Environmental Health Center
Plant Genome and Systems Biology
The PGSB plant genomics group focuses on the analysis of plant genomes, using bioinformatic techniques. Our mission is to develop options for a sustainable use of plants and understand how climate change impacts crops, food security and human health.
The PGSB plant genomics group focuses on the analysis of plant genomes, using bioinformatic techniques. Our mission is to develop options for a sustainable use of plants and understand how climate change impacts crops, food security and human health.
Scientists at PGSB
Publications
Lin, Y.-C. ; Urbany, C. ; Shlykova, A. ; Hölker, A.C. ; Ouzunova, M. ; Presterl, T. ; Pook, T. ; Mayer, M. ; Urzinger, S. ; Schön, C.C.
Genetic dissection of grain yield and correlated proxy traits under suboptimal conditions.Jafarian, S. ; Geyer, M. ; Buegger, F. ; Winkler, J.B. ; Gerl, G. ; Mayer, K.F.X. ; Kamal, N. ; Schnitzler, J.-P. ; Hartl, L. ; Spannagl, M.
Identification of marker genes for drought stress tolerance in wheat (Triticum aestivum) through carbon isotope composition.Mijan, R.D. ; Poudel, B. ; Thapa, S. ; Ajayi-Moses, O. ; Lux, T. ; Avni, R. ; Xu, S. ; Spannagl, M. ; Mascher, M. ; Maughan, J. ; Fiedler, J.D.
Chromosome-scale assembly of wheat cultivar Sumai 3, a major germplasm source for Fusarium head blight resistance.Zhang, M. ; Castellani, M. ; Steckenborn, S. ; Majka, M. ; Tsipas, G. ; Nascimento, T. ; Neumann, U. ; Thangavel, G. ; Robledillo, L.A. ; Lux, T. ; Deberon, L. ; Pfordt, U. ; Campoy, J.A. ; Vijayan, A. ; Timmers, T. ; Sargheini, N. ; Marek, M. ; Sun, H. ; Hofstatter, P.G. ; Hüettel, B. ; Dreißig, S. ; Mayer, K.F.X. ; Figueiredo, D.D. ; Vanzela, A.L.L. ; Schneeberger, K. ; Marques, A.
Sex without crossovers mimics clonal reproduction in Rhynchospora tenuis.Chen, E. ; Wehrkamp, C.M. ; Jhingan, S. ; Lux, T. ; Zhu, Z. ; Chen, J. ; Tulpová, Z. ; Himmelbach, A. ; Fuchs, J. ; Feng, J. ; Rabanus‐Wallace, M.T. ; Hana Šimková, ; Spannagl, M. ; Mascher, M. ; Wicker, T. ; Houben, A. ; Stein, N.
Unveiling centromeric retrotransposon dynamics through a high-quality rye genome assembly.Zhang, K. ; He, Y. ; Lin, H. ; He, J. ; Wang, Z. ; Li, W. ; Chen, Y. ; Li, J. ; Shi, Y. ; Huang, X. ; Ding, M. ; Yang, P. ; Chen, Z. ; Chitikineni, A. ; Li, J. ; Gao, J. ; Feng, B. ; Zhang, Z. ; Hao, M. ; Mir, R.R. ; Liu, D. ; Woo, S.H. ; Janovská, D. ; Quinet, M. ; Fernie, A.R. ; Liao, W. ; Feng, X. ; Gauchan, D.P. ; Dhami, N. ; Kreft, I. ; Piński, A. ; Betekhtin, A. ; Spannagl, M. ; Liu, X. ; Varshney, R.K. ; Liu, J. ; Zhou, M.
Pangenome-guided breeding restores high-altitude adaptation and improves yield in Tartary buckwheat.Mazzucotelli, E. ; Forestan, C. ; Zastrow-Hayes, G. ; Swarbreck, D. ; Lev-Mirom, Y. ; Cavalet-Giorsa, E. ; Bozzoli, M. ; Mastrangelo, A.M. ; Marone, D. ; Ranwez, V. ; Girodolle, J. ; Llaca, V. ; Fengler, K. ; Harris, C. ; Toegelová, H. ; Navrátilová, P. ; Faccioli, P. ; Desiderio, F. ; Valladares, A.P. ; Kaithakottil, G. ; Rusholme-Pilcher, R.L. ; Spannagl, M. ; Gundlach, H. ; Mayer, K.F.X. ; Blake, V.C. ; Faris, J.D. ; Xu, S.S. ; Sen, T.Z. ; Yao, E. ; Sánchez, J.I.Y. ; Liu, C. ; Farooq, M.A. ; Stefanelli, S. ; Cappucci, C. ; Oren, L. ; Eilam, T. ; Giorgioni, M. ; Stella, A. ; Lazzari, B. ; Lauria, M. ; Ceriotti, A. ; Pirona, R. ; Tavakol, E. ; Klymiuk, V. ; Ens, J. ; Chawla, H.S. ; Walkowiak, S. ; Pecchioni, N. ; Bassi, F.M. ; Sanchez-Garcia, M. ; Sonnante, G. ; Curci, P.L. ; Giuliano, G. ; Aprea, G. ; Pasha, A. ; Gadaleta, A. ; Marcotuli, I. ; Masci, S. ; Sestili, F. ; Palombieri, S. ; Scaglione, D. ; Morgante, M. ; Šimková, H. ; Provart, N.J. ; Krattinger, S.G. ; Pozniak, C.J. ; Chantret, N. ; Hall, A. ; Distelfeld, A. ; Tuberosa, R. ; Maccaferri, M. ; Cattivelli, L.
Durum wheat cv. svevo reference genome rel.2.0: A comprehensive tool for wheat genomics.Hu, B. ; Hänsch, R. ; Grunau, K. ; Hohtanz, L. ; Kucklick, M. ; Grünig, N. ; Haensch, V.G. ; Liu, R. ; Peng, T. ; Wiebicke, M. ; Fard, I.S. ; Messerer, M. ; Gädeke, F. ; Stradal, T.E.B. ; Milatz, M. ; Hertweck, C. ; Engelmann, S. ; Rennenberg, H. ; Oliphant, K.D.
Symbiotic peptides modulate rhizobial physiology without terminal differentiation.Varshney, R.K. ; Garg, V. ; Spannagl, M. ; Dreisigacker, S.
Genomics for next-generation wheat breeding.Kale, S.M. ; Gundlach, H. ; Gericke, O. ; Kamal, N. ; Almeida, A. ; Pitra, N. ; Price, N. ; Haberer, G. ; Lux, T. ; Krsticevic, F. ; Kemp, O. ; Bang, L.d. ; Himmelbach, A. ; Padmarasu, S. ; Rabanus-Wallace, M. ; Hořáková, L. ; Bačovský, V. ; Nielsen, K. ; Bjarnholt, N. ; Mićić, N. ; Kruse-Andersen, I. ; Møller, B.L. ; Janfelt, C. ; Skadhauge, B. ; Matthews, P.D. ; Mayer, K.F.X. ; Stein, N. ; Mascher, M. ; Spannagl, M. ; Feiner, A. ; Braumann, I.
Extensive variation between chromosomes of North American and European hop.Contact us