Rolled up magazines on blue background

CF-MPC Publication

Publications

Oluwagbemigun, K. ; Ziegler, D. ; Strom, A. ; Heier, M. ; Bönhof, G.J. ; Roden, M. ; Rathmann, W. ; Meisinger, C. ; Peters, A. ; Hauck, S.M. ; Petrera, A. ; Sinner, M.F. ; Kääb, S. ; Thorand, B. ; Herder, C.

Association of inflammatory and cardiovascular proteomics biomarkers with indices of heart rate variability in the general population: KORA S4/FF4 study.
Nat. Commun. 16:8774 (2025)

Distler, U. ; Yoo, H.B. ; Kardell, O. ; Hein, D. ; Sielaff, M. ; Scherer, M. ; Jozefowicz, A.M. ; Leps, C. ; Gomez-Zepeda, D. ; von Toerne, C. ; Merl-Pham, J. ; Barth, T.K. ; Tüshaus, J. ; Giesbertz, P. ; Müller, T. ; Kliewer, G. ; Aljakouch, K. ; Helm, B. ; Unger, H. ; Frey, D.L. ; Helm, D. ; Schwarzmüller, L.E. ; Popp, O. ; Qin, D. ; Wudy, S.I. ; Sinn, L.R. ; Mergner, J. ; Ludwig, C. ; Imhof, A. ; Kuster, B. ; Lichtenthaler, S.F. ; Krijgsveld, J. ; Klingmüller, U. ; Mertins, P. ; Coscia, F. ; Ralser, M. ; Mülleder, M. ; Hauck, S.M. ; Tenzer, S.

Multicenter evaluation of label-free quantification in human plasma on a high dynamic range benchmark set.
Sci. Rep. 15:36448 (2025)

Varkevisser, R.D.M. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Mul, D. ; Aanstoot, H.J. ; Paterson, A. ; Wolffenbuttel, B.H.R. ; van der Klauw, M.M.

Targeted proteomics analysis in type 1 diabetes identifies lower agouti-related protein levels in individuals with impaired hypoglycaemia awareness.
Int. J. Mol. Sci. 26, 8324 - 8324 (2025)

Chakraborty, A. ; Giraldo-Arias, J. ; Merl-Pham, J. ; Dick, E. ; Mastalerz, M. ; Zöller, M. ; Marchi, H. ; Le Gleut, R. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Hauck, S.M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Cholesterol regulates airway epithelial cell differentiation by inhibiting p53 nuclear translocation.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, 1889-1892 (2025)

Merl-Pham, J. ; Knüppel, L. ; Binzenhöfer, L. ; Hennen, E. ; Kaminski, N. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Hauck, S.M. ; Hilgendorff, A. ; Eickelberg, O. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Collagen post-translational modifications are altered in IPF including within ECM receptor binding motifs.
EMBO J. 44, 5037-5065 (2025)

Singh, I. ; Onogi, Y. ; Cardoso Micu Menezes, F.M. ; Khasanova, D. ; Kang, L. ; Wang, C. ; Ruiz-Trave, J. ; Sharma, S. ; Khalil, A. ; Reichenbach, V.K. ; Shi, Y. ; Flatley, A. ; Yan, X. ; Israel, A. ; Dragano, N.R.V. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Hoffmann, A. ; Ghosh, A. ; Noé, F. ; Wolfrum, C. ; Cucuruz, S. ; König, A.-C. ; Burtscher, I. ; Hauck, S.M. ; Lickert, H. ; Hofmann, S.M. ; Feederle, R. ; Schriever, S.C. ; Hernandez-Bautista, R. ; Sancar, G. ; Cebrian Serrano, A. ; Tetko, I.V. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Blüher, M. ; Hrabě de Angelis, M. ; Ussar, S.

NRAC controls CD36-mediated fatty acid uptake in adipocytes and lipid clearance in vivo.
J. Proteome Res. 24, 4862–4863 (2025)

Kardell, O. ; Gronauer, T.F. ; von Toerne, C. ; Merl-Pham, J. ; König, A.-C. ; Barth, T.K. ; Mergner, J. ; Ludwig, C. ; Tüshaus, J. ; Giesbertz, P. ; Breimann, S. ; Schweizer, L. ; Müller, T. ; Kliewer, G. ; Distler, U. ; Aljakouch, K. ; Gomez‐Zepeda, D. ; Popp, O. ; Qin, D. ; Teupser, D. ; Cox, J. ; Imhof, A. ; Küster, B. ; Lichtenthaler, S.F. ; Krijgsveld, J. ; Tenzer, S. ; Mertins, P. ; Coscia, F. ; Hauck, S.M.

Correction to “Multicenter longitudinal quality assessment of MS-based proteomics in plasma and serum”.
In:. 2025. 259-282 (Methods Enzymol. ; 719)

Klavaris, A. ; König, A.-C. ; Demetriades, C. ; Hauck, S.M. ; Kirmizis, A.

Affinity purification-mass spectrometry to identify nuclear protein interactions of N-terminal acetyltransferase NAA40.
FEBS J., DOI: 10.1111/febs.70194 (2025)

Yıldırım, S. ; Mhamane, A. ; Lösch, S. ; Wieder, A. ; Ermis, E. ; König, A.-C. ; Yilmaz, S. ; Hauck, S.M. ; Kocabaş, F. ; Szendroedi, J. ; Herzig, S. ; Ekim Üstünel, B.

TSC22D1 is a newly identified inhibitor of insulin secretion in pancreatic beta cells.
Nat. Comput. Sci., DOI: 10.1038/s43588-025-00832-7 (2025)

Burankova, Y. ; Abele, M. ; Bakhtiari, M. ; von Toerne, C. ; Barth, T.K. ; Schweizer, L. ; Giesbertz, P. ; Schmidt, J.R. ; Kalkhof, S. ; Müller-Deile, J. ; van Veelen, P.A. ; Mohammed, Y. ; Hammer, E. ; Arend, L. ; Adamowicz, K. ; Laske, T. ; Hartebrodt, A. ; Frisch, T. ; Meng, C. ; Matschinske, J. ; Späth, J. ; Röttger, R. ; Schwämmle, V. ; Hauck, S.M. ; Lichtenthaler, S.F. ; Imhof, A. ; Mann, M. ; Ludwig, C. ; Kuster, B. ; Baumbach, J. ; Zolotareva, O.

Privacy-preserving multicenter differential protein abundance analysis with FedProt.
In: Metabolomics. 2025. 1-23 (Methods Mol. Biol. ; 2925)

Artati, A. ; Couacault, P. ; Witting, M.

Nontargeted metabolomics using the Sciex ZenoTOF 7600.
Mol. Metab. 98:102185 (2025)

Dreher, S.I. ; Goj, T. ; von Toerne, C. ; Hoene, M. ; Irmler, M. ; Ouni, M. ; Jähnert, M. ; Beckers, J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Peter, A. ; Moller, A. ; Birkenfeld, A.L. ; Schürmann, A. ; Hauck, S.M. ; Weigert, C.

Sex differences in resting skeletal muscle and the acute and long-term response to endurance exercise in individuals with overweight and obesity.
Nat. Commun. 16:5151 (2025)

Peters, L. ; Drechsler, M. ; Herrera, M.A. ; Liu, J. ; Pees, B. ; Jarstorff, J. ; Czerwinski, A. ; Lubbock, F. ; Angelidou, G. ; Salzer, L. ; Moors, K.A. ; Paczia, N. ; Shi, Y.M. ; Schulenburg, H. ; Kaleta, C. ; Witting, M. ; Liebeke, M. ; Campopiano, D.J. ; Bode, H.B. ; Dierking, K.

Polyketide synthase-derived sphingolipids mediate microbiota protection against a bacterial pathogen in C. elegans.
JOSS 10, 8070 - 8070 (2025)

Graeve, M.D. ; Bittremieux, W. ; Naake, T. ; Huber, C. ; Mattanovich, M. ; Hoffmann, N. ; Marchal, P. ; Chrone, V.G. ; Louail, P. ; Hecht, H. ; Witting, M. ; Rainer, J.

SpectriPy: Enhancing cross-language mass spectrometry data analysis with R and python.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A7319 - A7319 (2025)

Hilgendorff, A. ; Kindt-Dunjko, A. ; Häfner, F. ; Förster, K. ; Heydarian, M. ; Hauck, S.M. ; Flemmer, A.W. ; von Toerne, C. ; Sophia, S. ; Toshner, M. ; Sucre, J.M.S.

Interleukin 7 Signaling as an Indicator of Pulmonary Vascular Disease in Preterm Infants Identified by Proteomic Screening and MRI Analysis.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A6856 - A6856 (2025)

Zöller, M. ; Mayr, C.H. ; Mastalerz, M. ; Dick, E. ; Chakraborty, A. ; Nakayma, M. ; Simon, L. ; Merl-Pham, J. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Schmid, O. ; Hauck, S.M. ; Schiller, H. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Transient and Persistent Airway Proteome Changes Induced by Cigarette Smoke.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 211, A6855 - A6855 (2025)

Zöller, M. ; Mastalerz, M. ; Dick, E. ; Hennen, E. ; Chakraborty, A. ; Merl-Pham, J. ; Marchi, H. ; Le Gleut, R. ; Jeridi, A. ; Prasse, A. ; Jäger, B. ; Santofimia‐Castaño, P. ; Stoleriu, M.-G. ; Hilgendorff, A. ; Yildirim, A.Ö. ; Hauck, S.M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Quantitative Proteomics Identifies Nuclear Protein 1 as a Regulator of Cell Death in Differentiated Primary Human Bronchial Epithelial Cells.
Pneumologie 79, S24 - S25 (2025)

Stoleriu, M.-G. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Schamberger, A.C. ; Heydarian, M. ; Gabriel, C. ; Najak, A. ; Disovic, A. ; Schneider, J. ; Gerckens, M. ; Burgstaller, G. ; Ding, Y. ; Doryab, A. ; Voss, C. ; Ketscher, C. ; Sienel, W. ; Kauke, T. ; Fertmann, J. ; Schneider, C. ; Behr, J. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Schubert, B. ; Hauck, S.M. ; Hatz, R. ; Schmid, O. ; Stöger, T. ; Schiller, H. ; Hilgendorff, A.

Development of advanced in-vitro human bronchial epithelial models and lung cell atlas in COPD enabled by thoracic surgery translational research.
Genome Biol. 26:100 (2025)

Maddhesiya, P. ; Lepko, T. ; Steiner‑Mezzardi, A. ; Schneider, J. ; Schwarz, V. ; Merl-Pham, J. ; Berger, F. ; Hauck, S.M. ; Ronfani, L. ; Bianchi, M.E. ; Simon, T. ; Krontira, A. ; Masserdotti, G. ; Götz, M. ; Ninkovic, J.

Hmgb2 improves astrocyte to neuron conversion by increasing the chromatin accessibility of genes associated with neuronal maturation in a proneuronal factor-dependent manner.
Prog. Retinal Eye Res. 106:101357 (2025)

Arrigo, A. ; Cremona, O. ; Aragona, E. ; Casoni, F. ; Consalez, G. ; Dogru, R.M. ; Hauck, S.M. ; Antropoli, A. ; Bianco, L. ; Parodi, M.B. ; Bandello, F. ; Grosche, A.

Müller cells trophism and pathology as the next therapeutic targets for retinal diseases.
Nat. Commun. 16:3750 (2025)

Tutino, M. ; Yu, N.Y.-L. ; Hatzikotoulas, K. ; Park, Y.-C. ; Kreitmaier, P. ; Katsoula, G. ; Berner, R. ; Casteels, K. ; Elding Larsson, H. ; Kordonouri, O. ; Ołtarzewski, M. ; Szypowska, A. ; Ott, R. ; Weiss, A. ; Winkler, C. ; Zapardiel-Gonzalo, J. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Bonifacio, E. ; Ziegler, A.-G. ; Zeggini, E.

Genetics of circulating proteins in newborn babies at high risk of type 1 diabetes.
J. Allergy Clin. Immunol. 156:339-351 (2025)

Abdel-Aziz, M.I. ; Hashimoto, S. ; Neerincx, A.H. ; Haarman, E.G. ; Cecil, A. ; Lintelmann, J. ; Witting, M. ; Hauck, S.M. ; Kerssemakers, N. ; Verster, J.C. ; Bang, C. ; Franke, A. ; Dierdorp, B.S. ; Dekker, T.J. ; Metwally, N.K.A. ; Duitman, J.W. ; Lutter, R. ; Gorenjak, M. ; Toncheva, A.A. ; Kheiroddin, P. ; Harner, S. ; Brandstetter, S. ; Wolff, C. ; Corcuera-Elosegui, P. ; López-Fernández, L. ; Perez-Garcia, J. ; Almeida, M.M. ; Sardón-Prado, O. ; Pino-Yanes, M. ; Potocnik, U. ; Kabesch, M. ; Vijverberg, S.J.H. ; Kraneveld, A.D. ; Maitland-van der Zee, A.H.

Metabotypes are linked to uncontrolled childhood asthma, gut microbiota, and systemic inflammation.
Alzheimers Dement. 21:e70040 (2025)

Wagemann, O. ; Nübling, G. ; Martínez-Murcia, F.J. ; Wlasich, E. ; Loosli, S.V. ; Sandkühler, K. ; Stockbauer, A. ; Prix, C. ; Katzdobler, S. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Fortea, J. ; Romero-Zaliz, R. ; Jiménez-Mesa, C. ; Górriz Sáez, J.M. ; Höglinger, G. ; Levin, J.

Exploratory analysis of the proteomic profile in plasma in adults with Down syndrome in the context of Alzheimer's disease.
Nat. Metab. 7, 435-437 (2025)

El Abiead, Y. ; Rutz, A. ; Zuffa, S. ; Amer, B. ; Xing, S. ; Brungs, C. ; Schmid, R. ; Correia, M.S.P. ; Caraballo-Rodriguez, A.M. ; Zarrinpar, A. ; Mannochio-Russo, H. ; Witting, M. ; Mohanty, I. ; Pluskal, T. ; Bittremieux, W. ; Knight, R. ; Patterson, A.D. ; van der Hooft, J.J.J. ; Böcker, S. ; Dunn, W.B. ; Linington, R.G. ; Wishart, D.S. ; Wolfender, J.L. ; Fiehn, O. ; Zamboni, N. ; Dorrestein, P.C.

Discovery of metabolites prevails amid in-source fragmentation.
Biomolecules 15:288 (2025)

Fleischer, A.B. ; Amann, B. ; von Toerne, C. ; Degroote, R.L. ; Schmalen, A. ; Weiser, T. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Differential expression of ARG1 and MRC2 in retinal Müller glial cells during autoimmune uveitis.
Metabolomics 21:29 (2025)

Witting, M. ; Salzer, L. ; Meyer, S.W. ; Barsch, A.

Phosphorylated glycosphingolipids are commonly detected in Caenorhabditis elegans lipidomes.
Nat. Commun. 16:1911 (2025)

Fischer, A. ; Han, W. ; Hu, S. ; Mück-Häusl, M. ; Wannemacher, J. ; Kadri, S. ; Lin, Y. ; Dai, R. ; Christ, S. ; Su, Y. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Deisenhofer, C. ; Dutta, S. ; Kadri, A. ; Güney, T.G. ; Correa-Gallegos, D. ; Mayr, C.H. ; Hatz, R. ; Stoleriu, M.G. ; Lindner, M. ; Hilgendorff, A. ; Adler, H. ; Machens, H.G. ; Schiller, H.B. ; Hauck, S.M. ; Rinkevich, Y.

Author Correction: Targeting pleuro-alveolar junctions reverses lung fibrosis in mice.
Nat. Commun. 16:3278 (2025)

Han, S. ; Yu, S. ; Shi, M. ; Harada, M. ; Ge, J. ; Lin, J. ; Prehn, C. ; Petrera, A. ; Li, Y. ; Sam, F. ; Matullo, G. ; Adamski, J. ; Suhre, K. ; Gieger, C. ; Hauck, S.M. ; Herder, C. ; Roden, M. ; Casale, F.P. ; Cai, N. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R.

LEOPARD: Missing view completion for multi-timepoint omics data via representation disentanglement and temporal knowledge transfer.
Nat. Commun. 16:173 (2025)

Fischer, A. ; Han, W. ; Hu, S. ; Mück-Häusl, M. ; Wannemacher, J. ; Kadri, S. ; Lin, Y. ; Dai, R. ; Christ, S. ; Su, Y. ; Dasgupta, B. ; Sardogan, A. ; Deisenhofer, C. ; Dutta, S. ; Kadri, A. ; Güney, T.G. ; Correa-Gallegos, D. ; Mayr, C.H. ; Hatz, R. ; Stoleriu, M.G. ; Lindner, M. ; Hilgendorff, A. ; Adler, H. ; Machens, H.G. ; Schiller, H.B. ; Hauck, S.M. ; Rinkevich, Y.

Targeting pleuro-alveolar junctions reverses lung fibrosis in mice.
J. Proteome Res. 24, 1017-1029 (2025)

Kardell, O. ; Gronauer, T.F. ; von Toerne, C. ; Merl-Pham, J. ; König, A.-C. ; Barth, T.K. ; Mergner, J. ; Ludwig, C. ; Tüshaus, J. ; Giesbertz, P. ; Breimann, S. ; Schweizer, L. ; Müller, T. ; Kliewer, G. ; Distler, U. ; Gomez-Zepeda, D. ; Popp, O. ; Qin, D. ; Teupser, D. ; Cox, J. ; Imhof, A. ; Küster, B. ; Lichtenthaler, S.F. ; Krijgsveld, J. ; Tenzer, S. ; Mertins, P. ; Coscia, F. ; Hauck, S.M.

Multicenter longitudinal quality assessment of MS-based proteomics in plasma and serum.
In: Metabolic Profiling. 2025. 67-89 (Methods Mol. Biol. ; 2891)

Witting, M. ; Rainer, J.

Bio- and chemoinformatic approaches for metabolomics data analysis.
Nat. Commun. 16:345 (2025)

Miranda-Cervantes, A. ; Fritzen, A.M. ; Raun, S.H. ; Hodek, O. ; Møller, L.L.V. ; Johann, K. ; Deisen, L. ; Gregorevic, P. ; Gudiksen, A. ; Artati, A. ; Adamski, J. ; Andersen, N.R. ; Sigvardsen, C.M. ; Carl, C.S. ; Voldstedlund, C.T. ; Kjøbsted, R. ; Hauck, S.M. ; Schjerling, P. ; Jensen, T.E. ; Cebrian Serrano, A. ; Jähnert, M. ; Gottmann, P. ; Burtscher, I. ; Lickert, H. ; Pilegaard, H. ; Schürmann, A. ; Tschöp, M.H. ; Moritz, T. ; Müller, T.D. ; Sylow, L. ; Kiens, B. ; Richter, E.A. ; Kleinert, M.

Pantothenate kinase 4 controls skeletal muscle substrate metabolism.
In: Clinical Metabolomics. 2025. 373-385 (Methods Mol. Biol. ; 2855)

Riols, F. ; Witting, M. ; Haid, M.

Differential mobility spectrometry-based cardiolipin analysis.
2024 in
In: Bio-Nano Interfaces: Perspectives, Properties, and Applications. 2024. 795-818

Johnston, B.D. ; Kreyling, W.G. ; Pfeiffer, C. ; Schäffler, M. ; Sarioglu, H. ; Ristig, S. ; Hirn, S. ; Haberl, N. ; Thalhammer, S. ; Hauck, S.M. ; Semmler-Behnke, M. ; Epple, M. ; Hühn, J. ; Pino, P.D. ; Parak, W.J.

Colloidal stability and surface chemistry are key factors for the composition of the protein corona of inorganic gold nanoparticles.
Obes. Facts 18, 121-129 (2024)

Ratter-Rieck, J.M. ; Zepina, A. ; Niersmann, C. ; Röhrig, K. ; Riols, F. ; Haid, M. ; Lintelmann, J. ; Hauck, S.M. ; Roden, M. ; Weigert, C. ; Herder, C.

Omentin increases glucose uptake, but not insulin sensitivity in human myotubes dependent on extracellular lactotransferrin.
Sci. Immunol. 9:eadl1467 (2024)

Bohnacker, S. ; Henkel, F. ; Hartung, F. ; Geerlof, A. ; Riemer, S. ; Prodjinotho, U.F. ; Salah, E.B. ; Mourao, A. ; Bohn, S. ; Teder, T. ; Thomas, D. ; Gurke, R. ; Böckel, C. ; Ud-Dean, M. ; König, A.-C. ; Quaranta, A. ; Alessandrini, F. ; Lechner, A. ; Spitzlberger, B. ; Kabat, A.M. ; Pearce, E.J. ; Haeggström, J.Z. ; Hauck, S.M. ; Wheelock, C.E. ; Jakobsson, P.J. ; Sattler, M. ; Voehringer, D. ; Feige, M.J. ; da Costa, C.P. ; Esser-von Bieren, J.

A helminth enzyme subverts macrophage-mediated immunity by epigenetic targeting of prostaglandin synthesis.
Biomark. Insights 19:11772719241274017 (2024)

Dietz, A. ; Subedi, P. ; Azimzadeh, O. ; Duchrow, L. ; Kaestle, F. ; Paetzold, J.C. ; Katharina Payer, S. ; Hornhardt, S. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Kempkes, B. ; Kuklik-Roos, C. ; Brandes, D. ; Borkhardt, A. ; Moertl, S. ; Gomolka, M.

The chromosome passenger complex (CPC) components and its associated pathways are promising candidates to differentiate between normosensitive and radiosensitive ATM-mutated cells.
J. Proteome Res. 23, 5279-5295 (2024)

Geyer, P.E. ; Hornburg, D. ; Pernemalm, M. ; Hauck, S.M. ; Palaniappan, K.K. ; Albrecht, V. ; Dagley, L.F. ; Moritz, R.L. ; Yu, X. ; Edfors, F. ; Vandenbrouck, Y. ; Mueller-Reif, J.B. ; Sun, Z. ; Brun, V. ; Ahadi, S. ; Omenn, G.S. ; Deutsch, E.W. ; Schwenk, J.M.

The circulating proteome─technological developments, current challenges, and future trends.
Cells 13:1563 (2024)

Kellner, M. ; Hörmann, J. ; Fackler, S. ; Hu, Y. ; Zhou, T. ; Lu, L. ; Ilik, I. ; Aktas, T. ; Feederle, R. ; Hauck, S.M. ; Gires, O. ; Gärtner, K. ; Li, L. ; Zeidler, R.

The nuclear speckles protein SRRM2 is exposed on the surface of cancer cells.
Atherosclerosis 398:118613 (2024)

Garcia, T. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Baber, R. ; Wirkner, K. ; Kirsten, H. ; Pott, J. ; Tönjes, A. ; Henger, S. ; Loeffler, M. ; Peters, A. ; Scholz, M.

Relationship of proteins and subclinical cardiovascular traits in the population-based LIFE-Adult study.
Sci. Rep. 14:21864 (2024)

Juhász, B. ; Horváth, K. ; Kuti, D. ; Shen, J. ; Feuchtinger, A. ; Zhang, C.-Y. ; Bata-Vidács, I. ; Nagy, I. ; Kukolya, J. ; Witting, M. ; Baranyi, M. ; Ferenczi, S. ; Walch, A.K. ; Sun, N. ; Kovács, K.J.

Dipeptide metabolite, glutamyl-glutamate mediates microbe-host interaction to boost spermatogenesis.
Nat. Commun. 15:7511 (2024)

Kofler, L. ; Grundmann, L. ; Gerhalter, M. ; Prattes, M. ; Merl-Pham, J. ; Zisser, G. ; Grishkovskaya, I. ; Hodirnau, V.V. ; Vareka, M. ; Breinbauer, R. ; Hauck, S.M. ; Haselbach, D. ; Bergler, H.

The novel ribosome biogenesis inhibitor usnic acid blocks nucleolar pre-60S maturation.
BMC Med. 22:420 (2024)

Luo, H. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Rathmann, W. ; Herder, C. ; Gieger, C. ; Hoyer, A. ; Peters, A. ; Thorand, B.

Association of plasma proteomics with mortality in individuals with and without type 2 diabetes: Results from two population-based KORA cohort studies.
Proteomics, DOI: 10.1002/pmic.202300591:e2300591 (2024)

Degroote, R.L. ; Schmalen, A. ; Renner, S. ; Wolf, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Diabetic retinopathy from the vitreous proteome perspective: The INSC94Y transgenic pig model study.
J. Neuroinflamm. 21:190 (2024)

Ayten, M. ; Straub, T. ; Kaplan, L. ; Hauck, S.M. ; Grosche, A. ; Koch, S.F.

CD44 signaling in Müller cells impacts photoreceptor function and survival in healthy and diseased retinas.
Mol. Metab. 88:101994 (2024)

Ayten, M. ; Díaz-Lezama, N. ; Ghanawi, H. ; Haffelder, F.C. ; Kajtna, J. ; Straub, T. ; Borsò, M. ; Imhof, A. ; Hauck, S.M. ; Koch, S.F.

Metabolic plasticity in a Pde6bSTOP/STOP retinitis pigmentosa mouse model following rescue.

Fontes, A. ; Pierson, H. ; Bierła, J.B. ; Eberhagen, C. ; Kinschel, J. ; Akdogan, B. ; Rieder, T. ; Sailer, J. ; Reinold, Q. ; Cielecka-Kuszyk, J. ; Szymanska, S. ; Neff, F. ; Steiger, K. ; Seelbach, O. ; Zibert, A. ; Schmidt, H.H. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Michalke, B. ; Semrau, J.D. ; DiSpirito, A.M. ; Ramalho-Santos, J. ; Kroemer, G. ; Polishchuk, R.S. ; Azul, A.M. ; DiSpirito, A. ; Socha, P. ; Lutsenko, S. ; Zischka, H.

Copper impairs the intestinal barrier integrity in Wilson disease.
Anal. Sci. Adv. 5:e2400002 (2024)

Couacault, P. ; Avella, D. ; Londoño-Osorio, S. ; Lorenzo, A.S. ; Gradillas, A. ; Kärkkäinen, O. ; Want, E. ; Witting, M.

Targeted and untargeted metabolomics and lipidomics in dried blood microsampling: Recent applications and perspectives.
Am. J. Physiol.-Cell Physiol. 326, C1462-C1481 (2024)

Dreher, S.I. ; Grubba, P. ; von Toerne, C. ; Moruzzi, A. ; Maurer, J. ; Goj, T. ; Birkenfeld, A.L. ; Peter, A. ; Loskill, P. ; Hauck, S.M. ; Weigert, C.

IGF1 promotes human myotube differentiation toward a mature metabolic and contractile phenotype.
Cell Death Dis. 15:286 (2024)

Peng, H. ; Xin, S. ; Pfeiffer, S. ; Müller, C. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Harter, P.N. ; Spitzer, D. ; Devraj, K. ; Varynskyi, B. ; Arzberger, T. ; Momma, S. ; Schick, J.A.

Fatty acid-binding protein 5 is a functional biomarker and indicator of ferroptosis in cerebral hypoxia.
Metabolites 14:215 (2024)

Duda, H.C. ; von Toerne, C. ; Korbonits, L. ; Didier, A. ; Scholz, A.M. ; Märtlbauer, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Cathepsin S is more abundant in serum of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis-Infected dairy cows.
Nature 628:E6 (2024)

Lukauskas, S. ; Tvardovskiy, A. ; Nguyen, N.V. ; Stadler, M. ; Faull, P. ; Ravnsborg, T. ; Özdemir Aygenli, B. ; Dornauer, S. ; Flynn, H. ; Lindeboom, R.G.H. ; Barth, T.K. ; Brockers, K. ; Hauck, S.M. ; Vermeulen, M. ; Snijders, A.P. ; Müller, C.L. ; DiMaggio, P.A. ; Jensen, O.N. ; Schneider, R. ; Bartke, T.

Publisher Correction: Decoding chromatin states by proteomic profiling of nucleosome readers.
Immun. Ageing 21:23 (2024)

Trares, K. ; Wiesenfarth, M. ; Stocker, H. ; Perna, L. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Beyreuther, K. ; Brenner, H. ; Schöttker, B.

Addition of inflammation-related biomarkers to the CAIDE model for risk prediction of all-cause dementia, Alzheimer's disease and vascular dementia in a prospective study.
RNA 30, 807-823 (2024)

Gerhalter, M. ; Kofler, L. ; Zisser, G. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Bergler, H.

The novel pre-rRNA detection workflow "Riboprobing" allows simple identification of undescribed RNA species.
iScience 27:109789 (2024)

Giovannetti, M. ; Rodríguez-Palero, M.J. ; Fabrizio, P. ; Nicolle, O. ; Bedet, C. ; Michaux, G. ; Witting, M. ; Artal-Sanz, M. ; Palladino, F.

SIN-3 transcriptional coregulator maintains mitochondrial homeostasis and polyamine flux.
Cell Rep. 43:114008 (2024)

Marder, M. ; Remmert, C. ; Perschel, J.A. ; Otgonbayar, M. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Bushe, J. ; Feuchtinger, A. ; Sheikh, B. ; Moussus, M. ; Meier, M.

Stem cell-derived vessels-on-chip for cardiovascular disease modeling.
Nature 627, 671-679 (2024)

Lukauskas, S. ; Tvardovskiy, A. ; Nguyen, N.V. ; Stadler, M. ; Faull, P. ; Ravnsborg, T. ; Özdemir Aygenli, B. ; Dornauer, S. ; Flynn, H. ; Lindeboom, R.G.H. ; Barth, T.K. ; Brockers, K. ; Hauck, S.M. ; Vermeulen, M. ; Snijders, A.P. ; Müller, C.L. ; DiMaggio, P.A. ; Jensen, O.N. ; Schneider, R. ; Bartke, T.

Decoding chromatin states by proteomic profiling of nucleosome readers.
Hypertension 81, 1156-1166 (2024)

Lin, J. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Müller, C.L. ; Peters, A. ; Thorand, B.

Associations of proteomics with hypertension and systolic blood pressure: KORA S4/F4/FF4 and KORA-Age1/Age2 Cohort Studies.
Nat. Methods 21, 153–155 (2024)

Kretschmer, F. ; Harrieder, E.-M. ; Hoffmann, M.A. ; Böcker, S. ; Witting, M.

RepoRT: A comprehensive repository for small molecule retention times.
Biol. Sex Differ. 15:26 (2024)

Pott, J. ; Kheirkhah, A. ; Gådin, J.R. ; Kleber, M.E. ; Delgado, G.E. ; Kirsten, H. ; Forer, L. ; Hauck, S.M. ; Burkhardt, R. ; Scharnagl, H. ; Loeffler, M. ; März, W. ; Thiery, J. ; Gieger, C. ; Peters, A. ; Silveira, A. ; Hooft, F.V. ; Kronenberg, F. ; Scholz, M.

Sex and statin-related genetic associations at the PCSK9 gene locus: Results of genome-wide association meta-analysis.
Cardiovasc. Diabetol. 23:53 (2024)

Luo, H. ; Huemer, M.-T. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Rathmann, W. ; Herder, C. ; Koenig, W. ; Hoyer, A. ; Peters, A. ; Thorand, B.

Association of plasma proteomics with incident coronary heart disease in individuals with and without type 2 diabetes: Results from the population-based KORA study.
Thorax 79, 524-537 (2024)

Stoleriu, M.-G. ; Ansari, M. ; Strunz, M. ; Schamberger, A.C. ; Heydarian, M. ; Ding, Y. ; Voss, C. ; Schneider, J.J. ; Gerckens, M. ; Burgstaller, G. ; Castelblanco, A. ; Kauke, T. ; Fertmann, J. ; Schneider, C. ; Behr, J. ; Lindner, M. ; Stacher-Priehse, E. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Eickelberg, O. ; Schubert, B. ; Hauck, S.M. ; Schmid, O. ; Hatz, R.A. ; Stöger, T. ; Schiller, H. ; Hilgendorff, A.

COPD basal cells are primed towards secretory to multiciliated cell imbalance driving increased resilience to environmental stressors.
J. Neuroinflamm. 21:33 (2024)

Pfaller, A.M. ; Kaplan, L. ; Moreira Carido Pereira, M. ; Grassmann, F. ; Díaz-Lezama, N. ; Ghaseminejad, F. ; Wunderlich, K.A. ; Glänzer, S. ; Bludau, O. ; Pannicke, T. ; Weber, B.H.F. ; Koch, S.F. ; Bonev, B. ; Hauck, S.M. ; Grosche, A.

The glucocorticoid receptor as a master regulator of the Müller cell response to diabetic conditions in mice.
Metabolomics 20:15 (2024)

Witting, M. ; Malik, A. ; Leach, A. ; Bridge, A. ; Aimo, L. ; Conroy, M.J. ; O'Donnell, V.B. ; Hoffmann, N. ; Kopczynski, D. ; Giacomoni, F. ; Paulhe, N. ; Gassiot, A.C. ; Poupin, N. ; Jourdan, F. ; Bertrand-Michel, J.

Challenges and perspectives for naming lipids in the context of lipidomics.
Anal. Chem. 95, 17550–17558 (2023)

Salzer, L. ; Novoa-del-Toro, E.M. ; Frainay, C. ; Kissoyan, K.A.B. ; Jourdan, F. ; Dierking, K. ; Witting, M.

APEX: An annotation propagation workflow through multiple experimental networks to improve the annotation of new metabolite classes in Caenorhabditis elegans.
Nat. Med. 29, 3149–3161 (2023)

Sirko, S. ; Schichor, C. ; Della Vecchia, P. ; Metzger, F. ; Sonsalla, G. ; Simon, T. ; Bürkle, M. ; Kalpazidou, S. ; Ninkovic, J. ; Masserdotti, G. ; Sauniere, J.F. ; Iacobelli, V. ; Iacobelli, S. ; Delbridge, C. ; Hauck, S.M. ; Tonn, J.C. ; Götz, M.

Injury-specific factors in the cerebrospinal fluid regulate astrocyte plasticity in the human brain.
J. Proteome Res. 23, 117-129 (2023)

Kardell, O. ; von Toerne, C. ; Merl-Pham, J. ; König, A.-C. ; Blindert, M. ; Barth, T.K. ; Mergner, J. ; Ludwig, C. ; Tüshaus, J. ; Eckert, S. ; Müller, S.A. ; Breimann, S. ; Giesbertz, P. ; Bernhardt, A.M.J. ; Schweizer, L. ; Albrecht, V. ; Teupser, D. ; Imhof, A. ; Kuster, B. ; Lichtenthaler, S.F. ; Mann, M. ; Cox, J. ; Hauck, S.M.

Multicenter collaborative study to optimize mass spectrometry workflows of clinical specimens.
Metabolites 13:24 (2023)

de Sá E Silva, D.M. ; Thaitumu, M. ; Theodoridis, G. ; Witting, M. ; Gika, H.

Volumetric absorptive microsampling in the analysis of endogenous metabolites.
Biomolecules 13:18 (2023)

Schmalen, A. ; Kammerl, I.E. ; Meiners, S. ; Nößner, E. ; Deeg , C.A. ; Hauck, S.M.

A lysine residue at the C-terminus of MHC class I ligands correlates with low C-terminal proteasomal cleavage probability.
Nucleic Acids Res. 51, 8691-8710 (2023)

Witzenberger, M. ; Burczyk, S. ; Settele, D. ; Mayer, W. ; Welp, L.M. ; Heiss, M. ; Wagner, M. ; Monecke, T. ; Janowski, R. ; Carell, T. ; Urlaub, H. ; Hauck, S.M. ; Voigt, A. ; Niessing, D.

Human TRMT2A methylates tRNA and contributes to translation fidelity.
Front. Cell Dev. Biol. 11:1240039 (2023)

Bilekova, S. ; Garcia-Colomer, B. ; Cebrian Serrano, A. ; Schirge, S. ; Krey, K. ; Sterr, M. ; Kurth, T. ; Hauck, S.M. ; Lickert, H.

Inceptor facilitates acrosomal vesicle formation in spermatids and is required for male fertility.

Chen, J. ; Wang, X. ; Schmalen, A. ; Haines, S. ; Wolff, M. ; Ma, H. ; Zhang, H. ; Stoleriu, M.-G. ; Nowak, J. ; Nakayama, M. ; Bueno, M. ; Brands, J. ; Mora, A.L. ; Lee, J.S. ; Krauss-Etschmann, S. ; Dmitrieva, A. ; Frankenberger, M. ; Hofer, T.P. ; Nößner, E. ; Moosmann, A. ; Behr, J. ; Milger, K. ; Deeg, C.A. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Hauck, S.M. ; Adler, H. ; Goldmann, T. ; Gaede, K.I. ; Behrends, J. ; Kammerl, I.E. ; Meiners, S.

Antiviral CD8+T-cell immune responses are impaired by cigarette smoke and in COPD.
BMC Med. 21:245 (2023)

Lin, J. ; Nano, J. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Zeller, T. ; Koenig, W. ; Müller, C.L. ; Peters, A. ; Thorand, B.

Proteomic profiling of longitudinal changes in kidney function among middle-aged and older men and women: The KORA S4/F4/FF4 study.
Front. Oncol. 13:1180642 (2023)

Subedi, P. ; Huber, K. ; Sterr, C. ; Dietz, A. ; Strasser, L. ; Kaestle, F. ; Hauck, S.M. ; Duchrow, L. ; Aldrian, C. ; Monroy Ordonez, E.B. ; Luka, B. ; Thomsen, A.R. ; Henke, M. ; Gomolka, M. ; Rößler, U. ; Azimzadeh, O. ; Moertl, S. ; Hornhardt, S.

Towards unravelling biological mechanisms behind radiation-induced oral mucositis via mass spectrometry-based proteomics.
Cancers 15:23 (2023)

Spella, M. ; Ntaliarda, G. ; Skiadas, G. ; Lamort, A.-S. ; Vreka, M. ; Marazioti, A. ; Lilis, I. ; Bouloukou, E. ; Giotopoulou, G.A. ; Pepe, M. ; Weiss, S.A. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Koch, I. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Arendt, K.A.M. ; Giopanou, I. ; Brunn, D. ; Savai, R. ; Jenne, D. ; de Château, M. ; Yull, F.E. ; Blackwell, T.S. ; Stathopoulos, G.T.

Non-oncogene addiction of KRAS-mutant cancers to IL-1β via versican and mononuclear IKKβ.
Diabetologia 66, 1655-1668 (2023)

Luo, H. ; Bauer, A. ; Nano, J. ; Petrera, A. ; Rathmann, W. ; Herder, C. ; Hauck, S.M. ; Sun, B.B. ; Hoyer, A. ; Peters, A. ; Thorand, B.

Associations of plasma proteomics with type 2 diabetes and related traits: Results from the longitudinal KORA S4/F4/FF4 Study.
J. Allergy Clin. Immunol. 152, 610-621 (2023)

Marques Dos Santos, M. ; Pivniouk, V. ; Rankl, B. ; Walker, A. ; Pagani, G. ; Hertkorn, N. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Müller, C. ; Bracher, F. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Schloter, M. ; Michael, A.N. ; Anderson, D. ; Honeker, L. ; Gozdz, J. ; Pivniouk, O. ; Ober, C. ; Holbreich, M. ; Martinez, F.D. ; Snyder, S.A. ; von Mutius, E. ; Vercelli, D.

Asthma-protective agents in dust from traditional farm environments.
Front. Immunol. 14:1128239 (2023)

Kastlmeier, M.T. ; Gonzalez-Rodriguez, E. ; Cabanis , P. ; Günther, E. ; König, A.-C. ; Han, L. ; Hauck, S.M. ; See, F. ; Asgharpour, S. ; Bukas, C. ; Burgstaller, G. ; Piraud, M. ; Lehmann, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Stöger, T. ; Hilgendorff, A. ; Voss, C.

Cytokine signaling converging on IL11 in ILD fibroblasts provokes aberrant epithelial differentiation signatures.
Biomolecules 13:24 (2023)

Schilloks, M.C. ; Giese, I.M. ; Hinrichs, A. ; Korbonits, L. ; Hauck, S.M. ; Wolf, E. ; Deeg, C.A.

Effects of GHR deficiency and juvenile hypoglycemia on immune cells of a porcine model for Laron syndrome.

Hartl, N. ; Jürgens, D.C. ; Carneiro, S. ; König, A.-C. ; Xiao, X. ; Liu, R. ; Hauck, S.M. ; Merkel, O.M.

Protein corona investigations of polyplexes with varying hydrophobicity - From method development to in vitro studies.
J. Control. Release 360, 613-629 (2023)

Hartl, N. ; Gabold, B. ; Adams, F. ; Uhl, P. ; Oerter, S. ; Gätzner, S. ; Metzger, M. ; König, A.-C. ; Hauck, S.M. ; Appelt-Menzel, A. ; Mier, W. ; Fricker, G. ; Merkel, O.M.

Overcoming the blood-brain barrier? - prediction of blood-brain permeability of hydrophobically modified polyethylenimine polyplexes for siRNA delivery into the brain with in vitro and in vivo models.
J. Proteome Res. 22, 837–850 (2023)

Blume, B. ; Schwantes, V. ; Witting, M. ; Hayen, H. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Helmer, P.O. ; Michalke, B.

Lipidomic and metallomic alteration of Caenorhabditis elegans after acute and chronic manganese, iron and zinc exposure with link to neurodegenerative disorders. 
Mol. Neurodegener. 18:15 (2023)

Todorova, V. ; Stauffacher, M.F. ; Ravotto, L. ; Nötzli, S. ; Karademir, D. ; Ebner, L.J.A. ; Imsand, C. ; Merolla, L. ; Hauck, S.M. ; Samardzija, M. ; Saab, A.S. ; Barros, L.F. ; Weber, B. ; Grimm, C.

Deficits in mitochondrial TCA cycle and OXPHOS precede rod photoreceptor degeneration during chronic HIF activation.
EBioMedicine 89:104456 (2023)

Bernhardt, A.M. ; Tiedt, S. ; Teupser, D. ; Dichgans, M. ; Meyer, B. ; Gempt, J. ; Kuhn, P.H. ; Simons, M. ; Palleis, C. ; Weidinger, E. ; Nübling, G. ; Holdt, L. ; Hönikl, L. ; Gasperi, C. ; Giesbertz, P. ; Müller, S.A. ; Breimann, S. ; Lichtenthaler, S.F. ; Kuster, B. ; Mann, M. ; Imhof, A. ; Barth, T. ; Hauck, S.M. ; Zetterberg, H. ; Otto, M. ; Weichert, W. ; Hemmer, B. ; Levin, J.

A unified classification approach rating clinical utility of protein biomarkers across neurologic diseases.
Nat. Commun. 14:709 (2023)

Kulaj, K. ; Harger, A. ; Bauer, M. ; Caliskan, Ö.S. ; Gupta, T.K. ; Chiang, D.M. ; Milbank, E. ; Reber, J. ; Karlas, A. ; Kotzbeck, P. ; Sailer, D.N. ; Volta, F. ; Lutter, D. ; Prakash, S. ; Merl-Pham, J. ; Ntziachristos, V. ; Hauner, H. ; Pfaffl, M.W. ; Tschöp, M.H. ; Müller, T.D. ; Hauck, S.M. ; Engel, B.D. ; Gerdes, J.M. ; Pfluger, P.T. ; Krahmer, N. ; Stemmer, K.

Adipocyte-derived extracellular vesicles increase insulin secretion through transport of insulinotropic protein cargo.
Front. Microbiol. 13:957830 (2023)

Nakayama, M. ; Marchi, H. ; Dmitrieva, A. ; Chakraborty, A. ; Merl-Pham, J. ; Hennen, E. ; Le Gleut, R. ; Ruppert, C. ; Guenther, A. ; Kahnert, K. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Hauck, S.M. ; Adler, H. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Quantitative proteomics of differentiated primary bronchial epithelial cells from chronic obstructive pulmonary disease and control identifies potential novel host factors post-influenza A virus infection.
PLoS ONE 18:e0280399 (2023)

Ha, C.S.R. ; Müller-Nurasyid, M. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Marini, F. ; Bartsch, D.K. ; Slater, E.P. ; Strauch, K.

Proteomics biomarker discovery for individualized prevention of familial pancreatic cancer using statistical learning.
Cell Rep. 42:112045 (2023)

Weiß, M. ; Chanou, A. ; Schauer, T. ; Tvardovskiy, A. ; Meiser, S. ; König, A.-C. ; Schmidt, T. ; Kruse, E. ; Ummethum, H. ; Trauner, M. ; Werner, M. ; Lalonde, M. ; Hauck, S.M. ; Scialdone, A. ; Hamperl, S.

Single-copy locus proteomics of early- and late-firing DNA replication origins identifies a role of Ask1/DASH complex in replication timing control.
Nucleic Acids Res. 51, 1297-1316 (2023)

Molitor, L. ; Klostermann, M. ; Bacher, S. ; Merl-Pham, J. ; Spranger, N. ; Burczyk, S. ; Ketteler, C. ; Rusha, E. ; Tews, D. ; Pertek, A. ; Proske, M. ; Busch, A. ; Reschke, S. ; Feederle, R. ; Hauck, S.M. ; Blum, H. ; Drukker, M. ; Fischer-Posovszky, P. ; König, J. ; Zarnack, K. ; Niessing, D.

Depletion of the RNA-binding protein PURA triggers changes in posttranscriptional gene regulation and loss of P-bodies.
Glia 71, 391-414 (2023)

Kaplan, L. ; Drexler, C.G. ; Pfaller, A.M. ; Brenna, S. ; Wunderlich, K.A. ; Dimitracopoulos, A. ; Merl-Pham, J. ; Perez, M.T. ; Schlötzer-Schrehardt, U. ; Enzmann, V. ; Samardzija, M. ; Puig, B. ; Fuchs, P. ; Franze, K. ; Hauck, S.M. ; Grosche, A.

Retinal regions shape human and murine Müller cell proteome profile and functionality.
Pediatr. Res. 93, 625-632 (2023)

Kindt, A. ; Förster, K. ; Cochius-den Otter, S.C.M. ; Flemmer, A.W. ; Hauck, S.M. ; Flatley, A. ; Kamphuis, J. ; Karrasch, S. ; Behr, J. ; Franz, A. ; Härtel, C. ; Krumsiek, J. ; Tibboel, D. ; Hilgendorff, A.

Validation of disease-specific biomarkers for the early detection of bronchopulmonary dysplasia.
Cell Rep. 41:111867 (2022)

Rehman, R. ; Miller, M. ; Krishnamurthy, S.S. ; Kjell, J. ; Elsayed, L. ; Hauck, S.M. ; olde Heuvel, F. ; Conquest, A. ; Chandrasekar, A. ; Ludolph, A. ; Boeckers, T. ; Mulaw, M.A. ; Götz, M. ; Morganti-Kossmann, M.C. ; Takeoka, A. ; Roselli, F.

Met/HGFR triggers detrimental reactive microglia in TBI.
Metabolomics 18:106 (2022)

Winder, C.L. ; Witting, M. ; Tugizimana, F. ; Dunn, W.B. ; Reinke, S.N.

Providing metabolomics education and training: Pedagogy and considerations.
Cell Rep. 41:111761 (2022)

Orth, M.F. ; Surdez, D. ; Faehling, T. ; Ehlers, A.C. ; Marchetto, A. ; Grossetete, S. ; Volckmann, R. ; Zwijnenburg, D.A. ; Gerke, J.S. ; Zaidi, S. ; Alonso, J. ; Sastre, A. ; Baulande, S. ; Sill, M. ; Cidre-Aranaz, F. ; Ohmura, S. ; Kirchner, T. ; Hauck, S.M. ; Reischl, E. ; Gymrek, M. ; Pfister, S.M. ; Strauch, K. ; Koster, J. ; Delattre, O. ; Grunewald, T.G.P.

Systematic multi-omics cell line profiling uncovers principles of Ewing sarcoma fusion oncogene-mediated gene regulation.
Diabetologia 66, 579-589 (2022)

Maalmi, H. ; Strom, A. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Strassburger, K. ; Kuss, O. ; Zaharia, O.P. ; Bönhof, G.J. ; Rathmann, W. ; Trenkamp, S. ; Burkart, V. ; Szendroedi, J. ; Ziegler, D. ; Roden, M. ; Herder, C.

Serum neurofilament light chain: A novel biomarker for early diabetic sensorimotor polyneuropathy.
Metabolomics 18:97 (2022)

Harrieder, E.-M. ; Kretschmer, F. ; Dunn, W. ; Böcker, S. ; Witting, M.

Critical assessment of chromatographic metadata in publicly available metabolomics data repositories.
Biochim. Biophys. Acta-Mol. Basis Dis. 1869:166592 (2022)

Bauer, A. ; Pachl, E. ; Hellmuth, J.C. ; Kneidinger, N. ; Heydarian, M. ; Frankenberger, M. ; Stubbe, H.C. ; Ryffel, B. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Behr, J. ; Kaiser, R. ; Scherer, C. ; Deng, L. ; Teupser, D. ; Ahmidi, N. ; Muenchhoff, M. ; Schubert, B. ; Hilgendorff, A.

Proteomics reveals antiviral host response and NETosis during acute COVID-19 in high-risk patients.
J. Clin. Endocrinol. Metab. 108, 865-875 (2022)

Goj, T. ; Hoene, M. ; Fritsche, L. ; Schneeweiss, P. ; Machann, J. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Fritsche, A. ; Birkenfeld, A.L. ; Peter, A. ; Niess, A.M. ; Moller, A. ; Weigert, C.

The acute cytokine response to 30 min exercise bouts before and after 8-week endurance training in subjects with obesity.
J. Extra. Vesicles 11:e12254 (2022)

Demais, V. ; Pohl, A. ; Wunderlich, K.A. ; Pfaller, A.M. ; Kaplan, L. ; Barthélémy, A. ; Dittrich, R. ; Puig, B. ; Giebel, B. ; Hauck, S.M. ; Pfrieger, F.W. ; Grosche, A.

Release of VAMP5-positive extracellular vesicles by retinal Müller glia in vivo.
Alzheimers Res. Ther. 14:128 (2022)

Trares, K. ; Bhardwaj, M. ; Perna, L. ; Stocker, H.R. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Beyreuther, K. ; Brenner, H. ; Schöttker, B.

Association of the inflammation-related proteome with dementia development at older age: Results from a large, prospective, population-based cohort study.
Metabolomics 18:70 (2022)

Kirwan, J.A. ; Gika, H.G. ; Beger, R.D. ; Bearden, D. ; Dunn, W.B. ; Goodacre, R. ; Theodoridis, G. ; Witting, M. ; Yu, L.R. ; Wilson, I.D.

Quality assurance and quality control reporting in untargeted metabolic phenotyping: mQACC recommendations for analytical quality management.
Metabolites 12:924 (2022)

Korbonits, L. ; Kleinwort, K.J.H. ; Amann, B. ; Didier, A. ; Märtlbauer, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis infected cows reveal divergent immune response in bovine peripheral blood derived lymphocyte proteome.
Bioinformatics 38, 4044-4045 (2022)

Salzer, L. ; Witting, M. ; Schmitt-Kopplin, P.

MobilityTransformR: An R package for effective mobility transformation of CE-MS data.
Lab Chip 22, 3172-3186 (2022)

Compera, N. ; Atwell, S. ; Wirth, J. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Meier, M.

Adipose microtissue-on-chip: A 3D cell culture platform for differentiation, stimulation, and proteomic analysis of human adipocytes.
Clin. Nutr. 41, 1818-1826 (2022)

Huemer, M.-T. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Drey, M. ; Peters, A. ; Thorand, B.

Proteomics of the phase angle: Results from the population-based KORA S4 study.
Mol. Metab. 61:101508 (2022)

Wang, J. ; Onogi, Y. ; Krueger, M. ; Oeckl, J. ; Karlina, R. ; Singh, I. ; Hauck, S.M. ; Feederle, R. ; Li, Y. ; Ussar, S.

PAT2 regulates vATPase assembly and lysosomal acidification in brown adipocytes.
Nat. Metab. 4, 1086–1088 (2022)

McDonald, J.G. ; Ejsing, C.S. ; Kopczynski, D. ; Holcapek, M. ; Aoki, J. ; Arita, M. ; Baker, E.S. ; Bertrand-Michel, J. ; Bowden, J.A. ; Brügger, B. ; Ellis, S.R. ; Fedorova, M. ; Griffiths, W.J. ; Han, X. ; Hartler, J. ; Hoffmann, N. ; Koelmel, J.P. ; Köfeler, H.C. ; Mitchell, T.W. ; O'Donnell, V.B. ; Saigusa, D. ; Schwudke, D. ; Shevchenko, A. ; Ulmer, C.Z. ; Wenk, M.R. ; Witting, M. ; Wolrab, D. ; Xia, Y. ; Ahrends, R. ; Liebisch, G. ; Ekroos, K.

Introducing the lipidomics minimal reporting checklist.
Front. Mol. Biosci. 9:841373 (2022)

Amara, A. ; Frainay, C. ; Jourdan, F. ; Naake, T. ; Neumann, S. ; Novoa-del-Toro, E.M. ; Salek, R.M. ; Salzer, L. ; Scharfenberg, S. ; Witting, M.

Networks and graphs discovery in metabolomics data analysis and interpretation.
Front. Immunol. 13:895519 (2022)

Zauhar, R. ; Biber, J. ; Jabri, Y. ; Kim, M. ; Hu, J. ; Kaplan, L. ; Pfaller, A.M. ; Schaefer, N. ; Enzmann, V. ; Schloetzer-Schrehardt, U. ; Straub, T. ; Hauck, S.M. ; Gamlin, P.D. ; McFerrin, M.B. ; Messinger, J. ; Strang, C.E. ; Curcio, C.A. ; Dana, N. ; Pauly, D. ; Grosche, A. ; Li, M. ; Stambolian, D.

As in real estate, location matters: Cellular expression of complement varies between macular and peripheral regions of the retina and supporting Tissues.
Science 376:eabf9088 (2022)

O'Neill, A.C. ; Uzbas, F. ; Antognolli, G. ; Merino, F.L. ; Draganova, K. ; Jäck, A. ; Zhang, S. ; Pedini, G. ; Schessner, J.P. ; Cramer, K. ; Schepers, A. ; Metzger, F. ; Esgleas Izquierdo, M. ; Smialowski, P. ; Guerrini, R. ; Falk, S. ; Feederle, R. ; Freytag, S. ; Wang, Z. ; Bahlo, M. ; Jungmann, R. ; Bagni, C. ; Borner, G.H.H. ; Robertson, S.P. ; Hauck, S.M. ; Götz, M.

Spatial centrosome proteome of human neural cells uncovers disease-relevant heterogeneity.
Sci. Adv. 8:eabg9287 (2022)

Thomas, J. ; Martinez-Reza, M.F. ; Thorwirth, M. ; Zarb, Y. ; Conzelmann, K.K. ; Hauck, S.M. ; Grade, S. ; Götz, M.

Excessive local host-graft connectivity in aging and amyloid-loaded brain.
Sci. Adv. 8:eabg9445 (2022)

Grade, S. ; Thomas, J. ; Zarb, Y. ; Thorwirth, M. ; Conzelmann, K.K. ; Hauck, S.M. ; Götz, M.

Brain injury environment critically influences the connectivity of transplanted neurons.
Metabolites 12:173 (2022)

Rainer, J. ; Vicini, A. ; Salzer, L. ; Stanstrup, J. ; Badia, J.M. ; Neumann, S. ; Stravs, M.A. ; Hernandes, V.V. ; Gatto, L. ; Gibb, S. ; Witting, M.

A modular and expandable ecosystem for metabolomics data annotation in R.
Proteomes 10:7 (2022)

Kleinwort, K.J.H. ; Degroote, R.L. ; Hirmer, S. ; Korbonits, L. ; Lorenz, L. ; Scholz, A.M. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Bovine peripheral blood derived lymphocyte proteome and secretome show divergent reaction of bovine immune phenotypes after stimulation with Pokeweed mitogen.
Metabolites 12:254 (2022)

Kleinwort, K.J.H. ; Weigand, M. ; Hoffmann, L. ; Degroote, R.L. ; Dietrich, R. ; Maertlbauer, E.P. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Pudding proteomics: Cyclomaltodextrin glucanotransferase and microbial proteases can liquefy extended shelf life dairy products.

Mukama, T. ; Fortner, R.T. ; Katzke, V. ; Hynes, L.C. ; Petrera, A. ; Hauck, S.M. ; Johnson, T. ; Schulze, M. ; Schiborn, C. ; Rostgaard-Hansen, A.L. ; Tjønneland, A. ; Overvad, K. ; Pérez, M.J.S. ; Crous-Bou, M. ; Chirlaque, M.D. ; Amiano, P. ; Ardanaz, E. ; Watts, E.L. ; Travis, R.C. ; Sacerdote, C. ; Grioni, S. ; Masala, G. ; Signoriello, S. ; Tumino, R. ; Gram, I.T. ; Sandanger, T.M. ; Sartor, H. ; Lundin, E. ; Idahl, A. ; Heath, A.K. ; Dossus, L. ; Weiderpass, E. ; Kaaks, R.

Prospective evaluation of 92 serum protein biomarkers for early detection of ovarian cancer.
PLoS ONE 17:e0268815 (2022)

Pott, J. ; Garcia, T. ; Hauck, S.M. ; Petrera, A. ; Wirkner, K. ; Loeffler, M. ; Kirsten, H. ; Peters, A. ; Scholz, M.

Genetically regulated gene expression and proteins revealed discordant effects.
Nat. Metab. 4, 190-202 (2022)

Maqdasy, S. ; Lecoutre, S. ; Renzi, G. ; Frendo-Cumbo, S. ; Rizo-Roca, D. ; Moritz, T. ; Juvany, M. ; Hodek, O. ; Gao, H. ; Couchet, M. ; Witting, M. ; Kerr, A. ; Bergo, M.O. ; Choudhury, R.P. ; Aouadi, M. ; Zierath, J.R. ; Krook, A. ; Mejhert, N. ; Rydén, M.

Impaired phosphocreatine metabolism in white adipocytes promotes inflammation.
Nat. Commun. 13:1347 (2022)

Alka, O. ; Shanthamoorthy, P. ; Witting, M. ; Kleigrewe, K. ; Kohlbacher, O. ; Röst, H.L.

DIAMetAlyzer allows automated false-discovery rate-controlled analysis for data-independent acquisition in metabolomics.
Nat. Immunol. 23, 518-531 (2022)

Fischer, A. ; Wannemacher, J. ; Christ, S. ; Koopmans, T. ; Kadri, S. ; Zhao, J. ; Gouda, M. ; Ye, H. ; Mück-Häusl, M. ; Krenn, P.W. ; Machens, H. ; Faessler, R. ; Neumann, P. ; Hauck, S.M. ; Rinkevich, Y.

Neutrophils direct preexisting matrix to initiate repair in damaged tissues.
Nat. Genet. 54, 18–29 (2022)

Hawe, J. ; Wilson, R. ; Schmid, K. ; Zhou, L. ; Lakshmanan, L.N. ; Lehne, B.C. ; Kühnel, B. ; Scott, W.R. ; Wielscher, M. ; Yew, Y.W. ; Baumbach, C. ; Lee, D.P. ; Marouli, E. ; Bernard, M. ; Pfeiffer, L. ; Matias-Garcia, P.R. ; Autio, M.I. ; Bourgeois, S. ; Herder, C. ; Karhunen, V. ; Meitinger, T. ; Prokisch, H. ; Rathmann, W. ; Roden, M. ; Sebert, S. ; Shin, J. ; Strauch, K. ; Zhang, W. ; Tan, W.L.W. ; Hauck, S.M. ; Merl-Pham, J. ; Grallert, H. ; Barbosa, E.G.V. ; Illig, T. ; Peters, A. ; Paus, T. ; Pausova, Z. ; Deloukas, P. ; Foo, R.S.Y. ; Jarvelin, M.R. ; Kooner, J.S. ; Loh, M. ; Heinig, M. ; Gieger, C. ; Waldenberger, M. ; Chambers, J.C.

Genetic variation influencing DNA methylation provides insights into molecular mechanisms regulating genomic function.
J. Neurosci. 42, 1557-1573 (2022)

Lam, D.D. ; Williams, R.H. ; Lujan, E. ; Tanabe, K. ; Huber, G. ; Saw, N.L. ; Merl-Pham, J. ; Salminen, A.V. ; Lohse, D. ; Spendiff, S. ; Plastini, M.J. ; Zech, M. ; Lochmüller, H. ; Geerlof, A. ; Hauck, S.M. ; Shamloo, M. ; Wernig, M. ; Winkelmann, J.

Collagen VI regulates motor circuit plasticity and motor performance by cannabinoid modulation.
J. Chromatogr. B 1188:123069 (2022)

Harrieder, E.-M. ; Kretschmer, F. ; Böcker, S. ; Witting, M.

Current state-of-the-art of separation methods used in LC-MS based metabolomics and lipidomics.
Cell Death Differ., DOI: 10.1038/s41418-021-00883-z (2022)

Xin, S. ; Müller, C. ; Pfeiffer, S. ; Kraft, V. ; Merl-Pham, J. ; Bao, X. ; Feederle, R. ; Jin, X. ; Hauck, S.M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Schick, J.

MS4A15 drives ferroptosis resistance through calcium-restricted lipid remodeling.
Sci. Adv. 7:eabb3673 (2021)

Gerckens, M. ; Schorpp, K.K. ; Pelizza, F. ; Wögrath, M. ; Reichau, K. ; Ma, H. ; Dworsky, A.-M. ; Sengupta, A. ; Stoleriu, M.-G. ; Heinzelmann, K. ; Merl-Pham, J. ; Irmler, M. ; Alsafadi, H.N. ; Trenkenschuh, E. ; Sarnova, L. ; Jirouskova, M. ; Frieß, W. ; Hauck, S.M. ; Beckers, J. ; Kneidinger, N. ; Behr, J. ; Hilgendorff, A. ; Hadian, K. ; Lindner, M. ; Königshoff, M. ; Eickelberg, O. ; Gregor, M. ; Plettenburg, O. ; Yildirim, A.Ö. ; Burgstaller, G.

Phenotypic drug screening in a human fibrosis model identified a novel class of antifibrotic therapeutics.
Anal. Bioanal. Chem., DOI: 10.1007/s00216-021-03828-0 (2021)

Stoffel, R. ; Quilliam, M.A. ; Hardt, N. ; Fridstrom, A. ; Witting, M.

N-Alkylpyridinium sulfonates for retention time indexing in reversed-phase-liquid chromatography-mass spectrometry–based metabolomics.
Front. Pharmacol. 12:771571 (2021)

Schmalen, A. ; Lorenz, L. ; Grosche, A. ; Pauly, D. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M.

Proteomic phenotyping of stimulated Müller cells uncovers profound pro-inflammatory signaling and antigen-presenting capacity.
Nat. Biotechnol. 40, 411–421 (2021)

Hoffmann, M.A. ; Nothias, L.F. ; Ludwig, M. ; Fleischauer, M. ; Gentry, E.C. ; Witting, M. ; Dorrestein, P.C. ; Dührkop, K. ; Böcker, S.

High-confidence structural annotation of metabolites absent from spectral libraries.
Radiat. Environ. Biophys. 60:689 (2021)

Schuster, M. ; Tewary, G. ; Bao, X. ; Subedi, P. ; Hauck, S.M. ; Olsen, A.K. ; Eide, D.M. ; Trott, K.R. ; Götz, S. ; Atkinson, M.J. ; Rosemann, M.

Correction to: In vitro cellular and proteome assays identify Wnt pathway and CDKN2A-regulated senescence affected in mesenchymal stem cells from mice after a chronic LD gamma irradiation in utero.
Hum. Mol. Genet. 31, 999-1011 (2021)

Pott, J. ; Gadin, J. ; Theusch, E. ; Kleber, M.E. ; Delgado, G.E. ; Kirsten, H. ; Hauck, S.M. ; Burkhardt, R. ; Scharnagl, H. ; Krauss, R.M. ; Loeffler, M. ; März, W. ; Thiery, J. ; Silveira, A. ; Vant Hooft, F.M. ; Scholz, M.

Meta-GWAS of PCSK9 levels detects two novel loci at APOB and TM6SF2.
EMBO Rep.:e53007 (2021)

Zhang, X. ; Schuhmachers, P. ; Mourao, A. ; Giansanti, P. ; Murer, A. ; Thumann, S. ; Kuklik-Roos, C. ; Beer, S. ; Hauck, S.M. ; Hammerschmidt, W. ; Kuppers, R. ; Kuster, B. ; Raab, M. ; Strebhardt, K. ; Sattler, M. ; Münz, C. ; Kempkes, B.

PLK1-dependent phosphorylation restrains EBNA2 activity and lymphomagenesis in EBV-infected mice.
Eur. Respir. J. 59:2101798 (2021)

Kammerl, I.E. ; Hardy, S. ; Flexeder, C. ; Urmann, A. ; Peierl, J. ; Wang, Y. ; Vosyka, O. ; Frankenberger, M. ; Milger, K. ; Behr, J. ; Koch, A. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Pilette, C. ; Schulz, H. ; Meiners, S.

Activation of immune cell proteasomes in peripheral blood of smokers and COPD patients - implications for therapy.

Kunzke, T. ; Hölzl, F.T. ; Prade, V.M. ; Buck, A. ; Huber, K. ; Feuchtinger, A. ; Ebert, K. ; Zwingenberger, G. ; Geffers, R. ; Hauck, S.M. ; Haffner, I. ; Luber, B. ; Lordick, F. ; Walch, A.K.

Metabolomic therapy response prediction in pretherapeutic tissue biopsies for trastuzumab in patients with HER2-positive advanced gastric cancer.

Kabiri, Y. ; Fuhrmann, A. ; Becker, A. ; Jedermann, L. ; Eberhagen, C. ; König, A. ; Silva, T.B. ; Borges, F. ; Hauck, S.M. ; Michalke, B. ; Knolle, P. ; Zischka, H.

Mitochondrial impairment by MitobloCK-6 inhibits liver cancer cell proliferation. 
Nat. Commun. 12:5208 (2021)

Hoefig, K.P. ; Reim, A. ; Gallus, C. ; Wong, E.H. ; Behrens, G. ; Conrad, C. ; Xu, M. ; Kifinger, L. ; Ito-Kureha, T. ; Defourny, K.A.Y. ; Geerlof, A. ; Mautner, J.M. ; Hauck, S.M. ; Baumjohann, D. ; Feederle, R. ; Mann, M. ; Wierer, M. ; Glasmacher, E. ; Heissmeyer, V.

Defining the RBPome of primary T helper cells to elucidate higher-order Roquin-mediated mRNA regulation.
Metabolites 11:549 (2021)

Kleinwort, K.J.H. ; Hobmaier, B.F. ; Mayer, R. ; Hölzel, C. ; Degroote, R.L. ; Märtlbauer, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis proteome changes profoundly in milk.
Radiat. Environ. Biophys. 60, 397-410 (2021)

Schuster, M. ; Tewary, G. ; Bao, X. ; Subedi, P. ; Hauck, S.M. ; Olson, A.K. ; Eide, D.M. ; Trott, K.R. ; Götz, S. ; Atkinson, M.J. ; Rosemann, M.

In vitro cellular and proteome assays identify Wnt pathway and CDKN2A-regulated senescence affected in mesenchymal stem cells from mice after a chronic LD gamma irradiation in utero.
Neurobiol. Dis. 157:105423 (2021)

Miljanovic, N. ; Hauck, S.M. ; van Dijk, R.M. ; Di Liberto, V. ; Rezaei, A. ; Potschka, H.

Proteomic signature of the Dravet syndrome in the genetic Scn1a-A1783V mouse model.
Nat. Bio. Eng. 5, 897-913 (2021)

Wiedenmann, S. ; Breunig, M. ; Merkle, J. ; von Toerne, C. ; Georgiev, T. ; Moussus, M. ; Schulte, L.N. ; Seufferlein, T. ; Sterr, M. ; Lickert, H. ; Weissinger, S.E. ; Möller, P. ; Hauck, S.M. ; Hohwieler, M. ; Kleger, A. ; Meier, M.

Single-cell-resolved differentiation of human induced pluripotent stem cells into pancreatic duct-like organoids on a microwell chip.
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 65, 430-441 (2021)

Konigsberg, I.R. ; Borie, R. ; Walts, A.D. ; Cardwell, J. ; Rojas, M. ; Metzger, F. ; Hauck, S.M. ; Fingerlin, T.E. ; Yang, I.V. ; Schwartz, D.A.

Molecular signatures of idiopathic pulmonary fibrosis.
J. Cachexia Sarcopenia Muscle 12, 1011–1023 (2021)

Huemer, M.-T. ; Bauer, A. ; Petrera, A. ; Scholz, M. ; Hauck, S.M. ; Drey, M. ; Peters, A. ; Thorand, B.

Proteomic profiling of low muscle and high fat mass: A machine learning approach in the KORA S4/FF4 study.
J. Am. Soc. Nephrol. 32, 1747-1763 (2021)

Matias-Garcia, P.R. ; Wilson, R. ; Guo, Q. ; Zaghlool, S. ; Eales, J. ; Xu, X. ; Charchar, F.J. ; Dormer, J. ; Maalmi, H. ; Schlosser, P. ; Elhadad, M.A. ; Nano, J. ; Sharma, S. ; Peters, A. ; Fornoni, A. ; Mook-Kanamori, D. ; Winkelmann, J. ; Danesh, J. ; di Angelantonio, E. ; Ouwehand, W. ; Watkins, N. ; Roberts, D. ; Petrera, A. ; Graumann, J. ; Koenig, W. ; Hveem, K. ; Jonasson, C. ; Köttgen, A. ; Butterworth, A. ; Prunotto, M. ; Hauck, S.M. ; Herder, C. ; Suhre, K. ; Gieger, C. ; Tomaszewski, M. ; Teumer, A. ; Waldenberger, M.

Plasma proteomics of renal function: A trans-ethnic metaanalysis and Mendelian randomization study.
J. Cell Sci. 134:jcs255422 (2021)

Steichele, M. ; Sauermann, L.S. ; Koenig, A. ; Hauck, S.M. ; Boettger, A.

Ancestral role of TNF-R pathway in cell differentiation in the basal metazoan Hydra.
PeerJ 9:e11316 (2021)

Sagmeister, S. ; Merl-Pham, J. ; Petrera, A. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M.

High glucose treatment promotes extracellular matrix proteome remodeling in Muller glial cells.
Cells 10:711 (2021)

Lorenz, L. ; Hirmer, S. ; Schmalen, A. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Cell surface profiling of retinal Müller glial cells reveals association to immune pathways after LPS stimulation.
Aging Cell 20:e13342 (2021)

Dall, K.B. ; Havelund, J.F. ; Harvald, E.B. ; Witting,M. ; Færgeman, N.J.

HLH-30-dependent rewiring of metabolism during starvation in C. elegans.
Metabolomics 17:33 (2021)

Spanier, B. ; Laurençon, A. ; Weiser, A. ; Pujol, N. ; Omi, S. ; Barsch, A. ; Korf, A. ; Meyer, S.W. ; Ewbank, J.J. ; Palladino, F. ; Garvis, S. ; Aguilaniu, H. ; Witting,M.

Correction to: Comparison of lipidome profiles of Caenorhabditis elegans-results from an inter-laboratory ring trial.
Glycobiology 31, 873-883 (2021)

Lorenz, L. ; Amann, B. ; Hirmer, S. ; Degroote, R.L. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

NEU1 is more abundant in uveitic retina with concomitant desialylation of retinal cells.
Metabolomics 17:25 (2021)

Spanier, B. ; Laurençon, A. ; Weiser, A. ; Pujol, N. ; Omi, S. ; Barsch, A. ; Korf, A. ; Meyer, S.W. ; Ewbank, J.J. ; Paladino, F. ; Garvis, S. ; Aguilaniu, H. ; Witting,M.

Comparison of lipidome profiles of Caenorhabditis elegans—results from an inter-laboratory ring trial.
Sci. Immunol. 6:eaaz6563 (2021)

Regen, T. ; Isaac, S. ; Amorim, A. ; Núñez, N.G. ; Hauptmann, J. ; Shanmugavadivu, A. ; Klein, M. ; Sankowski, R. ; Mufazalov, I.A. ; Yogev, N. ; Huppert, J. ; Wanke, F. ; Witting,M. ; Grill, A. ; Gálvez, E.J.C. ; Nikolaev, A. ; Blanfeld, M. ; Prinz, I. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Strowig, T. ; Reinhardt, C. ; Prinz, M. ; Bopp, T. ; Becher, B. ; Ubeda, C. ; Waisman, A.

IL-17 controls central nervous system autoimmunity through the intestinal microbiome.
Diabetologia 64, 1079-1092 (2021)

Assfalg, R. ; Knoop, J. ; Hoffman, K.L. ; Pfirrmann, M. ; Zapardiel-Gonzalo, J. ; Hofelich, A. ; Eugster, A. ; Weigelt, M. ; Matzke, C. ; Reinhardt, J. ; Fuchs, Y. ; Bunk, M. ; Weiss, A. ; Hippich, M. ; Halfter, K. ; Hauck, S.M. ; Hasford, J. ; Petrosino, J.F. ; Achenbach, P. ; Bonifacio, E. ; Ziegler, A.-G.

Oral insulin immunotherapy in children at risk for type 1 diabetes in a randomised controlled trial.
Cell Rep. 34:108653 (2021)

Rackles, E. ; Witting,M. ; Forné, I. ; Zhang, X. ; Zacherl, J. ; Schrott, S. ; Fischer, C. ; Ewbank, J.J. ; Osman, C. ; Imhof, A. ; Rolland, S.G.

Reduced peroxisomal import triggers peroxisomal retrograde signaling.
J. Proteome Res. 20, 751-762 (2021)

Petrera, A. ; von Toerne, C. ; Behler, J. ; Huth, C. ; Thorand, B. ; Hilgendorff, A. ; Hauck, S.M.

Multiplatform approach for plasma proteomics: Complementarity of olink proximity extension assay technology to mass spectrometry-based protein profiling.
Cell Stem Cell 28, 524-534.e7 (2021)

Russo, G.L. ; Sonsalla, G. ; Natarajan, P. ; Breunig, C. ; Bulli, G. ; Merl-Pham, J. ; Schmitt, S. ; Giehrl-Schwab, J. ; Giesert, F. ; Jastroch, M. ; Zischka, H. ; Wurst, W. ; Stricker, S.H. ; Hauck, S.M. ; Masserdotti, G. ; Götz, M.

CRISPR-mediated induction of neuron-enriched mitochondrial proteins boosts direct glia-to-neuron conversion.

Huber, K. ; Gomolka, M. ; Thomsen, A.R. ; Hauck, S.M. ; Duchrow, L. ; Ordonez, M.E.B. ; Henke, M. ; Moertl, S. ; Hornhardt, S.

Characterization of radiation-induced Normal Tissue Reactions in a Head and Neck Tumor Patient Collective.
Front. Immunol. 11:607473 (2020)

Giese, I.M. ; Schilloks, M.C. ; Degroote, R.L. ; Weigand, M. ; Renner, S. ; Wolf, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Chronic hyperglycaemia drives functional impairment of lymphocytes in diabetic INSC94Y transgenic pigs.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 202, 1720-1724 (2020)

Mathei, S.K. ; Cardwell, J. ; Metzger, F. ; Powers, J. ; Walts, A.D. ; Kropski, J.A. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Yang, I.V. ; Schwartz, D.A.

Preclinical pulmonary fibrosis circulating protein biomarkers.
Acta Neuropathol. Commun. 8:207 (2020)

Gerhards, R. ; Pfeffer, L.K. ; Lorenz, J. ; Starost, L. ; Nowack, L. ; Thaler, F.S. ; Schlüter, M. ; Rübsamen, H. ; Macrini, C. ; Winklmeier, S. ; Mader, S. ; Bronge, M. ; Grönlund, H. ; Feederle, R. ; Hsia, H.E. ; Lichtenthaler, S.F. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Kuhlmann, T. ; Bauer, I.J. ; Beltran, E. ; Gerdes, L.A. ; Mezydlo, A. ; Bar-Or, A. ; Banwell, B. ; Khademi, M. ; Olsson, T. ; Hohlfeld, R. ; Lassmann, H. ; Kümpfel, T. ; Kawakami, N. ; Meinl, E.

Oligodendrocyte myelin glycoprotein as a novel target for pathogenic autoimmunity in the CNS.

Gurley, J.M. ; Gmyrek, G.B. ; Mcclellan, M.E. ; Hargis, E.A. ; Hauck, S.M. ; Dozmorov, M.G. ; Wren, J.D. ; Carr, D.J.J. ; Elliott, M.H.

Neuroretinal-derived caveolin-1 promotes endotoxin-induced inflammation in the murine retina.
PLoS ONE 15:e0238533 (2020)

Meissner, K. ; Lutter, D. ; von Toerne, C. ; Haile, A. ; Woods, S.C. ; Hoffmann, V. ; Ohmayer, U. ; Hauck, S.M. ; Tschöp, M.H.

Molecular classification of the placebo effect in nausea.

Raguz, N. ; Heim, A. ; Engal, E. ; Wesche, J. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Erkelenz, S. ; Schaal, H. ; Bensaude, O. ; Wolf, A. ; Salton, M. ; Böttger, A.

JMJD6 regulates splicing of its own gene resulting in alternatively spliced isoforms with different nuclear targets.

Azimzadeh, O. ; Azizova, T. ; Merl-Pham, J. ; Blutke, A. ; Moseeva, M. ; Zubkova, O. ; Anastasov, N. ; Feuchtinger, A. ; Hauck, S.M. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.

Chronic occupational exposure to ionizing radiation induces alterations in the structure and metabolism of the heart: A proteomic analysis of human formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) cardiac tissue.
Nat. Methods 17, 905–908 (2020)

Nothias, L.F. ; Petras, D. ; Schmid, R. ; Dührkop, K. ; Rainer, J. ; Sarvepalli, A. ; Protsyuk, I. ; Ernst, M. ; Tsugawa, H. ; Fleischauer, M. ; Aicheler, F. ; Aksenov, A.A. ; Alka, O. ; Allard, P.M. ; Barsch, A. ; Cachet, X. ; Caraballo-Rodriguez, A.M. ; Da Silva, R.R. ; Dang, T. ; Garg, N. ; Gauglitz, J.M. ; Gurevich, A. ; Isaac, G. ; Jarmusch, A.K. ; Kameník, Z. ; Kang, K.B. ; Kessler, N. ; Koester, I. ; Korf, A. ; Le Gouellec, A. ; Ludwig, M. ; Martin H, C. ; McCall, L.I. ; McSayles, J. ; Meyer, S.W. ; Mohimani, H. ; Morsy, M. ; Moyne, O. ; Neumann, S. ; Neuweger, H. ; Nguyen, N.H. ; Nothias-Esposito, M. ; Paolini, J. ; Phelan, V.V. ; Pluskal, T. ; Quinn, R.A. ; Rogers, S. ; Shrestha, B. ; Tripathi, A. ; van der Hooft, J.J.J. ; Vargas, F. ; Weldon, K.C. ; Witting, M. ; Yang, H. ; Zhang, Z. ; Zubeil, F. ; Kohlbacher, O. ; Böcker, S. ; Alexandrov, T. ; Bandeira, N. ; Wang, M. ; Dorrestein, P.C.

Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment.
New Phytol. 228, 1939-1952 (2020)

Ghirardo, A. ; Fochi, V. ; Lange, B. ; Witting, M. ; Schnitzler, J.-P. ; Perotto, S. ; Balestrini, R.

Metabolomic adjustments in the orchid mycorrhizal fungus Tulasnella calospora during symbiosis with Serapias vomeracea.
Diabetes 69, 2766-2778 (2020)

Elhadad, M.A. ; Jonasson, C. ; Huth, C. ; Wilson, R. ; Gieger, C. ; Matias-Garcia, P.R. ; Grallert, H. ; Graumann, J. ; Gailus-Durner, V. ; Rathmann, W. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Koenig, W. ; Sinner, M.F. ; Oprea, T.I. ; Suhre, K. ; Thorand, B. ; Hveem, K. ; Peters, A. ; Waldenberger, M.

Deciphering the plasma proteome of type 2 diabetes.
Metabolites 10:301 (2020)

Gmelch, L. ; Wirtz, D. ; Witting, M. ; Weber, N. ; Striegel, L. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Rychlik, M.

Comprehensive vitamer profiling of folate mono- and polyglutamates in baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) as a function of different sample preparation procedures.
Neurobiol. Dis. 143:105018 (2020)

Henke, C. ; Töllner, K. ; van Dijk, R.M. ; Miljanovic, N. ; Cordes, T. ; Twele, F. ; Bröer, S. ; Ziesak, V. ; Rohde, M. ; Hauck, S.M. ; Vogel, C. ; Welzel, L. ; Schumann, T. ; Willmes, D.M. ; Kurzbach, A. ; El-Agroudy, N.N. ; Bornstein, S.R. ; Schneider, S.A. ; Jordan, J. ; Potschka, H. ; Metallo, C.M. ; Köhling, R. ; Birkenfeld, A.L. ; Löscher, W.

Disruption of the sodium-dependent citrate transporter SLC13A5 in mice causes alterations in brain citrate levels and neuronal network excitability in the hippocampus.
Cell Rep. 32:108059 (2020)

Meul, T. ; Berschneider, K. ; Schmitt, S. ; Mayr, C. ; Mattner, L. ; Schiller, H. B. ; Yazgili, A.S. ; Wang, X. ; Lukas, C. ; Schlesser, C. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Graf, E. ; Schwarzmayr, T. ; Perocchi, F. ; Kukat, A. ; Trifunovic, A. ; Kremer, L.S. ; Prokisch, H. ; Popper, B. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Zischka, H. ; Meiners, S.

Mitochondrial regulation of the 26S proteasome.
Sci. Rep. 10:14461 (2020)

Blutke, A. ; Sun, N. ; Xu, Z. ; Buck, A. ; Harrison, L. ; Schriever, S.C. ; Pfluger, P.T. ; Wiles, D. ; Kunzke, T. ; Huber, K. ; Schlegel, J. ; Aichler, M. ; Feuchtinger, A. ; Matiasek, K. ; Hauck, S.M. ; Walch, A.K.

Light sheet fluorescence microscopy guided MALDI-imaging mass spectrometry of cleared tissue samples.
J. Proteomics 225:103876 (2020)

Deeg, C.A. ; Degroote, R.L. ; Giese, I.M. ; Hirmer, S. ; Amann, B. ; Weigand, M. ; Wiedemann, C. ; Hauck, S.M.

CD11d is a novel antigen on chicken leukocytes.
Mol. Oncol. 14, 2420-2435 (2020)

Yang, L. ; Kraft, V. ; Pfeiffer, S. ; Merl-Pham, J. ; Bao, X. ; An, Y. ; Hauck, S.M. ; Schick, J.

Nonsense-mediated decay factor SMG7 sensitizes cells to TNF alpha-induced apoptosis via CYLD tumor suppressor and the noncoding oncogenePvt1.
J. Proteomics 224:103843 (2020)

Weigand, M. ; Degroote, R.L. ; Amann, B. ; Renner, S. ; Wolf, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Proteome profile of neutrophils from a transgenic diabetic pig model shows distinct changes.

Brett, E. ; Sauter, M. ; Timmins, E. ; Azimzadeh, O. ; Rosemann, M. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Nelson, P.J. ; Becker, K.F. ; Schunn, I. ; Lowery, A. ; Kerin, M.J. ; Atkinson, M.J. ; Krueger, A. ; Machens, H. ; Duscher, D.

Oncogenic linear collagen VI of invasive breast cancer is induced by CCL5.
Sci. Rep. 10:1326 (2020)

Herrmann, A. ; Roesner, M. ; Werner, T. ; Hauck, S.M. ; Koch, A. ; Bauer A. ; Schneider, M. ; Brack-Werner, R.

Potent inhibition of HIV replication in primary human cells by novel synthetic polyketides inspired by Aureothin.
PLoS Genet. 16:e1008638 (2020)

Haeussler, S. ; Köhler, F. ; Witting, M. ; Premm, M.F. ; Rolland, S.G. ; Fischer, C. ; Chauve, L. ; Casanueva, O. ; Conradt, B.

Autophagy compensates for defects in mitochondrial dynamics.
Front. Immunol. 10:3064 (2020)

Degroote, R.L. ; Weigand, M. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

IL8 and PMA trigger the regulation of different biological processes in Granulocyte activation.
In: Computational Methods and Data Analysis for Metabolomics. 2020. 361-386 (Methods Mol. Biol. ; 2104)

Hattwell, J.P.N. ; Hastings, J. ; Casanueva, O. ; Schirra, H.J. ; Witting, M.

Using genome-scale metabolic networks for analysis, visualization, and integration of targeted metabolomics data.
Cell Rep. 30, 3183-3194.e4 (2020)

Darr, J. ; Tomar, A. ; Lassi, M. ; Gerlini, R. ; Berti, L. ; Hering, A. ; Scheid, F. ; Hrabě de Angelis, M. ; Witting, M. ; Teperino, R.

iTAG-RNA isolates cell-specific transcriptional responses to environmental stimuli and identifies an RNA-based endocrine axis.
ACS Cent. Sci. 6, 41-53 (2020)

Kraft, V. ; Bezjian, C.T. ; Pfeiffer, S. ; Ringelstetter, L. ; Müller, C. ; Zandkarimi, F. ; Merl-Pham, J. ; Bao, X. ; Anastasov, N. ; Kössl, J. ; Brandner, S. ; Daniels, J.D. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Hauck, S.M. ; Stockwell, B.R. ; Hadian, K. ; Schick, J.

GTP cyclohydrolase 1/tetrahydrobiopterin counteract ferroptosis through lipid remodeling.
Neuroscience 424, 102-120 (2020)

von Rüden, E.L. ; Zellinger, C. ; Gedon, J. ; Walker, A. ; Bierling, V. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Potschka, H.

Regulation of Alzheimer's disease-associated proteins during epileptogenesis.
Graefes Arch. Clin. Exp. Ophthalmol. 258, 221–230 (2020)

Ghaseminejad, F. ; Kaplan, L. ; Pfaller, A.M. ; Hauck, S.M. ; Grosche, A.

The role of Muller cell glucocorticoid signaling in diabetic retinopathy.
Prostaglandins Other Lipid Mediat. 146:106387 (2020)

Rahm, M. ; Merl-Pham, J. ; Adamski, J. ; Hauck, S.M.

Time-resolved phosphoproteomic analysis elucidates hepatic 11,12-Epoxyeicosatrienoic acid signaling pathways.
J. Proteome Res. 19, 337-345 (2020)

Hladik, D. ; Dalke, C. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Azimzadeh, O. ; Philipp, J. ; Ung, M.-C. ; Schlattl, H. ; Rößler, U. ; Graw, J. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.

Creb signaling mediates dose-dependent radiation response in the murine hippocampus two years after total body exposure.
2019 in
In: Translational Research Methods in Diabetes, Obesity, and Nonalcoholic Fatty Liver Disease. 2019. 309-347

Grallert, H. ; Marzi, C. ; Hauck, S.M. ; Gieger, C.

Omics: Potential role in early phase drug development.

Meul, T. ; Wang, X. ; Angelidis, I. ; Berschneider, K. ; Schmitt, S. ; Zischka, H. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Schiller, H. B. ; Meiners, S.

Mitochondrial dysfunction activates MHC class I adaptive immune responses in lung aging.
Glia 67, E629-E629 (2019)

Pauly, D. ; Agarwal, D. ; Dana, N. ; Schäfer, N. ; Grassmann, F. ; Zhang, N.R. ; Gautam, A.K. ; Weber, B.H.F. ; Hauck, S.M. ; Kim, M. ; Curcio, C.A. ; Stambolian, D. ; Li, M. ; Grosche, A.

Glial cells shape the complement homeostasis the healthy and diseased murine retina.
Glia 67, E689-E690 (2019)

Koupourtidou, C. ; Schwarz, V. ; Sanchez-Gonzalez, R. ; Breunig, C. ; Fischer, J. ; Sirko, S. ; Götz, M. ; Hauck, S.M. ; Stricker, S.H. ; Ninkovic, J.

Tlr2 and Cxcr3 pathways modulate scar formation after traumatic brain injury.
PeerJ 2019:e8130 (2019)

Kleinwort, K.J.H. ; Hauck, S.M. ; Degroote, R.L. ; Scholz, A.M. ; Hölzel, C. ; Maertlbauer, E.P. ; Deeg, C.

Peripheral blood bovine lymphocytes and MAP show distinctly different proteome changes and immune pathways in host-pathogen interaction.
Cell Rep. 29, 2835-2848.e4 (2019)

Pauly, D. ; Agarwal, D. ; Dana, N. ; Schäfer, N. ; Biber, J. ; Wunderlich, K.A. ; Jabri, Y. ; Straub, T. ; Zhang, N.R. ; Gautam, A.K. ; Weber, B.H.F. ; Hauck, S.M. ; Kim, M. ; Curcio, C.A. ; Stambolian, D. ; Li, M. ; Grosche, A.

Cell type-specific complement expression in the healthy and diseased retina.

Hladik, D. ; Buratovic, S. ; von Toerne, C. ; Azimzadeh, O. ; Subedi, P. ; Philipp, J. ; Winkler, S. ; Feuchtinger, A. ; Samson, E. ; Hauck, S.M. ; Stenerlöw, B. ; Eriksson, P. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.

Combined treatment with low-dose ionizing radiation and ketamine induces adverse changes in CA1 neuronal structure in murine hippocampi.

Barjaktarovic, Z. ; Merl-Pham, J. ; Braga-Tanaka, I. ; Tanaka, S. ; Hauck, S.M. ; Saran, A. ; Mancuso, M. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S. ; Azimzadeh, O.

Hyperacetylation of cardiac mitochondrial proteins is associated with metabolic impairment and sirtuin downregulation after chronic total body irradiation of ApoE -/- mice.
Cell Rep. 29, 873-888.e10 (2019)

Gehring, T. ; Erdmann, T. ; Rahm, M. ; Grass, C. ; Flatley, A. ; O´Neill, T.J. ; Woods, S. ; Meininger, I. ; Karayel, O. ; Kutzner, K. ; Grau, M. ; Shinohara, H. ; Lammens, K. ; Feederle, R. ; Hauck, S.M. ; Lenz, G. ; Krappmann, D.

MALT1 phosphorylation controls activation of T lymphocytes and survival of ABC-DLBCL tumor cells.
Metabolites 9:200 (2019)

Stanstrup, J. ; Broeckling, C.D. ; Helmus, R. ; Hoffmann, N. ; Mathé, E. ; Naake, T. ; Nicolotti, L. ; Peters, K. ; Rainer, J. ; Salek, R.M. ; Schulze, T. ; Schymanski, E.L. ; Stravs, M.A. ; Thévenot, E.A. ; Treutler, H. ; Weber, R.J.M. ; Willighagen, E. ; Witting, M. ; Neumann, S.

The metaRbolomics Toolbox in Bioconductor and beyond.
Matrix biology plus 1, DOI: 10.1016/j.mbplus.2019.04.002:100005 (2019)

Merl-Pham, J. ; Basak, T. ; Knüppel, L. ; Ramanujam, D. ; Athanason, M. ; Behr, J. ; Engelhardt, S. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Vanacore, R. ; Staab-Weijnitz, C.A.

Quantitative proteomic profiling of extracellular matrix and site-specific collagen post-translational modifications in an in vitro model of lung fibrosis.
Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab. 317, E374-E387 (2019)

Kappler, L. ; Hoene, M. ; Hu, C. ; von Toerne, C. ; Li, J. ; Bleher, D. ; Hoffmann, C. ; Böhm, A. ; Kollipara, L. ; Zischka, H. ; Königsrainer, A. ; Häring, H.-U. ; Peter, A. ; Xu, G. ; Sickmann, A. ; Hauck, S.M. ; Weigert, C. ; Lehmann, R.

Linking bioenergetic function of mitochondria to tissue-specific molecular fingerprints.
J. Exp. Med. 216, 1700-1723 (2019)

von Gamm, M. ; Schaub, A. ; Jones, A. ; Wolf, C. ; Behrens, G. ; Lichti, J. ; Essig, K. ; Macht, A. ; Pircher, J. ; Ehrlich, A. ; Davari, K. ; Chauhan, D. ; Busch, B. ; Wurst, W. ; Feederle, R. ; Feuchtinger, A. ; Tschöp, M.H. ; Friedel, C.C. ; Hauck, S.M. ; Sattler, M. ; Geerlof, A. ; Hornung, V. ; Heissmeyer, V. ; Schulz, C. ; Heikenwalder, M. ; Glasmacher, E.

Immune homeostasis and regulation of the interferon pathway require myeloid-derived Regnase-3.

Staab-Weijnitz, C.A. ; Merl-Pham, J. ; Basak, T. ; Knüppel, L. ; Ramanujam, D. ; Athanason, M. ; Behr, J. ; Engelhardt, S. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Vanacore, R.

Quantitative proteomic profiling of extracellular matrix and collagen posttranslational modifications in an in vitro model of lung fibrosis.

Mathai, S.K. ; Metzger, F. ; Cardwell, J. ; Kropski, J.A. ; Powers, J. ; Walts, A.D. ; Markin, C. ; Brown, K.K. ; Steele, M.P. ; Schwarz, M.I. ; Lynch, D.A. ; Eickelberg, O. ; Fingerlin, T.E. ; Loyd, J.E. ; Hauck, S.M. ; Yang, I.V. ; Schwartz, D.A.

Circulating plasma proteins differentially detected in idiopathic pulmonary fibrosis and in subjects with pre-clinical pulmonary fibrosis.
Chem. Phys. Lipids 222, 15-22 (2019)

Hänel, V. ; Pendleton, C. ; Witting, M.

The sphingolipidome of the model organism Caenorhabditis elegans.
Mol. Cell 74, 951-965.e13 (2019)

Modic, M. ; Grosch, M. ; Rot, G. ; Schirge, S. ; Lepko, T. ; Yamazaki, T. ; Lee, F.C.Y. ; Rusha, E. ; Shaposhnikov, D. ; Palo, M. ; Merl-Pham, J. ; Cacchiarelli, D. ; Rogelj, B. ; Hauck, S.M. ; von Mering, C. ; Meissner, A. ; Lickert, H. ; Hirose, T. ; Ule, J. ; Drukker, M.

Cross-regulation between TDP-43 and paraspeckles promotes pluripotency-differentiation transition.
J. Neuroinflamm. 16:43 (2019)

Mages, K. ; Grassmann, F. ; Jägle, H. ; Rupprecht, R. ; Weber, B.H.F. ; Hauck, S.M. ; Grosche, A.

The agonistic TSPO ligand XBD173 attenuates the glial response thereby protecting inner retinal neurons in a murine model of retinal ischemia.
Nature 567, 113-117 (2019)

Camargo Ortega, G. ; Falk, S. ; Johansson, P.A. ; Peyre, E. ; Broix, L. ; Sahu, S.K. ; Hirst, W. ; Schlichthaerle, T. ; de Juan Romero, C. ; Draganova, K. ; Vinopal, S. ; Chinnappa, K. ; Gavranovic, A. ; Karakaya, T. ; Steininger, T. ; Merl-Pham, J. ; Feederle, R. ; Shao, W. ; Shi, S.H. ; Hauck, S.M. ; Jungmann, R. ; Bradke, F. ; Borrell, V. ; Geerlof, A. ; Reber, S. ; Tiwari, V.K. ; Huttner, W.B. ; Wilsch-Bräuninger, M. ; Nguyen, L.A. ; Götz, M.

The centrosome protein AKNA regulates neurogenesis via microtubule organization.
J. Chromatogr. B 1109, 142-148 (2019)

Sillner, N. ; Walker, A. ; Harrieder, E.-M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Witting, M.

Development and application of a HILIC UHPLC-MS method for polar fecal metabolome profiling.
Stem Cell Rep. 12, 258-273 (2019)

Obermann, J. ; Wagner, F. ; Kociaj, A. ; Zambusi, A. ; Ninkovic, J. ; Hauck, S.M. ; Chapouton, P.

The surface proteome of adult neural stem cells in zebrafish unveils long-range cell-cell connections and age-related changes in responsiveness to IGF.
Eur. J. Epidemiol. 34, 409-422 (2019)

Huth, C. ; von Toerne, C. ; Schederecker, F. ; de Las Heras Gala, T. ; Herder, C. ; Kronenberg, F. ; Meisinger, C. ; Rathmann, W. ; Koenig, W. ; Waldenberger, M. ; Roden, M. ; Peters, A. ; Hauck, S.M. ; Thorand, B.

Protein markers and risk of type 2 diabetes and prediabetes: A targeted proteomics approach in the KORA F4/FF4 study.
J. Proteomics 193, 1-9 (2019)

Kammerl, I.E. ; Caniard, A. ; Merl-Pham, J. ; Ben-Nissan, G. ; Mayr, C.H. ; Mossina, A. ; Geerlof, A. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Sharon, M. ; Meiners, S.

Dissecting the molecular effects of cigarette smoke on proteasome function.

Einer, C. ; Leitzinger, C. ; Lichtmannegger, J. ; Eberhagen, C. ; Rieder, T. ; Borchard, S. ; Wimmer, R. ; Denk, G. ; Popper, B. ; Neff, F. ; Polishchuk, E.V. ; Polishchuk, R.S. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Müller, J.C. ; Karst, U. ; Baral, B.S. ; DiSpirito, A.A. ; Kremer, A.E. ; Semrau, J. ; Weiss, K.H. ; Hohenester, S. ; Zischka, H.

A high caloric diet aggravates mitochondrial dysfunction and triggers severe liver damage in Wilson disease rats.
Diabetes Metab. Res. Rev. 35:e3074 (2019)

Niersmann, C. ; Hauck, S.M. ; Kannenberg, J.M. ; Röhrig, K. ; von Toerne, C. ; Roden, M. ; Herder, C. ; Carstensen-Kirberg, M.

Omentin-regulated proteins combine a pro-inflammatory phenotype with an anti-inflammatory counterregulation in human adipocytes: A proteomics analysis.

Fernandez, I.E. ; Sun, N. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Verleden, S. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Walch, A.K. ; Eickelberg, O.

Pharmacometabolic effect of pirfenidone treatment in IPF detected by high resolution MALDI-FTICR imaging.
Prog. Retinal Eye Res. 70, 55-84 (2018)

Bergen, A.A. ; Arya, S. ; Koster, C. ; Pilgrim, M.G. ; Wiatrek-Moumoulidis, D. ; van der Spek, P. ; Hauck, S.M. ; Boon, C.J.F. ; Emri, E. ; Stewart, A.J. ; Lengyel, I.

On the origin of proteins in human drusen: The meet, greet and stick hypothesis.
Front. Immunol. 9:2884 (2018)

Lutterberg, K. ; Kleinwort, K.J.H. ; Hobmaier, B.F. ; Hauck, S.M. ; Nuske, S. ; Scholz, A.M. ; Deeg, C.A.

A functionally different immune phenotype in cattle is associated with higher mastitis incidence.

Knüppel, L. ; Merl-Pham, J. ; Hennen, E. ; Hatz, R. ; Behr, J. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Staab-Weijnitz, C.A.

A proteomic analysis of extracellular matrix from idiopathic pulmonary fibrosis patient-derived fibroblasts in response to transforming growth factor beta 1.

Smirnova, N.F. ; Morrone, C. ; Conlon, T.M. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.

A quantitative proteomics profiling of murine lung grafts indicates novel pathways associated with chronic lung allograft dysfunction.

Meiners, S. ; Kammerl, I.E. ; Caniard, A.M. ; Merl-Pham, J. ; Ben-Nissan, G. ; Mossina, A. ; Geerlof, A. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Sharon, M.

Dissecting the molecular effects of cigarette smoke on proteasome function.

Witting, M. ; Hastings, J. ; Rodriguez, N. ; Joshi, C.J. ; Hattwell, J.P.N. ; Ebert, P.R. ; van Weeghel, M. ; Gao, A.W. ; Wakelam, M.J.O. ; Houtkooper, R.H. ; Mains, A. ; Novère, N.L. ; Sadykoff, S. ; Schroeder, F. ; Lewis, N.E. ; Schirra, H.J. ; Kaleta, C. ; Casanueva, O.

Modeling meets metabolomics— the WormJam consensus model as basis for metabolic studies in the model organism Caenorhabditis elegans.

Fernandez, I.E. ; Sun, N. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Verleden, S. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Eickelberg, O. ; Walch, A.K.

Pharmacometabolic response to pirfenidone treatment in pulmonary fibrosis detected by high resolution MALDI FTICR-mass spectrometry imaging.
Pediatr. Blood Cancer 65, S366-S366 (2018)

von Frowein, J. ; Hauck, S.M. ; Kappler, R. ; Pagel, P. ; Fleischmann, K.K. ; Magg, T. ; Cairo, S. ; Roscher, A. ; von Schweinitz, D. ; Schmid, I.

miR-492 regulates metastatic Ppoperties of hepatoblastoma via CD44.
Diabetologia 61, S150-S150 (2018)

Knoch, K.-P. ; Petzold, A. ; Wegbrod, C. ; Soenmez, A. ; Münster, C. ; Friedrich, A. ; Marinicova, Z.Z. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Solimena, M.

CVB5 proteases 2A reduces insulin granule maturation only indirect.
Diabetologia 61, S271-S271 (2018)

Kappler, L. ; Hoene, M. ; Li, J. ; Hu, C. ; von Toerne, C. ; Kollipara, L. ; Hoffmann, C. ; Böhm, A. ; Hauck, S.M. ; Xu, G. ; Häring, H.-U. ; Peter, A. ; Sickmann, A. ; Weigert, C. ; Lehmann, R.

Linking of bioenergetic function of mitochondria to tissue-specific molecular fingerprints in mice and humans.
Diabetologia 61, S254-S255 (2018)

Niersmann, C. ; Hauck, S.M. ; Kannenberg, J.M. ; Roehrig, K. ; von Toerne, C. ; Roden, M. ; Herder, C. ; Carstensen-Kirberg, M.

Omentin-induced secretion of proteins by primary human adipocytes and stimulation of the innate immune system.
Sci. Rep. 8:12332 (2018)

Schauer, M. ; Kleinwort, K.J.H. ; Degroote, R.L. ; Wiedemann, C. ; Kremmer, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Interaction of septin 7 and DOCK8 in equine lymphocytes reveals novel insights into signaling pathways associated with autoimmunity.
Eur. Respir. J. 52:1702314 (2018)

Sun, N. ; Fernandez, I.E. ; Wei, M. ; Witting, M. ; Aichler, M. ; Feuchtinger, A. ; Burgstaller, G. ; Verleden, S.E. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Eickelberg, O. ; Walch, A.K.

Pharmacometabolic response to pirfenidone in pulmonary fibrosis detected by MALDI-FTICR-MSI.
Plant Cell Environ. 41, 2791-2805 (2018)

Clancy, M.V. ; Zytynska, S.E. ; Moritz, F. ; Witting, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Weisser, W.W. ; Schnitzler, J.-P.

Metabotype variation in a field population of tansy plants influences aphid host selection.
Proteomics 11:e1700321 (2018)

Ruzafa, N. ; Pereiro, X. ; Lepper, M.F. ; Hauck, S.M. ; Vecino, E.

A proteomics approach to identify candidate proteins secreted by Müller glia that protect ganglion cells in the retina.
J. Chromatogr. B 1083, 35-43 (2018)

Sillner, N. ; Walker, A. ; Koch, W. ; Witting, M. ; Schmitt-Kopplin, P.

Metformin impacts cecal bile acid profiles in mice.
EMBO Rep. 19:e45294 (2018)

Frik, J. ; Merl-Pham, J. ; Plesnila, N. ; Mattugini, N. ; Kjell, J. ; Kraska, J. ; Gómez, R.M. ; Hauck, S.M. ; Sirko, S. ; Götz, M.

Cross-talk between monocyte invasion and astrocyte proliferation regulates scarring in brain injury.
Glia 66, 1644-1662 (2018)

Mattugini, N. ; Merl-Pham, J. ; Petrozziello, E. ; Schindler, L. ; Bernhagen, J. ; Hauck, S.M. ; Götz, M.

Influence of white matter injury on gray matter reactive gliosis upon stab wound in the adult murine cerebral cortex.
Electrophoresis 39, 1645-1653 (2018)

Hemmler, D. ; Heinzmann, S.S. ; Wöhr, K. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Witting, M.

Tandem HILIC-RP liquid chromatography for increased polarity coverage in food analysis.
Plant Physiol. 176, 2639-2656 (2018)

Kaling, M. ; Schmidt, A. ; Moritz, F. ; Rosenkranz, M. ; Witting, M. ; Kasper, K. ; Janz, D. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Schnitzler, J.-P. ; Polle, A.

Mycorrhiza-triggered transcriptomic and metabolomic networks impinge on herbivore fitness.
J. Trace Elem. Med. Biol. 49, 184-191 (2018)

Pao, P.-J. ; Emri, E. ; Abdirahman, S.B. ; Soorma, T. ; Zeng, H.H. ; Hauck, S.M. ; Thompson, R.B. ; Lengyel, I.

The effects of zinc supplementation on primary human retinal pigment epithelium.

Roullier-Gall, C. ; Signoret, J. ; Hemmler, D. ; Witting, M. ; Kanawati, B. ; Schaefer, B.W. ; Gougeon, R.D. ; Schmitt-Kopplin, P.

Usage of FT-ICR-MS metabolomics for characterizing the chemical signatures of barrel-aged whisky.
Neurobiol. Dis. 112, 119-135 (2018)

Keck, M. ; van Dijk, R.M. ; Deeg, C.A. ; Kistler, K. ; Walker, A. ; von Rüden, E.L. ; Russmann, V. ; Hauck, S.M. ; Potschka, H.

Proteomic profiling of epileptogenesis in a rat model: Focus on cell stress, extracellular matrix and angiogenesis.
Sci. Rep. 8:1801 (2018)

Sarrach, S. ; Huang, Y. ; Niedermeyer, S. ; Hachmeister, M. ; Fischer, L. ; Gille, S. ; Pan, M. ; Mack, B. ; Kranz, G. ; Libl, D. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Paoluzzi Tomada, E. ; Kieslinger, M. ; Jeremias, I. ; Scialdone, A. ; Gires, O.

Spatiotemporal patterning of EpCAM is important for murine embryonic endo-And mesodermal differentiation.
Liver Int. 38, 1280-1291 (2018)

von Frowein, J. ; Hauck, S.M. ; Kappler, R. ; Pagel, P. ; Fleischmann, K.K. ; Magg, T. ; Cairo, S. ; Roscher, A. ; von Schweinitz, D. ; Schmid, I.

MiR-492 regulates metastatic properties of hepatoblastoma via CD44.
Mitochondrion, DOI: 10.1016/j.mito.2017.08.015 (2018)

Einer, C. ; Hohenester, S. ; Wimmer, R. ; Wottke, L. ; Artmann, R. ; Schulz, S. ; Gosmann, C. ; Simmons, A. ; Leitzinger, C. ; Eberhagen, C. ; Borchard, S. ; Schmitt, S. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Jastroch, M. ; Walheim, E. ; Rust, C. ; Gerbes, A.L. ; Popper, B. ; Mayr, D. ; Schnurr, M. ; Vollmar, A.M. ; Denk, G.U. ; Zischka, H.

Mitochondrial adaptation in steatotic mice.
Worm 6:e1373939 (2017)

Hastings, J. ; Mains, A. ; Artal-Sanz, M. ; Bergmann, S. ; Braeckman, B.P. ; Bundy, J. ; Cabreiro, F. ; Dobson, P. ; Ebert, P. ; Hattwell, J. ; Hefzi, H. ; Houtkooper, R.H. ; Jelier, R. ; Joshi, C. ; Kothamachu, V.B. ; Lewis, N. ; Lourenco, A.B. ; Nie, Y. ; Norvaisas, P. ; Pearce, J. ; Riccio, C. ; Rodriguez, N. ; Santermans, T. ; Scarcia, P. ; Schirra, H.J. ; Sheng, M. ; Smith, R. ; Suriyalaksh, M. ; Towbin, B. ; Tuli, M.A. ; van Weeghel, M. ; Weinkove, D. ; Zecic, A. ; Zimmermann, J. ; Le Novère, N. ; Kaleta, C. ; Witting, M. ; Casanueva, O.

WormJam: A consensus C. elegans metabolic reconstruction and metabolomics community and workshop series.
Data Brief 15, 163-169 (2017)

Einer, C. ; Hohenester, S. ; Wimmer, R. ; Wottke, L. ; Artmann, R. ; Schulz, S. ; Gosmann, C. ; Simmons, A. ; Leitzinger, C. ; Eberhagen, C. ; Borchard, S. ; Schmitt, S. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Jastroch, M. ; Walheim, E. ; Rust, C. ; Gerbes, A.L. ; Popper, B. ; Mayr, D. ; Schnurr, M. ; Vollmar, A.M. ; Denk, G. ; Zischka, H.

Data on chow, liver tissue and mitochondrial fatty acid compositions as well as mitochondrial proteome changes after feeding mice a western diet for 6-24 weeks.
J. Chromatogr. B 1071, 1-2 (2017)

Junot, C. ; Witting, M.

Identification of molecules from non-targeted analysis.
J. Proteome Res. 17, 618-634 (2017)

Lepper, M.F. ; Ohmayer, U. ; von Toerne, C. ; Maison, N. ; Ziegler, A.-G. ; Hauck, S.M.

Proteomic landscape of patient-derived CD4+T cells in recent-onset type 1 diabetes.
Diabetologia 60, S23-S23 (2017)

Neukam, M. ; Ganss, K. ; Vasiljevic, J. ; Soenmez, A. ; Kurth, T. ; Hauck, S.M. ; Solimena, M.

A novel method for the background-free purification of age-distinct insulin secretory granules for proteomic and lipidomic analyses.
Adv. Func. Mat. 27:1701956 (2017)

Johnston, B.D. ; Kreyling, W.G. ; Pfeiffer, C. ; Schäffler, M. ; Sarioglu, H. ; Ristig, S. ; Hirn, S. ; Haberl, N. ; Thalhammer, S. ; Hauck, S.M. ; Semmler-Behnke, M. ; Epple, M. ; Hühn, J. ; del Pino, P. ; Parak, W.J.

Colloidal stability and surface chemistry are key factors for the composition of the protein corona of inorganic gold nanoparticles.
PLoS ONE 12:e0182993 (2017)

Behr, S. ; Brameyer, S. ; Witting, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Jung, K.

Comparative analysis of LytS/LytTR-type histidine kinase/response regulator systems in γ-proteobacteria.
Proteomics 17:1700013 (2017)

Hauck, S.M. ; Lepper, M.F. ; Hertl, M. ; Sekundo, W. ; Deeg, C.A.

Proteome dynamics in biobanked horse peripheral blood derived lymphocytes (PBL) with induced autoimmune uveitis.
Bioanalysis 9, 969-973 (2017)

Silva Indrasekara, S. ; Lockett, M.R. ; Witting, M. ; Zhang, Y.S.

New Investigator Award: Announcing our finalists!
Glia 65, E404-E405 (2017)

Mattugini, N. ; Ohlig, S. ; Merl-Pham, J. ; Kannaiyan, N. ; Hauck, S.M. ; Rossner, M.J. ; Götz, M.

Differences of grey and white matter astrocytes in the intact and injured cerebral cortex.
Glia 65, E193-E193 (2017)

Pfaller, A. ; Grassmann, F. ; Hauser, A. ; Pannicke, T. ; Hauck, S.M. ; Kloeting, N. ; Weber, B. ; Grosche, A.

miRNA profile and expression analysis of Muller cells from the diabetic retina implicates a possible role of PDGF-mediated signaling in retinal glia for disease progression.
Neurobiol. Dis. 105, 164-178 (2017)

Keck, M.E. ; Androsova, G. ; Gualtieri, F. ; Walker, A. ; von Rüden, E.L. ; Russmann, V. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Krause, R. ; Potschka, H.

A systems level analysis of epileptogenesis-associated proteome alterations.
Sci. Rep. 7:1388 (2017)

Behr, S. ; Kristoficova, I. ; Witting, M. ; Breland, E.J. ; Eberly, A.R. ; Sachs, C. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Hadjifrangiskou, M. ; Jung, K.

Identification of a high-affinity pyruvate receptor in escherichia coli.

Welk, V. ; Meul, T. ; Merl-Pham, J. ; Korfei, M. ; Koch, I. ; Semren, N. ; Guenther, A. ; Lindner, M. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Proteasomal activator 200 (pa200) regulates cellular proliferation: A putative role for Ipf and lung cancer pathogenesis.
Mol. Cell. Proteomics 16, 1528-1546 (2017)

Obermann, J. ; Priglinger, C.S. ; Merl-Pham, J. ; Geerlof, A. ; Priglinger, S.G. ; Götz, M. ; Hauck, S.M.

Proteome-wide identification of glycosylation-dependent interactors of Galectin-1 and Galectin-3 on mesenchymal retinal pigment epithelial cells.
2017 in
In: (Proteomic Forum 2017, 2-5 April 2017, Potsdam). 2017. 119-120

Lepper, M.F. ; Ohmayer, U. ; von Toerne, C. ; Ziegler, A.-G. ; Hauck, S.M.

The proteomic landscape of patient-derived CD4+ T cells in recent-onset type 1 diabetes.
Vet. Immunol. Immunopathol. 187, 48-54 (2017)

Braus, B.K. ; Miller, I. ; Kummer, S. ; Kleinwort, K.J.H. ; Hirmer, S. ; Hauck, S.M. ; McMullen, R.J. ; Kerschbaumer, M. ; Deeg, C.A.

Investigation of corneal autoantibodies in horses with immune mediated keratitis (IMMK).
Diabetologia 60, 1541–1549 (2017)

Kleinwort, K.J.H. ; Amann, B. ; Hauck, S.M. ; Hirmer, S. ; Blutke, A. ; Renner, S. ; Uhl, P.B. ; Lutterberg, K. ; Sekundo, W. ; Wolf, E. ; Deeg, C.A.

Retinopathy with central oedema in an INSC94Y transgenic pig model of long-term diabetes.
Metabolites 7:7 (2017)

Zisi, C. ; Sampsonidis, I. ; Fasoula, S. ; Papachristos, K. ; Witting, M. ; Gika, H.G. ; Nikitas, P. ; Pappa-Louisi, A.

QSRR modeling for metabolite standards analyzed by two different chromatographic columns using multiple linear regression.

Yentrapalli, R. ; Merl-Pham, J. ; Azimzadeh, O. ; Mutschelknaus, L. ; Peters, C. ; Hauck, S.M. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S. ; Mörtl, S.

Quantitative changes in the protein and miRNA cargo of plasma exosome-like vesicles after exposure to ionizing radiation.
Nucleic Acids Res. 45, 3266-3279 (2017)

Lee, H.K. ; Qian, K. ; von Toerne, C. ; Hoerburger, L. ; Claussnitzer, M. ; Hoffmann, C. ; Glunk, V. ; Wahl, S. ; Breier, M. ; Eck, F. ; Jafari, L. ; Molnos, S. ; Grallert, H. ; Dahlman, I. ; Arner, P. ; Brunner, C. ; Hauner, H. ; Hauck, S.M. ; Laumen, H.

Allele-specific quantitative proteomics unravels molecular mechanisms modulated by cis-regulatory PPARG locus variation.
J. Proteome Res. 16, 898-910 (2017)

Virgiliou, C. ; Gika, H.G. ; Witting, M. ; Bletsou, A.A. ; Athanasiadis, A. ; Zafrakas, M. ; Thomaidis, N.S. ; Raikos, N. ; Makrydimas, G. ; Theodoridis, G.A.

Amniotic fluid and maternal serum metabolic signatures in the second trimester associated with preterm delivery.
J. Proteomics 154, 102-108 (2017)

Degroote, R.L. ; Uhl, P.B. ; Amann, B. ; Krackhardt, A.M. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Formin like 1 expression is increased on CD4 + T lymphocytes in spontaneous autoimmune uveitis.
Bioanalysis 9, 37-51 (2017)

Virgiliou, C. ; Valianou, L. ; Witting, M. ; Moritz, F. ; Fotakis, C. ; Zoumpoulakis, P. ; Chatziioannou, A.C. ; Lazaros, L. ; Makrydimas, G. ; Chatzimeletiou, K. ; Raikos, N. ; Theodoridis, G.A.

Metabolic profile of human coelomic fluid.
Proteomics 17:1600243 (2017)

Mossina, A. ; Lukas, C. ; Merl-Pham, J. ; Uhl, F.E. ; Mutze, K. ; Schamberger, A.C. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Jia, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Cigarette smoke alters the secretome of lung epithelial cells.
J. Proteome Res. 16, 307-318 (2017)

Subramanian, V. ; Seemann, I. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Stewart, F. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S. ; Azimzadeh, O.

The role of TGF beta and PPAR alpha signalling pathways in radiation response of locally exposed heart: Integrated global transcriptomics and proteomics analysis.
Diabetologia 60, 287-295 (2017)

von Toerne, C. ; Laimighofer, M. ; Achenbach, P. ; Beyerlein, A. ; de Las Heras Gala, T. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Ziegler, A.-G. ; Hauck, S.M.

Peptide serum markers in islet autoantibody-positive children.
Oncotarget 8, 9067-9078 (2017)

Azimzadeh, O. ; Azizova, T.V. ; Merl-Pham, J. ; Subramanian, V. ; Bakshi, M.V. ; Moseeva, M. ; Zubkova, O. ; Hauck, S.M. ; Anastasov, N. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.

A dose-dependent perturbation in cardiac energy metabolism is linked to radiation-induced ischemic heart disease in Mayak nuclear workers.

Deeg, C.A. ; Uhl, P.B. ; Amann, B. ; Blutke, A. ; Renner, S. ; Hirmer, S. ; Merl-Pham, J. ; Sekundo, W. ; Wanke, R. ; Wolf, E. ; Hauck, S.M.

The INSC94Y transgenic pig: A novel model for diabetic retinopathy with macular edema.

Palfi, A. ; Hokamp, K. ; Hauck, S.M. ; Vencken, S. ; Carrigan, M. ; Ueffing, M. ; Greene, C. ; Farrar, G.J.

miRNA regulation and potential interactors of Rac1 in the mouse retina.
Front. Immunol. 7, 542:542 (2016)

Schaefer, N. ; Grosche, A. ; Reinders, J. ; Hauck, S.M. ; Pouw, R.B. ; Kuijpers, T.W. ; Wouters, D. ; Ehrenstein, B. ; Enzmann, V. ; Zipfel, P.F. ; Skerka, C. ; Pauly, D.

Complement regulator FHR-3 is elevated either locally or systemically in a selection of autoimmune diseases.
J. Invest. Dermatol. 136, S232-S232 (2016)

Graessel, A. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Kloppmann, E. ; Goldberg, T. ; Koppensteiner, H. ; Schindler, M. ; Krause, L. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Blank, S.

Identification of new cell surface targets on human T helper cells.
Sci. Rep. 6:31431 (2016)

Palfi, A. ; Hokamp, K. ; Hauck, S.M. ; Vencken, S. ; Millington-Ward, S. ; Chadderton, N. ; Carrigan, M. ; Körtvely, E. ; Greene, C.M. ; Kenna, P.F. ; Farrar, G.J.

microRNA regulatory circuits in a mouse model of inherited retinal degeneration.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 57, 4504-4511 (2016)

Kleinwort, K.J. ; Amann, B. ; Hauck, S.M. ; Feederle, R. ; Sekundo, W. ; Deeg, C.A.

Immunological characterization of intraocular lymphoid follicles in a spontaneous recurrent uveitis model.
Hum. Mol. Genet. 25, 4462-4472 (2016)

Trifunovic, D. ; Arango-González, B. ; Comitato, A. ; Barth, M. ; del Amo, E.M. ; Kulkarni, M. ; Sahaboglu, A. ; Hauck, S.M. ; Urtti, A. ; Arsenijevic, Y. ; Ueffing, M. ; Marigo, V. ; Paquet-Durand, F.

HDAC inhibition in the cpfl1 mouse protects degenerating cone photoreceptors in vivo.
Hum. Mol. Genet. 25, 4201-4210 (2016)

Yang, J. ; Bassuk, A.G. ; Merl-Pham, J. ; Hsu, C.W. ; Colgan, D.F. ; Li, X. ; Au, K.S. ; Zhang, L. ; Smemo, S. ; Justus, S. ; Nagahama, Y. ; Grossbach, A.J. ; Howard, M.A. ; Kawasaki, H. ; Feldstein, N.A. ; Dobyns, W.B. ; Northrup, H. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Mahajan, V.B. ; Tsang, S.H.

Catenin delta-1 (CTNND1) phosphorylation controls the mesenchymal to epithelial transition in astrocytic tumors.

Amann, B. ; Kleinwort, K.J. ; Hirmer, S. ; Sekundo, W. ; Kremmer, E. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Expression and distribution pattern of aquaporin 4, 5 and 11 in retinas of 15 different species.
Cell Rep. 16, 559-570 (2016)

Nestor, C.E. ; Lentini, A. ; Hägg Nilsson, C. ; Gawel, D.R. ; Gustafsson, M. ; Mattson, L. ; Wang, H. ; Rundquist, O. ; Meehan, R.R. ; Klocke, B. ; Seifert, M. ; Hauck, S.M. ; Laumen, H. ; Zhang, H. ; Benson, M.

5-hydroxymethylcytosine remodeling precedes lineage specification during differentiation of human CD4+ T cells.
Diabetologia 59, 1882-1892 (2016)

von Toerne, C. ; Huth, C. ; de Las Heras Gala, T. ; Kronenberg, F. ; Herder, C. ; Koenig, W. ; Meisinger, C. ; Rathmann, W. ; Waldenberger, M. ; Roden, M. ; Peters, A. ; Thorand, B. ; Hauck, S.M.

MASP1, THBS1, GPLD1 and ApoA-IV are novel biomarkers associated with prediabetes: The KORA F4 study.
Oncotarget 7, 44062-44075 (2016)

Huber, M. ; Falkenberg, N. ; Hauck, S.M. ; Priller, M. ; Braselmann, H. ; Feuchtinger, A. ; Walch, A.K. ; Schmitt, M. ; Aubele, M.

Cyr61 and YB-1 are novel interacting partners of uPAR and elevate the malignancy of triple-negative breast cancer.
PLoS ONE 11:e0156952 (2016)

Bakshi, M.V. ; Azimzadeh, O. ; Merl-Pham, J. ; Verreet, T. ; Hauck, S.M. ; Benotmane, M.A. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.

In-utero low-dose irradiation leads to persistent alterations in the mouse heart proteome.
Hum. Mol. Genet. 25, 3143-3151 (2016)

Kortvely, E. ; Hauck, S.M. ; Behler, J. ; Ho, N. ; Ueffing, M.

The unconventional secretion of ARMS2.
Plant Physiol. 171, 1495-1510 (2016)

Carella, P. ; Merl-Pham, J. ; Wilson, D.C. ; Dey, S. ; Hauck, S.M. ; Vlot, A.C. ; Cameron, R.K.

Comparative proteomics analysis of Arabidopsis phloem exudates collected during the induction of systemic acquired resistance.
Oncotarget 7, 30396-30407 (2016)

Dragoi, D. ; Krattenmacher, A. ; Mishra, V.K. ; Schmidt, J. ; Kloos, U. ; Meixner, L.K. ; Hauck, S.M. ; Buggenthin, F. ; Schwartz, D. ; Marr, C. ; Johnsen, S.A. ; Scheel, C.

Twist1 induces distinct cell states depending on TGFBR1-activation.
J. Neuroinflamm. 13:89 (2016)

Deeg, C.A. ; Amann, B. ; Lutz, K. ; Hirmer, S. ; Lutterberg, K. ; Kremmer, E. ; Hauck, S.M.

Aquaporin 11, a regulator of water efflux at retinal Müller glial cell surface decreases concomitant with immune-mediated gliosis.
J. Proteome Res. 15, 1350-1359 (2016)

Ly, A. ; Merl-Pham, J. ; Priller, M. ; Gruhn, F. ; Senninger, N. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M.

Proteomic profiling suggests central role of STAT signaling during retinal degeneration in the rd10 mouse model.
Food Chem. 203, 207-215 (2016)

Roullier-Gall, C. ; Witting, M. ; Moritz, F. ; Gil, R.B. ; Goffette, D. ; Valade, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Gougeon, R.D.

Natural oxygenation of Champagne wine during ageing on lees: A metabolomics picture of hormesis.

Heinzelmann, K. ; Noskovicova, N. ; Merl-Pham, J. ; Preissler, G. ; Winter, H. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Hauck, S.M. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.

Surface proteome analysis identifies platelet derived growth factor receptor-alpha as a critical mediator of transforming growth factor-beta-induced collagen secretion.
Plant Physiol. 170, 1945-1961 (2016)

Vanzo, E. ; Merl-Pham, J. ; Velikova, V.B. ; Ghirardo, A. ; Lindermayr, C. ; Hauck, S.M. ; Bernhardt, J. ; Riedel, K. ; Durner, J. ; Schnitzler, J.-P.

Modulation of protein S-nitrosylation by isoprene emission in poplar.
Oncogene 35, 4269-4281 (2016)

Bognar, M. ; Vincendeau, M. ; Erdmann, T. ; Seeholzer, T. ; Grau, M. ; Linnemann, J. ; Ruland, J. ; Scheel, C. ; Lenz, P. ; Ott, G. ; Lenz, G. ; Hauck, S.M. ; Krappmann, D.

Oncogenic CARMA1 couples NF-κB and β-catenin signaling in diffuse large B-cell lymphomas.
PLoS ONE 11:e0146887 (2016)

Priglinger, C.S. ; Obermann, J. ; Szober, C.M. ; Merl-Pham, J. ; Ohmayer, U. ; Behler, J. ; Gruhn, F. ; Kreutzer, T.C. ; Wertheimer, C. ; Geerlof, A. ; Priglinger, S.G. ; Hauck, S.M.

Epithelial-to-mesenchymal transition of RPE cells in vitro confers increased β1,6-N-glycosylation and increased susceptibility to galectin-3 binding.
Brain Behav. Immun. 53, 138-158 (2016)

Walker, A. ; Russmann, V. ; Deeg, C.A. ; von Toerne, C. ; Kleinwort, K.J. ; Szober, C.M. ; Rettenbeck, M.L. ; von Rüden, E.L. ; Goc, J. ; Ongerth, T. ; Boes, K. ; Salvamoser, J.D. ; Vezzani, A. ; Hauck, S.M. ; Potschka, H.

Proteomic profiling of epileptogenesis in a rat model: Focus on inflammation.
Proteome Sci. 13:26 (2016)

Kempf, S.J. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Atkinson, M.J. ; Benotmane, M.A. ; Tapio, S.

Long-term consequences of in utero irradiated mice indicate proteomic changes in synaptic plasticity related signalling.
Adv. Exp. Med. Biol. 854, 411-418 (2016)

Reagan, A. ; Gu, X. ; Hauck, S.M. ; Ash, J.D. ; Cao, G. ; Thompson, T.C. ; Elliott, M.H.

Retinal caveolin-1 modulates neuroprotective signaling.
Mol. Cell. Proteomics 15, 462-480 (2016)

Grosche, A. ; Hauser, A. ; Lepper, M.F. ; Mayo, R. ; von Toerne, C. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M.

The proteome of native adult Muller glial cells from murine retina.
Plant Cell Environ. 39, 147-164 (2016)

Zhao, F. ; El-Kelish, A. ; Durner, J. ; Lindermayr, C. ; Winkler, J.B. ; Rueff, F. ; Behrendt, H. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Holzinger, A. ; Kofler, W. ; Braun, P. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Ernst, D. ; Frank, U.

Common ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.): Allergenicity and molecular characterisation of pollen after plant exposure to elevated NO2.
In: Advances in Wine Research. Washington, DC: American Chemical Society, 2015. 13-27 (ACS Symp. Series ; 1203)

Roullier-Gall, C. ; Witting, M. ; Tziotis, D. ; Ruf, A. ; Lucio, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Gougeon, R.D.

Combined nontargeted analytical methodologies for the characterization of the chemical evolution of bottled wines.
BMC Evol. Biol. 15:283 (2015)

Fellner, L. ; Simon, S. ; Scherling, C. ; Witting, M. ; Schober, S. ; Polte, C. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Keim, D.A. ; Scherer, S. ; Neuhaus, K.

Evidence for the recent origin of a bacterial protein-coding, overlapping orphan gene by evolutionary overprinting.

Heinzelmann, K. ; Noskovicova, N. ; Merl-Pham, J. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O.

TGF-beta affects nintedanib function via PDGFR alpha in primary human fibroblasts.
Allergy 70, 128 (2015)

Frank, U. ; Zhao, F. ; El-Kelish, A. ; Heller, W. ; Braun, P. ; Durner, J. ; Winkler, J.B. ; Engel, M. ; Pfeifer, M. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Oeder, S. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Ernst, D.

Ragweed (Ambrosia artemisiifolia): How does Ambrosia pollen react to different air pollution? A systems biology approach.
Allergy 70, 104 (2015)

Graessel, A. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Kloppmann, E. ; Goldberg, T. ; Koppensteiner, H. ; Schindler, M. ; Knapp, B. ; Krause, L. ; Kremmer, E. ; Blank, S. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Suttner, K.

Identification of new cell surface proteins on human naive CD4+ T-cells potentially involved in the early T-cell activation.
Epilepsia 56, 193-193 (2015)

Potschka, H. ; Walker, A. ; Russmann, V. ; von Rueden, L. ; Goc, J. ; Kleinwort, K.J. ; Szober, C.M. ; von Toerne, C. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M.

Differential proteome analysis during epileptogenesis: Focus on inflammation.
Epilepsia 56, 4-4 (2015)

von Rueden, E.- L. ; Zellinger, C. ; Walker, A. ; Russmann, V. ; Kleinwort, K.J. ; Szober, C.M. ; von Toerne, C. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Potschka, H.

Shared pathophysiology of temporal lobe epilepsy and Alzheimer´s disease -  a differential proteomics approach in a post-status epilepticus model.

Elliott, M.H. ; Hauck, S.M. ; Dozmorov, M.G. ; Liang, J. ; Mcclellan, M.E. ; Wren, J.D. ; Stamer, W.D.

Caveolae and conventional outflow: Proteomic profiling of outflow tissue caveolae and evidence of mechanosensing.

Palfi, A. ; Millington-Ward, S. ; Chadderton, N. ; Hokamp, K. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Vencken, S. ; Greene, C. ; Kenna, P. ; Farrar, J.

MiR-182 and miR-96 co-regulate Rac1 expression in the mouse retina.
2015 in
In: Krentz, A.J.* ; Heinemann, L.* ; Hompesch, M.* [Eds.]: Translational Research Methods for Diabetes, Obesity and Cardiometabolic Drug Development. London: Springer, 2015. 189-222

Grallert, H. ; Marzi, C. ; Hauck, S.M. ; Gieger, C.

Omics: Potential role in early-phase drug development.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 56:2347 (2015)

Pao, P. ; Abdirahman, S.B. ; Soorma, T. ; Csincsik, L. ; Perkins, S.J. ; Hauck, S.M. ; Thompson, R. ; Lengyel, I.

The effects of zinc supplements on primary human foetal retinal pigment epithelium in culture.
J. Proteome Res. 14, 4674-4686 (2015)

Kempf, S.J. ; Sepe, S. ; von Toerne, C. ; Janik, D. ; Neff, F. ; Hauck, S.M. ; Atkinson, M.J. ; Mastroberardino, P.G. ; Tapio, S.

Neonatal irradiation leads to persistent proteome alterations involved in synaptic plasticity in the mouse hippocampus and cortex.
Glia 63, 2340-2361 (2015)

Sirko, S. ; Irmler, M. ; Gascón, S. ; Bek, S. ; Schneider, S. ; Dimou, L. ; Obermann, J. ; de Souza Paiva, D. ; Poirier, F. ; Beckers, J. ; Hauck, S.M. ; Barde, Y.A. ; Götz, M.

Astrocyte reactivity after brain injury -  the role of galectins 1 and 3.
J. Chromatogr. A 1406, 145-155 (2015)

Sampsonidis, I. ; Witting, M. ; Koch, W. ; Virgiliou, C. ; Gika, H.G. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Theodoridis, G.A.

Computational analysis and ratiometric comparison approaches aimed to assist column selection in hydrophilic interaction liquid chromatography-tandem mass spectrometry targeted metabolomics.
Mol. Cell. Proteomics 14, 2764-2774 (2015)

Schäfer, A. ; Neschen, S. ; Kahle-Stephan, M. ; Sarioglu, H. ; Gaisbauer, T. ; Imhof, A. ; Adamski, J. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M.

The epoxyeicosatrienoic acid pathway enhances hepatic insulin signaling and is repressed in insulin-resistant mouse liver.
Nat. Commun. 6:7333 (2015)

Laurent, S.A. ; Hoffmann, F.S. ; Kuhn, P.H. ; Cheng, Q. ; Chu, Y. ; Schmidt-Supprian, M. ; Hauck, S.M. ; Schuh, E. ; Krumbholz, M. ; Rübsamen, H. ; Wanngren, J. ; Khademi, M. ; Olsson, T. ; Alexander, T. ; Hiepe, F. ; Pfister, H.W. ; Weber, F. ; Jenne, D. ; Wekerle, H. ; Hohlfeld, R. ; Lichtenthaler, S.F. ; Meinl, E.

γ-secretase directly sheds the survival receptor BCMA from plasma cells.
Mol. Cell. Proteomics 14, 2085-2102 (2015)

Graessel, A. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Kloppmann, E. ; Goldberg, T. ; Koppensteiner, H. ; Schindler, M. ; Knapp, B. ; Krause, L. ; Dietz, K. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Suttner, K.

A combined omics approach to generate the surface atlas of human naive CD4+ T cells during early TCR activation.
Sci. Rep. 5:10230 (2015)

Keller, I.E. ; Vosyka, O. ; Takenaka, S. ; Kloß, A. ; Dahlmann, B. ; Willems, L.I. ; Verdoes, M. ; Overkleeft, H.S. ; Marcos, E. ; Adnot, S. ; Hauck, S.M. ; Ruppert, C. ; Günther, A. ; Herold, S. ; Ohno, S. ; Adler, H. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.

Regulation of immunoproteasome function in the lung.

Jeandet, P. ; Heinzmann, S.S. ; Roullier-Gall, C. ; Cilindre, C. ; Aron, A. ; Deville, M.A. ; Moritz, F. ; Karbowiak, T. ; Demarville, D. ; Brun, C. ; Moreau, F. ; Michalke, B. ; Liger-Belair, G. ; Witting, M. ; Lucio, M. ; Steyer, D. ; Gougeon, R.D. ; Schmitt-Kopplin, P.

Chemical messages in 170-year-old champagne bottles from the Baltic Sea: Revealing tastes from the past.
J. Proteome Res. 14, 2055-2064 (2015)

Kempf, S.J. ; Mörtl, S. ; Sepe, S. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Atkinson, M.J. ; Mastroberardino, P.G. ; Tapio, S.

Low-dose ionizing radiation rapidly affects mitochondrial and synaptic signaling pathways in murine hippocampus and cortex.
PLoS ONE 10:e0115996 (2015)

Lorber, B. ; Chew, D.J. ; Hauck, S.M. ; Chong, R.S. ; Fawcett, J.W. ; Martin, K.R.

Retinal glia promote dorsal root ganglion axon regeneration.
Tetrahedron 71, 2983-2990 (2015)

Roullier-Gall, C. ; Witting, M. ; Tziotis, D. ; Ruf, A. ; Gougeon, R. ; Schmitt-Kopplin, P.

Integrating analytical resolutions in non-targeted wine metabolomics.
J. Immunol. 194, 542-552 (2015)

Hoffmann, F.S. ; Kühn, P. ; Laurent, S.A. ; Hauck, S.M. ; Berer, K. ; Wendlinger, S.A. ; Krumbholz, M. ; Khademi, M. ; Olsson, T. ; Dreyling, M. ; Pfister, H. ; Alexander, T. ; Hiepe, F. ; Kümpfel, T. ; Crawford, H.C. ; Wekerle, H. ; Hohlfeld, R. ; Lichtenthaler, S.F. ; Meinl, E.

The immunoregulator soluble TACI is released by ADAM10 and reflects B cell activation in autoimmunity.
Histochem. Cell Biol. 143, 453-462 (2015)

Ly, A. ; Schöne, C. ; Becker, M. ; Rattke, J. ; Meding, S. ; Aichler, M. ; Suckau, D. ; Walch, A.K. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M.

High-resolution MALDI mass spectrometric imaging of lipids in the mammalian retina.
Anal. Bioanal. Chem. 407, 1059-1073 (2015)

Witting, M. ; Lucio, M. ; Tziotis, D. ; Wägele, B. ; Suhre, K. ; Voulhoux, R. ; Garvis, S. ; Schmitt-Kopplin, P.

DI-ICR-FT-MS-based high-throughput deep metabotyping: A case study of the Caenorhabditis elegans-Pseudomonas aeruginosa infection model.
Mol. Metab. 4, 39-50 (2015)

Kahle-Stephan, M. ; Schäfer, A. ; Seelig, A. ; Schultheiß, J. ; Wu, M. ; Aichler, M. ; Leonhardt, J. ; Rathkolb, B. ; Rozman, J. ; Sarioglu, H. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Wolf, E. ; Kastenmüller, G. ; Adamski, J. ; Walch, A.K. ; Hrabě de Angelis, M. ; Neschen, S.

High fat diet-induced modifications in membrane lipid and mitochondrial-membrane protein signatures precede the development of hepatic insulin resistance in mice.
J. Proteome Res. 14, 366-373 (2015)

Bakshi, M.V. ; Azimzadeh, O. ; Barjaktarovic, Z. ; Kempf, S.J. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Buratovic, S. ; Eriksson, P. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.

Total body exposure to low-dose ionizing radiation induces long-term alterations to the liver proteome of neonatally exposed mice.
Br. J. Dermatol. 172, 994-1001 (2015)

Molin, S. ; Merl, J. ; Dietrich, K.A. ; Regauer, M. ; Flaig, M. ; Letulé, V. ; Saucke, T. ; Herzinger, T. ; Ruzicka, T. ; Hauck, S.M.

The hand eczema proteome: Imbalance of epidermal barrier proteins.
Eur. J. Cancer 50, S63 (2014)

Pastula, A. ; Hauck, S.M. ; Janssen, K.P. ; Schmid, R.M. ; Quante, M.

Mesenchymal cells regulate growth of intestinal crypts by a Wnt independent mechanism in 3D culture system.
Abstr. Pap. Am. Chem. Soc. 248:40-AGFD (2014)

Gougeon, R.D. ; Roullier-Gall, C. ; Witting, M. ; Lucio, M. ; Schmitt-Kopplin, P.

Combined non-targeted analytical methodologies for the characterization of the chemical evolution of bottled wines.
J. Chromatogr. B 978-979, 118-121 (2014)

Witting, M. ; Rudloff, H.-C. ; Thondamal, M. ; Aguilaniu, H. ; Schmitt-Kopplin, P.

Fast separation and quantification of steroid hormones Δ4- and Δ7-dafachronic acid in Caenorhabditis elegans.
J. Neuroimmunol. 275, 5-6 (2014)

Hoffmann, F. ; Kühn, P. ; Laurent, S.A. ; Hauck, S.M. ; Berer, K. ; Krumbholz, M. ; Khademi, M. ; Olsson, T. ; Dreyling, M. ; Pfister, H. ; Alexander, T. ; Hiepe, F. ; Kuempfel, T. ; Crawford, H.C. ; Wekerle, H. ; Hohlfeld, R. ; Lichtenthaler, S.F. ; Meinl, E.

ADAM10 releases the immunoregulator soluble TACI - a novel biomarker for B-cell pathologies.
2014 in
In: Dechamp, C.* ; Meon, H.* ; Chevrolat, P.* [Eds.]: AMBROISIE, the first international ragweed review. Saint-Priest, France: 2014. 32-43 ( ; 29)

Frank, U. ; El-Kelish, A. ; Zhao, F. ; Durner, J. ; Winkler, J.B. ; Behrendt, H. ; Traidl-Hoffmann, C. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Ernst, D.

Ragweed (Ambrosia artemisiifolia) pollen allergenicity: Proteome analysis upon elevated CO2 and drought stress.
Front. Chem. 2:102 (2014)

Roullier-Gall, C. ; Witting, M. ; Gougeon, R.D. ; Schmitt-Kopplin, P.

High precision mass measurements for wine metabolomics.
PLoS ONE 9:e110464 (2014)

Kempf, S.J. ; Buratovic, S. ; von Toerne, C. ; Mörtl, S. ; Stenerlöw, B. ; Hauck, S.M. ; Atkinson, M.J. ; Eriksson, P. ; Tapio, S.

Ionising radiation immediately impairs synaptic plasticity-associated cytoskeletal signalling pathways in HT22 cells and in mouse brain: An in vitro/in vivo comparison study.
Anal. Chem. 86, 10568-10575 (2014)

Huber, K. ; Feuchtinger, A. ; Borgmann, D.M. ; Li, Z. ; Aichler, M. ; Hauck, S.M. ; Zitzelsberger, H. ; Schwaiger, M. ; Keller, U. ; Walch, A.K.

A novel approach of MALDI drug imaging, immunohistochemistry, and digital image analysis for drug distribution studies in tissues.

Kühn-Steven, A. ; Nieters, A. ; Köttgen, A. ; Goek, O.N. ; Michels, K. ; Nöthlings, U. ; Jacobs, G. ; Meisinger, C. ; Pessler, F. ; Akmatov, M.F. ; Kühnisch, J. ; Moebus, S. ; Glocker, E. ; Naus, S. ; Keimling, M. ; Leitzmann, M. ; Linseisen, J. ; Sarioglu, H. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Wallaschofski, H. ; Wichmann, H.-E. ; Illig, T.

Feasibility and quality development of biomaterials in the pretest studies of the German National Cohort.
Nat. Commun. 5:4879 (2014)

Thondamal, M. ; Witting, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Aguilaniu, H.

Steroid hormone signalling links reproduction to lifespan in dietary-restricted Caenorhabditis elegans.
J. Invest. Dermatol. 134, S55 (2014)

Kretschmer, A. ; Prokisch, H. ; Eyerich, S. ; Hauck, S.M. ; Peters, A. ; Adamski, J. ; Reischl, E. ; Weidinger, S.

A common atopy-associated variant in the Th2 cytokine locus control region impacts transcriptional regulation and alters SMAD3 and SP1 binding.
PLoS ONE 9:e106886 (2014)

Vanzo, E. ; Ghirardo, A. ; Merl-Pham, J. ; Lindermayr, C. ; Heller, W. ; Hauck, S.M. ; Durner, J. ; Schnitzler, J.-P.

S-nitroso-proteome in poplar leaves in response to acute ozone stress.
J. Proteomics 109, 50-62 (2014)

Uhl, P.B. ; Szober, C.M. ; Amann, B. ; Alge-Priglinger, C.S. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

In situ cell surface proteomics reveals differentially expressed membrane proteins in retinal pigment epithelial cells during autoimmune uveitis.
Hum. Mol. Genet. 23, 5989-5997 (2014)

Becirovic, E. ; Nguyen, O.N. ; Paparizos, C. ; Butz, E.S. ; Stern-Schneider, G. ; Wolfrum, U. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Wahl-Schott, C. ; Michalakis, S. ; Biel, M.

Peripherin-2 couples rhodopsin to the CNG channel in outer segments of rod photoreceptors.
Mol. Cell. Proteomics 13, 2371-2381 (2014)

von Toerne, C. ; Menzler, J. ; Ly, A. ; Senninger, N. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M.

Identification of a novel neurotrophic factor from primary retinal Müller cells using SILAC.
Nucleic Acids Res. 42, 7833-7850 (2014)

Heim, A. ; Grimm, C. ; Müller, U. ; Häußler, S. ; Mackeen, M.M. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Kessler, B.M. ; Schofield, C.J. ; Wolf, A. ; Böttger, A.

Jumonji domain containing protein 6 (Jmjd6) modulates splicing and specifically interacts with arginine-serine-rich (RS) domains of SR- and SR-like proteins.
ISME J. 8, 2380-2396 (2014)

Walker, A. ; Pfitzner, B. ; Neschen, S. ; Kahle-Stephan, M. ; Harir, M. ; Lucio, M. ; Moritz, F. ; Tziotis, D. ; Witting, M. ; Rothballer, M. ; Engel, M. ; Schmid, M. ; Endesfelder, D. ; Klingenspor, M. ; Rattei, T. ; zu Castell, W. ; Hrabě de Angelis, M. ; Hartmann, A. ; Schmitt-Kopplin, P.

Distinct signatures of host-microbial meta-metabolome and gut microbiome in two C57BL/6 strains under high-fat diet.
Adv. Exp. Med. Biol. 801, 381-387 (2014)

Hauck, S.M. ; von Toerne, C. ; Ueffing, M.

The neuroprotective potential of retinal Müller glial cells.
Histochem. Cell Biol. 142, 361-371 (2014)

Huber, K. ; Aichler, M. ; Sun, N. ; Buck, A. ; Li, Z. ; Fernandez, I.E. ; Hauck, S.M. ; Zitzelsberger, H. ; Eickelberg, O. ; Janssen, K.P. ; Keller, U. ; Walch, A.K.

A rapid ex vivo tissue model for optimising drug detection and ionisation in MALDI imaging studies.
Exp. Dermatol. 23, E22 (2014)

Kretschmer, A. ; Moeller, G. ; Prokisch, H. ; Eyerich, S. ; Wahl, S. ; Eyerich, K. ; Hauck, S.M. ; Illig, T. ; Peters, A. ; Waldenberger, M. ; Adamski, J. ; Reischl, E. ; Weidinger, S.

A common atopy-associated variant in the Th2 cytokine locus control region impacts transcriptional regulation and alters SMAD3 and SP1 binding.
J. Proteome Res. 13, 2005-2018 (2014)

Velikova, V.B. ; Ghirardo, A. ; Vanzo, E. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Schnitzler, J.-P.

Genetic manipulation of isoprene emissions in poplar plants remodels the chloroplast proteome.
Leukemia 28, 2355-2366 (2014)

Klar, R. ; Schober, S. ; Rami, M. ; Mall, S. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Admon, A. ; Slotta-Huspenina, J. ; Schwaiger, M. ; Stevanovic, S. ; Oostendorp, R.A. ; Busch, D.H. ; Peschel, C. ; Krackhardt, A.M.

Therapeutic targeting of naturally presented myeloperoxidase-derived HLA peptide ligands in myeloid leukemia cells by TCR-transgenic T cells.
Water Res. 57, 280-294 (2014)

Zhang, F. ; Harir, M. ; Moritz, F. ; Zhang, J. ; Witting, M. ; Wu, Y. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Fekete, A. ; Gáspár, A. ; Hertkorn, N.

Molecular and structural characterization of dissolved organic matter during and post cyanobacterial bloom in Taihu by combination of NMR spectroscopy and FTICR mass spectrometry.
Allergy 69, 632-642 (2014)

Kretschmer, A. ; Möller, G. ; Lee, H.K. ; Laumen, H. ; von Toerne, C. ; Schramm, K. ; Prokisch, H. ; Eyerich, S. ; Wahl, S. ; Baurecht, H. ; Franke, A. ; Claussnitzer, M. ; Eyerich, K. ; Teumer, A. ; Milani, L. ; Klopp, N. ; Hauck, S.M. ; Illig, T. ; Peters, A. ; Waldenberger, M. ; Adamski, J. ; Reischl, E. ; Weidinger, S.

A common atopy-associated variant in the TH2 cytokine locus control region impacts transcriptional regulation and alters SMAD3 and SP1 binding.
PLoS ONE 9:e91684 (2014)

Degroote, R.L. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Hirmer, S. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

Unraveling the equine lymphocyte proteome: Differential septin 7 expression associates with immune cells in equine recurrent uveitis.
Genome Res. 24, 592-603 (2014)

Spieler, D. ; Kaffe, M. ; Knauf, F. ; Bessa, J. ; Tena, J.J. ; Giesert, F. ; Schormair, B. ; Tilch, E. ; Lee, H. ; Horsch, M. ; Czamara, D. ; Karbalai, N. ; von Toerne, C. ; Waldenberger, M. ; Gieger, C. ; Lichtner, P. ; Claussnitzer, M. ; Naumann, R. ; Müller-Myhsok, B. ; Torres, M. ; Garrett, L. ; Rozman, J. ; Klingenspor, M. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Beckers, J. ; Hölter, S.M. ; Meitinger, T. ; Hauck, S.M. ; Laumen, H. ; Wurst, W. ; Casares, F. ; Gómez-Skarmeta, J.L. ; Winkelmann, J.

Restless Legs Syndrome-associated intronic common variant in Meis1 alters enhancer function in the developing telencephalon.
J. Neurochem. 130, 227-240 (2014)

Kucharska, J. ; del Río, P. ; Arango-González, B. ; Gorza, M. ; Feuchtinger, A. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M.

Cyr61 activates retinal cells and prolongs photoreceptor survival in rd1 mouse model of retinitis pigmentosa.
Mol. Cell. Proteomics 13, 733-748 (2014)

Pischedda, F. ; Szczurkowska, J. ; Cirnaru, M.D. ; Giesert, F. ; Vezzoli, E. ; Ueffing, M. ; Sala, C. ; Francolini, M. ; Hauck, S.M. ; Cancedda, L. ; Piccoli, G.

A cell surface biotinylation assay to reveal membrane-associated neuronal cues: Negr1 regulates dendritic arborization.
J. Neurosci. 34, 2797-2812 (2014)

Griciuc, A. ; Roux, M.J. ; Merl, J. ; Giangrande, A. ; Hauck, S.M. ; Aron, L. ; Ueffing, M.

Proteomic survey reveals altered energetic patterns and metabolic failure prior to retinal degeneration.
Proteomics 14, 913-923 (2014)

Sun, N. ; Ly, A. ; Meding, S. ; Witting, M. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Aichler, M. ; Walch, A.K.

High-resolution metabolite imaging of light and dark treated retina using MALDI-FTICR mass spectrometry.
Cell 156, 343-358 (2014)

Claussnitzer, M. ; Dankel, S.N. ; Klocke, B. ; Grallert, H. ; Glunk, V. ; Berulava, T. ; Lee, H.K. ; Oskolkov, N. ; Fadista, J. ; Ehlers, K. ; Wahl, S. ; Hoffmann, C. ; Qian, K. ; Rönn, T. ; Riess, H. ; Müller-Nurasyid, M. ; Bretschneider, N. ; Schroeder, T. ; Skurk, T. ; Horsthemke, B. ; DIAGRAM Consortium (Gieger, C. ; Huth, C. ; Klopp, N. ; Meitinger, T. ; Petersen, A.-K. ; Thorand, B. ; Wichmann, H.-E.) ; Spieler, D. ; Klingenspor, M. ; Seifert, M. ; Kern, M.J. ; Mehjert, N. ; Dahlman, I. ; Hansson, O. ; Hauck, S.M. ; Blüher, M. ; Arner, P. ; Groop, L. ; Illig, T. ; Suhre, K. ; Hsu, Y.H. ; Mellgren, G. ; Hauner, H. ; Laumen, H.

Leveraging cross-species transcription factor binding site patterns: From diabetes risk loci to disease mechanisms.
J. Anim. Physiol. Anim. Nutr. 98, 32–42 (2014)

Amann, B. ; Hirmer, S. ; Hauck, S.M. ; Kremmer, E. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

True blue: S-opsin is widely expressed in different animal species.
2013 in
München, Technische Universität, Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan, Diss., 2013, 179 S.

Witting, M.

Host-Pathogen metabolomics of Pseudomonas aeruginosa infection models.
PLoS ONE 8:e82392 (2013)

Frankó, A. ; Baris, O.R. ; Bergschneider, E. ; von Toerne, C. ; Hauck, S.M. ; Aichler, M. ; Walch, A.K. ; Wurst, W. ; Wiesner, R.J. ; Johnston, I.C.D. ; Hrabě de Angelis, M.

Efficient isolation of pure and functional mitochondria from mouse tissues using automated tissue disruption and enrichment with anti-TOM22 magnetic beads.
Vet. J. 198, 625-630 (2013)

Treutlein, G. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Hartmann, K. ; Dorsch, R.

Follow-up protein profiles in urine samples during the course of obstructive feline idiopathic cystitis.
J. Proteome Res. 12, 5812–5819 (2013)

Degroote, R.L. ; Hauck, S.M. ; Treutlein, G. ; Amann, B. ; Fröhlich, K.J.H. ; Kremmer, E. ; Merl, J. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M. ; Deeg, C. A.

Expression changes and novel interaction partners of talin 1 in effector cells of autoimmune uveitis.
Talanta 118, 45-53 (2013)

Lin, S. ; Kanawati, B. ; Liu, L. ; Witting, M. ; Li, M. ; Huang, J. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Cai, Z.

Ultrahigh resolution mass spectrometry-based metabolic characterization reveals cerebellum as a disturbed region in two animal models.

Mossina, A. ; Merl, J. ; Vosyka, O. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Meiners, S.

Proteomic profiling of alveolar epithelial cells exposed to cigarette smoke extract.

Gimm, T. ; Hoeland, A. ; Schwarz, M. ; Hossain, H. ; Ehrhardt, H. ; Gortner, L. ; Scholz, M. ; Reicherzer, T. ; Hauck, S.M. ; Hilgendorff, A.

Identification of biomarkers for early diagnosis in BPD.
Bone Marrow Transplant. 48, S74-S75 (2013)

Klar, R. ; Schober, S. ; Rami, M. ; Sarioglu, H. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Admon, A. ; Barnea, E. ; Kremmer, E. ; Oostendorp, R. ; Stevanovic, S. ; Busch, D.H. ; Peschel, C. ; Krackhardt, A.M.

Immunoproteomic identification of naturally presented epitopes presented on primary myeloid leukaemia cells and their potential as targets for T-cell receptor gene modified donor lymphocyte infusions.
Diabetologia 57, 192-203 (2013)

Ly, A. ; Scheerer, M.F. ; Zukunft, S. ; Muschet, C. ; Merl, J. ; Adamski, J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Neschen, S. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M.

Retinal proteome alterations in a mouse model of type 2 diabetes.
PLoS ONE 8:e70011 (2013)

Priglinger, C.S. ; Szober, C.M. ; Priglinger, S.G. ; Merl, J. ; Euler, K.N. ; Kernt, M. ; Gondi, G. ; Behler, J. ; Geerlof, A. ; Kampik, A. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M.

Galectin-3 induces clustering of CD147 and integrin-β1 transmembrane glycoprotein receptors on the RPE cell surface.
Neuroscience 246, 59-72 (2013)

Wahl, V. ; Vogler, S. ; Grosche, A. ; Pannicke, T. ; Ueffing, M. ; Wiedemann, P. ; Reichenbach, A. ; Hauck, S.M. ; Bringmann, A.

Osteopontin inhibits osmotic swelling of retinal glial (Müller) cells by inducing release of VEGF.
Radiat. Environ. Biophys. 52, 451-461 (2013)

Bakshi, M.V. ; Barjaktarovic, Z. ; Azimzadeh, O. ; Kempf, S.J. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Eriksson, P. ; Buratovic, S. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.

Long-term effects of acute low-dose ionizing radiation on the neonatal mouse heart: A proteomic study.
Nanotechnol. 24:265103 (2013)

Schäffler, M. ; Semmler-Behnke, M. ; Sarioglu, H. ; Takenaka, S. ; Wenk, A. ; Schleh, C. ; Hauck, S.M. ; Johnston, B.D. ; Kreyling, W.G.

Serum protein identification and quantification of the corona of 5, 15 and 80 nm gold nanoparticles.
Mol. Vis. 19, 904-916 (2013)

Veiga-Crespo, P. ; del Río, P. ; Blindert, M. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M. ; Vecino, E.

Phenotypic map of porcine retinal ganglion cells.
J. Pathol. 230, 410-419 (2013)

Aichler, M. ; Elsner, M. ; Ludyga, N. ; Feuchtinger, A. ; Zangen, V. ; Maier, S.K. ; Balluff, B. ; Schöne, C. ; Hierber, L. ; Braselmann, H. ; Meding, S. ; Rauser, S. ; Zischka, H. ; Aubele, M. ; Schmitt, M. ; Feith, M. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Langer, R. ; Kuester, B. ; Zitzelsberger, H. ; Höfler, H. ; Walch, A.K.

Clinical response to chemotherapy in oesophageal adenocarcinoma patients is linked to defects in mitochondria.
J. Proteome Res. 12, 1331-1343 (2013)

von Toerne, C. ; Kahle-Stephan, M. ; Schäfer, A. ; Ispiryan, R. ; Blindert, M. ; Hrabě de Angelis, M. ; Neschen, S. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M.

Apoe, Mbl2 and Psp plasma protein levels correlate with diabetic phenotype in NZO mice - an optimized rapid workflow for SRM-based quantification.
2012 in
Vortrag: International Symposium on Climate Change and Human Activities: Coastal Consequences and Responses, 28 - 31 October 2012, Shanghai (2012)

Zhang, F. ; Zhang, J. ; Harir, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Witting, M. ; Fekete, A. ; Wu, Y. ; Gáspár, A. ; Hertkorn, N.

Characterization of dissolved organic matter during and after cyanobacterium (Microcystis aeruginosa) bloom in Taihu Lake, China.
2012 in
In: Suhre, K.* [Eds.]: Genetics Meets Metabolomics: From Experiment to Systems Biology. Heidelberg: Springer, 2012. 57-71

Witting, M. ; Lucio, M. ; Tziotis, D.

Ultrahigh resolution mass spectrometry based non-targeted microbial metabolomics.
PLoS ONE 7:e51391 (2012)

Treutlein, G. ; Dorsch, R. ; Euler, K.N. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Hartmann, K. ; Deeg, C.A.

Novel potential interacting partners of fibronectin in spontaneous animal model of interstitial cystitis.
J. Proteome Res. 11, 5748-5762 (2012)

Gündisch, S. ; Hauck, S.M. ; Sarioglu, H. ; Schott, C. ; Viertler, C. ; Kap, M. ; Schuster, T. ; Reischauer, B. ; Rosenberg, R. ; Verhoef, C. ; Mischinger, H.-J. ; Riegman, P. ; Zatloukal, K. ; Becker, K.-F.

Variability of protein and phosphoprotein levels in clinical tissue specimens during the preanalytical phase.
Int. J. Mol. Sci. 13, 14053-14072 (2012)

Szober, C.M. ; Hauck, S.M. ; Euler, K.N. ; Fröhlich, K.J.H. ; Alge-Priglinger, C.S. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

Profound re-organization of cell surface proteome in equine retinal pigment epithelial cells in response to in vitro culturing.
J. Pathol. 228, 459-470 (2012)

Meding, S. ; Balluff, B. ; Elsner, M. ; Schöne, C. ; Rauser, S. ; Nitsche, U. ; Maak, M. ; Schäfer, A. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Langer, R. ; Höfler, H. ; Friess, H. ; Rosenberg, R. ; Walch, A.K.

Tissue-based proteomics reveals FXYD3, S100A11 and GSTM3 as novel markers for regional lymph node metastasis in colon cancer.
Vet. Ophthalmol. 15, 57-64 (2012)

Zipplies, J.K. ; Hauck, S.M. ; Eberhardt, C. ; Hirmer, S. ; Amann, B. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

Miscellaneous vitreous-derived IgM antibodies target numerous retinal proteins in equine recurrent uveitis.
J. Proteomics 75, 4536-4544 (2012)

Degroote, R.L. ; Hauck, S.M. ; Kremmer, E. ; Amann, B. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

Altered expression of talin 1 in peripheral immune cells points to a significant role of the innate immune system in spontaneous autoimmune uveitis.
J. Proteomics 75, 4545-4554 (2012)

Hauck, S.M. ; Hofmaier, F. ; Dietter, J. ; Swadzba, M.E. ; Blindert, M. ; Amann, B. ; Behler, J. ; Kremmer, E. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

Label-free LC-MSMS analysis of vitreous from autoimmune uveitis reveals a significant decrease in secreted Wnt signalling inhibitors DKK3 and SFRP2.
PLoS ONE 7:e39860 (2012)

Wägele, B. ; Witting, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Suhre, K.

MassTRIX reloaded: Combined analysis and visualization of transcriptome and metabolome data.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 53, 294-300 (2012)

Swadzba, M.E. ; Hirmer, S. ; Amann, B. ; Hauck, S.M. ; Deeg, C.A.

Vitreal IgM autoantibodies target neurofilament medium in a spontaneous model of autoimmune uveitis.
J. Proteomics 75, 2384-2395 (2012)

Azimzadeh, O. ; Scherthan, H. ; Yentrapalli, R. ; Barjaktarovic, Z. ; Ueffing, M. ; Conrad, M. ; Neff, F. ; Calzada-Wack, J. ; Aubele, M. ; Buske, C. ; Atkinson, M.J. ; Hauck, S.M. ; Tapio, S.

Label-free protein profiling of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) heart tissue reveals immediate mitochondrial impairment after ionising radiation.
Am. J. Vet. Res. 72, 1407-1415 (2011)

Lemberger, S.I. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Hirmer, S. ; Hartmann, K. ; Dorsch, R.

Comparison of urine protein profiles in cats without urinary tract disease and cats with idiopathic cystitis, bacterial urinary tract infection, or urolithiasis.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 52, 5941-5954 (2011)

Limb, G.A. ; Martin, K.R ; Sixth ARVO/Pfizer Ophthalmics Research Institute Conference Working Group (Hauck, S.M.)

Current prospects in optic nerve protection and regeneration: Sixth ARVO/Pfizer Ophthalmics Research Institute conference.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 52, 2314-2320 (2011)

Hofmaier, F. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Degroote, R.L. ; Deeg, C.A.

Changes in matrix metalloproteinase network in a spontaneous autoimmune uveitis model.
Glia 59, 821-832 (2011)

del Río, P. ; Irmler, M. ; Arango-González, B. ; Favor, J. ; Bobe, C. ; Bartsch, U. ; Vecino, E. ; Beckers, J. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M.

GDNF-induced osteopontin from Müller glial cells promotes photoreceptor survival in the Pde6brd1 mouse model of retinal degeneration.
BJU Int. 107, 670-677 (2011)

Lemberger, S.I. ; Dorsch, R. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Hirmer, S. ; Hartmann, K. ; Deeg, C.A.

Decrease of Trefoil factor 2 in cats with feline idiopathic cystitis.

Zipplies, J.K. ; Kirschfink, M. ; Amann, B. ; Hauck, S.M. ; Stangassinger, M. ; Deeg, C.A.

Complement factor B expression profile in a spontaneous uveitis model.
Aids 24, 2433-2442 (2010)

Vincendeau, M. ; Kramer, S. ; Hadian, K. ; Rothenaigner, I. ; Bell, J. ; Hauck, S.M. ; Bickel, C. ; Nagel, D. ; Kremmer, E. ; Werner, T. ; Leib-Mösch, C. ; Brack-Werner, R.

Control of HIV replication in astrocytes by a family of highly conserved host proteins with a common Rev-interacting domain (Risp).
Mol. Cell. Proteomics 9, 2292-2305 (2010)

Hauck, S.M. ; Dietter, J. ; Kramer, R.L. ; Hofmaier, F. ; Zipplies, J.K. ; Amann, B. ; Feuchtinger, A. ; Deeg, C.A. ; Ueffing, M.

Deciphering membrane-associated molecular processes in target tissue of autoimmune uveitis by label-free quantitative mass spectrometry.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 51, 375-382 (2010)

Zipplies, J.K. ; Hauck, S.M. ; Schoeffmann, S. ; Amann, B. ; van der Meijden, C.H. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

Kininogen in autoimmune uveitis: Decrease in peripheral blood stream versus increase in target tissue.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 51, 79-88 (2010)

Körtvely, E. ; Hauck, S.M. ; Duetsch, G. ; Gloeckner, C.J. ; Kremmer, E. ; Alge-Priglinger, C.S. ; Deeg, C.A. ; Ueffing, M.

ARMS2 is a constituent of the extracellular matrix providing a link between familial and sporadic age-related macular degenerations.
J. Proteome Res. 8, (Sp. Iss. SI), 992-998 (2009)

Zipplies, J.K. ; Hauck, S.M. ; Schoeffmann, S. ; Amann, B. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M. ; Deeg, C.A.

Serum PEDF levels are decreased in a spontaneous animal model for human autoimmune uveitis.
J. Neurochem. 108, 796-810 (2009)

Paquet-Durand, F. ; Hauck, S.M. ; van Veen, T. ; Ueffing, M. ; Ekström, P.

PKG activity causes photoreceptor cell death in two retinitis pigmentosa models.
Parasit. Vectors 2:6 (2009)

Roelfstra, L. ; Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Buse, C. ; Membrez, M. ; Betschart, B. ; Pfister, K.

Protein expression profile of Gasterophilus intestinalis larvae causing horse gastric myiasis and characterization of horse immune reaction.
J. Biol. Chem. 284, 33384-33391 (2009)

Hadian, K. ; Vincendeau, M. ; Mäusbacher, N. ; Nagel, D. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Loyter, A. ; Werner, T. ; Wolff, H. ; Brack-Werner, R.

Identification of a heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-recognition region in the HIV Rev protein.
2009 in
Vortrag: 34th Annual Meeting on Retroviruses in CSHL, 17th May 2009, CSHL, NY, USA. (2009)

Vincendeau, M. ; Kramer, S. ; Hadian, K. ; Rothenaigner, I. ; Bell, J. ; Hauck, S.M. ; Bickel, C. ; Kremmer, E. ; Leib-Mösch, C. ; Brack-Werner, R.

A novel family of host cell factors that control hiv production by targeting rev.
Vet. Immunol. Immunopathol. 124, 177-183 (2008)

Braus, B.K. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Heinrich, C. ; Fritsche, J. ; Koestlin, R. ; Deeg, C.A.

Neuron-specific enolase antibodies in patients with sudden acquired retinal degeneration syndrome.
Mol. Cell. Proteomics 7, 1349-1361 (2008)

Hauck, S.M. ; Gloeckner, C.J. ; Harley, M.E. ; Schoeffmann, S. ; Boldt, K. ; Ekström, P.A. ; Ueffing, M.

Identification of paracrine neuroprotective candidate proteins by a functional assay-driven proteomics approach.
Ophthalmic Res. 40, 151-153 (2008)

Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Pompetzki, D. ; Altmann, F. ; Raith, A. ; Schmalzl, T. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M.

Equine recurrent uveitis: A spontaneous horse model of uveitis.
Electrophoresis 29, 1325-1332 (2008)

Buse, C. ; Altmann, F. ; Amann, B. ; Hauck, S.M. ; Nautrup, C.P. ; Ueffing, M. ; Stangassinger, M. ; Deeg, C. A.

Discovering novel targets for autoantibodies in dilated cardiomyopathy.
Clin. Dev. Immunol. 2007:39245 (2007)

Deeg, C.A. ; Raith, A.J. ; Amann, B. ; Crabb, J.W. ; Thurau, S.R. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Wildner, G. ; Stangassinger, M.

CRALBP is a highly prevalent autoantigen for human autoimmune uveitis.
J. Neurosci. 27, 10311-10319 (2007)

Paquet-Durand, F. ; Silva, J. ; Talukdar, T. ; Johnson, L.E. ; Azadi, S. ; van Veen, T. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M. ; Ekström, P.A.

Excessive activation of poly(ADP-ribose) polymerase contributes to inherited photoreceptor degeneration in the retinal degeneration 1 mouse.
Mol. Immunol. 44, 3291-3296 (2007)

Deeg, C.A. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Kremmer, E. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M.

Major retinal autoantigens remain stably expressed during all stages of spontaneous uveitis.
Glia 55, 1061-1073 (2007)

Swiatek-de Lange, M. ; Stampfl, A. ; Hauck, S.M. ; Zischka, H. ; Gloeckner, C.J. ; Deeg, C.A. ; Ueffing, M.

Membrane-initiated effects of progesterone on calcium dependent signaling and activation of VEGF gene expression in retinal glial cells.
Proteomics 7, 1540-1548 (2007)

Deeg, C.A. ; Altmann, F. ; Hauck, S.M. ; Schoeffmann, S. ; Amann, B. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M.

Down-regulation of pigment epithelium-derived factor in uveitic lesion associates with focal vascular endothelial growth factor expression and breakdown of the blood-retinal barrier.
J. Proteome Res. 6, 2121-2131 (2007)

Hauck, S.M. ; Schoeffmann, S. ; Amann, B. ; Stangassinger, M. ; Gerhards, H. ; Ueffing, M. ; Deeg , C.A.

Retinal Mueller Glial Cells Trigger the Hallmark Inflammatory Process in Autoimmune Uveitis.
Anat. Histol. Embryol. 35, 412-415 (2006)

Deeg, C.A. ; Amann, B. ; Hauck, S.M. ; Kaspers, B.

Defining cytochemical markers for different cell types in the equine retina.
Mol. Cell. Proteomics 5, 2185-2200 (2006)

Zischka, H. ; Braun, R.J. ; Marantidis, E.P. ; Büringer, D. ; Bornhövd, C. ; Hauck, S.M. ; Demmer, O. ; Gloeckner, C.J. ; Reichert, A.S. ; Madeo, F. ; Ueffing, M.

Differential analysis of Saccharomyces cerevisiae mitochondria by free flow electrophoresis.
Mol. Cell. Proteomics 5, 1462-1470 (2006)

Deeg, C.A. ; Pompetzki, D. ; Raith, A.J. ; Hauck, S.M. ; Amann, B. ; Suppmann, S. ; Goebel, T.W. ; Olazabal, U. ; Gerhards, H. ; Reese, S. ; Stangassinger, M. ; Kaspers, B. ; Ueffing, M.

Identification and functional validation of novel autoantigens in equine uveitis.
Mol. Cell. Proteomics 5, 324-336 (2006)

Hauck, S.M. ; Ekström, P.A.R. ; Ahuja-Jensen, P. ; Suppmann, S. ; Paquet-Durand, F. ; van Veen, T. ; Ueffing, M.

Differential modification of phosducin protein in degenerating rd1 retina is associated with constitutively active Ca2+/calmodulin kinase II in rod outer segments.
Mol. Cell. Biol. 26, 2746-2757 (2006)

Hauck, S.M. ; Kinkl, N. ; Deeg, C.A. ; Swiatek-de Lange, M. ; Schöffmann, S. ; Ueffing, M.

GDNF family ligands trigger indirect neuroprotective signaling in retinal glial cells.
J. Neurochem. 96, 802-814 (2006)

Paquet-Durand, F. ; Azadi, S. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; van Veen, T. ; Ekström, P.

Calpain is activated in degenerating photoreceptors in the rd1 mouse.
Proteomics 5, 3623-3636 (2005)

Hauck, S.M. ; Schoeffmann, S. ; Deeg, C.A. ; Gloeckner, C.J. ; Swiatek-de Lange, M. ; Ueffing, M.

Proteomic analysis of the porcine interphotoreceptor matrix.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 44, 3629-3641 (2003)

Alge, C.S. ; Suppmann, S. ; Priglinger, S.G. ; Neubauer, A.S. ; May, C.A. ; Hauck, S.M. ; Welge-Lussen, U. ; Ueffing, M. ; Kampik, A.

Comparative proteome analysis of native differentiated and cultured dedifferentiated human RPE cells.