Skip to main content

Schneider Lab Publications

2024 Scientific Article in Nature Communications Nat. Commun. 15:2960 (2024)

Yamaguchi, K. ; Chen, X. ; Rodgers, B. ; Miura, F. ; Bashtrykov, P. ; Bonhomme, F. ; Salinas-Luypaert, C. ; Haxholli, D. ; Gutekunst, N. ; Özdemir Aygenli, B. ; Ferry, L. ; Kirsh, O. ; Laisné, M. ; Scelfo, A. ; Ugur, E. ; Arimondo, P.B. ; Leonhardt, H. ; Kanemaki, M.T. ; Bartke, T. ; Fachinetti, D. ; Jeltsch, A. ; Ito, T. ; Defossez, P.A.

Non-canonical functions of UHRF1 maintain DNA methylation homeostasis in cancer cells.

2023 Nature Structural & Molecular Biology Nat. Struct. Mol. Biol., DOI: 10.1038/s41594-023-01179-1 (2023)

Basu, S. ; Shukron, O. ; Hall, D.W. ; Parutto, P. ; Ponjavic, A. ; Shah, D.I. ; Boucher, W. ; Lando, D. ; Zhang, W. ; Reynolds, N. ; Sober, L.H. ; Jartseva, A. ; Ragheb, R. ; Ma, X. ; Cramard, J. ; Floyd, R. ; Balmer, J. ; Drury, T.A. ; Carr, A.R. ; Needham, L.M. ; Aubert, A. ; Communie, G. ; Gor, K. ; Steindel, M. ; Morey, L. ; Blanco, E. ; Bartke, T. ; di Croce, L. ; Berger, I. ; Schaffitzel, C. ; Lee, S.F. ; Stevens, T.J. ; Klenerman, D. ; Hendrich, B.D. ; Holcman, D. ; Laue, E.D.

Publisher Correction: Live-cell three-dimensional single-molecule tracking reveals modulation of enhancer dynamics by NuRD.

2023 Scientific Article in Nature Structural & Molecular Biology Nat. Struct. Mol. Biol. 30, 1628-1639 (2023)

Basu, S. ; Shukron, O. ; Hall, D. ; Parutto, P. ; Ponjavic, A. ; Shah, D. ; Boucher, W. ; Lando, D. ; Zhang, W. ; Reynolds, N. ; Sober, L.H. ; Jartseva, A. ; Ragheb, R. ; Ma, X. ; Cramard, J. ; Floyd, R. ; Balmer, J. ; Drury, T.A. ; Carr, A.R. ; Needham, L.M. ; Aubert, A. ; Communie, G. ; Gor, K. ; Steindel, M. ; Morey, L. ; Blanco, E. ; Bartke, T. ; di Croce, L. ; Berger, I. ; Schaffitzel, C. ; Lee, S.F. ; Stevens, T.J. ; Klenerman, D. ; Hendrich, B.D. ; Holcman, D. ; Laue, E.D.

Live-cell three-dimensional single-molecule tracking reveals modulation of enhancer dynamics by NuRD.

2023 Scientific Article in Nature Cell Biology Nat. Cell Biol. 25, 1017-1032 (2023)

Gaggioli, V. ; Lo, C.S.Y. ; Reveron-Gomez, N. ; Jasencakova, Z. ; Domenech, H. ; Nguyen, H. ; Sidoli, S. ; Tvardovskiy, A. ; Uruci, S. ; Slotman, J.A. ; Chai, Y. ; Gonçalves, J.G.S.C.S. ; Manolika, E.M. ; Jensen, O.N. ; Wheeler, D. ; Sridharan, S. ; Chakrabarty, S. ; Demmers, J. ; Kanaar, R. ; Groth, A. ; Taneja, N.

Dynamic de novo heterochromatin assembly and disassembly at replication forks ensures fork stability.

2022 Scientific Article in Nature Communications Nat. Commun. 13:1303 (2022)

Günsel, G.G. ; Conlon, T.M. ; Jeridi, A. ; Kim, R. ; Ertüz, Z. ; Lang, N.J. ; Ansari, M. ; Novikova, M. ; Jiang, D. ; Strunz, M. ; Gaianova, M. ; Hollauer, C. ; Gabriel, C. ; Angelidis, I. ; Doll, S. ; Pestoni, J. ; Edelmann, S.L. ; Kohlhepp, M.S. ; Guillot, A. ; Bassler, K. ; Van Eeckhoutte, H.P. ; Kayalar, Ö. ; Konyalilar, N. ; Kanashova, T. ; Rodius, S. ; Ballester-Lopez, C. ; Genes Robles, C.M. ; Smirnova, N.F. ; Rehberg, M. ; Agarwal, C. ; Krikki, I. ; Piavaux, B. ; Verleden, S.E. ; Vanaudenaerde, B. ; Königshoff, M. ; Dittmar, G. ; Bracke, K.R. ; Schultze, J.L. ; Watz, H. ; Eickelberg, O. ; Stöger, T. ; Burgstaller, G. ; Tacke, F. ; Heissmeyer, V. ; Rinkevich, Y. ; Bayram, H. ; Schiller, H. B. ; Conrad, M. ; Schneider, R. ; Yildirim, A.Ö.

The arginine methyltransferase PRMT7 promotes extravasation of monocytes resulting in tissue injury in COPD.

2020 Scientific Article in Science Advances Sci. Adv. 6:eaaz4551 (2020)

Ignatova, V.V. ; Kaiser, S. ; Ho, J.S.Y. ; Bing, X. ; Stolz, P. ; Tan, Y.X. ; Lee, C.L. ; Gay, F.P.H. ; Lastres, P.R. ; Gerlini, R. ; Rathkolb, B. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Sanz-Moreno, A. ; Klein-Rodewald, T. ; Calzada-Wack, J. ; Ibragimov, E. ; Valenta, M. ; Lukauskas, S. ; Pavesi, A. ; Marschall, S. ; Leuchtenberger, S. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Hrabě de Angelis, M. ; Bultmann, S. ; Rando, O.J. ; Guccione, E. ; Kellner, S.M. ; Schneider, R.

METTL6 is a tRNA m3C methyltransferase that regulates pluripotency and tumor cell growth.

2020 Scientific Article in Nature Communications Nat. Commun. 11:3559 (2020)

Strunz, M. ; Simon, L. ; Ansari, M. ; Kathiriya, J.J. ; Angelidis, I. ; Mayr, C. ; Tsidiridis, G. ; Lange, M. ; Mattner, L. ; Yee, M. ; Ogar, P. ; Sengupta, A. ; Kukhtevich, I. ; Schneider, R. ; Zhao, Z. ; Voss, C. ; Stöger, T. ; Neumann, J.H.L. ; Hilgendorff, A. ; Behr, J. ; O'Reilly, M. ; Lehmann, M. ; Burgstaller, G. ; Königshoff, M. ; Chapman, H.A. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.

Alveolar regeneration through a Krt8+transitional stem cell state that persists in human lung fibrosis.

2020 Meeting abstract in Wound repair and regeneration Wound Repair Regen. 28, A7-A7 (2020)

Strunz, M. ; Simon, L. ; Ansari, M. ; Mattner, L. ; Angelidis, I. ; Mayr, C. ; Kathiriya, J. ; Yee, M. ; Ogar, P. ; Voss, C. ; Stöger, T. ; Kukhtevich, I. ; Schneider, R. ; Lehmann, M. ; Koenigshoff, M. ; Burgstaller, G. ; O'Reilly, M. ; Chapman, H. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.

Fate trajectory modeling reveals convergence of airway derived progenitors and AT2 cells on transient KRT8+alveolar cell state during lung regeneration.

2020 Scientific Article in Genes and Development Genes Dev. 34, 715-729 (2020)

Ignatova, V.V. ; Stolz, P. ; Kaiser, S. ; Gustafsson, T.H. ; Lastres, P.R. ; Sanz-Moreno, A. ; Cho, Y.-L. ; Amarie, O.V. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Klein-Rodewald, T. ; Calzada-Wack, J. ; Becker, L. ; Marschall, S. ; Kraiger, M. ; Garrett, L. ; Seisenberger, C. ; Hölter, S.M. ; Borland, K. ; Van De Logt, E. ; Jansen, P.W.T.C. ; Baltissen, M.P. ; Valenta, M. ; Vermeulen, M. ; Wurst, W. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Rando, O.J. ; Kellner, S.M. ; Bultmann, S. ; Schneider, R.

The rRNA m6A methyltransferase METTL5 is involved in pluripotency and developmental programs.

2019 Nature Structural & Molecular Biology Nat. Struct. Mol. Biol., DOI: 10.1038/s41594-019-0341-8 (2019)

Beltran, M. ; Tavares, M. ; Justin, N. ; Khandelwal, G. ; Ambrose, J. ; Foster, B. ; Worlock, K.B. ; Tvardovskiy, A. ; Kunzelmann, S. ; Herrero, J. ; Bartke, T. ; Gamblin, S.J. ; Wilson, J.R. ; Jenner, R.G.

Author Correction: G-tract RNA removes Polycomb repressive complex 2 from genes (Nature Structural & Molecular Biology, (2019), 26, 10, (899-909), 10.1038/s41594-019-0293-z).

2018Poster: 40 years Myc, 50 years Polymerase II, and 65 years Dirk Eick!, 9 November 2018, Planegg-Martinsried. (2018)

Andrau, J.-C. ; Geyer, M. ; Hermeking, H. ; Hölzel, M. ; Imhof, A. ; Murphy, S. ; Schneider, R.

Regulation of transcription: RNA Pol II and Myc.

2016 Scientific Article in Nature Communications Nat. Commun. 7:10782 (2016)

Kabra, D.G. ; Pfuhlmann, K. ; García-Cáceres, C. ; Schriever, S.C. ; Casquero García, V. ; Kebede, A.F. ; Fuente-Martin, E. ; Trivedi, C. ; Heppner, K. ; Uhlenhaut, N.H. ; Legutko, B. ; Kabra, U.D. ; Gao, Y. ; Yi, C.-X. ; Quarta, C. ; Clemmensen, C. ; Finan, B. ; Müller, T.D. ; Meyer, C.W. ; Paez-Pereda, M. ; Stemmer, K. ; Woods, S.C. ; Perez-Tilve, D. ; Schneider, R. ; Olson, E.N. ; Tschöp, M.H. ; Pfluger, P.T.

Hypothalamic leptin action is mediated by histone deacetylase 5.

2013 Scientific Article in Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110, E2191-E2198 (2013)

Fejer, G. ; Wegner, M.D. ; Györy, I. ; Cohen, I.R. ; Engelhard, P. ; Voronov, E. ; Manke, T. ; Ruzsics, Z. ; Dölken, L. ; Prazeres da Costa, O. ; Branzk, N. ; Huber, M. ; Prasse, A. ; Schneider, R. ; Apte, R.N. ; Galanos, C. ; Freudenberg, M.A.

Nontransformed, GM-CSF-dependent macrophage lines are a unique model to study tissue macrophage functions.

2012 Scientific Article in Nature Genetics Nat. Genet. 44, 1104-1110 (2012)

Peifer, M. ; Fernández-Cuesta, L. ; Sos, M.L. ; George, J. ; Seidel, D. ; Kasper, L.H. ; Plenker, D. ; Leenders, F. ; Sun, R. ; Zander, T. ; Menon, R. ; Koker, M. ; Dahmen, I. ; Müller, C. ; di Cerbo, V. ; Schildhaus, H.U. ; Altmüller, J. ; Baessmann, I. ; Becker, C. ; de Wilde, B. ; Vandesompele, J. ; Böhm, D. ; Ansén, S. ; Gabler, F. ; Wilkening, I. ; Heynck, S. ; Heuckmann, J.M. ; Lu, X. ; Carter, S.L. ; Cibulskis, K. ; Banerji, S. ; Getz, G. ; Park, K.S. ; Rauh, D. ; Grütter, C. ; Fischer, M. ; Pasqualucci, L. ; Wright, G. ; Wainer, Z. ; Russell, P. ; Petersen, I. ; Chen, Y. ; Stoelben, E. ; Ludwig, C. ; Schnabel, P.A. ; Hoffmann, H. ; Muley, T. ; Brockmann, M.M. ; Engel-Riedel, W. ; Muscarella, L.A. ; Fazio, V.M. ; Groen, H.J.M. ; Timens, W. ; Sietsma, H. ; Thunnissen, E. ; Smit, E. ; Heideman, D.A. ; Snijders, P.J. ; Cappuzzo, F. ; Ligorio, C. ; Damiani, S. ; Field, J. ; Solberg, S. ; Brustugun, O.T. ; Lund-Iversen, M. ; Sänger, J. ; Clement, J.H. ; Soltermann, A. ; Moch, H. ; Weder, W. ; Solomon, B. ; Soria, J.C. ; Validire, P. ; Besse, B. ; Brambilla, E. ; Brambilla, C. ; Lantuejoul, S. ; Lorimier, P. ; Schneider, P.M. ; Hallek, M. ; Pao, W. ; Meyerson, M. ; Sage, J. ; Shendure, J. ; Schneider, R. ; Büttner, R. ; Wolf, J. ; Nürnberg, P. ; Perner, S. ; Heukamp, L.C. ; Brindle, P.K. ; Haas, S. ; Thomas, R.K.

Integrative genome analyses identify key somatic driver mutations of small-cell lung cancer.

2012 Scientific Article in Epigenetics & Chromatin Epigenetics Chromatin 5:7 (2012)

Talbert, P.B. ; Ahmad, K. ; Almouzni, G. ; Ausió, J. ; Berger, F. ; Bhalla, P.L. ; Bonner, W.M. ; Cande, W.Z. ; Chadwick, B.P. ; Chan, S.W. ; Cross, G.A. ; Cui, L. ; Dimitrov, S.I. ; Doenecke, D. ; Eirin-López, J.M. ; Gorovsky, M.A. ; Hake, S.B. ; Hamkalo, B.A. ; Holec, S. ; Jacobsen, S.E. ; Kamieniarz, K. ; Khochbin, S. ; Ladurner, A.G. ; Landsman, D. ; Latham, J.A. ; Loppin, B. ; Malik, H.S. ; Marzluff, W.F. ; Pehrson, J.R. ; Postberg, J. ; Schneider, R. ; Singh, M.B. ; Smith, M.M. ; Thompson, E.E. ; Torres-Padilla, M.E. ; Tremethick, D.J. ; Turner, B.M. ; Waterborg, J.H. ; Wollmann, H. ; Yelagandula, R. ; Zhu, B.M. ; Henikoff, S.

A unified phylogeny-based nomenclature for histone variants.