Environmental Health Center
Plant Genome and Systems Biology
The PGSB plant genomics group focuses on the analysis of plant genomes, using bioinformatic techniques. Our mission is to develop options for a sustainable use of plants and understand how climate change impacts crops, food security and human health.
The PGSB plant genomics group focuses on the analysis of plant genomes, using bioinformatic techniques. Our mission is to develop options for a sustainable use of plants and understand how climate change impacts crops, food security and human health.
Scientists at PGSB
Publications
Spanner, R. ; Sallam, A.H. ; Guo, Y. ; Jayakodi, M. ; Himmelbach, A. ; Fiebig, A. ; Simmons, J. ; Bethke, G. ; Lee, Y. ; Pacheco Arge, L.W. ; Qiu, Y. ; Badea, A. ; Baum, M. ; Belzile, F. ; Ben-David, R. ; Brueggeman, R. ; Case, A. ; Cattivelli, L. ; Davis, M.F. ; Dockter, C. ; Dolezel, J. ; Glick, L. ; Greiner, S. ; Hamilton, R. ; Hayes, P.M. ; Heisel, S. ; Henson, C. ; Kilian, B. ; Komatsuda, T. ; Li, C. ; Liu, C. ; Mahalingam, R. ; Maruschewski, M. ; Matny, O. ; Maurer, A. ; Mayer, K.F.X. ; Mayrose, I. ; Moscou, M. ; Muehlbauer, G.J. ; Oono, Y. ; Ordon, F. ; Özkan, H. ; Pecinka, A. ; Perovic, D. ; Pillen, K. ; Pourkheirandish, M. ; Russell, J. ; Šafář, J. ; Salvi, S. ; Sanchez-Garcia, M. ; Sato, K. ; Schmutzer, T. ; Scholz, U. ; Scott, J. ; Singh Brar, G. ; Smith, K.P. ; Sorrells, M.E. ; Spannagl, M. ; Stein, N. ; Tondelli, A. ; Tuberosa, R. ; Tucker, J.D. ; Turkington, T. ; Valkoun, J. ; Verma, R.P.S. ; Vinje, M.A. ; von Korff, M. ; Walling, J.G. ; Waugh, R. ; Wise, R.P. ; Wulff, B.B.H. ; Yang, S. ; Zhang, G. ; Morrell, P.L. ; Mascher, M. ; Steffenson, B.J.
Whole-genome resequencing of the wild barley diversity collection: A resource for identifying and exploiting genetic variation for cultivated barley improvement.Jørgensen, M.E. ; Vequaud, D. ; Wang, Y. ; Andersen, C.B. ; Bayer, M. ; Box, A. ; Braune, K.B. ; Cai, Y. ; Chen, F. ; Cuesta-Seijo, J.A. ; Dong, H. ; Fincher, G.B. ; Gojkovic, Z. ; Huang, Z. ; Jaegle, B. ; Kale, S.M. ; Krsticevic, F. ; Le Roux, P.M. ; Lozier, A. ; Lu, Q. ; Mascher, M. ; Murozuka, E. ; Nakamura, S. ; Simmelsgaard, M.U. ; Pedas, P.R. ; Pin, P.A. ; Podzimska-Sroka, D. ; Sato, K. ; Spannagl, M. ; Rasmussen, M.W. ; Russell, J. ; Schreiber, M. ; Thomsen, H.C. ; Thomsen, N.W. ; Tulloch, S. ; Voss, C. ; Skadhauge, B. ; Stein, N. ; Willerslev, E. ; Waugh, R. ; Dockter, C.
Postdomestication selection of MKK3 shaped seed dormancy and end-use traits in barley.Avni, R. ; Kamal, N. ; Bitz, L. ; Jellen, E.N. ; Bekele, W.A. ; Angessa, T.T. ; Auvinen, P. ; Bitz, O. ; Boyle, B. ; Canales, F.J. ; Carlson, C.H. ; Chapman, B. ; Chawla, H. ; Chen, Y. ; Copetti, D. ; Correia de Lemos, S. ; Dang, V.D. ; Eichten, S.R. ; Klos, K.E. ; Fenn, A. ; Fiebig, A. ; Fu, Y.B. ; Gundlach, H. ; Gupta, R. ; Haberer, G. ; He, T. ; Herrmann, M.H. ; Himmelbach, A. ; Howarth, C.J. ; Hu, H. ; Isidro Y Sánchez, J. ; Itaya, A. ; Jannink, J.L. ; Jia, Y. ; Kaur, R. ; Knauft, M. ; Langdon, T. ; Lux, T. ; Marmon, S. ; Marosi, V.B. ; Mayer, K.F.X. ; Michel, S. ; Nandety, R.S. ; Nilsen, K.T. ; Paczos-Grzęda, E. ; Pasha, A. ; Prats, E. ; Provart, N.J. ; Ravagnani, A. ; Reid, R.W. ; Schlueter, J.A. ; Schulman, A.H. ; Sen, T.Z. ; Singh, J. ; Singh, M. ; Sirijovski, N. ; Stein, N. ; Studer, B. ; Viitala, S. ; Vronces, S. ; Walkowiak, S. ; Wang, P. ; Waters, A.J. ; Wight, C.P. ; Yan, W. ; Yao, E. ; Zhang, X.Q. ; Zhou, G. ; Zhou, Z. ; Tinker, N.A. ; Fiedler, J.D. ; Li, C. ; Maughan, P.J. ; Spannagl, M. ; Mascher, M.
A pangenome and pantranscriptome of hexaploid oat.Michlmayr, H. ; Siller, M. ; Kenjeric, L. ; Doppler, M. ; Malachová, A. ; Hofer, M.J. ; Hametner, C. ; Schweiger, W. ; Steiner, B. ; Kugler, K.G. ; Mayer, K.F.X. ; Buerstmayr, H. ; Schuhmacher, R. ; Krska, R. ; Labrou, N.E. ; Papageorgiou, A.C. ; Adam, G.
Detoxification of deoxynivalenol by pathogen-inducible tau-class glutathione transferases from wheat.White, B. ; Lux, T. ; Rusholme-Pilcher, R. ; Juhász, A. ; Kaithakottil, G. ; Duncan, S.R. ; Simmonds, J. ; Rees, H. ; Wright, J. ; Colmer, J. ; Ward, S. ; Joynson, R. ; Coombes, B. ; Irish, N. ; Henderson, S. ; Barker, T. ; Chapman, H. ; Catchpole, L. ; Gharbi, K. ; Bose, U. ; Okada, M. ; Handa, H. ; Nasuda, S. ; Shimizu, K.K. ; Gundlach, H. ; Lang, D. ; Naamati, G. ; Legg, E.J. ; Bharti, A.K. ; Colgrave, M.L. ; Haerty, W. ; Uauy, C. ; Swarbreck, D. ; Poland, J.A. ; Krattinger, S.G. ; Stein, N. ; Mayer, K.F.X. ; Pozniak, C. ; Spannagl, M. ; Hall, A.
De novo annotation reveals transcriptomic complexity across the hexaploid wheat pan-genome.Feng, J.W. ; Pidon, H. ; Cuacos, M. ; Lux, T. ; Himmelbach, A. ; Haghi, R. ; Fuchs, J. ; Haberer, G. ; Kuo, Y.T. ; Guo, Y. ; Jayakodi, M. ; Toegelová, H. ; Harpke, D. ; Knauft, M. ; Fiebig, A. ; Maruschewski, M. ; Ronen, M. ; Sharon, A. ; Šimková, H. ; Mayer, K.F.X. ; Spannagl, M. ; Kumlehn, J. ; Heckmann, S. ; Houben, A. ; Blattner, F.R. ; Stein, N. ; Mascher, M.
A haplotype-resolved pangenome of the barley wild relative Hordeum bulbosum.Bevan, M.W. ; Messerer, M. ; Gundlach, H. ; Kamal, N. ; Hall, A. ; Spannagl, M. ; Mayer, K.F.X.
Integrating Arabidopsis and crop species gene discovery for crop improvement.Hu, B. ; Messerer, M. ; Haberer, G. ; Lux, T. ; Marosi, V.B. ; Mayer, K.F.X. ; Oliphant, K.D. ; Kaufholdt, D. ; Schulze, J. ; Kreth, L.S. ; Jurgeleit, J. ; Geffers, R. ; Hänsch, R. ; Rennenberg, H.
Genomic and transcriptomic insights into legume-rhizobia symbiosis in the nitrogen-fixing tree Robinia pseudoacacia.Mayer, K.F.X. ; Haberer, G.
Genomics: To be (or not to be) a duckweed.Kamal, N. ; Spannagl, M.
Genus-wide plant pangenome could inform next-generation crop design.Contact us