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A beneficial environment promotes immune resilience through epigenetic regulation.Heumos, L. ; Ji, Y. ; May, L. ; Green, T.D. ; Peidli, S. ; Zhang, X. ; Wu, X. ; Ostner, J. ; Schumacher, A. ; Hrovatin, K. ; Müller, M. ; Chong, F. ; Sturm, G. ; Tejada Lapuerta, A. ; Dann, E. ; Dong, M. ; Pinto, G. ; Bahrami, M. ; Gold, I. ; Rybakov, S. ; Namsaraeva, A. ; Moinfar, A.A. ; Zheng, Z. ; Roellin, E. ; Mekki, I.I ; Sander, C. ; Lotfollahi, M. ; Schiller, H.B. ; Theis, F.J.
Pertpy: An end-to-end framework for perturbation analysis.Firsova, A.B. ; Marco Salas, S. ; Kuemmerle, L. ; Abalo, X.M. ; Sountoulidis, A. ; Larsson, L. ; Mahbubani, K.T. ; Theelke, J. ; Andrusivova, Z. ; Alonso Galicia, L. ; Liontos, A. ; Balassa, T. ; Kovács, F. ; Horvath, P. ; Chen, Y. ; Gote-Schniering, J. ; Stoleriu, M.-G. ; Behr, J. ; Meyer, K.B. ; Timens, W. ; Schiller, H.B. ; Luecken, M. ; Theis, F.J. ; Lundeberg, J. ; Nilsson, M. ; Nawijn, M.C. ; Samakovlis, C.
Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung.Voss, C. ; Han, L. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Haefner, V. ; Angelidis, I. ; Mayr, C.H. ; Berthing, T. ; Zhou, Q. ; Günther, E. ; Huzain, O. ; Schmid, O. ; Vogel, U. ; Schniering, J. ; Gaedcke, S. ; Theis, F.J. ; Schiller, H.B. ; Stöger, T.
Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: Single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation.Kadri, S. ; Fischer, A. ; Mück-Häusl, M. ; Han, W. ; Kadri, A. ; Lin, Y. ; Yang, L. ; Hu, S. ; Ye, H. ; Ramesh, P. ; Ansari, M. ; Schiller, H.B. ; Machens, H.G. ; Rinkevich, Y.
A mesothelial differentiation gateway drives fibrosis.Jirouskova, M. ; Harant, K. ; Cejnar, P. ; Ojha, S. ; Korelova, K. ; Sarnova, L. ; Sticova, E. ; Mayr, C.H. ; Schiller, H.B. ; Gregor, M.
Dynamics of compartment-specific proteomic landscapes of hepatotoxic and cholestatic models of liver fibrosis.Fischer, A. ; Han, W. ; Hu, S. ; Mück-Häusl, M. ; Wannemacher, J. ; Kadri, S. ; Lin, Y. ; Dai, R. ; Christ, S. ; Su, Y. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Deisenhofer, C. ; Dutta, S. ; Kadri, A. ; Güney, T.G. ; Correa-Gallegos, D. ; Mayr, C.H. ; Hatz, R. ; Stoleriu, M.G. ; Lindner, M. ; Hilgendorff, A. ; Adler, H. ; Machens, H.G. ; Schiller, H.B. ; Hauck, S.M. ; Rinkevich, Y.
Author Correction: Targeting pleuro-alveolar junctions reverses lung fibrosis in mice.Fischer, A. ; Han, W. ; Hu, S. ; Mück-Häusl, M. ; Wannemacher, J. ; Kadri, S. ; Lin, Y. ; Dai, R. ; Christ, S. ; Su, Y. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Deisenhofer, C. ; Dutta, S. ; Kadri, A. ; Güney, T.G. ; Correa-Gallegos, D. ; Mayr, C.H. ; Hatz, R. ; Stoleriu, M.G. ; Lindner, M. ; Hilgendorff, A. ; Adler, H. ; Machens, H.G. ; Schiller, H.B. ; Hauck, S.M. ; Rinkevich, Y.
Targeting pleuro-alveolar junctions reverses lung fibrosis in mice.