Popowicz Lab
Unsere primäre Forschungstätigkeit ist die Wirkstoffforschung mit Schwerpunkt auf Protein-Protein-Wechselwirkungen und der Suche nach neuen Targets. Protein-Protein-Interaktome bieten eine enorme Anzahl von Protein-Protein-Interaktionen (PPI), die als therapeutische Targets verwendet werden können. Die Entwicklung von PPI-Modulatoren ist jedoch schwierig, da Substrate fehlen, die als Ausgangspunkt für die analoge Entwicklung verwendet werden können, und die Schnittstellen in der Regel groß und die Bindungsenergien verstreut sind. PPI erfordern normalerweise Verbindungen mit einzigartigen chemischen Eigenschaften, die in modernen Screening-Bibliotheken selten zu finden sind. Wir verwenden strukturbasierte Berechnungsmethoden, um PPIs-Modulatoren zu identifizieren. Mit Hilfe von fragmentbasiertem Screening, NMR-basierter SAR-Evaluierung und Röntgenkristallographie entwerfen wir Moleküle, die als chemische Sonden zur Validierung des therapeutischen Proof-of-Concept von PPI dienen und zu Wirkstoffkandidaten optimiert werden können.
Unser Forschungsinteresse umfasst außerdem:
- Multikomponenten-Ligandenchemie, computergestütztes Synthesedesign
- Integration von fragmentbasierten und mehrkomponentigen Ansätzen
- Nutzung von transienten, dynamischen Zuständen der Schnittflächen zur Optimierung von Liganden
- Neue rechnergestützte Techniken in der Wirkstoffentwicklung
- SAR mittels Röntgenstrukturanalyse und NMR
- Strukturbiologie von Komplexen
Publikationen
Napolitano, V. ; Mroz, P. ; Marciniak, M. ; Kalel, V.C. ; Softley, C. ; Janna Olmos, J.D. ; Tippler, B.G. ; Schorpp, K.K. ; Rioton, S. ; Fröhlich, T. ; Plettenburg, O. ; Hadian, K. ; Erdmann, R. ; Sattler, M. ; Popowicz, G.M. ; Dawidowski, M. ; Dubin, G.
Structure-based design, synthesis and evaluation of a novel family of PEX5-PEX14 interaction inhibitors against Trypanosoma.Narayanan, D. ; Tran, K.T. ; Pallesen, J.S. ; Solbak, S.M. ; Qin, Y. ; Mukminova, E. ; Luchini, M. ; Vasilyeva, K.O. ; González Chichón, D. ; Goutsiou, G. ; Poulsen, C. ; Haapanen, N. ; Popowicz, G.M. ; Sattler, M. ; Olagnier, D. ; Gajhede, M. ; Bach, A.
Development of noncovalent small-molecule Keap1-Nrf2 inhibitors by fragment-based drug discovery.Cardoso Micu Menezes, F.M. ; Popowicz, G.M.
ULYSSES: An efficient and easy to use semiempirical library for C+.Napolitano, V. ; Softley, C. ; Blat, A. ; Kalel, V.C. ; Schorpp, K.K. ; Siebenmorgen, T. ; Hadian, K. ; Erdmann, R. ; Sattler, M. ; Popowicz, G.M. ; Dubin, G.
Small molecule mediated inhibition of protein cargo recognition by peroxisomal transport receptor PEX5 is toxic to Trypanosoma.Cardoso Micu Menezes, F.M. ; Popowicz, G.M.
Acid rain and flue gas: Quantum chemical hydrolysis of NO2.Popowicz Lab Kontakt
