Epigenetics @HelmholtzMunich
Dozens of researchers @Helmholtz Munich join forces to reveal the myriad of secrets of Epigenetics.
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Dozens of researchers at Helmholtz Munich joined forces
to reveal the myriad of secrets of Epigenetics.
The Epigenetics@HelmholtzMunich Community Research consists of almost 30 labs from 17 Helmholtz Munich institutes, committed to performing ground-breaking research in the field of epigenetics. These groups are pioneers in their respective disciplines, utilizing cutting edge techniques to answer the complex questions of today.
The topics studied by the community include: stem cells, cellular plasticity, metabolism, diabetes, computational biology, epidemiology, immunology, development, and systems biology.
Seminars & Events
Recent Publications
Kazeminia, S. ; Marr, C. ; Rieck, B.
Topological Inductive Bias fosters Multiple Instance Learning in Data-Scarce Scenarios.Hankofer, V. ; Ghirardo, A. ; Obermaier, L. ; Poschet, G. ; Kumar, J.S. ; Gross, I. ; Durner, J. ; Rychlik, M. ; Wirtz, M. ; Hell, R. ; Schnitzler, J.-P. ; Groth, M.
Photorespiration is linked to DNA methylation by formate as a one-carbon source.Mueller, S. ; de Andrade Krätzig, N. ; Tschurtschenthaler, M. ; Silva, M.G. ; Thordsen, C. ; Trozzo, R. ; Simon, P. ; Saab, F. ; Kaltenbacher, T. ; Zukowska, M. ; Lucarelli, D. ; Öllinger, R. ; Griger, J. ; Groß, N. ; Groll, T. ; Löprich, J. ; Zaurito, A.E. ; Schömig, L.R. ; Bugter, J.M. ; Bärthel, S. ; Falcomatà, C. ; Strong, A. ; Brandt, C. ; Najajreh, M. ; Papargyriou, A. ; Maresch, R. ; Collins, K.A.N. ; Sailer, D. ; Schneeweis, C. ; Burger, S. ; Fröhlich, L.M. ; Klement, C. ; Belka, A. ; Montero, J.J. ; Jungwirth, U. ; Reichert, M. ; Moser, M. ; Neumann, J. ; Vassiliou, G. ; Cadiñanos, J. ; Varela, I. ; Marr, C. ; Alonso, D.F. ; Lollini, P.L. ; Zhao, J. ; Chesler, L. ; Isacke, C.M. ; Riedel, A. ; Braun, C.J. ; Sos, M.L. ; Beleggia, F. ; Reinhardt, H.C. ; Musteanu, M. ; Barbacid, M. ; Quante, M. ; Schmidt-Supprian, M. ; Schneider, G. ; Clare, S. ; Lawley, T.D. ; Dougan, G. ; Steiger, K. ; Conte, N. ; Bradley, A. ; Rad, L. ; Saur, D. ; Rad, R.
A disease model resource reveals core principles of tissue-specific cancer evolution.Schmidt, T. ; Kumar, C.N. ; Stricker, S.H.
Gene anschalten statt umbauen: CRISPR aktiviert Zellprogramme ohne DNA-Eingriff.Bader, J.M. ; Makarov, C. ; Richter, S. ; Strauss, M.T. ; Held, F. ; Wahle, M. ; Lorenz, M.B. ; Pöschl, L. ; Skowronek, P. ; Thielert, M. ; Berthele, A. ; Zeng, W.F. ; Ammar, C. ; Bludau, I. ; Schubert, B. ; Theis, F.J. ; Gasperi, C. ; Hemmer, B. ; Mann, M.
Large-scale proteomics across neurological disorders uncovers biomarker panel and targets in multiple sclerosis.Richter, T. ; Wang, W. ; Palma, A. ; Theis, F.J.
Generative models of cell dynamics: From Neural ODEs to flow matching.Maier, L. ; Sun, Y. ; Kronberg, J. ; Abner, E. ; Coley, K. ; Marenholz, I. ; Weiss, S. ; Foraita, R. ; Karramass, T. ; Mykkänen, J. ; Hernandez-Pacheco, N. ; Wang, C.A. ; Kitaba, N.T. ; Pechlivanis, S. ; Bouzigon, E. ; Tingskov Pedersen, C.E. ; Schoos, A.M. ; Curtin, J. ; Kress, S. ; Hernangomez-Laderas, A. ; Foppiano, F. ; Ashley, S. ; Batini, C. ; Bryant, L. ; Homuth, G. ; Gieger, C. ; Gilles, S. ; Lyytikäinen, L.P. ; Rovio, S. ; Pahkala, K. ; Vernet, R. ; Valenta, R. ; Llop, S. ; Torrent, M. ; Böck, A. ; Tang, M.L.K. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Metspalu, A. ; Esko, T. ; Sprikkelman, A.B. ; John, C. ; Lee, Y.A. ; Beyer, K. ; Völzke, H. ; Pigeot, I. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Duijts, L. ; Lu, H. ; Raitakari, O.T. ; Lehtimäki, T. ; Kähönen, M. ; Tio, C.H.L. ; Melén, E. ; Pennell, C.E. ; Holloway, J.W. ; von Mutius, E. ; Siroux, V. ; Bønnelykke, K. ; Custovic, A. ; Simpson, A. ; Schikowski, T. ; Bilbao, J.R. ; Schaub, B. ; Peters, R. ; Kersten, E.T.G. ; Vonk, J.M. ; Thiering, E. ; Peters, A. ; Koppelman, G.H. ; Standl, M.
Meta-analysis of genome-wide association studies of food allergy and IgE-sensitization.Li, J. ; Wang, J. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Cheng, X. ; Luecken, M. ; Lu, J. ; Monavarfeshani, A. ; Yan, W. ; Zheng, Y. ; Zuo, Z. ; Colborn, S.L.Z. ; Cortez, B.S. ; Owen, L.A. ; Wick, B. ; Bao, X. ; Choi, J. ; Haeussler, M. ; Tran, N.M. ; Shekhar, K. ; Sanes, J.R. ; Stout, J.T. ; Chen, S. ; Li, Y. ; DeAngelis, M.M. ; Theis, F.J. ; Chen, R.
Author Correction: Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina.Bahrami, M. ; Richter, T. ; Schmacke, N.A. ; Egea Lavandera, A. ; Theis, F.J.
From modality-specific to compositional foundation models for cell biology.Langstein-Skora, I. ; Schmid, A. ; Huth, F. ; Shabani, D. ; Spechtenhauser, L. ; Likhodeeva, M. ; Kunert, F. ; Metzner, F.J. ; Emenecker, R.J. ; Richardson, M.O. ; Aftab, W. ; Götz, M.J. ; Payer, S. ; Pietrantoni, N. ; Valka, V. ; Ravichandran, S.K. ; Bartke, T. ; Karl-Peter, H. ; Gerland, U. ; Korber, P. ; Holehouse, A.S.
Sequence and chemical specificity define the functional landscape of intrinsically disordered regions.Stephan, N. ; Halama, A. ; Thareja, G. ; Sarwath, H. ; Grallert, H. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Schmidt, F. ; Graumann, J. ; Suhre, K.
Identification of protein signatures reflecting latent variation in aptamer-based affinity proteomics.Laurent, K. ; Teperino, R. ; Hrabě de Angelis, M. ; Skerrett-Byrne, D.A. ; Beckers, J.
Epigenetic legacy: The role of sperm miRNAs in the paternal inheritance of diabetes and obesity development.Casalone, E. ; Rosselli, M. ; Birolo, G. ; Debernardi, C. ; Catalano, C. ; Aneli, S. ; Allione, A. ; Di Primio, C. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Anton, G. ; Vineis, P. ; Sacerdote, C. ; Matullo, G.
Integration of short non coding RNA and genetic factors for coronary artery disease risk prediction in a prospective study.Tiesmeyer, S. ; Müller-Bötticher, N. ; Malt, A. ; Ma, L. ; Marco-Salas, S. ; Kiessling, P. ; Horn, P. ; Guillot, A. ; Kuemmerle, L. ; Tacke, F. ; Theis, F.J. ; Kuppe, C. ; Nilsson, M. ; Eils, R. ; Long, B. ; Ishaque, N.
Identifying 3D signal overlaps in spatial transcriptomics data with ovrlpy.Marmolejo, C.O. ; Sanchez, C. ; Helms, E. ; McEvoy, M.J. ; Lee, J. ; Werner, M. ; Roberts, P. ; Hamperl, S. ; Saldivar, J.C.
Precise control of transcription condensates across S phase balances linker histone expression with DNA replication, ensuring genome stability.Sinke, L. ; van Dongen, J. ; Delerue, T. ; Wilson, R. ; Xia, Y. ; Beekman, M. ; Willemsen, G. ; Gieger, C. ; Herder, C. ; Koenig, W. ; Peters, A. ; de Geus, E.J.C. ; Ordovas, J.M. ; Bell, J.T. ; Waldenberger, M. ; Boomsma, D.I. ; Slagboom, P.E. ; Heijmans, B.T.
Epigenome-wide association study of circulating interleukin-6 connects DNA methylation to immunometabolic and inflammatory health.Ranasinghe, D. ; Lin, W.Y. ; Fordham, S.E. ; Alharbi, A.A. ; Sunter, N.J. ; Elstob, C. ; Nahari, M.H. ; Xu, Y. ; Park, C. ; Hungate, E. ; Quante, A. ; Strauch, K. ; Gieger, C. ; Skol, A.D. ; Rahman, T. ; Sucheston-Campbell, L. ; Hahn, T. ; Clay-Gilmour, A.I. ; Jones, G.L. ; Marr, H.J. ; Jackson, G.H. ; Menne, T. ; Collin, M. ; Ivey, A. ; Hills, R.K. ; Burnett, A.K. ; Russell, N.H. ; Fitzgibbon, J. ; Larson, R.A. ; Le Beau, M.M. ; Stock, W. ; Heidenreich, O. ; Enshaei, A. ; Gunasinghe, D. ; Hawking, Z.L. ; Heslop, H.S. ; Nandana, D. ; Di, B. ; Plokhuta, A. ; Brown, I.T. ; Allsup, D.J. ; Houlston, R.S. ; Collins, A. ; Milne, P. ; Norden, J. ; Dickinson, A.M. ; Lendrem, B.C. ; Daly, A.K. ; Palm, L. ; Piechocki, K. ; Jeffries, S. ; Bornhäuser, M. ; Röllig, C. ; Altmann, H. ; Ruhnke, L. ; Kunadt, D. ; Wagenführ, L. ; Cordell, H.J. ; Darlay, R. ; Andersen, M.K. ; Fontana, M.C. ; Martinelli, G. ; Marconi, G. ; Sanz, M. ; Cervera, J. ; Gomez-Segui, I. ; Cluzeau, T. ; Moreilhon, C. ; Raynaud, S. ; Sill, H. ; Voso, M.T. ; Dombret, H. ; Cheok, M.H. ; Preudhomme, C. ; Gale, R.E. ; Linch, D.C. ; Weisinger, J. ; Masszi, A. ; Nowak, D. ; Hofmann, W.K. ; Gilkes, A.F. ; Porkka, K. ; Milosevic Feenstra, J.D. ; Kralovics, R. ; Wang, J. ; Meggendorfer, M. ; Haferlach, T. ; Krizsán, S. ; Bödör, C. ; Parkin, B.L. ; Malek, S.N. ; Stölzel, F. ; Onel, K. ; Allan, J.M.
Common variation at 1q23.3, 2p23.3, 2q33.3, and 2p21 influences risk of acute myeloid leukemia.Weiler, P. ; Theis, F.J.
CellRank: Consistent and data view agnostic fate mapping for single-cell genomics.