Environmental Health Center
Plant Genome and Systems Biology
The PGSB plant genomics group focuses on the analysis of plant genomes, using bioinformatic techniques. Our mission is to develop options for a sustainable use of plants and understand how climate change impacts crops, food security and human health.
The PGSB plant genomics group focuses on the analysis of plant genomes, using bioinformatic techniques. Our mission is to develop options for a sustainable use of plants and understand how climate change impacts crops, food security and human health.
Scientists at PGSB
Publications
Chen, E. ; Wehrkamp, C.M. ; Jhingan, S. ; Lux, T. ; Zhu, Z. ; Chen, J. ; Tulpová, Z. ; Himmelbach, A. ; Fuchs, J. ; Feng, J. ; Rabanus‐Wallace, M.T. ; Hana Šimková, ; Spannagl, M. ; Mascher, M. ; Wicker, T. ; Houben, A. ; Stein, N.
Unveiling centromeric retrotransposon dynamics through a high-quality rye genome assembly.Zhang, K. ; He, Y. ; Lin, H. ; He, J. ; Wang, Z. ; Li, W. ; Chen, Y. ; Li, J. ; Shi, Y. ; Huang, X. ; Ding, M. ; Yang, P. ; Chen, Z. ; Chitikineni, A. ; Li, J. ; Gao, J. ; Feng, B. ; Zhang, Z. ; Hao, M. ; Mir, R.R. ; Liu, D. ; Woo, S.H. ; Janovská, D. ; Quinet, M. ; Fernie, A.R. ; Liao, W. ; Feng, X. ; Gauchan, D.P. ; Dhami, N. ; Kreft, I. ; Piński, A. ; Betekhtin, A. ; Spannagl, M. ; Liu, X. ; Varshney, R.K. ; Liu, J. ; Zhou, M.
Pangenome-guided breeding restores high-altitude adaptation and improves yield in Tartary buckwheat.Mazzucotelli, E. ; Forestan, C. ; Zastrow-Hayes, G. ; Swarbreck, D. ; Lev-Mirom, Y. ; Cavalet-Giorsa, E. ; Bozzoli, M. ; Mastrangelo, A.M. ; Marone, D. ; Ranwez, V. ; Girodolle, J. ; Llaca, V. ; Fengler, K. ; Harris, C. ; Toegelová, H. ; Navrátilová, P. ; Faccioli, P. ; Desiderio, F. ; Valladares, A.P. ; Kaithakottil, G. ; Rusholme-Pilcher, R.L. ; Spannagl, M. ; Gundlach, H. ; Mayer, K.F.X. ; Blake, V.C. ; Faris, J.D. ; Xu, S.S. ; Sen, T.Z. ; Yao, E. ; Sánchez, J.I.Y. ; Liu, C. ; Farooq, M.A. ; Stefanelli, S. ; Cappucci, C. ; Oren, L. ; Eilam, T. ; Giorgioni, M. ; Stella, A. ; Lazzari, B. ; Lauria, M. ; Ceriotti, A. ; Pirona, R. ; Tavakol, E. ; Klymiuk, V. ; Ens, J. ; Chawla, H.S. ; Walkowiak, S. ; Pecchioni, N. ; Bassi, F.M. ; Sanchez-Garcia, M. ; Sonnante, G. ; Curci, P.L. ; Giuliano, G. ; Aprea, G. ; Pasha, A. ; Gadaleta, A. ; Marcotuli, I. ; Masci, S. ; Sestili, F. ; Palombieri, S. ; Scaglione, D. ; Morgante, M. ; Šimková, H. ; Provart, N.J. ; Krattinger, S.G. ; Pozniak, C.J. ; Chantret, N. ; Hall, A. ; Distelfeld, A. ; Tuberosa, R. ; Maccaferri, M. ; Cattivelli, L.
Durum wheat cv. svevo reference genome rel.2.0: A comprehensive tool for wheat genomics.Hu, B. ; Hänsch, R. ; Grunau, K. ; Hohtanz, L. ; Kucklick, M. ; Grünig, N. ; Haensch, V.G. ; Liu, R. ; Peng, T. ; Wiebicke, M. ; Fard, I.S. ; Messerer, M. ; Gädeke, F. ; Stradal, T.E.B. ; Milatz, M. ; Hertweck, C. ; Engelmann, S. ; Rennenberg, H. ; Oliphant, K.D.
Symbiotic peptides modulate rhizobial physiology without terminal differentiation.Varshney, R.K. ; Garg, V. ; Spannagl, M. ; Dreisigacker, S.
Genomics for next-generation wheat breeding.Kale, S.M. ; Gundlach, H. ; Gericke, O. ; Kamal, N. ; Almeida, A. ; Pitra, N. ; Price, N. ; Haberer, G. ; Lux, T. ; Krsticevic, F. ; Kemp, O. ; Bang, L.d. ; Himmelbach, A. ; Padmarasu, S. ; Rabanus-Wallace, M. ; Hořáková, L. ; Bačovský, V. ; Nielsen, K. ; Bjarnholt, N. ; Mićić, N. ; Kruse-Andersen, I. ; Møller, B.L. ; Janfelt, C. ; Skadhauge, B. ; Matthews, P.D. ; Mayer, K.F.X. ; Stein, N. ; Mascher, M. ; Spannagl, M. ; Feiner, A. ; Braumann, I.
Extensive variation between chromosomes of North American and European hop.Brightly, W.H. ; Fjellheim, S. ; Lux, T. ; Mullinger, M.D. ; Osborne, C.P. ; Preston, J.C. ; Sandve, S.R. ; Vorontsova, M.S. ; Dunning, L.T.
Cold origins limit the establishment of northern temperate plants in the Southern Hemisphere.Wang, J. ; Li, L. ; Li, C. ; Reynolds, M. ; Spannagl, M. ; Schnitzler, J.-P. ; Zhao, Y. ; Ma, Z. ; Xu, J. ; Mao, X. ; Jing, R.
TaWAK5 perceives OGs to activate drought responses in wheat.Tao, X.Y. ; Tan, C. ; Liu, Y. ; Wang, Y. ; Raza, A. ; He, J. ; Wang, L. ; Xia, K. ; Yan, Y. ; Liao, S. ; Jiang, W. ; Qu, Y. ; Xu, B. ; Zhou, Y. ; Yang, X. ; Roy, S. ; Denton, M. ; Tucker, M. ; Able, J. ; Gilliham, M. ; Langridge, P. ; Hu, H.W. ; He, J.Z. ; Zhao, C. ; Zhou, M. ; Mir, R.R. ; Chitikineni, A. ; Li, C. ; Zhang, P. ; Trethowan, R. ; Ding, Y. ; Zhang, J. ; Franks, P. ; Wu, Q. ; Ye, L. ; Wang, Y. ; Wu, F. ; Zhang, G. ; Cai, S. ; Shen, Q. ; Jiang, H. ; Chen, G. ; Zhou, Y. ; Song, C. ; Zhang, Y. ; Ma, W. ; Li, X. ; Guo, W. ; Zeng, J. ; He, X. ; Liu, W. ; Feng, X. ; Zhang, R. ; Li, G. ; Cao, X. ; Liu, S. ; Liu, Q. ; Chen, J. ; Zhang, X. ; Liu, L. ; Zeng, F. ; Deng, F. ; Qin, Y. ; Zhu, X. ; Shabala, S. ; Tee, E.E. ; Schnurbusch, T. ; Mascher, M. ; Wu, H. ; Spannagl, M. ; Xin, M. ; Gou, J. ; Brar, G. ; Xue, D. ; Wang, W. ; Reynolds, M. ; Zhao, Y. ; Liu, Z. ; Krugman, T. ; Sakata, Y. ; Yee, S. ; Chan, K. ; Pogson, B. ; Zhang, Y. ; Marchant, D.B. ; Siddique, K.H.M. ; Fang, X. ; Chen, A. ; Henry, R. ; Boden, S.A. ; Varshney, R.K. ; Xu, S.C. ; Xu, X. ; Chen, Z.H.
The potential of wheat spatial omics.Fenn, A. ; Correia de Lemos, S.M. ; Lahaye, T. ; Becker, C. ; Hückelhoven, R. ; Kamal, N.
Shaping immunity: Genetic diversity as a key resource for crop protection.