E. coli bacteria found in intestine of warm-blooded organism - 3D render

Head of Laboratory

M.Sc. Susanne Walch

Research Area

Susanne Walch is Head of the Laboratory at COMI since 2012 and focuses on the assessment of microbiomes of different environments using next-generation sequencing. She is operating the next-generation sequencers, including MiSeq and NextSeq 550 (Illumina). She is the project leader for genetic engineering related to GenTSV §15, safety officer, and first aider.

CV

2025

Master of Science Biology at TU Munich

2012

Bachelor of Science Biology at LMU Munich

2009

Trained Biology laboratory assistant at GSF/ Helmholtz Zentrum München

2009

Awarded for the best exam as Biology laboratory assistant of IHK Munich and upper Bavaria

Publications

Environ. Microbiome 20:92 (2025)

Thaqi, S.K. ; Hensel, N. ; Vitow, N. ; Baum, C. ; Streb, L.-M. ; Kublik, S. ; Leinweber, P. ; Panten, K. ; Schloter, M. ; Schulz, S.

Non-rhizobial endophyte recruitment and diversity in Pisum sativum are strongly shaped by phosphorus fertilizer form.
Environ. Microbiome 20:69 (2025)

Kampouris, I.D. ; Kuhl-Nagel, T. ; Behr, J.H. ; Sommermann, L. ; Babin, D. ; Francioli, D. ; Zrenner, R. ; Kublik, S. ; Schloter, M. ; Ludewig, U. ; Smalla, K. ; Neumann, G. ; Grosch, R. ; Geistlinger, J.

Selective recruitment of beneficial microbes in the rhizosphere of maize affected by microbial inoculants, farming practice, and seasonal variations.
In:. 2025. e71 - e72 (Z. Geburtsh. u. Neonat. ; 229)

Staude, B. ; Gschwendtner, S. ; Frodermann, T. ; Oehmke, F. ; Kohl, T. ; Kublik, S. ; Schloter, M. ; Ehrhardt, H.

Assoziationen mikrobieller Strukturen im Fruchtwasser bei Frühgeburt mit schweren akuten Komplikationen und Langzeitfolgen der Frühgeburt.
Br. J. Dermatol. 192, 684-696 (2024)

Amar, Y. ; Niedermeier, S. ; Silva, R. ; Kublik, S. ; Schloter, M. ; Biedermann, T. ; Köberle, M. ; Eberlein, B.

Skin microbiome dynamics in patients with polymorphic light eruption in response to UV radiations.
Physiol. Plant. 176:e14483 (2024)

Sommer, A. ; Wenig, M. ; Knappe, C. ; Kublik, S. ; Fösel, B. ; Schloter, M. ; Vlot, A.C.

A salicylic acid-associated plant-microbe interaction attracts beneficial Flavobacterium sp. to the Arabidopsis thaliana phyllosphere.
Microbiol. Spectr. 12:e0042224 (2024)

Mahmoud, F.M. ; Pritsch, K. ; Siani, R. ; Benning, S. ; Radl, V. ; Kublik, S. ; Bunk, B. ; Spröer, C. ; Schloter, M.

Comparative genomic analysis of strain Priestia megaterium B1 reveals conserved potential for adaptation to endophytism and plant growth promotion.
Microorganisms 12:255 (2024)

Ishola, O.A. ; Kublik, S. ; Durai Raj, A.C. ; Ohnmacht, C. ; Schulz, S. ; Fösel, B. ; Schloter, M.

Comparative metagenomic analysis of bacteriophages and prophages in gnotobiotic mouse models.
Respir. Res. 24:248 (2023)

Staude, B. ; Gschwendtner, S. ; Frodermann, T. ; Oehmke, F. ; Kohl, T. ; Kublik, S. ; Schloter, M. ; Ehrhardt, H.

Microbial signatures in amniotic fluid at preterm birth and association with bronchopulmonary dysplasia.
Microbiome 11:206 (2023)

Amar, Y. ; Rogner, D. ; Silva, R. ; Fösel, B. ; Ud-Dean, M. ; Lagkouvardos, I. ; Steimle‑Grauer, S.A. ; Niedermeier, S. ; Kublik, S. ; Jargosch, M. ; Heinig, M. ; Thomas, J. ; Eyerich, S. ; Wikström, J.D. ; Schloter, M. ; Eyerich, K. ; Biedermann, T. ; Köberle, M.

Correction: Darier’s disease exhibits a unique cutaneous microbial dysbiosis associated with inflammation and body malodour (Microbiome, (2023), 11, 1, (162), 10.1186/s40168-023-01587-x).
New Phytol. 240, 2020-2034 (2023)

Bender, S.F. ; Schulz, S. ; Martinez-Cuesta, R. ; Laughlin, R.J. ; Kublik, S. ; Pfeiffer-Zakharova, K. ; Vestergaard, G. ; Hartman, K. ; Parladé, E. ; Römbke, J. ; Watson, C.J. ; Schloter, M. ; van der Heijden, M.G.A.

Simplification of soil biota communities impairs nutrient recycling and enhances above- and belowground nitrogen losses.

Looking for a new challenge?

Join our team.