Skip to main content
Rolled up magazines on blue background
Africa Studio - stock.adobe.com

Publications

2025 Scientific Article in Chemical Science Chem. Sci. 16, 670-684 (2025)

Van Herck, J. ; Gil, M.V. ; Jablonka, K.M. ; Abrudan, A. ; Anker, A.S. ; Asgari, M. ; Blaiszik, B. ; Buffo, A. ; Choudhury, L. ; Corminboeuf, C. ; Daglar, H. ; Elahi, A.M. ; Foster, I.T. ; García, S.A. ; Garvin, M. ; Godin, G. ; Good, L.L. ; Gu, J. ; Xiao Hu, N. ; Jin, X. ; Junkers, T. ; Keskin, S. ; Knowles, T.P.J. ; Laplaza, R. ; Lessona, M. ; Majumdar, S.K. ; Mashhadimoslem, H. ; McIntosh, R.D. ; Moosavi, S.M. ; Mouriño, B. ; Nerli, F. ; Pevida, C. ; Poudineh, N. ; Rajabi-Kochi, M. ; Saar, K.L. ; Hooriabad Saboor, F. ; Sagharichiha, M. ; Schmidt, K.J. ; Shi, J. ; Simone, E. ; Svatunek, D. ; Taddei, M. ; Tetko, I.V. ; Tolnai, D. ; Vahdatifar, S. ; Whitmer, J. ; Wieland, D.C.F. ; Willumeit-Römer, R. ; Züttel, A. ; Smit, B.

Assessment of fine-tuned large language models for real-world chemistry and material science applications.

2024 Scientific Article in Science immunology Sci. Immunol. 9:eadl1467 (2024)

Bohnacker, S.# ; Henkel, F.# ; Hartung, F.# ; Geerlof, A. ; Riemer, S. ; Prodjinotho, U.F. ; Salah, E.B. ; Mourao, A. ; Bohn, S. ; Teder, T. ; Thomas, D. ; Gurke, R. ; Böckel, C. ; Ud-Dean, M. ; König, A.-C. ; Quaranta, A. ; Alessandrini, F. ; Lechner, A. ; Spitzlberger, B. ; Kabat, A.M. ; Pearce, E.J. ; Haeggström, J.Z. ; Hauck, S.M. ; Wheelock, C.E. ; Jakobsson, P.J. ; Sattler, M. ; Voehringer, D. ; Feige, M.J. ; da Costa, C.P. ; Esser-von Bieren, J.

A helminth enzyme subverts macrophage-mediated immunity by epigenetic targeting of prostaglandin synthesis.

2024 Scientific Article in Molecular Cell Mol. Cell 84, 4629-4644.e9 (2024)

Ito, J. ; Nakamura, T. ; Toyama, T. ; Chen, D. ; Berndt, C. ; Poschmann, G. ; Mourao, A. ; Doll, S. ; Suzuki, M. ; Zhang, W. ; Zheng, J. ; Trümbach, D. ; Yamada, N. ; Ono, K. ; Yazaki, M. ; Kawai, Y. ; Arisawa, M. ; Ohsaki, Y. ; Shirakawa, H. ; Wahida, A. ; Proneth, B. ; Saito, Y. ; Nakagawa, K. ; Mishima, E. ; Conrad, M.

PRDX6 dictates ferroptosis sensitivity by directing cellular selenium utilization.

Structure In:. 2024. 1281-1287 (Structure ; 32)

Bussi, G. ; Bonomi, M. ; Gkeka, P. ; Sattler, M. ; Al-Hashimi, H.M. ; Auffinger, P. ; Duca, M. ; Foricher, Y. ; Incarnato, D. ; Jones, A.N. ; Kirmizialtin, S. ; Krepl, M. ; Orozco, M. ; Palermo, G. ; Pasquali, S. ; Salmon, L. ; Schwalbe, H. ; Westhof, E. ; Zacharias, M.

RNA dynamics from experimental and computational approaches.

2024 Scientific Article in ACS Chemical Neuroscience ACS Chem. Neurosci. 15, 3181-3201 (2024)

Góral, I. ; Wichur, T. ; Sługocka, E. ; Grygier, P. ; Głuch-Lutwin, M. ; Mordyl, B. ; Honkisz-Orzechowska, E. ; Szałaj, N. ; Godyń, J. ; Panek, D. ; Zaręba, P. ; Sarka, A. ; Żmudzki, P. ; Latacz, G. ; Pustelny, K. ; Bucki, A. ; Czarna, A. ; Cardoso Micu Menezes, F.M. ; Więckowska, A.

Exploring novel GSK-3β inhibitors for anti-neuroinflammatory and neuroprotective effects: Synthesis, crystallography, computational analysis, and biological evaluation.

2024 Nature Communications Nat. Commun. 15:6632 (2024)

Xu, M. ; Ito-Kureha, T. ; Kang, H.-S. ; Chernev, A. ; Raj, T. ; Hoefig, K.P. ; Hohn, C. ; Giesert, F. ; Wang, Y. ; Pan, W. ; Ziętara, N. ; Straub, T. ; Feederle, R. ; Daniel, C. ; Adler, B. ; König, J. ; Feske, S. ; Tsokos, G.C. ; Wurst, W. ; Urlaub, H. ; Sattler, M. ; Kisielow, J. ; Wulczyn, F.G. ; Łyszkiewicz, M.&deg ; Heissmeyer, V.&deg

Correction to "The thymocyte-specific RNA-binding protein Arpp21 provides TCR repertoire diversity by binding to the 3'-UTR and promoting Rag1 mRNA expression".

2024 Scientific Article in ACS applied materials & interfaces ACS Appl. Mater. Interfaces 16, 37275-37287 (2024)

Kohantorabi, M. ; Ugolotti, A. ; Sochor, B. ; Rössler, J. ; Wagstaffe, M. ; Meinhardt, A. ; Beck, E.E. ; Dolling, D.S. ; Garcia, M.B. ; Creutzburg, M. ; Keller, T.F. ; Schwartzkopf, M. ; Vayalil, S.K. ; Thuenauer, R. ; Guédez, G. ; Löw, C. ; Ebert, G. ; Protzer, U. ; Hammerschmidt, W. ; Zeidler, R. ; Roth, S.V. ; Di Valentin, C. ; Stierle, A. ; Noei, H.

Light-induced transformation of virus-like particles on TiO2.

2024 Scientific Article in Nature Communications Nat. Commun. 15:2194 (2024)

Xu, M. ; Ito-Kureha, T. ; Kang, H.-S. ; Chernev, A. ; Raj, T. ; Hoefig, K.P. ; Hohn, C. ; Giesert, F. ; Wang, Y. ; Pan, W. ; Ziętara, N. ; Straub, T. ; Feederle, R. ; Daniel, C. ; Adler, B. ; König, J. ; Feske, S. ; Tsokos, G.C. ; Wurst, W. ; Urlaub, H. ; Sattler, M. ; Kisielow, J. ; Wulczyn, F.G. ; Łyszkiewicz, M.&deg ; Heissmeyer, V.&deg

The thymocyte-specific RNA-binding protein Arpp21 provides TCR repertoire diversity by binding to the 3'-UTR and promoting Rag1 mRNA expression.

2024 Scientific Article in Nucleic Acids Research Nucleic Acids Res. 52, 6441-6458 (2024)

Matsuda, A. ; Plewka, J. ; Rawski, M. ; Mourao, A. ; Zajko, W. ; Siebenmorgen, T. ; Kresik, L. ; Lis, K. ; Jones, A. ; Pachota, M. ; Karim, A. ; Hartman, K. ; Nirwal, S. ; Sonani, R. ; Chykunova, Y. ; Minia, I. ; Mak, P. ; Landthaler, M. ; Nowotny, M. ; Dubin, G. ; Sattler, M. ; Suder, P. ; Popowicz, G.M. ; Pyrc, K. ; Czarna, A.

Despite the odds: Formation of the SARS-CoV-2 methylation complex.

2023 Scientific Article in Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 120, 11:e2309205120 (2023)

Schmidt, H.# ; Raj, T.# ; O´Neill, T.J. ; Muschaweckh, A. ; Giesert, F. ; Negraschus, A. ; Hoefig, K.P. ; Behrens, G. ; Esser, L. ; Baumann, Christina ; Feederle, R. ; Plaza-Sirvent, C. ; Geerlof, A. ; Gewies, A. ; Isay, S.E. ; Ruland, J. ; Schmitz, I. ; Wurst, W. ; Korn, T. ; Krappmann, D. ; Heissmeyer, V.

Unrestrained cleavage of Roquin-1 by MALT1 induces spontaneous T cell activation and the development of autoimmunity.

2023 Scientific Article in Nature Methods Nat. Methods 20, 523-535 (2023)

Agam, G. ; Gebhardt, C. ; Popara, M. ; Mächtel, R. ; Folz, J. ; Ambrose, B. ; Chamachi, N. ; Chung, S.Y. ; Craggs, T.D. ; de Boer, M. ; Grohmann, D. ; Ha, T. ; Hartmann, A. ; Hendrix, J. ; Hirschfeld, V. ; Hübner, C.G. ; Hugel, T. ; Kammerer, D. ; Kang, H.-S. ; Kapanidis, A.N. ; Krainer, G. ; Kramm, K. ; Lemke, E.A. ; Lerner, E. ; Margeat, E. ; Martens, K. ; Michaelis, J. ; Mitra, J. ; Moya Muñoz, G.G. ; Quast, R.B. ; Robb, N.C. ; Sattler, M. ; Schlierf, M. ; Schneider, J. ; Schröder, T. ; Sefer, A. ; Tan, P.S. ; Thurn, J. ; Tinnefeld, P. ; van Noort, J. ; Weiss, S. ; Wendler, N. ; Zijlstra, N. ; Barth, A. ; Seidel, C.A.M. ; Lamb, D.C. ; Cordes, T.

Reliability and accuracy of single-molecule FRET studies for characterization of structural dynamics and distances in proteins.

2023 Review in Archives of Toxicology Arch. Toxicol. 97, 1267-1283 (2023)

Escher, B.I. ; Altenburger, R. ; Blüher, M. ; Colbourne, J.K. ; Ebinghaus, R. ; Fantke, P. ; Hein, M. ; Köck, W. ; Kümmerer, K. ; Leipold, S. ; Li, X. ; Scheringer, M. ; Scholz, S. ; Schloter, M. ; Schweizer, P.J. ; Tal, T. ; Tetko, I.V. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Wick, L.Y. ; Fenner, K.

Modernizing persistence-bioaccumulation-toxicity (PBT) assessment with high throughput animal-free methods.

2023 Scientific Article in Molecular Cell Mol. Cell 83, 2653-2672.e15 (2023)

Ebersberger, S.# ; Hipp, C.# ; Mulorz, M.M. ; Buchbender, A. ; Hubrich, D. ; Kang, H.-S. ; Martinez Lumbreras, S. ; Kristofori, P. ; Sutandy, F.X.R. ; Llacsahuanga Allcca, L. ; Schönfeld, J. ; Bakisoglu, C. ; Busch, A. ; Hänel, H. ; Tretow, K. ; Welzel, M. ; Di Liddo, A. ; Möckel, M.M. ; Zarnack, K. ; Ebersberger, I. ; Legewie, S. ; Luck, K. ; Sattler, M. ; König, J.

FUBP1 is a general splicing factor facilitating 3' splice site recognition and splicing of long introns.

2023 Scientific Article in Expert Opinion on Drug Discovery Expert Opin. Drug Discov. 18, 821-833 (2023)

Vistoli, G. ; Manelfi, C. ; Talarico, C. ; Fava, A. ; Warshel, A. ; Tetko, I.V. ; Apostolov, R. ; Ye, Y. ; Latini, C. ; Ficarelli, F. ; Palermo, G. ; Gadioli, D. ; Vitali, E. ; Varriale, G. ; Pisapia, V. ; Scaturro, M. ; Coletti, S. ; Gregori, D. ; Gruffat, D. ; Leija, E. ; Hessenauer, S. ; Delbianco, A. ; Allegretti, M. ; Beccari, A.R.

MEDIATE - Molecular DockIng at homE: Turning collaborative simulations into therapeutic solutions.

2023 Scientific Article in Pharmaceutics Pharmaceutics 15:19 (2023)

Zanuttigh, E. ; Derderian, K. ; Güra, M. ; Geerlof, A. ; Di Meo, I. ; Cavestro, C. ; Hempfling, S. ; Ortiz Collazos, S. ; Mauthe, M. ; Kmiec, T. ; Cammarota, E. ; Panzeri, M.C. ; Klopstock, T. ; Sattler, M. ; Winkelmann, J. ; Messias, A.C. ; Iuso, A.

Identification of autophagy as a functional target suitable for the pharmacological treatment of mitochondrial membrane protein-associated neurodegeneration (MPAN) in vitro.

2023 Scientific Article in Nucleic Acids Research Nucleic Acids Res. 51, 1297-1316 (2023)

Molitor, L.# ; Klostermann, M.# ; Bacher, S. ; Merl-Pham, J. ; Spranger, N. ; Burczyk, S. ; Ketteler, C. ; Rusha, E. ; Tews, D. ; Pertek, A. ; Proske, M. ; Busch, A. ; Reschke, S. ; Feederle, R. ; Hauck, S.M. ; Blum, H. ; Drukker, M. ; Fischer-Posovszky, P. ; König, J. ; Zarnack, K.&deg ; Niessing, D.&deg

Depletion of the RNA-binding protein PURA triggers changes in posttranscriptional gene regulation and loss of P-bodies.

2022 Scientific Article in eLife eLife 11:e77443 (2022)

Chora, A.F. ; Pedroso, D. ; Kyriakou, E. ; Pejanovic, N. ; Colaço, H. ; Gozzelino, R. ; Barros, A. ; Willmann, K. ; Velho, T.R. ; Moita, C. ; Santos, I. ; Pereira, P. ; Carvalho, S. ; Martins, F.B. ; Ferreira, J.A. ; de Almeida, S.F. ; Benes, V. ; Anrather, J. ; Weis, S. ; Soares, M.P. ; Geerlof, A. ; Neefjes, J.J. ; Sattler, M. ; Messias, A.C.&deg ; Neves Costa, A.&deg ; Moita, L.F.&deg

DNA damage independent inhibition of NF-kB transcription by anthracyclines.

2022 Scientific Article in European Journal of Medicinal Chemistry Eur. J. Med. Chem. 243:114778 (2022)

Napolitano, V.&deg ; Mroz, P. ; Marciniak, M. ; Kalel, V.C. ; Softley, C. ; Janna Olmos, J.D. ; Tippler, B.G. ; Schorpp, K.K. ; Rioton, S. ; Fröhlich, T. ; Plettenburg, O. ; Hadian, K. ; Erdmann, R. ; Sattler, M. ; Popowicz, G.M. ; Dawidowski, M.&deg ; Dubin, G.&deg

Structure-based design, synthesis and evaluation of a novel family of PEX5-PEX14 interaction inhibitors against Trypanosoma.

2022 Scientific Article in Frontiers in Immunology Front. Immunol. 13:958952 (2022)

Kreft, L. ; Schepers, A. ; Hils, M. ; Swiontek, K. ; Flatley, A. ; Janowski, R. ; Mirzaei, M.K. ; Dittmar, M. ; Chakrapani, N. ; Desai, M.S. ; Eyerich, S. ; Deng, L. ; Niessing, D. ; Fischer, K. ; Feederle, R. ; Blank, S. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Hilger, C. ; Biedermann, T. ; Ohnmacht, C.

A novel monoclonal IgG1 antibody specific for Galactose-alpha-1,3-galactose questions alpha-Gal epitope expression by bacteria.

2022 Scientific Article in Nature Nature 608, 778-783 (2022)

Mishima, E.&deg ; Ito, J. ; Wu, Z. ; Nakamura, T. ; Wahida, A. ; Doll, S. ; Tonnus, W. ; Nepachalovich, P. ; Eggenhofer, E. ; Aldrovandi, M. ; Henkelmann, B. ; Yamada, K.i. ; Wanninger, J. ; Zilka, O. ; Sato, E. ; Feederle, R. ; Hass, D, ; Maida, A. ; Mourao, A. ; Linkermann, A. ; Geissler, E.K. ; Nakagawa, K. ; Abe, T. ; Fedorova, M. ; Proneth, B. ; Pratt, D.A. ; Conrad, M.&deg

A non-canonical vitamin K cycle is a potent ferroptosis suppressor.

2022 Scientific Article in Cell Chemical Biology Cell Chem. Bio. 29, 774-784.e8 (2022)

Napolitano, V.# ; Dabrowska, A.# ; Schorpp, K.K.# ; Mourao, A.# ; Barreto-Duran, E. ; Benedyk, M. ; Botwina, P. ; Brandner, S. ; Bostock, M.J. ; Chykunova, Y. ; Czarna, A. ; Dubin, G. ; Fröhlich, T. ; Hölscher, M. ; Jedrysik, M. ; Matsuda, A. ; Owczarek, K. ; Pachota, M. ; Plettenburg, O. ; Potempa, J.S. ; Rothenaigner, I. ; Schlauderer, F. ; Slysz, K. ; Szczepanski, A. ; Greve-Isdahl Mohn, K. ; Blomberg, B. ; Sattler, M.&deg ; Hadian, K.&deg ; Popowicz, G.M.&deg ; Pyrc, K.&deg

Acriflavine, a clinically approved drug, inhibits SARS-CoV-2 and other betacoronaviruses.

2022 Scientific Article in Computational and Structural Biotechnology Journal Comp. Struc. Biotech. J. 20, 443-458 (2022)

Margreiter, M.A. ; Witzenberger, M. ; Wasser, Y. ; Davydova, E.-O. ; Janowski, R. ; Metz, J. ; Habib, P. ; Sahnoun, S.E.M. ; Sobisch, C. ; Poma, B. ; Palomino-Hernández, O. ; Wagner, M. ; Carell, T. ; Jon Shah, N. ; Schulz, J.B.&deg ; Niessing, D.&deg ; Voigt, A.&deg ; Rossetti, G.&deg

Small-molecule modulators of TRMT2A decrease PolyQ aggregation and PolyQ-induced cell death.

2022 Scientific Article in Life Science Alliance Life Sci. All. 5:e202101164 (2022)

Borchard, S. ; Raschke, S. ; Zak, K.M. ; Eberhagen, C. ; Einer, C. ; Weber, E. ; Müller, S.M. ; Michalke, B. ; Lichtmannegger, J. ; Wieser, A. ; Rieder, T. ; Popowicz, G.M. ; Adamski, J. ; Klingenspor, M. ; Coles, A.H. ; Viana, R. ; Vendelbo, M.H. ; Sandahl, T.D. ; Schwerdtle, T. ; Plitz, T. ; Zischka, H.

Bis-choline tetrathiomolybdate prevents copper-induced blood-brain barrier damage.

2021 Scientific Article in Nature Immunology Nat. Immunol. 22, 1563-1576 (2021)

Behrens, G.# ; Edelmann, S.L.# ; Raj, T.# ; Kronbeck, N. ; Monecke, T. ; Davydova, E.-O. ; Wong, E.H. ; Kifinger, L. ; Giesert, F. ; Kirmaier, M.E. ; Hohn, C. ; de Jonge, L.S. ; Pisfil, M.G. ; Fu, M. ; Theurich, S. ; Feske, S. ; Kawakami, N. ; Wurst, W. ; Niessing, D. ; Heissmeyer, V.

Disrupting Roquin-1 interaction with Regnase-1 induces autoimmunity and enhances antitumor responses.

2021 Scientific Article in Nature Communications Nat. Commun. 12:5208 (2021)

Hoefig, K.P.# ; Reim, A. ; Gallus, C.# ; Wong, E.H. ; Behrens, G. ; Conrad, C. ; Xu, M. ; Kifinger, L. ; Ito-Kureha, T. ; Defourny, K.A.Y. ; Geerlof, A. ; Mautner, J.M. ; Hauck, S.M. ; Baumjohann, D. ; Feederle, R. ; Mann, M. ; Wierer, M.&deg ; Glasmacher, E.&deg ; Heissmeyer, V.&deg

Defining the RBPome of primary T helper cells to elucidate higher-order Roquin-mediated mRNA regulation.

2021 Scientific Article in Environmental Health Perspectives Environ. Health Perspect. 129:47013 (2021)

Mansouri, K. ; Karmaus, A.L. ; Fitzpatrick, J. ; Patlewicz, G. ; Pradeep, P. ; Alberga, D. ; Alepee, N. ; Allen, T.E.H. ; Allen, D. ; Alves, V.M. ; Andrade, C.H. ; Auernhammer, T.R. ; Ballabio, D. ; Bell, S. ; Benfenati, E. ; Bhattacharya, S. ; Bastos, J.V. ; Boyd, S. ; Brown, J.B. ; Capuzzi, S.J. ; Chushak, Y. ; Ciallella, H. ; Clark, A.M. ; Consonni, V. ; Daga, P.R. ; Ekins, S. ; Farag, S. ; Fedorov, M. ; Fourches, D. ; Gadaleta, D. ; Gao, F. ; Gearhart, J.M. ; Goh, G. ; Goodman, J.M. ; Grisoni, F. ; Grulke, C.M. ; Hartung, T. ; Hirn, M. ; Karpov, P. ; Korotcov, A. ; Lavado, G.J. ; Lawless, M. ; Li, X. ; Luechtefeld, T. ; Lunghini, F. ; Mangiatordi, G.F. ; Marcou, G. ; Marsh, D. ; Martin, T. ; Mauri, A. ; Muratov, E.N. ; Myatt, G.J. ; Nguyen, D.T. ; Nicolotti, O. ; Note, R. ; Pande, P. ; Parks, A.K. ; Peryea, T. ; Polash, A.H. ; Rallo, R. ; Roncaglioni, A. ; Rowlands, C.J. ; Ruiz, P. ; Russo, D.P. ; Sayed, A. ; Sayre, R. ; Sheils, T. ; Siegel, C. ; Silva, A.C. ; Simeonov, A. ; Sosnin, S. ; Southall, N. ; Strickland, J. ; Tang, Y. ; Teppen, B. ; Tetko, I.V. ; Thomas, D. ; Tkachenko, V. ; Todeschini, R. ; Toma, C. ; Tripodi, I. ; Trisciuzzi, D. ; Tropsha, A. ; Varnek, A. ; Vukovic, K. ; Wang, Z. ; Wang, L. ; Waters, K.M. ; Wedlake, A.J. ; Wijeyesakere, S.J. ; Wilson, D. ; Xiao, Z. ; Yang, H. ; Zahoranszky-Kohalmi, G. ; Zakharov, A.V. ; Zhang, F.F. ; Zhang, Z. ; Zhao, T. ; Zhu, H. ; Zorn, K.M. ; Casey, W. ; Kleinstreuer, N.C.

CATMoS: Collaborative acute toxicity modeling suite.

2021 Scientific Article in EMBO Reports EMBO Rep. 22:e49568 (2021)

Stadler, D.# ; Kächele, M.# ; Jones, A.# ; Hess J. ; Urban, C. ; Schneider, J. ; Xia, Y. ; Oswald, A. ; Nebioglu, F. ; Bester, R. ; Lasitschka, F. ; Ringelhan, M. ; Ko, C. ; Chou, W.M. ; Geerlof, A. ; van de Klundert, M. ; Wettengel, J.M. ; Schirmacher, P. ; Heikenwälder, M. ; Schreiner, S. ; Bartenschlager, R. ; Pichlmair, A. ; Sattler, M. ; Unger, K. ; Protzer, U.

Interferon-induced degradation of the persistent hepatitis B virus cccDNA form depends on ISG20.

2021 Scientific Article in Nature Communications Nat. Commun. 12:2999 (2021)

Georgiadi, A.#&deg ; Lopez Salazar, V.# ; El-Merahbi, R. ; Karikari, R.A. ; Ma, X. ; Mourao, A. ; Klepac, K. ; Bühler, L. ; Alfaro, A.J. ; Kaczmarek, I. ; Linford, A. ; Bosma, M. ; Shilkova, O. ; Ritvos, O. ; Nakamura, N. ; Hirose, S. ; Lassi, M. ; Teperino, R. ; Machado, J. ; Scheideler, M. ; Dietrich, A. ; Geerlof, A. ; Feuchtinger, A. ; Blutke, A. ; Fischer, K. ; Müller, T.D. ; Kessler, K. ; Schöneberg, T. ; Thor, D. ; Hornemann, S. ; Kruse, M. ; Nawroth, P.P. ; Pivovarova-Ramich, O. ; Pfeiffer, A.F.H. ; Sattler, M. ; Blüher, M. ; Herzig, S.&deg

Orphan GPR116 mediates the insulin sensitizing effects of the hepatokine FNDC4 in adipose tissue.

2021 Scientific Article in Journal of Medicinal Chemistry J. Med. Chem. 64, 4623-4661 (2021)

Pallesen, J.S. ; Narayanan, D. ; Tran, K.T. ; Solbak, S.M. ; Marseglia, G. ; Sørensen, L.M.E. ; Høj, L.J. ; Munafò, F. ; Carmona, R.M.C. ; Garcia, A.D. ; Desu, H.L. ; Brambilla, R. ; Johansen, T.N. ; Popowicz, G.M. ; Sattler, M. ; Gajhede, M. ; Bach, A.

Deconstructing noncovalent kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1) inhibitors into fragments to reconstruct new potent compounds.

2021 Scientific Article in Clinical Genetics Clin. Genet. 99, 789-801 (2021)

Schuch, L.A. ; Forstner, M. ; Rapp, C.K. ; Li, Y. ; Smith, D.E.C. ; Mendes, M.I. ; Delhommel, F. ; Sattler, M. ; Emiralioğlu, N. ; Taskiran, E.Z. ; Orhan, D. ; Kiper, N. ; Rohlfs, M. ; Jeske, T. ; Hastreiter, M. ; Gerstlauer, M. ; Torrent-Vernetta, A. ; Moreno-Galdó, A. ; Kammer, B. ; Brasch, F. ; Reu-Hofer, S. ; Griese, M.

FARS1-related disorders caused by bi-allelic mutations in cytosolic phenylalanyl-tRNA synthetase genes: Look beyond the lungs!

2020 Scientific Article in Journal of Hepatology J. Hepatol. 73, 1347-1359 (2020)

Lampl, S. ; Janas, M.K. ; Donakonda, S. ; Brugger, M. ; Lohr, K. ; Schneider, A. ; Manske, K. ; Sperl, L.E. ; Kläger, S. ; Küster, B. ; Wettmarshausen, J. ; Müller, C. ; Laschinger, M. ; Hartmann, D. ; Hüser, N. ; Perocchi, F. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Hagn, F. ; Zender, L. ; Hornung, V. ; Borner, C. ; Pichlmair, A. ; Kashkar, H. ; Klingenspor, M. ; Prinz, M. ; Schreiner, S. ; Conrad, M. ; Jost, P.J. ; Zischka, H. ; Steiger, K. ; Krönke, M. ; Zehn, D. ; Protzer, U. ; Heikenwälder, M. ; Knolle, P.A. ; Wohlleber, D.

Reduced mitochondrial resilience enables non-canonical induction of apoptosis after TNF receptor signaling in virus-infected hepatocytes.

2020 Scientific Article in Autophagy Autophagy 16, 2294-2296 (2020)

Santovito, D. ; Egea, V. ; Bidzhekov, K. ; Natarelli, L. ; Mourao, A. ; Blanchet, X. ; Wichapong, K. ; Aslani, M. ; Brunßen, C. ; Horckmans, M. ; Hristov, M. ; Geerlof, A. ; Lutgens, E. ; Daemen, M.J.A.P. ; Hackeng, T. ; Ries, C. ; Chavakis, T. ; Morawietz, H. ; Naumann, R. ; Hundelshausen, P.V. ; Steffens, S. ; Duchêne, J. ; Megens, R.T.A. ; Sattler, M. ; Weber, C.

Autophagy unleashes noncanonical microRNA functions.

2020 Chemical Society reviews Chem. Soc. Rev. 49, 3716 (2020)

Muratov, E.N. ; Bajorath, J. ; Sheridan, R.P. ; Tetko, I.V. ; Filimonov, D. ; Poroikov, V. ; Oprea, T.I. ; Baskin, I.I. ; Varnek, A. ; Roitberg, A. ; Isayev, O. ; Curtarolo, S. ; Fourches, D. ; Cohen, Y. ; Aspuru-Guzik, A. ; Winkler, D.A. ; Agrafiotis, D. ; Cherkasov, A. ; Tropsha, A.

QSAR without borders (vol 10, pg 531, 2020).

2020 Scientific Article in Science Translational Medicine Sci. Transl. Med. 12:eaaz2294 (2020)

Santovito, D.#&deg ; Egea, V.# ; Bidzhekov, K.# ; Natarelli, L.# ; Mourao, A. ; Blanchet, X. ; Wichapong, K. ; Aslani, M. ; Brunßen, C. ; Horckmans, M. ; Hristov, M. ; Geerlof, A. ; Lutgens, E. ; Daemen, M.J.A.P. ; Hackeng, T. ; Ries, C. ; Chavakis, T. ; Morawietz, H. ; Naumann, R. ; von Hundelshausen, P. ; Steffens, S. ; Duchêne, J. ; Megens, R.T.A. ; Sattler, M. ; Weber, C.&deg

Noncanonical inhibition of caspase-3 by a nuclear microRNA confers endothelial protection by autophagy in atherosclerosis.

2020 Scientific Article in Science Translational Medicine Sci. Transl. Med. 12:eaay0605 (2020)

de los Reyes Jimenez, M. ; Lechner, A. ; Alessandrini, F. ; Bohnacker, S. ; Schindela, S. ; Trompette, A. ; Haimerl, P. ; Thomas, D. ; Henkel, F. ; Mourao, A. ; Geerlof, A. ; da Costa, C.P. ; Chaker, A. ; Brüne, B. ; Nüsing, R. ; Jakobsson, P.J. ; Nockher, W.A. ; Feige, M.J. ; Haslbeck, M. ; Ohnmacht, C. ; Marsland, B.J. ; Voehringer, D. ; Harris, N.L. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Esser-von Bieren, J.

An anti-inflammatory eicosanoid switch mediates the suppression of type-2 inflammation by helminth larval products.

2020 Scientific Article in Bioorganic chemistry Bioorg. Chem. 98:103717 (2020)

Dawidowski, M. ; Król, M. ; Szulczyk, B. ; Chodkowski, A. ; Podsadni, P. ; Konopelski, P. ; Ufnal, M. ; Szuberski, P. ; Wróbel, M.Z. ; Zhang, Y. ; El Harchi, A. ; Hancox, J.C. ; Jarkovska, D. ; Mistrova, E. ; Sviglerova, J. ; Štengl, M. ; Popowicz, G.M. ; Turło, J.

Structure-activity relationship and cardiac safety of 2-aryl-2-(pyridin-2-yl) acetamides as a new class of broad-spectrum anticonvulsants derived from Disopyramide.

2020 Review in Chemical Society reviews Chem. Soc. Rev. 49, 3525-3564 (2020)

Muratov, E.N. ; Bajorath, J. ; Sheridan, R.P. ; Tetko, I.V. ; Filimonov, D. ; Poroikov, V. ; Oprea, T.I. ; Baskin, I.I. ; Varnek, A. ; Roitberg, A. ; Isayev, O. ; Curtalolo, S. ; Fourches, D. ; Cohen, Y. ; Aspuru-Guzik, A. ; Winkler, D.A. ; Agrafiotis, D. ; Cherkasov, A. ; Tropsha, A.

QSAR without borders.

2020 Scientific Article in Environmental Health Perspectives Environ. Health Perspect. 128:27002 (2020)

Mansouri, K. ; Kleinstreuer, N. ; Abdelaziz, A.M. ; Alberga, D. ; Alves, V.M. ; Andersson, P.L. ; Andrade, C.H. ; Bai, F. ; Balabiu, I. ; Ballabio, D. ; Benfenati, E. ; Bhhatarai, B. ; Boyer, S. ; Chen, J. ; Consonni, V. ; Farag, S. ; Fourches, D. ; Garcia-Sosa, A.T. ; Grulke, C.M. ; Hong, H. ; Horvath, D. ; Hu, X. ; Huang, R. ; Jeliazkova, N. ; Li, J. ; Li, X. ; Liu, H. ; Manganelli, S. ; Mangiatordi, G.F. ; Maran, U. ; Marcou, G. ; Martin, T. ; Muratov, E. ; Nguyen, D.T. ; Nicolotti, O. ; Nikolov, N.G. ; Norinder, U. ; Papa, E. ; Petitjean, M. ; Piir, G. ; Pogodin, P. ; Poroikov, V. ; Qiao, X. ; Richard, A.M. ; Roncaglioni, A. ; Ruiz, P. ; Rupakheti, C. ; Sakkiah, S. ; Sangion, A. ; Schramm, K.-W. ; Selvaraj, C. ; Shah, I. ; Sild, S. ; Sun, L. ; Taboureau, O. ; Tang, Y. ; Tetko, I.V. ; Todeschini, R. ; Tong, W. ; Trisciuzzi, D. ; Tropsha, A. ; van den Driessche, G. ; Varnek, A. ; Wang, Z. ; Wedebye, E.B. ; Williams, A.J. ; Xie, H. ; Zakharo, V. ; Zheng, Z. ; Judson, R.S.

CoMPARA: Collaborative modeling project for androgen receptor activity.

2020 Scientific Article in Journal of Medicinal Chemistry J. Med. Chem. 63, 847-879 (2020)

Dawidowski, M.&deg ; Kalel, V.C. ; Napolitano, V. ; Fino, R. ; Schorpp, K.K. ; Emmanouilidis, L. ; Lenhart, D. ; Ostertag, M.S. ; Kaiser, M. ; Kolonko, M. ; Tippler, B. ; Schliebs, W. ; Dubin, G. ; Mäser, P. ; Tetko, I.V. ; Hadian, K. ; Plettenburg, O. ; Erdmann, R. ; Sattler, M.&deg ; Popowicz, G.M.&deg

Structure-activity relationship in pyrazolo[4,3-c]pyridines, first inhibitors of PEX14-PEX5 Protein-Protein Interaction (PPI) with trypanocidal activity.