Chen, Y. ; Jentzsch, R.C. ; Wang, Z. ; Qazi, N. ; Lang, N.J. ; Albanese, P. ; Jankevics, A. ; Theis, F.J. ; Scheltema, R.A. ; Wuyts, W.A. ; Gote-Schniering, J. ; Schiller, H.

Evolution of epithelial-mesenchymal cell circuits in the progression of pulmonary fibrosis.

Chen, Y. ; Schniering, J. ; Müller, M. ; Albanese, P. ; Jankevics, A. ; Jentzsch, R.C. ; Tata, A. ; Ansari, M. ; De Sadeleer, L.J. ; Yang, L. ; Heumos, L. ; Agami, A. ; Zhou, S. ; Mayr, C. ; Hatz, R. ; Schneider, C.P. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Stoleriu, M.G. ; Dorfmueller, P. ; Theis, F.J. ; Tata, P.R. ; Luecken, M. ; Scheltema, R.A. ; Schiller, H.

A spatially resolved extracellular matrix proteome atlas of the distal human lung.

Häfner, F. ; Johansson, C. ; Schwarzkopf, L. ; Forster, K. ; Kraus, Y. ; Flemmer, A.W. ; Hansmann, G. ; Sallmon, H. ; Felderhoff-Müser, U. ; Witt, S. ; Schwettmann, L. ; Hilgendorff, A.

Current diagnosis and treatment practice for pulmonary hypertension in bronchopulmonary dysplasia-A survey study in Germany (PUsH BPD).

Rambold, U. ; Sperling, S. ; Chew, Z. ; Wang, Y. ; Steer, B. ; Zeller, K. ; Strobl, L.J. ; Zimber-Strobl, U. ; Adler, H.

A mouse model to study the pathogenesis of γ-herpesviral infections in germinal center B cells.
Radiol. Artif. Intell. 5:e220239 (2023)

Mairhörmann, B. ; Castelblanco, A. ; Häfner, F. ; Koliogiannis, V. ; Haist, L. ; Winter, D. ; Flemmer, A.W. ; Ehrhardt, H. ; Stöcklein, S. ; Dietrich, O. ; Förster, K. ; Hilgendorff, A. ; Schubert, B.

Automated MRI lung segmentation and 3D morphologic features for quantification of neonatal lung disease.
Sci. Transl. Med. 15, 19:eadh0908 (2023)

Lang, N.J. ; Schniering, J. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Yang, L. ; De Sadeleer, L.J. ; Jentzsch, R.C. ; Shitov, V.A. ; Zhou, S. ; Ansari, M. ; Agami, A. ; Mayr, C. ; Hooshiar Kashani, B. ; Chen, Y. ; Heumos, L. ; Pestoni, J. ; Molnar, E.S. ; Geeraerts, E. ; Anquetil, V. ; Saniere, L. ; Wögrath, M. ; Gerckens, M. ; Lehmann, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Hatz, R.A. ; Kneidinger, N. ; Behr, J. ; Wuyts, W.A. ; Stoleriu, M.-G. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Burgstaller, G. ; Schiller, H.

Ex vivo tissue perturbations coupled to single-cell RNA-seq reveal multilineage cell circuit dynamics in human lung fibrogenesis.

Verleden, S.E. ; Hendriks, J.M.H. ; Snoeckx, A. ; Mai, C. ; Mentens, Y. ; Callebaut, W. ; De Belie, B. ; Van Schil, P.E. ; Verplancke, V. ; Janssens, A.C. ; Jacob, J. ; Pakzad, A. ; Conlon, T.M. ; Guvenc, G. ; Yildirim, A.Ö. ; Pauwels, P. ; Koljenovic, S. ; Kwakkel-Van-Erp, J.M. ; Lapperre, T.

Small airways disease in Pre-COPD with emphysema: A cross-sectional study.
Curr. Oncol. 30, 9542-9568 (2023)

Acharya, R. ; Mahapatra, A. ; Verma, H.K. ; Bhaskar, L.V.K.S.

Unveiling therapeutic targets for esophageal cancer: A comprehensive review.
Sci. Adv. 9:eadj3793 (2023)

Kos, A. ; Lopez, J.P. ; Bordes, J. ; De Donno, C. ; Dine, J. ; Brivio, E. ; Karamihalev, S. ; Luecken, M. ; Almeida-Correa, S. ; Gasperoni, S. ; Dick, A. ; Miranda, L. ; Büttner, M. ; Stoffel, R. ; Flachskamm, C. ; Theis, F.J. ; Schmidt, M.V. ; Chen, A.

Early life adversity shapes social subordination and cell type-specific transcriptomic patterning in the ventral hippocampus.
2023 in
In: Molecular Pharmaceutics and Nano Drug Delivery: Fundamentals and Challenges. 2023. 103-134

Paliwal, S.R. ; Sulakhiya, K. ; Kumar, P. ; Maiti, S. ; Paliwal, R.

Hormonal delivery systems.
Turk. J. Immunol. 11, 1-16 (2023)

Mahapatra, A. ; Verma, H.K. ; Nag, S. ; Singh, S. ; Khattri, A. ; Bhaskar, L.V.K.S.

Advances in the molecular etiology of severe combined immunodeficiency and its screening.
OpenNano 12:100161 (2023)

Jürgens, D.C. ; Deßloch, L. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Winkeljann, J. ; Zielinski, S. ; Munschauer, M. ; Hörner, A.L. ; Burgstaller, G. ; Winkeljann, B. ; Merkel, O.M.

Lab-scale siRNA and mRNA LNP manufacturing by various microfluidic mixing techniques – an evaluation of particle properties and efficiency.
Atemwegs- Lungenkr. 49, 140-146 (2023)

Bramey, N. ; Schmeck, B. ; Lehmann, M.

Aging and regeneration in the lung – Significance for COPD.

Dilger, M. ; Armant, O. ; Ramme, L. ; Mülhopt, S. ; Sapcariu, S.C. ; Schlager, C. ; Dilger, E. ; Reda, A. ; Orasche, J. ; Schnelle-Kreis, J. ; Conlon, T.M. ; Yildirim, A.Ö. ; Hartwig, A. ; Zimmermann, R. ; Hiller, K. ; Diabaté, S. ; Paur, H.R. ; Weiss, C.

Systems toxicology of complex wood combustion aerosol reveals gaseous carbonyl compounds as critical constituents.

Häfner, F. ; Kindt, A.S.D. ; Strobl, K. ; Forster, K. ; Heydarian, M. ; Gonzalez-Rodriguez, E. ; Schubert, B. ; Kraus, Y. ; Robert, D.P. ; Flemmer, A.W. ; Ertl-Wagner, B. ; Dietrich, O. ; Stoecklein, S. ; Tello, K. ; Hilgendorff, A.

MRI pulmonary artery flow detects lung vascular pathology in preterms with lung disease.

Wickramasinghe, L.C. ; Tsantikos, E. ; Kindt, A.S.D. ; Raftery, A.L. ; Gottschalk, T.A. ; Borger, J.G. ; Malhotra, A. ; Anderson, G.P. ; van Wijngaarden, P. ; Hilgendorff, A. ; Hibbs, M.L.

Granulocyte colony-stimulating factor is a determinant of severe bronchopulmonary dysplasia and coincident retinopathy.

Kapellos, T. ; Conlon, T.M. ; Yildirim, A.Ö. ; Lehmann, M.

The impact of the immune system on lung injury and regeneration in COPD.
Nanomed. 18, 1261-1279 (2023)

Kurmi, B.D. ; Patel, P. ; Paliwal, R. ; Kumar, P. ; Paliwal, S.R.

Multifunctional nanotherapeutics for intracellular trafficking of doxorubicin against breast cancer.
Transl. Oncol. 39:101800 (2023)

Jia, J. ; Marazioti, A. ; Voulgaridis, A. ; Psallidas, I. ; Lamort, A.-S. ; Iliopoulou, M. ; Krontira, A.C. ; Lilis, I. ; Asciak, R. ; Kanellakis, N.I. ; Rahman, N.M. ; Karkoulias, K. ; Spiropoulos, K. ; Liu, R. ; Kaiser, J.C. ; Stathopoulos, G.T.

Clinical identification of malignant pleural effusions.

Tanabe, S. ; Beaton, D. ; Chauhan, V. ; Choi, I. ; Choi, J. ; Clerbaux, L.A. ; Coppola, L. ; Dumont, A.F. ; Esterhuizen, M. ; Filipovska, J. ; FitzGerald, R. ; Fritsche, E. ; Garcia-Reyero, N. ; Goralczyk, A. ; Huliganga, E. ; Kim, Y.J. ; Klose, J. ; La Rocca, C. ; Landesmann, B. ; Mally, A. ; Murugadoss, S. ; Omeragic, E. ; Ouédraogo, G. ; Pereira, J.M. ; Sadi, B. ; Schaffert, A. ; Song, Y. ; Sovadinova, I. ; Stöger, T. ; Tollefsen, K.E. ; Wittwehr, C. ; Yauk, C.

Report of the 3rd and 4th Mystery of Reactive Oxygen Species Conference.
iScience 26:108345 (2023)

Leuschner, G. ; Semenova, A. ; Mayr, C. ; Kapellos, T. ; Ansari, M. ; Seeliger, B. ; Frankenberger, M. ; Kneidinger, N. ; Hatz, R.A. ; Hilgendorff, A. ; Prasse, A. ; Behr, J. ; Mann, M. ; Schiller, H.

Mass spectrometry-based autoimmune profiling reveals predictive autoantigens in idiopathic pulmonary fibrosis.
Nature 623, 792-802 (2023)

Correa-Gallegos, D. ; Ye, H. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Kadri, S. ; Kandi, R. ; Dai, R. ; Lin, Y. ; Kopplin, R. ; Shantaram Shenai, D. ; Wannemacher, J. ; Ichijo, R. ; Jiang, D. ; Strunz, M. ; Ansari, M. ; Angelidis, I. ; Schiller, H. ; Voltz, T. ; Machens, H.G. ; Rinkevich, Y.

CD201+ fascia progenitors choreograph injury repair.

Zhao, A. ; Gudmundsson, E. ; Mogulkoc, N. ; van Moorsel, C. ; Corte, T.J. ; Vasudev, P. ; Romei, C. ; Chapman, R. ; Wallis, T.J.M. ; Denneny, E. ; Goos, T. ; Savas, R. ; Ahmed, A. ; Brereton, C.J. ; van Es, H.W. ; Jo, H. ; De Liperi, A. ; Duncan, M. ; Pontoppidan, K. ; De Sadeleer, L.J. ; van Beek, F. ; Barnett, J. ; Cross, G. ; Procter, A. ; Veltkamp, M. ; Hopkins, P. ; Moodley, Y. ; Taliani, A. ; Taylor, M. ; Verleden, S. ; Tavanti, L. ; Vermant, M. ; Nair, A. ; Stewart, I. ; Janes, S.M. ; Young, A.L. ; Barber, D. ; Alexander, D.C. ; Porter, J.C. ; Wells, A.U. ; Jones, M.G. ; Wuyts, W.A. ; Jacob, J.

Mortality surrogates in combined pulmonary fibrosis and emphysema.
EBioMedicine 98:104869 (2023)

Han, B. ; Lv, Y. ; Moser, D. ; Zhou, X. ; Woehrle, T. ; Han, L. ; Osterman, A. ; Rudelius, M. ; Choukér, A. ; Lei, P.

ACE2-independent SARS-CoV-2 virus entry through cell surface GRP78 on monocytes - evidence from a translational clinical and experimental approach.

Bostancieri, N. ; Bakir, K. ; Kul, S. ; Eralp, A. ; Kayalar, Ö. ; Konyalilar, N. ; Rajabi, H. ; Yuncu, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Bayram, H.

The effect of multiple outgrowths from bronchial tissue explants on progenitor/stem cell number in primary bronchial epithelial cell cultures from smokers and patients with COPD.
Cell Stem Cell 30, 1397-1399 (2023)

Schniering, J. ; Schiller, H. B.

Multilineage circuits of regenerative cell states.
ACS Nano 17, 21056-21072 (2023)

Han, L. ; Haefner, V. ; Yu, Y. ; Han, B. ; Ren, H. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Liu, Q. ; Feuchtinger, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Adler, H. ; Stöger, T.

Nanoparticle-exposure-triggered virus reactivation induces lung emphysema in mice.

Doryab, A. ; Heydarian, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Hilgendorff, A. ; Behr, J. ; Schmid, O.

Breathing-induced stretch enhances the efficacy of an inhaled and orally delivered anti-fibrosis drug in vitro.

Varaprasad, G.L. ; Gupta, V.K. ; Prasad, K. ; Kim, E. ; Tej, M.B. ; Mohanty, P. ; Verma, H.K. ; Raju, G.S.R. ; Bhaskar, L. ; Huh, Y.S.

Recent advances and future perspectives in the therapeutics of prostate cancer.
Signal Transduct. Target. Ther. 8:332 (2023)

Jeridi, A. ; Kapellos, T. ; Yildirim, A.Ö.

Fumarate hydratase: A new checkpoint of metabolic regulation in inflammatory macrophages.
Front. Microbiol. 14:1072053 (2023)

Hyams, Y. ; Rubin-Blum, M. ; Rosner, A. ; Brodsky, L. ; Rinkevich, Y. ; Rinkevich, B.

Physiological changes during torpor favor association with Endozoicomonas endosymbionts in the urochordate Botrylloides leachii.
Front. Plant Sci. 14:1124899 (2023)

Han, Y. ; Georgii, E. ; Priego-Cubero, S. ; Wurm, C. ; Hüther, P. ; Huber, G. ; Koller, R. ; Becker, C. ; Durner, J. ; Lindermayr, C.

Arabidopsis histone deacetylase HD2A and HD2B regulate seed dormancy by repressing DELAY OF GERMINATION 1.

Chen, J. ; Wang, X. ; Schmalen, A. ; Haines, S. ; Wolff, M. ; Ma, H. ; Zhang, H. ; Stoleriu, M.-G. ; Nowak, J. ; Nakayama, M. ; Bueno, M. ; Brands, J. ; Mora, A.L. ; Lee, J.S. ; Krauss-Etschmann, S. ; Dmitrieva, A. ; Frankenberger, M. ; Hofer, T.P. ; Nößner, E. ; Moosmann, A. ; Behr, J. ; Milger, K. ; Deeg, C.A. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Hauck, S.M. ; Adler, H. ; Goldmann, T. ; Gaede, K.I. ; Behrends, J. ; Kammerl, I.E. ; Meiners, S.

Antiviral CD8+T-cell immune responses are impaired by cigarette smoke and in COPD.
Nat. Methods 20, 1530-1536 (2023)

Rosenberger, F.A. ; Thielert, M. ; Strauss, M.T. ; Schweizer, L. ; Ammar, C. ; Mädler, S.C. ; Metousis, A. ; Skowronek, P. ; Wahle, M. ; Madden, K. ; Schniering, J. ; Semenova, A. ; Schiller, H. ; Rodriguez, E. ; Nordmann, T.M. ; Mund, A. ; Mann, M.

Spatial single-cell mass spectrometry defines zonation of the hepatocyte proteome.
Biomolecules 13:18 (2023)

Schmalen, A. ; Kammerl, I.E. ; Meiners, S. ; Nößner, E. ; Deeg , C.A. ; Hauck, S.M.

A lysine residue at the C-terminus of MHC class I ligands correlates with low C-terminal proteasomal cleavage probability.

Han, Y. ; Haouel, A. ; Georgii, E. ; Priego-Cubero, S. ; Wurm, C. ; Hemmler, D. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Becker, C. ; Durner, J. ; Lindermayr, C.

Histone deacetylases HD2A and HD2B undergo feedback regulation by ABA and modulate drought tolerance via mediating ABA-induced transcriptional repression.

Staab-Weijnitz, C.A. ; Onursal, C. ; Nambiar, D. ; Vanacore, R.

Assessment of collagen in translational models of lung research.
Nat. Biotechnol. 41, 604-606 (2023)

Virshup, I. ; Bredikhin, D. ; Heumos, L. ; Palla, G. ; Sturm, G. ; Gayoso, A. ; Kats, I. ; Koutrouli, M. ; Berger, B. ; Pe'er, D. ; Regev, A. ; Teichmann, S.A. ; Finotello, F. ; Wolf, F.A. ; Yosef, N. ; Stegle, O. ; Theis, F.J.

The scverse project provides a computational ecosystem for single-cell omics data analysis.
Cancers 15:23 (2023)

Spella, M. ; Ntaliarda, G. ; Skiadas, G. ; Lamort, A.-S. ; Vreka, M. ; Marazioti, A. ; Lilis, I. ; Bouloukou, E. ; Giotopoulou, G.A. ; Pepe, M. ; Weiss, S.A. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Koch, I. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Arendt, K.A.M. ; Giopanou, I. ; Brunn, D. ; Savai, R. ; Jenne, D. ; de Château, M. ; Yull, F.E. ; Blackwell, T.S. ; Stathopoulos, G.T.

Non-oncogene addiction of KRAS-mutant cancers to IL-1β via versican and mononuclear IKKβ.
Front. Immunol. 14:1112608 (2023)

Windhorst, A.C. ; Heydarian, M. ; Schwarz, M. ; Oak, P. ; Forster, K. ; Frankenberger, M. ; Gonzalez-Rodriguez, E. ; Zhang, X. ; Ehrhardt, H. ; Hübener, C. ; Flemmer, A.W. ; Hossain, H. ; Stöger, T. ; Schulz, C. ; Hilgendorff, A.

Monocyte signature as a predictor of chronic lung disease in the preterm infant.
In:. 442 Glossop Rd, Sheffield S10 2px, England: European Respiratory Soc Journals Ltd, 2023.:12 (ERJ Open Res. ; 9)

Cuevas Ocaña, S. ; El-Merhie, N. ; Kuipers, M.E. ; Lehmann, M. ; Enes, S.R. ; Voss, C. ; Dean, L.S.N. ; Loxham, M. ; Boots, A.W. ; Cloonan, S.M. ; Greene, C.M. ; Heijink, I.H. ; Joannes, A. ; Mailleux, A.A. ; Mansouri, N. ; Reynaert, N.L. ; van der Does, A.M. ; Wagner, D. ; Ubags, N.

ERS International Congress 2022: Highlights from the Basic and Translational Science Assembly.
Sci. Adv. 9:eadd8564 (2023)

Vornholz, L. ; Isay, S.E. ; Kurgyis, Z. ; Strobl, D.C. ; Loll, P. ; Mosa, M.H. ; Luecken, M. ; Sterr, M. ; Lickert, H. ; Winter, C. ; Greten, F.R. ; Farin, H.F. ; Theis, F.J. ; Ruland, J.

Synthetic enforcement of STING signaling in cancer cells appropriates the immune microenvironment for checkpoint inhibitor therapy.

Wang, X. ; Zhang, H. ; Wang, Y. ; Bramasole, L. ; Guo, K. ; Mourtada, F. ; Meul, T. ; Hu, Q. ; Viteri-Alvarez, V. ; Kammerl, I.E. ; Königshoff, M. ; Lehmann, M. ; Magg, T. ; Hauck, F. ; Fernandez, I.E. ; Meiners, S.

DNA sensing via the cGAS/STING pathway activates the immunoproteasome and adaptive T-cell immunity.
Eur. Respir. J. 61:3 (2023)

Lehmann, M. ; Kolb, M.

Another piece in the pirfenidone puzzle.
Front. Immunol. 14:1209992 (2023)

Windhorst, A.C. ; Heydarian, M. ; Schwarz, M. ; Oak, P. ; Forster, K. ; Frankenberger, M. ; Gonzalez-Rodriguez, E. ; Zhang, X. ; Ehrhardt, H. ; Hübener, C. ; Flemmer, A.W. ; Hossain, H. ; Stöger, T. ; Schulz, C. ; Hilgendorff, A.

Corrigendum: Monocyte signature as a predictor of chronic lung disease in the preterm infant.
Naunyn-Schmiedebergs Arch. Pharmakol. 396, 2287-2310 (2023)

Rani, R. ; Raina, N. ; Sharma, A. ; Kumar, P. ; Tulli, H.S. ; Gupta, M.

Advancement in nanotechnology for treatment of rheumatoid arthritis: Scope and potential applications.
NanoImpact 31:100466 (2023)

Braakhuis, H.M. ; Gremmer, E.R. ; Bannuscher, A. ; Drasler, B. ; Keshavan, S. ; Rothen-Rutishauser, B. ; Birk, B. ; Verlohner, A. ; Landsiedel, R. ; Meldrum, K. ; Doak, S.H. ; Clift, M.J.D. ; Erdem, J.S. ; Foss, O.A.H. ; Zienolddiny-Narui, S. ; Serchi, T. ; Moschini, E. ; Weber, P. ; Burla, S. ; Kumar, P. ; Schmid, O. ; Zwart, E. ; Vermeulen, J.P. ; Vandebriel, R.J.

Transferability and reproducibility of exposed air-liquid interface co-culture lung models.
Front. Immunol. 14:1128239 (2023)

Kastlmeier, M.T. ; Gonzalez-Rodriguez, E. ; Cabanis , P. ; Günther, E. ; König, A.-C. ; Han, L. ; Hauck, S.M. ; See, F. ; Asgharpour, S. ; Bukas, C. ; Burgstaller, G. ; Piraud, M. ; Lehmann, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Stöger, T. ; Hilgendorff, A. ; Voss, C.

Cytokine signaling converging on IL11 in ILD fibroblasts provokes aberrant epithelial differentiation signatures.
Nat. Cancer 4, 629-647 (2023)

Javitt, A. ; Shmueli, M.D. ; Kramer, M.P. ; Kolodziejczyk, A.A. ; Cohen, I.J. ; Radomir, L. ; Sheban, D. ; Kamer, I. ; Litchfield, K. ; Bab-Dinitz, E. ; Zadok, O. ; Neiens, V. ; Ulman, A. ; Wolf-Levy, H. ; Eisenberg-Lerner, A. ; Kacen, A. ; Alon, M. ; Rêgo, A.T. ; Stacher-Priehse, E. ; Lindner, M. ; Koch, I. ; Bar, J. ; Swanton, C. ; Samuels, Y. ; Levin, Y. ; da Fonseca, P.C.A. ; Elinav, E. ; Friedman, N. ; Meiners, S. ; Merbl, Y.

The proteasome regulator PSME4 modulates proteasome activity and antigen diversity to abrogate antitumor immunity in NSCLC.
Antioxidants 12:16 (2023)

Szepesi, Á. ; Bakacsy, L. ; Fehér, A. ; Kovács, H. ; Pálfi, P. ; Poór, P. ; Szőllősi, R. ; Gondor, O.K. ; Janda, T. ; Szalai, G. ; Lindermayr, C. ; Szabados, L. ; Zsigmond, L.

L-aminoguanidine induces imbalance of ROS/RNS homeostasis and polyamine catabolism of tomato roots after short-term salt exposure.

Beck, C. ; Ramanujam, D. ; Vaccarello, P. ; Widenmeyer, F. ; Feuerherd, M. ; Cheng, C.C. ; Bomhard, A. ; Abikeeva, T. ; Schädler, J. ; Sperhake, J.P. ; Graw, M. ; Safi, S. ; Hoffmann, H. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Rad, R. ; Protzer, U. ; Frischmuth, T. ; Engelhardt, S.

Trimannose-coupled antimiR-21 for macrophage-targeted inhalation treatment of acute inflammatory lung damage.
Pharmaceuticals 16:20 (2023)

Momeni Larimi, M. ; Babamiri, A. ; Biglarian, M. ; Ramiar, A. ; Tabe, R. ; Inthavong, K. ; Farnoud, A.

Numerical and experimental analysis of drug inhalation in realistic human upper airway model.
Bioinformatics 39:8 (2023)

Heumos, L. ; Ehmele, P. ; Kuhn Cuellar, L. ; Menden, K. ; Miller, E. ; Lemke, S. ; Gabernet, G. ; Nahnsen, S.

mlf-core: A framework for deterministic machine learning.
Nat. Rev. Genet. 24, 550-572 (2023)

Heumos, L. ; Schaar, A. ; Lance, C. ; Litinetskaya, A. ; Drost, F. ; Zappia, L. ; Luecken, M. ; Strobl, D.C. ; Henao, J. ; Curion, F. ; Schiller, H. ; Theis, F.J.

Best practices for single-cell analysis across modalities.
Nat. Med. 29, 1563-1577 (2023)

Sikkema, L. ; Ramirez Suastegui, C. ; Strobl, D.C. ; Gillett, T.E. ; Zappia, L. ; Madissoon, E. ; Markov, N.S. ; Zaragosi, L.E. ; Ji, Y. ; Ansari, M. ; Arguel, M.J. ; Apperloo, L. ; Banchero, M. ; Bécavin, C. ; Berg, M. ; Chichelnitskiy, E. ; Chung, M.I. ; Collin, A. ; Gay, A.C.A. ; Schniering, J. ; Hooshiar Kashani, B. ; Inecik, K. ; Jain, M. ; Kapellos, T. ; Kole, T.M. ; Leroy, S. ; Mayr, C. ; Oliver, A.J. ; von Papen, M. ; Peter, L. ; Taylor, C.J. ; Walzthoeni, T. ; Xu, C. ; Bui, L.T. ; De Donno, C. ; Dony, L. ; Faiz, A. ; Guo, M. ; Gutierrez, A.J. ; Heumos, L. ; Huang, N. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Jackson, N.D. ; Kadur Lakshminarasimha Murthy, P. ; Lotfollahi, M. ; Tabib, T. ; Talavera Lopez, C.N. ; Travaglini, K.J. ; Wilbrey-Clark, A. ; Worlock, K.B. ; Yoshida, M. ; van den Berge, M. ; Bossé, Y. ; Desai, T.J. ; Eickelberg, O. ; Kaminski, N. ; Krasnow, M.A. ; Lafyatis, R. ; Nikolić, M.Z. ; Powell, J.E. ; Rajagopal, J. ; Rojas, M. ; Rozenblatt-Rosen, O. ; Seibold, M.A. ; Sheppard, D. ; Shepherd, D.P. ; Sin, D.D. ; Timens, W. ; Tsankov, A.M. ; Whitsett, J. ; Xu, Y. ; Banovich, N.E. ; Barbry, P. ; Duong, T.E. ; Falk, C.S. ; Meyer, K.B. ; Kropski, J.A. ; Pe'er, D. ; Schiller, H. ; Tata, P.R. ; Schultze, J.L. ; Teichmann, S.A. ; Misharin, A.V. ; Nawijn, M.C. ; Luecken, M. ; Theis, F.J.

An integrated cell atlas of the lung in health and disease.
Diagnostics 13:14 (2023)

Damirov, F. ; Stoleriu, M.-G. ; Manapov, F. ; Büsing, K. ; Michels, J.D. ; Preissler, G. ; Hatz, R. ; Hohenberger, P. ; Roessner, E.D.

Histology of the primary tumor correlates with false positivity of integrated 18F-FDG-PET/CT lymph node staging in resectable lung cancer patients.
Cell Rep. 42:112533 (2023)

Saini, M. ; Schmidleitner, L. ; Moreno, H.D. ; Donato, E. ; Falcone, M. ; Bartsch, J. ; Klein, C. ; Vogel, V. ; Würth, R. ; Pfarr, N. ; Espinet, E. ; Lehmann, M. ; Königshoff, M. ; Reitberger, M. ; Haas, S. ; Graf, E. ; Schwarzmayr, T. ; Strom, T.M. ; Spaich, S. ; Sütterlin, M. ; Schneeweiss, A. ; Weichert, W. ; Schotta, G. ; Reichert, M. ; Aceto, N. ; Sprick, M.R. ; Trumpp, A. ; Scheel, C.

Resistance to mesenchymal reprogramming sustains clonal propagation in metastatic breast cancer.

Heydarian, M. ; Oak, P. ; Koschlig, M. ; Kamgari, N. ; Hagemann, M. ; Wjst, M. ; Hilgendorff, A.

Prenatal vitamin D supplementation mitigates inflammation-related alveolar remodeling in neonatal mice.
Cell Rep. 42:112525 (2023)

Kapellos, T. ; Baßler, K. ; Fujii, W. ; Nalkurthi, C. ; Schaar, A. ; Bonaguro, L. ; Pecht, T. ; Galvao, I. ; Agrawal, S. ; Saglam, A. ; Dudkin, E. ; Frishberg, A. ; De Domenico, E. ; Horne, A. ; Donovan, C. ; Kim, R.Y. ; Gallego-Ortega, D. ; Gillett, T.E. ; Ansari, M. ; Schulte-Schrepping, J. ; Offermann, N. ; Antignano, I. ; Sivri, B. ; Lu, W. ; Eapen, M.S. ; van Uelft, M. ; Osei-Sarpong, C. ; van den Berge, M. ; Donker, H.C. ; Groen, H.J.M. ; Sohal, S.S. ; Klein, J. ; Schreiber, T. ; Feißt, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Schiller, H. ; Nawijn, M.C. ; Becker, M. ; Händler, K. ; Beyer, M. ; Capasso, M. ; Ulas, T. ; Hasenauer, J. ; Pizarro, C. ; Theis, F.J. ; Hansbro, P.M. ; Skowasch, D. ; Schultze, J.

Systemic alterations in neutrophils and their precursors in early-stage chronic obstructive pulmonary disease.

Kalgudde Gopal, S. ; Dai, R. ; Stefanska, A.M. ; Ansari, M. ; Zhao, J. ; Ramesh, P. ; Bagnoli, J.W. ; Correa-Gallegos, D. ; Lin, Y. ; Christ, S. ; Angelidis, I. ; Lupperger, V. ; Marr, C. ; Davies, L.C. ; Enard, W. ; Machens, H.G. ; Schiller, H. ; Jiang, D. ; Rinkevich, Y.

Wound infiltrating adipocytes are not myofibroblasts.
Chest 164, 1476-1480 (2023)

Goos, T. ; Dubbeldam, A. ; Vermant, M. ; Gogaert, S. ; De Sadeleer, L.J. ; De Crem, N. ; De Langhe, E. ; Yserbyt, J. ; Weynand, B. ; Carlon, M.S. ; Verschakelen, J. ; Vermeer, S. ; Verleden, S.E. ; Wuyts, W.A.

Intrafamilial correlation and variability in the clinical evolution of pulmonary fibrosis.
J. Invest. Dermatol. 143, 1667-1677 (2023)

Almet, A.A. ; Yuan, H. ; Annusver, K. ; Ramos, R. ; Liu, Y. ; Wiedemann, J. ; Sorkin, D.H. ; Landén, N.X. ; Sonkoly, E. ; Haniffa, M. ; Nie, Q. ; Lichtenberger, B.M. ; Luecken, M. ; Andersen, B. ; Tsoi, L.C. ; Watt, F.M. ; Gudjonsson, J.E. ; Plikus, M.V. ; Kasper, M.

A Roadmap for a consensus human skin cell atlas and single-cell data standardization.

Stoleriu, M.-G. ; Gerckens, M. ; Zimmermann, J. ; Schön, J. ; Damirov, F. ; Samm, N. ; Kovács, J. ; Stacher-Priehse, E. ; Kellerer, C. ; Jörres, R.A. ; Kauke, T. ; Ketscher, C. ; Grützner, U. ; Hatz, R.

Preoperative risk factors predict perioperative allogenic blood transfusion in patients undergoing primary lung cancer resections: a retrospective cohort study from a high-volume thoracic surgery center.
Front. Microbiol. 13:957830 (2023)

Nakayama, M. ; Marchi, H. ; Dmitrieva, A. ; Chakraborty, A. ; Merl-Pham, J. ; Hennen, E. ; Le Gleut, R. ; Ruppert, C. ; Guenther, A. ; Kahnert, K. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Hauck, S.M. ; Adler, H. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Quantitative proteomics of differentiated primary bronchial epithelial cells from chronic obstructive pulmonary disease and control identifies potential novel host factors post-influenza A virus infection.
Pharmaceuticals 16:14 (2023)

Farnoud, A. ; Tofighian, H. ; Baumann, I. ; Ahookhosh, K. ; Pourmehran, O. ; Cui, X. ; Heuveline, V. ; Song, C. ; Vreugde, S. ; Wormald, P.J. ; Menden, M.P. ; Schmid, O.

Numerical and machine Learning analysis of the parameters affecting the regionally delivered nasal dose of nano- and micro-sized aerosolized drugs.
J. Control. Release 354, 305-315 (2023)

Kandil, R. ; Baldassi, D. ; Böhlen, S. ; Müller, J.T. ; Jürgens, D.C. ; Bargmann, T. ; Dehmel, S. ; Xie, Y. ; Mehta, A. ; Sewald, K. ; Merkel, O.M.

Targeted GATA3 knockdown in activated T cells via pulmonary siRNA delivery as novel therapy for allergic asthma.
Pediatr. Res. 93, 625-632 (2023)

Kindt, A. ; Förster, K. ; Cochius-den Otter, S.C.M. ; Flemmer, A.W. ; Hauck, S.M. ; Flatley, A. ; Kamphuis, J. ; Karrasch, S. ; Behr, J. ; Franz, A. ; Härtel, C. ; Krumsiek, J. ; Tibboel, D. ; Hilgendorff, A.

Validation of disease-specific biomarkers for the early detection of bronchopulmonary dysplasia.
IEEE Xplore, 28-33 (2022)

Abdollahi, H. ; Nabaei, M. ; Ahookhosh, K. ; Babamiri, A. ; Farnoud, A.

Evaluating the Potential of Ellipsoidal Particles for Inhalation Therapy in Comparison to Spherical Particles.

Van Eeckhoutte, H.P. ; Donovan, C. ; Kim, R.Y. ; Conlon, T.M. ; Ansari, M. ; Khan, H. ; Jayaraman, R. ; Hansbro, N.G. ; Dondelinger, Y. ; Delanghe, T. ; Beal, A.M. ; Geddes, B. ; Bertin, J. ; Berghe, T.V. ; De Volder, J. ; Maes, T. ; Vandenabeele, P. ; Vanaudenaerde, B.M. ; Deforce, D. ; Škevin, S. ; Van Nieuwerburgh, F. ; Verhamme, F.M. ; Joos, G.F. ; Idrees, S. ; Schiller, H. B. ; Yildirim, A.Ö. ; Faiz, A. ; Bertrand, M.J.M. ; Brusselle, G.G. ; Hansbro, P.M. ; Bracke, K.R.

RIPK1 kinase-dependent inflammation and cell death contribute to the pathogenesis of COPD.
Int. J. Mol. Sci. 23:15666 (2022)

Kastlmeier, M.T. ; Günther, E. ; Stöger, T. ; Voss, C.

Lung organoids for hazard assessment of nanomaterials.
Sarcoidosis Vasc. Diffus. Lung Dis. 39:e2022016 (2022)

Silbernagel, E. ; Stacher-Priehse, E. ; Dinkel, J. ; Stepp, H. ; Gesierich, W. ; Lindner, M. ; Behr, J. ; Reichenberger, F.

Bronchoscopic probe-based confocal laser endomicroscopy to diagnose diffuse parenchymal lung diseases.

Gabryś, H.S. ; Schniering, J. ; Brunner, M. ; Bogowicz, M. ; Blüthgen, C. ; Frauenfelder, T. ; Guckenberger, M. ; Maurer, B. ; Tanadini-Lang, S.

Transferability of radiomic signatures from experimental to human interstitial lung disease.
Pneumologie, DOI: 10.1055/a-1956-8800 (2022)

Biener, L. ; Milger, K. ; Suhling, H. ; Korn, S. ; Pizarro, C. ; Skowasch, D.

Impact of short-term pausing of oral corticosteroids on blood eosinophil count in patients with severe asthma.

Förster, K. ; Marchi, H. ; Stöcklein, S. ; Dietrich, O. ; Ehrhardt, H. ; Wielpütz, M.O. ; Flemmer, A.W. ; Schubert, B. ; Mall, M.A. ; Ertl-Wagner, B. ; Hilgendorff, A.

MRI based scoring of the diseased lung in the preterm infant with BPD.
NanoImpact 28:100439 (2022)

Bannuscher, A. ; Schmid, O. ; Drasler, B. ; Rohrbasser, A. ; Braakhuis, H.M. ; Meldrum, K. ; Zwart, E.P. ; Gremmer, E.R. ; Birk, B. ; Rissel, M. ; Moschini, E. ; Evans, S.J. ; Kumar, P. ; Orak, S. ; Doryab, A. ; Erdem, J.S. ; Serchi, T. ; Vandebriel, R.J. ; Cassee, F.R. ; Doak, S.H. ; Petri-Fink, A. ; Zienolddiny, S. ; Clift, M.J.D. ; Rothen-Rutishauser, B.

An inter-laboratory effort to harmonize the cell-delivered in vitro dose of aerosolized materials.
Nat. Neurosci. 25, 1608-1625 (2022)

Zambusi, A. ; Novoselc, K.T. ; Hutten, S. ; Kalpazidou, S. ; Koupourtidou, C. ; Schieweck, R. ; Aschenbroich, S. ; Silva, L. ; Yazgili, A.S. ; van Bebber, F. ; Schmid, B. ; Möller, G. ; Tritscher, C. ; Stigloher, C. ; Delbridge, C. ; Sirko, S. ; Günes, Z.I. ; Liebscher, S. ; Schlegel, J. ; Aliee, H. ; Theis, F.J. ; Meiners, S. ; Kiebler, M. ; Dormann, D. ; Ninkovic, J.

TDP-43 condensates and lipid droplets regulate the reactivity of microglia and regeneration after traumatic brain injury.

Geiger, F. ; Zeitlmayr, S. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Rajan, S. ; Breit, A. ; Gudermann, T. ; Dietrich, A.

An inhibitory function of TRPA1 channels in TGF-β1-driven fibroblast to myofibroblast differentiation.
Biochim. Biophys. Acta-Mol. Basis Dis. 1869:166592 (2022)

Bauer, A. ; Pachl, E. ; Hellmuth, J.C. ; Kneidinger, N. ; Heydarian, M. ; Frankenberger, M. ; Stubbe, H.C. ; Ryffel, B. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Behr, J. ; Kaiser, R. ; Scherer, C. ; Deng, L. ; Teupser, D. ; Ahmidi, N. ; Muenchhoff, M. ; Schubert, B. ; Hilgendorff, A.

Proteomics reveals antiviral host response and NETosis during acute COVID-19 in high-risk patients.
Allergy 78, 1218-1233 (2022)

Musiol, S. ; Harris, C. ; Karlina, R. ; Gostner, J.M. ; Rathkolb, B. ; Schnautz, B. ; Schneider, E. ; Mair, L. ; Vergara, E.E. ; Flexeder, C. ; Koletzko, S. ; Bauer, C.P. ; Schikowski, T. ; Berdel, D. ; von Berg, A. ; Herberth, G. ; Rozman, J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Standl, M. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Ussar, S. ; Alessandrini, F.

Dietary digestible carbohydrates are associated with higher prevalence of asthma in humans and with aggravated lung allergic inflammation in mice.

Al-Samir, S. ; Yildirim, A.Ö. ; Sidhaye, V.K. ; King, L.S. ; Breves, G. ; Conlon, T.M. ; Stoeger, C. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Gros, G. ; Endeward, V.

Aqp5--/-- mice exhibit reduced maximal O2 consumption under cold exposure, normal pulmonary gas exchange, and impaired formation of brown adipose tissue.
Nanotechnology in the Life Sciences, 93-122 (2022)

Tiwari, R. ; Gulbake, A. ; Kumar, P. ; Gulbake, A.S. ; Gupta, R. ; Bisht, D. ; Sethiya, N.K.

Aptamer-based targeted drug delivery systems.

Shin, H. ; Morty, R.E. ; Sucre, J.M.S. ; Negretti, N.M. ; Markmann, M. ; Hossain, H. ; Krauss-Etschmann, S. ; Dehmel, S. ; Hilgendorff, A.

Reference genes for the developing mouse lung under consideration of biological, technical and experimental confounders.
Front. Cell. Infect. Microbiol. 12:958634 (2022)

Berthold, E. ; Ma-Lauer, Y. ; Chakraborty, A. ; von Brunn, B. ; Hilgendorff, A. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Hausch, F. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; von Brunn, A.

Effects of immunophilin inhibitors and non-immunosuppressive analogs on coronavirus replication in human infection models.
Genes 13:1420 (2022)

Dehmel, S. ; Weiss, K. ; El-Merhie, N. ; Callegari, J. ; Konrad, B ; Mutze, K. ; Eickelberg, O. ; Königshoff, M. ; Krauss-Etschmann, S.

microRNA expression profile of purified alveolar epithelial type II cells.
Front. Immunol. 13:1000927 (2022)

Xiong, K. ; Qi, M. ; Stöger, T. ; Zhang, J. ; Chen, S.

The role of tumor-associated macrophages and soluble mediators in pulmonary metastatic melanoma.
Patient pre. adh. 16, 1759-1770 (2022)

Fischer, C. ; Jörres, R.A. ; Alter, P. ; Trudzinski, F.C. ; Yildirim, A.Ö. ; Bals, R. ; Vogelmeier, C.F. ; Kauffmann-Guerrero, D. ; Behr, J. ; Watz, H. ; Holle, R. ; Kahnert, K.

Basic determinants of disease knowledge in COPD patients: Results from COSYCONET.
Biomolecules 12:1150 (2022)

Yazgili, A.S. ; Ebstein, F. ; Meiners, S.

The proteasome activator PA200/PSME4: An emerging new player in health and disease.
NanoImpact 28:100416 (2022)

Tschiche, H.R. ; Bierkandt, F.S. ; Creutzenberg, O. ; Fessard, V. ; Franz, R. ; Greiner, R. ; Gruber-Traub, C. ; Haas, K.H. ; Haase, A. ; Hartwig, A. ; Hesse, B.D. ; Hund-Rinke, K. ; Iden, P. ; Kromer, C. ; Löschner, K. ; Mutz, D. ; Rakow, A. ; Rasmussen, K. ; Rauscher, H. ; Richter, H. ; Schoon, J. ; Schmid, O. ; Som, C. ; Spindler, L.M. ; Tovar, G.E.M. ; Westerhoff, P. ; Wohlleben, W. ; Luch, A. ; Laux, P.

Analytical and toxicological aspects of nanomaterials in different product groups: Challenges and opportunities.

Kessler, N. ; Viehmann, S.F. ; Krollmann, C. ; Mai, K. ; Kirschner, K.M. ; Luksch, H. ; Kotagiri, P. ; Böhner, A.M.C. ; Huugen, D. ; de Oliveira Mann, C.C. ; Otten, S. ; Weiss, S.A. ; Zillinger, T. ; Dobrikova, K. ; Jenne, D. ; Behrendt, R. ; Ablasser, A. ; Bartok, E. ; Hartmann, G. ; Hopfner, K.P. ; Lyons, P.A. ; Boor, P. ; Rosen-Wolff, A. ; Teichmann, L.L. ; Heeringa, P. ; Kurts, C. ; Garbi, N.

Monocyte-derived macrophages aggravate pulmonary vasculitis via cGAS/STING/IFN-mediated nucleic acid sensing.

Chen, Y. ; Toth, R. ; Chocarro, S. ; Weichenhan, D. ; Hey, J. ; Lutsik, P. ; Sawall, S. ; Stathopoulos, G.T. ; Plass, C. ; Sotillo, R.

Club cells employ regeneration mechanisms during lung tumorigenesis.
Front. Immunol. 13:913275 (2022)

Kuhn, L. ; Valentin, S. ; Stojanovic, K. ; Strobl, D.C. ; Babushku, T. ; Wang, Y. ; Rambold, U. ; Scheffler, L. ; Grath, S. ; John-Robbert, D. ; Blum, H. ; Feuchtinger, A. ; Blutke, A. ; Weih, F. ; Kitamura, D. ; Rad, R. ; Strobl, L.J. ; Zimber-Strobl, U.

RelB contributes to the survival, migration and lymphomagenesis of B cells with constitutively active CD40 signaling.
Nutrients 14:3912 (2022)

Kindt, A. ; Kraus, Y. ; Rasp, D. ; Förster, K. ; Ahmidi, N. ; Flemmer, A.W. ; Herber-Jonat, S. ; Heinen, F. ; Weigand, H. ; Hankemeier, T. ; Koletzko, B. ; Krumsiek, J. ; Babl, J. ; Hilgendorff, A.

Improved Macro- and micronutrient supply for favorable growth and metabolomic profile with standardized parenteral nutrition solutions for very preterm infants.
Mol. Cell. Pediatr. 9:16 (2022)

Heydarian, M. ; Schulz, C. ; Stöger, T. ; Hilgendorff, A.

Association of immune cell recruitment and BPD development.
Arch. Toxicol. 96, 2767-2783 (2022)

Zeitlmayr, S. ; Zierler, S. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Dietrich, A. ; Geiger, F. ; Horgen, F.D. ; Gudermann, T. ; Breit, A.

TRPM7 restrains plasmin activity and promotes transforming growth factor-β1 signaling in primary human lung fibroblasts.

Mümmler, C. ; Suhling, H. ; Walter, J. ; Kneidinger, N. ; Buhl, R. ; Kayser, M.Z. ; Drick, N. ; Behr, J. ; Welte, T. ; Korn, S. ; Milger, K.

Overall response to anti-IL5/anti-IL5Rα treatment in severe asthma does not depend on initial bronchodilator responsiveness.
J. Allergy Clin. Immunol. 150, 1209-1215.e2 (2022)

Strieker, S. ; Weinmann, T. ; Gerlich, J. ; von Mutius, E. ; Nowak, D. ; Radon, K. ; Wengenroth, L.

Farm living and allergic rhinitis from childhood to young adulthood - prospective results of the GABRIEL study.

Stoecklein, S. ; Koliogiannis, V. ; Prester, T. ; Kolben, T. ; Jegen, M. ; Hübener, C. ; Hasbargen, U. ; Flemmer, A. ; Dietrich, O. ; Schinner, R. ; Dinkel, J. ; Fink, N.R. ; Muenchhoff, M. ; Hintz, S. ; Delius, M. ; Mahner, S. ; Ricke, J. ; Hilgendorff, A.

Effects of SARS-CoV-2 on prenatal lung growth assessed by fetal MRI.
J. Control. Release 351, 137-150 (2022)

Zimmermann, C.M. ; Baldassi, D. ; Chan, K. ; Adams, N.B.P. ; Neumann, A. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Wei, X. ; Kneidinger, N. ; Stoleriu, M.G. ; Burgstaller, G. ; Witzigmann, D. ; Luciani, P. ; Merkel, O.M.

Spray drying siRNA-lipid nanoparticles for dry powder pulmonary delivery.
Oxid. Med. Cell. Longev. 2022:9154295 (2022)

Panda, P. ; Verma, H.K. ; Lakkakula, S. ; Merchant, N. ; Kadir, F. ; Rahman, S. ; Jeffree, M.S. ; Lakkakula, B.V.K.S. ; Rao, P.V.

Biomarkers of oxidative stress tethered to cardiovascular diseases.
Front. Immunol. 13:901194 (2022)

Alessandrini, F. ; de Jong, R.J. ; Wimmer, M. ; Maier, A.-M. ; Fernandez, I.E. ; Hils, M. ; Buters, J.T.M. ; Biedermann, T. ; Zissler, U.M. ; Hoffmann, C. ; Esser-von Bieren, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Ohnmacht, C.

Lung epithelial CYP1 activity regulates aryl hydrocarbon receptor dependent allergic airway inflammation.
Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 323, L341-L354 (2022)

Ikonomou, L. ; Magnusson, M. ; Dries, R. ; Herzog, E.L. ; Hynds, R. ; Borok, Z. ; Park, J.A. ; Skolasinski, S. ; Burgess, J.K. ; Turner, L. ; Mojarad, S.M. ; Mahoney, J.E. ; Lynch, T. ; Lehmann, M. ; Thannickal, V.J. ; Hook, J.L. ; Vaughan, A.E. ; Hoffman, E.T. ; Weiss, D.J. ; Ryan, A.L.

Stem cells, cell therapies, and bioengineering in lung biology and disease 2021.
Biomolecules 12:756 (2022)

Schlesser, C. ; Meul, T. ; Stathopoulos, G.T. ; Meiners, S.

Metformin induces resistance of cancer cells to the proteasome inhibitor bortezomib.
World J. Gastroenterol. 28, 1718-1721 (2022)

Verma, H.K. ; Prasad, K. ; Kumar, P. ; Lvks, B.

Viral hepatitis: A global burden needs future directions for the management.

Bal, C. ; Idzko, M. ; Škrgat, S. ; Koch, A. ; Milger, K. ; Schulz, C. ; Zehetmayer, S. ; Hamelmann, E. ; Buhl, R. ; Korn, S.

Fraction of exhaled nitric oxide is associated with disease burden in the German Asthma Net severe asthma cohort.
2022 in
In: Nanotheranostics for Treatment and Diagnosis of Infectious Diseases. 2022. 229-273

Tiwari, A. ; Gulbake, A.S. ; Kumar, P.

Lipid nanoparticles and nanoemulsions exploited in the diagnosis and treatment of infectious diseases.
Med. Sci. 10:23 (2022)

Mirastschijski, U. ; Jiang, D. ; Rinkevich, Y.

Genital wound repair and scarring.
Front. Med. 9:889834 (2022)

Krick, S. ; Geraghty, P. ; Jourdan Le Saux, C. ; Rojas, M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Editorial: Defining and characterizing respiratory disease in an aging population.
Nanomaterials 12:1362 (2022)

Leroux, M.M. ; Hocquel, R. ; Bourge, K. ; Kokot, B. ; Kokot, H. ; Koklič, T. ; Štrancar, J. ; Ding, Y. ; Kumar, P. ; Schmid, O. ; Rihn, B.H. ; Ferrari, L. ; Joubert, O.

Aerosol–cell exposure system applied to semi-adherent cells for aerosolization of lung surfactant and nanoparticles followed by high quality RNA extraction.
Cells 11:1341 (2022)

Preisendörfer, S. ; Ishikawa, Y. ; Hennen, E. ; Winklmeier, S. ; Schupp, J.C. ; Knüppel, L. ; Fernandez, I.E. ; Binzenhöfer, L. ; Flatley, A. ; Juan-Guardela, B.M. ; Ruppert, C. ; Guenther, A. ; Frankenberger, M. ; Hatz, R.A. ; Kneidinger, N. ; Behr, J. ; Feederle, R. ; Schepers, A. ; Hilgendorff, A. ; Kaminski, N. ; Meinl, E. ; Bächinger, H.P. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

FK506-binding protein 11 is a novel plasma cell-specific antibody folding catalyst with increased expression in idiopathic pulmonary fibrosis.
Cell Death Dis. 13:614 (2022)

Shahzad, T. ; Chao, C.M. ; Hadzic, S. ; Behnke, J. ; Biebach, L. ; Boettcher-Friebertshaeuser, E. ; Wilhelm, J. ; Hilgendorff, A. ; Zimmer, K. ; Morty, R.E. ; Bellusci, S. ; Ehrhardt, H.

TRAIL protects the immature lung from hyperoxic injury.
Anaesth. Intensive Ther. 54, 12-17 (2022)

Schmidt, F. ; Nowak, L. ; Obereisenbuchler, F. ; Hetrodt, J. ; Heiß-Neumann, M. ; Schönlebe, A. ; Heinig-Menhard, K. ; Gesierich, W. ; Behr, J. ; Hatz, R.A. ; Dinkel, J. ; Stoleriu, M.-G.

Predicting the effectiveness of high-flow oxygen therapy in COVID-19 patients: A single-centre observational study.
Pharmaceutics 14:671 (2022)

Secher, T. ; Bodier-Montagutelli, E. ; Parent, C. ; Bouvart, L. ; Cortes, M. ; Ferreira, M.A. ; Macloughlin, R. ; Ilango, G. ; Schmid, O. ; Respaud, R. ; Heuzé-Vourc’h, N.

Aggregates associated with instability of antibodies during aerosolization induce adverse immunological effects.
Ann. Neurosci. 29, 255-268 (2022)

Sahu, T. ; Pande, B. ; Sinha, M. ; Sinha, R. ; Verma, H.K.

Neurocognitive changes in sickle cell disease: A comprehensive review.
Cells 11:1050 (2022)

Chakraborty, A. ; Mastalerz, M. ; Ansari, M. ; Schiller, H. B. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Emerging roles of airway epithelial cells in idiopathic pulmonary fibrosis.
Viruses 14:911 (2022)

Cheng, S. ; Liu, X. ; Mu, J. ; Yan, W. ; Wang, M. ; Chai, H. ; Sha, Y. ; Jiang, S. ; Wang, S. ; Ren, Y. ; Gao, C. ; Ding, Z. ; Stöger, T. ; Tseren-Ochir, E.O. ; Dodovski, A. ; Alfonso, P. ; Mingala, C.N. ; Yin, R.

Intense innate immune responses and severe metabolic disorders in chicken embryonic visceral tissues caused by infection with highly virulent newcastle disease virus compared to the avirulent virus: A bioinformatics analysis.
Environ. Nanotechnol. Monit. Manag. 18:100707 (2022)

Tschiche, H.R. ; Bierkandt, F.S. ; Creutzenberg, O. ; Fessard, V. ; Franz, R. ; Giese, B. ; Greiner, R. ; Haas, K.H. ; Haase, A. ; Hartwig, A. ; Hund‑Rinke, K. ; Iden, P. ; Kromer, C. ; Loeschner, K. ; Mutz, D. ; Rakow, A. ; Rasmussen, K. ; Rauscher, H. ; Richter, H. ; Schoon, J. ; Schmid, O. ; Som, C. ; Günter, G.E. ; Westerhoff, P. ; Wohlleben, W. ; Luch, A. ; Laux, P.

Environmental considerations and current status of grouping and regulation of engineered nanomaterials.
J. Invest. Dermatol. 142, 1767-1770 (2022)

Correa-Gallegos, D. ; Machens, H.G. ; Rinkevich, Y.

States and fates of skin fibroblasts revealed through chromatin accessibility.
Biomedicines 10:592 (2022)

Arendt, K.A.M. ; Ntaliarda, G. ; Armenis, V. ; Kati, D. ; Henning, C. ; Giotopoulou, G.A. ; Pepe, M. ; Klotz, L.V. ; Lamort, A.-S. ; Hatz, R.A. ; Kobold, S. ; Schamberger, A.C. ; Stathopoulos, G.T.

An in vivo inflammatory loop potentiates KRAS blockade.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 206, 372-373 (2022)

Lehmann, M. ; Rojas, M.

IPF: Let's keep the focus on the A(ge)TII cell.

Heinzelmann, K. ; Hu, Q. ; Hu, Y. ; Dobrinskikh, E. ; Ansari, M. ; Melo-Narváez, C. ; Ulke, H.M. ; Leavitt, C. ; Mirita, C. ; Trudeau, T. ; Saal, M.L. ; Rice, P. ; Gao, B. ; Janssen, W.J. ; Yang, I.V. ; Schiller, H. B. ; Vladar, E.K. ; Lehmann, M. ; Königshoff, M.

Single cell RNA sequencing identifies G-protein coupled receptor 87 as a basal cell marker expressed in distal honeycomb cysts in idiopathic pulmonary fibrosis.
Allergy 77, 2839-2843 (2022)

Lommatzsch, M. ; Suhling, H. ; Korn, S. ; Bergmann, K.C. ; Schreiber, J. ; Bahmer, T. ; Rabe, K.F. ; Buhl, R. ; Virchow, J.C. ; Milger, K.

Safety of combining biologics in severe asthma: Asthma-related and unrelated combinations.
Front. Immunol. 12:795232 (2022)

Ren, L. ; Wang, L. ; Rehberg, M. ; Stöger, T. ; Zhang, J. ; Chen, S.

Applications and immunological effects of quantum dots on respiratory system.
Cells 11:304 (2022)

Spix, B. ; Jeridi, A. ; Ansari, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Schiller, H. B. ; Grimm, C.

Endolysosomal cation channels and lung disease.
Respir. Res. 23:2 (2022)

Nikolova, S. ; Guenther, A. ; Savai, R. ; Weissmann, N. ; Ghofrani, H.A. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O. ; Klepetko, W. ; Voswinckel, R. ; Seeger, W. ; Grimminger, F. ; Schermuly, R.T. ; Pullamsetti, S.S.

Correction to: Phosphodiesterase 6 subunits are expressed and altered in idiopathic pulmonary fibrosis.
Thorax 77, 1176-1186 (2022)

Heydarian, M. ; Oak, P. ; Zhang, X. ; Kamgari, N. ; Kindt, A.S.D. ; Koschlig, M. ; Pritzke, T. ; Gonzalez-Rodriguez, E. ; Förster, K. ; Morty, R.E. ; Häfner, F. ; Hübener, C. ; Flemmer, A.W. ; Yildirim, A.Ö. ; Sudheendra, D. ; Tian, X. ; Petrera, A. ; Kirsten, H. ; Ahnert, P. ; Morrell, N. ; Desai, T.J. ; Sucre, J. ; Spiekerkoetter, E. ; Hilgendorff, A.

Relationship between impaired BMP signalling and clinical risk factors at early-stage vascular injury in the preterm infant.
J. Heart Lung Transpl. 41, S311-S311 (2022)

Liu, H. ; Hollauer, C. ; Hagl, C. ; Michel, S. ; Yildirim, A.Ö. ; Dashkevich, A.

Prolonged cold ischemia and indirect alloimmunity are fundamental for the development of chronic lung allograft dysfunction.
J. Control. Release 345, 661-674 (2022)

Baldassi, D. ; Ambike, S. ; Feuerherd, M. ; Cheng, C.-C. ; Peeler, D.J. ; Feldmann, D.P. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Wei, X. ; Keller, L.A. ; Kneidinger, N. ; Stoleriu, M.G. ; Popp, A. ; Burgstaller, G. ; Pun, S.H. ; Michler, T. ; Merkel, O.M.

Inhibition of SARS-CoV-2 replication in the lung with siRNA/VIPER polyplexes.

Günsel, G.G. ; Conlon, T.M. ; Jeridi, A. ; Kim, R. ; Ertüz, Z. ; Lang, N.J. ; Ansari, M. ; Novikova, M. ; Jiang, D. ; Strunz, M. ; Gaianova, M. ; Hollauer, C. ; Gabriel, C. ; Angelidis, I. ; Doll, S. ; Pestoni, J. ; Edelmann, S.L. ; Kohlhepp, M.S. ; Guillot, A. ; Bassler, K. ; Van Eeckhoutte, H.P. ; Kayalar, Ö. ; Konyalilar, N. ; Kanashova, T. ; Rodius, S. ; Ballester-Lopez, C. ; Genes Robles, C.M. ; Smirnova, N.F. ; Rehberg, M. ; Agarwal, C. ; Krikki, I. ; Piavaux, B. ; Verleden, S.E. ; Vanaudenaerde, B. ; Königshoff, M. ; Dittmar, G. ; Bracke, K.R. ; Schultze, J.L. ; Watz, H. ; Eickelberg, O. ; Stöger, T. ; Burgstaller, G. ; Tacke, F. ; Heissmeyer, V. ; Rinkevich, Y. ; Bayram, H. ; Schiller, H. B. ; Conrad, M. ; Schneider, R. ; Yildirim, A.Ö.

The arginine methyltransferase PRMT7 promotes extravasation of monocytes resulting in tissue injury in COPD.
Sci. Adv. 8:eabj9949 (2022)

Wu, X. ; Bos, I.S.T. ; Conlon, T.M. ; Ansari, M. ; Verschut, V. ; van der Koog, L. ; Verkleij, L.A. ; D'Ambrosi, A. ; Matveyenko, A. ; Schiller, H. B. ; Königshoff, M. ; Schmidt, M. ; Kistemaker, L.E.M. ; Yildirim, A.Ö. ; Gosens, R.

A transcriptomics-guided drug target discovery strategy identifies receptor ligands for lung regeneration.
Eur. Respir. J. 59:2102057 (2022)

Luecken, M. ; Zaragosi, L.E. ; Madissoon, E. ; Sikkema, L. ; Firsova, A.B. ; De Domenico, E. ; Kuemmerle, L. ; Saglam, A. ; Berg, M. ; Gay, A.C.A. ; Schniering, J. ; Mayr, C. ; Abalo, X.M. ; Larsson, L. ; Sountoulidis, A. ; Teichmann, S. ; van Eunen, K. ; Koppelman, G.H. ; Saeb-Parsy, K. ; Leroy, S. ; Powell, P. ; Sarkans, U. ; Timens, W. ; Lundeberg, J. ; van den Berge, M. ; Nilsson, M. ; Horváth, P. ; Denning, J. ; Papatheodorou, I. ; Schultze, J.L. ; Schiller, H. B. ; Barbry, P. ; Petoukhov, I. ; Misharin, A.V. ; Adcock, I. ; von Papen, M. ; Theis, F.J. ; Samakovlis, C. ; Meyer, K.B. ; Nawijn, M.C.

The discovAIR project: A roadmap towards the Human Lung Cell Atlas.
Nat. Methods 19, 159–170 (2022)

Lange, M. ; Bergen, V. ; Klein, M. ; Setty, M. ; Reuter, B. ; Bakhti, M. ; Lickert, H. ; Ansari, M. ; Schniering, J. ; Schiller, H. B. ; Pe'er, D. ; Theis, F.J.

CellRank for directed single-cell fate mapping.

Spix, B. ; Butz, E.S. ; Chen, C.C. ; Rosato, A.S. ; Tang, R. ; Jeridi, A. ; Kudrina, V. ; Plesch, E. ; Wartenberg, P. ; Arlt, E. ; Briukhovetska, D. ; Ansari, M. ; Günsel, G.G. ; Conlon, T.M. ; Wyatt, A. ; Wetzel, S. ; Teupser, D. ; Holdt, L.M. ; Ectors, F. ; Boekhoff, I. ; Boehm, U. ; García-Añoveros, J. ; Saftig, P. ; Giera, M. ; Kobold, S. ; Schiller, H. B. ; Zierler, S. ; Gudermann, T. ; Wahl-Schott, C. ; Bracher, F. ; Yildirim, A.Ö. ; Biel, M. ; Grimm, C.

Lung emphysema and impaired macrophage elastase clearance in mucolipin 3 deficient mice.
Nucleic Acids Res. 50, 333-349 (2022)

Ambike, S. ; Cheng, C.-C. ; Feuerherd, M. ; Velkov, S. ; Baldassi, D. ; Afridi, S.Q. ; Porras-Gonzalez, D.L. ; Wei, X. ; Hagen, P. ; Kneidinger, N. ; Stoleriu, M.G. ; Grass, V. ; Burgstaller, G. ; Pichlmair, A. ; Merkel, O.M. ; Ko, C. ; Michler, T.

Targeting genomic SARS-CoV-2 RNA with siRNAs allows efficient inhibition of viral replication and spread.
J. Non-Newton. Fluid Mech. 300:104727 (2022)

Sedaghat, M.H. ; Farnoud, A. ; Schmid, O. ; Abouali, O.

Nonlinear simulation of mucociliary clearance: A three- dimensional study.

Ihantola, T. ; Hirvonen, M.R. ; Ihalainen, M. ; Hakkarainen, H. ; Sippula, O. ; Tissari, J. ; Bauer, S. ; Di Bucchianico, S. ; Rastak, N. ; Hartikainen, A. ; Leskinen, J. ; Yli-Pirilä, P. ; Martikainen, M.V. ; Miettinen, M. ; Suhonen, H. ; Rönkkö, T.J. ; Kortelainen, M. ; Lamberg, H. ; Czech, H. ; Martens, P. ; Orasche, J. ; Michalke, B. ; Yildirim, A.Ö. ; Jokiniemi, J. ; Zimmermann, R. ; Jalava, P.I.

Genotoxic and inflammatory effects of spruce and brown coal briquettes combustion aerosols on lung cells at the air-liquid interface.
Cardiovasc. Res. 118, 1289–1302 (2022)

Immler, R. ; Nadolni, W. ; Bertsch, A. ; Morikis, V. ; Rohwedder, I. ; Masgrau-Alsina, S. ; Schroll, T. ; Yevtushenko, A. ; Soehnlein, O. ; Moser, M. ; Gudermann, T. ; Barnea, E.R. ; Rehberg, M. ; Simon, S.I. ; Zierler, S. ; Pruenster, M. ; Sperandio, M.

The voltage-gated potassium channel KV1.3 regulates neutrophil recruitment during inflammation.

Bondesson, D. ; Meijers, A. ; Janssens, G. ; Rit, S. ; Rabe, M. ; Kamp, F. ; Niepel, K. ; Otter, L.A.D. ; Both, S. ; Brousmiche, S. ; Dinkel, J. ; Belka, C. ; Parodi, K. ; Knopf, A. ; Kurz, C. ; Landry, G.

Anthropomorphic lung phantom based validation of in-room proton therapy 4D-CBCT image correction for dose calculation.
2021 in
In: (28th National and 6th International Iranian Conference on Biomedical Engineering (ICBME), 25-26 November 2021, Sharif University of Technology). 2021. 101-106

Abdollahi, H. ; Babamiri, A. ; Ahookhosh, K. ; Farnoud, A. ; Nabaei, M.

Effects of Inhalation Flow Rate on Particle Deposition and Flow Structure in a Model of Tracheobronchial Airway.

Lamort, A.-S. ; Kaiser, J.C. ; Pepe, M. ; Lilis, I. ; Ntaliarda, G. ; Somogyi, K. ; Spella, M. ; Behrend, S.J. ; Giotopoulou, G.A. ; Kujawa, W. ; Lindner, M. ; Koch, I. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Sotillo, R. ; Schamberger, A.C. ; Stathopoulos, G.T.

Prognostic phenotypes of early-stage lung adenocarcinoma.
Curr. Pharm. Des. 28, 165-177 (2021)

Paliwal, R. ; Kumar, P. ; Chaurasiya, A. ; Kenwat, R. ; Katke, S. ; Paliwal, S.R.

Development of nanomedicines and nano-similars: Recent advances in regulatory landscape.
Cleft Palate-Craniofac. J. 59, 1422-1427 (2021)

Purohit, M.R. ; Saikrishna, L. ; Verma, H.K. ; Bhaskar, L.V.K.S. ; Hussain, S.A.

Association between MTHFD1 1958G > A variant and non-syndromic cleft lip and palate: An updated meta-analysis.
PLoS Biol. 19:e3001490 (2021)

Kratzel, A. ; Kelly, J.N. ; V'kovski, P. ; Portmann, J. ; Brüggemann, Y. ; Todt, D. ; Ebert, N. ; Shrestha, N. ; Plattet, P. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; von Brunn, A.  ; Steinmann, E. ; Dijkman, R. ; Zimmer, G. ; Pfaender, S. ; Thiel, V.

A genome-wide CRISPR screen identifies interactors of the autophagy pathway as conserved coronavirus targets.
Sci. Adv. 7:eabb3673 (2021)

Gerckens, M. ; Schorpp, K.K. ; Pelizza, F. ; Wögrath, M. ; Reichau, K. ; Ma, H. ; Dworsky, A.-M. ; Sengupta, A. ; Stoleriu, M.-G. ; Heinzelmann, K. ; Merl-Pham, J. ; Irmler, M. ; Alsafadi, H.N. ; Trenkenschuh, E. ; Sarnova, L. ; Jirouskova, M. ; Frieß, W. ; Hauck, S.M. ; Beckers, J. ; Kneidinger, N. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Hadian, K. ; Lindner, M. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O. ; Gregor, M. ; Plettenburg, O. ; Yildirim, A.Ö. ; Burgstaller, G.

Phenotypic drug screening in a human fibrosis model identified a novel class of antifibrotic therapeutics.
Cells 10:3336 (2021)

Kammerl, I.E. ; Flexeder, C. ; Karrasch, S. ; Thorand, B. ; Heier, M. ; Peters, A. ; Schulz, H. ; Meiners, S.

Blood immunoproteasome activity is regulated by sex, age and in chronic inflammatory diseases: A first population-based study.

Marazioti, A. ; Krontira, A.C. ; Behrend, S.J. ; Giotopoulou, G.A. ; Ntaliarda, G. ; Blanquart, C. ; Bayram, H. ; Iliopoulou, M. ; Vreka, M. ; Trassl, L. ; Pepe, M. ; Hackl, C.M. ; Klotz, L.V. ; Weiss, S.A. ; Koch, I. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Wagner, D.E. ; Papadaki, H. ; Antimisiaris, S.G. ; Jean, D. ; Deshayes, S. ; Grégoire, M. ; Kayalar, ; Mortazavi, D. ; Dilege, ; Tanju, S. ; Erus, S. ; Yavuz, Ö. ; Bulutay, P. ; Fırat, P. ; Psallidas, I. ; Spella, M. ; Giopanou, I. ; Lilis, I. ; Lamort, A.-S. ; Stathopoulos, G.T.

KRAS signaling in malignant pleural mesothelioma.
Front. Psychiatr. 12:737440 (2021)

Chen, B. ; Yadav, M. ; Mulkalwar, M. ; Saikrishna, L. ; Verma, H.K. ; Ye, W. ; Bhaskar, L.V.K.S.

Meta-analysis on the association of neuropeptide Y rs16139 variant with the risk of alcoholism.

Behr, J. ; Prasse, A. ; Kreuter, M. ; Johow, J. ; Rabe, K.F. ; Bonella, F. ; Bonnet, R. ; Grohe, C. ; Held, M. ; Wilkens, H. ; Hammerl, P. ; Koschel, D. ; Blaas, S. ; Wirtz, H. ; Ficker, J.H. ; Neumeister, W. ; Schoenfeld, N. ; Claussen, M. ; Kneidinger, N. ; Frankenberger, M. ; Hummler, S. ; Kahn, N. ; Tello, S. ; Freise, J. ; Welte, T. ; Neuser, P. ; Guenther, A.

Pirfenidone in patients with progressive fibrotic interstitial lung diseases other than idiopathic pulmonary fibrosis (RELIEF): A double-blind, randomised, placebo-controlled, phase 2b trial.

Mastalerz, M. ; Dick, E. ; Chakraborty, A. ; Hennen, E. ; Schamberger, A.C. ; Schröppel, A. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Schmid, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Validation of in vitro models for smoke exposure of primary human bronchial epithelial cells.
Front. Pharmacol. 12:76420 (2021)

Farnoud, A. ; Tofighian, H. ; Baumann, I. ; Martin, A.R. ; Rashidi, M.M. ; Menden, M.P. ; Schmid, O.

Pulsatile bi-directional aerosol flow affects aerosol delivery to the intranasal olfactory region: A patient-specific computational study
PLoS Pathog. 17:e1009742 (2021)

Winheim, E. ; Rinke, L. ; Lutz, K. ; Reischer, A. ; Leutbecher, A. ; Wolfram, L. ; Rausch, L. ; Kranich, J. ; Wratil, P.R. ; Huber, J.E. ; Baumjohann, D. ; Rothenfußer, S. ; Schubert, B. ; Hilgendorff, A. ; Hellmuth, J.C. ; Scherer, C. ; Muenchhoff, M. ; von Bergwelt-Baildon, M. ; Stark, K. ; Straub, T. ; Brocker, T. ; Keppler, O.T. ; Subklewe, M. ; Krug, A.B.

Impaired function and delayed regeneration of dendritic cells in COVID-19.

Hoeper, M.M. ; Pausch, C. ; Olsson, K.M. ; Huscher, D. ; Pittrow, D. ; Grünig, E. ; Staehler, G. ; Vizza, C.D. ; Gall, H. ; Distler, O. ; Opitz, C. ; Gibbs, J.S.R. ; Delcroix, M. ; Ghofrani, H.A. ; Park, D.H. ; Ewert, R. ; Kaemmerer, H. ; Kabitz, H.J. ; Skowasch, D. ; Behr, J. ; Milger, K. ; Halank, M. ; Wilkens, H. ; Seyfarth, H.J. ; Held, M. ; Dumitrescu, D. ; Tsangaris, I. ; Vonk-Noordegraaf, A. ; Ulrich, S. ; Klose, H. ; Claussen, M. ; Lange, T.J. ; Rosenkranz, S.

COMPERA 2.0: A refined 4-strata risk assessment model for pulmonary arterial hypertension.

Danielsen, P.H. ; Bendtsen, K.M. ; Knudsen, K.B. ; Poulsen, S.S. ; Stöger, T. ; Vogel, U.

Nanomaterial- and shape-dependency of TLR2 and TLR4 mediated signaling following pulmonary exposure to carbonaceous nanomaterials in mice.
Front. Physiol. 12:751374 (2021)

Shao, T. ; Verma, H.K. ; Pande, B. ; Costanzo, V. ; Ye, W. ; Cai, Y. ; Bhaskar, L.V.K.S.

Physical activity and nutritional influence on immune function: An important strategy to improve immunity and health status.
Biochem. Pharmacol. 194, 114803 (2021)

Korkmaz, B. ; Lamort, A.-S. ; Domain, R. ; Beauvillain, C. ; Gieldon, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Stathopoulos, G.T. ; Rhimi, M. ; Jenne, D. ; Kettritz, R.

Cathepsin C inhibition as a potential treatment strategy in cancer.
Eur. Respir. Rev. 30:210122 (2021)

Behrend, S.J. ; Giotopoulou, G.A. ; Spella, M. ; Stathopoulos, G.T.

A role for club cells in smoking-associated lung adenocarcinoma.

Kammerl, I.E. ; Hardy, S. ; Flexeder, C. ; Urmann, A. ; Peierl, J. ; Wang, Y. ; Vosyka, O. ; Frankenberger, M. ; Milger, K. ; Behr, J. ; Koch, A. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Pilette, C. ; Schulz, H. ; Meiners, S.

Activation of immune cell proteasomes in peripheral blood of smokers and COPD patients - implications for therapy.

Schniering, J. ; Maciukiewicz, M. ; Gabryś, H.S. ; Brunner, M. ; Blüthgen, C. ; Meier, C. ; Braga-Lagache, S. ; Uldry, A.C. ; Heller, M. ; Guckenberger, M. ; Fretheim, H. ; Nakas, C.T. ; Hoffmann-Vold, A.M. ; Distler, O. ; Frauenfelder, T. ; Tanadini-Lang, S. ; Maurer, B.

Computed tomography-based radiomics decodes prognostic and molecular differences in interstitial lung disease related to systemic sclerosis.

Maan, Z.N. ; Rinkevich, Y. ; Barrera, J. ; Chen, K. ; Henn, D. ; Foster, D. ; Bonham, C.A. ; Padmanabhan, J. ; Sivaraj, D. ; Duscher, D. ; Hu, M. ; Yan, K. ; Januszyk, M. ; Longaker, M.T. ; Weissman, I.L. ; Gurtner, G.C.

Epidermal-derived hedgehog signaling drives mesenchymal proliferation during digit tip regeneration.
BMC Genom Data 22:36 (2021)

van der Vorst, E.P.C. ; Pepe, M. ; Peters, L.J.F. ; Haberbosch, M. ; Jansen, Y. ; Naumann, R. ; Stathopoulos, G.T. ; Weber, C. ; Bidzhekov, K.

Correction to: Transcriptome signature of miRNA-26b KO mouse model suggests novel targets.
Biomech. Model. Mechanobiol., DOI: 10.1007/s10237-021-01518-5 (2021)

Taheri, M.H. ; Pourmehran, O. ; Sarafraz, M.M. ; Ahookhosh, K. ; Farnoud, A. ; Cui, X.

Effect of swirling flow and particle-release pattern on drug delivery to human tracheobronchial airways.
JCI insight 6:e150862 (2021)

Kaiser, R. ; Leunig, A. ; Pekayvaz, K. ; Popp, O. ; Joppich, M. ; Polewka, V. ; Escaig, R. ; Anjum, A. ; Hoffknecht, M.L. ; Gold, C. ; Brambs, S. ; Engel, A. ; Stockhausen, S. ; Knottenberg, V. ; Titova, A. ; Haji, M. ; Scherer, C. ; Muenchhoff, M. ; Hellmuth, J.C. ; Saar, K. ; Schubert, B. ; Hilgendorff, A. ; Schulz, C. ; Kääb, S. ; Zimmer, R. ; Hübner, N. ; Massberg, S. ; Mertins, P. ; Nicolai, L. ; Stark, K.

Self-sustaining interleukin-8 loops drive a prothrombotic neutrophil phenotype in severe COVID-19.
Theranostics 11, 9342-9357 (2021)

Zhang, Y. ; Qian, Z. ; Jiang, D. ; Sun, Y. ; Gao, S. ; Jiang, X. ; Wang, H. ; Tao, J.

Neuromedin B receptor stimulation of Cav3.2 T-type Ca2+ channels in primary sensory neurons mediates peripheral pain hypersensitivity.
In:. 2021. 305-336 (Handb. Exp. Pharmacol. ; 269)

Hu, Y. ; Ciminieri, C. ; Hu, Q. ; Lehmann, M. ; Königshoff, M. ; Gosens, R.

WNT signalling in lung physiology and pathology.
Pediatr. Pulmonol., DOI: 10.1002/ppul.25626 (2021)

Förster, K. ; Roth, C.J. ; Hilgendorff, A. ; Ertl-Wagner, B. ; Flemmer, A.W. ; Wall, W.A.

In silico numerical simulation of ventilator settings during high-frequency ventilation in preterm infants.

Jacobsen, H. ; Walendy-Gnirß, K. ; Tekin-Bubenheim, N. ; Kouassi, N.M. ; Ben-Batalla, I. ; Berenbrok, N. ; Wolff, M. ; dos Reis, V.P. ; Zickler, M. ; Scholl, L. ; Gries, A. ; Jania, H. ; Kloetgen, A. ; Düsedau, A. ; Pilnitz-Stolze, G. ; Jeridi, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Stoeger, C. ; Hrabě de Angelis, M. ; Manuylova, T. ; Klingel, K. ; Culley, F.J. ; Behrends, J. ; Loges, S. ; Schneider, B. ; Krauss-Etschmann, S. ; Openshaw, P.J.M. ; Gabriel, G.

Offspring born to influenza A virus infected pregnant mice have increased susceptibility to viral and bacterial infections in early life.
J. Comput. Assist. Tomogr. 45, 959-963 (2021)

Spiro, J. ; Ceelen, F. ; Kneidinger, N. ; Sommer, W.H. ; Schinner, R. ; Dinkel, J. ; Hesse, N.

Structured reporting of computed tomography examinations in post-lung transplantation patients.
Clin. Transl. Allergy 11:e12049 (2021)

Mümmler, C. ; Dünzelmann, K. ; Kneidinger, N. ; Barnikel, M. ; Munker, D. ; Gröger, M. ; Canis, M. ; Behr, J. ; Koch, A. ; Haubner, F. ; Milger, K.

Real-life effectiveness of biological therapies on symptoms in severe asthma with comorbid CRSwNP.
Signal Transduct. Target. Ther. 6:287 (2021)

Conlon, T.M. ; Knolle, P.A. ; Yildirim, A.Ö.

Local tissue development of type 1 innate lymphoid cells: Guided by interferon-gamma.

Cosnier, F. ; Seidel, C. ; Valentino, S. ; Schmid, O. ; Bau, S. ; Vogel, U. ; Devoy, J. ; Gaté, L.

Retained particle surface area dose drives inflammation in rat lungs following acute, subacute, and subchronic inhalation of nanomaterials.

Fischer, D.S. ; Ansari, M. ; Wagner, K.I. ; Jarosch, S. ; Huang, Y. ; Mayr, C. ; Strunz, M. ; Lang, N.J. ; D'Ippolito, E. ; Hammel, M. ; Mateyka, L. ; Weber, S. ; Wolff, L.S. ; Witter, K. ; Fernandez, I.E. ; Leuschner, G. ; Milger, K. ; Frankenberger, M. ; Nowak, L. ; Heinig-Menhard, K. ; Koch, I. ; Stoleriu, M.-G. ; Hilgendorff, A. ; Behr, J. ; Pichlmair, A. ; Schubert, B. ; Theis, F.J. ; Busch, D.H. ; Schiller, H. B. ; Schober, K.

Single-cell RNA sequencing reveals ex vivo signatures of SARS-CoV-2-reactive T cells through 'reverse phenotyping'.
Infection, DOI: 10.1007/s15010-021-01669-8 (2021)

Munker, D. ; Veit, T. ; Barton, J. ; Mertsch, P. ; Mümmler, C. ; Osterman, A. ; Khatamzas, E. ; Barnikel, M. ; Hellmuth, J.C. ; Münchhoff, M. ; Walter, J. ; Ghiani, A. ; Munker, S. ; Dinkel, J. ; Behr, J. ; Kneidinger, N. ; Milger, K.

Pulmonary function impairment of asymptomatic and persistently symptomatic patients 4 months after COVID-19 according to disease severity.
Pneumologie 75, 960-970 (2021)

Stoleriu, M.-G. ; Gerckens, M. ; Stroh, K. ; Kovács, J. ; Samm, N. ; Obereisenbuchner, F. ; Hetrodt, J. ; Schmidt, F.M. ; Reinmuth, N. ; Heiß-Neumann, M. ; Stacher-Priehse, E. ; Koch, I. ; Behr, J. ; Ketscher, C. ; Grützner, U. ; Hatz, R.

Prevention of COVID-19 in thoracic surgery patients: Lessons learned during the first pandemic wave.
BMC Genom Data 22:23 (2021)

van der Vorst, E.P.C. ; Pepe, M. ; Peters, L.J.F. ; Haberbosch, M. ; Jansen, Y. ; Nauman, R. ; Stathopoulos, G.T. ; Weber, C. ; Bidzhekov, K.

Transcriptome signature of miRNA-26b KO mouse model suggests novel targets.
Cancer Res. 81, 3568-3579 (2021)

Schoeps, B. ; Eckfeld, C. ; Prokopchuk, O. ; Böttcher, J. ; Häußler, D. ; Steiger, K. ; Demir, I.E. ; Knolle, P. ; Soehnlein, O. ; Jenne, D. ; Hermann, C.D. ; Krüger, A.

Timp1 triggers neutrophil extracellular trap formation in pancreatic cancer.

Ahookhosh, K. ; Saidi, M. ; Mohammadpourfard, M. ; Aminfar, H. ; Hamishehkar, H. ; Farnoud, A. ; Schmid, O.

Flow structure and particle deposition analyses for optimization of a pressurized metered dose inhaler (pMDI) in a model of tracheobronchial airway.

Lu, K. ; Lai, K.P. ; Stöger, T. ; Ji, S. ; Lin, Z. ; Lin, X. ; Chan, T.F. ; Fang, J.K. ; Lo, M. ; Gao, L. ; Qiu, C. ; Chen, S. ; Chen, G. ; Li, L. ; Wang, L.

Detrimental effects of microplastic exposure on normal and asthmatic pulmonary physiology.
FEBS J. 289, 5034-5048 (2021)

Correa-Gallegos, D. ; Rinkevich, Y.

Cutting into wound repair.

Trueblood, M.B. ; Schmid, O. ; Altese, N. ; Hurst, C.J. ; Liu, W. ; Gelles, T. ; Achterberg, S.C. ; Whitefield, P.D. ; Hagen, D.E.

Calibration of gas flow meters using choked flow and an evacuated vessel.
Front. Med. 8:665152 (2021)

Sucre, J. ; Haist, L. ; Bolton, C.E. ; Hilgendorff, A.

Early changes and indicators characterizing lung aging in neonatal chronic lung disease.

Nathan, S.D. ; Cottin, V. ; Behr, J. ; Hoeper, M.M. ; Martinez, F.J. ; Corte, T.J. ; Keogh, A.M. ; Leuchte, H. ; Mogulkoc, N. ; Ulrich, S. ; Wuyts, W.A. ; Yao, Z. ; Ley-Zaporozhan, J. ; Mueller-Lisse, U.G. ; Scholle, F. ; Brueggenwerth, G. ; Busse, D. ; Nikkho, S. ; Wells, A.U.

Impact of lung morphology on clinical outcomes with riociguat in patients with pulmonary hypertension and idiopathic interstitial pneumonia: A post hoc subgroup analysis of the RISE-IIP study.
Oncotarget 12, 1057-1071 (2021)

Colarusso, C. ; Terlizzi, M. ; Lamort, A.-S. ; Cerqua, I. ; Roviezzo, F. ; Stathopoulos, G.T. ; Pinto, A. ; Sorrentino, R.

Caspase-11 and AIM2 inflammasome are involved in smoking-induced COPD and lung adenocarcinoma.
Br. J. Pharmacol. 178, 4026-4041 (2021)

Costa, R. ; Wagner, D.E. ; Doryab, A. ; De Santis, M.M. ; Schorpp, K.K. ; Rothenaigner, I. ; Lehmann, M. ; Baarsma, H.A. ; Liu, X. ; Schmid, O. ; Campillos, M.J. ; Yildirim, A.Ö. ; Hadian, K. ; Königshoff, M.

A drug screen with approved compounds identifies amlexanox as a novel Wnt/β-catenin activator inducing lung epithelial organoid formation.
Front. Med. 8:593874 (2021)

Onursal, C. ; Dick, E. ; Angelidis, I. ; Schiller, H. B. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Collagen biosynthesis, processing, and maturation in lung ageing.
Immunol. Rev. 302, 147-162 (2021)

Correa-Gallegos, D. ; Jiang, D. ; Rinkevich, Y.

Fibroblasts as confederates of the immune system.
Clin. Chest Med. 42, 365-373 (2021)

Lehmann, M. ; Königshoff, M.

Regenerative medicine and the hope for a cure.
In: Myofibroblasts. 2021. 447-456 (Methods Mol. Biol. ; 2299)

Burgstaller, G. ; Gerckens, M. ; Eickelberg, O. ; Königshoff, M.

Decellularized human lung scaffolds as complex three-dimensional tissue culture models to study functional behavior of fibroblasts.

Esteve-Codina, A. ; Hofer, T.P. ; Burggraf, D. ; Heiss-Neumann, M.S. ; Gesierich, W. ; Boland, A. ; Olaso, R. ; Bihoreau, M.T. ; Deleuze, J.F. ; Möller, W. ; Schmid, O. ; Soler Artigas, M. ; Renner, K. ; Hohlfeld, J.M. ; Welte, T. ; Fuehner, T. ; Jerrentrup, L. ; Koczulla, A.R. ; Greulich, T. ; Prasse, A. ; Müller-Quernheim, J. ; Gupta, S. ; Brightling, C. ; Subramanian, D.R. ; Parr, D.G. ; Kolsum, U. ; Gupta, V. ; Barta, I. ; Döme, B. ; Strausz, J. ; Stendardo, M. ; Piattella, M. ; Boschetto, P. ; Korzybski, D. ; Gorecka, D. ; Nowinski, A. ; Dabad, M. ; Fernández-Callejo, M. ; Endesfelder, D. ; zu Castell, W. ; Hiemstra, P.S. ; Venge, P. ; Nößner, E. ; Griebel, T. ; Heath, S. ; Singh, D. ; Gut, I. ; Ziegler-Heitbrock, L.

Gender specific airway gene expression in COPD sub-phenotypes supports a role of mitochondria and of different types of leukocytes.
Curr. Opin. Genet. Dev. 70, 7-14 (2021)

Jiang, D. ; Rinkevich, Y.

Distinct fibroblasts in scars and regeneration.
STAR Protoc. 2:100526 (2021)

Yazgili, A.S. ; Meul, T. ; Welk, V. ; Semren, N. ; Kammerl, I.E. ; Meiners, S.

In-gel proteasome assay to determine the activity, amount, and composition of proteasome complexes from mammalian cells or tissues.
Immunohorizons 5, 273-283 (2021)

Mackowiak, C. ; Marchiol, T. ; Paljetak, H.C. ; Fauconnier, L. ; Palomo, J. ; Secher, T. ; Panek, C. ; Sedda, D. ; Savigny, F. ; Erard, F. ; Bragonzi, A. ; Huaux, F. ; Stöger, T. ; Schiller, H. B. ; Sirard, J.C. ; Le Bert, M. ; Couillin, I. ; Quesniaux, V.F.J. ; Togbe, D. ; Ryffel, B.

Chronic Pseudomonas aeruginosa lung infection is IL-1R independent, but relies on MyD88 signaling.
Clin. Imaging 79, 96-101 (2021)

Stoleriu, M.-G. ; Gerckens, M. ; Obereisenbuchner, F. ; Zaimova, I. ; Hetrodt, J. ; Mavi, S.C. ; Schmidt, F. ; Schoenlebe, A.A. ; Heinig-Menhard, K. ; Koch, I. ; Jörres, R.A. ; Spiro, J. ; Nowak, L. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Gesierich, W. ; Heiß-Neumann, M. ; Dinkel, J.

Automated quantitative thin slice volumetric low dose CT analysis predicts disease severity in COVID-19 patients.

Lutter, J. ; Jörres, R.A. ; Trudzinski, F.C. ; Alter, P. ; Kellerer, C. ; Watz, H. ; Welte, T. ; Bals, R. ; Kauffmann-Guerrero, D. ; Behr, J. ; Holle, R. ; F Vogelmeier, C. ; Kahnert, K.

Treatment of COPD Groups GOLD A and B with inhaled corticosteroids in the COSYCONET cohort - determinants and consequences.
Nat. Cell Biol. 23, 566-576 (2021)

Böttcher, A. ; Büttner, M. ; Tritschler, S. ; Sterr, M. ; Aliluev, A. ; Oppenländer, L. ; Burtscher, I. ; Sass, S. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Ziegenhain, C. ; Enard, W. ; Schamberger, A.C. ; Verhamme, F.M. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Lickert, H.

Author Correction: Non-canonical Wnt/PCP signalling regulates intestinal stem cell lineage priming towards enteroendocrine and Paneth cell fates.

Eberherr, A.C. ; Maaske, A. ; Wolf, C. ; Giesert, F. ; Berutti, R. ; Rusha, E. ; Pertek, A. ; Kastlmeier, M.T. ; Voss, C. ; Plummer, M. ; Sayed, A. ; Graf, E. ; Effner, R. ; Volz, T. ; Drukker, M. ; Strom, T.M. ; Meitinger, T. ; Stöger, T. ; Buyx, A.M. ; Hagl, B. ; Renner, E.D.

Rescue of STAT3 function in hyper-IgE syndrome using adenine base editing.

Macrini, C. ; Gerhards, R. ; Winklmeier, S. ; Bergmann, L. ; Mader, S. ; Spadaro, M. ; Vural, A. ; Smolle, M. ; Hohlfeld, R. ; Kümpfel, T. ; Lichtenthaler, S.F. ; Franquelim, H.G. ; Jenne, D. ; Meinl, E.

Features of MOG required for recognition by patients with MOG antibody-associated disorders.
Endocr. Relat. Cancer 28, 213-224 (2021)

Stauffer, E. ; Weber, P. ; Heider, T. ; Dalke, C. ; Blutke, A. ; Walch, A.K. ; Burgstaller, G. ; Brix, N. ; Lauber, K. ; Zitzelsberger, H. ; Unger, K. ; Selmansberger, M.

Transcriptomic landscape of radiation-induced murine thyroid proliferative lesions.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 65, 22-29 (2021)

Hynds, R.E. ; Zacharias, W.J. ; Nikolić, M.Z. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O. ; Gosens, R. ; de Coppi, P. ; Janes, S.M. ; Morrisey, E. ; Clevers, H. ; Ryan, A.L. ; Stripp, B.R. ; Sun, X. ; Kim, C.F. ; Lin, Q.S.

National heart, lung and blood institute and building respiratory epithelium and tissue for health (BREATH) consortium workshop report: Moving forward in lung regeneration.
EMBO Mol. Med. 13:e12871 (2021)

Mayr, C. ; Simon, L. ; Leuschner, G. ; Ansari, M. ; Schniering, J. ; Geyer, P.E. ; Angelidis, I. ; Strunz, M. ; Singh, P. ; Kneidinger, N. ; Reichenberger, F. ; Silbernagel, E. ; Böhm, S. ; Adler, H. ; Lindner, M. ; Maurer, B. ; Hilgendorff, A. ; Prasse, A. ; Behr, J. ; Mann, M. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.

Integrative analysis of cell state changes in lung fibrosis with peripheral protein biomarkers.
Nature 589, E6 (2021)

Conlon, T.M. ; John-Schuster, G. ; Heide, D. ; Pfister, D. ; Lehmann, M. ; Hu, Y. ; Ertüz, Z. ; López, M.A. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Mayr, C. ; Angelidis, I. ; Ciminieri, C. ; Costa, R. ; Kohlhepp, M.S. ; Guillot, A. ; Güneş, G. ; Jeridi, A. ; Funk, M.C. ; Beroshvili, G. ; Prokosch, S. ; Hetzer, J. ; Verleden, S.E. ; Alsafadi, H.N. ; Lindner, M. ; Burgstaller, G. ; Becker, L. ; Irmler, M. ; Dudek, M. ; Janzen, J. ; Goffin, E. ; Gosens, R. ; Knolle, P. ; Pirotte, B. ; Stöger, T. ; Beckers, J. ; Wagner, D.E. ; Singh, I. ; Theis, F.J. ; Hrabě de Angelis, M. ; O’Connor, T. ; Tacke, F. ; Boutros, M. ; Dejardin, E. ; Eickelberg, O. ; Schiller, H. B. ; Königshoff, M. ; Heikenwalder, M. ; Yildirim, A.Ö.

Publisher Correction: Inhibition of LTβR signalling activates WNT-induced regeneration in lung (Nature, (2020), 588, 7836, (151-156), 10.1038/s41586-020-2882-8).

Doryab, A. ; Taskin, M.B. ; Stahlhut, P. ; Schröppel, A. ; Orak, S. ; Voss, C. ; Ahluwalia, A. ; Rehberg, M. ; Hilgendorff, A. ; Stöger, T. ; Groll, J. ; Schmid, O.

A bioinspired in vitro lung model to study particokinetics of nano-/microparticles under cyclic stretch and air-liquid interface conditions.
BMC Cancer 21:139 (2021)

Wenter, V. ; Albert, N.L. ; Ahmaddy, F. ; Unterrainer, M. ; Hornung, J. ; Ilhan, H. ; Bartenstein, P. ; Spitzweg, C. ; Kneidinger, N. ; Todica, A.

The diagnostic challenge of coexistent sarcoidosis and thyroid cancer - a retrospective study.
Int. J. Mol. Sci. 22:1658 (2021)

Weiss, S.A. ; Rehm, S.R.T. ; Perera, N.C. ; Biniossek, M.L. ; Schilling, O. ; Jenne, D.

Origin and expansion of the serine protease repertoire in the myelomonocyte lineage.
Matrix biol. 97, 58-71 (2021)

Wan, L. ; Jiang, D. ; Correa-Gallegos, D. ; Ramesh, P. ; Zhao, J. ; Ye, H. ; Zhu, S. ; Wannemacher, J. ; Volz, T. ; Rinkevich, Y.

Connexin43 gap junction drives fascia mobilization and repair of deep skin wounds.
Cancers 13:384 (2021)

Spella, M. ; Stathopoulos, G.T.

Immune resistance in lung adenocarcinoma.
Cancers 13:208 (2021)

Brunn, D. ; Turkowski, K. ; Günther, S. ; Weigert, A. ; Muley, T. ; Kriegsmann, M. ; Winter, H. ; Dammann, R.H. ; Stathopoulos, G.T. ; Thomas, M. ; Guenther, A. ; Grimminger, F. ; Pullamsetti, S.S. ; Seeger, W. ; Savai, R.

Interferon regulatory factor 9 promotes lung cancer progression via regulation of versican.
Nat. Med. 27, 546–559 (2021)

Muus, C. ; Luecken, M. ; Eraslan, G. ; Sikkema, L. ; Waghray, A. ; Heimberg, G. ; Kobayashi, Y. ; Vaishnav, E.D. ; Subramanian, A. ; Smillie, C. ; Jagadeesh, K.A. ; Duong, E.T. ; Fiskin, E. ; Triglia, E.T. ; Ansari, M. ; Cai, P. ; Lin, B. ; Buchanan, J. ; Chen, S. ; Shu, J. ; Haber, A.L. ; Chung, H. ; Montoro, D.T. ; Adams, T. ; Aliee, H. ; Allon, S.J. ; Andrusivova, Z. ; Angelidis, I. ; Ashenberg, O. ; Bassler, K. ; Bécavin, C. ; Benhar, I. ; Bergenstråhle, J. ; Bergenstråhle, L. ; Bolt, L. ; Braun, E. ; Bui, L.T. ; Callori, S. ; Chaffin, M. ; Chichelnitskiy, E. ; Chiou, J. ; Conlon, T.M. ; Cuoco, M.S. ; Cuomo, A.S.E. ; Deprez, M. ; Duclos, G. ; Fine, D. ; Fischer, D.S. ; Ghazanfar, S. ; Gillich, A. ; Giotti, B. ; Gould, J. ; Guo, M. ; Gutierrez, A.J. ; Habermann, A.C. ; Harvey, T. ; He, P. ; Hou, X. ; Hu, L. ; Hu, Y. ; Jaiswal, A. ; Ji, L. ; Jiang, P. ; Kapellos, T.S. ; Kuo, C.S. ; Larsson, L. ; Leney-Greene, M.A. ; Lim, K. ; Litviňuková, M. ; Ludwig, L.S. ; Lukassen, S. ; Luo, W. ; Maatz, H. ; Madissoon, E. ; Mamanova, L. ; Manakongtreecheep, K. ; Leroy, S. ; Mayr, C. ; Mbano, I.M. ; McAdams, A.M. ; Nabhan, A.N. ; Nyquist, S.K. ; Penland, L. ; Poirion, O.B. ; Poli, S. ; Qi, C. ; Queen, R. ; Reichart, D. ; Rosas, I. ; Schupp, J.C. ; Shea, C.V. ; Shi, X. ; Sinha, R. ; Sit, R.V. ; Slowikowski, K. ; Slyper, M. ; Smith, N.P. ; Sountoulidis, A. ; Strunz, M. ; Sullivan, T.B. ; Sun, D. ; Talavera-López, C. ; Tan, P. ; Tantivit, J. ; Travaglini, K.J. ; Tucker, N.R. ; Vernon, K.A. ; Wadsworth, M.H. ; Waldman, J. ; Wang, X. ; Xu, K. ; Yan, W. ; Zhao, W. ; Ziegler, C.G.K.

Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tissues and demographics.
Nat. Cell Biol. 23, 23-31 (2021)

Böttcher, A. ; Büttner, M. ; Tritschler, S. ; Sterr, M. ; Aliluev, A. ; Oppenländer, L. ; Burtscher, I. ; Sass, S. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Ziegenhain, C. ; Enard, W. ; Schamberger, A.C. ; Verhamme, F.M. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Lickert, H.

Non-canonical Wnt/PCP signalling regulates intestinal stem cell lineage priming towards enteroendocrine and Paneth cell fates.
J. Proteome Res. 20, 751-762 (2021)

Petrera, A. ; von Toerne, C. ; Behler, J. ; Huth, C. ; Thorand, B. ; Hilgendorff, A. ; Hauck, S.M.

Multiplatform approach for plasma proteomics: Complementarity of olink proximity extension assay technology to mass spectrometry-based protein profiling.
Chem 7, 480-494 (2021)

von Schirnding, C. ; Giopanou, I. ; Hermawan, A. ; Wehl, L. ; Ntaliarda, G. ; Illes, R. ; Datz, S. ; Geisslinger, F. ; Bartel, K. ; Sommer, A.-K. ; Lianou, M. ; Weiß, V. ; Feckl, J. ; Vollmar, A.M. ; Bräuchle, C. ; Stathopoulos, G.T. ; Wagner, E. ; Roidl, A. ; Bein, T. ; Engelke, H.

Synergistic combination of calcium and citrate in mesoporous nanoparticles targets pleural tumors.
Adv. Mater. 33:2005476 (2021)

De Santis, M. ; Alsafadi, H.N. ; Tas, S. ; Bölükbas, D.A. ; Prithiviraj, S. ; Da Silva, I.A.N. ; Mittendorfer, M. ; Ota, C. ; Stegmayr, J. ; Daoud, F. ; Königshoff, M. ; Swärd, K. ; Wood, J.A. ; Tassieri, M. ; Bourgine, P.E. ; Lindstedt, S. ; Mohlin, S. ; Wagner, D.E.

Extracellular-matrix-reinforced bioinks for 3D bioprinting human tissue.
Biotechnol. Bioeng. 118, 690-702 (2021)

Cei, D. ; Doryab, A. ; Lenz, A.-G. ; Schröppel, A. ; Mayer, P. ; Burgstaller, G. ; Nossa, R. ; Ahluwalia, A. ; Schmid, O.

Development of a dynamic in vitro stretch model of the alveolar interface with aerosol delivery.

Behr, J. ; Nathan, S.D. ; Wuyts, W.A. ; Mogulkoc Bishop, N. ; Bouros, D.E. ; Antoniou, K. ; Guiot, J. ; Kramer, M.R. ; Kirchgaessler, K.U. ; Bengus, M. ; Gilberg, F. ; Perjesi, A. ; Harari, S. ; Wells, A.U.

Efficacy and safety of sildenafil added to pirfenidone in patients with advanced idiopathic pulmonary fibrosis and risk of pulmonary hypertension: A double-blind, randomised, placebo-controlled, phase 2b trial.
J. Allergy Clin. Immunol. 147, 1041-1048 (2021)

Lodge, C.J. ; Lowe, A.J. ; Milanzi, E. ; Bowatte, G. ; Abramson, M.J. ; Tsimiklis, H. ; Axelrad, C. ; Robertson, B. ; Darling, A.E. ; Svanes, C. ; Wjst, M. ; Dharmage, S.C. ; Bode, L.

Human milk oligosaccharide profiles and allergic disease up to 18 years.
ERJ Open Res. 6:00350-2019 (2020)

Ubags, N.D. ; Baker, J. ; Boots, A. ; Costa, R. ; El-Merhie, N. ; Fabre, A. ; Faiz, A. ; Heijink, I.H. ; Hiemstra, P.S. ; Lehmann, M. ; Meiners, S. ; Rolandsson Enes, S. ; Bartel, S.

ERS International Congress, Madrid, 2019: Highlights from the basic and translational science assembly.

Bölükbas, D.A. ; Datz, S. ; Meyer-Schwickerath, C. ; Morrone, C. ; Doryab, A. ; Gößl, D. ; Vreka, M. ; Yang, L. ; Argyo, C. ; van Rijt, S.H. ; Lindner, M. ; Eickelberg, O. ; Stöger, T. ; Schmid, O. ; Lindstedt, S. ; Stathopoulos, G.T. ; Bein, T. ; Wagner, D.E. ; Meiners, S.

Organ‐restricted vascular delivery of nanoparticles for lung cancer therapy.
Adv. Func. Mat., DOI: 10.1002/adfm.202004707 (2020)

Doryab, A. ; Taskin, M.B. ; Stahlhut, P. ; Schröppel, A. ; Wagner, D.E. ; Groll, J. ; Schmid, O.

A biomimetic, copolymeric membrane for cell-stretch experiments with pulmonary epithelial cells at the air-liquid interface.

Leuschner, G. ; Klotsche, J. ; Kreuter, M. ; Prasse, A. ; Wirtz, H. ; Pittrow, D. ; Frankenberger, M. ; Behr, J. ; Kneidinger, N.

Idiopathic pulmonary fibrosis in elderly patients: Analysis of the INSIGHTS-IPF Observational Study.
Eur. Respir. J. 57, DOI: 10.1183/13993003.01416-2020 (2020)

Morrone, C. ; Smirnova, N.F. ; Jeridi, A. ; Kneidinger, N. ; Hollauer, C. ; Schupp, J.C. ; Kaminski, N. ; Jenne, D. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Cathepsin B promotes collagen biosynthesis driving Bronchiolitis Obliterans Syndrome.
Ann. Thorac. Surg. 110, e461-e463 (2020)

Stoleriu, M.-G. ; Gerckens, M. ; Hetrodt, J. ; Heiß-Neumann, M. ; Koch, I. ; Stacher-Priehse, E. ; Dinkel, J. ; Behr, J. ; Grützner, U. ; Hatz, R.

Clinical course of three postoperative symptomatic COVID-19 cases in patients after lung lobectomy.
Int. J. Chron. Obstruct. Pulmon. Dis. 15, 2787-2798 (2020)

Lutter, J. ; Jörres, R.A. ; Welte, T. ; Watz, H. ; Waschki, B. ; Alter, P. ; Trudzinski, F.C. ; Ohlander, J. ; Behr, J. ; Bals, R. ; Studnicka, M. ; Holle, R. ; Vogelmeier, C.F. ; Kahnert, K.

Impact of education on COPD severity and all-cause mortality in lifetime never-smokers and longtime ex-smokers: Results of the COSYCONET cohort.

Umkehrer, S. ; Morrone, C. ; Dinkel, J. ; Aigner, L. ; Reiser, M.F. ; Herzen, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Pfeiffer, F. ; Hellbach, K.

A proof-of principal study using phase-contrast imaging for the detection of large airway pathologies after lung transplantation.

Hoeper, M.M. ; Pausch, C. ; Grünig, E. ; Klose, H. ; Staehler, G. ; Huscher, D. ; Pittrow, D. ; Olsson, K.M. ; Vizza, C.D. ; Gall, H. ; Benjamin, N. ; Distler, O. ; Opitz, C. ; Gibbs, J.S.R. ; Delcroix, M. ; Ghofrani, H.A. ; Rosenkranz, S. ; Ewert, R. ; Kaemmerer, H. ; Lange, T.J. ; Kabitz, H.J. ; Skowasch, D. ; Skride, A. ; Jureviciene, E. ; Paleviciute, E. ; Miliauskas, S. ; Claussen, M. ; Behr, J. ; Milger, K. ; Halank, M. ; Wilkens, H. ; Wirtz, H. ; Pfeuffer-Jovic, E. ; Harbaum, L. ; Scholtz, W. ; Dumitrescu, D. ; Bruch, L. ; Coghlan, G. ; Neurohr, C. ; Tsangaris, I. ; Gorenflo, M. ; Scelsi, L. ; Vonk-Noordegraaf, A. ; Ulrich, S. ; Held, M.

Idiopathic pulmonary arterial hypertension phenotypes determined by cluster analysis from the COMPERA registry.
Eur. Respir. Rev. 29:200222 (2020)

Melo-Narváez, C. ; Stegmayr, J. ; Wagner, D.E. ; Lehmann, M.

Lung regeneration: Implications of the diseased niche and ageing.

Veit, T. ; Barnikel, M. ; Crispin, A. ; Kneidinger, N. ; Ceelen, F. ; Arnold, P. ; Munker, D. ; Schmitzer, M. ; Barton, J. ; Schiopu, S. ; Schiller, H. B. ; Frankenberger, M. ; Milger, K. ; Behr, J. ; Neurohr, C. ; Leuschner, G.

Variability of forced vital capacity in progressive interstitial lung disease: A prospective observational study.

Jiang, D. ; Christ, S. ; Correa-Gallegos, D. ; Ramesh, P. ; Kalgudde Gopal, S. ; Wannemacher, J. ; Mayr, C. ; Lupperger, V. ; Yu, Q. ; Ye, H. ; Mück-Häusl, M. ; Rajendran, V. ; Wan, L. ; Liu, J. ; Mirastschijski, U. ; Volz, T. ; Marr, C. ; Schiller, H. B. ; Rinkevich, Y.

Injury triggers fascia fibroblast collective cell migration to drive scar formation through N-cadherin.
Nature 588, 151–156 (2020)

Conlon, T.M. ; John-Schuster, G. ; Heide, D. ; Pfister, D. ; Lehmann, M. ; Hu, Y. ; Ertüz, Z. ; López, M.A. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Mayr, C. ; Ciminieri, C. ; Costa, R. ; Kohlhepp, M.S. ; Guillot, A. ; Güneş, G. ; Jeridi, A. ; Funk, M.C. ; Beroshvili, G. ; Prokosch, S. ; Hetzer, J. ; Verleden, S.E. ; Alsafadi, H.N. ; Lindner, M. ; Burgstaller, G. ; Becker, L. ; Irmler, M. ; Dudek, M. ; Janzen, J. ; Goffin, E. ; Gosens, R. ; Knolle, P. ; Pirotte, B. ; Stöger, T. ; Beckers, J. ; Wagner, D.E. ; Singh, I. ; Theis, F.J. ; Hrabě de Angelis, M. ; O’Connor, T. ; Tacke, F. ; Boutros, M. ; Dejardin, E. ; Eickelberg, O. ; Schiller, H. B. ; Königshoff, M. ; Heikenwalder, M. ; Yildirim, A.Ö.

Inhibition of LTβR signalling activates WNT-induced regeneration in lung.
Respir. Med. 175:106194 (2020)

Kirsch, F. ; Schramm, A. ; Kurz, C.F. ; Schwarzkopf, L. ; Lutter, J. ; Huber, M.B. ; Leidl, R.

Effect of BMI on health care expenditures stratified by COPD GOLD severity grades: Results from the LQ-DMP study.
Thorax 75, 1004-1008 (2020)

Kanellakis, N.I. ; Asciak, R. ; Hamid, M.A. ; Yao, X. ; McCole, M. ; McGowan, S. ; Seraia, E. ; Hatch, S. ; Hallifax, R.J. ; Mercer, R.M. ; Bedawi, E.O. ; Jones, S. ; Verrill, C. ; Dobson, M. ; George, V. ; Stathopoulos, G.T. ; Peng, Y. ; Ebner, D. ; Dong, T. ; Rahman, N.M. ; Psallidas, I.

Patient-derived malignant pleural mesothelioma cell cultures: A tool to advance biomarker-driven treatments.
Phys. Fluids 32:101905 (2020)

Farnoud, A. ; Tofighian, H. ; Baumann, I. ; Garcia, G.J.M. ; Schmid, O. ; Gutheil, E. ; Rashidi, M.M.

Large eddy simulations of airflow and particle deposition in pulsating bi-directional nasal drug delivery.
Adv. Healthc. Mater. 9:2000918 (2020)

Erben, A. ; Hörning, M. ; Hartmann, B. ; Becke, T. ; Eisler, S.A. ; Southan, A. ; Cranz, S. ; Hayden, O. ; Kneidinger, N. ; Königshoff, M. ; Lindner, M. ; Tovar, G.E.M. ; Burgstaller, G. ; Clausen-Schaumann, H. ; Sudhop, S. ; Heymann, M.

Precision 3D-printed cell scaffolds mimicking native tissue composition and mechanics.
JCI insight 5:e134464 (2020)

Weber, J. ; Rajan, S. ; Schremmer, C. ; Chao, Y.K. ; Krasteva-Christ, G. ; Kannler, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Brosien, M. ; Schredelseker, J. ; Weissmann, N. ; Grimm, C. ; Gudermann, T. ; Dietrich, A.

TRPV4 channels are essential for alveolar epithelial barrier function as protection from lung edema.
Health Qual. Life Outcomes 18:334 (2020)

Maqhuzu, P.N. ; Szentes, B.L. ; Kreuter, M. ; Bahmer, T. ; Kahn, N. ; Claussen, M. ; Holle, R. ; Schwarzkopf, L.

Determinants of health-related quality of life decline in interstitial lung disease.
Adv. Mater. 32:e2003913 (2020)

Kokot, H. ; Kokot, B. ; Sebastijanović, A. ; Voss, C. ; Podlipec, R. ; Zawilska, P. ; Berthing, T. ; Ballester-Lopez, C. ; Danielsen, P.H. ; Contini, C. ; Ivanov, M. ; Krišelj, A. ; Čotar, P. ; Zhou, Q. ; Ponti, J. ; Zhernovkov, V. ; Schneemilch, M. ; Doumandji, Z. ; Pušnik, M. ; Umek, P. ; Pajk, S. ; Joubert, O. ; Schmid, O. ; Urbančič, I. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Lobaskin, V. ; Halappanavar, S. ; Quirke, N. ; Lyubartsev, A.P. ; Vogel, U. ; Koklič, T. ; Stöger, T. ; Štrancar, J.

Prediction of chronic inflammation for inhaled particles: The impact of material cycling and quarantining in the lung epithelium.
J. Allergy Clin. Immunol. Pract. 9, 1177-1185.e4 (2020)

Mümmler, C. ; Munker, D. ; Barnikel, M. ; Veit, T. ; Kayser, M. ; Welte, T. ; Behr, J. ; Kneidinger, N. ; Suhling, H. ; Milger, K.

Dupilumab improves asthma control and lung function in patients with insufficient outcome during previous antibody therapy.

Behr, J. ; Prasse, A. ; Wirtz, H. ; Koschel, D. ; Pittrow, D. ; Held, M. ; Klotsche, J. ; Andreas, S. ; Claussen, M. ; Grohe, C. ; Wilkens, H. ; Hagmeyer, L. ; Skowasch, D. ; Meyer, J.F. ; Kirschner, J. ; Glaeser, S. ; Kahn, N. ; Welte, T. ; Neurohr, C. ; Schwaiblmair, M. ; Bahmer, T. ; Oqueka, T. ; Frankenberger, M. ; Kreuter, M.

Survival and course of lung function in the presence or absence of antifibrotic treatment in patients with idiopathic pulmonary fibrosis: Long-term results of the INSIGHTS-IPF registry.

Munkhbaatar, E. ; Dietzen, M. ; Agarwal, D. ; Anton, M. ; Jesinghaus, M. ; Boxberg, M. ; Pfarr, N. ; Bidola, P. ; Uhrig, S. ; Höckendorf, U. ; Meinhardt, A.L. ; Wahida, A. ; Heid, I. ; Braren, R. ; Mishra, R. ; Warth, A. ; Muley, T. ; Poh, P.S.P. ; Wang, X. ; Fröhling, S. ; Steiger, K. ; Slotta-Huspenina, J. ; van Griensven, M. ; Pfeiffer, F. ; Lange, S. ; Rad, R. ; Spella, M. ; Stathopoulos, G.T. ; Ruland, J. ; Bassermann, F. ; Weichert, W. ; Strasser, A. ; Branca, C. ; Heikenwalder, M. ; Swanton, C. ; McGranahan, N. ; Jost, P.J.

MCL-1 gains occur with high frequency in lung adenocarcinoma and can be targeted therapeutically.
Radiat. Oncol. 15:214 (2020)

Käsmann, L. ; Dietrich, A. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Manapov, F. ; Behr, J. ; Rimner, A. ; Jeremic, B. ; Senan, S. ; De Ruysscher, D. ; Lauber, K. ; Belka, C.

Radiation-induced lung toxicity - cellular and molecular mechanisms of pathogenesis, management, and literature review.
Respir. Med. 172:106117 (2020)

Kahnert, K. ; Jörres, R.A. ; Kauczor, H.U. ; Biederer, J. ; Jobst, B. ; Alter, P. ; Biertz, F. ; Mertsch, P. ; Lucke, T. ; Lutter, J. ; Trudzinski, F.C. ; Behr, J. ; Bals, R. ; Watz, H. ; Vogelmeier, C.F. ; Welte, T.

Relationship between clinical and radiological signs of bronchiectasis in COPD patients: Results from COSYCONET.
Eur. Respir. Rev. 29:200126 (2020)

Korfei, M. ; MacKenzie, B. ; Meiners, S.

The ageing lung under stress.

Strunz, M. ; Simon, L. ; Ansari, M. ; Kathiriya, J.J. ; Angelidis, I. ; Mayr, C. ; Tsidiridis, G. ; Lange, M. ; Mattner, L. ; Yee, M. ; Ogar, P. ; Sengupta, A. ; Kukhtevich, I. ; Schneider, R. ; Zhao, Z. ; Voss, C. ; Stöger, T. ; Neumann, J.H.L. ; Hilgendorff, A. ; Behr, J. ; O'Reilly, M. ; Lehmann, M. ; Burgstaller, G. ; Königshoff, M. ; Chapman, H.A. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.

Alveolar regeneration through a Krt8+transitional stem cell state that persists in human lung fibrosis.
2020 in
München, Ludwig Maximilian Universität, Medizinische Fakultät, Diss., 2020, 144 S.

Arendt, K.A.M.

An in vivo inflammatory loop potentiates KRAS blockade.
Cell Rep. 32:108059 (2020)

Meul, T. ; Berschneider, K. ; Schmitt, S. ; Mayr, C. ; Mattner, L. ; Schiller, H. B. ; Yazgili, A.S. ; Wang, X. ; Lukas, C. ; Schlesser, C. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Graf, E. ; Schwarzmayr, T. ; Perocchi, F. ; Kukat, A. ; Trifunovic, A. ; Kremer, L.S. ; Prokisch, H. ; Popper, B. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Zischka, H. ; Meiners, S.

Mitochondrial regulation of the 26S proteasome.

Jarosch, I. ; Schneeberger, T. ; Gloeckl, R. ; Kreuter, M. ; Frankenberger, M. ; Neurohr, C. ; Prasse, A. ; Freise, J. ; Behr, J. ; Hitzl, W. ; Koczulla, A.R. ; Kenn, K.

Short-term effects of comprehensive pulmonary rehabilitation and its maintenance in patients with idiopathic pulmonary fibrosis: A randomized controlled trial.
Sci. Adv. 6:eaaz6105 (2020)

Sarode, P. ; Zheng, X. ; Giotopoulou, G.A. ; Weigert, A. ; Kuenne, C. ; Günther, S. ; Friedrich, A. ; Gattenlöhner, S. ; Stiewe, T. ; Brüne, B. ; Grimminger, F. ; Stathopoulos, G.T. ; Pullamsetti, S.S. ; Seeger, W. ; Savai, R.

Reprogramming of tumor-associated macrophages by targeting β-catenin/FOSL2/ARID5A signaling: A potential treatment of lung cancer.

Nikou, S. ; Arbi, M. ; Dimitrakopoulos, F.D. ; Sirinian, C. ; Chadla, P. ; Pappa, I. ; Ntaliarda, G. ; Stathopoulos, G.T. ; Papadaki, H. ; Zolota, V. ; Lygerou, Z. ; Kalofonos, H.P. ; Bravou, V.

Integrin-linked kinase (ILK) regulates KRAS, IPP complex and Ras suppressor-1 (RSU1) promoting lung adenocarcinoma progression and poor survival.

Fischer, A. ; Koopmans, T. ; Ramesh, P. ; Christ, S. ; Strunz, M. ; Wannemacher, J. ; Aichler, M. ; Feuchtinger, A. ; Walch, A.K. ; Ansari, M. ; Theis, F.J. ; Schorpp, K.K. ; Hadian, K. ; Neumann, P.A. ; Schiller, H. B. ; Rinkevich, Y.

Post-surgical adhesions are triggered by calcium-dependent membrane bridges between mesothelial surfaces.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 62, 681-691 (2020)

Alsafadi, H.N. ; Uhl, F.E. ; Pineda, R.H. ; Bailey, K.E. ; Rojas, M. ; Wagner, D.E. ; Königshoff, M.

Applications and approaches for three-dimensional precision-cut lung slices disease modeling and drug discovery.

Szentes, B.L. ; Schultz, K. ; Nowak, D. ; Schüler, M. ; Schwarzkopf, L.

How does the EQ-5D-5L perform in asthma patients compared with an asthma-specific quality of life questionnaire?
Stem Cells 38, 1467-1478 (2020)

Hu, Y. ; Ng-Blichfeldt, J.P. ; Ota, C. ; Ciminieri, C. ; Ren, W. ; Hiemstra, P.S. ; Stolk, J. ; Gosens, R. ; Königshoff, M.

Wnt/β-catenin signaling is critical for regenerative potential of distal lung epithelial progenitor cells in homeostasis and emphysema.

Kreyling, W.G. ; Holzwarth, U. ; Hirn, S. ; Schleh, C. ; Wenk, A. ; Schäffler, M. ; Haberl, N. ; Gibson, N.

Quantitative biokinetics over a 28 day period of freshly generated, pristine, 20 nm silver nanoparticle aerosols in healthy adult rats after a single 11/2-hour inhalation exposure.
Part. Fibre Toxicol. 17:16 (2020)

Halappanavar, S. ; van den Brule, S. ; Nymark, P. ; Gaté, L. ; Seidel, C. ; Valentino, S. ; Zhernovkov, V. ; Høgh Danielsen, P. ; De Vizcaya, A. ; Wolff, H. ; Stöger, T. ; Boyadziev, A. ; Poulsen, S.S. ; Sørli, J.B. ; Vogel, U.

Adverse outcome pathways as a tool for the design of testing strategies to support the safety assessment of emerging advanced materials at the nanoscale.
Adv. Exp. Med. Biol. 1233, 55-100 (2020)

Coux, O. ; Zieba, B.A. ; Meiners, S.

The proteasome system in health and disease.
EMBO Rep. 21:e48777 (2020)

Munir, S. ; Basu, A. ; Maity, P. ; Krug, L. ; Haas, P. ; Jiang, D. ; Strauss, G. ; Wlaschek, M. ; Geiger, H. ; Singh, K. ; Scharffetter-Kochanek, K.

TLR4-dependent shaping of the wound site by MSCs accelerates wound healing.
PLoS ONE 15:e0232847 (2020)

Bondesson, D. ; Silbernagel, E. ; Behr, J. ; Reichenberger, F. ; Dinkel, J.

Automated evaluation of probe-based confocal laser endomicroscopy in the lung.
Cell Prolif. 53:e12828 (2020)

Hu, C. ; Meiners, S. ; Lukas, C. ; Stathopoulos, G.T. ; Chen, J.

Role of exosomal microRNAs in lung cancer biology and clinical applications.
Allergy 75, 1979-1990 (2020)

Alhasan, M.M. ; Cait, A.M. ; Heimesaat, M.M. ; Blaut, M. ; Klopfleisch, R. ; Wedel, A. ; Conlon, T.M. ; Yildirim, A.Ö. ; Sodemann, E.B. ; Mohn, W.W. ; Bereswill, S. ; Conrad, M.L.

Antibiotic use during pregnancy increases offspring asthma severity in a dose-dependent manner.

Lasch, F. ; Karch, A. ; Koch, A. ; Derlin, T. ; Voskrebenzev, A. ; Alsady, T.M. ; Hoeper, M.M. ; Gall, H. ; Roller, F. ; Harth, S. ; Steiner, D. ; Krombach, G. ; Ghofrani, H.A. ; Rengier, F. ; Heußel, C.P. ; Grünig, E. ; Beitzke, D. ; Hacker, M. ; Lang, I.M. ; Behr, J. ; Bartenstein, P. ; Dinkel, J. ; Schmidt, K.H. ; Kreitner, K.F. ; Frauenfelder, T. ; Ulrich, S. ; Hamer, O.W. ; Pfeifer, M. ; Johns, C.S. ; Kiely, D.G. ; Swift, A.J. ; Wild, J. ; Vogel-Claussen, J.

Comparison of MRI and VQ-SPECT as a screening test for patients with suspected CTEPH: CHANGE-MRI study design and rationale.

Grosch, M. ; Rusha, E. ; Ori, C. ; Truong, D.J.J. ; O'Neill, A.C. ; Pertek, A. ; Westmeyer, G.G. ; Drukker, M.

Nucleus size and DNA accessibility are linked to the regulation of paraspeckle formation in cellular differentiation.

Liu, H. ; Zistler, K. ; Jeridi, A. ; Morrone, C. ; Schulte-Doeinghaus, S. ; Hagl, C. ; Yildirim, A.Ö. ; Michel, S. ; Dashkevich, A.

Rapid activation of pro-lymphangiogenic phenotype and consequent increase of lymphatic density occurs during the development of chronic lung allograft dysfunction.
J. Heart Lung Transpl. 39, S356-S357 (2020)

Morrone, C. ; Rehm, S.R.T. ; Smirnova, N. ; Doryab, A. ; Schmid, O. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö. ; Jenne, D.

Regulation of cysteine-protease activity prevents graft dysfunction during ischemia-lung reperfusion.
Wound Repair Regen. 28, A16-A16 (2020)

Jiang, D. ; Ramesh, P. ; Christ, S. ; Correa-Gallegos, D. ; Gopal, S.K. ; Yu, Q. ; Lupperger, V. ; Marr, C. ; Rinkevich, Y.

Scar formation is driven by N-cadherin dependent collective fibroblast migration.
Wound Repair Regen. 28, A6-A6 (2020)

Correa-Gallegos, D. ; Jiang, D. ; Rinkevich, Y.

Subcutaneous fascia is a cell repository for scars.
Wound Repair Regen. 28, A10-A10 (2020)

Christ, S. ; Jiang, D. ; Correa-Gallegos, D. ; Ramesh, P. ; Rinkevich, Y.

Two succeeding fibroblastic lineages drive dermal development and the transition from regeneration to scarring.
Wound Repair Regen. 28, A1-A1 (2020)

Kastlmeier, M.T. ; Stöger, T. ; Hilgendorff, A. ; Voss, C.

HIPSC in vitro model for therapeutic strategies in fibrotic regeneration.
Cell. Signal. 70:109588 (2020)

Lehmann, M. ; Hu, Q. ; Hu, Y. ; Hafner, K. ; Costa, R. ; van den Berg, A. ; Königshoff, M.

Chronic WNT/β-catenin signaling induces cellular senescence in lung epithelial cells.
Wound Repair Regen. 28, A6-A6 (2020)

Cranz, S. ; Gerckens, M. ; Sengupta, A. ; Sahabian, A. ; Ori, C. ; Martin, U. ; Drukker, M. ; Lindner, M. ; Behr, J. ; Olmer, R. ; Königshoff, M. ; Burgstaller, G.

Rebuilding new lungs: Studying homing of progenitor lung cell types into their native niche of decellularized ex vivo human lung slices by 4D live-cell light-sheet microscopy.
Wound Repair Regen. 28, A15-A15 (2020)

Jiang, D. ; de Vries, J. ; Muschhammer, J. ; Schatz, S. ; Hein, T. ; Fidan, M. ; Romanov, V. ; Rinkevich, Y. ; Scharffetter-Kochanek, K.

Local and transient inhibition of p21 expression ameliorates age-related delayed wound healing.
Wound Repair Regen. 28, A13-A13 (2020)

Conlon, T.M. ; Sarker, R.S. ; Morrone, C. ; Srivastava, B. ; Fehrenbach, H. ; Yildirim, A.Ö.

Regeneration of airway epithelial cell regulated by arginine methylation.
Wound Repair Regen. 28, A7-A7 (2020)

Strunz, M. ; Simon, L. ; Ansari, M. ; Mattner, L. ; Angelidis, I. ; Mayr, C. ; Kathiriya, J. ; Yee, M. ; Ogar, P. ; Voss, C. ; Stöger, T. ; Kukhtevich, I. ; Schneider, R. ; Lehmann, M. ; Koenigshoff, M. ; Burgstaller, G. ; O'Reilly, M. ; Chapman, H. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.

Fate trajectory modeling reveals convergence of airway derived progenitors and AT2 cells on transient KRT8+alveolar cell state during lung regeneration.
Clin. Exp. Allergy 50, 520-531 (2020)

Sodemann, E.B. ; Dähling, S. ; Klopfleisch, R. ; Boiarina, E. ; Cataldo, D. ; Alhasan, M.M. ; Yildirim, A.Ö. ; Witzenrath, M. ; Tabeling, C. ; Conrad, M.L.

Maternal asthma is associated with persistent changes in allergic offspring antibody glycosylation.
Expert Opin. Drug Deliv. 17, 463-478 (2020)

Ehrmann, S. ; Schmid, O. ; Darquenne, C. ; Rothen-Rutishauser, B. ; Sznitman, J. ; Yang, L. ; Barosova, H. ; Vecellio, L. ; Mitchell, J. ; Henze-Vourc´h, N.

Innovative preclinical models for pulmonary drug delivery research.
Small 16:1907476 (2020)

Hadrup, N. ; Zhernovkov, V. ; Jacobsen, N.R. ; Voss, C. ; Strunz, M. ; Schiller, H. B. ; Halappanavar, S. ; Poulsen, S.S. ; Kholodenko, B. ; Stöger, T. ; Saber, A.T. ; Vogel, U.

Acute phase response as a biological mechanism-of-action of (nano)particle-induced cardiovascular disease.
Mamm. Genome 31, 30-48 (2020)

Kollmus, H. ; Fuchs, H. ; Lengger, C. ; Haselimashhadi, H. ; Bogue, M.A. ; Östereicher, M.A. ; Horsch, M. ; Adler, T. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Amarie, O.V. ; Becker, L. ; Beckers, J. ; Calzada-Wack, J. ; Garrett, L. ; Hans, W. ; Hölter, S.M. ; Klein-Rodewald, T. ; Maier, H. ; Mayer-Kuckuk, P. ; Miller, G. ; Moreth, K. ; Neff, F. ; Rathkolb, B. ; Rácz, I. ; Rozman, J. ; Spielmann, N. ; Treise, I. ; Busch, D.H. ; Graw, J. ; Klopstock, T. ; Wolf, E. ; Wurst, W. ; Yildirim, A.Ö. ; Mason, J. ; Torres, A. ; Balling, R. ; Mehaan, T. ; Gailus-Durner, V. ; Schughart, K. ; Hrabě de Angelis, M.

A comprehensive and comparative phenotypic analysis of the collaborative founder strains identifies new and known phenotypes.
Naunyn-Schmiedebergs Arch. Pharmakol. 393, 37-37 (2020)

Rajan, S. ; Weber, J. ; Chao, Y.K. ; Kannler, M. ; Krasteva-Christ, G. ; Yildirim, A.Ö. ; Brosien, M. ; Schredelseker, J. ; Weissmann, N. ; Grimm, C. ; Gudermann, T. ; Dietrich, A.

Essential functions of TRPV4 channels in alveolar epithelium.
In: Tumor Microenvironment. Gewerbestrasse 11, Cham, Ch-6330, Switzerland: Springer International Publishing Ag, 2020. 53-69 (Adv. Exp. Med. Biol. ; 1225)

Giotopoulou, G.A. ; Stathopoulos, G.T.

Effects of inhaled tobacco smoke on the pulmonary tumor microenvironment.
Environ. Toxicol. Pharmacol. 74:103303 (2020)

Hadrup, N. ; Saber, A.T. ; Kyjovska, Z.O. ; Jacobsen, N.R. ; Vippola, M. ; Sarlin, E. ; Ding, Y. ; Schmid, O. ; Wallin, H. ; Jensen, K.A. ; Vogel, U.

Pulmonary toxicity of Fe2O3, ZnFe2O4, NiFe2O4 and NiZnFe4O8 nanomaterials: Inflammation and DNA strand breaks.
Toxicol. Appl. Pharmacol. 386:114830 (2020)

Danielsen, P.H. ; Knudsen, K.B. ; Štrancar, J. ; Umek, P. ; Koklič, T. ; Garvas, M. ; Vanhala, E. ; Savukoski, S. ; Ding, Y. ; Madsen, A.M. ; Jacobsen, N.R. ; Weydahl, I.K. ; Berthing, T. ; Poulsen, S.S. ; Schmid, O. ; Wolff, H. ; Vogel, U.

Effects of physicochemical properties of TiO2 nanomaterials for pulmonary inflammation, acute phase response and alveolar proteinosis in intratracheally exposed mice.

Stoecklein, S. ; Hilgendorff, A. ; Li, M. ; Förster, K. ; Flemmer, A.W. ; Galiè, F. ; Wunderlich, S. ; Wang, D. ; Stein, S. ; Ehrhardt, H. ; Dietrich, O. ; Zou, Q. ; Zhou, S. ; Ertl-Wagner, B. ; Liu, H.

Variable functional connectivity architecture of the preterm human brain: Impact of developmental cortical expansion and maturation.

Greiffo, F.R. ; Viteri-Alvarez, V. ; Frankenberger, M. ; Dietel, D. ; Ortega-Gomez, A. ; Lee, J.S. ; Hilgendorff, A. ; Behr, J. ; Soehnlein, O. ; Eickelberg, O. ; Fernandez, I.E.

CX3CR1-fractalkine axis drives kinetic changes of monocytes in fibrotic interstitial lung diseases.
Wound Repair Regen. 28, 49-60 (2020)

Jiang, D. ; de Vries, J.C. ; Muschhammer, J. ; Schatz, S. ; Ye, H. ; Hein, T. ; Fidan, M. ; Romanov, V.S. ; Rinkevich, Y. ; Scharffetter-Kochanek, K.

Local and transient inhibition of p21 expression ameliorates age-related delayed wound healing.
Allergy 75, 370-380 (2020)

George, L. ; Taylor, A.R. ; Esteve-Codina, A. ; Soler Artigas, M. ; Thun, G.A. ; Bates, S. ; Pavlidis, S. ; Wagers, S. ; Boland, A. ; Prasse, A. ; Boschetto, P. ; Parr, D.G. ; Nowinski, A. ; Barta, I. ; Hohlfeld, J. ; Greulich, T. ; van den Berge, M. ; Hiemstra, P.S. ; Timens, W. ; Hinks, T. ; Wenzel, S. ; Siddiqui, S. ; Richardson, M. ; Venge, P. ; Heath, S. ; Gut, I. ; Tobin, M.D. ; Edwards, L. ; Riley, J.H. ; Djukanovic, R. ; Auffray, C. ; De-Meulder, B. ; Erik-Dahlen, S. ; Adcock, I.M. ; Chung, K.F. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Sterk, P.J. ; Singh, D. ; Brightling, C.E.

Blood eosinophil count and airway epithelial transcriptome relationships in COPD versus asthma.
Cardiovasc. Res. 116, 406-415 (2020)

Heitmeier, T. ; Sydykov, A. ; Lukas, C. ; Vroom, C. ; Korfei, M. ; Petrovic, A. ; Klingel, K. ; Günther, A. ; Eickelberg, O. ; Weissmann, N. ; Ghofrani, H.A. ; Seeger, W. ; Grimminger, F. ; Schermuly, R.T. ; Meiners, S. ; Kosanovic, D.

Altered proteasome function in right ventricular hypertrophy.
Thorax 75, 184-187 (2020)

Förster, K. ; Ertl-Wagner, B. ; Ehrhardt, H. ; Busen, H. ; Sass, S. ; Pomschar, A. ; Naehrlich, L. ; Schulze, A. ; Flemmer, A.W. ; Hübener, C. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Dietrich, O. ; Hilgendorff, A.

Altered relaxation times in MRI indicate bronchopulmonary dysplasia.

Ramsheh, M.Y. ; Thun, G.A. ; Codina, A.E. ; Haldar, K. ; Barer, M. ; Gut, I. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Singh, D. ; Brightling, C.

Prevotella genera abundance in bronchial brush samples differentiates COPD from health and is associated with gene expression.

Ramsheh, M.Y. ; Haldar, K. ; Barer, M. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Gut, I. ; Singh, D. ; Brightling, C.

Association between COPD bronchial brush microbiome-determined ?Proteobacteria:Firmicutes (G:F) ratio and GOLD grade and symptoms.

Wolff, M. ; El-Merhie, N. ; Reuter, S. ; Goldmann, T. ; Yildirim, A.Ö. ; Fehrenbach, H. ; Krauss-Etschmann, S.

LSC-2019-Relevant murine model to study the development of COPD pathogenesis in smokers with viral infections.

Gonzalez, E. ; Zhang, X. ; Oak, P. ; Markmann, M. ; Hilgendorff, A.

Hyperoxia exposure induces age-dependent changes in gene expression in healthy mouse lung.

Hardy, S. ; Schneider, A. ; Frankenberger, M. ; Koch, A. ; Milger, K. ; Moulin, C. ; Fievez, M. ; Pilette, C. ; Meiners, S. ; Kammerl, I.E.

LSC-2019-Validating immunoproteasome activity as a potential biomarker in non-invasive samples from COPD patients.

Chen, J. ; Brands, J. ; Bueno, M. ; Adler, H. ; Mora, A. ; Meiners, S. ; Kammerl, I.E.

LSC-2019-Effect of cigarette smoke on immunoproteasome function during virus infection.
2019 in
In:. 2019.

Cyrys, J. ; Schnelle-Kreis, J. ; Kowalski, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Schmid, O. ; Stöger, T. ; Peters, A. ; Schneider, A.E. ; Pickford, R. ; Zhang, S. ; Breitner-Busch, S.

Ambient ultrafine particles: Evidence for policy maker.

Meul, T. ; Wang, X. ; Angelidis, I. ; Berschneider, K. ; Schmitt, S. ; Zischka, H. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Schiller, H. B. ; Meiners, S.

Mitochondrial dysfunction activates MHC class I adaptive immune responses in lung aging.

Behr, J. ; Wirtz, H. ; Pittrow, D. ; Prasse, A. ; Koschel, D. ; Geier, S. ; Klotsche, J. ; Andreas, S. ; Claussen, M. ; Grohe, C. ; Wilkens, H. ; Hagmeyer, L. ; Skowasch, D. ; Meyer, J.F. ; Kirschner, J. ; Glaeser, S. ; Kahn, N. ; Welte, T. ; Neurohr, C. ; Schwaiblmair, M. ; Held, M. ; Bahmer, T. ; Oqueka, T. ; Frankenberger, M. ; Kreuter, M.

Late Breaking Abstract - Survival and course of lung function in patients with idiopathic pulmonary fibrosis with or without antifibrotic treatment: Long-term results of the INSIGHTS-IPF registry.
Proc. SPIE 11113:111130G (2019)

Morgan, K.S. ; Gradl, R. ; Dierolf, M. ; Jud, C. ; Günther, B. ; Werdiger, F. ; Gardner, M. ; Cmielewski, P. ; McCarron, A. ; Farrow, N. ; Haas, H. ; Kimm, M.A. ; Yang, L. ; Kutschke, D. ; Stöger, T. ; Schmid, O. ; Achterhold, K. ; Pfeiffer, F. ; Parsons, D. ; Donnelley, M.

In vivo x-ray imaging of the respiratory system using synchrotron sources and a compact light source.

Thun, G.A. ; Derdak, S. ; Castro-Giner, F. ; Apunte-Ramos, K. ; Águeda, L. ; Wjst, M. ; Boland, A. ; Deleuze, J.F. ; Kolsum, U. ; Heiss-Neumann, M.S. ; Nowinski, A. ; Gorecka, D. ; Hohlfeld, J.M. ; Welte, T. ; Brightling, C.E. ; Parr, D.G. ; Prasse, A. ; Müller-Quernheim, J. ; Greulich, T. ; Stendardo, M. ; Boschetto, P. ; Barta, I. ; Döme, B. ; Gut, M. ; Singh, D. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Gut, I.G.

High degree of polyclonality hinders somatic mutation calling in lung brush samples of COPD cases and controls.

Ulke, H.M. ; Mutze, K. ; Lehmann, M. ; Wagner, D.E. ; Heinzelmann, K. ; Guenther, A. ; Eickelberg, O. ; Königshoff, M.

The oncogene ECT2 contributes to a hyperplastic, proliferative lung epithelial cell phenotype in idiopathic pulmonary fibrosis.
Nature 576, 287-292 (2019)

Correa-Gallegos, D. ; Jiang, D. ; Christ, S. ; Ramesh, P. ; Ye, H. ; Wannemacher, J. ; Kalgudde Gopal, S. ; Yu, Q. ; Aichler, M. ; Walch, A.K. ; Mirastschijski, U. ; Volz, T. ; Rinkevich, Y.

Patch repair of deep wounds by mobilized fascia.
Nature 575, 693-698 (2019)

Doll, S. ; Freitas, F.P. ; Shah, R. ; Aldrovandi, M. ; da Silva, M.C. ; Ingold, I. ; Grocin, A.G. ; Xavier da Silva, T.N. ; Panzilius, E. ; Scheel, C. ; Mourao, A. ; Buday, K. ; Sato, M. ; Wanninger, J. ; Vignane, T. ; Mohana, V. ; Rehberg, M. ; Flatley, A. ; Schepers, A. ; Kurz, A. ; White, D. ; Sauer, M. ; Sattler, M. ; Tate, E.W. ; Schmitz, W. ; Schulze, A. ; O’Donnell, V. ; Proneth, B. ; Popowicz, G.M. ; Pratt, D.A. ; Angeli, J.P.F. ; Conrad, M.

FSP1 is a glutathione-independent ferroptosis suppressor.
Thorax 75, 8-16 (2019)

Ramsheh, M.Y. ; Haldar, K. ; Bafadhel, M. ; George, L. ; Free, R.C. ; John, C. ; Reeve, N.F. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Gut, I. ; Singh, D. ; Mistry, V. ; Tobin, M.D. ; Oggioni, M.R. ; Brightling, C. ; Barer, M.R.

Resistome analyses of sputum from COPD and healthy subjects reveals bacterial load-related prevalence of target genes.
Carcinogenesis 41, 1134-1144 (2019)

Giopanou, I. ; Kanellakis, N.I. ; Giannou, A.D. ; Lilis, I. ; Marazioti, A. ; Spella, M. ; Papaleonidopoulos, V. ; Simoes, D.C.M. ; Zazara, D.E. ; Agalioti, T. ; Moschos, C. ; Magkouta, S. ; Kalomenidis, I. ; Panoutsakopoulou, V. ; Lamort, A.-S. ; Stathopoulos, G.T.

Osteopontin drives KRAS-mutant lung adenocarcinoma.

Gulbake, A.S. ; Jain, A. ; Shilpi, S. ; Kumar, P. ; Gulbake, A.

Mannosylated multiwalled carbon nanotubes assisted artesunate delivery for cerebral malaria.
FASEB J. 33, 12392-12408 (2019)

Kesireddy, V.S. ; Chillappagari, S. ; Ahuja, S. ; Knudsen, L. ; Henneke, I. ; Graumann, J. ; Meiners, S. ; Ochs, M. ; Ruppert, C. ; Korfei, M. ; Seeger, W. ; Mahavadi, P.

Susceptibility of microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta (MAP1LC3B/LC3B) knockout mice to lung injury and fibrosis.

Pang, Y.P. ; Moura, M.C. ; Thompson, G.E. ; Nelson, D.R. ; Hummel, A.M. ; Jenne, D. ; Emerling, D. ; Volkmuth, W. ; Robinson, W.H. ; Specks, U.

Remote activation of a latent epitope in an autoantigen decoded with simulated B-factors.

Sarker, R.S. ; Conlon, T.M. ; Morrone, C. ; Srivastava, B. ; Konyalilar, N. ; Verleden, S.E. ; Bayram, H. ; Fehrenbach, H. ; Yildirim, A.Ö.

CARM1 regulates senescence during airway epithelial cell injury in COPD pathogenesis.
Nat. Rev. Rheumatol. 15, 705-730 (2019)

Distler, J.H.W. ; Györfi, A.H. ; Ramanujam, M. ; Whitfield, M.L. ; Königshoff, M. ; Lafyatis, R.

Shared and distinct mechanisms of fibrosis.

Andrault, P.-M. ; Schamberger, A.C. ; Chazeirat, T. ; Sizaret, D. ; Renault, J. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Hennen, E. ; Petit-Courty, A. ; Wartenberg, M. ; Saidi, A. ; Baranek, T. ; Guyetant, S. ; Courty, Y. ; Eickelberg, O. ; Lalmanach, G. ; Lecaille, F.

Cigarette smoke induces overexpression of active human cathepsin S in lungs from current smokers with or without COPD.
Eur. J. Immunol. 49, 1594-1595 (2019)

Alhasan, M. ; Cait, A. ; Heimesaat, M.M. ; Blaut, M. ; Klopfleisch, R. ; Yildirim, A.Ö. ; Sodemann, E.B. ; Bereswill, S. ; Conrad, M.L.

Antibiotic use during pregnancy impacts neonatal microbiota composition and increases offspring asthma severity.
J. Thorac. Oncol. 14, S454-S454 (2019)

Arendt, K.A.M. ; Ntaliarda, G. ; Armenis, V. ; Stathopoulos, G.T.

An in vivo inflammatory loop potentiates KRAS blockade.
Eur. J. Hum. Genet. 27, 470-471 (2019)

Oplopoiou, M. ; Kati, D. ; Ntaliarda, G. ; Papaleonidopoulos, V. ; Giopanou, I. ; Lilis, I. ; Stathopoulos, G.T.

The role of Trp53 in chemical-induced lung adenocarcinoma.

Welk, V. ; Meul, T. ; Lukas, C. ; Kammerl, I.E. ; Mulay, S.R. ; Schamberger, A.C. ; Semren, N. ; Fernandez, I.E. ; Anders, H.J. ; Günther, A. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Korfei, M. ; Meiners, S.

Proteasome activator PA200 regulates myofibroblast differentiation.
Small 15:1904112 (2019)

Yang, L. ; Gradl, R. ; Dierolf, M. ; Möller, W. ; Kutschke, D. ; Feuchtinger, A. ; Hehn, L. ; Donnelley, M. ; Günther, B. ; Achterhold, K. ; Walch, A.K. ; Stöger, T. ; Razansky, D. ; Pfeiffer, F. ; Morgan, K.S. ; Schmid, O.

Multimodal precision imaging of pulmonary nanoparticle delivery in mice: Dynamics of application, spatial distribution, and dosimetry.
Rev. Sci. Instruments 90:103103 (2019)

Umkehrer, S. ; Birnbacher, L. ; Burkhardt, R. ; Von Teuffenbach, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Pfeiffer, D. ; Herzen, J. ; Pfeiffer, F.

Optimization of in vivo murine X-ray dark-field computed tomography.

Wang, X. ; Chen, S. ; Ren, H. ; Chen, J. ; Li, J. ; Wang, Y. ; Hua, Y. ; Wang, X. ; Huang, N.

HMGN2 regulates non-tuberculous mycobacteria survival via modulation of M1 macrophage polarization.
Blood Adv. 3, 2713-2721 (2019)

Tsai, J.M. ; Shoham, M. ; Fernhoff, N.B. ; George, B.M. ; Marjon, K.D. ; McCracken, M.N. ; Kao, K.S. ; Sinha, R. ; Volkmer, A.K. ; Miyanishi, M. ; Seita, J. ; Rinkevich, Y. ; Weissman, I.L.

Neutrophil and monocyte kinetics play critical roles in mouse peritoneal adhesion formation.

Marazioti, A. ; Papadia, K. ; Kannavou, M. ; Spella, M. ; Basta, A. ; de Lastic, A.L. ; Rodi, M. ; Mouzaki, A. ; Samiotaki, M. ; Panayotou, G. ; Stathopoulos, G.T. ; Antimisiaris, S.G.

Cellular vesicles: New insights in engineering methods, interaction with cells and potential for brain targeting.

Lamort, A.-S. ; Hamon, Y. ; Czaplewski, C. ; Gieldon, A. ; Seren, S. ; Coquet, L. ; Lecaille, F. ; Lesner, A. ; Lalmanach, G. ; Gauthier, F. ; Jenne, D. ; Korkmaz, B.

Processing and maturation of cathepsin C zymogen: A biochemical and molecular modeling analysis.
Rheumatology 58, 222 (2019)

Thompson, G. ; Moura, M.C. ; Nelson, D. ; Fussner, L. ; Hummel, A. ; Jenne, D. ; Fervenza, F. ; Hoffman, G. ; Kallenberg, C. ; Langford, C. ; McCune, J. ; Merkel, P. ; Monach, P. ; Seo, P. ; Spiera, R. ; St Clair, E.W. ; Ytterberg, S. ; Stone, J. ; Robinson, W. ; Pang, Y. ; Specks, U.

Preferential binding to an unexpected epitope of a chimeric recombinant proteinase 3 variant by anti-neutrophil cytoplasmic antibodies.
Cells 8:815 (2019)

Lamort, A.-S. ; Giopanou, I. ; Psallidas, I. ; Stathopoulos, G.T.

Osteopontin as a link between inflammation and cancer: The thorax in the spotlight.
Viruses 11:646 (2019)

Fei, Y. ; Liu, X. ; Mu, J. ; Li, J. ; Yu, X. ; Chang, J. ; Bi, Y. ; Stöger, T. ; Wajid, A. ; Muzyka, D. ; Sharshov, K. ; Shestopalov, A. ; Amonsin, A. ; Chen, J. ; Ding, Z. ; Yin, R.

The emergence of avian orthoavulavirus 13 in wild migratory waterfowl in China revealed the existence of diversified trailer region sequences and HN gene lengths within this serotype.
ERJ Open Res. 5:00194-2018 (2019)

Nikolić, M.Z. ; Garrido-Martin, E.M. ; Greiffo, F.R. ; Fabre, A. ; Heijink, I.H. ; Boots, A. ; Greene, C.M. ; Hiemstra, P.S. ; Bartel, S.

From the pathophysiology of the human lung alveolus to epigenetic editing: Congress 2018 highlights from ERS Assembly 3 "Basic and Translational Science.".
Adv. Func. Mat. 29:1903114 (2019)

Doryab, A. ; Tas, S. ; Taskin, M.B. ; Yang, L. ; Hilgendorff, A. ; Groll, J. ; Wagner, D.E. ; Schmid, O.

Evolution of bioengineered lung models: Recent advances and challenges in tissue mimicry for studying the role of mechanical forces in cell biology.
Matrix biology plus 1, DOI: 10.1016/j.mbplus.2019.04.002:100005 (2019)

Merl-Pham, J. ; Basak, T. ; Knüppel, L. ; Ramanujam, D. ; Athanason, M. ; Behr, J. ; Engelhardt, S. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Vanacore, R. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Quantitative proteomic profiling of extracellular matrix and site-specific collagen post-translational modifications in an in vitro model of lung fibrosis.

Förster, K. ; Herber-Jonat, S. ; Florian, A. ; Klemme, M. ; Flemmer, A.W.

Langzeitentwicklung von Kindern nach Extra Corporaler Membran Oxygenierung (ECMO).

Ng-Blichfeldt, J.P. ; de Jong, T. ; Kortekaas, R.K. ; Wu, X. ; Lindner, M. ; Guryev, V. ; Hiemstra, P.S. ; Stolk, J. ; Königshoff, M. ; Gosens, R.

TGF-beta activation impairs fibroblast ability to support adult lung epithelial progenitor cell organoid formation.

Kreyling, W.G. ; Holzwarth, U. ; Schleh, C. ; Hirn, S. ; Wenk, A. ; Schäffler, M. ; Haberl, N. ; Semmler-Behnke, M. ; Gibson, N.

Quantitative biokinetics over a 28day period of freshly generated, pristine, 20 nm titanium dioxide nanoparticle aerosols in healthy adult rats after a single two-hour inhalation exposure.

Rehm, S.R.T. ; Smirnova, N.F. ; Morrone, C. ; Götzfried, J. ; Feuchtinger, A. ; Pedersen, J. ; Korkmaz, B. ; Yildirim, A.Ö. ; Jenne, D.

Premedication with a cathepsin C inhibitor alleviates early primary graft dysfunction in mouse recipients after lung transplantation.

Fernandez, I.M. ; Macrini, C. ; Krumbholz, M. ; Hensbergen, P.J. ; Ederveen, A.L.H. ; Winklmeier, S. ; Vural, A. ; Kurne, A. ; Jenne, D. ; Kamp, F. ; Gerdes, L.A. ; Hohlfeld, R. ; Wuhrer, M. ; Kuempfel, T. ; Meinl, E.

The glycosylation site of myelin oligodendrocyte glycoprotein affects autoantibody recognition in a large proportion of patients.
J. Control. Release 307, 282-291 (2019)

Gradl, R. ; Dierolf, M. ; Yang, L. ; Hehn, L. ; Günther, B. ; Möller, W. ; Kutschke, D. ; Stöger, T. ; Gleich, B. ; Achterhold, K. ; Donnelley, M. ; Pfeiffer, F. ; Schmid, O. ; Morgan, K.S.

Visualizing treatment delivery and deposition in mouse lungs using in vivo x-ray imaging.
J. Aerosol Med. Pulm. Drug Deliv. 32, A12-A12 (2019)

Yang, L. ; Gradl, R. ; Feuchtinger, A. ; Morgan, K.S. ; Kutschke, D. ; Stöger, T. ; Razansky, D. ; Walch, A.K. ; Pfeiffer, F. ; Schmidt, O.

Novel imaging tolls for deciphering pulmonary aerosol deposition with single-cell resolution in non-dissected murine lungs.
J. Thorac. Dis. 11, 1963-1972 (2019)

Klotz, L.V. ; Lindner, M. ; Eichhorn, M.E. ; Grützner, U. ; Koch, I. ; Winter, H. ; Kauke, T. ; Duell, T. ; Hatz, R.

Pleurectomy/decortication and hyperthermic intrathoracic chemoperfusion using cisplatin and doxorubicin for malignant pleural mesothelioma.
J. Aerosol Med. Pulm. Drug Deliv. 32, A7-A7 (2019)

Orak, S. ; Rothen-Rutishauser, B. ; Jud, C. ; Farnoud, A. ; Bucholski, A. ; Egle, R. ; Boerner, G. ; Denk, O. ; Schmid, O.

Towards prediction of the pharmacokinetics of inhaled nanomedicine from physiological cell models: A case study with liposomal ciclosporin A (L-CSA) using the vitrocell cloud system.
ERJ Open Res. 5:00226-2018 (2019)

Merrick, C. ; Sherrill, T. ; Kanellakis, N.I. ; Asciak, R. ; Stathopoulos, G.T. ; Maldonado, F. ; Rahman, N.M. ; Blackwell, T. ; Psallidas, I.

Novel mouse model of indwelling pleural catheter in mice with malignant pleural effusion.
eLife 8:e45571 (2019)

Spella, M. ; Lilis, I. ; Pepe, M. ; Chen, Y. ; Armaka, M. ; Lamort, A.-S. ; Zazara, D.E. ; Roumelioti, F. ; Vreka, M. ; Kanellakis, N.I. ; Wagner, D.E. ; Giannou, A.D. ; Armenis, V. ; Arendt, K.A.M. ; Klotz, L.V. ; Toumpanakis, D. ; Karavana, V. ; Zakynthinos, S.G. ; Giopanou, I. ; Marazioti, A. ; Aidinis, V. ; Sotillo, R. ; Stathopoulos, G.T.

Club cells form lung adenocarcinomas and maintain the alveoli of adult mice.

Conlon, T.M. ; Güneş, G. ; Sarker, R.S. ; Fehrenbach, H. ; Yildirim, A.Ö.

Arginine methylation epigenetically regulates airway epithelial cell injury in COPD pathogenesis.

Srivastava, B. ; Conlon, T.M. ; Mitula, E. ; Sarker, R.S. ; Yildirim, A.Ö.

Developing oxysterol inhibitors as a novel therapeutic target for iBALT driven chronic pulmonary diseases.

Gunsel, G.G. ; Conlon, T.M. ; Sarker, R. ; Jia, J. ; Heinzelmann, K. ; Tasdemir, D. ; Bayram, H. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Metabolomic regulation of B cells drives the pathogenesis of COPD.

Staab-Weijnitz, C.A. ; Merl-Pham, J. ; Basak, T. ; Knüppel, L. ; Ramanujam, D. ; Athanason, M. ; Behr, J. ; Engelhardt, S. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Vanacore, R.

Quantitative proteomic profiling of extracellular matrix and collagen posttranslational modifications in an in vitro model of lung fibrosis.

Heinzelmann, K. ; Ulke, H.M. ; Mutze, K. ; Wagner, D.E. ; Ren, W. ; Guenther, A. ; Eickelberg, O. ; Koenigshoff, M.

Epithelial cell transforming sequence 2 contributes to alveolar epithelial cell reprogramming in idiopathic pulmonary fibrosis.

Fernandez, I.E. ; Greiffo, F.R. ; Viteri-Alvarez, V. ; Bastidas, I. ; Roy, R. ; Frankenberger, M. ; Behr, J. ; Forrest, A. ; Hilgendorff, A. ; Eickelberg, O.

Myeloid-derived suppressor cells orchestrate immunosuppressive networks in idiopathic pulmonary fibrosis.
2019 in
In: (Trans. Annu. Meet. Soc. Biomater. Annu. Int. Biomater. Symp., 03-06 April 2019, Seattle, USA). 2019. 560 ( ; 40)

Bölükbas, D.A. ; Morrone, C. ; Doryab, A. ; Datz, S. ; Gößl, D. ; Meyer-Schwickerath, C. ; Vreka, M. ; van Rijt, S.H. ; Stöger, T. ; Stathopoulos, G.T. ; Lindstedt, S. ; Bein, T. ; Meiners, S. ; Wagner, D.E.

Fine-tuning lung cancer nanotherapy using closed cardiopulmonary circulation.
NanoImpact 14:100158 (2019)

Halappanavar, S. ; Rahman, L. ; Nikota, J. ; Poulsen, S.S. ; Ding, Y. ; Jackson, P. ; Wallin, H. ; Schmid, O. ; Vogel, U. ; Williams, A.

Ranking of nanomaterial potency to induce pathway perturbations associated with lung responses.

Moore, C. ; Blumhagen, R.Z. ; Yang, I.V. ; Walts, A. ; Powers, J. ; Walker, T. ; Bishop, M. ; Russell, P. ; Vestal, B. ; Cardwell, J. ; Markin, C.R. ; Mathai, S.K. ; Schwarz, M.I. ; Steele, M.P. ; Lee, J. ; Brown, K.K. ; Loyd, J.E. ; Crapo, J.D. ; Silverman, E.K. ; Cho, M.H. ; James, J.A. ; Guthridge, J.M. ; Cogan, J.D. ; Kropski, J.A. ; Swigris, J.J. ; Bair, C. ; Soon Kim, D. ; Ji, W. ; Kim, H. ; Song, W.J. ; Maier, L.A. ; Pacheco, K.A. ; Hirani, N. ; Poon, A.S. ; Li, F. ; Jenkins, R.G. ; Braybrooke, R. ; Saini, G. ; Maher, T.M. ; Molyneaux, P.L. ; Saunders, P. ; Zhang, Y. ; Gibson, K.F. ; Kass, D.J. ; Rojas, M. ; Sembrat, J. ; Wolters, P.J. ; Collard, H.R. ; Sundy, J.S. ; O'Riordan, T. ; Strek, M.E. ; Noth, I. ; Ma, S.F. ; Porteous, M.K. ; Kreider, M.E. ; Patel, N.B. ; Inoue, Y. ; Hirose, M. ; Arai, T. ; Akagawa, S. ; Eickelberg, O. ; Fernandez, I.E. ; Behr, J. ; Mogulkoc, N. ; Corte, T.J. ; Glaspole, I. ; Tomassetti, S. ; Ravaglia, C. ; Poletti, V. ; Crestani, B. ; Borie, R. ; Kannengiesser, C. ; Parfrey, H. ; Fiddler, C. ; Rassl, D. ; Molina-Molina, M. ; Machahua, C. ; Montes Worboys, A. ; Gudmundsson, G. ; Isaksson, H.J. ; Lederer, D.J. ; Podolanczuk, A.J. ; Montesi, S.B. ; Bendstrup, E. ; Danchel, V. ; Selman, M. ; Pardo, A. ; Henry, M.T. ; Keane, M.P. ; Doran, P. ; Vašáková, M. ; Sterclova, M. ; Ryerson, C.J. ; Wilcox, P.G. ; Okamoto, T. ; Furusawa, H. ; Miyazaki, Y. ; Laurent, G. ; Baltic, S. ; Prele, C. ; Moodley, Y. ; Shea, B.S. ; Ohta, K. ; Suzukawa, M. ; Narumoto, O. ; Nathan, S.D. ; Venuto, D.C. ; Woldehanna, M.L. ; Kokturk, N. ; de Andrade, J.A. ; Luckhardt, T. ; Kulkarni, T. ; Bonella, F. ; Donnelly, S.C. ; McElroy, A. ; Armstrong, M.E. ; Aranda, A. ; Carbone, R.G. ; Puppo, F. ; Beckman, K.B. ; Nickerson, D.A. ; Fingerlin, T.E. ; Schwartz, D.A.

Resequencing study confirms host defense and cell senescence gene variants contribute to the risk of idiopathic pulmonary fibrosis.
EBioMedicine 43, 562-575 (2019)

Ballester-Lopez, C. ; Conlon, T.M. ; Ertüz, Z. ; Greiffo, F.R. ; Irmler, M. ; Verleden, S.E. ; Beckers, J. ; Fernandez, I.E. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

The Notch ligand DNER regulates macrophage IFN gamma release in chronic obstructive pulmonary disease.
Mol. Cell 74, 951-965.e13 (2019)

Modic, M. ; Grosch, M. ; Rot, G. ; Schirge, S. ; Lepko, T. ; Yamazaki, T. ; Lee, F.C.Y. ; Rusha, E. ; Shaposhnikov, D. ; Palo, M. ; Merl-Pham, J. ; Cacchiarelli, D. ; Rogelj, B. ; Hauck, S.M. ; von Mering, C. ; Meissner, A. ; Lickert, H. ; Hirose, T. ; Ule, J. ; Drukker, M.

Cross-regulation between TDP-43 and paraspeckles promotes pluripotency-differentiation transition.
Ann. Intern. Med. 170, 332-335 (2019)

Mascalzoni, D. ; Bentzen, H.B. ; Budin-Ljøsne, I. ; Bygrave, L.A. ; Bell, J. ; Dove, E.S. ; Fuchsberger, C. ; Hveem, K. ; Mayrhofer, M.T. ; Meraviglia, V. ; O'Brien, D.R. ; Pattaro, C. ; Pramstaller, P.P. ; Rakic, V. ; Rossini, A. ; Shabani, M. ; Svantesson, D.J.B. ; Tomasi, M. ; Ursin, L. ; Wjst, M. ; Kaye, J.

Are requirements to deposit data in research repositories compatible with the european union's general data protection regulation?
OncoImmunology 8:1593802 (2019)

Lilis, I. ; Ntaliarda, G. ; Papaleonidopoulos, V. ; Giotopoulou, G.A. ; Oplopoiou, M. ; Marazioti, A. ; Spella, M. ; Marwitz, S. ; Goldmann, T. ; Bravou, V. ; Giopanou, I. ; Stathopoulos, G.T.

Interleukin-1β provided by KIT-competent mast cells is required for KRAS-mutant lung adenocarcinoma.

Vetrivel, S. ; Tiso, N. ; Kügler, A. ; Irmler, M. ; Horsch, M. ; Beckers, J. ; Hladik, D. ; Giesert, F. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Sabrautzki, S. ; Adler, T. ; Treise, I. ; Busch, D.H. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Ollert, M. ; Götz, A. ; Amarie, O.V. ; Stöger, T. ; Schulz, H. ; Becker, L. ; Klopstock, T. ; Schrewe, A. ; Spielmann, N. ; Bekeredjian, R. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Zimprich, A. ; Wurst, W. ; Mayer-Kuckuk, P. ; Hans, W. ; Rozman, J. ; Klingenspor, M. ; Neff, F. ; da Silva Buttkus, P. ; Calzada-Wack, J. ; Rácz, I. ; Zimmer, A. ; Rathkolb, B. ; Wolf, E. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Östereicher, M.A. ; Miller, G. ; Steinkamp, R. ; Lengger, C. ; Maier, H. ; Stoeger, C. ; Leuchtenberger, S. ; Hrabě de Angelis, M. ; Graw, J.

Mutation in the mouse histone gene Hist2h3c1 leads to degeneration of the lens vesicle and severe microphthalmia.

Kerdidani, D. ; Chouvardas, P. ; Arjo, A.R. ; Giopanou, I. ; Ntaliarda, G. ; Guo, Y.A. ; Tsikitis, M. ; Kazamias, G. ; Potaris, K. ; Stathopoulos, G.T. ; Zakynthinos, S. ; Kalomenidis, I. ; Soumelis, V. ; Kollias, G. ; Tsoumakidou, M.

Wnt1 silences chemokine genes in dendritic cells and induces adaptive immune resistance in lung adenocarcinoma.
J. Heart Lung Transpl. 38, S250-S250 (2019)

Morrone, C. ; Smirnova, N.F. ; Kneidinger, N. ; Schiller, H. B. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Elevetad cysteine-protease activity in bronchiolitis obliterans syndrome.
Exp. Dermatol. 28, E13-E13 (2019)

Jiang, D. ; Christ, S. ; Gallegos, D.C. ; Ramesh, P. ; Gopal, S.K. ; Yu, Q. ; Mayr, C. ; Lupperger, V. ; Liu, J. ; Marr, C. ; Schiller, H. B. ; Rinkevich, Y.

Visualizing scar development in living tissues reveals the collective migration of fibroblasts mediated by N-cadherin.
Carcinogenesis 40, 1240-1250 (2019)

Castelletti, N. ; Kaiser, J.C. ; Simonetto, C. ; Furukawa, K. ; Küchenhoff, H. ; Stathopoulos, G.T.

Risk of lung adenocarcinoma from smoking and radiation arises in distinct molecular pathways.

Gerckens, M. ; Alsafadi, H.N. ; Wagner, D.E. ; Lindner, M. ; Burgstaller, G. ; Königshoff, M.

Generation of human 3D lung tissue cultures (3D-LTCs) for disease modeling.
Carcinogenesis 40, 1352-1362 (2019)

Kanellakis, N.I. ; Giannou, A.D. ; Pepe, M. ; Αgalioti, T. ; Zazara, D.E. ; Giopanou, I. ; Psallidas, I. ; Spella, M. ; Μarazioti, A. ; Arendt, K.A.M. ; Lamort, A.-S. ; Tsaniras, S.C. ; Taraviras, S. ; Papadaki, H. ; Lilis, I. ; Stathopoulos, G.T.

Tobacco chemical-induced mouse lung adenocarcinoma cell lines pin the prolactin orthologue proliferin as a lung tumour promoter.
J. Immunol. 202, 1406-1416 (2019)

Kunze, F.A. ; Bauer, M. ; Komuczki, J. ; Lanzinger, M. ; Gunasekera, K. ; Hopp, A.K. ; Lehmann, M. ; Becher, B. ; Müller, A. ; Hottiger, M.O.

ARTD1 in myeloid cells controls the IL-12/18-IFN-γ axis in a model of sterile sepsis, chronic bacterial infection, and cancer.
Cancer Med. 8, 1486-1499 (2019)

Klotz, L.V. ; Courty, Y. ; Lindner, M. ; Petit-Courty, A. ; Stowasser, A. ; Koch, I. ; Eichhorn, M.E. ; Lilis, I. ; Morresi-Hauf, A. ; Arendt, K.A.M. ; Pepe, M. ; Giopanou, I. ; Ntaliarda, G. ; Behrend, S.J. ; Oplopoiou, M. ; Gissot, V. ; Guyetant, S. ; Marchand-Adam, S. ; Behr, J. ; Kaiser, J.C. ; Hatz, R.A. ; Lamort, A.-S. ; Stathopoulos, G.T.

Comprehensive clinical profiling of the Gauting locoregional lung adenocarcinoma donors.
Ann. Surg. Oncol. 26, S192-S192 (2019)

Krampitz, G.W. ; Tsai, J. ; Norton, J.A. ; Weissman, I.L. ; Rinkevich, Y.

Adhesions are derived from hypoxia responsive mesothelin-positive mesothelial cells and are resolved via targeted therapies.
In: Mouse Cell Culture. 2019. 275-295 (Methods Mol. Biol. ; 1940)

Bölükbas, D.A. ; De Santis, M.M. ; Alsafadi, H.N. ; Doryab, A. ; Wagner, D.E.

The preparation of decellularized mouse lung matrix scaffolds for analysis of lung regenerative cell potential.
JCI insight 4:123971 (2019)

Smirnova, N.F. ; Conlon, T.M. ; Morrone, C. ; Dorfmuller, P. ; Humbert, M. ; Stathopoulos, G.T. ; Umkehrer, S. ; Pfeiffer, F. ; Yildirim, A.Ö. ; Eickelberg, O.

Inhibition of B cell–dependent lymphoid follicle formation prevents lymphocytic bronchiolitis after lung transplantation.
Small 15:1805400 (2019)

Hsiao, I.L. ; Fritsch-Decker, S. ; Leidner, A. ; Al-Rawi, M. ; Hug, V. ; Diabaté, S. ; Grage, S.L. ; Meffert, M. ; Stöger, T. ; Gerthsen, D. ; Ulrich, A.S. ; Niemeyer, C.M. ; Weiss, C.

Biocompatibility of amine-functionalized silica nanoparticles: The role of surface coverage.

Angelidis, I. ; Simon, L. ; Fernandez, I.E. ; Strunz, M. ; Mayr, C. ; Greiffo, F.R. ; Tsitsiridis, G. ; Ansari, M. ; Graf, E. ; Strom, T.M. ; Nagendran, M. ; Desai, T. ; Eickelberg, O. ; Mann, M. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.

An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics.

von Siemens, S.M. ; Jörres, R.A. ; Behr, J. ; Alter, P. ; Lutter, J. ; Lucke, T. ; Söhler, S. ; Welte, T. ; Watz, H. ; Vogelmeier, C.F. ; Trudzinski, F. ; Rief, W. ; Herbig, B. ; Kahnert, K.

Effect of COPD severity and comorbidities on the result of the PHQ-9 tool for the diagnosis of depression: Results from the COSYCONET cohort study.

Kammerl, I.E. ; Caniard, A. ; Merl-Pham, J. ; Ben-Nissan, G. ; Mayr, C.H. ; Mossina, A. ; Geerlof, A. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Sharon, M. ; Meiners, S.

Dissecting the molecular effects of cigarette smoke on proteasome function.
ACS Nano 13, 1029-1041 (2019)

Yang, L. ; Feuchtinger, A. ; Möller, W. ; Ding, Y. ; Kutschke, D. ; Möller, G. ; Schittny, J.C. ; Burgstaller, G. ; Hofmann, W. ; Stöger, T. ; Razansky, D. ; Walch, A.K. ; Schmid, O.

Three-dimensional quantitative co-mapping of pulmonary morphology and nanoparticle distribution with cellular resolution in non-dissected murine lungs.

Yamano, T. ; Steinert, M. ; Steer, B. ; Klein, L. ; Hammerschmidt, W. ; Adler, H.

B cells latently infected with murine gammaherpesvirus 68 (MHV-68) are present in the mouse thymus-A step toward immune evasion?
Clin. Exp. Allergy 49, 331-340 (2019)

Lau, M.Y.Z. ; Dharmage, S.C. ; Burgess, J.A. ; Win, A.K. ; Lowe, A.J. ; Lodge, C.J. ; Perret, J. ; Hui, J. ; Thomas, P.S. ; Giles, G. ; Thompson, B.R. ; Abramson, M.J. ; Walters, E.H. ; Matheson, M.C. ; Collaboration (Wjst, M.)

Early-life exposure to sibling modifies the relationship between CD14 polymorphisms and allergic sensitization.
Microb. Pathog. 126, 109-115 (2019)

Gao, C. ; Ding, Z. ; Qian, J. ; Liu, X. ; Zhang, X. ; Cong, Y. ; Ding, C. ; Yu, S. ; Hu, S. ; Stöger, T. ; Yin, R.

The virulence of NDV NA-1 strain regulated by the 3 ' leader or 5 ' trailer sequences.
IEEE Trans. Med. Imaging 38, 649-656 (2019)

Gradl, R. ; Morgan, K.S. ; Dierolf, M. ; Jud, C. ; Hehn, L. ; Günther, B. ; Möller, W. ; Kutschke, D. ; Yang, L. ; Stöger, T. ; Pfeiffer, D. ; Gleich, B. ; Achterhold, K. ; Schmid, O. ; Pfeiffer, F.

Dynamic in vivo chest x-ray dark field imaging in mice.
2018 in
München, Ludwig-Maximilians-Universität, Medizinische Fakultät, Diss., 2018, 188 S.

Welk, V.

Dissecting the role of proteasome activators in lung biology and disease.

Pepe, M. ; Pelizza, F. ; Lamort, A. ; Kanellakis, N.I. ; Stathopoulos, G.T.

Alteration patterns of tobacco carcinogens in lung adenocarcinoma reveal novel KRAS-addicted candidate oncogenes.

Fernandez, I.E. ; Sun, N. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Verleden, S. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Walch, A.K. ; Eickelberg, O.

Pharmacometabolic effect of pirfenidone treatment in IPF detected by high resolution MALDI-FTICR imaging.

De Santis, M. ; Ota, C. ; Costa, R. ; Doryab, A. ; Alsafadi, H.N. ; Bolukbas, D. ; Königshoff, M. ; Wagner, D.

Development of a hybrid alginate-ECM hydrogel as a potential bioink for 3D bioprinting.

Welk, V. ; Meul, T. ; Lukas, C. ; Bolukbas, D. ; Koch, I. ; Lindner, M. ; Meiners, S.

Analyzing the role of proteasome activator 200 (PA200) in lung cancer.

Knüppel, L. ; Heinzelmann, K. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

FKBP10 regulates fibroblast migration via synthesis of collagen VI.

Lamort, A. ; Weiss, S. ; Lillis, I. ; Armenis, V. ; Arendt, K.A.M. ; Pepe, M. ; Klotz, L.V. ; Marazioti, A. ; Spella, M. ; Giopanou, I. ; Ntaliarda, G. ; Giotopoulou, G.A. ; Lianou, M. ; Oplopoiou, M. ; Kauka, K. ; Jenne, D. ; Stathopoulos, G.T.

Tumor-derived granulocyte chemotactic protein 2 cooperates with neutrophil proteinase 3 to drive lung adenocarcinoma.

Fernandez, I.E. ; Greiffo, F.R. ; Roi, R. ; Behr, J. ; Forrest, A.R. ; Eickelberg, O.

Circulating MDSC modulate IPF progression by orchestrating immunosuppressive and pro-fibrotic networks.

Lambert, K.A. ; Lodge, C. ; Prendergast, L.A. ; Bowatte, G. ; Lowe, A. ; Wjst, M. ; Abramson, M.J. ; Dharmage, S.C. ; Erbas, B.

Associations between early life exposure to pollen and adolescent lung function are modified by residential greenness.

Costa, R. ; Wagner, D.E. ; De Santis, M. ; Bailey, K.E. ; Doryab, A. ; Schorpp, K.K. ; Rothenaigner, I. ; Ota, C. ; Baarsma, H.A. ; Campillos, M.J. ; Hadian, K. ; Königshoff, M.

Novel compounds for WNT/beta-catenin induced lung repair in chronic obstructive pulmonary disease.

Wartenberg, M. ; Andrault, P. ; Schamberger, A.C. ; Chazeirat, T. ; Sizaret, D. ; Renault, J. ; Petit, A. ; Saidi, A. ; Guyetant, S. ; Courty, Y. ; Eickelberg, O. ; Lalmanach, G. ; Lecaille, F.

Cigarette smoke induces overexpression of cathepsin S in active smokers with and without COPD.

Kindt-Dunjko, A. ; Foerster, K. ; Flemmer, A. ; Oak, P. ; Pomschar, A. ; Ertl-Wagner, B. ; Krumsiek, J. ; Hilgendorff, A.

Late Breaking Abstract - Protein signature stratifies severity of chronic lung disease in preterms after birth.

Schmid, O. ; Möller, W. ; Stelzl, A. ; Lund, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Krauss-Etschmann, S. ; Robichaud, A.

Preclinical experiments support recent clinical switch to delivered dose during methacholine bronchoprovocation testing.

Smirnova, N.F. ; Morrone, C. ; Conlon, T.M. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

A quantitative proteomics profiling of murine lung grafts indicates novel pathways associated with chronic lung allograft dysfunction.

Knüppel, L. ; Merl-Pham, J. ; Hennen, E. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

A proteomic analysis of extracellular matrix from idiopathic pulmonary fibrosis patient-derived fibroblasts in response to transforming growth factor beta 1.
Sci. Transl. Med. 10:eaan6735 (2018)

Tsai, J.M. ; Sinha, R. ; Seita, J. ; Fernhoff, N. ; Christ, S. ; Koopmans, T. ; Krampitz, G.W. ; McKenna, K.M. ; Xing, L. ; Sandholzer, M. ; Sales, J.H. ; Shoham, M. ; McCracken, M. ; Joubert, L.M. ; Gordon, S.R. ; Poux, N. ; Wernig, G. ; Norton, J.A. ; Weissman, I.L. ; Rinkevich, Y.

Surgical adhesions in mice are derived from mesothelial cells and can be targeted by antibodies against mesothelial markers.

Morrone, C. ; Smirnova, N.F. ; Kneidinger, N. ; Mann, M. ; Schiller, H.B. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Increased peribronchiolar and perivascular cysteine protease activity is associated with bronchiolitis obliterans syndrome.

Schittny, J.C. ; Möller, W. ; Holzwarth, U. ; Hirn, S. ; Wenk, A. ; Schleh, C. ; Schäffler, M. ; Haberl, N. ; Gibson, N. ; Kreyling, W.G.

Age-dependent deposition patterns and quantitative biokinetics of inhaled 20nm gold nanoparticles in rat lungs.

Conlon, T.M. ; Sarker, R.S. ; Jia, J. ; Heinzelmann, K. ; Tasdemir, D. ; Bayram, H. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Immuno-metabolomic regulation of B cell guided iBALT positioning drives cigarette smoke-induced COPD.

Foerster, K. ; Ertl-Wagner, B. ; Sass, S. ; Stoecklein, S. ; Schoeppe, F. ; Dietrich, O. ; Pomschar, A. ; Schulze, A. ; Huebener, C. ; Theis, F.J. ; Ehrhardt, H. ; Flemmer, A. ; Hilgendorff, A.

Quantitative MRI measurements to detect pulmonary hypertension in bronchopulomnary dysplasia.

Hu, Y. ; Skronska-Wasek, W. ; Ota, C. ; Mutze, K. ; Baarsma, H.A. ; Wagner, D.E. ; Lehmann, M. ; Bracke, K.R. ; Brusselle, G.G. ; Yildirim, A.Ö. ; Koenigshoff, M.

The progenitor cell marker LGR5 is reduced in epithelial cells in emphysema.

Foerster, K. ; Sass, S. ; Pomschar, A. ; Ehrhardt, H. ; Naehrlich, L. ; Schulze, A. ; Flemmer, A. ; Huebener, C. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Dietrich, O. ; Ertl-Wagner, B. ; Hilgendorff, A.

Diagnosis of bronchopulmonary dysplasia using magnetic resonance imaging analysis.

Heinzelmann, K. ; Gerckens, M. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Hilgendorff, A.

DPPIV expression in human lung fibroblasts affects phenotypic changes in fibrosis.

Oak, P. ; Koschlig, M. ; Pritzke, T. ; Foerster, K. ; Ahnert, P. ; Windhorst, A. ; Reicherzer, T. ; Ehrhardt, H. ; Hilgendorff, A.

Gender specific response of the neonatal lung to postnatal injury.

Fernandez, I.E. ; Sun, N. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Verleden, S. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Eickelberg, O. ; Walch, A.K.

Pharmacometabolic response to pirfenidone treatment in pulmonary fibrosis detected by high resolution MALDI FTICR-mass spectrometry imaging.

Preisendörfer, S. ; Knüppel, L. ; Ishikawa, Y. ; Binzenhöfer, L. ; Fernandez, I.E. ; Juan-Guardela, B.M. ; Ruppert, C. ; Guenther, A. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Kaminski, N. ; Schepers, A. ; Bachinger, H. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

FK506 binding protein 11, a plasma cell-specific antibody folding catalyst, is increased in pulmonary fibrosis.

Costa, R. ; Wagner, D.E. ; De Santis, M. ; Bailey, K.E. ; Doryab, A. ; Schorpp, K.K. ; Rothenaigner, I. ; Ota, C. ; Baarsma, H.A. ; Campillos, M. ; Hadian, K. ; Koenigshoff, M.

Drug repurposing for WNT/beta-catenin induced lung repair in chronic obstructive pulmonary disease.
Hum. Genomics 12:50 (2018)

Mahmutovic, L. ; Akcesme, B. ; Durakovic, C. ; Akcesme, F.B. ; Maric, A. ; Adilovic, M. ; Hamad, N. ; Wjst, M. ; Feeney, O. ; Semiz, S.

Perceptions of students in health and molecular life sciences regarding pharmacogenomics and personalized medicine.
Respir. Med. 145, 89-94 (2018)

Matthes, S. ; Stadler, J. ; Barton, J. ; Leuschner, G. ; Munker, D. ; Arnold, P. ; Villena-Hermoza, H. ; Frankenberger, M. ; Probst, P. ; Koch, A. ; Kneidinger, N. ; Milger, K. ; Behr, J. ; Neurohr, C.

Asthma features in severe COPD: Identifying treatable traits.
Arthritis Rheum. 70 (2018)

Thompson, G.A. ; Moura, M.C. ; Nelson, D. ; Hummel, A.M. ; Jenne, D. ; Fervenza, F. ; Hoffman, G.S. ; Kallenberg, C.G.M. ; Langford, C. ; McCune, J.W. ; Merkel, P.A. ; Monach, P.A. ; Seo, P. ; Spiera, R.F. ; St Clair, E.W. ; Ytterberg, S.R. ; Stone, J.H. ; Robinson, W.H. ; Pang, Y. ; Specks, U.

Characterization of preferential recognition of a chimeric recombinant proteinase 3 variant by anti-neutrophil cytoplasmic antibodies.
Front. Immunol. 9:979 (2018)

Ghosh, S. ; Drexler, I. ; Bhatia, S. ; Adler, H. ; Gennery, A.R. ; Borkhardt, A.

Interleukin-2-inducible T-cell kinase deficiency-new patients, new insight?
Front. Immunol. 9, 2197:979 (2018)

Ghosh, S. ; Drexler, I. ; Bhatia, S. ; Adler, H. ; Gennery, A.R. ; Borkhardt, A.

Erratum: Corrigendum: Interleukin-2-inducible T-cell kinase deficiency-new patients, new insight? (Frontiers in immunology (2018) 9 (979)).
Public Health Genomics 21, 19-20 (2018)

Oplopoiou, M. ; Kati, D. ; Ntaliarda, G. ; Giopanou, I. ; Papaleonidopoulos, V. ; Lilis, I. ; Stathopoulos, G.T.

Trp53 signaling in chemically induced lung adenocarcinoma.
EBioMedicine 36, 461-474 (2018)

Ng-Blichfeldt, J.P. ; Schrik, A. ; Kortekaas, R.K. ; Noordhoek, J.A. ; Heijink, I.H. ; Hiemstra, P.S. ; Stolk, J. ; Königshoff, M. ; Gosens, R.

Retinoic acid signaling balances adult distal lung epithelial progenitor cell growth and differentiation.
Cytokine, DOI: 10.1016/j.cyto.2018.08.006 (2018)

Magkouta, S. ; Kollintza, A. ; Moschos, C. ; Spella, M. ; Skianis, I. ; Pappas, A. ; Vazakidou, M.E. ; Stathopoulos, G.T. ; Kalomenidis, I.

Role of angiopoietins in mesothelioma progression.
ACS Nano 12, 7771-7790 (2018)

Kreyling, W.G. ; Möller, W. ; Holzwarth, U. ; Hirn, S. ; Wenk, A. ; Schleh, C. ; Schäffler, M. ; Haberl, N. ; Gibson, N. ; Schittny, J.C.

Age-dependent rat lung deposition patterns of inhaled 20 manometer gold nanoparticles and their quantitative biokinetics in adult rats.
Transboundary Emer. Dis. 65, 1421-1428 (2018)

Chen, Y. ; Ding, Z. ; Liu, X. ; Chen, J. ; Li, J. ; Fei, Y. ; Liu, Z. ; Stöger, T. ; Bi, Y. ; Yin, R.

Biological and phylogenetic characterization of a novel hemagglutination-negative avian avulavirus 6 isolated from wild waterfowl in China.
Aging 10, 2122-2135 (2018)

Prange, R. ; Thiedmann, M. ; Bhandari, A. ; Mishra, N. ; Sinha, A. ; Häsler, R. ; Rosenstiel, P. ; Uliczka, K. ; Wagner, C. ; Yildirim, A.Ö. ; Fink, C. ; Roeder, T.

A Drosophila model of cigarette smoke induced COPD identifies Nrf2 signaling as an expedient target for intervention.

Roth, C.J. ; Förster, K. ; Hilgendorff, A. ; Ertl-Wagner, B. ; Wall, W.A. ; Flemmer, A.W.

Gas exchange mechanisms in preterm infants on HFOV - a computational approach.

Lehmann, M. ; Buhl, L. ; Alsafadi, H.N. ; Klee, S. ; Hermann, S. ; Mutze, K. ; Ota, C. ; Lindner, M. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Wagner, D.E. ; Königshoff, M.

Differential effects of Nintedanib and Pirfenidone on lung alveolar epithelial cell function in ex vivo murine and human lung tissue cultures of pulmonary fibrosis.

Ota, C. ; Ng-Blichfeldt, J.P. ; Korfei, M. ; Alsafadi, H.N. ; Lehmann, M. ; Skronska-Wasek, W. ; De Santis, M. ; Guenther, A. ; Wagner, D.E. ; Königshoff, M.

Dynamic expression of HOPX in alveolar epithelial cells reflects injury and repair during the progression of pulmonary fibrosis.
Eur. Respir. J. 52:1601355 (2018)

De Santis, M. ; Bolukbas, D.A. ; Lindstedt, S. ; Wagner, D.E.

How to build a lung: Latest advances and emerging themes in lung bioengineering.

Sun, N. ; Fernandez, I.E. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Feuchtinger, A. ; Burgstaller, G. ; Verleden, S.E. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Eickelberg, O. ; Walch, A.K.

Pharmacometabolic response to pirfenidone in pulmonary fibrosis detected by MALDI-FTICR-MSI.

Martin-Medina, A. ; Lehmann, M. ; Burgy, O. ; Hermann, S. ; Baarsma, H.A. ; Wagner, D.E. ; De Santis, M. ; Ciolek, F. ; Hofer, T.P. ; Frankenberger, M. ; Aichler, M. ; Lindner, M. ; Gesierich, W. ; Guenther, A. ; Walch, A.K. ; Coughlan, C. ; Wolters, P.  ; Lee, J.S. ; Behr, J. ; Königshoff, M.

Increased extracellular vesicles mediate WNT5A signaling in idiopathic pulmonary fibrosis.

Schmitzer, M. ; Winter, H. ; Kneidinger, N. ; Meimarakis, G. ; Dick, A. ; Schramm, R. ; Klotz, L.V. ; Preissler, G. ; Strobl, N. ; von Dossow, V. ; Schneider, C. ; Weig, T. ; Hatz, R. ; Kauke, T.

Persistence of de novo donor-specific HLA-antibodies after lung transplantation: A potential marker of decreased patient survival.
Ann. Neurol. 84, 315-328 (2018)

Spadaro, M. ; Winklmeier, S. ; Beltrán, E. ; Macrini, C. ; Höftberger, R. ; Schuh, E. ; Thaler, F.S. ; Gerdes, L.A. ; Laurent, S.A. ; Gerhards, R. ; Brändle, S. ; Dornmair, K. ; Breithaupt, C. ; Krumbholz, M. ; Moser, M. ; Kirshnamoorthy, G. ; Kamp, F. ; Jenne, D. ; Hohlfeld, R. ; Kümpfel, T. ; Lassmann, H. ; Kawakami, N. ; Meinl, E.

Pathogenicity of human antibodies against myelin oligodendrocyte glycoprotein.
Cancer Res. 78, 3634-3644 (2018)

Magkrioti, C. ; Oikonomou, N. ; Kaffe, E. ; Mouratis, M.A. ; Xylourgidis, N. ; Barbayianni, I. ; Megadoukas, P. ; Harokopos, V. ; Valavanis, C. ; Chun, J. ; Kosma, A. ; Stathopoulos, G.T. ; Bouros, E. ; Bouros, D. ; Syrigos, K. ; Aidinis, V.

The autotaxin - lysophosphatidic acid axis promotes lung carcinogenesis.
In:. 2018.:180040 (Eur. Respir. Rev. ; 27)

Meiners, S. ; Lloyd, C. ; Chambers, R.C.

Cell–matrix interactions in lung disease and regeneration: ERS lung science conference 2018 report.

Heinzelmann, K. ; Lehmann, M. ; Gerckens, M. ; Noskovicova, N. ; Frankenberger, M. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O.

Cell-surface phenotyping identifies CD36 and CD97 as novel markers of fibroblast quiescence in lung fibrosis.
Lancet Oncol. 19, 930-939 (2018)

Psallidas, I. ; Kanellakis, N.I. ; Gerry, S. ; Thézénas, M.L. ; Charles, P.D. ; Samsonova, A. ; Schiller, H. B. ; Fischer, R. ; Asciak, R. ; Hallifax, R.J. ; Mercer, R. ; Dobson, M. ; Dong, T. ; Pavord, I.D. ; Collins, G.S. ; Kessler, B.M. ; Pass, H.I. ; Maskell, N. ; Stathopoulos, G.T. ; Rahman, N.M.

Development and validation of response markers to predict survival and pleurodesis success in patients with malignant pleural effusion (PROMISE): A multicohort analysis.

Seren, S. ; Rashed Abouzaid, M. ; Eulenberg-Gustavus, C. ; Hirschfeld, J. ; Soliman, H. ; Jerke, U. ; N'Guessan, K. ; Dallet-Choisy, S. ; Lesner, A. ; Lauritzen, C. ; Schacher, B. ; Eickholz, P. ; Nagy, N. ; Széll, M. ; Croix, C. ; Viaud-Massuard, M.C. ; Al Farraj Aldosari, A. ; Ragunatha, S. ; Ibrahim Mostafa, M. ; Giampieri, F. ; Battino, M. ; Cornillier, H. ; Lorette, G. ; Stephan, J.L. ; Goizet, C. ; Pedersen, J. ; Gauthier, F. ; Jenne, D. ; Marchand-Adam, S. ; Chapple, I.L. ; Kettritz, R. ; Korkmaz, B.

Consequences of cathepsin C inactivation for membrane exposure of proteinase 3, the target antigen in autoimmune vasculitis.
Nanoscale 10, 11564-11577 (2018)

Yang, L. ; Kuang, H. ; Zhang, W. ; Wei, H. ; Xu, H.

Quantum dots cause acute systemic toxicity in lactating rats and growth restriction of offspring.

Götzfried, J. ; Smirnova, N.F. ; Morrone, C. ; Korkmaz, B. ; Yildirim, A.Ö. ; Eickelberg, O. ; Jenne, D.

Preservation with alpha(1)-antitrypsin improves primary graft function of murine lung transplants.
Pflugers Arch. 47, 1231–1241 (2018)

Kannler, M. ; Lüling, R. ; Yildirim, A.Ö. ; Gudermann, T. ; Steinritz, D. ; Dietrich, A.

TRPA1 channels: Expression in non-neuronal murine lung tissues and dispensability for hyperoxia-induced alveolar epithelial hyperplasia.
Transl. Res., DOI: 10.1016/j.trsl.2018.03.003 (2018)

Meiners, S. ; Evankovich, J. ; Mallampalli, R.K.

The ubiquitin proteasome system as a potential therapeutic target for systemic sclerosis.

Reicherzer, T. ; Häffner, S. ; Shahzad, T. ; Gronbach, J. ; Mysliwietz, J. ; Huebener, C. ; Hasbargen, U. ; Gertheiss, J. ; Schulze, A. ; Bellusci, S. ; Morty, R.E. ; Hilgendorff, A. ; Ehrhardt, H.

Activation of the NF-kappa B pathway alters the phenotype of MSCs in the tracheal aspirates of preterm infants with severe BPD.

Saxon, J.A. ; Yu, H. ; Polosukhin, V.V. ; Stathopoulos, G.T. ; Gleaves, L.A. ; McLoed, A.G. ; Massion, P.P. ; Yull, F.E. ; Zhao, Z. ; Blackwell, T.S.

P52 expression enhances lung cancer progression.

Gradl, R. ; Dierolf, M. ; Guenther, B. ; Hehn, L. ; Möller, W. ; Kutschke, D. ; Yang, L. ; Donnelley, M. ; Murrie, R. ; Erl, A. ; Stöger, T. ; Gleich, B. ; Achterhold, K. ; Schmid, O. ; Pfeiffer, F. ; Morgan, K.S.

In vivo dynamic phase-contrast X-ray Imaging using a compact light source.

Zhang, W. ; Ohno, S. ; Steer, B. ; Klee, S. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Wagner, D.E. ; Lehmann, M. ; Stöger, T. ; Königshoff, M. ; Adler, H.

S100a4 is secreted by alternatively activated alveolar macrophages and promotes activation of lung fibroblasts in pulmonary fibrosis.

Zhang, P. ; Ding, Z. ; Liu, X. ; Chen, Y. ; Li, J. ; Tao, Z. ; Fei, Y. ; Xue, C. ; Qian, J. ; Wang, X. ; Li, Q. ; Stöger, T. ; Chen, J. ; Bi, Y. ; Yin, R.

Enhanced replication of virulent Newcastle disease virus in chicken macrophages is due to polarized activation of cells by inhibition of TLR7.
Cancer Res. 78, 2939-2951 (2018)

Vreka, M. ; Lilis, I. ; Papageorgopoulou, M. ; Giotopoulou, G.A. ; Lianou, M. ; Giopanou, I. ; Kanellakis, N.I. ; Spella, M. ; Agalioti, T. ; Armenis, V. ; Goldmann, T. ; Marwitz, S. ; Yull, F.E. ; Blackwell, T.S. ; Pasparakis, M. ; Marazioti, A. ; Stathopoulos, G.T.

IkB kinase a Is required for development and progression of KRAS-mutant lung adenocarcinoma.

Knüppel, L. ; Heinzelmann, K. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

FK506-binding protein 10 (FKBP10) regulates lung fibroblast migration via collagen VI synthesis.
J. Innate Immun. 10, 487-501 (2018)

Hartl, D. ; Tirouvanziam, R. ; Laval, J. ; Greene, C.M. ; Habiel, D.M. ; Sharma, L. ; Yildirim, A.Ö. ; Dela Cruz, C.S. ; Hogaboam, C.M.

Innate immunity of the lung: From basic mechanisms to translational medicine.
2018 in
In: Abstract submission (American Thoracic Society (ATS) International Conference 2018, 18-23 May 2018, American Thoracic Society (ATS) International Conference 2018). 2018.:13993 - Fractalkine/CX3CR1 Axis ( ; Annual)

Greiffo, F.R. ; Frankenberger, M. ; Dietel, D. ; Ortega-Gomez, A. ; Behr, J. ; Soehnlein, O. ; Fernandez, I.E. ; Eickelberg, O.

Fractalkine/CX3CR1 axis drives kinetic changes of monocytes in fibrotic Interstitial Lung Disease.

Dehmel, S. ; Nathan, P. ; Bartel, S. ; El-Mehrie, N. ; Scherb, H. ; Milger, K. ; John-Schuster, G. ; Yildirim, A.Ö. ; Hyklema, M. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Schaub, B. ; Eickelberg, O. ; Krauss-Etschmann, S.

Intrauterine smoke exposure deregulates lung function, pulmonary transcriptomes, and in particular insulin-like growth factor (IGF)-1 in a sex-specific manner.
Nat. Cell Biol. 20, 422-431 (2018)

Jiang, D. ; Correa-Gallegos, D. ; Christ, S. ; Stefanska, A. ; Liu, J. ; Ramesh, P. ; Rajendran, V. ; De Santis, M. ; Wagner, D.E. ; Rinkevich, Y.

Two succeeding fibroblastic lineages drive dermal development and the transition from regeneration to scarring.

Jia, J. ; Conlon, T.M. ; Sarker, R.S. ; Taşdemir, D. ; Smirnova, N.F. ; Srivastava, B. ; Verleden, S.E. ; Güneş, G. ; Wu, X. ; Prehn, C. ; Gao, J. ; Heinzelmann, K. ; Lintelmann, J. ; Irmler, M. ; Pfeiffer, S. ; Schloter, M. ; Zimmermann, R. ; Hrabě de Angelis, M. ; Beckers, J. ; Adamski, J. ; Bayram, H. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Cholesterol metabolism promotes B-cell positioning during immune pathogenesis of chronic obstructive pulmonary disease.

Guarino, C. ; Gruba, N. ; Grzywa, R. ; Dyguda-Kazimierowicz, E. ; Hamon, Y. ; Łȩgowska, M. ; Skoreński, M. ; Dallet-Choisy, S. ; Marchand-Adam, S. ; Kellenberger, C. ; Jenne, D. ; Sieńczyk, M. ; Lesner, A. ; Gauthier, F. ; Korkmaz, B.

Exploiting the S4-S5 Specificity of Human Neutrophil Proteinase 3 to Improve the Potency of Peptidyl Di(chlorophenyl)-phosphonate Ester Inhibitors: A Kinetic and Molecular Modeling Analysis.

Noskovicova, N. ; Heinzelmann, K. ; Burgstaller, G. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.

Cub domain-containing protein 1 negatively regulates TGF-β signaling and myofibroblast differentiation.
JCI insight 3:93203 (2018)

Houssaini, A. ; Breau, M. ; Kebe, K. ; Abid, S. ; Marcos, E. ; Lipskaia, L. ; Rideau, D. ; Parpaleix, A. ; Huang, J. ; Amsellem, V. ; Vienney, N. ; Validire, P. ; Maitre, B. ; Attwe, A. ; Lukas, C. ; Vindrieux, D. ; Boczkowski, J. ; Derumeaux, G. ; Pende, M. ; Bernard, D. ; Meiners, S. ; Adnot, S.

mTOR pathway activation drives lung cell senescence and emphysema.

Shandilya, N. ; Ligthart, T. ; van Voorde, I. ; Stahlmecke, B. ; Clavaguera, S. ; Philippot, C. ; Ding, Y. ; Goede, H.

A nanomaterial release model for waste shredding using a Bayesian belief network.
Pediatrics 141:e20170889 (2018)

Lai, T. ; Wu, M. ; Liu, J. ; Luo, M.C. ; He, L. ; Wang, X. ; Wu, B.L. ; Ying, S. ; Chen, Z. ; Li, W. ; Shen, H.

Acid-suppressive drug use during pregnancy and the risk of childhood asthma: A meta-analysis.

Marazioti, A. ; Lilis, I. ; Vreka, M. ; Apostolopoulou, H. ; Kalogeropoulou, A. ; Giopanou, I. ; Giotopoulou, G.A. ; Krontira, A.C. ; Iliopoulou, M. ; Kanellakis, N.I. ; Agalioti, T. ; Giannou, A.D. ; Jones-Paris, C. ; Iwakura, Y. ; Kardamakis, D. ; Blackwell, T.S. ; Taraviras, S. ; Spella, M. ; Stathopoulos, G.T.

Myeloid-derived interleukin-1β drives oncogenic KRAS-NF-κΒ addiction in malignant pleural effusion.

Hellbach, K. ; Meinel, F.G. ; Conlon, T.M. ; Willer, K. ; Yaroshenko, A. ; Velroyen, A. ; Braunagel, M. ; Auweter, S. ; Reiser, M.F. ; Eickelberg, O. ; Pfeiffer, F. ; Yildirim, A.Ö.

X-ray dark-field imaging to depict acute lung inflammation in mice.

Rozman, J. ; Rathkolb, B. ; Oestereicher, M.A. ; Schütt, C. ; Ravindranath, A.C. ; Leuchtenberger, S. ; Sharma, S. ; Kistler, M. ; Willershäuser, M. ; Brommage, R. ; Meehan, T.F. ; Mason, J. ; Haselimashhadi, H. ; Hough, T. ; Mallon, A.-M. ; Wells, S. ; Santos, L. ; Lelliott, C.J. ; White, J.K. ; Sorg, T. ; Champy, M.-F. ; Bower, L.R. ; Reynolds, C.L. ; Flenniken, A.M. ; Murray, S.A. ; Nutter, L.M.J. ; Svenson, K.L. ; West, D. ; Tocchini-Valentini, G.P. ; Beaudet, A.L. ; Bosch, F. ; Braun, R.B. ; Dobbie, M.S. ; Gao, X. ; Herault, Y. ; Moshiri, A. ; Moore, B.A. ; Kent Lloyd, K.C. ; McKerlie, C. ; Masuya, H. ; Tanaka, N. ; Flicek, P. ; Parkinson, H.E. ; Sedlacek, R. ; Seong, J.K. ; Wang, C.-K.L. ; Moore, M. ; Brown, S.D. ; Tschöp, M.H. ; Wurst, W. ; Klingenspor, M. ; Wolf, E. ; Beckers, J. ; Machicao, F. ; Peter, A. ; Staiger, H. ; Häring, H.-U. ; Grallert, H. ; Campillos, M. ; Maier, H. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Werner, T. ; Hrabě de Angelis, M. ; IMPC Consortium (Eickelberg, O.) ; IMPC Consortium (Yildirim, A.Ö.)

Identification of genetic elements in metabolism by high-throughput mouse phenotyping.  

Burgstaller, G. ; Sengupta, A. ; Vierkotten, S. ; Preissler, G. ; Lindner, M. ; Behr, J. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O.

Distinct niches within the extracellular matrix dictate fibroblast function in (cell free) 3D lung tissue cultures.

Maldonado, M. ; Salgado-Aguayo, A. ; Herrera, I. ; Cabrera, S. ; Ortíz-Quintero, B. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Eickelberg, O. ; Ramírez, R. ; Manicone, A.M. ; Selman, M. ; Pardo, A.

Upregulation and nuclear location of MMP28 in alveolar epithelium of idiopathic pulmonary fibrosis.
Pharmacol. Ther. 187, 150-166 (2018)

Skronska-Wasek, W. ; Gosens, R. ; Königshoff, M. ; Baarsma, H.A.

WNT receptor signalling in lung physiology and pathology.
Biotechnol. J. 13:1700341 (2018)

Zscheppang, K. ; Berg, J.V. ; Hedtrich, S. ; Verheyen, L. ; Wagner, D.E. ; Suttorp, N. ; Hippenstiel, S. ; Hocke, A.C.

Human pulmonary 3D models for translational research.

Förster, K. ; Sass, S. ; Ehrhardt, H. ; Mous, D.S. ; Rottier, R.J. ; Oak, P. ; Schulze, A. ; Flemmer, A.W. ; Gronbach, J. ; Hübener, C. ; Desai, T. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Hilgendorff, A.

Early identification of bronchopulmonary dysplasia using novel biomarkers by proteomic screening.
J. Community Genet. 9, 103-116 (2018)

Borry, P. ; Bentzen, H.B. ; Budin-Ljøsne, I. ; Cornel, M.C. ; Howard, H.C. ; Feeney, O. ; Jackson, L. ; Mascalzoni, D. ; Mendes, Á. ; Peterlin, B. ; Riso, B. ; Shabani, M. ; Skirton, H. ; Sterckx, S. ; Vears, D. ; Wjst, M. ; Felzmann, H.

The challenges of the expanded availability of genomic information: An agenda-setting paper.
Microb. Ecol. 75, 529-542 (2018)

Kostric, M. ; Milger, K. ; Krauss-Etschmann, S. ; Engel, M. ; Vestergaard, G. ; Schloter, M. ; Schöler, A.

Development of a stable lung microbiome in healthy neonatal mice.

Leuschner, G. ; Stocker, F. ; Veit, T. ; Kneidinger, N. ; Winter, H. ; Schramm, R. ; Weig, T. ; Matthes, S. ; Ceelen, F. ; Arnold, P. ; Munker, D. ; Klenner, F. ; Hatz, R. ; Frankenberger, M. ; Behr, J. ; Neurohr, C.

Outcome of lung transplantation in idiopathic pulmonary fibrosis with previous anti-fibrotic therapy.
In:. 2017. 323-326 (Breathe ; 13)

Almendros, I. ; Bartel, S. ; Bostantzoglou, C. ; Jubrail, J. ; Lehmann, M. ; Wagner, D.E.

Early career members at the ers lsc 2017: Mechanistic overlap between chronic lung injury and cancer.

Maldonado, M. ; Salgado-Aguayo, A. ; Herrera, I. ; Ortiz, B. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Selman, M. ; Pardo, A.

MMP28 is overexpressed in bronchial and alveolar epithelial cells in Idiopathic Pulmonary Fibrosis.
Oncotarget 8, 114019-114030 (2017)

Giopanou, I. ; Lilis, I. ; Papadaki, H. ; Papadas, T. ; Stathopoulos, G.T.

A link between ReIB expression and tumor progression in laryngeal cancer.

Hellbach, K. ; Yaroshenko, A. ; Willer, K. ; Conlon, T.M. ; Braunagel, M.B. ; Auweter, S. ; Yildirim, A.Ö. ; Eickelberg, O. ; Pfeiffer, F. ; Reiser, M.F. ; Meinel, F.G.

X-ray dark-field radiography facilitates the diagnosis of pulmonary fibrosis in a mouse model.
J. Aerosol Med. Pulm. Drug Deliv. 30, 411-424 (2017)

Schmid, O. ; Jud, C. ; Umehara, Y. ; Mueller, D. ; Bucholski, A. ; Gruber, F. ; Denk, O. ; Egle, R. ; Petri-Fink, A. ; Rothen-Rutishauser, B.M.

Biokinetics of aerosolized liposomal ciclosporin A in human lung cells in vitro using an air-liquid cell interface exposure system.
Mult. Scler. J. 23, 976-976 (2017)

Spadaro, M. ; Winklmeier, S. ; Beltran, E. ; Macrini, C. ; Hoeftberger, R. ; Schuh, E. ; Thaler, F.S. ; Gerdes, L.A. ; Laurent, S.A. ; Gerhards, R. ; Braendle, S. ; Dornmair, K. ; Moser, M. ; Krishnamoorthy, G. ; Kamp, F. ; Jenne, D. ; Hohlfeld, R. ; Kmpfel, T. ; Lassmann, H. ; Kawakami, N. ; Meinl, E.

Pathogenic mechanisms of human autoantibodies against myelin oligodendrocyte glycoprotein.

Voigt, C. ; May, P. ; Gottschlich, A. ; Markota, A. ; Wenk, D. ; Gerlach, I. ; Voigt, S. ; Stathopoulos, G.T. ; Arendt, K.A.M. ; Heise, C. ; Rataj, F. ; Janssen, K.P. ; Königshoff, M. ; Winter, H. ; Himsl, I. ; Thasler, W.E. ; Schnurr, M. ; Rothenfußer, S. ; Endres, S. ; Kobold, S.

Cancer cells induce interleukin-22 production from memory CD4+T cells via interleukin-1 to promote tumor growth.
Eur. Respir. Rev. 26:170073 (2017)

Brandsma, C.A. ; de Vries, M. ; Costa, R. ; Woldhuis, R.R. ; Königshoff, M. ; Timens, W.

Lung ageing and COPD: Is there a role for ageing in abnormal tissue repair?

Ryerson, C.J. ; Corte, T.J. ; Lee, J.S. ; Richeldi, L. ; Walsh, S.L.F. ; Myers, J.L. ; Behr, J. ; Cottin, V. ; Danoff, S.K. ; Flaherty, K.R. ; Lederer, D.J. ; Lynch, D.A. ; Martinez, F.J. ; Raghu, G. ; Travis, W.D. ; Udwadia, Z. ; Wells, A.U. ; Collard, H.R.

A standardized diagnostic ontology for fibrotic interstitial lung disease. An International Working Group Perspective.

Egaña, I. ; Kaito, H. ; Nitzsche, A. ; Becker, L. ; Ballester-Lopez, C. ; Niaudet, C. ; Petkova, M. ; Liu, W. ; Vandlandewijck, M. ; Vernaleken, A. ; Klopstock, T. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Hrabě de Angelis, M. ; Rask-Andersen, H. ; Johansson, H.J. ; Lehtiö, J. ; He, L. ; Yildirim, A.Ö. ; Hellström, M. ; German Mouse Clinic Consortium (Aguilar-Pimentel, J.A. ; Ollert, M. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Amarie, O.V. ; Graw, J. ; Beckers, J. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Zimprich, A. ; Wurst, W. ; Moreth, K. ; Bekeredjian, R. ; Neff, F. ; Calzada-Wack, J. ; Rácz, I. ; Zimmer, A. ; Rathkolb, B. ; Wolf, E. ; Rozman, J. ; Klingenspor, M. ; Stöger, T. ; Eickelberg, O. ; Treise, I. ; Busch, D.H. ; Östereicher, M.A. ; Steinkamp, R. ; Lengger, C. ; Maier, H. ; Stoeger, C. ; Leuchtenberger, S.)

Female mice lacking Pald1 exhibit endothelial cell apoptosis and emphysema.
Nervenarzt 88, 1395–1401 (2017)

Tacke, U. ; Weigand-Brunnhölzl, H. ; Hilgendorff, A. ; Giese, R.M. ; Flemmer, A.W. ; König, H. ; Warken-Madelung, B. ; Arens, M. ; Hesse, N. ; Schroeder, A.S.

Entwicklungsneurologie – vernetzte Medizin und neue Perspektiven.

Bowl, M.R. ; Simon,  M.M. ; Ingham, N.J. ; Greenaway, S. ; Santos, L. ; Cater, H. ; Taylor, S. ; Mason, J. ; Kurbatova, N. ; Pearson, S. ; Bower, L.R. ; Clary, D. ; Meziane, H. ; Reilly, P. ; Minowa, O. ; Kelsey, L. ; Tocchini-Valentini, G.P. ; Gao, X. ; Bradley, A. ; Skarnes, W.C. ; Moore, M. ; Beaudet, A.L. ; Justice, M.J. ; Seavitt, J.R. ; Dickinson, M.E. ; Wurst, W. ; Hrabě de Angelis, M. ; Herault, Y. ; Wakana, S. ; Nutter, L.M.J. ; Flenniken, A.M. ; McKerlie, C. ; Murray, S.A. ; Svenson, K.L. ; Braun, R.E. ; West, D.B. ; Llyod, K.C.K. ; Adams, D.J. ; White, J. ; Karp, N. ; Flicek, P. ; Smedley, D. ; Meehan, T.F. ; Parkinson, H.E. ; Teboul, L. ; Wells, S. ; Steel, K.P. ; Mallon, A.M. ; Brown, S.D. ; International Mouse Phenotyping Consortium (Beig, J. ; Bürger, A. ; Giesert, F. ; Graw, J. ; Kühn, R. ; Oritz, O. ; Schick, J. ; Seisenberger, C. ; Amarie, O.V. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Zimprich, A. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Beckers, J. ; Brommage, R. ; Calzada-Wack, J. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Lengger, C. ; Leuchtenberger, S. ; Maier, H. ; Marschall, S. ; Moreth, K. ; Neff, F. ; Östereicher, M.A. ; Rozman, J. ; Steinkamp, R. ; Stoeger, C. ; Treise, I. ; Stöger, T. ; Yildirim, A.Ö. ; Becker, L. ; Rathkolb, B. ; Eickelberg, O. ; Schmidt-Weber, C.B.)

A large scale hearing loss screen reveals an extensive unexplored genetic landscape for auditory dysfunction.
FASEB J. 32, 703-716 (2017)

Mümmler, C. ; Burgy, O. ; Hermann, S. ; Mutze, K. ; Günther, A. ; Königshoff, M.

Cell-specific expression of runt-related transcription factor 2 contributes to pulmonary fibrosis.
Behav. Brain Res. 352, 187-196 (2017)

Fuchs, H. ; Aguilar-Pimentel, A. ; Amarie, O.V. ; Becker, L. ; Calzada-Wack, J. ; Cho, Y.-L. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Irmler, M. ; Kistler, M. ; Kraiger, M. ; Mayer-Kuckuk, P. ; Moreth, K. ; Rathkolb, B. ; Rozman, J. ; da Silva Buttkus, P. ; Treise, I. ; Zimprich, A. ; Gampe, K. ; Hutterer, C. ; Leuchtenberger, S. ; Maier, H. ; Miller, M. ; Scheideler, A. ; Wu, M. ; Beckers, J. ; Bekeredjian, R. ; Brielmeier, M. ; Busch, D.H. ; Klingenspor, M. ; Klopstock, T. ; Ollert, M. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Stöger, T. ; Wolf, E. ; Wurst, W. ; Yildirim, A.Ö. ; Zimmer, A. ; Gailus-Durner, V. ; Hrabě de Angelis, M.

Understanding gene functions and disease mechanisms: Phenotyping pipelines in the German Mouse Clinic.
Eur. Respir. Rev. 26:170021 (2017)

Greiffo, F.R. ; Eickelberg, O. ; Fernandez, I.E.

Systems medicine advances in interstitial lung disease.

Johnston, B.D. ; Kreyling, W.G. ; Pfeiffer, C. ; Schäffler, M. ; Sarioglu, H. ; Ristig, S. ; Hirn, S. ; Haberl, N. ; Thalhammer, S. ; Hauck, S.M. ; Semmler-Behnke, M. ; Epple, M. ; Hühn, J. ; del Pino, P. ; Parak, W.J.

Colloidal stability and surface chemistry are key factors for the composition of the protein corona of inorganic gold nanoparticles.
Allergy 72, 59-59 (2017)

Bartel, S. ; Jatzlauk, G. ; Kepert, I. ; Fonseca, J. ; Müller, C. ; Milger, K. ; Hochwind, K. ; Kostric, M. ; Eickelberg, O. ; Schloter, M. ; Hartmann, A. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Krauss-Etschmann, S.

The metabolite D-tryptophan from probiotic bacteria ameliorates allergic airway disease and influences the gut microbiome.

Röhm, M. ; Carle, S. ; Maigler, F. ; Flamm, J. ; Kramer, V. ; Mavoungou, C. ; Schmid, O. ; Schindowski, K.

A comprehensive screening platform for aerosolizable protein formulations for intranasal and pulmonary drug delivery.
Immunol. Res. 65, 1065–1073 (2017)

Xu, Q. ; Liu, X. ; Wang, X. ; Hua, Y. ; Chen, J. ; Li, J. ; Wang, Y. ; Stöger, T. ; Chen, S. ; Huang, N.

Growth arrest-specific protein 7 regulates the murine M1 alveolar macrophage polarization.
EMBO Mol. Med. 9, 1504-1520 (2017)

Oak, P. ; Pritzke, T. ; Thiel, I. ; Koschlig, M. ; Mous, D.S. ; Windhorst, A. ; Jain, N. ; Eickelberg, O. ; Foerster, K. ; Schulze, A. ; Goepel, W. ; Reicherzer, T. ; Ehrhardt, H. ; Rottier, R.J. ; Ahnert, P. ; Gortner, L. ; Desai, T.J. ; Hilgendorff, A.

Attenuated PDGF signaling drives alveolar and microvascular defects in neonatal chronic lung disease.
Placenta 57, 144-151 (2017)

Segura, M.T. ; Demmelmair, H. ; Krauss-Etschmann, S. ; Nathan, P. ; Dehmel, S. ; Padilla, M.C. ; Rueda, R. ; Koletzko, B. ; Campoy, C.

Maternal BMI and gestational diabetes alter placental lipid transporters and fatty acid composition.
Thorax 72, 1007-1020 (2017)

Milger, K. ; Yu, Y. ; Brudy, E. ; Irmler, M. ; Skapenko, A. ; Mayinger, M. ; Lehmann, M. ; Beckers, J. ; Reichenberger, F. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Königshoff, M. ; Krauss-Etschmann, S.

Pulmonary CCR2+CD4+  T cells are immune regulatory and attenuate lung fibrosis development.
Mol. Cell. Oncol. 4:e1345711 (2017)

Spella, M. ; Marazioti, A. ; Arendt, K.A.M. ; Stathopoulos, G.T.

RAS oncogenes direct metastasis.

Lehmann, M. ; Korfei, M. ; Mutze, K. ; Klee, S. ; Skronska-Wasek, W. ; Alsafadi, H.N. ; Ota, C. ; Costa, R. ; Schiller, H. B. ; Lindner, M. ; Wagner, A. ; Günther, A.L. ; Königshoff, M.

Senolytic drugs target alveolar epithelial cell function and attenuate experimental lung fibrosis ex vivo.
Eur. Respir. Rev. 26:170048 (2017)

Spella, M. ; Lilis, I. ; Stathopoulos, G.T.

Shared epithelial pathways to lung repair and disease.
PLoS ONE 12:e0180859 (2017)

Engel, M. ; Endesfelder, D. ; Schloter-Hai, B. ; Kublik, S. ; Granitsiotis, M.S. ; Boschetto, P. ; Stendardo, M. ; Barta, I. ; Döme, B. ; Deleuze, J.F. ; Boland, A. ; Müller-Quernheim, J. ; Prasse, A. ; Welte, T. ; Hohlfeld, J. ; Subramanian, D. ; Parr, D. ; Gut, I.G. ; Greulich, T. ; Koczulla, A.R. ; Nowinski, A. ; Gorecka, D. ; Singh, D. ; Gupta, S. ; Brightling, C.E. ; Hoffmann, H. ; Frankenberger, M. ; Hofer, T.P. ; Burggraf, D. ; Heiss-Neumann, M.S. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Schloter, M. ; zu Castell, W.

Influence of lung CT changes in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) on the human lung microbiome.

Gradl, R. ; Dierolf, M. ; Hehn, L. ; Günther, B. ; Yildirim, A.Ö. ; Gleich, B. ; Achterhold, K. ; Pfeiffer, F. ; Morgan, K.S.

Propagation-based phase-contrast x-ray imaging at a compact light source.

Burgstaller, G. ; Oehrle, B. ; Gerckens, M. ; White, E.S. ; Schiller, H. B. ; Eickelberg, O.

The instructive extracellular matrix of the lung: Basic composition and alterations in chronic lung disease.

Schiller, H. B. ; Mayr, C.H. ; Leuschner, G. ; Strunz, M. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Preisendörfer, S. ; Eckes, B. ; Moinzadeh, P. ; Krieg, T. ; Schwartz, D.A. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Mann, M. ; Eickelberg, O.

Deep proteome profiling reveals common prevalence of MZB1-positive plasma B cells in human lung and skin fibrosis.

Manfrini, N. ; Ricciardi, S. ; Miluzio, A. ; Fedeli, M. ; Scagliola, A. ; Gallo, S. ; Brina, D. ; Adler, T. ; Busch, D.H. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Biffo, S.

High levels of eukaryotic Initiation Factor 6 (eIF6) are required for immune system homeostasis and for steering the glycolytic flux of TCR-stimulated CD4+ T cells in both mice and humans.

Karp, N.A. ; Mason, J. ; Beaudet, A.L. ; Benjamini, Y. ; Bower, L. ; Braun, R.E. ; Brown, S.D.M. ; Chesler, E.J. ; Dickinson, M.E. ; Flenniken, A.M. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Gao, X. ; Guo, S. ; Greenaway, S. ; Heller, R. ; Herault, Y. ; Justice, M.J. ; Kurbatova, N. ; Lelliott, C.J. ; Lloyd, K.C.K. ; Mallon, A.M. ; Mank, J.E. ; Masuya, H. ; McKerlie, C. ; Meehan, T.F. ; Mott, R.F. ; Murray, S.A. ; Parkinson, H. ; Ramirez-Solis, R. ; Santos, L. ; Seavitt, J.R. ; Smedley, D. ; Sorg, T. ; Speak, A.O. ; Steel, K.P. ; Svenson, K.L. ; Wakana, S. ; West, D. ; Wells, S. ; Westerberg, H. ; Yaacoby, S. ; White, J.K. ; International Mouse Phenotyping Consortium (Aguilar-Pimentel, J.A. ; Treise, I. ; Moreth, K. ; Stöger, T. ; Amarie, O.V. ; Neff, C. ; Wurst, W. ; Calzada-Wack, J. ; Marschall, S. ; Brommage, R. ; Steinkamp, R. ; Lengger, C. ; Östereicher, M.A. ; Maier, H. ; Stoeger, C. ; Leuchtenberger, S. ; Yildirim, A.Ö. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Zimprich, A. ; Seisenberger, C. ; Bürger, A. ; Graw, J. ; Eickelberg, O. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Gailus-Durner, V. ; Beckers, J. ; Rathkolb, B. ; Rozman, J.) ; Becker, L.

Prevalence of sexual dimorphism in mammalian phenotypic traits.
Immunology 152, 402-413 (2017)

Kaestle, M. ; Bartel, S. ; Geillinger-Kästle, K. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Ryffel, B. ; Eickelberg, O. ; Krauss-Etschmann, S.

microRNA cluster 106a~363 is involved in T-Helper 17 (Th17) cell differentiation.

Ganguly, K. ; Ettehadieh, D. ; Upadhyay, S. ; Takenaka, S. ; Adler, T. ; Karg, E.W. ; Krombach, F. ; Kreyling, W.G. ; Schulz, H. ; Schmid, O. ; Stöger, T.

Early pulmonary response is critical for extra-pulmonary carbon nanoparticle mediated effects: Comparison of inhalation versus intra-arterial infusion exposures in mice.  

Tufman, A. ; Kahnert, K. ; Kauffmann-Guerrero, D. ; Manapov, F. ; Milger, K. ; Müller-Lisse, U. ; Winter, H. ; Huber, R.M. ; Schneider, C.

Clinical relevance of the M1b and M1c descriptors from the proposed TNM 8 classification of lung cancer.
J. Allergy Clin. Immunol. 139, 1935-1945.e12 (2017)

Hose, A.J. ; Depner, M. ; Illi, S. ; Lau, S. ; Keil, T. ; Wahn, U. ; Fuchs, O. ; Pfefferle, P.I. ; Schmaußer-Hechfellner, E. ; Genuneit, J. ; Lauener, R. ; Karvonen, A.M. ; Roduit, C. ; Dalphin, J.-C. ; Riedler, J. ; Pekkanen, J. ; von Mutius, E. ; Ege, M.J. ; Bauer, C.P. ; Forster, J. ; Zepp, F. ; Wahn, V. ; Schuster, A. ; Bergmann, R.L. ; Bergmann, K.E. ; Reich, A. ; Grabenhenrich, L. ; Schaub, B. ; Loss, G.J. ; Renz, H. ; Kabesch, M. ; Roponen, M. ; Hyvärinen, A. ; Tiittanen, P. ; Remes, S. ; Braun-Fahrländer, C. ; Frei, R. ; Kaulek, V. ; Dalphin, M. ; Doekes, G. ; Blümer, N. ; Frey, U.H.

Latent class analysis reveals clinically relevant atopy phenotypes in 2 birth cohorts.
Mol. Neurobiol. 55, 4580–4595 (2017)

Garrett, L. ; Becker, L. ; Rozman, J. ; Puk, O. ; Stöger, T. ; Yildirim, A.Ö. ; Bohla, A. ; Eickelberg, O. ; Hans, W. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Klopstock, T. ; Rácz, I. ; Zimmer, A. ; Klingenspor, M. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Wurst, W. ; Hrabě de Angelis, M. ; Graw, J. ; Hölter, S.M.

Fgf9Y162C mutation alters information processing and social memory in mice.

Αgalioti, T. ; Giannou, A.D. ; Krontira, A.C. ; Kanellakis, N.I. ; Kati, D. ; Vreka, M. ; Pepe, M. ; Spella, M. ; Lilis, I. ; Zazara, D.E. ; Nikolouli, E. ; Spiropoulou, N. ; Papadakis, A. ; Papadia, K. ; Voulgaridis, A. ; Harokopos, V. ; Stamou, P. ; Meiners, S. ; Eickelberg, O. ; Snyder, L.A. ; Antimisiaris, S.G. ; Kardamakis, D. ; Psallidas, I. ; Μarazioti, A. ; Stathopoulos, G.T.

Mutant KRAS promotes malignant pleural effusion formation.

Zawada, A.M. ; Zhang, L. ; Emrich, I.E. ; Rogacev, K.S. ; Krezdorn, N. ; Rotter, B. ; Fliser, D. ; Devaux, Y. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Heine, G.H.

Reprint of: MicroRNA profiling of human intermediate monocytes.
Allergy 72, 1962-1971 (2017)

Milger, K. ; Götschke, J. ; Krause, L. ; Nathan, P. ; Alessandrini, F. ; Tufman, A. ; Fischer, R. ; Bartel, S. ; Theis, F.J. ; Behr, J. ; Dehmel, S. ; Müller, N.S. ; Kneidinger, N. ; Krauss-Etschmann, S.

Identification of a plasma miRNA biomarker-signature for allergic asthma: A translational approach.

Greiffo, F.R. ; Fernandez, I.E. ; Frankenberger, M. ; Ortega-Gomez, A. ; Behr, J. ; Soehnlein, O. ; Eickelberg, O.

Monocyte immunophenotyping reflects aberrant activation patterns in interstitial lung disease patients.

Heinzelmann, K. ; Noskovicova, N. ; Lehmann, M. ; Lindner, M. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O.

Cd82 is a novel mediator of fibroblast proliferation.

Fernandez, I.E. ; Roy, R. ; Greiffo, F.R. ; Frankenberger, M. ; Behr, J. ; Forrest, A.R. ; Eickelberg, O.

Quantitative proteomics reveals novel fibrotic networks of myeloid-derived suppressor cell and monocytes in ipf.

John-Schuster, G. ; Conlon, T.M. ; Günter, S. ; Eickelberg, O. ; Heikenwalder, M. ; Yildirim, A.Ö.

Lymphotoxin-beta-receptor blockade prevents cigarette smoke-induced COPD.

Conlon, T.M. ; Hackl, M. ; Bartel, J. ; Krumsiek, J. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Theis, F.J. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

2d cross-omics integrated enrichment analysis of human and mice COPD lungs reveal novel pathological mechanisms of disease progression.

Conlon, T.M. ; Jia, J. ; Gao, J. ; Heinzelmann, K. ; Tasdemir, D. ; Bayram, H. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Loss of the cholesterol metabolizing enzyme Ch25h protects against cigarette smoke-induced COPD.

Jarosch, I. ; Schneeberger, T. ; Gloeckl, R. ; Kreuter, M. ; Benstz, J. ; Frankenberger, M. ; Neurohr, C. ; Prasse, A. ; Behr, J. ; Kenn, K.

Different effects of pulmonary rehabilitation in Anxious Vs. Non-Anxious patients with idiopathic pulmonary fibrosis - a pilot study.

Maldonado, M. ; Ortiz-Quintero, B. ; Herrera, I. ; Ramirez, R. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Eickelberg, O. ; Salgado-Aguayo, A. ; Selman, M. ; Pardo, A.

Matrix metalloproteinase (mmp)-28 is expressed in alveolar epithelial cells in idiopathic pulmonary fibrosis and increases their proliferation and migration.

Ciolek, F. ; Heinzelmann, K. ; Eickelberg, O. ; Königshoff, M. ; Baarsma, H.

Regulation and function of non-canonical Wnt-5a in human lung fibroblasts.

Welk, V. ; Meul, T. ; Merl-Pham, J. ; Korfei, M. ; Koch, I. ; Semren, N. ; Guenther, A. ; Lindner, M. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Proteasomal activator 200 (pa200) regulates cellular proliferation: A putative role for Ipf and lung cancer pathogenesis.

Ota, C. ; Ng-Blichfeldt, J. ; Mutze, K. ; Baarsma, H. ; Skronska-Wasek, W. ; Königshoff, M.

Hopx-Wnt crosstalk regulates alveolar homeostasis.

Bartel, S. ; Schulz, N. ; Alessandrini, F. ; Schamberger, A.C. ; Pagel, P. ; Theis, F.J. ; Milger, K. ; Nößner, E. ; Stick, S.M. ; Kicic, A. ; Eickelberg, O. ; Freishtat, R.J. ; Krauss-Etschmann, S.

Pulmonary microRNA profiles identify involvement of Creb1 and Sec14l3 in bronchial epithelial changes in allergic asthma.
Proc. SPIE 10132:101325L (2017)

Gromann, L.B. ; Scherer, K. ; Yaroshenko, A. ; Bölükbas, D.A. ; Hellbach, K. ; Meinel, F.G. ; Braunagel, M. ; Eickelberg, O. ; Reiser, M.F. ; Pfeiffer, F. ; Meiners, S. ; Herzen, J.

First experiences with in-vivo x-ray dark-field imaging of lung cancer in mice.

Kneidinger, N. ; Milger, K. ; Janitza, S. ; Ceelen, F. ; Leuschner, G. ; Dinkel, J. ; Königshoff, M. ; Weig, T. ; Schramm, R. ; Winter, H. ; Behr, J. ; Neurohr, C.

Lung volumes predict survival in patients with chronic lung allograft dysfunction.
Curr. Opin. Pulm. Med. 23, 290-297 (2017)

Giopanou, I. ; Arendt, K.A.M. ; Stathopoulos, G.T.

Lung carcinogenesis and fibrosis taken together: Just coincidence?

Lehmann, M. ; Buhl, L. ; Klee, S. ; Wagner, D.E. ; Behr, J. ; Lindner, M. ; Königshoff, M.

Effects of nintedanib and pirfenidone on alveolar epithelial cells in 2d and 3d lung cultures.

Yin, R. ; Zhang, P. ; Liu, X. ; Chen, Y. ; Tao, Z. ; Ai, L. ; Li, J. ; Yang, Y. ; Li, M. ; Xue, C. ; Qian, J. ; Wang, X. ; Chen, J. ; Li, Y. ; Xiong, Y. ; Zhang, J. ; Stöger, T. ; Bi, Y. ; Ding, Z.

Dispersal and transmission of avian paramyxovirus serotype 4 among wild birds and domestic poultry.

Alsafadi, H.N. ; Lehmann, M. ; Lindner, M. ; Peschel, B. ; Königshoff, M. ; Wagner, D.E.

An ex vivo human model of idiopathic pulmonary fibrosis using precision cut lung slices.

Ng-Blichfeldt, J. ; Ota, C. ; Stolk, J. ; Hiemstra, P. ; Gosens, R. ; Königshoff, M.

Wnt activity marks lung progenitors capable of forming spheres in vitro.

Sarker, R.S. ; Conlon, T.M. ; Dorer, J. ; Burgstaller, G. ; Merthan, L. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Bustin, M. ; Furusawa, T. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Epigenetic histone-1 modulator Hmgn5 regulates cellular apoptosis In COPD pathogenesis.

Houssaini, A. ; Breau, M. ; Kebe, K. ; Abid, S. ; Marcos, E. ; Lipskaia, L. ; Rideau, D. ; Parpaleix, A. ; Huang, J. ; Amsellem, V. ; Maitre, B. ; Bizard, E. ; Vienney, N. ; Luka, C. ; Validyre, P. ; Boczkowski, J. ; Derumeaux, G. ; Bernard, D. ; Meiners, S. ; Adnot, S.

Activation of the Mtor pathway drives lung cell senescence and emphysema in chronic obstructive pulmonary disease (COPD).

Hilgendorff, A. ; Foerster, K. ; Sass, S. ; Stoecklein, S. ; Dietrich, O. ; Pomschar, A. ; Schulze, A. ; Huebener, C. ; Theis, F.J. ; Erhardt, H. ; Flemmer, A.W. ; Ertl-Wagner, B.

Discrimination of pulmonary changes in neonatal chronic lung disease by a new Mri score.

Oak, P. ; Pritzke, T. ; Koschlig, M. ; Windhorst, A. ; Jain, N. ; Reicherzer, T. ; Ehrhardt, H. ; Frankenberger, M. ; Schwarz, M.A. ; Hilgendorff, A.

Monocyte-centred inflammatory response driving pulmonary injury in neonatal chronic lung disease.

Oak, P. ; Kamgari, N. ; Pritzke, T. ; John-Schuster, G. ; Jia, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Hilgendorff, A.

Enhanced vulnerability of the developing lungs by moderate prenatal cigarette smoke upon postnatal injury.

Kammerl, I.E. ; Chen, S. ; Vergara, E.E. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Muchamuel, T. ; Kirk, C. ; Florea, B.I. ; Overkleeft, H.S. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S. ; Stöger, T.

Deficiency of immunoproteasome subunits increases alternative polarization of alveolar macrophages.

Baarsma, H.A. ; Skronska-Wasek, W. ; Mutze, K. ; Ciolek, F. ; Wagner, D.E. ; John-Schuster, G. ; Heinzelmann, K. ; Guenther, A. ; Bracke, K.R. ; Dagouassat, M. ; Boczkowski, J. ; Brusselle, G.G. ; Smits, R. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M.

Non-canonical Wnt-5a signaling impairs endogenous lung repair in COPD.
Mol. Ther. Nucleic Acids 7, 350-365 (2017)

Schrom, E. ; Huber, M. ; Aneja, M.K. ; Dohmen, C. ; Emrich, D. ; Geiger, J. ; Hasenpusch, G. ; Herrmann-Janson, A. ; Kretzschmann, V. ; Mykhailyk, O. ; Pasewald, T. ; Oak, P. ; Hilgendorff, A. ; Wohlleber, D. ; Hoymann, H. ; Schaudien, D. ; Plank, C. ; Rudolph, C. ; Kubisch-Dohmen, R.

Translation of angiotensin-converting enzyme 2 upon liver- and lung-targeted delivery of optimized chemically modified mRNA.
Biochem. Pharmacol. 131, 52-67 (2017)

Guarino, C. ; Hamon, Y. ; Croix, C. ; Lamort, A.-S. ; Dallet-Choisy, S. ; Marchand-Adam, S. ; Lesner, A. ; Baranek, T. ; Viaud-Massuard, M.C. ; Lauritzen, C. ; Pedersen, J.H. ; Heuze-Vourc'h, N. ; Si-Tahar, M. ; Firatli, E. ; Jenne, D. ; Gauthier, F. ; Horwitz, M.S. ; Borregaard, N. ; Korkmaz, B.

Prolonged pharmacological inhibition of cathepsin C results in elimination of neutrophil serine proteases.

Scherer, K. ; Yaroshenko, A. ; Bölükbas, D.A. ; Gromann, L.B. ; Hellbach, K. ; Meinel, F.G. ; Braunagel, M. ; Berg, J.V. ; Eickelberg, O. ; Reiser, M.F. ; Pfeiffer, F. ; Meiners, S. ; Herzen, J.

X-ray dark-field radiography - in-vivo diagnosis of lung cancer in mice.
EMBO Mol. Med. 9, 672-686 (2017)

Giannou, A.D. ; Marazioti, A. ; Kanellakis, N.I. ; Giopanou, I. ; Lilis, I. ; Zazara, D.E. ; Ntaliarda, G. ; Kati, D. ; Armenis, V. ; Giotopoulou, G.A. ; Krontira, A.C. ; Lianou, M. ; Agalioti, T. ; Vreka, M. ; Papageorgopoulou, M. ; Fouzas, S. ; Kardamakis, D. ; Psallidas, I. ; Spella, M. ; Stathopoulos, G.T.

NRAS destines tumor cells to the lungs.
Clin. Exp. Rheumatol. 35, 103, 98-101 (2017)

Oommen, E. ; Hummel, A.M. ; Allmannsberger, L. ; Cuthbertson, D. ; Carette, S. ; Pagnoux, C. ; Hoffman, G.S. ; Jenne, D. ; Khalidi, N.A. ; Koening, C. ; Langford, C. ; McAlear, C. ; Moreland, L. ; Seo, P. ; Sreih, A. ; Ytterberg, S. ; Merkel, P. ; Specks, U. ; Monach, P.

IgA antibodies to myeloperoxidase in patients with eosinophilic granulomatosis with polyangiitis (Churg-Strauss).

Gall, H. ; Felix, J.F. ; Schneck, F.K. ; Milger, K. ; Sommer, N. ; Voswinckel, R. ; Franco, O.H. ; Hofman, A. ; Schermuly, R.T. ; Weissmann, N. ; Grimminger, F. ; Seeger, W. ; Ghofrani, H.A.

The Giessen Pulmonary Hypertension Registry: Survival in pulmonary hypertension subgroups.
Nanotox. 11, 454-464 (2017)

Kreyling, W.G. ; Holzwarth, U. ; Haberl, N. ; Kozempel, J. ; Wenk, A. ; Hirn, S. ; Schleh, C. ; Schäffler, M. ; Lipka, J. ; Semmler-Behnke, M. ; Gibson, N.

Quantitative biokinetics of titanium dioxide nanoparticles after intratracheal instillation in rats (Part 3).
Nanotox. 11, 443-453 (2017)

Kreyling, W.G. ; Holzwarth, U. ; Schleh, C. ; Kozempel, J. ; Wenk, A. ; Haberl, N. ; Hirn, S. ; Schäffler, M. ; Lipka, J. ; Semmler-Behnke, M. ; Gibson, N.

Quantitative biokinetics of titanium dioxide nanoparticles after oral application in rats (Part 2).
Nanotox. 11, 434-442 (2017)

Kreyling, W.G. ; Holzwarth, U. ; Haberl, N. ; Kozempel, J. ; Hirn, S. ; Wenk, A. ; Schleh, C. ; Schäffler, M. ; Lipka, J. ; Semmler-Behnke, M. ; Gibson, N.

Quantitative biokinetics of titanium dioxide nanoparticles after intravenous injection in rats (Part 1).

Klar, K. ; Perchermeier, S. ; Bhattacharjee, S. ; Harb, H. ; Adler, T. ; Istvanffy, R. ; Loffredo-Verde, E. ; Oostendorp, R. ; Renz, H. ; Prazeres da Costa, C.U.

Chronic schistosomiasis during pregnancy epigenetically reprograms T cell differentiation in offspring of infected mothers.

Tsai, J.M. ; Koh, P.W. ; Stefanska, A. ; Xing, L. ; Walmsley, G.G. ; Poux, N. ; Weissman, I.L. ; Rinkevich, Y.

Localized hepatic lobular regeneration by central-vein-associated lineage-restricted progenitors.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 56, 551-552 (2017)

Costa, R. ; Königshoff, M.

Linking wnt signaling to mucosal inflammation.

Taggart, C. ; Mall, M.A. ; Lalmanach, G. ; Cataldo, D. ; Ludwig, A. ; Janciauskiene, S. ; Heath, N. ; Meiners, S. ; Overall, C.M. ; Schultz, C. ; Turk, B. ; Borensztajn, K.S.

Protean proteases: At the cutting edge of lung diseases.
OncoImmunology 6:e1256528 (2017)

Giopanou, I. ; Lilis, I. ; Papaleonidopoulos, V. ; Agalioti, T. ; Kanellakis, N.I. ; Spiropoulou, N. ; Spella, M. ; Stathopoulos, G.T.

Tumor-derived osteopontin isoforms cooperate with TRP53 and CCL2 to promote lung metastasis.

Papadia, K. ; Markoutsa, E. ; Mourtas, S. ; Giannou, A.D. ; La Ferla, B. ; Nicotra, F. ; Salmona, M. ; Klepetsanis, P. ; Stathopoulos, G.T. ; Antimisiaris, S.G.

Multifunctional LUV liposomes decorated for BBB and amyloid targeting. A. In vitro proof-of-concept.
Lancet Resp. Med. 5, 224-234 (2017)

Fuchs, O. ; Bahmer, T. ; Rabe, K.F. ; von Mutius, E.

Asthma transition from childhood into adulthood.
Cytotherapy 19, S23-S24 (2017)

Geiger, S. ; Hereth, M. ; Forster, D. ; Hollauer, C. ; Ballester, C.F. ; Hermann, E. ; Yildirim, A.Ö. ; Guenther, C.

Amelioration of lung function and pulmonary tissue regeneration after treatment with AAT-expressing human MSCS in a murine model of elastase-induced emphysema.
Chem. Biol. Interact. 276, 95-104 (2017)

Loerz, C. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Huebbe, P. ; Giller, K. ; Metges, C. ; Rimbach, G. ; Maser, E.

Regulation of 11β-hydroxysteroid dehydrogenase type 1 following caloric restriction and re-feeding is species dependent.
Adv. Sci. 4:1600238 (2017)

Zensen, C. ; Fernandez, I.E. ; Eickelberg, O. ; Feldmann, J. ; Lohmüller, T.

Detecting swelling states of red blood cells by "Cell-fluid coupling spectroscopy".
Dis. Model. Mech. 10, 409-423 (2017)

Poobalasingam, T. ; Yates, L.L. ; Walker, S.A. ; Pereira, M. ; Gross, N.Y. ; Ali, A. ; Kolatsi-Joannou, M. ; Jarvelin, M.R. ; Pekkanen, J. ; Papakrivopoulou, E. ; Long, D.A. ; Griffiths, M. ; Wagner, D.E. ; Königshoff, M. ; Hind, M. ; Minelli, C. ; Lloyd, C.M. ; Dean, C.H.

Heterozygous Vangl2Looptail mice reveal novel roles for the planar cell polarity pathway in adult lung homeostasis and repair.

Malik, R. ; Dau, T. ; Gonik, M. ; Sivakumar, A. ; Deredge, D.J. ; Edeleva, E.V. ; Götzfried, J. ; van der Laan, S.W. ; Pasterkamp, G. ; Beaufort, N. ; Seixas, S. ; Bevan, S. ; Lincz, L.F. ; Holliday, E.G. ; Burgess, A.I. ; Rannikmäe, K. ; Minnerup, J. ; Kriebel, J. ; Waldenberger, M. ; Müller-Nurasyid, M. ; Lichtner, P. ; Saleheen, D. ; Rothwell, P.M. ; Levi, C. ; Attia, J. ; Sudlow, C.L. ; Braun, D. ; Markus, H.S. ; Wintrode, P.L. ; Berger, K. ; Jenne, D. ; Dichgans, M.

Common coding variant in SERPINA1 increases the risk for large artery stroke.
PLoS ONE 12:e0172716 (2017)

Vonk, J.M. ; Scholtens, S. ; Postma, D.S. ; Moffatt, M.F. ; Jarvis, D. ; Ramasamy, A. ; Wjst, M. ; Omenaas, E.R. ; Bouzigon, E. ; Demenais, F. ; Nadif, R. ; Siroux, V. ; Polonikov, A.V. ; Solodilova, M. ; Ivanov, V.P. ; Curjuric, I. ; Imboden, M. ; Kumar, A. ; Probst-Hensch, N. ; Ogorodova, L.M. ; Puzyrev, V.P. ; Bragina, E.Y. ; Freidin, M.B. ; Nolte, I.M. ; Farrall, A.M. ; Cookson, W.O.C.M. ; Strachan, D.P. ; Koppelman, G.H. ; Boezen, H.M.

Adult onset asthma and interaction between genes and active tobacco smoking: The GABRIEL consortium.

Alsafadi, H.N. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Lehmann, M. ; Lindner, M. ; Peschel, B. ; Königshoff, M. ; Wagner, D.E.

An ex vivo model to induce early fibrosis-like changes in human precision-cut lung slices.

Knüppel, L. ; Ishikawa, Y. ; Aichler, M. ; Heinzelmann, K. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Walch, A.K. ; Bächinger, H.P. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

A novel antifibrotic mechanism of nintedanib and pirfenidone: Inhibition of collagen fibril assembly.

Papadia, K. ; Giannou, A.D. ; Markoutsa, E. ; Bigot, C. ; Vanhoute, G. ; Mourtas, S. ; der Linden, A.V. ; Stathopoulos, G.T. ; Antimisiaris, S.G.

Multifunctional LUV liposomes decorated for BBB and amyloid targeting - B. In vivo brain targeting potential in wild-type and APP/PS1 mice.

Skronska-Wasek, W. ; Mutze, K. ; Baarsma, H.A. ; Alsafadi, H.N. ; Lehmann, M. ; Costa, R. ; Wagner, D.E. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M.

Reduced frizzled receptor 4 expression prevents WNT/β-catenin-driven alveolar lung repair in COPD.

Sattler, C. ; Moritz, F. ; Chen, S. ; Steer, B. ; Kutschke, D. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Adler, H. ; Stöger, T.

Nanoparticle exposure reactivates latent herpesvirus and restores a signature of acute infection.
PLoS ONE 12:e0169223 (2017)

Altmäe, S. ; Segura, M.T. ; Esteban, F.J. ; Bartel, S. ; Brandi, P. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Demmelmair, H. ; López-Sabater, C. ; Koletzko, B. ; Krauss-Etschmann, S. ; Campoy, C.

Maternal pre-pregnancy obesity is associated with altered placental transcriptome.

Baarsma, H.A. ; Skronska-Wasek, W. ; Mutze, K. ; Ciolek, F. ; Wagner, D.E. ; John-Schuster, G. ; Heinzelmann, K. ; Günther, A. ; Bracke, K.R. ; Dagouassat, M. ; Boczkowski, J. ; Brusselle, G.G. ; Smits, R. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M.

Noncanonical WNT-5A signaling impairs endogenous lung repair in COPD.

Zawada, A.M. ; Zhang, L. ; Emrich, I.E. ; Rogacev, K.S. ; Krezdorn, N. ; Rotter, B. ; Fliser, D. ; Devaux, Y. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Heine, G.H.

MicroRNA profiling of human intermediate monocytes.
J. Appl. Physiol. 122, 191-197 (2017)

Möller, W. ; Sheng Feng, M.S. ; Domanski, U. ; Franke, K.-J. ; Celik, G. ; Bartenstein, P. ; Becker, S. ; Meyer, G. ; Schmid, O. ; Eickelberg, O. ; Tatkov, S. ; Nilius, G.

Nasal high flow reduces dead space.

Storch, U. ; Forst, A. ; Pardatscher, F. ; Erdogmus, S. ; Philipp, M. ; Gregoritza, M. ; Mederos y Schnitzlera, M. ; Gudermann, T.

Dynamic NHERF interaction with TRPC4/5 proteins is required for channel gating by diacylglycerol.
Biochim. Biophys. Acta 1863, 560-568 (2017)

Hofmann, K. ; Fiedler, S. ; Vierkotten, S. ; Weber, J. ; Klee, S. ; Jia, J. ; Zwickenpflug, W. ; Flockerzi, V. ; Storch, U. ; Yildirim, A.Ö. ; Gudermann, T. ; Königshoff, M. ; Dietrich, A.

Classical transient receptor potential 6 (TRPC6) channels support myofibroblast differentiation and development of experimental pulmonary fibrosis.
Proteomics 17:1600243 (2017)

Mossina, A. ; Lukas, C. ; Merl-Pham, J. ; Uhl, F.E. ; Mutze, K. ; Schamberger, A.C. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Jia, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Cigarette smoke alters the secretome of lung epithelial cells.
Thorax 72, 1-9 (2017)

Campbell, B. ; Raherison, C. ; Lodge, C.J. ; Lowe, A.J. ; Gislason, T. ; Heinrich, J. ; Sunyer, J. ; Gómez Real, F. ; Norbäck, D. ; Matheson, M.C. ; Wjst, M. ; Dratva, J. ; de Marco, R. ; Jarvis, D. ; Schlünssen, V. ; Janson, C. ; Leynaert, B. ; Svanes, C. ; Dharmage, S.C.

The effects of growing up on a farm on adult lung function and allergic phenotypes: An international population-based study.
J. Allergy Clin. Immunol. 139, 1525-1535 (2017)

Kepert, I. ; Fonseca, J. ; Müller, C. ; Milger, K. ; Hochwind, K. ; Kostric, M. ; Fedoseeva, M. ; Ohnmacht, C. ; Dehmel, S. ; Nathan, P. ; Bartel, S. ; Eickelberg, O. ; Schloter, M. ; Hartmann, A. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Krauss-Etschmann, S.

D-Tryptophan from probiotic bacteria influences the gut microbiome and allergic airway disease.

Hilgendorff, A. ; Windhorst, A. ; Klein, M. ; Tchatalbachev, S. ; Windemuth-Kieselbach, C. ; Kreuder, J. ; Heckmann, M. ; Gkatzoflia, A. ; Ehrhardt, H. ; Mysliwietz, J. ; Maier, M. ; Izar, B. ; Billion, A. ; Gortner, L. ; Chakraborty, T. ; Hossain, H.

Gene expression profiling at birth characterizing the preterm infant with early onset infection.
In:. 2016. 21-33 (Pharmacogenet. Genomics)

Wjst, M. ; Werner, M.

Methods of genotyping.
Eur. Respir. J. 48, PP104 (2016)

Förster, K. ; Sass, S. ; Dietrich, O. ; Pomschar, A. ; Nährlich, L. ; Schulze, A. ; Flemmer, A.W. ; Ehrhardt, H. ; Hübener, C. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Ertl-Wagner, B. ; Hilgendorff, A.

LSC Abstract – Early biomarkers indicating the development of neonatal chronic lung disease defined by clinical and imaging parameters.
JCI insight 1:e90301 (2016)

Ge, L. ; Habiel, D.M. ; Hansbro, P.M. ; Kim, R.Y. ; Gharib, S.A. ; Edelman, J.D. ; Königshoff, M. ; Parimon, T. ; Brauer, R. ; Huang, Y. ; Allen, J. ; Jiang, D. ; Kurkciyan, A.A. ; Mizuno, T. ; Stripp, B.R. ; Noble, P.W. ; Hogaboam, C.M. ; Chen, P.

miR-323a-3p regulates lung fibrosis by targeting multiple profibrotic pathways.
Thorax 71, A7-A7 (2016)

Kanellakis, N.I. ; Giannou, A.D. ; Pepe, M. ; Agalioti, T. ; Zazara, D.E. ; Vreka, M. ; Lilis, I. ; Giopanou, I. ; Spella, M. ; Marazioti, A. ; Rahman, N. ; Pavord, I.D. ; Psallidas, I. ; Stathopoulos, G.T.

Mouse lung adenocarcinoma cell lines reveal PRL2C2 as a novel lung tumour promoter.
Thorax 71, A7-A7 (2016)

Psallidas, I. ; Kanellakis, N.I. ; Vreka, M. ; Giannou, A.D. ; Maniatis, L. ; Moschos, C. ; Giopanou, I. ; Agalioti, T. ; Lilis, I. ; Magkouta, S. ; Kalomenidis, I. ; Rahman, N.M. ; Pavord, I.D. ; Stathopoulos, G.T.

Osteopontin as an airway epithelial tumour promoter.
Microcirc. 23, 621-625 (2016)

Schnitzler, M.M.Y. ; Storch, U. ; Gudermann, T.

Mechanosensitive G(q/11) protein-coupled receptors mediate myogenic vasoconstriction.
Respiration 92, 98-106 (2016)

Bonella, F. ; Kreuter, M. ; Hagmeyer, L. ; German Nintedanib Compassionate Use Consortium (Neurohr, C. ; Milger, K.) ; Keller, C. ; Kohlhaeufl, M.J. ; Mueller-Quernheim, J. ; Prasse, A.

Insights from the German compassionate use program of nintedanib for the treatment of idiopathic pulmonary fibrosis.

Larsson, D.H. ; Vågberg, W. ; Yaroshenko, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Hertz, H.M.

High-resolution short-exposure small-animal laboratory x-ray phase-contrast tomography.
Allergy 71, 31-32 (2016)

Dietz, K. ; de los Reyes Jimenez, M. ; Gollwitzer, E.S. ; Chaker, A. ; Zissler, U.M. ; Harris, N.L. ; Königshoff, M. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Marsland, B.J. ; Esser-von Bieren, J.

Age-dependent regulation of remodeling factors during allergic airway inflammation.
Eur. Heart J. 37, 568-568 (2016)

Houssaini, A. ; Abid, S. ; Derumeaux, G. ; Wan, F. ; Parpaleix, A. ; Rideau, D. ; Marcos, E. ; Czibik, G. ; Sawaki, D. ; Dubois-Rande, J.L. ; Zhenlin, L. ; Pende, M. ; Amsellem, V. ; Lipskaia, L. ; Adnot, A.

Selective TSC1 deletion in smooth muscle activates mTOR signaling and induces pulmonary hypertension.
Med. Sci. Sports Exerc. 48, 1276-1284 (2016)

Pereira, P.R. ; Oliveira-Junior, M.C. ; MacKenzie, B. ; Chiovatto, J.E.D. ; Matos, Y. ; Greiffo, F.R. ; Rigonato-Oliveira, N.C. ; Brugemman, T.R. ; Delle, H. ; Idzko, M. ; Albertini, R. ; Ligeiro Oliveira, A.P. ; Damaceno-Rodrigues, N.R. ; Caldini, E.G. ; Fernandez, I.E. ; Castro-Faria-Neto, H.C. ; Dolhnikoff, M. ; Eickelberg, O. ; Vieira, R.P.

Exercise reduces lung fibrosis involving serotonin/akt signaling.

Hamon, Y. ; Legowska, M. ; Herve, V. ; Dallet-Choisy, S. ; Marchand-Adam, S. ; Vanderlynden, L. ; Demonte, M. ; Williams, R. ; Scott, C.J. ; Si-Tahar, M. ; Heuze-Vourc'h, N. ; Lalmanach, G. ; Jenne, D. ; Lesner, A. ; Gauthier, F. ; Korkmaz, B.

Neutrophilic cathepsin C is maturated by a multistep proteolytic process and secreted by activated cells during inflammatory lung diseases.
Pharmacol. Rev. 68, 603-630 (2016)

Korkmaz, B. ; Lesner, A. ; Guarino, C. ; Wysocka, M. ; Kellenberger, C. ; Watier, H. ; Specks, U. ; Gauthier, F. ; Jenne, D.

Inhibitors and antibody fragments as potential anti-inflammatory therapeutics targeting neutrophil proteinase 3 in human disease.

Leppkes, M. ; Maueroeder, C. ; Hirth, S. ; Nowecki, S. ; Günther, C. ; Billmeier, U. ; Paulus, S. ; Biermann, M. ; Munoz, L.E. ; Hoffmann, M. ; Wildner, D. ; Croxford, A.L. ; Waisman, A. ; Mowen, K. ; Jenne, D. ; Krenn, V. ; Mayerle, J. ; Lerch, M.M. ; Schett, G. ; Wirtz, S. ; Neurath, M.F. ; Hermann, M. ; Becker, C.

Externalized decondensed neutrophil chromatin occludes pancreatic ducts and drives pancreatitis.

White, E.S. ; Borok, Z. ; Brown, K. ; Eickelberg, O. ; Guenther, A. ; Jenkins, R. ; Kolb, M. ; Martinez, F.J. ; Roman, J. ; Sime, P.

An american thoracic society official research statement: Future directions in lung fibrosis research.

Strange, C.B. ; Herth, F.J.F. ; Valipour, A. ; Shah, P.L. ; Eberhardt, R. ; Grah, C. ; Egan, J. ; Ficker, J.H. ; Wagner, M. ; Witt, C. ; Liebers, U. ; Hopkins, P.N. ; Gesierich, W. ; Phillips, M.A. ; Stanzel, F. ; McNulty, W. ; Petermann, C. ; Snell, G.I. ; Gompelmann, D.

Step-up randomized controlled trial of segmental vapor ablation in patients with severe emphysema: 6 month results.

Oak, P. ; Koschlig, M. ; Windhorst, A. ; Jain, N. ; Reicherzer, T. ; Ehrhardt, H. ; Frankenberger, M. ; Alvira, C.M. ; Schwarz, M.A. ; Eickelberg, O. ; Hilgendorff, A.

Monocyte-centred inflammatory response characterizing early stages of Bpd development in the preterm infant.

Jia, J. ; Conlon, T.M. ; Lopez, C.B. ; Eickelberg, O. ; Mall, M.A. ; Yildirim, A.Ö.

Chronic bronchitis enhancement in newborn mice from exposure to environmental tobacco smoke.

Bonella, F. ; Kreuter, M. ; Hagmeyer, L. ; Neurohr, C. ; Keller, C. ; Kohlhaeufl, M. ; Mueller-Quernheim, J. ; Milger, K. ; Prasse, A.

Insights from a multi-centre real life experience in Germany with nintedanib for the Tteatment of idiopathic pulmonary fibrosis.

Wagner, D.E. ; Mutze, K. ; Schiller, H.B. ; Costa, R. ; Kaminski, N. ; Königshoff, M.

Hippo signaling is deranged in idiopathic pulmonary fibrosis and correlates with disease severity.

Knüppel, L. ; Ishikawa, Y. ; Heinzelmann, K. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Bachinger, H. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Effects of nintedanib and pirfenidone on expression and maturation of collagen - A comprehensive analysis.

Behr, J. ; Wirtz, H. ; Prasse, A. ; Pittrow, D. ; Klotsche, J. ; Koschel, D. ; Andreas, S. ; Claussen, M. ; Grohe, C. ; Kreuter, M.

Predictors of mortality in patients with idiopathic pulmonary fibrosis under clinical practice conditions: Insights-Ipf registry.

Lehmann, M. ; Mutze, K. ; Schiller, H.B. ; Wagner, D.E. ; Königshoff, M.

Increased alveolar epithelial cell senescence in pulmonary fibrosis.

Keller, I.E. ; Dann, A. ; Lukas, C. ; Brech, D. ; Vosyka, O. ; Nössner, E. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Proteasome-dependent Mhc I antigen presentation is altered by cigarette smoke.

Conlon, T.M. ; Merthan, L. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Furusawa, T. ; Bustin, M. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Reduced expression of the epigenetic regulator Hmgn5 enhances susceptibility to emphysema.

Baarsma, H.A. ; Skronska-Wasek, W. ; Mutze, K. ; Ciolek, F. ; John-Schuster, G. ; Dagouassat, M. ; Günther, A. ; Boczkowski, J. ; Smits, R. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M.

Non-canonical Wnt-5a compromises endogenous lung repair In COPD.

Staab-Weijnitz, C.A. ; Schamberger, A.C. ; Fernandez, I.E. ; Schiller, H. B. ; Heinzelmann, K. ; Sterclova, M. ; Vasakova, M. ; Mann, M. ; Eickelberg, O.

Expression and regulation of glutathione peroxidase 3 in interstitial lung disease.

Welk, V. ; Semren, N. ; Korfei, M. ; Günther, A. ; Eickelberg, O.

Proteasome activator 200 (pa200) is dysregulated in fibrotic remodeling of the lung.

Koschlig, M. ; Tian, X. ; Sudheendra, D. ; Spiekerkoetter, E.F. ; Hilgendorff, A.

Enhanced effects of hyperoxia on Vessel development in newborn mice heterozygote for the bmp receptor 2.

Stelzer, D. ; Ihle, F. ; Weber, A. ; Kneidinger, N. ; Zimmermann, G. ; Ceelen, F. ; Schramm, R. ; Winter, H. ; Frey, L. ; Andraschko, M. ; Vogeser, M. ; Behr, J. ; Neurohr, C.

Impact of posaconazol liquid vs. tablet formulation on plasma trough levels in lung transplant recipients.

Wrenn, S. ; Coffey, A. ; Uhl, F.E. ; Bianchi, J. ; Dacken, B. ; Petersen, T. ; Wagner, D.E. ; Boyson, J.E. ; Weiss, D.J.

Decellularized wild type and alpha-galactosyltransferase knockout pig lungs stimulate M2 phenotype in human monocyte/macrophages.

Fernandez, I.E. ; Greiffo, F.R. ; Frankenberger, M. ; Heinzelmann, K. ; Neurohr, C. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.

Peripheral blood myeloid-derived suppressor cells reflect disease status In Ipf.

Klee, S. ; Lehmann, M. ; Wagner, D.E. ; Baarsma, H.A. ; Königshoff, M.

Wisp1 mediates Il6-dependent proliferation in healthy and Ipf-derived primary human lung fibroblasts.

Psallidas, I. ; Kanellakis, N.I. ; Vreka, M. ; Giannou, A.D. ; Maniatis, L. ; Magkouta, S. ; Moschos, C. ; Giopanou, I. ; Agalioti, T. ; Lillis, I. ; Kalomenidis, I. ; Rahman, N.M. ; Stathopoulos, G.T.

Osteopontin as an airway epithelial tumor promoter.

Houssaini, A. ; Kebe, K. ; Breau, M. ; Marcos, E. ; Huang, J. ; Attwe, A. ; Bizard, E. ; Abid, S. ; Validire, P. ; Maitre, B. ; Meiners, S. ; Amsellem, V. ; Adnot, S.

Targeting the mtor signaling pathway to inhibit lung cell senescence In chronic obstructive pulmonary disease (COPD).

Schmid, O. ; Möller, W. ; Stelzl, A. ; Amarie, O.V. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Towards standardized airway hyperresponsiveness measurements In mice.
ERJ Open Res. 2:00029-2016 (2016)

Dvorkin-Gheva, A. ; Vanderstocken, G. ; Yildirim, A.Ö. ; Brandsma, C.A. ; Obeidat, M. ; Bossé, Y. ; Hassell, J.A. ; Stampfli, M.R.

Total particulate matter concentration skews cigarette smoke’s gene expression profile.
Adv. Healthc. Mater. 6:1600818 (2016)

Wuttke, S. ; Zimpel, A. ; Bein, T. ; Braig, S. ; Stoiber, K. ; Vollmar, A. ; Müller, D. ; Haastert-Talini, K. ; Schaeske, J. ; Stiesch, M. ; Zahn, G. ; Mohmeyer, A. ; Behrens, P. ; Eickelberg, O. ; Bölükbas, D.A. ; Meiners, S.

Validating metal-organic framework nanoparticles for their nanosafety in diverse biomedical applications.
Genes Genomes Genetics G3 6, 4035-4046 (2016)

Fuchs, H. ; Sabrautzki, S. ; Przemeck, G.K.H. ; Leuchtenberger, S. ; Lorenz-Depiereux, B. ; Becker, L. ; Rathkolb, B. ; Horsch, M. ; Garrett, L. ; Östereicher, M.A. ; Hans, W. ; Abe, K. ; Sagawa, N. ; Rozman, J. ; Vargas Panesso, I.L. ; Sandholzer, M. ; Lisse, T.S. ; Adler, T. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Calzada-Wack, J. ; Ehrhard, N. ; Elvert, R. ; Gau, C. ; Hölter, S.M. ; Micklich, K. ; Moreth, K. ; Prehn, C. ; Puk, O. ; Rácz, I. ; Stoeger, C. ; Vernaleken, A. ; Michel, D. ; Diener, S. ; Wieland, T. ; Adamski, J. ; Bekeredjian, R. ; Lengger, C. ; Maier, H. ; Neff, F. ; Ollert, M. ; Stöger, T. ; Yildirim, A.Ö. ; Strom, T.M. ; Zimmer, A. ; Wolf, E. ; Wurst, W. ; Klopstock, T. ; Beckers, J. ; Gailus-Durner, V. ; Hrabě de Angelis, M.

The first Scube3 mutant mouse line with pleiotropic phenotypic alterations.

Dau, T. ; Edeleva, E.V. ; Seidel, S.A. ; Stockley, R.A. ; Braun, D. ; Jenne, D.

Quantitative analysis of protease recognition by inhibitors in plasma using microscale thermophoresis.

Ota, C. ; Baarsma, H.A. ; Wagner, D.E. ; Hilgendorff, A. ; Königshoff, M.

Linking bronchopulmonary dysplasia to adult chronic lung diseases: Role of WNT signaling.
PLoS ONE 11:e0163420 (2016)

Andrade-Sousa, A.S. ; Rogério Pereira, P. ; MacKenzie, B. ; Oliveira-Junior, M.C. ; Assumpção-Neto, E. ; Brandão-Rangel, M.A. ; Damaceno-Rodrigues, N.R. ; Garcia Caldini, E. ; Velosa, A.P. ; Teodoro, W.R. ; Ligeiro de Oliveira, A.P. ; Dolhnikoff, M. ; Eickelberg, O. ; Vieira, R.P.

Aerobic exercise attenuated bleomycin-induced lung fibrosis in Th2-dominant mice.
Cell Chem. Bio. 23, 1302-1313 (2016)

Liu, X. ; Baarsma, H.A. ; Thiam, C.H. ; Montrone, C. ; Brauner, B. ; Fobo, G. ; Heier, J.S. ; Duscha, S. ; Königshoff, M. ; Angeli, V. ; Ruepp, A. ; Campillos, M.

Systematic identification of pharmacological targets from small-molecule phenotypic screens.
Mamm. Genome 27, 587-598 (2016)

Sabrautzki, S. ; Sandholzer, M.A. ; Lorenz-Depiereux, B. ; Brommage, R. ; Przemeck, G.K.H. ; Vargas Panesso, I.L. ; Vernaleken, A. ; Garrett, L. ; Baron, K. ; Yildirim, A.Ö. ; Rozman, J. ; Rathkolb, B. ; Gau, C. ; Hans, W. ; Hölter, S.M. ; Marschall, S. ; Stoeger, C. ; Becker, L. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Klingenspor, M. ; Klopstock, T. ; Lengger, C. ; Stefanie, L. ; Wolf, E. ; Strom, T.M. ; Wurst, W. ; Hrabě de Angelis, M.

Viable EdnraY129F mice feature human mandibulofacial dysostosis with alopecia (MFDA) syndrome due to the homologue mutation.
Invest. Radiol. 51, 597-601 (2016)

Hellbach, K. ; Yaroshenko, A. ; Willer, K. ; Pritzke, T. ; Baumann, A. ; Hesse, N. ; Auweter, S. ; Reiser, M.F. ; Eickelberg, O. ; Pfeiffer, F. ; Hilgendorff, A. ; Meinel, F.G.

Facilitated diagnosis of pneumothoraces in newborn mice using x-ray dark-field radiography.
Eur. Respir. J. 48, 1171-1183 (2016)

Fernandez, I.E. ; Greiffo, F.R. ; Frankenberger, M. ; Bandres, J. ; Heinzelmann, K. ; Neurohr, C. ; Hatz, R. ; Hartl, D. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.

Peripheral blood myeloid-derived suppressor cells reflect disease status in idiopathic pulmonary fibrosis.
Chest 150, 1361-1370 (2016)

Lee, Y.C. ; Idell, S. ; Stathopoulos, G.T.

Translational research in pleural infection and beyond.

Steer, B. ; Strehle, M. ; Sattler, C. ; Bund, D. ; Flach, B. ; Stöger, T. ; Haas, J.G. ; Adler, H.

The small noncoding RNAs (sncRNAs) of murine gammaherpesvirus 68 (MHV-68) are involved in regulating the latent-to-lytic switch in vivo.
J. Allergy Clin. Immunol. 139, 1343-1354.e6 (2016)

Dietz, K. ; de los Reyes Jimenez, M. ; Gollwitzer, E.S. ; Chaker, A. ; Zissler, U.M. ; Rådmark, O.P. ; Baarsma, H.A. ; Königshoff, M. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Marsland, B.J. ; Esser-von Bieren, J.

Age dictates a steroid resistant cascade of Wnt5a, transglutaminase-2 and leukotrienes in inflamed airways.
Biochem. Biophys. Res. Commun. 477, 1051-1058 (2016)

Yu, Y. ; He, Z. ; Cao, Y. ; Tang, H. ; Huang, F.

TAGLN2, a novel regulator involved in Hepatitis B virus transcription and replication.
Antiviral Res. 133, 140-144 (2016)

Yin, R. ; Liu, X. ; Zhang, P. ; Chen, Y. ; Xie, G. ; Ai, L. ; Xue, C. ; Qian, J. ; Bi, Y. ; Chen, J. ; Sun, Y. ; Stöger, T. ; Ding, Z.

A Raf kinase inhibitor demonstrates antiviral activities both in vitro and in vivo against different genotypes of virulent Newcastle disease virus.
Acta Physiol. 217, 142-143 (2016)

Houssaini, A. ; Kebe, K. ; Breau, M. ; Marcos, E. ; Abid, S. ; Bizard, E. ; Huang, J. ; Attwe, A. ; Rideau, D. ; Validire, P. ; Maitre, B. ; Amsellem, V. ; Meiners, S. ; Adnot, S.

Targeting the mtor signaling pathway to inhibit lung cell senescence in Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD).

Jia, J. ; Conlon, T.M. ; Seimetz, M. ; Bednorz, M. ; Zhou-Suckow, Z. ; Weissmann, N. ; Eickelberg, O. ; Mall, M.A. ; Yildirim, A.Ö.

Cigarette smoke causes acute airways disease and exacerbates chronic obstructive lung disease in neonatal mice.
BMC Cancer 16:409 (2016)

Tufman, A. ; Huber, R.M. ; Voelk, S. ; Aigner, F. ; Edelmann, M. ; Gamarra, F. ; Kiefl, R. ; Kahnert, K. ; Tian, F. ; Boulesteix, A.L. ; Endres, S. ; Kobold, S.

Interleukin-22 is elevated in lavage from patients with lung cancer and other pulmonary diseases.

Weber, A. ; Herr, C. ; Hendrowarsito, L. ; Meyer, N. ; Nennstiel-Ratzel, U. ; von Mutius, E. ; Bolte, G. ; Colon, D. ; Kolb, S.

No further increase in the parent reported prevalence of allergies in Bavarian preschool children: Results from three cross-sectional studies.

Smirnova, N.F. ; Schamberger, A.C. ; Nayakanti, S. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.

Detection and quantification of epithelial progenitor cell populations in human healthy and IPF lungs.

Schamberger, A.C. ; Schiller, H. B. ; Fernandez, I.E. ; Sterclova, M. ; Heinzelmann, K. ; Hennen, E. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Vasakova, M. ; Mann, M. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Glutathione peroxidase 3 localizes to the epithelial lining fluid and the extracellular matrix in interstitial lung disease.

Richter, M.J. ; Milger, K. ; Tello, K. ; Stille, P. ; Seeger, W. ; Mayer, E. ; Ghofrani, H.A. ; Gall, H.

Heart rate response during 6-minute walking testing predicts outcome in operable chronic thromboembolic pulmonary hypertension.
Tissue Eng. Part C Meth. 22, 418-428 (2016)

Zvarova, B. ; Uhl, F.E. ; Uriarte, J.J. ; Borg, Z.D. ; Coffey, A.L. ; Bonenfant, N.R. ; Weiss, D.J. ; Wagner, D.E.

Residual detergent detection method for nondestructive cytocompatibility evaluation of decellularized whole lung scaffolds.

de Jong, S.E. ; Selman, M.H.J. ; Adegnika, A.A. ; Amoah, A.S. ; van Riet, E. ; Kruize, Y.C.M. ; Raynes, J.G. ; Rodriguez, A. ; Boakye, D. ; von Mutius, E. ; Knulst, A.C. ; Genuneit, J. ; Cooper, P.J. ; Hokke, C.H. ; Wuhrer, M. ; Yazdanbakhsh, M.

IgG1 Fc N-glycan galactosylation as a biomarker for immune activation.
J. Cyst. Fibros. 15, 340-349 (2016)

Hector, A. ; Kirn, T. ; Ralhan, A. ; Graepler-Mainka, U. ; Berenbrinker, S. ; Riethmueller, J. ; Hogardt, M. ; Wagner, M. ; Pfleger, A. ; Autenrieth, I. ; Kappler, M. ; Griese, M. ; Eber, E. ; Martus, P. ; Hartl, D.

Microbial colonization and lung function in adolescents with cystic fibrosis.
Thorax 71, 675-676 (2016)

Staab-Weijnitz, C.A. ; Eickelberg, O.

Repositioning compounds from cancer drug discovery to IPF: PI3K inhibition.
Tissue Eng. Part C Meth. 22, 725-739 (2016)

Platz, J. ; Bonenfant, N.R. ; Uhl, F. ; Coffey, A.J. ; McKnight, T. ; Parsons, C. ; Sokocevic, D. ; Borg, Z.D. ; Lam, Y.W. ; Deng, B. ; Fields, J. ; Desarno, M. ; Loi, R. ; Hoffman, A. ; Bianchi, J. ; Dacken, B. ; Petersen, T. ; Wagner, D.E. ; Weiss, D.J.

Comparative study to the use of decellularized alpha-Gal KO pig lungs for xenogeneic lung transplantation.
Cell Rep. 16, 120-132 (2016)

McLoed, A.G. ; Sherrill, T.P. ; Cheng, D.S. ; Han, W. ; Saxon, J.A. ; Gleaves, L.A. ; Wu, P. ; Polosukhin, V.V. ; Karin, M. ; Yull, F.E. ; Stathopoulos, G.T. ; Georgoulias, V. ; Zaynagetdinov, R. ; Blackwell, T.S.

Neutrophil-derived IL-1β impairs the efficacy of NF-κB inhibitors against lung cancer.

Chen, S. ; Yin, R. ; Mutze, K. ; Yu, Y. ; Takenaka, S. ; Königshoff, M. ; Stöger, T.

No involvement of alveolar macrophages in the initiation of carbon nanoparticle induced acute lung inflammation in mice.
Eur. Respir. Rev. 25, 189-198 (2016)

Psallidas, I. ; Kalomenidis, I. ; Porcel, J.M. ; Robinson, B.W. ; Stathopoulos, G.T.

Malignant pleural effusion: From bench to bedside.

Subramanian, D.R. ; Gupta, S. ; Burggraf, D. ; vom Silberberg, S. ; Heimbeck, I. ; Heiss-Neumann, M.S. ; Haeussinger, K. ; Newby, C. ; Hargadon, B. ; Raj, V. ; Singh, D. ; Kolsum, U. ; Hofer, T.P. ; Al-Shair, K. ; Luetzen, N. ; Prasse, A. ; Müller-Quernheim, J. ; Benea, G. ; Leprotti, S. ; Boschetto, P. ; Gorecka, D. ; Nowinski, A. ; Oniszh, K. ; zu Castell, W. ; Hagen, M. ; Barta, I. ; Döme, B. ; Strausz, J. ; Greulich, T. ; Vogelmeier, C. ; Koczulla, A.R. ; Gut, I. ; Hohlfeld, J. ; Welte, T. ; Lavae-Mokhtari, M. ; Ziegler-Heitbrock, L. ; Brightling, C. ; Parr, D.G.

Emphysema- and airway-dominant COPD phenotypes defined by standardised quantitative computed tomography.
Biophys. J. 110, 134A (2016)

Zensen, C. ; Buelvas, I. ; Eickelberg, O. ; Lohmueller, T. ; Feldmann, J.

'Optical shaking' of red blood cells: A strategy to measure cell-fluid coupling with optical tweezers.

Hamon, Y. ; Legowska, M. ; Herve, V. ; Dallet-Choisy, S. ; Marchand-Adam, S. ; Vanderlynden, L. ; Demonte, M. ; Williams, R. ; Scott, C.J. ; Si-Tahar, M. ; Heuze-Vourc'h, N. ; Lalmanach, G. ; Jenne, D. ; Lesner, A. ; Gauthier, F. ; Korkmaz, B.

Neutrophilic cathepsin C is maturated by a multistep proteolytic process and secreted by activated cells during inflammatory lung diseases.

Lowe, A.J. ; Lodge, C.J. ; Allen, K.J. ; Abramson, M.J. ; Matheson, M.C. ; Thomas, P.S. ; Barton, C.A. ; Bennett, C.M. ; Erbas, B. ; Svanes, C. ; Wjst, M. ; Gómez Real, F. ; Perret, J.L. ; Russell, M.A. ; Southey, M.C. ; Hopper, J.L. ; Gurrin, L.C. ; Axelrad, C.J. ; Hill, D.J. ; Dharmage, S.C.

Cohort profile: Melbourne Atopy Cohort study (MACS).
Analyst 141, 4293-4298 (2016)

Zhou, H. ; Wang, Q. ; Yuan, D. ; Wang, J. ; Huang, Y. ; Wu, H. ; Jian, J. ; Yang, D. ; Huang, N. ; Haisch, C. ; Jiang, Z. ; Chen, S.

Early apoptosis real-time detection by label-free SERS based on externalized phosphatidylserine.
J. Aerosol Med. Pulm. Drug Deliv. 29, 107-126 (2016)

Darquenne, C. ; Fleming, J.S. ; Katz, I. ; Martin, A.R. ; Schroeter, J. ; Usmani, O.S. ; Venegas, J. ; Schmid, O.

Bridging the gap between science and clinical efficacy: Physiology, imaging, and modeling of aerosols in the lung.

Bowatte, G. ; Lodge, C.J. ; Lowe, A.J. ; Erbas, B. ; Dennekamp, M. ; Marks, G.B. ; Perret, J. ; Hui, J. ; Wjst, M. ; Gurrin, L.C. ; Allen, K.J. ; Abramson, M.J. ; Matheson, M.C. ; Dharmage, S.C.

Do variants in GSTs modify the association between traffic air pollution and asthma in adolescence?
Data Brief 7, 1175-1178 (2016)

Lipka, J. ; Semmler-Behnke, M. ; Wenk, A. ; Burkhardt, J. ; Aigner, A. ; Kreyling, W.G.

Biokinetic datasets of PEI F25-LMW complexed and non-complexed 32P-siRNA within different lung compartments.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 55, 309-322 (2016)

Kolahian, S. ; Fernandez, I.E. ; Eickelberg, O. ; Hartl, D.

Immune mechanisms in pulmonary fibrosis.

Welk, V. ; Coux, O. ; Kleene, V. ; Abeza, C. ; Trümbach, D. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Inhibition of proteasome activity induces formation of alternative proteasome complexes.

Yaroshenko, A. ; Pritzke, T. ; Koschlig, M. ; Kamgari, N. ; Willer, K. ; Gromann, L. ; Auweter, S. ; Hellbach, K. ; Reiser, M. ; Eickelberg, O. ; Pfeiffer, F. ; Hilgendorff, A.

Visualization of neonatal lung injury associated with mechanical ventilation using X-ray dark-field radiography.

Ehrhardt, H. ; Pritzke, T. ; Oak, P. ; Kossert, M. ; Biebach, L. ; Forster, K. ; Koschlig, M. ; Alvira, C.M. ; Hilgendorff, A.

Absence of TNF-α enhances inflammatory response in the newborn lung undergoing mechanical ventilation.
Nanoscale 8, 8058-8069 (2016)

van Rijt, S.H. ; Bölükbas, D.A. ; Argyo, C. ; Wipplinger, K. ; Naureen, M. ; Datz, S. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S. ; Bein, T. ; Schmid, O. ; Stöger, T.

Applicability of avidin protein coated mesoporous silica nanoparticles as drug carriers in the lung.
Acta Biomater. 32, 256-263 (2016)

Sui, T. ; Lunt, A.J.G. ; Baimpas, N. ; Sandholzer, M. ; Li, T. ; Zeng, K. ; Landini, G. ; Korsunsky, A.M.

Understanding nature's residual strain engineering at the human dentine-enamel junction interface.
Eur. Respir. J. 47, 1842-1854 (2016)

Horowitz, J.C. ; Osterholzer, J.J. ; Marazioti, A. ; Stathopoulos, G.T.

"Scar-cinoma": Viewing the fibrotic lung mesenchymal cell in the context of cancer biology.

Kermanizadeh, A. ; Gosens, I. ; MacCalman, L. ; Johnston, H. ; Danielsen, P.H. ; Jacobsen, N.R. ; Lenz, A.-G. ; Fernandes, T.F. ; Schins, R.P. ; Cassee, F.R. ; Wallin, H. ; Kreyling, W.G. ; Stöger, T. ; Loft, S. ; Møller, P. ; Tran, L. ; Stone, V.

A multilaboratory toxicological assessment of a panel of 10 engineered nanomaterials to human health - ENPRA project - the highlights, limitations, and current and future challenges.

Fernandez, I.E. ; Amarie, O.V. ; Mutze, K. ; Königshoff, M. ; Yildirim, A.Ö. ; Eickelberg, O.

Systematic phenotyping and correlation of biomarkers with lung function and histology in lung fibrosis.

Leppkes, M. ; Maueroeder, C. ; Hirth, S. ; Nowecki, S. ; Guenther, C. ; Billmeier, U. ; Paulus, S. ; Biermann, M. ; Munoz, L.E. ; Hoffmann, M. ; Wildner, D. ; Croxford, A.L. ; Waisman, A. ; Mowen, K. ; Jenne, D. ; Krenn, V. ; Mayerle, J. ; Lerch, M.M. ; Schett, G. ; Wirtz, S. ; Neurath, M.F. ; Hermann, M. ; Becker, C.

Externalized decondensed neutrophil chromatin occludes pancreatic ducts and drives pancreatitis.
Cell Death Differ. 23, 1026-1037 (2016)

Chen, S. ; Kammerl, I.E. ; Vosyka, O. ; Baumann, T. ; Yu, Y. ; Wu, Y. ; Irmler, M. ; Overkleeft, H.S. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S. ; Stöger, T.

Immunoproteasome dysfunction augments alternative polarization of alveolar macrophages.
PLoS ONE 11:e0147388 (2016)

Minelli, C. ; Dean, C.H. ; Hind, M. ; Alves, A.C. ; Amaral, A.F.S. ; Siroux, V. ; Huikari, V. ; Artigas, M.S. ; Evans, D.M ; Loth, D.W. ; Bossé, Y. ; Postma, D.S. ; Sin, D. ; Thompson, J. ; Demenais, F. ; Henderson, J. ; SpiroMeta Consortium () ; CHARGE Consortium (Albrecht, E. ; Flexeder, C. ; Gieger, C. ; Grallert, H. ; Hampel, R. ; Heinrich, J. ; Karrasch, S. ; Schulz, H. ; Wjst, M.) ; Bouzigon, E. ; Jarvis, D. ; Jarvelin, M.R. ; Burney, P.

Association of forced vital capacity with the developmental gene NCOR2.

Wysocka, M. ; Gruba, N. ; Grzywa, R. ; Giełdoń, A. ; Bąchor, R. ; Brzozowski, K. ; Sienczyk, M. ; Jenne, D. ; Szewczuk, Z. ; Rolka, K. ; Lesner, A.

PEGylated substrates of NSP4 protease: A tool to study protease specificity.

Putman, R.K. ; Hatabu, H. ; Araki, T. ; Gudmundsson, G. ; Gao, W. ; Nishino, M. ; Okajima, Y. ; Dupuis, J. ; Latourelle, J.C. ; Cho, M.H. ; El-Chemaly, S. ; Coxson, H.O. ; Celli, B.R. ; Fernandez, I.E. ; Zazueta, O.E. ; Ross, J.C. ; Harmouche, R. ; Estépar, R.S. ; Diaz, A.A. ; Sigurdsson, S. ; Gudmundsson, E.F. ; Eiriksdottir, G. ; Aspelund, T. ; Budoff, M.J. ; Kinney, G.L. ; Hokanson, J.E. ; Williams, M.C. ; Murchison, J.T. ; MacNee, W. ; Hoffmann, U. ; O'Donnell, C.J. ; Launer, L.J. ; Harrris, T.B. ; Gudnason, V. ; Silverman, E.K. ; O'Connor, G.T. ; Washko, G.R. ; Rosas, I.O. ; Hunninghake, G.M.

Association between interstitial lung abnormalities and all-cause mortality.

Klee, S. ; Lehmann, M. ; Wagner, D.E. ; Baarsma, H.A. ; Königshoff, M.

WISP1 mediates IL-6-dependent proliferation in primary human lung fibroblasts.
Int. Immunol. 28, 473-487 (2016)

Bartmann, J. ; Frankenberger, M. ; Neurohr, C. ; Eickelberg, O. ; Nößner, E. ; von Wulffen, W.

A novel role of MMP-13 for murine DC function: Its inhibition dampens T cell activation.

Heinzelmann, K. ; Noskovicova, N. ; Merl-Pham, J. ; Preissler, G. ; Winter, H. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Hauck, S.M. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.

Surface proteome analysis identifies platelet derived growth factor receptor-alpha as a critical mediator of transforming growth factor-beta-induced collagen secretion.

Kammerl, I.E. ; Dann, A. ; Mossina, A. ; Brech, D. ; Lukas, C. ; Vosyka, O. ; Nathan, P. ; Conlon, T.M. ; Wagner, D.E. ; Overkleeft, H.S. ; Prasse, A. ; Rosas, I.O. ; Straub, T. ; Krauss-Etschmann, S. ; Königshoff, M. ; Preissler, G. ; Winter, H. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Heinzelmann, K. ; Yildirim, A.Ö. ; Nößner, E. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Impairment of immunoproteasome function by cigarette smoke and in COPD.
Pflugers Arch. 468, 1-2 (2016)

Mori, Y. ; Takahashi, N. ; Ogawa, N. ; Gudermann, T.

Oxygen physiology: Sensors and ion channels.
FASEB J. 30, 1823-1835 (2016)

Spanjer, A.I. ; Baarsma, H.A. ; Oostenbrink, L.M. ; Jansen, S.R. ; Kuipers, C.C. ; Lindner, M. ; Postma, D.S. ; Meurs, H. ; Heijink, I.H. ; Gosens, R. ; Königshoff, M.

TGF-β-induced profibrotic signaling is regulated in part by the WNT receptor Frizzled-8.
Appl. Environ. Microbiol. 82, 1530-1536 (2016)

Zhang, P. ; Xie, G. ; Liu, X. ; Ai, L. ; Chen, Y. ; Meng, X. ; Bi, Y. ; Chen, J. ; Sun, Y. ; Stöger, T. ; Ding, Z. ; Yin, R.

High genetic diversity of Newcastle disease virus in wild and domestic birds in Northeastern China from 2013 to 2015 reveals potential epidemic trends.
Histochem. Cell Biol. 145, 201-211 (2016)

Sun, N. ; Fernandez, I.E. ; Wei, M. ; Wu, Y. ; Aichler, M. ; Eickelberg, O. ; Walch, A.K.

Pharmacokinetic and pharmacometabolomic study of pirfenidone in normal mouse tissues using high mass resolution MALDI-FTICR-mass spectrometry imaging.

Bardou, O. ; Menou, A. ; François, C. ; Duitman, J.W. ; von der Thüsen, J.H. ; Borie, R. ; Sales, K.U. ; Mutze, K. ; Castier, Y. ; Sage, E.H. ; Liu, L. ; Bugge, T.H. ; Fairlie, D.P. ; Königshoff, M. ; Crestani, B. ; Borensztajn, K.S.

Membrane-anchored serine protease matriptase is a trigger of pulmonary fibrogenesis.
FEBS J. 283, 498-509 (2016)

Hamon, Y. ; Legowska, M. ; Fergelot, P. ; Dallet-Choisy, S. ; Newell, L. ; Vanderlynden, L. ; Kord Valeshabad, A. ; Acrich, K. ; Kord, H. ; Charalampos, T. ; Morice-Picard, F. ; Surplice, I. ; Zoidakis, J. ; David, K. ; Vlahou, A. ; Ragunatha, S. ; Nagy, N. ; Farkas, K. ; Széll, M. ; Goizet, C. ; Schacher, B. ; Battino, M. ; Al Farraj Aldosari, A. ; Wang, X. ; Liu, Y. ; Marchand-Adam, S. ; Lesner, A. ; Kara, E. ; Korkmaz-Icöz, S. ; Moss, C. ; Eickholz, P. ; Taïeb, A. ; Kavukcu, S. ; Jenne, D. ; Gauthier, F. ; Korkmaz, B.

Analysis of urinary cathepsin C for diagnosing Papillon-Lefèvre syndrome.
Clin. Sci. 130, 273-287 (2016)

Conlon, T.M. ; Bartel, J. ; Ballweg, K. ; Günter, S. ; Prehn, C. ; Krumsiek, J. ; Meiners, S. ; Theis, F.J. ; Adamski, J. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Metabolomics screening identifies reduced L-carnitine to be associated with progressive emphysema.
J. Cyst. Fibros. 15, 325-331 (2016)

Chillappagari, S. ; Müller, C. ; Mahavadi, P. ; Guenther, A. ; Nahrlich, L. ; Rosenblum, J. ; Rubin, B.K. ; Henke, M.O.

A small molecule neutrophil elastase inhibitor, KRP-109, inhibits cystic fibrosis mucin degradation.
Mucosal Immunol. 9, 240-253 (2016)

Karo-Atar, D. ; Bordowitz, A. ; Wand, O. ; Pasmanik-Chor, M. ; Fernandez, I.E. ; Itan, M. ; Frenkel, R. ; Herbert, D.R. ; Finkelman, F.D. ; Eickelberg, O. ; Munitz, A.

A protective role for IL-13 receptor α 1 in bleomycin-induced pulmonary injury and repair.
Oncotarget 7, 30068-30083 (2016)

John-Schuster, G. ; Günter, S. ; Hager, K. ; Conlon, T.M. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

Inflammaging increases susceptibility to cigarette smoke-induced COPD.