Gruppenleiter, Hadian
Plattform für das Screening von Wirkstoffkandidaten
Wir arbeiten mit Forschern des Zentrums sowie mit nationalen und internationalen Kooperationspartnern zusammen und entwickeln maßgeschneiderte Screening-Assays zur Identifizierung neuartiger bioaktiver Moleküle.
Plattform für das Screening von Wirkstoffkandidaten
Unser Fachwissen und unser Schwerpunkt
Wir arbeiten mit Forschern des Zentrums sowie mit nationalen und internationalen Kooperationspartnern zusammen und entwickeln maßgeschneiderte Screening-Assays zur Identifizierung neuartiger bioaktiver Moleküle. Ein Schwerpunkt liegt dabei auf der Entwicklung phänotypischer Assays für das High-Content-Screening (HCS), um die Biologie des zugrunde liegenden Krankheitszustands besser abzubilden. Zur Analyse der High-Content-Bilder setzen wir Techniken des maschinellen Lernens ein. Wir stellen modernste Geräte und Screening-Verfahren zur Verfügung und betreuen die hauseigenen Diversitäts- und zielgerichteten Wirkstoffbibliotheken.
Screening-Assay-Verfahren
Biochemische Assays:
- Protein-Protein-Interaktions-Assays (PPI):
- AlphaScreen-Interaktionsassay (homogener Assay)
- TR-FRET (HTRF)-Interaktionsassay (homogener Assay)
- DELFIA-Assay zur zeitaufgelösten Fluoreszenz (ELISA-basierter Assay)
- Mikroskalige Thermophorese (MST)
- Pull-down-Assays (GST, StrepTagII, His, GFP-Trap usw.)
- Enzymatische Assays:
- DUBs (AMC, IQF-diUb, AlphaScreen usw.)
- Protease-Spaltungsassay (z. B. AMC-Substrate)
- Kinase-Assays (AlphaScreen, HTRF, ELISA
- Phosphatase assays (AlphaScreen, HTRF)
- Wechselwirkungen zwischen Proteinen und Wirkstoffen sowie zwischen Nukleinsäuren und Wirkstoffen:
- Mikroskalige Thermophorese
Zellbasierte HCS-/HTS-Assays:
- High-Content-Screening (HCS) mit dem Operetta-System:
- Stammzell-Screening
- 3D-Zellsysteme
- Morphologieanalyse (z. B. Neuronen)
- Zellprofilierung mittels Cell-Painting-Assay
- Zelluläre Substrukturen (z. B. Flecken, Organellen usw.)
- Analyse der zellulären Translokation (z. B. zwischen Zellkern und Zytoplasma)
- Protein-Protein-Wechselwirkungen (z. B. BiFC, FRET)
- High-Content-Bildanalyse mit spezialisierter Software und maschinellem Lernen/Deep Learning
- High-Throughput-Screening (HTS):
- Protein-Protein-Wechselwirkungen (NanoBRET)
- Fluoreszenzbasierte Reporter-Assays
- Zellviabilitäts-Assays
- Apoptose-Assays
Wirkstoff-Bibliotheken
Diversitätsbibliotheken (30.000 bioaktive Verbindungen):
- ChemDiv subset
- Diversitätsauswahl von 10.000 Verbindungen
- Etwa 50 % der Verbindungen sind in der Lage, die Blut-Hirn-Schranke zu überwinden (Informationen aus Berechnungen)
- Enamine subset
- Diversitätsauswahl von 10.000 Verbindungen
- ChemBridge subset
- Diversitätsauswahl von 5.000 Verbindungen
- ChemDiv Protein-Protein Interaction (PPI) subset
- Diversitätsauswahl von 5.000 Verbindungen
- Schwerpunkt auf PPI-Hemmung
Fokussierte Bibliotheken:
- Prestwick: Von der FDA zugelassene Arzneimittel
- Medchem Express: Von der FDA zugelassene Arzneimittel
- Repurposing-Bibliothek
- GPCR-Wirkstoffbibliothek