Antibodies destroy an infected cell by a virus, immun defense kill the infected cell

Ebert Lab

Our lab is interested in the study of cell signaling pathways related to cell death and inflammation manipulated during host-pathogen interactions for novel therapeutic development.

About our research

Our research is focused on the characterization of host-pathogen interactions and the role of cell signaling and cell death during intracellular infections to identify novel host and virulence factors that manipulate the host to facilitate infection. Analysis and understanding of involved signaling pathways and factors allow us to identify novel potent therapeutic targets and strategies to fight infections. We aim to identify and design small molecule compounds that inhibit or eliminate these factors to support the control of infection, including chronic hepatitis B, SARS-CoV-2 and bunyavirus infection. Our work intersects with the fields of molecular virology, cell signaling, immunology and biochemistry and includes in vitro based cell culture assays and tools as well as in vivo infection models in BSL2 and BSL3 laboratories.

 

Our research topics

Our scientists at Ebert Lab

Porträt Gregor Ebert
Dr. Gregor Ebert

Gruppenleiter

Porträt Felix Eßlinger
Felix Esslinger

PhD Student

Porträt Olga Polezhaeva
Olga Polezhaeva

Technician

Porträt Daniele Mistretta
Daniele Mistretta

Technician

Porträt Zhe Ma
Dr. Zhe Ma

Post Doc

Profil anzeigen
Porträt Daina Chakma
Daina Chakma

PhD Student

Profil anzeigen

Publications

Cell Host Microbe 32, 2112-2130.e10 (2024)

Rong, Z. ; Mai, H. ; Ebert, G. ; Kapoor, S. ; Puelles, V.G. ; Czogalla, J. ; Hu, S. ; Su, J. ; Prtvar, D. ; Singh, I. ; Schädler, J. ; Delbridge, C. ; Steinke, H. ; Frenzel, H. ; Schmidt, K. ; Braun, C. ; Bruch, G. ; Ruf, V. ; Ali, M. ; Sühs, K.W. ; Nemati, M. ; Hopfner, F. ; Ulukaya, S. ; Jeridi, D. ; Mistretta, D. ; Caliskan, Ö.S. ; Wettengel, J.M. ; Cherif, F. ; Kolabas, Z.I. ; Molbay, M. ; Horvath, I. ; Zhao, S. ; Krahmer, N. ; Yildirim, A.Ö. ; Ussar, S. ; Herms, J. ; Huber, T.B. ; Tahirovic, S. ; Schwarzmaier, S.M. ; Plesnila, N. ; Höglinger, G. ; Ondruschka, B. ; Bechmann, I. ; Protzer, U. ; Elsner, M. ; Bhatia, H.S. ; Hellal, F. ; Ertürk, A.

Persistence of spike protein at the skull-meninges-brain axis may contribute to the neurological sequelae of COVID-19.

Huang, Y. ; Bergant, V. ; Grass, V. ; Emslander, Q. ; Hamad, M.S. ; Hubel, P. ; Mergner, J. ; Piras, A. ; Krey, K. ; Henrici, A. ; Öllinger, R. ; Tesfamariam, Y.M. ; Dalla Rosa, I. ; Bunse, T. ; Sutter, G. ; Ebert, G. ; Schmidt, F.I. ; Way, M. ; Rad, R. ; Bowie, A.G. ; Protzer, U. ; Pichlmair, A.

Multi-omics characterization of the monkeypox virus infection.
ACS Appl. Mater. Interfaces 16, 37275-37287 (2024)

Kohantorabi, M. ; Ugolotti, A. ; Sochor, B. ; Rössler, J. ; Wagstaffe, M. ; Meinhardt, A. ; Beck, E.E. ; Dolling, D.S. ; Garcia, M.B. ; Creutzburg, M. ; Keller, T.F. ; Schwartzkopf, M. ; Vayalil, S.K. ; Thuenauer, R. ; Guédez, G. ; Löw, C. ; Ebert, G. ; Protzer, U. ; Hammerschmidt, W. ; Zeidler, R. ; Roth, S.V. ; Di Valentin, C. ; Stierle, A. ; Noei, H.

Light-induced transformation of virus-like particles on TiO2.

Falke, S. ; Lieske, J. ; Herrmann, A. ; Loboda, J. ; Karničar, K. ; Günther, S. ; Reinke, P.Y.A. ; Ewert, W. ; Usenik, A. ; Lindič, N. ; Sekirnik, A. ; Dretnik, K. ; Tsuge, H. ; Turk, V. ; Chapman, H.N. ; Hinrichs, W. ; Ebert, G. ; Turk, D. ; Meents, A.

Structural elucidation and antiviral activity of covalent cathepsin L inhibitors.
Cell Discov. 10:42 (2024)

Gruber, C. ; Krautner, L. ; Bergant, V. ; Grass, V. ; Ma, Z. ; Rheinemann, L. ; Krus, A. ; Reinhardt, F. ; Mazneykova, L. ; Rocha-Hasler, M. ; Truong, D.J.J. ; Westmeyer, G.G. ; Pichlmair, A. ; Ebert, G. ; Giesert, F. ; Wurst, W.

Engineered, nucleocytoplasmic shuttling Cas13d enables highly efficient cytosolic RNA targeting.
Virology 595:110089 (2024)

Tu, T. ; Wettengel, J.M. ; Xia, Y. ; Testoni, B. ; Littlejohn, M. ; Le Bert, N. ; Ebert, G. ; Verrier, E.R. ; Tavis, J.E. ; Cohen, C.

Major open questions in the hepatitis B and D field – Proceedings of the inaugural International emerging hepatitis B and hepatitis D researchers workshop.
Virology 589:12 (2024)

Deerain, J.M. ; Aktepe, T.E. ; Trenerry, A.M. ; Ebert, G. ; Hyde, J.L. ; Charry, K. ; Edgington-Mitchell, L. ; Xu, B. ; Ambrose, R.L. ; Sarvestani, S.T. ; Lawlor, K.E. ; Pearson, J.S. ; White, P.A. ; Mackenzie, J.M.

Murine norovirus infection of macrophages induces intrinsic apoptosis as the major form of programmed cell death.

Reinke, P.Y.A. ; de Souza, E.E. ; Gunther, S. ; Falke, S. ; Lieske, J. ; Ewert, W. ; Loboda, J. ; Herrmann, A. ; Rahmani Mashhour, A. ; Karničar, K. ; Usenik, A. ; Lindič, N. ; Sekirnik, A. ; Botosso, V.F. ; Santelli, G.M.M. ; Kapronezai, J. ; de Araújo, M.V. ; Silva-Pereira, T.T. ; Filho, A.F.S. ; Tavares, M.S. ; Flórez-Álvarez, L. ; de Oliveira, D.B.L. ; Durigon, E.L. ; Giaretta, P.R. ; Heinemann, M.B. ; Hauser, M. ; Seychell, B. ; Böhler, H. ; Rut, W. ; Drag, M. ; Beck, T. ; Cox, R. ; Chapman, H.N. ; Betzel, C. ; Brehm, W. ; Hinrichs, W. ; Ebert, G. ; Latham, S.L. ; Guimarães, A.M.S. ; Turk, D. ; Wrenger, C. ; Meents, A.

Calpeptin is a potent cathepsin inhibitor and drug candidate for SARS-CoV-2 infections.

Garnish, S.E. ; Martin, K.R. ; Kauppi, M. ; Jackson, V.E. ; Ambrose, R. ; Eng, V.V. ; Chiou, S. ; Meng, Y. ; Frank, D. ; Tovey Crutchfield, E.C. ; Patel, K.M. ; Jacobsen, A.V. ; Atkin-Smith, G.K. ; Di Rago, L. ; Doerflinger, M. ; Horne, C.R. ; Hall, C. ; Young, S.N. ; Cook, M. ; Athanasopoulos, V. ; Vinuesa, C.G. ; Lawlor, K.E. ; Wicks, I.P. ; Ebert, G. ; Ng, A.P. ; Slade, C.A. ; Pearson, J.S. ; Samson, A.L. ; Silke, J. ; Murphy, J.M. ; Hildebrand, J.M.

A common human MLKL polymorphism confers resistance to negative regulation by phosphorylation.
ACS Appl. Mater. Interfaces 15, 8770-8782 (2023)

Kohantorabi, M. ; Wagstaffe, M. ; Creutzburg, M. ; Ugolotti, A. ; Kulkarni, S. ; Jeromin, A. ; Krekeler, T. ; Feuerherd, M. ; Herrmann, A. ; Ebert, G. ; Protzer, U. ; Guédez, G. ; Löw, C. ; Thuenauer, R. ; Schlueter, C. ; Gloskovskii, A. ; Keller, T.F. ; Di Valentin, C. ; Stierle, A. ; Noei, H.

Adsorption and inactivation of SARS-CoV-2 on the surface of anatase TiO2(101).
iScience 25:104632 (2022)

Frank, D. ; Garnish, S.E. ; Sandow, J.J. ; Weir, A. ; Liu, L. ; Clayer, E. ; Meza, L. ; Rashidi, M. ; Cobbold, S.A. ; Scutts, S.R. ; Doerflinger, M. ; Anderton, H. ; Lawlor, K.E. ; Lalaoui, N. ; Kueh, A.J. ; Eng, V.V. ; Ambrose, R.L. ; Herold, M.J. ; Samson, A.L. ; Feltham, R. ; Murphy, J.M. ; Ebert, G. ; Pearson, J.S. ; Vince, J.E.

Ubiquitylation of RIPK3 beyond-the-RHIM can limit RIPK3 activity and cell death.
Mol. Microbiol., DOI: 10.1111/mmi.14849 (2022)

Grohmann, C. ; Marapana, D.S. ; Ebert, G.

Targeted protein degradation at the host-pathogen interface.

Contact

Porträt Gregor Ebert
Dr. Gregor Ebert

Gruppenleiter