Rolled up magazines on blue background

Alle Publikationen

Strzelecki, M. ; Yin, K. ; Talavera Lopez, C.N. ; Martinez Jimenez, C.P.

Isolation of nuclei from flash-frozen liver tissue for single-cell multiomics.
Science 378, 754-761 (2022)

Border, R. ; Athanasiadis, G.I. ; Buil, A. ; Schork, A.J. ; Cai, N. ; Young, A.I. ; Werge, T. ; Flint, J. ; Kendler, K.S. ; Sankararaman, S. ; Dahl, A.W. ; Zaitlen, N.A.

Cross-trait assortative mating is widespread and inflates genetic correlation estimates.
Sci. Adv. 8:eabo1023 (2022)

Chang, S. ; Fermani, F. ; Lao, C.L. ; Huang, L. ; Jakovcevski, M. ; Di Giaimo, R. ; Gagliardi, M. ; Menegaz, D. ; Hennrich, A.A. ; Ziller, M.J. ; Eder, M. ; Klein, R. ; Cai, N. ; Deussing, J.M.

Tripartite extended amygdala-basal ganglia CRH circuit drives locomotor activation and avoidance behavior.

Gundlach, K.A. ; Nawroth, J. ; Kanso, E. ; Nasrin, F. ; Ruby, E.G. ; McFall-Ngai, M.

Ciliated epithelia are key elements in the recruitment of bacterial partners in the squid-vibrio symbiosis.
Metabolites 12:840 (2022)

Bauer, S. ; Eigenmann, J. ; Zhao, Y. ; Fleig, J. ; Hawe, J.S. ; Pan, C. ; Bongiovanni, D. ; Wengert, S. ; Ma, A.E. ; Lusis, A.J. ; Kovacic, J.C. ; Bjoerkegren, J.L.M. ; Maegdefessel, L. ; Schunkert, H. ; von Scheidt, M.

Identification of the transcription factor ATF3 as a direct and indirect regulator of the LDLR.
Lect. Notes Comput. Sc. 13434 LNCS, 150-159 (2022)

Waibel, D.J.E. ; Atwell, S. ; Meier, M. ; Marr, C. ; Rieck, B.

Capturing shape information with multi-scale topological loss terms for 3D reconstruction.
Science 377, 543-548 (2022)

van den Hoek, H. ; Klena, N. ; Jordan, M.A. ; Viar, G.A. ; Righetto, R.D. ; Schaffer, M. ; Erdmann, P.S. ; Wan, W. ; Geimer, S. ; Plitzko, J.M. ; Baumeister, W. ; Pigino, G. ; Hamel, V. ; Guichard, P. ; Engel, B.D.

In situ architecture of the ciliary base reveals the stepwise assembly of intraflagellar transport trains.
Nature 607, 823-830 (2022)

Dietrich, H.M. ; Righetto, R.D. ; Kumar, A. ; Wietrzynski, W. ; Trischler, R. ; Schuller, S.K. ; Wagner, J. ; Schwarz, F.M. ; Engel, B.D. ; Müller, V. ; Schuller, J.M.

Membrane-anchored HDCR nanowires drive hydrogen-powered CO2 fixation.
Comput. Meth. Programs Biomed. 224:106990 (2022)

Lamm, L. ; Righetto, R.D. ; Wietrzynski, W. ; Pöge, M. ; Martinez-Sanchez, A. ; Peng, T. ; Engel, B.D.

MemBrain: A deep learning-aided pipeline for detection of membrane proteins in Cryo-electron tomograms.
Lab Chip 22, 3172-3186 (2022)

Compera, N. ; Atwell, S. ; Wirth, J. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Meier, M.

Adipose microtissue-on-chip: A 3D cell culture platform for differentiation, stimulation, and proteomic analysis of human adipocytes.
iScience 25:105298 (2022)

Waibel, D.J.E. ; Kiermeyer, N. ; Atwell, S. ; Sadafi, A. ; Meier, M. ; Marr, C.

SHAPR predicts 3D cell shapes from 2D microscopic images.
Lect. Notes Comput. Sc. 13278 LNBI, 385-386 (2022)

An, U. ; Cai, N. ; Dahl, A. ; Sankararaman, S.

AutoComplete: Deep learning-based phenotype imputation for large-scale biomedical data.

Cocina, A. ; Brechbühler, R. ; Vonk, S.J.W. ; Cui, J. ; Rossinelli, A.A. ; Rojo, H. ; Rabouw, F.T. ; Norris, D.J.

Nanophotonic approach to study excited-state dynamics in semiconductor nanocrystals.
Genome Biol. Evol. 14:evac066 (2022)

Trujillo, J.T. ; Long, J. ; Aboelnour, E. ; Ogas, J. ; Wisecaver, J.H.

CHD chromatin remodeling protein diversification yields novel clades and domains absent in classic model organisms.
Nat. Med., DOI: 10.1038/s41591-022-01905-0 (2022)

Wagner, S. ; Matek, C. ; Shetab Boushehri, S. ; Boxberg, M. ; Lamm, L. ; Sadafi, A. ; Waibel, D.J.E. ; Marr, C. ; Peng, T.

Make deep learning algorithms in computational pathology more reproducible and reusable.
iScience 25:104227 (2022)

Han, X. ; Yu, Z. ; Zhuo, Y. ; Zhao, B. ; Ren, Y. ; Lamm, L. ; Xue, X. ; Feng, J. ; Marr, C. ; Shan, F. ; Peng, T. ; Zhang, X.Y.

The value of longitudinal clinical data and paired CT scans in predicting the deterioration of COVID-19 revealed by an artificial intelligence system.

Wolff, G. ; Sakurai, M. ; Mhamane, A. ; Troullinaki, M. ; Maida, A. ; Deligiannis, I.K. ; Yin, K. ; Weber, P. ; Morgenstern, J. ; Wieder, A. ; Kwon, Y. ; Sekar, R. ; Zeigerer, A. ; Roden, M. ; Blüher, M. ; Volk, N. ; Poth, T. ; Hackert, T. ; Wiedmann, L. ; De Angelis Rigotti, F. ; Rodriguez-Vita, J. ; Fischer, A. ; Mukthavaram, R. ; Limphong, P. ; Tachikawa, K. ; Karmali, P. ; Payne, J. ; Chivukula, P. ; Ekim Üstünel, B. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Szendrödi, J. ; Nawroth, P.P. ; Herzig, S.

Hepatocyte-specific activity of TSC22D4 triggers progressive NAFLD by impairing mitochondrial function.
Int. J. Mol. Sci. 23:3474 (2022)

Scaltsoyiannes, V. ; Corre, N. ; Waltz, F. ; Giegé, P.

Types and functions of mitoribosome-specific ribosomal proteins across eukaryotes.

Yin, K. ; Patten, D. ; Gough, S.C. ; de Barros Gonçalves, S. ; Chan, A. ; Olan, I. ; Cassidy, L. ; Poblocka, M. ; Zhu, H. ; Lun, A. ; Schuijs, M.J. ; Young, A. ; Martinez Jimenez, C.P. ; Halim, T.Y.F. ; Shetty, S. ; Narita, M. ; Hoare, M.

Senescence-induced endothelial phenotypes underpin immune-mediated senescence surveillance.
ACS Photonics 9, 630-640 (2022)

Aellen, M. ; Rossinelli, A.A. ; Keitel, R.C. ; Brechbühler, R. ; Antolinez, F.V. ; Rodrigo, S.G. ; Cui, J. ; Norris, D.J.

Role of gain in Fabry-Pérot surface plasmon polariton lasers.
Nat. Genet., DOI: 10.1038/s41588-022-01092-1 (2022)

Schork, A.J. ; Peterson, R.E. ; Dahl, A. ; Cai, N. ; Kendler, K.S.

Author Correction: Indirect paths from genetics to education (Nature Genetics, (2022), 54, 4, (372-373), 10.1038/s41588-021-00999-5).
Front. Psychiatr. 13:815718 (2022)

Falkai, P. ; Koutsouleris, N. ; Bertsch, K. ; Bialas, M. ; Binder, E. ; Bühner, M. ; Buyx, A. ; Cai, N. ; Cappello, S. ; Ehring, T. ; Gensichen, J. ; Hamann, J. ; Hasan, A. ; Henningsen, P. ; Leucht, S. ; Möhrmann, K.H. ; Nagelstutz, E. ; Padberg, F. ; Peters, A. ; Pfäffel, L. ; Reich-Erkelenz, D. ; Riedl, V. ; Rueckert, D. ; Schmitt, A. ; Schulte-Körne, G. ; Scheuring, E. ; Schulze, T.G. ; Starzengruber, R. ; Stier, S. ; Theis, F.J. ; Winkelmann, J. ; Wurst, W. ; Priller, J.

Concept of the Munich/Augsburg Consortium Precision in Mental Health for the German Center of Mental Health.
Nat. Methods 19, 353–358 (2022)

Bandi, V.G. ; Luciano, M.P. ; Saccomano, M. ; Patel, N.L. ; Bischof, T.S. ; Lingg, J.G.P. ; Tsrunchev,P. ; Nix, M.N. ; Ruehle, B. ; Sanders, C. ; Riffle, L. ; Robinson, C.M. ; Difilippantonio, S. ; Kalen, J.D. ; Resch-Genger, U. ; Ivanic, J. ; Bruns, O.T. ; Schnermann, M.J.

Targeted multicolor in vivo imaging over 1,000 nm enabled by nonamethine cyanines.
Nat. Neurosci. 25, 154-167 (2022)

Noack, F. ; Vangelisti, S. ; Raffl, G. ; Moreira Carido Pereira, M. ; Diwakar, S.J. ; Chong, F. ; Bonev, B.

Multimodal profiling of the transcriptional regulatory landscape of the developing mouse cortex identifies Neurog2 as a key epigenome remodeler.
Nat. Genet. 54, 372-373 (2022)

Schork, A.J. ; Peterson, R.E. ; Dahl, A. ; Cai, N. ; Kendler, K.S.

Indirect paths from genetics to education.
Nat. Microbiol. 7, 363-364 (2022)

Righetto, R.D. ; Engel, B.D.

Expanding the arsenal of bacterial spearguns.
Mol. Psychiatry 27, 1667–1675 (2022)

Nguyen, T.D. ; Harder, A. ; Xiong, Y. ; Kowalec, K. ; Hägg, S. ; Cai, N. ; Kuja-Halkola, R. ; Dalman, C. ; Sullivan, P.F. ; Lu, Y.

Genetic heterogeneity and subtypes of major depression.
Genes Genomes Genetics G3 12:jkab394 (2022)

Zou, J. ; Gopalakrishnan, S. ; Parker, C.C. ; Nicod, J. ; Mott, R. ; Cai, N. ; Lionikas, A. ; Davies, R.W. ; Palmer, A.A. ; Flint, J.

Analysis of independent cohorts of outbred CFW mice reveals novel loci for behavioral and physiological traits and identifies factors determining reproducibility.