Rolled up magazines on blue background

Alle Publikationen

Nat. Mater., DOI: 10.1038/s41563-025-02418-0 (2025)

Karfusehr, C. ; Eder, M. ; Yang, H.Y. ; Beinsteiner, B. ; Jasnin, M. ; Simmel, F.C.

Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes.
GigaScience 14, DOI: 10.1093/gigascience/giaf100 (2025)

Urel, H. ; Benassou, S. ; Marti, H. ; Reska, T.T.M. ; Sauerborn, E. ; Pinheiro Alves de Souza, Y. ; Perlas Puente,A. ; Rayo, E. ; Biggel, M. ; Kesselheim, S. ; Borel, N. ; Martin, E.J. ; Venegas, C.B. ; Schloter, M. ; Schröder, K. ; Mittelstrass, J. ; Prospero, S. ; Ferguson, J.M. ; Urban, L.

Nanopore- and AI-empowered microbial viability inference.
In:. 2025. 151-158 (Methods Mol. Biol. ; 2958)

Introini, V. ; Porcella, G. ; Kidiyoor, G.R. ; Cicuta, P. ; Cosentino Lagomarsino, M.

Quantifying Nuclear Shape Fluctuations During Early Mitosis.
Cell Rep. 44:116474 (2025)

Ries, C. ; Stark, T. ; Boulat, B. ; Ruhwedel, T. ; Delling, J.P. ; Infante, A.M. ; von Poblotzki, J.T. ; Ulivi, A.F. ; von Mücke-Heim, I.A. ; Chang, S.C.-E. ; Sakimura, K. ; Itoi, K. ; Nestvogel, D.B. ; Attardo, A. ; Czisch, M. ; Nave, K.A. ; Möbius, W. ; Dimou, L. ; Deussing, J.M.

Neuropeptide CRH prevents premature differentiation of OPCs following CNS injury and in early postnatal development.
PLoS ONE 20:e0333994 (2025)

Gygax, D. ; Ramirez, S. ; Chibesa, M. ; Simpamba, T. ; Riffel, M. ; Riffel, T. ; Srivathsan, A. ; Nijland, R. ; Urban, L.

Evaluation of nanopore sequencing for increasing accessibility of eDNA studies in biodiverse countries.
Genome Res. 35, 2682-2690 (2025)

Nappi, A. ; Shilova, L. ; Karaletsos, T. ; Cai, N. ; Casale, F.P.

BayesRVAT enhances rare-variant association testing through Bayesian aggregation of functional annotations.
Opt. Commun. 596:132519 (2025)

Ma, Q. ; Ma, R. ; Yu, H. ; Jiang, X. ; Zhou, Q. ; Wang, X. ; Liang, X. ; Ni, K.

Inverse design of mode-locked fiber lasers based on conditional generative adversarial network (cGAN).
Stem Cell Res. Ther. 16:573 (2025)

Klassen, M.C. ; Balázs, A. ; Zöllner, J. ; Cleve, N. ; Czichon, L. ; von Schledorn, L. ; Hegermann, J. ; Nawroth, J. ; Roth, D. ; Mielenz, M. ; Hedtfeld, S. ; Stanke, F. ; Rubil, T. ; Ius, F. ; Jonigk, D. ; Hanrahan, J.W. ; Ruhparwar, A. ; Olmer, R. ; Mall, M.A. ; Merkert, S. ; Martin, U.

Human induced pluripotent stem cells for in vitro modeling of impaired mucociliary clearance in cystic fibrosis lung disease.
Allergy, DOI: 10.1111/all.70121 (2025)

Korkmaz, R.Ü. ; Omony, J. ; Tan, X. ; Klotz, M. ; Dragunas, G. ; Chen, S. ; Shankhwar, S. ; Ertüz, Z. ; Müller, C. ; Ragab, M. ; Jeridi, A. ; Augustin, R. ; Nawroth, J. ; Kapellos, T. ; Rankl, B. ; Yildirim, A.Ö. ; von Mutius, E.

The therapeutic potential of farm dust extracts in a mouse model of eosinophilic inflammation.
Z. Gastroenterol. 63, e452 - e452 (2025)

Neckermann, L. ; Erdösi, P. ; Zhang, L. ; Assum, I. ; Dropmann, A. ; Alaoua, S. ; Büttner, M. ; Lin, T. ; Gerstner, M. ; Ebert, M.P. ; Bantel, H. ; Dooley, S. ; Kluth, A. ; Menden, M.P. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Hammad, S.

Preclinical evaluation of human ABCB5+ skin-derived stem cells reveals regenerative mechanisms and prognostic markers in a novel ACLF mouse model.
ACS Biomater. Sci. Eng. 11, 6506-6514 (2025)

Roth, D. ; Zampa, B. ; Augustin, R. ; Payandehjoo, D. ; Porcella, G. ; Sahin, A.T. ; van der Does, A.M. ; Nawroth, J.

Release, transfer, fold: Using a silicone adhesive for on-demand 3D tissue engineering.
Mol. Cell 85, 2503-2516.e8 (2025)

Matthews, R.E. ; Danac, J.M.C. ; Naden, E.L. ; Farleigh Smith, L.E. ; Lestari, S. ; Gungi, A. ; Appert, A. ; Buttress, T. ; Verma, A. ; Sinclair, O. ; Chong, F. ; Suberu, J. ; Antrobus, R. ; Bonev, B. ; Dawson, M.A. ; Reid, A.J. ; Timms, R.T. ; Ahringer, J. ; Tchasovnikarova, I.A.

CRAMP1 drives linker histone expression to enable Polycomb repression.
J. Invest. Dermatol., DOI: 10.1016/j.jid.2025.05.010 (2025)

Schneider, M.R. ; Meier, M.

Bringing high-resolution spatial order to sebaceous glands.
PLoS ONE 20:e0324189 (2025)

Davis, K.A.S. ; Coleman, J.R.I. ; Adams, M. ; Breen, G. ; Cai, N. ; Davies, H.L. ; Davies, K.J.A. ; Dregan, A. ; Eley, T.C. ; Fox, E. ; Holliday, J. ; Hübel, C. ; John, A. ; Kassam, A.S. ; Kempton, M.J. ; Lee, W. ; Li, D. ; Maina, J.G. ; McCabe, R. ; McIntosh, A.M. ; Oram, S. ; Richards, M. ; Skelton, M. ; Starkey, F. ; Ter Kuile, A.R. ; Thornton, L.M. ; Wang, R. ; Yu, Z. ; Zvrskovec, J. ; Hotopf, M.

The UK Biobank mental health enhancement 2022: Methods and results.
Nat. Methods, DOI: 10.1038/s41592-025-02694-3 (2025)

Ma, R. ; Santino, L.M. ; Chobola, T. ; Armbrust, N. ; Geilenkeuser, J. ; Sukumaran, S. ; Jing, Z. ; Levkina, A. ; Ridderbeek, K. ; Peng, T. ; Truong, D.J.J. ; Doll, S. ; Westmeyer, G.G. ; Cui, J.

A telescopic microscope equipped with a quanta image sensor for live-cell bioluminescence imaging.
eLife 13:RP95557 (2025)

Merino‐Salomón, A. ; Schneider, J. ; Babl, L. ; Krohn, J.F. ; Sobrinos‐Sanguino, M. ; Schäfer, T. ; Luque-Ortega, J.R. ; Alfonso, C. ; Jimenez, M. ; Jasnin, M. ; Schwille, P. ; Rivas, G.

Crosslinking by ZapD drives the assembly of short FtsZ filaments into toroidal structures in solution.
In: (Research in Computational Molecular Biology). 2025. 428-431 (Lect. Notes Comput. Sc. ; 15647 LNBI)

Nappi, A. ; Cai, N. ; Casale, F.P.

Bayesian aggregation of multiple annotations enhances rare variant association testing.
J. Am. Chem. Soc. 147, 17384–17393 (2025)

Spearman, A.L. ; Lin, E.Y. ; Mobley, E.B. ; Chmyrov, A. ; Arus, B.A. ; Turner, D.W. ; Garcia, C.A. ; Bui, K. ; Rowlands, C.J. ; Bruns, O.T. ; Sletten, E.M.

High-resolution multicolor shortwave infrared dynamic in vivo imaging with chromenylium nonamethine dyes.

Alvarez-Costes, S. ; Baker, C.S. ; Constantine, R. ; Carroll, E.L. ; Guhlin, J. ; Dutoit, L. ; Ferreira, S. ; Heimeier, D. ; Gemmell, N.J. ; Gillum, J. ; Hamner, R.M. ; Rayment, W. ; Roe, W. ; Te Aikā, B. ; Urban, L. ; Alexander, A.

Leveraging synteny to generate reference genomes for conservation: Assembling the genomes of Hector's and Māui dolphins.
Nat. Biotechnol., DOI: 10.1038/s41587-024-02528-1 (2025)

Luo, J. ; Molbay, M. ; Chen, Y. ; Horvath, I. ; Kadletz, K. ; Kick, B. ; Zhao, S. ; Al-Maskari, R. ; Singh, I. ; Ali, M. ; Bhatia, H.S. ; Minde, D.-P. ; Negwer, M. ; Höher, L. ; Calandra, G.M. ; Groschup, B. ; Su, J. ; Kimna, C. ; Rong, Z. ; Galensowske, N. ; Todorov, M.I. ; Jeridi, D. ; Ohn, T.-L. ; Roth, S. ; Simats, A. ; Singh, V. ; Khalin, I. ; Pan, C. ; Arus, B.A. ; Bruns, O.T. ; Zeidler, R. ; Liesz, A. ; Protzer, U. ; Plesnila, N. ; Ussar, S. ; Hellal, F. ; Paetzold, J.C. ; Elsner, M. ; Dietz, H. ; Ertürk, A.

Nanocarrier imaging at single-cell resolution across entire mouse bodies with deep learning.

Hölzlwimmer, F.R. ; Lindner, J. ; Tsitsiridis, G. ; Wagner, N. ; Casale, F.P. ; Yépez, V.A. ; Gagneur, J.

Aberrant gene expression prediction across human tissues.
ACS App. Optic. Mat. 3, 676-688 (2025)

Zhou, J. ; Ridderbeek, K. ; Zou, P. ; Naden, A.B. ; Gaussmann, S. ; Song, F. ; Falter-Braun, P. ; Kay, E.R. ; Sattler, M. ; Cui, J.

Modular nanoparticle platform for solution-phase optical sensing of protein-protein interactions.
Virus Evol. 11:veaf010 (2025)

Perlas Puente,A. ; Reska, T.T.M. ; Croville, G. ; Tarrés-Freixas, F. ; Guérin, J.L. ; Majó, N. ; Urban, L.

Improvements in RNA and DNA nanopore sequencing allow for rapid genetic characterization of avian influenza.
Chem. Commun. 61, 4820-4823 (2025)

Pieczykolan, M. ; Dancer, P.A. ; Klein, T. ; Piwonski, H. ; Rolbieski, H. ; Maity, B. ; Bruns, O.T. ; Cavallo, L. ; Kiessling, F. ; Rueping, M. ; Banala, S.

Small organic fluorophores with SWIR emission detectable beyond 1300 nm.

Han, S. ; Yu, S. ; Shi, M. ; Harada, M. ; Ge, J. ; Lin, J. ; Prehn, C. ; Petrera, A. ; Li, Y. ; Sam, F. ; Matullo, G. ; Adamski, J. ; Suhre, K. ; Gieger, C. ; Hauck, S.M. ; Herder, C. ; Roden, M. ; Casale, F.P. ; Cai, N. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R.

LEOPARD: Missing view completion for multi-timepoint omics data via representation disentanglement and temporal knowledge transfer.

Roth, D. ; Sahin, A.T. ; Ling, F. ; Tepho, N. ; Senger, C.N. ; Quiroz, E.J. ; Calvert, B.A. ; van der Does, A.M. ; Güney, T.G. ; Glasl, S. ; van Schadewijk, A. ; von Schledorn, L. ; Olmer, R. ; Kanso, E. ; Nawroth, J. ; Ryan, A.L.

Structure and function relationships of mucociliary clearance in human and rat airways.
JCI insight 10:e187899 (2025)

Koc-Gunel, S. ; Liu, E.C. ; Gautam, L.K. ; Calvert, B.A. ; Murthy, S. ; Harriott, N.C. ; Nawroth, J. ; Zhou, B. ; Krymskaya, V.P. ; Ryan, A.L.

Targeting fibroblast-endothelial interactions in LAM pathogenesis using 3D spheroid models and spatial transcriptomics.
Mol. Psychiatry 30:1715 (2025)

Cai, N. ; Verhulst, B. ; Andreassen, O.A. ; Buitelaar, J.K. ; Edenberg, H.J. ; Hettema, J.M. ; Gandal, M. ; Grotzinger, A. ; Jonas, K. ; Lee, P. ; Mallard, T.T. ; Mattheisen, M. ; Neale, M.C. ; Nurnberger, J.I. ; Peyrot, W.J. ; Tucker-Drob, E.M. ; Smoller, J.W. ; Kendler, K.S.

Correction: Assessment and ascertainment in psychiatric molecular genetics: challenges and opportunities for cross-disorder research.
Acta Biomater. 195, 536-546 (2025)

Huang, Y. ; Stankevych, M. ; Gujrati, V. ; Klemm, U. ; Mohammed, A. ; Wiesner, D. ; Saccomano, M. ; Tost, M. ; Feuchtinger, A. ; Mishra, K. ; Bruns, O.T. ; Geerlof, A. ; Ntziachristos, V. ; Stiel, A.-C.

Photoswitching protein-XTEN fusions as injectable optoacoustic probes.

Li, W. ; Li, A. ; Yu, B. ; Zhang, X. ; Liu, X. ; White, K.L. ; Stevens, R.C. ; Baumeister, W. ; Sali, A. ; Jasnin, M. ; Sun, L.

In situ structure of actin remodeling during glucose-stimulated insulin secretion using cryo-electron tomography.
Mol. Psychiatry, DOI: 10.1038/s41380-024-02878-x (2024)

Cai, N. ; Verhulst, B. ; Andreassen, O.A. ; Buitelaar, J.K. ; Edenberg, H.J. ; Hettema, J.M. ; Gandal, M. ; Grotzinger, A. ; Jonas, K. ; Lee, P. ; Mallard, T.T. ; Mattheisen, M. ; Neale, M.C. ; Nurnberger, J.I. ; Peyrout, W. ; Tucker-Drob, E.M. ; Smoller, J.W. ; Kendler, K.S.

Assessment and ascertainment in psychiatric molecular genetics: challenges and opportunities for cross-disorder research.
Nat. Neurosci., DOI: 10.1038/s41593-024-01858-2 (2024)

Bonev, B. ; Castelo-Branco, G. ; Chen, F. ; Codeluppi, S. ; Corces, M.R. ; Fan, J. ; Heiman, M. ; Harris, K. ; Inoue, F. ; Kellis, M. ; Levine, A.P. ; Lotfollahi, M. ; Luo, C. ; Maynard, K.R. ; Nitzan, M. ; Ramani, V. ; Satijia, R. ; Schirmer, L. ; Shen, Y. ; Sun, N. ; Green, G.S. ; Theis, F. ; Wang, X. ; Welch, J.D. ; Gokce, O. ; Konopka, G. ; Liddelow, S.A. ; Macosko, E. ; Ali Bayraktar, O. ; Habib, N. ; Nowakowski, T.J.

Author Correction: Opportunities and challenges of single-cell and spatially resolved genomics methods for neuroscience discovery.
Eur. Respir. J. 64:2401531 (2024)

Funk, M.C. ; Nawroth, J. ; Lehmann, M.

A breath of the future: A novel human model for COPD and beyond.
Cell Genom. 4:100722 (2024)

Sadowski, M. ; Thompson, M. ; Mefford, J. ; Haldar, T. ; Oni-Orisan, A. ; Border, R. ; Pazokitoroudi, A. ; Cai, N. ; Ayroles, J.F. ; Sankararaman, S. ; Dahl, A.W. ; Zaitlen, N.

Characterizing the genetic architecture of drug response using gene-context interaction methods.
N. Z. J. Zool., DOI: 10.1080/03014223.2024.2427719 (2024)

West, A.G. ; Ayriss, N.J. ; Hoggard, M. ; Digby, A. ; Eason, D. ; Uddstrom, L. ; Chatterton, J. ; Handley, K.M. ; Urban, L. ; Taylor, M.W.

Elusive aetiology of exudative cloacitis in the critically endangered kākāpō.
Nat. Neurosci. 27, 2292-2309 (2024)

Bonev, B. ; Gonçalo, C.B. ; Chen, F. ; Codeluppi, S. ; Corces, M.R. ; Fan, J. ; Heiman, M. ; Harris, K. ; Inoue, F. ; Kellis, M. ; Levine, A.P. ; Lotfollahi, M. ; Luo, C. ; Maynard, K.R. ; Nitzan, M. ; Ramani, V. ; Satijia, R. ; Schirmer, L. ; Shen, Y. ; Sun, N. ; Green, G.S. ; Theis, F. ; Wang, X. ; Welch, J.D. ; Gokce, O. ; Konopka, G. ; Liddelow, S.A. ; Macosko, E. ; Bayraktar, O. ; Habib, N. ; Nowakowski, T.J.

Opportunities and challenges of single-cell and spatially resolved genomics methods for neuroscience discovery.

Reverte-López, M. ; Kanwa, N. ; Qutbuddin, Y. ; Belousova, V. ; Jasnin, M. ; Schwille, P.

Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division.
In:. 2024.:PA2654 (Eur. Respir. J. ; 64)

Roth, D. ; Sahin, A.T. ; Ling, F. ; Senger, C.N. ; Quiroz, E.J. ; Calvert, B.A. ; van der Does, A.M. ; Güney, T.G. ; Tepho, N. ; Glasl, S. ; van Schadewijk, A. ; von Schledorn, L. ; Olmer, R. ; Kanso, E. ; Nawroth, J. ; Ryan, A.L.

Structure-function relationships of mucociliary clearance in human airways.
Am. J. Hum. Genet., DOI: 10.1016/j.ajhg.2024.09.009 (2024)

Dybdahl Krebs, M. ; Georgii Hellberg, K.L. ; Lundberg, M. ; Appadurai, V. ; Ohlsson, H. ; Pedersen, E.S.L. ; Steinbach, J. ; Matthews, J. ; Border, R. ; LaBianca, S. ; Calle, X. ; Meijsen, J.J. ; Ingason, A. ; Buil, A. ; Vilhjálmsson, B.J. ; Flint, J. ; Bacanu, S.A. ; Cai, N. ; Dahl, A. ; Zaitlen, N. ; Werge, T. ; Kendler, K.S. ; Schork, A.J.

Genetic liability estimated from large-scale family data improves genetic prediction, risk score profiling, and gene mapping for major depression.
Genome Res. 34, 1276-1285 (2024)

Sens, D.W. ; Shilova, L. ; Gräf, L. ; Grebenshchikova, M. ; Eskofier, B.M. ; Casale, F.P.

Genetics-driven risk predictions leveraging the Mendelian randomization framework.
ACS Nano, DOI: 10.1021/acsnano.4c07932 (2024)

Arteaga Cardona, F. ; Madirov, E. ; Popescu, R. ; Wang, D. ; Busko, D. ; Ectors, D. ; Kübel, C. ; Eggeler, Y.M. ; Arus, B.A. ; Chmyrov, A. ; Bruns, O.T. ; Richards, B.S. ; Hudry, D.

Dramatic impact of materials combinations on the chemical organization of core-shell nanocrystals: Boosting the Tm3+ emission above 1600 nm.
STAR Protoc. 5:103300 (2024)

Remmert, C. ; Otgonbayar, M. ; Perschel, J.A. ; Marder, M. ; Meier, M.

Protocol to generate a microfluidic vessels-on-chip platform using human pluripotent stem cell-derived endothelial cells.
PLoS Biol. 22:e3002755 (2024)

Urban, L. ; Santure, A.W. ; Uddstrom, L.R. ; Digby, A. ; Vercoe, D. ; Eason, D. ; Crane, J. ; Wylie, M.J. ; Davis, T. ; LeLec, M.F. ; Guhlin, J. ; Poulton, S. ; Slate, J. ; Alexander, A. ; Fuentes-Cross, P. ; Dearden, P.K. ; Gemmell, N.J. ; Azeem, F. ; Weyland, M. ; Schwefel, H.G.L. ; van Oosterhout, C. ; Morales, H.E.

The genetic basis of the kākāpō structural color polymorphism suggests balancing selection by an extinct apex predator.
Zoo Biol., DOI: 10.1002/zoo.21859 (2024)

Martin, E.J. ; Speak, S.A. ; Urban, L. ; Morales, H.E. ; van Oosterhout, C.

Sonification of genomic data to represent genetic load in Zoo populations.
2024 in
In: (Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging, 27-30 May 2024, Athen). 345 E 47th St, New York, Ny 10017 Usa: Ieee, 2024. DOI: 10.1109/ISBI56570.2024.10635419

Lamm, L. ; Righetto, R. ; Peng, T.

Mean shift clustering as a loss function for accurate and segmentation-aware localization of macromolecules in cryo-electron tomography.
2024 in
In: (Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging). 345 E 47th St, New York, Ny 10017 Usa: Ieee, 2024. DOI: 10.1109/ISBI56570.2024.10635306

Ortega, J.V. ; Haas, M. ; Effland, A.

Learning Diffusion Functions for Image Restoration.
Nat. Phys. 20, 1679-1686 (2024)

Ling, F. ; Essock-Burns, T. ; McFall-Ngai, M. ; Katija, K. ; Nawroth, J. ; Kanso, E.

Flow physics guides morphology of ciliated organs.
ISME Commun. 4:ycae099 (2024)

Reska, T.T.M. ; Pozdniakova, S. ; Borràs, S. ; Perlas Puente,A. ; Sauerborn, E. ; Cañas, L. ; Schloter, M. ; Rodó, X. ; Wang, Y. ; Winkler, J.B. ; Schnitzler, J.-P. ; Urban, L.

Air monitoring by nanopore sequencing.
Ann. Hum. Biol. 51:2366248 (2024)

Esteban, M.E. ; Pino Garcia, D. ; Romero-Lorca, A. ; Novillo, A. ; Gaibar, M. ; Riancho, J.A. ; Rojas-Martinez, A. ; Flores, C. ; Lapunzina, P. ; Carracedo, A. ; Athanasiadis, G.I. ; Fernández-Santander, A.

Worldwide distribution of genetic factors related to severity of COVID-19 infection.
Cell 187, 4637-4655.e26 (2024)

Simats, A. ; Zhang, S. ; Messerer, D. ; Chong, F. ; Beşkardeş, S. ; Chivukula, A.S. ; Cao, J. ; Besson-Girard, S. ; Montellano, F.A. ; Morbach, C. ; Carofiglio, O. ; Ricci, A. ; Roth, S. ; Llovera, G. ; Singh, R. ; Chen, Y. ; Filser, S. ; Plesnila, N. ; Braun, C. ; Spitzer, H. ; Gokce, O. ; Dichgans, M. ; Heuschmann, P.U. ; Hatakeyama, K. ; Beltrán, E. ; Clauss, S. ; Bonev, B. ; Schulz, C. ; Liesz, A.

Innate immune memory after brain injury drives inflammatory cardiac dysfunction.
Nat. Neurosci. 27, 1260–1273 (2024)

Pereira, A. ; Diwakar, S.J. ; Masserdotti, G. ; Beşkardeş, S. ; Simon, T. ; So, Y. ; Martín-Loarte, L. ; Bergemann, F. ; Vasan, L. ; Schauer, T. ; Danese, A. ; Bocchi, R. ; Colomé-Tatché, M. ; Schuurmans, C. ; Philpott, A. ; Straub, T. ; Bonev, B. ; Götz, M.

Direct neuronal reprogramming of mouse astrocytes is associated with multiscale epigenome remodeling and requires Yy1.

Sauerborn, E. ; Corredor, N.C. ; Reska, T.T.M. ; Perlas Puente,A. ; Vargas da Fonseca Atum, S. ; Goldman, N. ; Wantia, N. ; Prazeres da Costa, C.U. ; Foster-Nyarko, E. ; Urban, L.

Detection of hidden antibiotic resistance through real-time genomics.
Circ. Res. 134, 1681-1702 (2024)

Palmer, J.A. ; Rosenthal, N. ; Teichmann, S.A. ; Litvinukova, M.

Revisiting cardiac biology in the rra of single cell and spatial omics.
Nat. Photonics, DOI: 10.1038/s41566-024-01465-4 (2024)

Wang, F. ; Zhong, Y. ; Bruns, O.T. ; Liang, Y. ; Dai, H.

Author Correction: In vivo NIR-II fluorescence imaging for biology and medicine (Nature Photonics, (2024), 10.1038/s41566-024-01391-5).
J. Hepatol. 81, 289-302 (2024)

Yin, K. ; Büttner, M. ; Deligiannis, I.K. ; Strzelecki, M. ; Zhang, L. ; Talavera Lopez, C.N. ; Theis, F.J. ; Odom, D.T. ; Martinez Jimenez, C.P.

Polyploidisation pleiotropically buffers ageing in hepatocytes.
IEEE Trans. Med. Imaging 43, 3742-3754 (2024)

Martinez-Sanchez, A. ; Lamm, L. ; Jasnin, M. ; Phelippeau, H.

Simulating the cellular context in synthetic datasets for cryo-electron tomography.
Cell Rep. 43:114008 (2024)

Marder, M. ; Remmert, C. ; Perschel, J.A. ; Otgonbayar, M. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Bushe, J. ; Feuchtinger, A. ; Sheikh, B. ; Moussus, M. ; Meier, M.

Stem cell-derived vessels-on-chip for cardiovascular disease modeling.

Brombal, L. ; Arfelli, F. ; Brun, F. ; Di Trapani, V. ; Endrizzi, M. ; Menk, R. ; Perion, P. ; Rigon, L. ; Saccomano, M. ; Tromba, G. ; Olivo, A.

Edge-illumination spectral phase-contrast tomography.
Nat. Photonics, DOI: 10.1038/s41566-024-01391-5 (2024)

Wang, F. ; Zhong, Y. ; Bruns, O.T. ; Liang, Y. ; Dai, H.

In vivo NIR-II fluorescence imaging for biology and medicine.
Biosens. Bioelectron. 252:116120 (2024)

Schmidt, S. ; Li, W. ; Schubert, M. ; Binnewerg, B. ; Prönnecke, C. ; Zitzmann, F.D. ; Bulst, M. ; Wegner, S. ; Meier, M. ; Guan, K. ; Jahnke, H.G.

Novel high-dense microelectrode array based multimodal bioelectronic monitoring system for cardiac arrhythmia re-entry analysis.
Nat. Genet. 56, 222-233 (2024)

Meng, X. ; Navoly, G. ; Giannakopoulou, O. ; Levey, D.F. ; Koller, D. ; Pathak, G.A. ; Koen, N. ; Lin, K. ; Adams, M.J. ; Rentería, M.E. ; Feng, Y. ; Gaziano, J.M. ; Stein, D.J. ; Zar, H.J. ; Campbell, M.L. ; van Heel, D.A. ; Trivedi, B. ; Finer, S. ; McQuillin, A. ; Bass, N.J. ; Chundru, V.K. ; Martin, H.C. ; Huang, Q.Q. ; Valkovskaya, M. ; Chu, C.Y. ; Kanjira, S. ; Kuo, P.H. ; Chen, H.C. ; Tsai, S.J. ; Liu, Y.L. ; Kendler, K.S. ; Peterson, R.E. ; Cai, N. ; Fang, Y.J. ; Sen, S. ; Scott, L.J. ; Burmeister, M. ; Loos, R.J.F. ; Preuss, M.H. ; Actkins, K.V. ; Davis, L.K. ; Uddin, M.N. ; Wani, A.H. ; Wildman, D.E. ; Aiello, A.E. ; Ursano, R.J. ; Kessler, R.C. ; Kanai, M. ; Okada, Y. ; Sakaue, S. ; Rabinowitz, J.A. ; Maher, B.S. ; Uhl, G. ; Eaton, W. ; Cruz-Fuentes, C.S. ; Martinez-Levy, G.A. ; Campos, A.I. ; Millwood, I.Y. ; Chen, Z. ; Li, L. ; Wassertheil-Smoller, S. ; Jiang, Y. ; Tian, C. ; Martin, N.G. ; Mitchell, B.L. ; Byrne, E.M. ; Awasthi, S. ; Coleman, J.R.I. ; Ripke, S. ; Sofer, T. ; Walters, R.G. ; McIntosh, A.M. ; Polimanti, R. ; Dunn, E.C. ; Stein, M.B. ; Gelernter, J. ; Lewis, C.M. ; Kuchenbaecker, K.

Multi-ancestry genome-wide association study of major depression aids locus discovery, fine mapping, gene prioritization and causal inference.

Pfaller, A.M. ; Kaplan, L. ; Moreira Carido Pereira, M. ; Grassmann, F. ; Díaz-Lezama, N. ; Ghaseminejad, F. ; Wunderlich, K.A. ; Glänzer, S. ; Bludau, O. ; Pannicke, T. ; Weber, B.H.F. ; Koch, S.F. ; Bonev, B. ; Hauck, S.M. ; Grosche, A.

The glucocorticoid receptor as a master regulator of the Müller cell response to diabetic conditions in mice.
Biosens. Bioelectron. 250:116042 (2024)

Zitzmann, F.D. ; Schmidt, S. ; Frank, R. ; Weigel, W. ; Meier, M. ; Jahnke, H.G.

Microcavity well-plate for automated parallel bioelectronic analysis of 3D cell cultures.
Mod. Pathol. 37:100350 (2024)

Wagner, S. ; Matek, C. ; Shetab Boushehri, S. ; Boxberg, M. ; Lamm, L. ; Sadafi, A. ; Winter, D. ; Marr, C. ; Peng, T.

Built to last? Reproducibility and reusability of deep learning algorithms in computational pathology.
eLife 12:RP84553 (2023)

Urban, L. ; Miller, A.K. ; Eason, D. ; Vercoe, D. ; Shaffer, M. ; Wilkinson, S.P. ; Jeunen, G.J. ; Gemmell, N.J. ; Digby, A.

Non-invasive real-time genomic monitoring of the critically endangered kākāpō.
Biol. Psychiatry 95, 1110-1121 (2023)

Huang, L. ; Tang, S. ; Rietkerk, J. ; Appadurai, V. ; Krebs, M.D. ; Schork, A.J. ; Werge, T. ; Zuber, V. ; Kendler, K. ; Cai, N.

Polygenic analyses show important differences between MDD symptoms collected using PHQ9 and CIDI-SF.
Nat. Cell Biol. 12, 1873-1883 (2023)

Noack, F. ; Vangelisti, S. ; Ditzer, N. ; Chong, F. ; Albert, M. ; Bonev, B.

Joint epigenome profiling reveals cell-type-specific gene regulatory programmes in human cortical organoids.
Adv. Mater. Technol. 8, 10:2300195 (2023)

Hörner, M. ; Becker, J. ; Bohnert, R. ; Baños, M. ; Jerez-Longres, C. ; Mühlhäuser, V. ; Härrer, D. ; Wong, T.W. ; Meier, M. ; Weber, W.

A photoreceptor-based hydrogel with red light-responsive reversible sol-gel transition as transient cellular matrix.
ICES J. Mar. Sci. 80, 953-971 (2023)

Adams, C.I.M. ; Jeunen, G.J. ; Cross, H. ; Taylor, H.R. ; Bagnaro, A. ; Currie, K. ; Hepburn, C. ; Gemmell, N.J. ; Urban, L. ; Baltar, F. ; Stat, M. ; Bunce, M. ; Knapp, M.

Environmental DNA metabarcoding describes biodiversity across marine gradients.
Laser Photon. Rev. 17:2300292 (2023)

Lingg, J.G.P. ; Bischof, T.S. ; Arus, B.A. ; Cosco, E. ; Sletten, E.M. ; Rowlands, C.J. ; Bruns, O.T. ; Chmyrov, A.

Shortwave-infrared line-scan confocal microscope for deep tissue imaging in intact organs.
Nat. Mach. Intell. 5, 273–283 (2023)

Rädsch, T. ; Reinke, A. ; Weru, V. ; Tizabi, M.D. ; Schreck, N. ; Kavur, A.E. ; Pekdemir, B. ; Roß, T. ; Kopp-Schneider, A. ; Maier-Hein, L.

Labelling instructions matter in biomedical image analysis.
Genome Biol. 24:234 (2023)

Sánchez Quant, E.S. ; Richter, M. ; Colomé-Tatché, M. ; Martinez Jimenez, C.P.

Single-cell metabolic profiling reveals subgroups of primary human hepatocytes with heterogeneous responses to drug challenge.
Cell Rep. 42:113305 (2023)

Gruber, T. ; Contreras, R. ; Sánchez Quant, E.S. ; Miok, V. ; Makris, K. ; Le Thuc, O. ; Gonzales García, I. ; Garcia-Clavé, E. ; Althammer, F. ; Krabichler, Q. ; DeCamp, L.M. ; Jones, R.G. ; Lutter, D. ; Williams, R.H. ; Pfluger, P.T. ; Müller, T.D. ; Woods, S.C. ; Pospisilik, J.A. ; Martinez-Jimenez, C.P. ; Tschöp, M.H. ; Grinevich, V. ; García-Cáceres, C.

High-calorie diets uncouple hypothalamic oxytocin neurons from a gut-to-brain satiation pathway via κ-opioid signaling.
Nat. Genet. 55, 2269-2276 (2023)

An, U. ; Pazokitoroudi, A. ; Alvarez, M. ; Huang, L. ; Bacanu, S.A. ; Schork, A.J. ; Kendler, K. ; Pajukanta, P. ; Flint, J. ; Zaitlen, N. ; Cai, N. ; Dahl, A. ; Sankararaman, S.

Deep learning-based phenotype imputation on population-scale biobank data increases genetic discoveries.
Nat. Genet. 55, 2082-2093 (2023)

Dahl, A. ; Thompson, M.L. ; An, U. ; Krebs, M.D. ; Appadurai, V. ; Border, R. ; Bacanu, S.A. ; Werge, T. ; Flint, J. ; Schork, A.J. ; Sankararaman, S. ; Kendler, K.S. ; Cai, N.

Phenotype integration improves power and preserves specificity in biobank-based genetic studies of major depressive disorder.
Mol. Ecol. 32, 4224-4241 (2023)

West, A.G. ; Digby, A. ; Santure, A.W. ; Guhlin, J.G. ; Dearden, P. ; Taylor, M.W. ; Urban, L.

Capturing species-wide diversity of the gut microbiota and its relationship with genomic variation in the critically endangered kākāpō.
Stem Cell Rep. 18, 1972-1986 (2023)

Rosowski, S. ; Remmert, C. ; Marder, M. ; Akishiba, M. ; Bushe, J. ; Feuchtinger, A. ; Platen, A. ; Ussar, S. ; Theis, F.J. ; Wiedenmann, S. ; Meier, M.

Single-cell characterization of neovascularization using hiPSC-derived endothelial cells in a 3D microenvironment.
2023 in
In: (Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging). 345 E 47th St, New York, Ny 10017 Usa: Ieee, 2023. 5 ( ; 2023-April)

Carvajal Maldonado, J. ; Lamm, L. ; Liu, Y. ; Righetto, R. ; Schnabel, J.A. ; Peng, T.

F2FD: Fourier Perturbations for Denoising Cryo-Electron Tomograms and Comparison to Established Approaches.

Barbosa, I.A.M. ; Gopalakrishnan, R. ; Mercan, S. ; Mourikis, T.P. ; Martin, T. ; Wengert, S. ; Sheng, C. ; Ji, F. ; Lopes, R. ; Knehr, J. ; Altorfer, M. ; Lindeman, A. ; Russ, C. ; Naumann, U. ; Golji, J. ; Sprouffske, K. ; Barys, L. ; Tordella, L. ; Schübeler, D. ; Schmelzle, T. ; Galli, G.G.

Cancer lineage-specific regulation of YAP responsive elements revealed through large-scale functional epigenomic screens.
Mol. Syst. Biol. 19:e11686 (2023)

Urban, L. ; Perlas Puente,A. ; Francino, O. ; Martí-Carreras, J. ; Muga, B.A. ; Mwangi, J.W. ; Boykin Okalebo, L. ; Stanton, J.A.L. ; Black, A. ; Waipara, N. ; Fontsere, C. ; Eccles, D. ; Urel, H. ; Reska, T.T.M. ; Morales, H.E. ; Palmada-Flores, M. ; Marques-Bonet, T. ; Watsa, M. ; Libke, Z. ; Erkenswick, G. ; van Oosterhout, C.

Real-time genomics for One Health.
Theranostics 13, 1949-1973 (2023)

Merz, S. ; Breunig, M. ; Melzer, M.K. ; Heller, S. ; Wiedenmann, S. ; Seufferlein, T. ; Meier, M. ; Krüger, J. ; Mulaw, M.A. ; Hohwieler, M. ; Kleger, A.

Single-cell profiling of GP2-enriched pancreatic progenitors to simultaneously create acinar, ductal, and endocrine organoids.

Wirth, J. ; Huber, N. ; Yin, K. ; Brood, S. ; Chang, S.C.-E. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Meier, M.

Spatial transcriptomics using multiplexed deterministic barcoding in tissue.
Trends Genet. 39, 545-559 (2023)

Theissinger, K. ; Fernandes, C. ; Formenti, G. ; Bista, I. ; Berg, P.R. ; Bleidorn, C. ; Bombarely, A. ; Crottini, A. ; Gallo, G.R. ; Godoy, J.A. ; Jentoft, S. ; Malukiewicz, J. ; Mouton, A. ; Oomen, R.A. ; Paez, S. ; Palsbøll, P.J. ; Pampoulie, C. ; Ruiz-López, M.J. ; Secomandi, S. ; Svardal, H. ; Theofanopoulou, C. ; de Vries, J. ; Waldvogel, A.M. ; Zhang, G. ; Jarvis, E.D. ; Bálint, M. ; Ciofi, C. ; Waterhouse, R.M. ; Mazzoni, C.J. ; Höglund, J. ; European Reference Genome Atlas Consortium (Urban, L.)

How genomics can help biodiversity conservation.

Moore, J.L. ; Bhaskar, D. ; Gao, F. ; Matte-Martone, C. ; Du, S. ; Lathrop, E. ; Ganesan, S. ; Shao, L. ; Norris, R. ; Campamà Sanz, N. ; Annusver, K. ; Kasper, M. ; Cox, A. ; Hendry, C. ; Rieck, B. ; Krishnaswamy, S. ; Greco, V.

Cell cycle controls long-range calcium signaling in the regenerating epidermis.

Klein, T. ; Yang, S. ; Tusty, M.A. ; Nayak, J.V. ; Chang, M.T. ; Bruns, O.T. ; Bischof, T.S. ; Valdez, T.A.

Development of a shortwave infrared sinuscope for the detection of cerebrospinal fluid leaks.

von Schledorn, L. ; Puertollano Martín, D. ; Cleve, N. ; Zöllner, J. ; Roth, D. ; Staar, B.O. ; Hegermann, J. ; Ringshausen, F.C. ; Nawroth, J. ; Martin, U. ; Olmer, R.

Primary ciliary dyskinesia patient-specific hiPSC-derived airway epithelium in air-liquid interface culture recapitulates disease specific phenotypes in vitro.
Front. Neurosci. 17:1135494 (2023)

Arus, B.A. ; Cosco, E. ; Yiu, J. ; Balba, I. ; Bischof, T.S. ; Sletten, E.M. ; Bruns, O.T.

Shortwave infrared fluorescence imaging of peripheral organs in awake and freely moving mice.
Front. Oncol. 13:1146031 (2023)

Fürtjes, G. ; Reinecke, D. ; von Spreckelsen, N. ; Meißner, A.K. ; Rueß, D. ; Timmer, M. ; Freudiger, C. ; Ion-Margineanu, A. ; Khalid, F. ; Watrinet, K. ; Mawrin, C. ; Chmyrov, A. ; Goldbrunner, R. ; Bruns, O.T. ; Neuschmelting, V.

Intraoperative microscopic autofluorescence detection and characterization in brain tumors using stimulated Raman histology and two-photon fluorescence.
Nat. Ecol. Evol. 7, 1693-1705 (2023)

Guhlin, J. ; Le Lec, M.F. ; Wold, J. ; Koot, E. ; Winter, D. ; Biggs, P.J. ; Galla, S.J. ; Urban, L. ; Foster, Y. ; Cox, M.P. ; Digby, A. ; Uddstrom, L.R. ; Eason, D. ; Vercoe, D. ; Davis, T. ; Howard, J.T. ; Jarvis, E.D. ; Robertson, F.E. ; Robertson, B.C. ; Gemmell, N.J. ; Steeves, T.E. ; Santure, A.W. ; Dearden, P.K.

Species-wide genomics of kākāpō provides tools to accelerate recovery.
Cell 186, 3706-3725.e29 (2023)

Kolabas, Z.I. ; Kuemmerle, L. ; Perneczky, R. ; Förstera, B. ; Ulukaya, S. ; Ali, M. ; Kapoor, S. ; Bartos, L.M. ; Büttner, M. ; Caliskan, Ö.S. ; Rong, Z. ; Mai, H. ; Höher, L. ; Jeridi, D. ; Molbay, M. ; Khalin, I. ; Deligiannis, I.K. ; Negwer, M. ; Roberts, K. ; Simats, A. ; Carofiglio, O. ; Todorov, M.I. ; Horvath, I. ; Öztürk, F. ; Hummel, S. ; Biechele, G. ; Zatcepin, A. ; Unterrainer, M. ; Gnörich, J. ; Roodselaar, J. ; Shrouder, J. ; Khosravani, P. ; Tast, B. ; Richter, L. ; Díaz-Marugán, L. ; Kaltenecker, D. ; Lux, L. ; Chen, Y. ; Zhao, S. ; Rauchmann, B.S. ; Sterr, M. ; Kunze, I. ; Stanic Aguilera, K.N. ; Kan, V.W.Y. ; Besson-Girard, S. ; Katzdobler, S. ; Palleis, C. ; Schädler, J. ; Paetzold, J.C. ; Liebscher, S. ; Hauser, A.E. ; Gokce, O. ; Lickert, H. ; Steinke, H. ; Benakis, C. ; Braun, C. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Buerger, K. ; Albert, N.L. ; Höglinger, G. ; Levin, J. ; Haass, C. ; Kopczak, A. ; Dichgans, M. ; Havla, J. ; Kümpfel, T. ; Kerschensteiner, M. ; Schifferer, M. ; Simons, M. ; Liesz, A. ; Krahmer, N. ; Bayraktar, O.A. ; Franzmeier, N. ; Plesnila, N. ; Erener, S. ; Puelles, V.G. ; Delbridge, C. ; Bhatia, H.S. ; Hellal, F. ; Elsner, M. ; Bechmann, I. ; Ondruschka, B. ; Brendel, M. ; Theis, F.J. ; Ertürk, A.

Distinct molecular profiles of skull bone marrow in health and neurological disorders.
Cell Rep. Methods 3:100523 (2023)

Atwell, S. ; Waibel, D.J.E. ; Shetab Boushehri, S. ; Wiedenmann, S. ; Marr, C. ; Meier, M.

Label-free imaging of 3D pluripotent stem cell differentiation dynamics on chip.

McCaw, Z.R. ; O'Dushlaine, C. ; Somineni, H. ; Bereket, M. ; Klein, C. ; Karaletsos, T. ; Casale, F.P. ; Koller, D. ; Soare, T.W.

An allelic-series rare-variant association test for candidate-gene discovery.

Arteaga Cardona, F. ; Jain, N. ; Popescu, R. ; Busko, D. ; Madirov, E. ; Arus, B.A. ; Gerthsen, D. ; De Backer, A. ; Bals, S. ; Bruns, O.T. ; Chmyrov, A. ; Van Aert, S. ; Richards, B.S. ; Hudry, D.

Preventing cation intermixing enables 50% quantum yield in sub-15 nm short-wave infrared-emitting rare-earth based core-shell nanocrystals.
Mater. Today Bio 21:100713 (2023)

Nawroth, J. ; Roth, D. ; van Schadewijk, A. ; Ravi, A. ; Maulana, T.I. ; Senger, C.N. ; van Riet, S. ; Ninaber, D.K. ; de Waal, A.M. ; Kraft, D. ; Hiemstra, P.S. ; Ryan, A.L. ; van der Does, A.M.

Breathing on chip: Dynamic flow and stretch accelerate mucociliary maturation of airway epithelium in vitro

Alvarez, L. ; Marín-García, P.J. ; Rentero-Garrido, P. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Llobat, L.

Interleukin 6 and interferon gamma haplotypes are related to cytokine serum levels in dogs in an endemic Leishmania infantum region.

Kulaj, K. ; Harger, A. ; Bauer, M. ; Caliskan, Ö.S. ; Gupta, T.K. ; Chiang, D.M. ; Milbank, E. ; Reber, J. ; Karlas, A. ; Kotzbeck, P. ; Sailer, D.N. ; Volta, F. ; Lutter, D. ; Prakash, S. ; Merl-Pham, J. ; Ntziachristos, V. ; Hauner, H. ; Pfaffl, M.W. ; Tschöp, M.H. ; Müller, T.D. ; Hauck, S.M. ; Engel, B.D. ; Gerdes, J.M. ; Pfluger, P.T. ; Krahmer, N. ; Stemmer, K.

Adipocyte-derived extracellular vesicles increase insulin secretion through transport of insulinotropic protein cargo.

Strzelecki, M. ; Yin, K. ; Talavera Lopez, C.N. ; Martinez Jimenez, C.P.

Isolation of nuclei from flash-frozen liver tissue for single-cell multiomics.
Science 378, 754-761 (2022)

Border, R. ; Athanasiadis, G.I. ; Buil, A. ; Schork, A.J. ; Cai, N. ; Young, A.I. ; Werge, T. ; Flint, J. ; Kendler, K.S. ; Sankararaman, S. ; Dahl, A.W. ; Zaitlen, N.A.

Cross-trait assortative mating is widespread and inflates genetic correlation estimates.
Sci. Adv. 8:eabo1023 (2022)

Chang, S. ; Fermani, F. ; Lao, C.L. ; Huang, L. ; Jakovcevski, M. ; Di Giaimo, R. ; Gagliardi, M. ; Menegaz, D. ; Hennrich, A.A. ; Ziller, M.J. ; Eder, M. ; Klein, R. ; Cai, N. ; Deussing, J.M.

Tripartite extended amygdala-basal ganglia CRH circuit drives locomotor activation and avoidance behavior.

Gundlach, K.A. ; Nawroth, J. ; Kanso, E. ; Nasrin, F. ; Ruby, E.G. ; McFall-Ngai, M.

Ciliated epithelia are key elements in the recruitment of bacterial partners in the squid-vibrio symbiosis.
Metabolites 12:840 (2022)

Bauer, S. ; Eigenmann, J. ; Zhao, Y. ; Fleig, J. ; Hawe, J.S. ; Pan, C. ; Bongiovanni, D. ; Wengert, S. ; Ma, A.E. ; Lusis, A.J. ; Kovacic, J.C. ; Bjoerkegren, J.L.M. ; Maegdefessel, L. ; Schunkert, H. ; von Scheidt, M.

Identification of the transcription factor ATF3 as a direct and indirect regulator of the LDLR.
Lect. Notes Comput. Sc. 13434 LNCS, 150-159 (2022)

Waibel, D.J.E. ; Atwell, S. ; Meier, M. ; Marr, C. ; Rieck, B.

Capturing shape information with multi-scale topological loss terms for 3D reconstruction.
Science 377, 543-548 (2022)

van den Hoek, H. ; Klena, N. ; Jordan, M.A. ; Viar, G.A. ; Righetto, R.D. ; Schaffer, M. ; Erdmann, P.S. ; Wan, W. ; Geimer, S. ; Plitzko, J.M. ; Baumeister, W. ; Pigino, G. ; Hamel, V. ; Guichard, P. ; Engel, B.D.

In situ architecture of the ciliary base reveals the stepwise assembly of intraflagellar transport trains.
Nature 607, 823-830 (2022)

Dietrich, H.M. ; Righetto, R.D. ; Kumar, A. ; Wietrzynski, W. ; Trischler, R. ; Schuller, S.K. ; Wagner, J. ; Schwarz, F.M. ; Engel, B.D. ; Müller, V. ; Schuller, J.M.

Membrane-anchored HDCR nanowires drive hydrogen-powered CO2 fixation.
Comput. Meth. Programs Biomed. 224:106990 (2022)

Lamm, L. ; Righetto, R.D. ; Wietrzynski, W. ; Pöge, M. ; Martinez-Sanchez, A. ; Peng, T. ; Engel, B.D.

MemBrain: A deep learning-aided pipeline for detection of membrane proteins in Cryo-electron tomograms.
Lab Chip 22, 3172-3186 (2022)

Compera, N. ; Atwell, S. ; Wirth, J. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Meier, M.

Adipose microtissue-on-chip: A 3D cell culture platform for differentiation, stimulation, and proteomic analysis of human adipocytes.
iScience 25:105298 (2022)

Waibel, D.J.E. ; Kiermeyer, N. ; Atwell, S. ; Sadafi, A. ; Meier, M. ; Marr, C.

SHAPR predicts 3D cell shapes from 2D microscopic images.
Lect. Notes Comput. Sc. 13278 LNBI, 385-386 (2022)

An, U. ; Cai, N. ; Dahl, A. ; Sankararaman, S.

AutoComplete: Deep learning-based phenotype imputation for large-scale biomedical data.

Cocina, A. ; Brechbühler, R. ; Vonk, S.J.W. ; Cui, J. ; Rossinelli, A.A. ; Rojo, H. ; Rabouw, F.T. ; Norris, D.J.

Nanophotonic approach to study excited-state dynamics in semiconductor nanocrystals.
Genome Biol. Evol. 14:evac066 (2022)

Trujillo, J.T. ; Long, J. ; Aboelnour, E. ; Ogas, J. ; Wisecaver, J.H.

CHD chromatin remodeling protein diversification yields novel clades and domains absent in classic model organisms.
Nat. Med., DOI: 10.1038/s41591-022-01905-0 (2022)

Wagner, S. ; Matek, C. ; Shetab Boushehri, S. ; Boxberg, M. ; Lamm, L. ; Sadafi, A. ; Waibel, D.J.E. ; Marr, C. ; Peng, T.

Make deep learning algorithms in computational pathology more reproducible and reusable.
iScience 25:104227 (2022)

Han, X. ; Yu, Z. ; Zhuo, Y. ; Zhao, B. ; Ren, Y. ; Lamm, L. ; Xue, X. ; Feng, J. ; Marr, C. ; Shan, F. ; Peng, T. ; Zhang, X.Y.

The value of longitudinal clinical data and paired CT scans in predicting the deterioration of COVID-19 revealed by an artificial intelligence system.

Wolff, G. ; Sakurai, M. ; Mhamane, A. ; Troullinaki, M. ; Maida, A. ; Deligiannis, I.K. ; Yin, K. ; Weber, P. ; Morgenstern, J. ; Wieder, A. ; Kwon, Y. ; Sekar, R. ; Zeigerer, A. ; Roden, M. ; Blüher, M. ; Volk, N. ; Poth, T. ; Hackert, T. ; Wiedmann, L. ; De Angelis Rigotti, F. ; Rodriguez-Vita, J. ; Fischer, A. ; Mukthavaram, R. ; Limphong, P. ; Tachikawa, K. ; Karmali, P. ; Payne, J. ; Chivukula, P. ; Ekim Üstünel, B. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Szendrödi, J. ; Nawroth, P.P. ; Herzig, S.

Hepatocyte-specific activity of TSC22D4 triggers progressive NAFLD by impairing mitochondrial function.
Int. J. Mol. Sci. 23:3474 (2022)

Scaltsoyiannes, V. ; Corre, N. ; Waltz, F. ; Giegé, P.

Types and functions of mitoribosome-specific ribosomal proteins across eukaryotes.

Yin, K. ; Patten, D. ; Gough, S.C. ; de Barros Gonçalves, S. ; Chan, A. ; Olan, I. ; Cassidy, L. ; Poblocka, M. ; Zhu, H. ; Lun, A. ; Schuijs, M.J. ; Young, A. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Halim, T.Y.F. ; Shetty, S. ; Narita, M. ; Hoare, M.

Senescence-induced endothelial phenotypes underpin immune-mediated senescence surveillance.
ACS Photonics 9, 630-640 (2022)

Aellen, M. ; Rossinelli, A.A. ; Keitel, R.C. ; Brechbühler, R. ; Antolinez, F.V. ; Rodrigo, S.G. ; Cui, J. ; Norris, D.J.

Role of gain in Fabry-Pérot surface plasmon polariton lasers.
Nat. Genet., DOI: 10.1038/s41588-022-01092-1 (2022)

Schork, A.J. ; Peterson, R.E. ; Dahl, A. ; Cai, N. ; Kendler, K.S.

Author Correction: Indirect paths from genetics to education (Nature Genetics, (2022), 54, 4, (372-373), 10.1038/s41588-021-00999-5).
Front. Psychiatr. 13:815718 (2022)

Falkai, P. ; Koutsouleris, N. ; Bertsch, K. ; Bialas, M. ; Binder, E. ; Bühner, M. ; Buyx, A. ; Cai, N. ; Cappello, S. ; Ehring, T. ; Gensichen, J. ; Hamann, J. ; Hasan, A. ; Henningsen, P. ; Leucht, S. ; Möhrmann, K.H. ; Nagelstutz, E. ; Padberg, F. ; Peters, A. ; Pfäffel, L. ; Reich-Erkelenz, D. ; Riedl, V. ; Rueckert, D. ; Schmitt, A. ; Schulte-Körne, G. ; Scheuring, E. ; Schulze, T.G. ; Starzengruber, R. ; Stier, S. ; Theis, F.J. ; Winkelmann, J. ; Wurst, W. ; Priller, J.

Concept of the Munich/Augsburg Consortium Precision in Mental Health for the German Center of Mental Health.
Nat. Methods 19, 353–358 (2022)

Bandi, V.G. ; Luciano, M.P. ; Saccomano, M. ; Patel, N.L. ; Bischof, T.S. ; Lingg, J.G.P. ; Tsrunchev,P. ; Nix, M.N. ; Ruehle, B. ; Sanders, C. ; Riffle, L. ; Robinson, C.M. ; Difilippantonio, S. ; Kalen, J.D. ; Resch-Genger, U. ; Ivanic, J. ; Bruns, O.T. ; Schnermann, M.J.

Targeted multicolor in vivo imaging over 1,000 nm enabled by nonamethine cyanines.
Nat. Neurosci. 25, 154-167 (2022)

Noack, F. ; Vangelisti, S. ; Raffl, G. ; Moreira Carido Pereira, M. ; Diwakar, S.J. ; Chong, F. ; Bonev, B.

Multimodal profiling of the transcriptional regulatory landscape of the developing mouse cortex identifies Neurog2 as a key epigenome remodeler.
Nat. Genet. 54, 372-373 (2022)

Schork, A.J. ; Peterson, R.E. ; Dahl, A. ; Cai, N. ; Kendler, K.S.

Indirect paths from genetics to education.
Nat. Microbiol. 7, 363-364 (2022)

Righetto, R.D. ; Engel, B.D.

Expanding the arsenal of bacterial spearguns.
Mol. Psychiatry 27, 1667–1675 (2022)

Nguyen, T.D. ; Harder, A. ; Xiong, Y. ; Kowalec, K. ; Hägg, S. ; Cai, N. ; Kuja-Halkola, R. ; Dalman, C. ; Sullivan, P.F. ; Lu, Y.

Genetic heterogeneity and subtypes of major depression.
Genes Genomes Genetics G3 12:jkab394 (2022)

Zou, J. ; Gopalakrishnan, S. ; Parker, C.C. ; Nicod, J. ; Mott, R. ; Cai, N. ; Lionikas, A. ; Davies, R.W. ; Palmer, A.A. ; Flint, J.

Analysis of independent cohorts of outbred CFW mice reveals novel loci for behavioral and physiological traits and identifies factors determining reproducibility.
STAR Protoc. 2:100913 (2021)

Breunig, M. ; Merkle, J. ; Melzer, M.K. ; Heller, S. ; Seufferlein, T. ; Meier, M. ; Hohwieler, M. ; Kleger, A.

Differentiation of human pluripotent stem cells into pancreatic duct-like organoids.

Salinas-Giegé, T. ; Englmeier, R. ; Meichel, H. ; Soufari, H. ; Kühn, L. ; Pfeffer, S. ; Förster, F. ; Engel, B.D. ; Giegé, P. ; Drouard, L. ; Hashem, Y. ; Waltz, F.

How to build a ribosome from RNA fragments in Chlamydomonas mitochondria.
Biomolecules 11, New Approaches for the Treatment of Civilization Diseases:1683 (2021)

Neiburga, K.D. ; Vilne, B. ; Bauer, S. ; Bongiovanni, D. ; Ziegler, T. ; Lachmann, M. ; Wengert, S. ; Hawe, J.S. ; Güldener, U. ; Westerlund, A. ; Li, L. ; Pang, S. ; Yang, C. ; Saar, K. ; Huebner, N. ; Maegdefessel, L. ; Lange, R. ; Krane, M. ; Schunkert, H. ; von Scheidt, M.

Vascular tissue specific mirna profiles reveal novel correlations with risk factors in coronary artery disease.
Lab Chip 21, 4685-4695 (2021)

Ardila Riveros, J.C. ; Blöchinger, A. ; Atwell, S. ; Moussus, M. ; Compera, N. ; Rajabnia, O. ; Georgiev, T. ; Lickert, H. ; Meier, M. ; Lickert, H.

Automated optimization of endoderm differentiation on chip.
Cancers 13:5139 (2021)

Merkle, J. ; Breunig, M. ; Schmid, M. ; Allgöwer, C. ; Krüger, J. ; Melzer, M.K. ; Bens, S. ; Siebert, R. ; Perkhofer, L. ; Azoitei, N. ; Seufferlein, T. ; Heller, S. ; Meier, M. ; Müller, M. ; Kleger, A. ; Hohwieler, M.

Cdkn2a-mutated pancreatic ductal organoids from induced pluripotent stem cells to model a cancer predisposition syndrome.
J. Phys. Chem. C. 125, 21550-21558 (2021)

Höfler, M.V. ; Hoinka, N. ; Schäfer, T. ; Horn, M. ; Aussenac, F. ; Fuhrmann-Lieker, T. ; Gutmann, T.

Light amplification materials based on biopolymers doped with dye molecules - structural insights from 15N and 13C solid-state dynamic nuclear polarization.
Nano Lett. 21, 8952–8959 (2021)

Keitel, R.C. ; Aellen, M. ; Feber, B.L. ; Rossinelli, A.A. ; Meyer, S.A. ; Cui, J. ; Norris, D.J.

Active mode switching in plasmonic microlasers by spatial control of optical gain.
Nat. Methods, DOI: 10.1038/s41592-021-01349-3 (2021)

Moebel, E. ; Martinez-Sanchez, A. ; Lamm, L. ; Righetto, R.D. ; Wietrzynski, W. ; Albert, S. ; Larivière, D. ; Fourmentin, E. ; Pfeffer, S. ; Ortiz, J. ; Baumeister, W. ; Peng, T. ; Engel, B.D. ; Kervrann, C.

Author Correction: Deep learning improves macromolecule identification in 3D cellular cryo-electron tomograms (Nature Methods, (2021), 18, 11, (1386-1394), 10.1038/s41592-021-01275-4).
Nat. Methods 18, 1386-1394 (2021)

Moebel, E. ; Martinez-Sanchez, A. ; Lamm, L. ; Righetto, R.D. ; Wietrzynski, W. ; Albert, S. ; Larivière, D. ; Fourmentin, E. ; Pfeffer, S. ; Ortiz, J. ; Baumeister, W. ; Peng, T. ; Engel, B.D. ; Kervrann, C.

Deep learning improves macromolecule identification in 3D cellular cryo-electron tomograms.
Nat. Med. 27, 1564-1575 (2021)

Cai, N. ; Gomez-Duran, A. ; Yonova-Doing, E. ; Kundu, K. ; Burgess, A.I. ; Golder, Z.J. ; Calabrese, C. ; Bonder, M.J. ; Camacho, M. ; Lawson, R.A. ; Li, L. ; Williams-Gray, C.H. ; ICICLE-PD Study Group ; di Angelantonio, E. ; Roberts, D.J. ; Watkins, N.A. ; Ouwehand, W.H. ; Butterworth, A.S. ; Stewart, I.D. ; Pietzner, M. ; Wareham, N.J. ; Langenberg, C. ; Walter, K. ; Rothwell, P.M. ; Howson, J.M.M. ; Stegle, O. ; Chinnery, P.F. ; Soranzo, N.

Mitochondrial DNA variants modulate N-formylmethionine, proteostasis and risk of late-onset human diseases.
Nat. Rev. Drug Discov. 20, 920–940 (2021)

Siehler, J. ; Blöchinger, A. ; Meier, M. ; Lickert, H.

Engineering islets from stem cells for advanced therapies of diabetes.

Richter, M. ; Deligiannis, I.K. ; Yin, K. ; Danese, A. ; Lleshi, E. ; Coupland, P. ; Vallejos, C.A. ; Matchett, K.P. ; Henderson, N.C. ; Colomé-Tatché, M. ; Martinez Jimenez, C.P.

Single-nucleus RNA-seq2 reveals functional crosstalk between liver zonation and ploidy.
Lab Chip 21, 2986-2996 (2021)

Compera, N. ; Atwell, S. ; Wirth, J. ; Wolfrum, B. ; Meier, M.

Upscaling of pneumatic membrane valves for the integration of 3D cell cultures on chip.

Wiedenmann, S. ; Breunig, M. ; Merkle, J. ; von Toerne, C. ; Georgiev, T. ; Moussus, M. ; Schulte, L.N. ; Seufferlein, T. ; Sterr, M. ; Lickert, H. ; Weissinger, S.E. ; Möller, P. ; Hauck, S.M. ; Hohwieler, M. ; Kleger, A. ; Meier, M.

Single-cell-resolved differentiation of human induced pluripotent stem cells into pancreatic duct-like organoids on a microwell chip.
Cell 184, 3643-3659.e23 (2021)

Gupta, T.K. ; Klumpe, S. ; Gries, K. ; Heinz, S. ; Wietrzynski, W. ; Ohnishi, N. ; Niemeyer, J. ; Spaniol, B. ; Schaffer, M. ; Rast, A. ; Ostermeier, M. ; Strauss, M. ; Plitzko, J.M. ; Baumeister, W. ; Rudack, T. ; Sakamoto, W. ; Nickelsen, J. ; Schuller, J.M. ; Schroda, M. ; Engel, B.D.

Structural basis for VIPP1 oligomerization and maintenance of thylakoid membrane integrity.
Cell Stem Cell 28, 1105-1124.e19 (2021)

Breunig, M. ; Merkle, J. ; Wagner, M. ; Melzer, M.K. ; Barth, T.F.E. ; Engleitner, T. ; Krumm, J. ; Wiedenmann, S. ; Cohrs, C.M. ; Perkhofer, L. ; Jain, G. ; Krüger, J. ; Hermann, P.C. ; Schmid, M. ; Madácsy, T. ; Varga, A. ; Griger, J. ; Azoitei, N. ; Müller, M. ; Wessely, O. ; Robey, P.G. ; Heller, S. ; Dantes, Z. ; Reichert, M. ; Günes, C. ; Bolenz, C. ; Kuhn, F. ; Maléth, J. ; Speier, S. ; Liebau, S. ; Sipos, B. ; Kuster, B. ; Seufferlein, T. ; Rad, R. ; Meier, M. ; Hohwieler, M. ; Kleger, A.

Modeling plasticity and dysplasia of pancreatic ductal organoids derived from human pluripotent stem cells.

Cosco, E. ; Arus, B.A. ; Spearman, A.L. ; Atallah, T.L. ; Lim, I. ; Leland, O.S. ; Caram, J.R. ; Bischof, T.S. ; Bruns, O.T. ; Sletten, E.M.

Bright chromenylium polymethine dyes enable fast, four-color in vivo imaging with shortwave infrared detection.
Nat. Plants 7, 380-381 (2021)

Wietrzynski, W. ; Engel, B.D.

Chlorophyll biogenesis sees the light.
Nat. Plants 7, 524–538 (2021)

Zabret, J. ; Bohn, S. ; Schuller, S.K. ; Arnolds, O. ; Möller, M. ; Meier-Credo, J. ; Liauw, P. ; Chan, A. ; Tajkhorshid, E. ; Langer, J.D. ; Stoll, R. ; Krieger-Liszkay, A. ; Engel, B.D. ; Rudack, T. ; Schuller, J.M. ; Nowaczyk, M.M.

Structural insights into photosystem II assembly.
Nature 592:E1 (2021)

Ansarullah ; Jain, C. ; Far, F.F. ; Homberg, S. ; Wißmiller, K. ; von Hahn, F. ; Raducanu, A. ; Schirge, S. ; Sterr, M. ; Bilekova, S. ; Siehler, J. ; Wiener, J. ; Oppenländer, L. ; Morshedi, A. ; Bastidas-Ponce, A. ; Collden, G. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Feuchtinger, A. ; Grzybek, M. ; Ahlbrecht, C. ; Feederle, R. ; Plettenburg, O. ; Müller, T.D. ; Meier, M. ; Tschöp, M.H. ; Coskun, Ü. ; Lickert, H.

Author Correction: Inceptor counteracts insulin signalling in β-cells to control glycaemia.
Nat. Genet. 53, 313-321 (2021)

Bonder, M.J. ; Smail, C. ; Gloudemans, M.J. ; Frésard, L. ; Jakubosky, D. ; D'Antonio, M. ; Li, X. ; Ferraro, N.M. ; Carcamo-Orive, I. ; Mirauta, B. ; Seaton, D.D. ; Cai, N. ; Vakili, D. ; Horta, D. ; Zhao, C. ; Zastrow, D.B. ; Bonner, D.E. ; Wheeler, M.T. ; Kilpinen, H. ; Knowles, J.W. ; Smith, E.N. ; Frazer, K.A. ; Montgomery, S.B. ; Stegle, O.

Identification of rare and common regulatory variants in pluripotent cells using population-scale transcriptomics.

Chatzinakos, C. ; Lee, D. ; Cai, N. ; Vladimirov, V.I. ; Webb, B.T. ; Riley, B.P. ; Flint, J. ; Kendler, K.S. ; Ressler, K.J. ; Daskalakis, N.P. ; Bacanu, S.A.

Increasing the resolution and precision of psychiatric genome-wide association studies by re-imputing summary statistics using a large, diverse reference panel.

Ruiz Ojeda, F.J. ; Wang, J. ; Bäcker, T. ; Krueger, M. ; Zamani, S. ; Rosowski, S. ; Gruber, T. ; Onogi, Y. ; Feuchtinger, A. ; Schulz, T.J. ; Fässler, R. ; Müller, T.D. ; García-Cáceres, C. ; Meier, M. ; Blüher, M. ; Ussar, S.

Active integrins regulate white adipose tissue insulin sensitivity and brown fat thermogenesis.
Nature 590, 326–331 (2021)

Ansarullah ; Jain, C. ; Far, F.F. ; Homberg, S. ; Wissmiller, K. ; Gräfin von Hahn, F. ; Raducanu, A. ; Schirge, S. ; Sterr, M. ; Bilekova, S. ; Siehler, J. ; Wiener, J. ; Oppenländer, L. ; Morshedi, A. ; Bastidas-Ponce, A. ; Collden, G. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Feuchtinger, A. ; Grzybek, M. ; Ahlbrecht, C. ; Feederle, R. ; Plettenburg, O. ; Müller, T.D. ; Meier, M. ; Tschöp, M.H. ; Coskun, Ü. ; Lickert, H.

Inceptor counteracts insulin signalling in β-cells to control glycaemia.
Research Square, in press (2021)

Yu, Z. ; Han, X. ; Zhao, B. ; Zhuo, Y. ; Ren, Y. ; Xue, X. ; Lamm, L. ; Feng, J. ; Marr, C. ; Shan, F. ; Peng, T. ; Zhang, X.-Y.

DABC-Net for robust pneumonia segmentation and prediction of COVID-19 progression on chest CT scans.
Cell Metab. 33, 547-564.e7 (2021)

Fischer, A.W. ; Jaeckstein, M.Y. ; Gottschling, K. ; Heine, M. ; Sass, F. ; Mangels, N. ; Schlein, C. ; Worthmann, A. ; Bruns, O.T. ; Yuan, Y. ; Zhu, H. ; Chen, O. ; Ittrich, H. ; Nilsson, S.K. ; Stefanicka, P. ; Ukropec, J. ; Balaz, M. ; Dong, H. ; Sun, W. ; Reimer, R. ; Scheja, L. ; Heeren, J.

Lysosomal lipoprotein processing in endothelial cells stimulates adipose tissue thermogenic adaptation.
Nat. Bio. Eng. 4:1222 (2020)

Saif, M. ; Kwanten, W.J. ; Carr, J.A. ; Chen, I.X. ; Posada, J.M. ; Srivastava, A. ; Zhang, J. ; Zheng, Y. ; Pinter, M. ; Chatterjee, S. ; Softic, S. ; Kahn, C.R. ; van Leyen, K. ; Bruns, O.T. ; Jain, R.K. ; Bawendi, M.G.

Author Correction: Non-invasive monitoring of chronic liver disease via near-infrared and shortwave-infrared imaging of endogenous lipofuscin (Nature Biomedical Engineering, (2020), 4, 8, (801-813), 10.1038/s41551-020-0569-y).
In:. 2020. 174-183 (Lect. Notes Comput. Sc. ; 12265 LNCS)

Peng, T. ; Lamm, L. ; Loeffler, D. ; Ahmed, N. ; Navab, N. ; Schroeder, T. ; Marr, C.

Background and illumination correction for time-lapse microscopy data with correlated foreground.
Nat. Chem. 12, 1123-1130 (2020)

Cosco, E. ; Spearman, A.L. ; Ramakrishnan, S. ; Lingg, J.G.P. ; Saccomano, M. ; Pengshung, M. ; Arus, B.A. ; Wong, K.C.Y. ; Glasl, S. ; Ntziachristos, V. ; Warmer, M. ; McLaughlin, R.R. ; Bruns, O.T. ; Sletten, E.M.

Shortwave infrared polymethine fluorophores matched to excitation lasers enable non-invasive, multicolour in vivo imaging in real time.
Nat. Plants 6, 1480–1490 (2020)

He, S. ; Chou, H.T. ; Matthies, D. ; Wunder, T. ; Meyer, M.T. ; Atkinson, N. ; Martinez-Sanchez, A. ; Jeffrey, P.D. ; Port, S.A. ; Patena, W. ; He, G. ; Chen, V.K. ; Hughson, F.M. ; McCormick, A.J. ; Mueller-Cajar, O. ; Engel, B.D. ; Yu, Z. ; Jonikas, M.C.

The structural basis of Rubisco phase separation in the pyrenoid.
Nat. Genet. 52, 1151-1157 (2020)

Szabo, Q. ; Donjon, A. ; Jerković, I. ; Papadopoulos, G.L. ; Cheutin, T. ; Bonev, B. ; Nora, E.P. ; Bruneau, B.G. ; Bantignies, F. ; Cavalli, G.

Regulation of single-cell genome organization into TADs and chromatin nanodomains.

Chatzinakos, C. ; Georgiadis, F. ; Lee, D. ; Cai, N. ; Vladimirov, V.I. ; Docherty, A. ; Webb, B.T. ; Riley, B.P. ; Flint, J. ; Kendler, K.S. ; Daskalakis, N.P. ; Bacanu, S.A.

TWAS pathway method greatly enhances the number of leads for uncovering the molecular underpinnings of psychiatric disorders.

Klena, N. ; Le Guennec, M. ; Tassin, A.M. ; van den Hoek, H. ; Erdmann, P.S. ; Schaffer, M. ; Geimer, S. ; Aeschlimann, G. ; Kovacik, L. ; Sadian, Y. ; Goldie, K.N. ; Stahlberg, H. ; Engel, B.D. ; Hamel, V. ; Guichard, P.

Architecture of the centriole cartwheel-containing region revealed by cryo-electron tomography.

Saif, M. ; Kwanten, W.J. ; Carr, J.A. ; Chen, I.X. ; Posada, J.M. ; Srivastava, A. ; Zhang, J. ; Zheng, Y. ; Pinter, M. ; Chatterjee, S. ; Softic, S. ; Kahn, C.R. ; van Leyen, K. ; Bruns, O.T. ; Jain, R.K. ; Bawendi, M.G.

Non-invasive monitoring of chronic liver disease via near-infrared and shortwave-infrared imaging of endogenous lipofuscin.
Cell 180, 796-812 (2020)

Zhao, S. ; Todorov, M.I. ; Cai, R. ; Ai-Maskari, R. ; Steinke, H. ; Kemter, E. ; Mai, H. ; Rong, Z. ; Warmer, M. ; Stanic Aguilera, K.N. ; Schoppe, O. ; Paetzold, J.C. ; Gesierich, B. ; Wong, M.N. ; Huber, T.B. ; Duering, M. ; Bruns, O.T. ; Menze, B. ; Lipfert, J. ; Puelles, V.G. ; Wolf, E. ; Bechmann, I. ; Ertürk, A.

Cellular and molecular probing of intact human organs.
eLife 9:e53740 (2020)

Wietrzynski, W. ; Schaffer, M. ; Tegunov, D. ; Albert, S. ; Kanazawa, A. ; Plitzko, J.M. ; Baumeister, W. ; Engel, B.D.

Charting the native architecture of Chlamydomonas thylakoid membranes with single-molecule precision.
Nat. Genet. 52, 437-447 (2020)

Cai, N. ; Revez, J.A. ; Adams, M.J. ; Andlauer, T.F.M. ; Breen, G. ; Byrne, E.M. ; Clarke, T.K. ; Forstner, A.J. ; Grabe, H.J. ; Hamilton, S.P. ; Levinson, D.F. ; Lewis, C.M. ; Lewis, G. ; Martin, N.G. ; Milaneschi, Y. ; Mors, O. ; Müller-Myhsok, B. ; Penninx, B.W.J.H. ; Perlis, R.H. ; Pistis, G. ; Potash, J.B. ; Preisig, M. ; Shi, J. ; Smoller, J.W. ; Streit, F. ; Tiemeier, H. ; Uher, R. ; Van der Auwera, S. ; Viktorin, A. ; Weissman, M.M. ; Kendler, K.S. ; Flint, J.

Minimal phenotyping yields genome-wide association signals of low specificity for major depression.
Sci. Adv. 6:eaaz4137 (2020)

Le Guennec, M. ; Klena, N. ; Gambarotto, D. ; Laporte, M.H. ; Tassin, A.M. ; van den Hoek, H. ; Erdmann, P.S. ; Schaffer, M. ; Kovacik, L. ; Borgers, S. ; Goldie, K.N. ; Stahlberg, H. ; Bornens, M. ; Azimzadeh, J. ; Engel, B.D. ; Hamel, V. ; Guichard, P.

A helical inner scaffold provides a structural basis for centriole cohesion.
Mol. Cell 77, 294-309.e9 (2020)

Boxer, L.D. ; Renthal, W. ; Greben, A.W. ; Whitwam, T. ; Silberfeld, A. ; Stroud, H. ; Li, E. ; Yang, M.G. ; Kinde, B. ; Griffith, E.C. ; Bonev, B. ; Greenberg, M.E.

MeCP2 represses the rate of transcriptional initiation of highly methylated long genes.
Science 363, 257-260 (2019)

Schuller, J.M. ; Birrell, J.A. ; Tanaka, H. ; Konuma, T. ; Wulfhorst, H. ; Cox, N. ; Schuller, S.K. ; Thiemann, J. ; Lubitz, W. ; Sétif, P. ; Ikegami, T. ; Engel, B.D. ; Kurisu, G. ; Nowaczyk, M.M.

Structural adaptations of photosynthetic complex I enable ferredoxin-dependent electron transfer.
ACS Nano 13, 9048-9056 (2019)

Antolinez, F.V. ; Winkler, J.M. ; Rohner, P. ; Kress, S.J.P. ; Keitel, R.C. ; Kim, D.K. ; Marques-Gallego, P. ; Cui, J. ; Rabouw, F.T. ; Poulikakos, D. ; Norris, D.J.

Defect-tolerant plasmonic elliptical resonators for long-range energy transfer.

Chen, W. ; Cheng, C.A. ; Cosco, E. ; Ramakrishnan, A. ; Lingg, J.G.P. ; Bruns, O.T. ; Zink, J.I. ; Sletten, E.M.

Shortwave infrared imaging with J-aggregates stabilized in hollow mesoporous silica nanoparticles.
EMBO Rep. 20:e47379 (2019)

Chen, H.C. ; Eling, N. ; Martinez Jimenez, C.P. ; O'Brien, L.M. ; Carbonaro, V. ; Marioni, J.C. ; Odom, D.T. ; de la Roche, M.

IL-7-dependent compositional changes within the gamma delta T cell pool in lymph nodes during ageing lead to an unbalanced anti-tumour response.

Rowlands, C.J. ; Bruns, O.T. ; Franke, D. ; Fukamura, D. ; Jain, R.K. ; Bawendi, M.G. ; So, P.T.C.

Increasing the penetration depth of temporal focusing multiphoton microscopy for neurobiological applications.
Nature 567, 109-112 (2019)

Karakus, U. ; Thamamongood, T. ; Ciminski, K. ; Ran, W. ; Günther, S.C. ; Pohl, M.O. ; Eletto, D. ; Jeney, C. ; Hoffmann, D. ; Reiche, S. ; Schinköthe, J. ; Ulrich, R. ; Wiener, J. ; Hayes, M.G.B. ; Chang, M.W. ; Hunziker, A. ; Yángüez, E. ; Aydillo, T. ; Krammer, F. ; Oderbolz, J. ; Meier, M. ; Oxenius, A. ; Halenius, A. ; Zimmer, G. ; Benner, C. ; Hale, B.G. ; García-Sastre, A. ; Beer, M. ; Schwemmle, M. ; Stertz, S.

MHC class II proteins mediate cross-species entry of bat influenza viruses.
ACS Chem. Biol. 13, 3049-3053 (2018)

Schneider, N. ; Gäbelein, C. ; Wiener, J. ; Georgiev, T. ; Gobet, N. ; Weber, W. ; Meier, M.

Genetic code expansion method for temporal labeling of endogenously expressed proteins.

Carr, J.A. ; Aellen, M. ; Franke, D. ; So, P.T.C. ; Bruns, O.T. ; Bawendi, M.G.

Absorption by water increases fluorescence image contrast of biological tissue in the shortwave infrared.
Science 355, 1433-1436 (2017)

Martinez Jimenez, C.P. ; Eling, N. ; Chen, H.-C ; Vallejos, C.A. ; Kolodziejczyk, A.A. ; Connor, F. ; Stojic, L. ; Rayner, T.F. ; Stubbington, M.J.T. ; Teichmann, S.A. ; de la Roche, M. ; Marioni, J.C. ; Odom, D.T.

Aging increases cell-to-cell transcriptional variability upon immune stimulation.
Science 328, 1036-1040 (2010)

Schmidt, D. ; Wilson, M.D. ; Ballester, B. ; Schwalie, P.C. ; Brown, G.D. ; Marshall, A. ; Kutter, C. ; Watt, S. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Mackay, S. ; Talianidis, I. ; Flicek, P. ; Odom, D.T.

Five-vertebrate ChIP-seq reveals the evolutionary dynamics of transcription factor binding.